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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
2881 2025-11-18
KC1036, a multi-kinase inhibitor with anti-angiogenic activity, can effectively suppress the tumor growth of Ewing sarcoma
2025-Sep-18, Angiogenesis IF:9.2Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析尤文肉瘤肿瘤微环境中的细胞间通讯网络,并验证新型多激酶抑制剂KC1036在临床前模型中的抗肿瘤效果 首次绘制尤文肉瘤的细胞间通讯图谱,并发现新型多激酶抑制剂KC1036相比现有药物具有更优的抗肿瘤效果 研究仅限于临床前模型,尚未进行人体临床试验 开发尤文肉瘤的替代治疗策略 尤文肉瘤细胞系、细胞系来源异种移植模型和患者来源异种移植模型 单细胞测序分析 尤文肉瘤 单细胞RNA测序 CDX模型、PDX模型 单细胞RNA测序数据 未明确样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
2882 2025-11-18
Single-vessel transcriptome map pathological landscapes and reveal NR2F2-mediated smooth muscle cell phenotype acquisition in capillary malformations
2025-Sep-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过空间转录组学分析揭示了毛细血管畸形中血管病理景观及NR2F2介导的平滑肌细胞表型获得机制 首次在单血管水平构建毛细血管畸形的空间转录组图谱,发现NR2F2在调控平滑肌细胞表型获得中的核心作用 研究样本量有限,主要基于体外iPSC模型验证,需要更多临床样本验证 探究毛细血管畸形的血管发病机制及病理重塑过程 毛细血管畸形病变组织及iPSC分化的血管细胞 空间转录组学 血管畸形 空间全转录组分析,单细胞RNA测序,磷酸化蛋白质组学,免疫荧光染色 iPSC分化模型,Tet-on系统基因调控 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据,磷酸化蛋白质组数据,免疫荧光图像 未明确样本数量 NA 空间转录组学,单细胞RNA测序,磷酸化蛋白质组学 GeoMx 空间全转录组分析平台
2883 2025-11-18
Single-Cell RNA Sequencing of Ewing Sarcoma Tumors Demonstrates Transcriptional Heterogeneity and Clonal Evolution
2025-May-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析尤文肉瘤肿瘤的转录异质性和克隆进化 首次在尤文肉瘤中应用单细胞RNA测序揭示肿瘤转录异质性、克隆进化及免疫抑制微环境,并发现TSPAN8作为潜在治疗靶点 样本量较小(7名未治疗患者),循环肿瘤细胞验证使用独立队列 探究尤文肉瘤肿瘤异质性及其对治疗的意义 尤文肉瘤患者肿瘤组织、肿瘤微环境和循环肿瘤细胞 单细胞测序分析 尤文肉瘤 单细胞RNA测序,免疫荧光 NA 单细胞转录组数据,图像数据 7名未治疗尤文肉瘤患者 NA 单细胞RNA测序 NA NA
2884 2025-11-18
Single Cell Profiling in the Sox10Dom Hirschsprung Mouse Implicates Hox Genes in Enteric Neuron Trajectory Allocation
2025, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析Sox10Dom突变小鼠肠神经系统发育,揭示了Hox基因在肠神经元轨迹分配中的作用 首次将Hox基因表达变化(特别是Hoxa6)与肠神经元轨迹改变相关联 研究仅限于小鼠模型,样本量相对较小 探究Sox10缺陷如何改变肠神经元比例及其在肠神经系统早期发育中的作用机制 Sox10+/+和Sox10Dom/+同窝小鼠的肠神经系统祖细胞、发育中神经元和肠胶质细胞 单细胞组学 先天性巨结肠症 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 杂交链式反应 NA 单细胞转录组数据, 图像数据 Sox10+/+和Sox10Dom/+同窝小鼠的肠神经系统细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
2885 2025-11-18
CREB Drives Acinar to Ductal Cells Reprogramming and Promotes Pancreatic Cancer Progression in Preclinical Models of Alcoholic Pancreatitis
2025, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究揭示了CREB在酒精性胰腺炎模型中驱动腺泡细胞向导管细胞重编程并促进胰腺癌进展的机制 首次阐明CREB与致癌Kras在慢性炎症环境下协同促进胰腺癌进展的分子机制,发现CREB持续激活可导致不可逆的腺泡-导管化生 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 探究CREB在酒精性胰腺炎背景下促进胰腺癌进展的分子机制 遗传修饰小鼠模型(Ptf1aCreERTM/+;LSL-KrasG12D/+等)的胰腺组织 癌症生物学 胰腺癌 单细胞RNA测序,谱系追踪,Western blotting,磷酸化激酶阵列,定量PCR NA 基因表达数据,组织学图像,蛋白质印迹数据 多种遗传修饰小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
2886 2025-11-18
Targeting Ferroptosis Restores the Antiviral Activity of CD8+ T Cells During Chronic Hepatitis B Virus Infection
2025, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究揭示铁死亡是慢性乙型肝炎病毒感染中CD8+ T细胞功能失调的关键机制,并证明靶向铁死亡可恢复其抗病毒活性 首次发现HBV特异性CD8+ T细胞在慢性感染中发生铁死亡,并阐明棕榈酸和TGF-β1通过调控CD36和GPX4协同促进该过程的机制 NA 探究慢性HBV感染中CD8+ T细胞功能失调的机制及干预策略 慢性乙型肝炎患者的CD8+ T细胞,特别是HBV特异性CD8+ T细胞 免疫学 乙型肝炎 流式细胞术, 电子显微镜, 单细胞RNA测序, MHC I四聚体技术 NA 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据, 电子显微镜图像 慢性乙型肝炎患者的CD8+ T细胞样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
2887 2025-11-18
Spatial transcriptomics reveals influence of microenvironment on intrinsic fates in melanoma therapy resistance
2024-Jul-02, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过空间转录组学和单细胞RNA测序揭示了黑色素瘤治疗耐药性中细胞内在状态与肿瘤微环境的共同影响 首次在单细胞分辨率上证明耐药命运同时受细胞内在状态和肿瘤微环境共同塑造,并发现不同耐药程序在个体肿瘤中共存 研究主要基于异种移植模型,人类患者样本验证仍需进一步扩展 探索黑色素瘤治疗耐药性中细胞内在因素与微环境因素的相互作用机制 黑色素瘤细胞系、患者肿瘤样本和异种移植模型 空间转录组学 黑色素瘤 空间转录组学, 单细胞RNA测序 共识非负矩阵分解 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 多个细胞系和患者样本(具体数量未明确说明) NA 空间转录组学, 单细胞RNA测序 NA NA
2888 2025-11-18
Multiomic analysis of cervical squamous cell carcinoma identifies cellular ecosystems with biological and clinical relevance
2023-12, Nature genetics IF:31.7Q1
研究论文 通过多组学分析揭示宫颈鳞状细胞癌的肿瘤细胞状态多样性及其与免疫微环境的相互作用 首次在宫颈鳞癌中系统绘制高分辨率空间转录组图谱,发现三种肿瘤状态及其特异性免疫微环境,揭示FABP5介导的免疫排斥机制 临床样本分析尚属初步,需要更大规模验证 解析宫颈鳞癌肿瘤异质性及其对免疫治疗响应的机制 宫颈鳞状细胞癌组织样本 数字病理学 宫颈癌 单细胞RNA测序,空间转录组学,空间蛋白质组学,遗传扰动,药理学扰动 NA 单细胞转录组数据,空间转录组数据,蛋白质组数据 NA NA 单细胞RNA测序,空间转录组学,空间蛋白质组学 NA NA
2889 2025-11-18
East Asian-specific and cross-ancestry genome-wide meta-analyses provide mechanistic insights into peptic ulcer disease
2023-12, Nature genetics IF:31.7Q1
研究论文 通过跨祖先基因组荟萃分析揭示消化性溃疡疾病的遗传机制 首次进行大规模跨祖先(东亚和欧洲)消化性溃疡疾病基因组荟萃分析,发现25个新位点并揭示胃溃疡和十二指肠溃疡的遗传结构差异 NA 探索消化性溃疡疾病的遗传基础和发病机制 消化性溃疡疾病患者(52,032例)和对照人群(905,344例) 基因组学 消化性溃疡 全基因组关联研究(GWAS)、转录组分析 NA 基因组数据、转录组数据 52,032病例和905,344对照 NA 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq NA NA
2890 2025-11-18
Single-cell RNAseq analysis of spinal locomotor circuitry in larval zebrafish
2023-11-17, eLife IF:6.4Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析斑马鱼幼体脊髓运动神经元的分子特征及其在游泳行为中的功能差异 首次在斑马鱼脊髓运动神经元中发现特定电压依赖性离子通道和突触蛋白组合形成的功能'盒',并揭示其与高速游泳行为的关系 研究主要聚焦于斑马鱼模型,结果向其他物种的普适性需要进一步验证 探究脊髓运动神经元在游泳行为中的功能差异的分子基础 斑马鱼幼体脊髓神经元 神经科学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 斑马鱼幼体脊髓神经元单细胞样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2891 2025-11-18
A single-cell atlas depicting the cellular and molecular features in human anterior cruciate ligamental degeneration: A single cell combined spatial transcriptomics study
2023-11-16, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学构建了人类前交叉韧带退变的细胞图谱 首次在单细胞和空间水平揭示了韧带退变过程中新的成纤维细胞亚群及其动态轨迹 样本量相对有限,需要进一步验证关键发现 系统识别人类韧带细胞类型,研究韧带退变过程中的细胞身份、功能和相互作用 人类前交叉韧带健康与退变组织 空间转录组学 韧带退行性疾病 单细胞RNA测序,空间RNA测序,免疫组织化学染色,免疫荧光染色 计算分析 单细胞转录组数据,空间转录组数据 约49,356个细胞 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
2892 2025-11-18
Ruxolitinib improves hematopoietic regeneration by restoring mesenchymal stromal cell function in acute graft-versus-host disease
2023-08-01, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序发现芦可替尼可通过JAK2/STAT1通路直接修复骨髓间充质基质细胞功能,从而改善急性移植物抗宿主病相关的造血功能障碍 首次揭示急性移植物抗宿主病中骨髓微环境损伤的具体机制,并发现芦可替尼对骨髓间充质基质细胞的直接保护作用 研究主要基于小鼠模型,虽在患者样本中得到验证但样本量有限 探究急性移植物抗宿主病中骨髓微环境损伤机制及芦可替尼的治疗作用 小鼠模型和患者样本中的骨髓非造血细胞,特别是骨髓间充质基质细胞 单细胞测序分析 急性移植物抗宿主病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 单倍体MHC匹配移植急性移植物抗宿主病小鼠模型及患者样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2893 2025-11-18
Combined lineage tracing and scRNA-seq reveals unexpected first heart field predominance of human iPSC differentiation
2023-06-07, eLife IF:6.4Q1
研究论文 开发结合谱系追踪和单细胞RNA测序的系统,揭示人iPSC分化过程中第一心区祖细胞占主导地位 首次建立TBX5/MYL2谱系追踪报告系统,结合单细胞RNA测序全面分析hiPSC心脏分化过程 研究基于体外iPSC分化模型,不能完全模拟体内胚胎发育环境 研究人诱导多能干细胞向心脏细胞分化的发育轨迹和细胞谱系 人诱导多能干细胞(hiPSCs)及其分化产生的心脏祖细胞和心肌细胞 发育生物学 心血管疾病 谱系追踪,单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 2个独立iPSC细胞系,12个时间点 NA 单细胞RNA-seq NA 基于寡核苷酸样本多重分析的scRNA-seq技术
2894 2025-11-17
Single-cell transcriptomic analysis reveals T cell heterogeneity and metabolic reprogramming in human immune-mediated glomerulonephritis
2025-Dec-31, Autoimmunity IF:3.3Q3
研究论文 通过单细胞转录组分析揭示人类免疫介导性肾小球肾炎中T细胞的异质性和代谢重编程 首次构建人类免疫介导性肾小球肾炎T细胞的单细胞图谱,揭示疾病特异性T细胞状态、代谢特征和激活机制 研究局限于三种主要IMGN类型,样本来源和数量可能限制结果的普适性 阐明T细胞在人类免疫介导性肾小球肾炎发病机制中的特征和功能作用 免疫介导性肾小球肾炎患者的肾脏T细胞 单细胞组学 肾小球肾炎 单细胞RNA测序 基因共表达网络,细胞分化轨迹推断 单细胞转录组数据 三种主要IMGN类型(IgA肾病、狼疮性肾炎、膜性肾病)的患者样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
2895 2025-11-17
Digital pathology and spatial omics in steatohepatitis: Clinical applications and discovery potentials
2025-Dec-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
综述 本文综述了数字病理学和空间组学在脂肪性肝炎中的临床应用与发现潜力 整合数字病理学与空间生物学,通过机器学习算法增强组织学解读准确性,并探讨多模态整合的潜力 讨论了现有工具的局限性、知识缺口和技术前提条件 改善脂肪性肝炎的组织学解读准确性并探索疾病异质性 脂肪性肝炎患者的肝脏组织切片 数字病理学 脂肪性肝炎 线性与非线性显微镜、空间转录组学、空间蛋白质组学 机器学习算法 全切片图像、基因表达数据、蛋白质表达数据 NA NA 空间转录组学,空间蛋白质组学 NA NA
2896 2025-11-17
Next generation DNA sequencing data analysis and its application in clinical genomics
2025-Dec, Pathology, research and practice
综述 本文综述了新一代测序技术在临床基因组学中的应用及其数据分析方法 系统梳理了NGS技术在癌症研究、罕见病诊断和个性化医疗等领域的广泛应用,并展望了多组学数据整合和单细胞测序的发展前景 作为综述文章,未涉及具体实验设计和数据验证 探讨新一代测序数据分析方法及其在临床基因组学中的应用价值 新一代测序技术及其产生的基因组数据 基因组学 癌症,罕见病 新一代测序(NGS) NA DNA序列数据,RNA序列数据 NA NA 新一代测序,单细胞测序 NA NA
2897 2025-11-17
EMC8 expression in head and neck squamous cell carcinoma: Implications for poor prognosis and deficient CD8+ T cell infiltration
2025-Dec, Pathology, research and practice
研究论文 本研究探讨EMC8在头颈部鳞状细胞癌中的表达及其与预后和CD8+ T细胞浸润的关系 首次揭示EMC8在HNSCC中高表达与不良预后和CD8+ T细胞浸润减少的关联 EMC8促进免疫逃避和恶性肿瘤的具体分子机制尚未完全阐明 探究EMC8在头颈部鳞状细胞癌中的临床意义和免疫功能 头颈部鳞状细胞癌组织和患者临床样本 癌症生物学 头颈部鳞状细胞癌 单细胞RNA测序, Kaplan-Meier生存分析 NA mRNA表达数据, 蛋白质表达数据, 临床生存数据, 单细胞测序数据 HNSCC患者组织样本和临床数据 NA 单细胞RNA测序 NA NA
2898 2025-11-17
A newly developed Germlings Harvester (GEHA) in combination with metabarcoding analysis detected numerous plankton species, particularly HABs-causing species, from in-situ germination of resting stage cells
2025-Dec, Harmful algae IF:5.5Q1
研究论文 开发了新型Germlings Harvester (GEHA)设备并结合宏条形码技术,首次实现海洋沉积物中浮游生物休眠阶段细胞的原位萌发检测 首次开发GEHA设备实现原位检测浮游生物休眠细胞萌发,结合宏条形码技术发现128种新型休眠阶段细胞生产者,首次观测到9种有害藻华物种的原位萌发 未提及方法检测限和定量准确性,尚未进行大规模推广应用验证 研究浮游生物休眠阶段细胞萌发对群落组成和有害藻华形成的影响 海洋沉积物中的浮游生物休眠阶段细胞(包括甲藻孢囊、硅藻孢子等) 环境微生物学 NA 宏条形码分析、单细胞测序、克隆培养 NA 基因序列数据、物种鉴定数据 从青岛湾沉积物中鉴定出220种浮游生物物种 NA 宏条形码测序、单细胞测序 NA NA
2899 2025-11-17
Spatiotemporal transcriptomic insights into ferroptosis and TFRC-linked immune interactions in ischemia-reperfusion acute kidney injury
2025-Nov-15, Genes and immunity IF:5.0Q2
研究论文 本研究通过时空转录组学分析揭示了铁死亡在缺血再灌注急性肾损伤中的作用及其与免疫细胞的相互作用 整合单细胞和空间转录组学技术,首次系统揭示TFRC等铁死亡相关基因在肾小管细胞中的空间表达模式及其与巨噬浸润的邻近关系 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证尚需进一步研究 探究铁死亡相关基因在急性肾损伤中的表达特征、空间分布及免疫相互作用,寻找潜在治疗靶点 小鼠缺血再灌注急性肾损伤模型、肾小管细胞 生物信息学 急性肾损伤 单细胞RNA测序,空间转录组学,免疫荧光,共培养实验 机器学习诊断模型 基因表达数据,空间转录组数据,图像数据 小鼠模型样本 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
2900 2025-11-17
A single-cell multi-omics framework identifies immune cell drivers of migraine and repurposable therapeutics
2025-Nov-13, The journal of headache and pain IF:7.3Q1
研究论文 本研究通过建立单细胞多组学分析框架,识别偏头痛的免疫细胞驱动因素和可重新利用的治疗药物 首次整合单细胞表达数量性状位点数据和单细胞孟德尔随机化分析,系统探索偏头痛的免疫介导调控机制 未在文中明确说明研究的具体局限性 探索偏头痛的免疫遗传学基础并识别潜在治疗靶点 14种免疫细胞类型和9,117个独特的sc-eQTL 生物信息学 偏头痛 单细胞表达数量性状位点分析, 单细胞孟德尔随机化, 共定位分析, 单细胞RNA测序, 全基因组关联研究, 全表型组关联研究 孟德尔随机化模型, 共定位分析模型 单细胞基因表达数据, 基因型数据, 表型数据 涉及9,117个sc-eQTL和14种免疫细胞类型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
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