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当前共找到 39915 篇文献，本页显示第 2881 - 2900 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2881 | 2026-04-30 |
SlideCNA: spatial copy number alteration detection from Slide-seq-like spatial transcriptomics data
2025-May-02, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03573-y
PMID:40317049
|
研究论文 | SlideCNA是一种从Slide-seq类空间转录组数据中检测空间拷贝数变异（CNA）的计算工具 | 利用表达感知的空间分箱方法克服数据稀疏性，从近单细胞分辨率的空间转录组数据中提取拷贝数变异信号，实现空间亚克隆检测 | 未提及具体局限性 | 开发从稀疏空间转录组数据中检测拷贝数变异的方法，以揭示实体瘤的遗传空间异质性 | 模拟数据和真实Slide-seq数据（转移性乳腺癌样本） | 机器学习, 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学, RNA-seq | 分箱算法 | 空间基因表达数据 | 模拟数据和真实乳腺癌数据 | 未指定平台公司 | 空间转录组学（Slide-seq类） | Slide-seq | 近单细胞分辨率的空间转录组数据 |
| 2882 | 2026-04-30 |
Single-Cell Profiling of Mononuclear Cells Identifies Transcriptomics Signatures Differentiating Prostate Cancer From Benign Prostatic Hyperplasia
2025-05, Genes, chromosomes & cancer
DOI:10.1002/gcc.70051
PMID:40346907
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析外周血单核细胞，揭示前列腺癌与良性前列腺增生的转录组学差异 | 首次利用单细胞转录组学方法系统比较前列腺癌与良性前列腺增生患者外周血单核细胞的免疫细胞亚群及基因表达差异，发现CD14+单核细胞、NK细胞和γδT细胞在前列腺癌中显著升高，并鉴定出多个潜在生物标志物 | 样本量较小，仅包含4例前列腺癌和3例良性前列腺增生患者，且未进行功能验证 | 探究前列腺癌与良性前列腺增生在外周血单核细胞水平的分子差异，寻找区分两种疾病的潜在生物标志物 | 4例前列腺癌患者和3例良性前列腺增生患者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 7例外周血样本（4例前列腺癌，3例良性前列腺增生） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 2883 | 2026-04-30 |
Molecular and cellular neurocardiology in heart disease
2025-03, The Journal of physiology
DOI:10.1113/JP284739
PMID:38778747
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综述 | 本文更新并扩展了关于心脏病分子和细胞神经生物学的基础，重点讨论了心脏自主神经发育、新型细胞内通路和神经可塑性的最新发现 | 利用患者特异性干细胞研究交感神经损伤，通过空间转录组学和新型成像技术发现治疗心脏自主神经功能障碍的分子靶点 | 文中强调了尚未解答的问题和存在争议的领域 | 探讨心脏病的分子和细胞神经心脏学机制及治疗潜力 | 心脏自主神经系统、神经化学通路、患者特异性干细胞 | 机器学习, 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2884 | 2026-04-30 |
Biophysical modelling of intrinsic cardiac nervous system neuronal electrophysiology based on single-cell transcriptomics
2025-03, The Journal of physiology
DOI:10.1113/JP287595
PMID:40077928
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研究论文 | 基于单细胞转录组数据开发心脏内在神经系统神经元电生理模型的计算库 | 首次利用单神经元转录组数据构建心脏内在神经系统神经元电生理模型计算库，通过循环阈值选择离子通道组合，结合被动电学特性约束模型参数，成功预测了与实验观察一致的神经元相位和强直反应分布 | 未明确提及 | 构建心脏内在神经系统神经元电生理多尺度计算模型，研究其在心脏调节和病理中的功能作用 | 心脏内在神经系统（ICNS）神经元 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 单细胞转录组数据中的ICNS神经元 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2885 | 2026-04-30 |
Cross-species analyses of thymic mimetic cells reveal evolutionarily ancient origins and both conserved and species-specific elements
2025-Jan-14, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.11.025
PMID:39731911
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研究论文 | 通过跨物种分析胸腺模拟细胞，揭示其演化古老起源及保守与物种特异性特征 | 首次对人类儿童胸腺模拟细胞进行单细胞RNA测序，并与小鼠和斑马鱼数据整合，发现保守的演化特征和物种特异性适应 | 未明确说明局限性 | 探究胸腺模拟细胞的跨物种保守性与物种特异性，及其在自身免疫中的潜在作用 | 人类儿童、小鼠和斑马鱼的胸腺模拟细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类儿童捐献者（具体数量未说明），小鼠和斑马鱼样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2886 | 2026-04-30 |
Genome-scale modeling identifies dynamic metabolic vulnerabilities during the epithelial to mesenchymal transition
2024-Dec-27, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-07408-7
PMID:39730911
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研究论文 | 通过基因组规模代谢模型分析上皮-间质转化过程中的动态代谢脆弱性 | 结合时间序列转录组、蛋白质组和单细胞转录组数据，利用基因组规模代谢模型揭示了EMT过程中糖酵解和谷氨酰胺代谢的时序依赖性，并验证了烯醇酶3的亚型特异性依赖 | 未提及 | 阐明上皮-间质转化（EMT）过程中的代谢网络重编程及其动态依赖性 | TGF-β刺激的细胞培养模型中的EMT过程 | 机器学习 | 肺腺癌 | 基因组规模代谢建模 | 基因组规模代谢模型 | 转录组数据、蛋白质组数据、单细胞转录组数据 | 多个公共EMT时间序列转录组、蛋白质组和单细胞转录组数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2887 | 2026-04-30 |
Spatial and temporal expression analysis of BMP signal modifiers, Smoc1 and Smoc2, from postnatal to adult developmental stages in the mouse testis
2024-12, Gene expression patterns : GEP
IF:1.0Q4
DOI:10.1016/j.gep.2024.119383
PMID:39510490
|
research paper | 研究小鼠睾丸从出生后到成年发育阶段中BMP信号调节因子Smoc1和Smoc2的时空表达 | 首次分析了Smoc1和Smoc2在出生后睾丸中的时空表达模式，揭示其在雄性生殖细胞和支持细胞中的差异表达 | 未探讨Smoc1和Smoc2在生殖过程中的具体功能机制 | 阐明Smoc1和Smoc2在小鼠睾丸发育和精子发生中的表达动态 | 小鼠（新生、幼年和成年）的睾丸组织 | machine learning | NA | RNA原位杂交, 免疫荧光, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠睾丸样本，涵盖新生、幼年和成年阶段 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于单细胞转录组分析 |
| 2888 | 2026-04-30 |
Expression of ABC transporters in the Drosophila testis stem cell niche: Comparison of two approaches
2024-12, Gene expression patterns : GEP
IF:1.0Q4
DOI:10.1016/j.gep.2024.119386
PMID:39638273
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研究论文 | 研究了果蝇睾丸干细胞微环境中ABC转运蛋白的表达，并比较了两种方法的结果 | 首次在果蝇睾丸这一干细胞微环境模型中系统筛选ABC转运蛋白的表达，并对比增强子/基因陷阱筛选与单细胞测序两种方法的相关性 | 两种方法结果相关性较弱，提示单一技术可能不足以准确反映基因表达 | 探讨ABC转运蛋白在果蝇睾丸干细胞微环境中的表达模式 | 果蝇睾丸干细胞微环境 | 机器学习 | NA | 增强子/基因陷阱筛选、单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2889 | 2026-04-30 |
Single-cell heterogeneity in ribosome content and the consequences for the growth laws
2024-Oct-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.19.590370
PMID:38895328
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了酵母和细菌中单细胞核糖体含量的异质性及其对生长法则的影响 | 首次在单细胞水平上研究生长法则，发现单细胞核糖体含量与生长速率并不紧密相关，挑战了传统群体平均水平下的生长法则模型 | 仅研究了两种微生物，可能不适用于所有物种；未深入探讨引起单细胞核糖体含量变异的分子机制 | 探究单细胞水平的核糖体含量异质性及其与生长速率的关系，评估生长法则在单细胞层面的适用性 | 酿酒酵母（真核单细胞生物）与细菌（原核生物）中的单细胞 | 机器学习和生物信息学 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 高斯过程模型 | 转录组数据 | 来自多种条件、重复和物种的数千个单细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 2890 | 2026-04-30 |
mosna reveals different types of cellular interactions predictive of response to immunotherapies and survival in cancer
2024-Sep-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.16.532947
PMID:36993595
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研究论文 | mosna是一个Python包，用于分析空间组学数据并整合临床数据，以揭示与免疫治疗反应和癌症生存相关的细胞相互作用模式 | 开发了一个与所有空间组学方法兼容的Python包，能够整合多种算法并利用临床数据构建准确的空间网络，无缝训练机器学习模型并识别最具预测力的变量 | NA | 使空间组学数据与临床或生物数据的集成分析更加易于进行，从而获得对细胞相互作用模式或组织结构的生物学洞察 | 空间组学数据产生的数据集，包括亚细胞分辨转录组学（MERFISH、seqFISH）、蛋白质组学（CODEX、MIBI-TOF、低多重免疫荧光）以及基于斑点的空间转录组学（10x Visium） | 计算机视觉 | 癌症 | 空间组学 | 机器学习 | 模态数据（空间组学数据与临床数据） | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台 |
| 2891 | 2026-04-30 |
PERCEPTION predicts patient response and resistance to treatment using single-cell transcriptomics of their tumors
2024-Jun, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-024-00756-7
PMID:38637658
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研究论文 | 开发了PERCEPTION计算流程，利用单细胞转录组数据预测癌症患者治疗反应和耐药性 | 首次利用匹配的批量与单细胞表达谱构建个性化治疗反应模型，并成功在多个临床试验中验证 | NA | 开发基于单细胞转录组的精准肿瘤学计算工具，实现患者分层与治疗优化 | 培养细胞、患者肿瘤来源的原代细胞、多发性骨髓瘤和乳腺癌临床试验样本、肺癌患者 | 机器学习 | 多发性骨髓瘤, 乳腺癌, 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、批量转录组数据 | 大规模细胞系药物筛选数据及多个临床队列 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 2892 | 2026-04-30 |
Tumor PD-L1 engages myeloid PD-1 to suppress type I interferon to impair cytotoxic T lymphocyte recruitment
2023-03-13, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2023.02.005
PMID:36917954
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研究论文 | 该研究揭示肿瘤细胞PD-L1通过与髓系细胞PD-1结合，激活SHP2抑制I型干扰素信号通路，从而削弱细胞毒性T淋巴细胞向肺转移灶的募集，促进肿瘤免疫逃逸 | 首次发现肿瘤PD-L1并非直接抑制T细胞活性，而是通过髓系PD-1介导的SHP2-IFN-I-STAT1-CXCL9信号轴调控CTL募集，并证实该机制在肺转移中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据仅显示相关性，未完全验证机制；未阐明其他肿瘤模型或器官转移中的普适性 | 阐明肿瘤细胞PD-L1在肿瘤免疫逃逸中通过髓系细胞介导的分子机制 | 肿瘤细胞（PD-L1）、髓系细胞（PD-1）、细胞毒性T淋巴细胞、小鼠肺转移模型 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型（未明确具体数量）；人癌症患者样本（数量未指定） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2893 | 2024-08-07 |
Integrated single-cell sequencing and histopathological analyses reveal diverse injury and repair responses in a participant with acute kidney injury: a clinical-molecular-pathologic correlation
2022-06, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2022.03.011
PMID:35339536
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2894 | 2026-04-30 |
Expansion, persistence, and efficacy of donor memory-like NK cells infused for posttransplant relapse
2022-06-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI154334
PMID:35349491
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研究论文 | 该研究通过I期临床试验，评估了供者来源的记忆样自然杀伤细胞在单倍体相合造血干细胞移植后复发患者中的扩增、持久性和疗效 | 首次通过单细胞RNA测序和质谱流式技术在纵向时间点对输入体内的记忆样NK细胞亚群进行高分辨率特征分析，揭示了其在免疫相容环境中的快速扩增和长期持续能力 | 初始仅纳入6例患者，样本量较小，且未详细阐述记忆样NK细胞与T细胞和肿瘤靶标的相互作用机制 | 评估供者来源的细胞因子诱导的记忆样NK细胞治疗异基因造血干细胞移植后髓系肿瘤复发的安全性和有效性 | 接受单倍体相合造血干细胞移植后复发的髓系肿瘤患者 | 数字病理学 | 髓系肿瘤 | 单细胞RNA测序，质谱流式技术 | NA | 单细胞转录组数据，免疫表型数据 | 6名患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2895 | 2026-04-30 |
Single-cell RNA sequencing reveals evolution of immune landscape during glioblastoma progression
2022-06, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-022-01215-0
PMID:35624211
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序揭示胶质母细胞瘤进展过程中免疫景观的演变 | 首次在小鼠模型中通过单细胞转录组学系统描绘了GBM进展全过程中免疫细胞组成的大规模纵向变化，并发现与临床样本的低级别胶质瘤和GBM中相似的微胶质细胞和巨噬细胞关系 | 未明确提及局限性 | 研究胶质母细胞瘤进展过程中免疫微环境的动态演变及标准治疗的影响 | EGFR驱动的基因小鼠GBM模型及患者活检样本 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | EGFR驱动的基因小鼠GBM模型及患者低级别胶质瘤和GBM活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2896 | 2026-04-30 |
Human CD206+ macrophages associate with diabetes and adipose tissue lymphoid clusters
2022-02-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.146563
PMID:34990410
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研究论文 | 本研究分析了人类脂肪组织中三种巨噬细胞亚型在肥胖和糖尿病中的作用，发现CD206+CD11c-巨噬细胞与糖尿病相关，并在血管化淋巴样簇中聚集 | 首次在人类脂肪组织中定义CD206+巨噬细胞亚型与2型糖尿病的关联，并揭示其独特的基因表达谱和空间分布特征 | 样本量有限且仅来自肥胖参与者，未纳入正常体重或非糖尿病对照组 | 探究人类脂肪组织巨噬细胞亚型在肥胖和糖尿病中的作用及其基因表达特征 | 糖尿病和非糖尿病肥胖参与者的内脏脂肪组织和皮下脂肪组织 | 机器学习和数据分析 | 糖尿病、肥胖 | 单细胞转录组学、流式细胞术、免疫组化 | NA | 基因表达数据、细胞计数数据 | 糖尿病和非糖尿病肥胖参与者的脂肪组织样本 | NA | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | NA |
| 2897 | 2026-04-30 |
External signals regulate continuous transcriptional states in hematopoietic stem cells
2021-12-23, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.66512
PMID:34939923
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和ATAC测序，研究造血干细胞在外部信号刺激下的转录状态变化及其调控机制 | 首次在体内单细胞水平揭示造血干细胞对干扰素、G-CSF和前列腺素等微环境信号的转录反应异质性，发现六种标记基因富集但不排他的HSC状态，并证明染色质状态预先决定了HSC对信号的响应能力 | 未明确说明局限性 | 探究造血干细胞在外部应激信号下调控连续转录状态的分子机制 | 小鼠造血干细胞和LSK祖细胞 | 单细胞组学 | 血液疾病 | scRNA-seq, scATAC-seq | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞染色质可及性数据 | 功能验证的小鼠HSC和LSK祖细胞（具体数量未提供） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序平台 |
| 2898 | 2026-04-30 |
Multilineage murine stem cells generate complex organoids to model distal lung development and disease
2020-11-02, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2019103476
PMID:32985719
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研究论文 | 建立了三维鼠支气管肺泡类器官模型，模拟远端肺发育和疾病 | 首次通过FACS分选的支气管肺泡干细胞与肺驻留间充质细胞共培养，实现了高度分支的三维结构生成，并结合单细胞RNA测序和电镜验证细胞组成，支持巨噬细胞植入和病毒建模 | 未提及体外模型与体内环境的完全对应性及长期培养稳定性 | 建立复杂类器官模型以研究远端肺发育、感染和再生过程 | 小鼠支气管肺泡干细胞和肺驻留间充质细胞 | 数字病理学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序、荧光成像、电子显微镜 | 三维类器官模型 | 基因表达数据、图像数据 | FACS分选的支气管肺泡干细胞与肺驻留间充质细胞共培养样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2899 | 2026-04-30 |
Stromal cell diversity associated with immune evasion in human triple-negative breast cancer
2020-10-01, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2019104063
PMID:32790115
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research paper | 通过对五例三阴性乳腺癌进行单细胞RNA测序，揭示了肿瘤基质中成纤维细胞和血管周细胞的异质性及其与免疫逃逸的关联 | 首次描绘了三阴性乳腺癌中两种癌症相关成纤维细胞和两种血管周样细胞亚群，并揭示了它们与细胞毒性T细胞功能障碍和排斥的强相关性 | 未明确说明局限性 | 探究人类三阴性乳腺癌中肿瘤基质的细胞异质性及其与免疫逃逸的关系 | 五例三阴性乳腺癌患者的肿瘤组织样本 | machine learning | lung cancer | NA | NA | 文本和测序数据 | 5例三阴性乳腺癌患者肿瘤组织 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 2900 | 2026-04-30 |
A Widespread Neurogenic Potential of Neocortical Astrocytes Is Induced by Injury
2020-10-01, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2020.07.006
PMID:32758425
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研究论文 | 研究发现，当Notch信号被阻断时，大脑皮层星形胶质细胞在损伤后能够产生新的神经元，并揭示了其分子调控机制 | 首次证明Notch信号缺陷的星形胶质细胞在损伤后可转变为神经干细胞样状态并启动神经发生程序，且成功将星形胶质细胞神经发生与反应性胶质增生在单细胞水平上解耦 | 仅在小鼠模型中验证，且神经发生效率较低，仅少数预激活的星形胶质细胞在损伤后启动神经发生程序 | 阐明非神经源性脑区星形胶质细胞在损伤后产生新神经元的分子调控机制 | 小鼠大脑皮层星形胶质细胞 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠大脑皮层细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |