单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 2881 - 2900 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2881 | 2025-10-06 |
MIF-mediated crosstalk between THRSP + hepatocytes and CD74 + lipid-associated macrophages in hepatic periportal zone drives MASH
2025-Jun-12, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001429
PMID:40590856
|
研究论文 | 本研究揭示了THRSP+肝细胞通过MIF介导与CD74+脂质相关巨噬细胞在肝脏门静脉区的相互作用驱动MASH进展的机制 | 首次发现THRSP通过促进肝内新生脂肪生成和抑制FASN泛素化来驱动MASH进展，并阐明MIF介导的肝细胞与巨噬细胞空间串扰机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床验证仍需进一步研究 | 探究代谢功能障碍相关脂肪性肝炎(MASH)进展的空间分区机制 | MASH小鼠模型和MASH患者肝脏组织 | 空间转录组学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎 | 空间转录组学, CellPhoneDB分析, 基因过表达/敲除实验 | NA | 空间转录组数据, 基因表达数据 | MASH小鼠和患者肝脏样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2882 | 2025-10-06 |
MACanalyzeR scRNAseq analysis tool reveals PPARγHIGH/GDF15HIGH lipid-associated macrophages facilitate thermogenic expansion in BAT
2025-May-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-60295-2
PMID:40450001
|
研究论文 | 开发用于单细胞RNA测序分析的MACanalyzeR工具，揭示PPARγHIGH/GDF15HIGH脂质相关巨噬细胞在棕色脂肪组织产热扩张中的作用 | 开发了专门用于单核细胞/巨噬细胞代谢谱分析的scRNAseq工具MACanalyzeR，并首次发现Pparg脂质相关巨噬细胞通过分泌GDF15调节棕色脂肪组织稳态 | 研究仅使用雄性小鼠模型，未涉及雌性动物或人类样本 | 探究巨噬细胞在棕色脂肪组织功能和代谢调节中的作用机制 | 肥胖雄性小鼠模型（db/db和高脂饮食喂养小鼠）的棕色脂肪组织 | 单细胞转录组学 | 肥胖代谢疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 两种肥胖小鼠模型（db/db和高脂饮食喂养小鼠） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2883 | 2025-10-06 |
High throughput identification of genetic regulators of microglial inflammatory processes in Alzheimer's disease
2025-Mar-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.09.642133
PMID:40161839
|
研究论文 | 通过CRISPRi筛选和单细胞RNA测序系统研究阿尔茨海默病GWAS变异如何调控人类小胶质细胞炎症反应 | 首次将CRISPRi筛选与单细胞RNA测序结合，系统鉴定AD遗传风险因子对小胶质细胞炎症状态的调控功能 | 研究主要基于hiPSC衍生的小胶质细胞模型，可能无法完全反映体内真实情况 | 系统研究阿尔茨海默病GWAS变异对人类小胶质细胞炎症反应的遗传调控机制 | hiPSC衍生的小胶质细胞和119个AD GWAS风险位点 | 功能基因组学 | 阿尔茨海默病 | CRISPR抑制筛选, CROP-seq, 单细胞RNA测序 | CRISPRi, 单细胞转录组分析 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 119个AD GWAS风险位点的功能筛选 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2884 | 2025-10-06 |
Chronic alcohol consumption enhances the differentiation capacity of hematopoietic stem and progenitor cells into osteoclast precursors
2025-Feb-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.05.636743
PMID:39975302
|
研究论文 | 本研究通过食蟹猴模型揭示慢性酒精摄入增强造血干细胞和祖细胞向破骨细胞前体分化的能力 | 首次在灵长类动物模型中证实慢性酒精摄入通过改变造血干细胞和祖细胞的转录组和表观基因组，增强其向破骨细胞前体分化的能力 | 研究仅使用食蟹猴模型，尚未在人类中验证；样本规模有限 | 探究慢性酒精摄入如何影响造血干细胞和祖细胞向破骨细胞的分化能力 | 食蟹猴的造血干细胞和祖细胞及其分化的破骨细胞前体 | 单细胞组学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序，光谱流式细胞术，TRAP染色 | NA | 单细胞转录组数据，流式细胞数据 | 食蟹猴模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2885 | 2025-10-06 |
Comparative transcriptomic and genomic analysis of tumor cells in the marginal and center regions of tumor nests in human hepatocellular carcinoma
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1611951
PMID:40741331
|
研究论文 | 通过空间转录组学分析肝细胞癌肿瘤巢中心与边缘区域肿瘤细胞的转录组和基因组特征差异 | 首次在空间维度系统比较肝细胞癌肿瘤巢中心与边缘区域的转录组异质性和拷贝数变异特征 | 样本量较小（8例患者，19个样本），仅基于空间转录组数据 | 探究肝细胞癌肿瘤巢空间异质性的生物学特征 | 肝细胞癌患者的肿瘤巢和肝纤维化结节 | 空间转录组学 | 肝细胞癌 | 空间转录组学，拷贝数变异分析，基因本体富集分析 | inferCNV | 空间转录组数据，病理组织切片 | 8例肝细胞癌患者的19个空间转录组样本，包含24个肿瘤巢和15个肝纤维化结节 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2886 | 2025-10-06 |
Bioinformatics-based analysis of the relationship between STC1 expression and immune infiltration in gastric cancer
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1499121
PMID:40741411
|
研究论文 | 通过生物信息学分析STC1表达与胃癌免疫浸润的关系 | 首次系统评估STC1在胃癌中的表达及其与免疫浸润和T细胞耗竭的关联 | 基于公共数据库的回顾性分析，需要实验验证 | 评估STC1作为胃癌免疫治疗靶点的潜力 | 胃癌组织和癌旁组织 | 生物信息学 | 胃癌 | RNA-seq, 微阵列, 单细胞RNA测序, ssGSEA, TIMER, GSEA | Cox回归分析 | 基因表达数据 | TCGA-STAD项目、TCGA-GTEx项目和GEO数据库(GSE66229)的样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 2887 | 2025-10-06 |
Identification of CTSC-driven progression in ESCC by single-cell sequencing and experimental validation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1585139
PMID:40740774
|
研究论文 | 通过单细胞测序和实验验证识别CTSC在食管鳞癌进展中的驱动作用 | 整合三个单细胞数据集揭示食管鳞癌恶性细胞亚型与凋亡途径的关联，首次发现CTSC基因表达与免疫治疗耐药性相关 | 样本量相对有限（18个样本），需要在更大队列中验证CTSC的预后价值 | 研究食管鳞癌肿瘤微环境并构建基于凋亡相关基因的风险特征模型 | 食管鳞癌患者组织样本和细胞系 | 数字病理学 | 食管鳞癌 | 单细胞测序, 免疫组化, 体外实验, 体内实验 | COX回归风险模型, 伪时间分析 | 单细胞RNA测序数据, 免疫组化图像, 实验数据 | 18个样本共92,714个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2888 | 2025-10-06 |
Identification of a stromal immunosuppressive barrier orchestrated by SPP1+/C1QC+ macrophages and CD8+ exhausted T cells driving gastric cancer immunotherapy resistance
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1618591
PMID:40740771
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和大规模RNA测序数据，揭示了胃癌中由SPP1+/C1QC+巨噬细胞和CD8+耗竭T细胞主导的基质免疫抑制屏障 | 首次在胃癌中发现由特定巨噬细胞亚群和耗竭T细胞协同形成的免疫抑制屏障网络，并揭示了MIF信号轴在其中起关键作用 | 研究队列规模有限，需要更大样本验证；机制研究仍需进一步实验证实 | 探索胃癌免疫治疗抵抗的细胞相互作用网络和分子机制 | 胃癌患者免疫细胞及其相互作用网络 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序,免疫荧光 | 无监督聚类分析 | 基因表达数据,空间分布数据 | NFHGC队列（具体样本数未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序 | NA | NA |
| 2889 | 2025-10-06 |
Integrated multi-omics and machine learning reveal an immunogenic cell death-related signature for prognostic stratification and therapeutic optimization in colorectal cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1606874
PMID:40740776
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据和机器学习方法，开发了一个免疫原性细胞死亡相关特征用于结直肠癌的预后分层和治疗优化 | 整合单细胞RNA测序和批量转录组数据，通过评估101种机器学习组合构建了优化的11基因ICD相关特征，并发现了一个新型巨噬细胞亚型SPP1/SLC11A1 | 需要未来的验证研究来指导个性化治疗策略 | 系统表征免疫原性细胞死在结直肠癌中的预后意义和治疗潜力 | 结直肠癌患者 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序 | StepCox [forward], RSF | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 2890 | 2025-10-06 |
Integrative spatial and single-cell transcriptomics elucidate programmed cell death-driven tumor microenvironment dynamics in hepatocellular carcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1589563
PMID:40740783
|
研究论文 | 本研究开发了程序性细胞死亡评分预测模型，用于评估肝细胞癌预后并阐明肿瘤微环境差异 | 整合空间转录组学和单细胞转录组学分析，首次构建PCD评分模型并揭示UBE2E1作为关键致癌标志物 | 回顾性研究设计，样本量有限，需要进一步验证 | 开发程序性细胞死亡评分模型评估肝细胞癌预后并分析肿瘤微环境差异 | 肝细胞癌患者和肿瘤微环境细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序, 体外实验 | 预测模型 | 转录组数据 | TCGA数据库363例患者 + GEO数据库221例患者 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2891 | 2025-10-06 |
Deciphering spatially confined immune evasion niches in osteosarcoma with 3-D spatial transcriptomics: a literature review
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1640645
PMID:40740859
|
文献综述 | 通过三维空间转录组学技术解析骨肉瘤中空间受限的免疫逃逸生态位 | 首次系统整合三维空间转录组学技术揭示骨肉瘤中多层次免疫逃逸微环境的空间组织结构 | NA | 阐明骨肉瘤免疫逃逸机制并探索空间指导的联合治疗策略 | 骨肉瘤肿瘤微环境及其空间组织结构 | 空间转录组学 | 骨肉瘤 | 三维空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | 基于条形码的转录本捕获与体积重建技术 |
| 2892 | 2025-10-06 |
Natural killer cell as a potential predictive biomarker for early immune checkpoint inhibitor-associated cardiovascular adverse events: a retrospective cohort study
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1556373
PMID:40740863
|
研究论文 | 本研究探讨外周免疫细胞对免疫检查点抑制剂相关心血管不良事件的预测价值 | 首次发现基线NK细胞比例可作为早期免疫检查点抑制剂相关心血管不良事件的潜在预测生物标志物 | 回顾性研究设计，样本量有限，需要更大规模的前瞻性研究验证 | 评估外周免疫细胞在预测早期免疫检查点抑制剂相关心血管不良事件中的价值 | 接受免疫检查点抑制剂治疗的癌症患者 | 生物医学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，倾向评分匹配，受试者工作特征曲线分析 | 逻辑回归模型 | 单细胞RNA测序数据，临床数据 | 203名患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2893 | 2025-10-06 |
Multi-Omics Analysis Combined with Machine Learning Identified FABP4 in Smooth Muscle Cells as a Pathogenic Factor in Atherosclerosis
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S519114
PMID:40740974
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析和机器学习方法，识别出平滑肌细胞中的FABP4作为动脉粥样硬化的致病因子 | 首次结合单细胞RNA测序和机器学习技术鉴定出与动脉粥样硬化相关的Scissor+平滑肌细胞亚群，并发现FABP4作为关键致病因子 | 研究主要基于公共数据库和体外实验，需要进一步体内实验验证 | 探索平滑肌细胞在动脉粥样硬化发病机制中的作用并寻找治疗靶点 | 平滑肌细胞(SMCs)，特别是与动脉粥样硬化相关的Scissor+ SMCs亚群 | 生物信息学，机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，机器学习，qRT-PCR，药物预测 | LASSO回归，随机森林，支持向量机 | 基因表达数据，单细胞测序数据 | 475个Scissor+ SMCs和1363个Scissor- SMCs，来自多个公共数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2894 | 2025-10-06 |
High fat diet-induced loss of pituitary plasticity in aging female mice with ablated leptin signaling in somatotropes
2025, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2025.1617109
PMID:40741169
|
研究论文 | 本研究探讨高脂饮食对缺乏生长激素细胞瘦素受体的老年雌性小鼠垂体转录组功能的影响 | 首次揭示高脂饮食通过下调翻译调控通路和减少多潜能细胞表达来损害垂体可塑性 | 研究仅限于小鼠模型，未在人类中验证；样本量相对有限 | 研究高脂饮食对缺乏生长激素细胞瘦素受体的老年雌性小鼠垂体功能的影响 | 10月龄缺乏生长激素细胞瘦素受体的雌性小鼠及其同窝对照小鼠 | 单细胞转录组学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序，代谢笼监测，葡萄糖耐量测试 | NA | 单细胞转录组数据，血清激素数据 | 老年雌性突变小鼠和对照小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2895 | 2025-10-06 |
Airway-derived emphysema-specific alveolar type II cells exhibit impaired regenerative potential in COPD
2024-Dec, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.02071-2023
PMID:39147413
|
研究论文 | 本研究发现了COPD肺气肿特异性肺泡II型细胞亚群，并证明其再生能力受损 | 首次鉴定出位于扩张远端肺泡囊中的肺气肿特异性ATII细胞亚群(asATII细胞)，该细胞共表达肺泡标志物和气道俱乐部细胞标志物 | 研究主要基于单细胞测序和类器官实验，需要进一步体内功能验证 | 探究COPD中肺组织再生障碍的潜在驱动因素 | 人类和小鼠的肺泡II型细胞和气道俱乐部细胞 | 单细胞生物学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序，谱系标记，肺泡类器官培养 | NA | 单细胞转录组数据，空间定位数据 | 人类和小鼠COPD模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2896 | 2025-10-06 |
Digital Spatial Profiling Identifies Distinct Molecular Signatures of Vascular Lesions in Pulmonary Arterial Hypertension
2024-08-01, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202307-1310OC
PMID:38568479
|
研究论文 | 本研究利用数字空间转录组技术识别肺动脉高压中血管病变的独特分子特征 | 首次在微观水平上系统比较IPAH不同类型血管病变的分子特征，发现丛状病变和IPAH外膜具有最显著的基因表达差异 | 样本量相对有限（IPAH=11，对照=5），仅分析了转录组水平的变化 | 验证IPAH血管病变表达独特分子谱的假设 | 特发性肺动脉高压患者的肺血管病变和对照肺动脉 | 数字病理 | 肺动脉高压 | 数字空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | IPAH肺组织11例，对照肺动脉5例 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2897 | 2025-10-06 |
Pleiotropy, a feature or a bug? Toward co-ordinating plant growth, development, and environmental responses through engineering plant hormone signaling
2024-Aug, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2024.103151
PMID:38823314
|
综述 | 探讨利用系统生物学和单细胞测序技术识别候选基因，通过合成生物学方法协调植物生长、发育与环境响应的策略 | 提出整合系统生物学、单细胞测序与合成生物学来解析基因多效性，建立基因型-表型关系的新方法 | NA | 开发通过工程化植物激素信号传导来协调植物生长、发育与环境响应的育种和基因工程策略 | 植物基因网络和信号通路 | 合成生物学 | NA | 单细胞测序, 基因编辑(CRISPR), 合成生物学 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2898 | 2025-10-06 |
Synovial 5-Lipoxygenase-Derived Oxylipins Define a Lympho-Myeloid-Enriched Synovium
2024-Aug, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.42848
PMID:38508862
|
研究论文 | 本研究探讨滑膜组织中氧脂素与血浆氧脂素的相关性及其与滑膜组织学模式的关系 | 首次系统分析炎症关节中滑膜氧脂素与血浆氧脂素的相关性，并发现5-脂氧合酶衍生的氧脂素在淋巴-髓系富集滑膜中特异性高表达 | 样本量有限（32例滑膜组织和26例配对血浆样本），仅纳入类风湿关节炎和银屑病关节炎患者 | 确定炎症关节中滑膜氧脂素是否与血浆氧脂素及滑膜组织学模式相关 | 已确诊的类风湿关节炎和银屑病关节炎患者 | 生物医学研究 | 类风湿关节炎, 银屑病关节炎 | 液相色谱-串联质谱法, 单细胞RNA测序 | NA | 生物分子数据, 基因表达数据 | 32例滑膜组织样本和26例配对血浆样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2899 | 2025-10-06 |
Molecular Changes Implicate Angiogenesis and Arterial Remodeling in Systemic Sclerosis-Associated and Idiopathic Pulmonary Hypertension
2024-08, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.123.320005
PMID:38841857
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析系统性硬化症相关和特发性肺动脉高压患者肺组织中血管细胞的转录组变化 | 首次在单细胞水平揭示肺动脉高压中三种疾病相关内皮细胞亚群的特征及其分子调控机制 | 样本量有限（特发性肺动脉高压组仅3例），且使用离体肺组织可能无法完全反映疾病早期变化 | 阐明系统性硬化症相关和特发性肺动脉高压的血管病理生物学机制 | 系统性硬化症相关肺动脉高压患者（16例）、特发性肺动脉高压患者（3例）和健康对照者（15例）的离体肺组织 | 单细胞转录组学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序，免疫荧光染色 | NA | 单细胞转录组数据，组织图像数据 | 34例人类肺组织样本（16例SSc-PH，3例IPAH，15例对照） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2900 | 2025-10-06 |
Expression of L1 Cell Adhesion Molecule, a Nephronal Principal Cell Marker, in Nephrogenic Adenoma
2024-Aug, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.modpat.2024.100540
PMID:38901674
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术鉴定L1CAM作为肾源性腺瘤的潜在生物标志物，并揭示了其与肾单位集合管主细胞的表达关联 | 首次利用单细胞RNA测序技术发现L1CAM可作为肾源性腺瘤的特异性生物标志物，并建立了肾单位特异性标志物组合 | 样本量有限（35例患者样本），需要更大规模研究验证标志物的临床适用性 | 探索肾源性腺瘤的细胞起源并开发特异性诊断标志物 | 肾源性腺瘤患者组织样本及正常尿路上皮、前列腺组织等对照样本 | 数字病理学 | 泌尿系统疾病 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, RNA原位杂交 | NA | 基因表达数据, 组织图像 | 35例肾源性腺瘤患者样本及多种对照组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |