单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28344 篇文献，本页显示第 2881 - 2900 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2881 | 2025-05-01 |
Habitual Exercise Modulates Neuroimmune Interaction to Mitigate Aortic Stiffness
2025-Apr-30, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.325656
PMID:40304034
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research paper | 研究探讨了习惯性运动如何通过调节神经免疫相互作用来减轻主动脉硬化 | 揭示了运动通过调节交感神经与免疫细胞的相互作用来减轻血管纤维化和主动脉硬化的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需进一步验证 | 探究运动如何通过神经免疫相互作用减轻主动脉硬化 | C57BL/6小鼠和Ccr2基因敲除/敲入小鼠 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、基因本体分析 | 小鼠模型 | 基因表达数据、生理参数 | 多组C57BL/6小鼠和Ccr2基因修饰小鼠 |
| 2882 | 2025-05-01 |
Overload of Neprilysin in Placental Extracellular Vesicles Disrupts CNP-NPRB-Mediated Communication Between Vascular Endothelial and Smooth Muscle Cells: A Trigger for Symptoms of Preeclampsia
2025-Apr-30, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.325673
PMID:40304042
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research paper | 本研究探讨了胎盘源性细胞外囊泡中NEP的过载如何破坏CNP-NPRB介导的血管内皮和平滑肌细胞间的通讯，从而触发子痫前期症状 | 首次揭示了胎盘源性细胞外囊泡中NEP的过载通过降解CNP影响血管功能，是子痫前期发病的关键机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 阐明子痫前期的发病机制，特别是胎盘与血管功能障碍之间的联系 | 胎盘细胞外囊泡、血管内皮细胞、血管平滑肌细胞 | 生殖医学 | 子痫前期 | LC-MS、单细胞RNA测序、肌动描记术、腺病毒转染 | 小鼠疾病模型 | 蛋白质组学数据、RNA测序数据、生理参数 | 正常和子痫前期胎盘样本、妊娠小鼠模型 |
| 2883 | 2025-05-01 |
Exploring the Latent Information in Spatial Transcriptomics Data via Multi-View Graph Convolutional Network Based on Implicit Contrastive Learning
2025-Apr-30, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202413545
PMID:40304359
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研究论文 | 本研究提出了一种基于多视图图卷积网络和隐式对比学习的新框架STMIGCL，用于提高空间转录组数据的空间域识别精度 | 结合多视图图卷积网络和隐式对比学习，通过潜在空间对比增强优化低维表示，提升空间域识别的准确性和判别力 | 未明确提及具体局限性 | 提高空间转录组数据的空间域识别精度，增强对组织微环境和生物过程的理解 | 空间转录组数据 | 生物信息学 | NA | 多视图图卷积网络、隐式对比学习、注意力机制 | GCN（图卷积网络） | 空间转录组数据（基因表达与空间坐标） | NA |
| 2884 | 2025-05-01 |
Investigation into the Spatial Heterogeneity of Lung Composite Large-Cell Neuroendocrine Carcinoma Spatial Transcriptomic Analysis of Combined Large-Cell Neuroendocrine Carcinoma
2025-Apr-30, Cancer biotherapy & radiopharmaceuticals
DOI:10.1089/cbr.2025.0043
PMID:40304569
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research paper | 本研究探讨了肺复合大细胞神经内分泌癌（CoLCNEC）的空间转录组表达模式，并识别了关键基因 | 利用空间转录组技术（ST）分析了CoLCNEC患者的样本，发现了基因SMC1A在肿瘤区域的显著上调及其在癌细胞迁移、侵袭和细胞周期中的作用 | 研究仅基于一个CoLCNEC患者的样本，样本量较小，可能影响结果的普遍性 | 探索CoLCNEC的空间转录组表达模式，识别关键基因并验证其作为治疗靶点的潜力 | 肺复合大细胞神经内分泌癌（CoLCNEC）患者的肿瘤组织 | digital pathology | lung cancer | 空间转录组技术（ST）、高通量测序、免疫组化、RT-qPCR、Western blot、流式细胞术 | NA | 基因表达数据、空间位置数据 | 一个CoLCNEC患者的样本，包含三种不同成分（LCNEC、腺癌和鳞状细胞癌） |
| 2885 | 2025-05-01 |
Decoding Alzheimer's Disease: Single-Cell Sequencing Uncovers Brain Cell Heterogeneity and Pathogenesis
2025-Apr-30, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-025-04997-0
PMID:40304967
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综述 | 本文系统总结了单细胞转录组和表观基因组方法在阿尔茨海默病研究中的应用，重点关注细胞类型和亚型特异性转录组变化的表征 | 利用单细胞测序技术揭示了阿尔茨海默病大脑的细胞和分子异质性，并整合多种组学技术阐明疾病轨迹和细胞通讯网络 | NA | 增强对阿尔茨海默病发病机制的理解，并为精准医学识别新的治疗靶点和生物标志物 | 阿尔茨海默病患者大脑中的神经元和胶质细胞亚群 | 数字病理学 | 老年病 | scRNA-seq, ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | 单细胞测序数据 | NA |
| 2886 | 2025-05-01 |
Perivascular Niche-Resident Alveolar Macrophages Promote Interstitial Pneumonitis Related to Trastuzumab Deruxtecan Treatment
2025-Apr-29, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-2021
PMID:40300097
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research paper | 研究探讨了曲妥珠单抗德鲁替康（T-DXd）治疗乳腺癌时引发致命性间质性肺病（ILD）的机制，并提出预防策略 | 揭示了T-DXd通过Fc-FcγR相互作用触发肺泡巨噬细胞（AMs）从免疫抑制状态向促ILD状态的转变，以及通过SPP1通路介导的炎症和免疫激活机制 | 研究基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 理解T-DXd诱导的ILD机制并开发预防策略 | 曲妥珠单抗德鲁替康（T-DXd）和肺泡巨噬细胞（AMs） | 免疫学 | 乳腺癌和间质性肺病（ILD） | 单细胞RNA测序和活体显微镜技术 | 免疫活性小鼠模型 | 基因表达数据和显微镜图像 | NA |
| 2887 | 2025-05-01 |
Integrative Analysis of Lactylation-Associated Features in Abdominal Aortic Aneurysm and Its Immune Microenvironment Utilizing scRNA-seq and Bulk RNA Sequencing
2025-Apr-29, Circulation journal : official journal of the Japanese Circulation Society
IF:3.1Q2
DOI:10.1253/circj.CJ-24-0892
PMID:40301103
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研究论文 | 通过整合单细胞和批量RNA测序数据，研究腹部主动脉瘤（AAA）中乳酰化与免疫微环境的关系 | 首次揭示了乳酰化在不同免疫细胞类型中的异质性及其与免疫反应的关联，并鉴定了8个与乳酰化相关的核心基因 | 研究结果需要进一步的实验验证，特别是在人类样本中的应用 | 阐明乳酰化与AAA免疫反应之间的相互关系 | 腹部主动脉瘤（AAA）患者 | 生物信息学 | 心血管疾病 | scRNA-seq, Bulk RNA测序 | 机器学习算法（113种组合） | RNA测序数据 | NA |
| 2888 | 2025-05-01 |
Broad rim lesions are a new pathological and imaging biomarker for rapid disease progression in multiple sclerosis
2025-Apr-29, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-025-03625-7
PMID:40301560
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research paper | 该研究通过分析多发性硬化症（MS）尸检队列，发现了一种新型病变类型——宽边缘病变，可作为疾病快速进展的生物标志物 | 首次揭示了宽边缘病变作为MS快速进展的新型病理和影像学生物标志物，并验证了其与疾病进展的关联 | 研究样本来自尸检队列，可能无法完全反映活体患者的动态病理过程 | 探索多发性硬化症疾病进展的潜在机制并寻找相关生物标志物 | 多发性硬化症患者尸检脑组织样本和独立PET研究队列 | digital pathology | multiple sclerosis | 空间转录组学、PET成像 | NA | 组织病理学图像、转录组数据、PET影像数据 | 尸检队列186例，PET研究队列114例 |
| 2889 | 2025-05-01 |
Clinical Diagnosis and Treatment System for Neurological Psychological Gastrointestinal Diseases Based on Multimodal Artificial Intelligence and Immunology
2025-Apr-29, Current pharmaceutical biotechnology
IF:2.2Q3
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research paper | 开发了一种基于多模态人工智能和免疫学的神经系统心理胃肠疾病临床诊疗系统，用于预测和辅助治疗结直肠癌 | 结合神经免疫基因调控设计人工智能多模态胃肠疾病临床信息系统，利用单细胞测序技术和分子模拟技术深入分析生存预测系统中的特征选择生物机制 | 未提及具体样本量及模型在更广泛人群中的适用性验证 | 优化结直肠癌的诊疗策略，满足临床定价机构的需求 | 结直肠癌患者 | digital pathology | colorectal cancer | single-cell sequencing, molecular simulation | AI multimodal system | gene expression levels, immune cell status, living habits data | NA |
| 2890 | 2025-05-01 |
Autosomal dominant SLURP1 variants cause palmoplantar keratoderma and progressive symmetric erythrokeratoderma
2025-Apr-28, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljaf049
PMID:39913669
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研究论文 | 该研究通过全外显子测序发现了导致掌跖角化症和进行性对称性红斑角化症的SLURP1基因新变异 | 首次发现常染色体显性遗传的SLURP1变异会导致掌跖角化症和进行性对称性红斑角化症，并揭示了其作用机制 | 研究样本量较小（仅3个无亲缘关系的家系） | 鉴定导致掌跖角化症和进行性对称性红斑角化症的新遗传变异 | 表皮分化障碍患者（包括掌跖角化症和进行性对称性红斑角化症表型） | 遗传学 | 皮肤疾病 | 全外显子测序、计算机模拟预测、患者角质形成细胞实验、高分辨率空间转录组学、定量细胞因子分析 | NA | 基因序列数据、细胞实验数据 | 3个无亲缘关系的家系 |
| 2891 | 2025-05-01 |
LAMA4+ CD90+ eCAFs provide immunosuppressive microenvironment for liver cancer through induction of CD8+ T cell senescence
2025-Apr-28, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-025-02162-7
PMID:40289085
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research paper | 该研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组数据，鉴定了与肝细胞癌预后不良相关的CD90 eCAFs亚型，并揭示了其通过LAMA4诱导CD8+ T细胞衰老的机制 | 首次鉴定了LAMA4+ CD90+ eCAFs亚型，揭示了其通过ITGA6受体介导的DNA损伤信号通路诱导CD8+ T细胞衰老的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，临床样本验证不足 | 探究肝细胞癌中肿瘤微环境与免疫系统的相互作用机制 | 肝细胞癌中的癌症相关成纤维细胞(CAFs)和CD8+ T细胞 | 肿瘤免疫学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组、siRNA转染、Western blot、流式细胞术 | 自发小鼠肝细胞癌模型(DEN+CCL4诱导) | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、流式细胞数据 | 未明确说明样本数量，包含人类肝细胞癌样本和小鼠模型 |
| 2892 | 2025-05-01 |
Transcriptomic characterization of transitioning cell types in the skin of Atlantic salmon
2025-Apr-28, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-025-02196-w
PMID:40289111
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research paper | 本研究通过单核测序和空间转录组学技术，描述了健康大西洋鲑鱼组织中及伤口愈合过程中间充质基质细胞的转录组特征 | 首次绘制了伤口愈合过程中潜在分化间充质基质细胞亚群的转录组活性，揭示了不同亚群的空间生态位 | 研究仅针对大西洋鲑鱼，结果可能不适用于其他物种 | 探究大西洋鲑鱼皮肤伤口愈合过程中细胞转录组的变化 | 大西洋鲑鱼的间充质基质细胞（成纤维细胞样成体干细胞） | 转录组学 | NA | 单核测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 2893 | 2025-05-01 |
Advances in CRISPR/Cas13a-based biosensors for non-coding RNA detection
2025-Apr-25, Talanta
IF:5.6Q1
DOI:10.1016/j.talanta.2025.128223
PMID:40300474
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综述 | 本文综述了基于CRISPR/Cas13a的生物传感器在非编码RNA检测中的进展 | 整合了多种信号转导系统（如荧光、电化学、比色法、表面增强拉曼光谱等）的CRISPR/Cas13a生物传感器，为实时诊断应用提供了新方法 | 当前技术仍面临临床诊断和个性化医疗中的挑战，如工作流程复杂、处理时间长和技术难度高 | 探讨CRISPR/Cas13a生物传感器在非编码RNA检测中的应用及其在临床诊断和个性化医疗中的潜力 | 非编码RNA | 生物传感器 | NA | CRISPR/Cas13a, PCR, NGS, ELISA, smFISH, nanopore sequencing, scRNA-seq | NA | RNA | NA |
| 2894 | 2025-05-01 |
InSituCor: exploring spatially correlated genes conditional on the cell type landscape
2025-Apr-24, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03554-1
PMID:40275395
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research paper | 介绍了一个名为InSituCor的工具包，用于发现空间转录组数据中与细胞类型景观无关的空间相关基因模块 | InSituCor能够识别不受已知因素（如细胞类型分布）影响的空间相关基因，从而揭示更有意义的生物学关系 | 未明确提及具体的技术限制或数据适用范围 | 探索空间转录组数据中与细胞类型景观无关的空间相关基因 | 空间转录组数据中的基因表达模式 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学分析 | NA | 空间转录组数据 | NA |
| 2895 | 2025-05-01 |
Intratumoral microbiota predicts the response to neoadjuvant chemoimmunotherapy in triple-negative breast cancer
2025-Apr-24, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010365
PMID:40280564
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research paper | 该研究探讨了肿瘤内微生物群在三阴性乳腺癌新辅助化疗免疫治疗反应预测中的作用 | 首次证实肿瘤内微生物群可作为预测三阴性乳腺癌患者对新辅助化疗免疫治疗反应的生物标志物 | 样本量相对较小(89例患者)，且仅针对早期三阴性乳腺癌患者 | 探索肿瘤内微生物群在预测三阴性乳腺癌新辅助化疗免疫治疗反应中的作用 | 89例早期三阴性乳腺癌女性患者 | digital pathology | triple-negative breast cancer | 16S rDNA sequencing, scRNA-seq | machine-learning models | genomic sequencing data, transcriptome data | 89例早期三阴性乳腺癌女性患者 |
| 2896 | 2025-05-01 |
Neuroprotectin D1 and GPR37 protect against chemotherapy-induced peripheral neuropathy and the transition from acute to chronic pain
2025-Apr-24, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2025.107746
PMID:40287118
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研究论文 | 研究探讨了Neuroprotectin D1 (NPD1)和GPR37在化疗引起的周围神经病变(CIPN)及急性疼痛向慢性疼痛转变中的保护作用 | 揭示了GPR37在感觉神经元中的表达及其在CIPN疼痛慢性化中的作用，以及NPD1通过GPR37依赖的方式保护感觉神经元免受化疗药物损伤的机制 | 研究主要基于动物模型，人类DRG样本的数据有限 | 探究NPD1和GPR37在化疗引起的周围神经病变和疼痛慢性化中的作用 | 小鼠背根神经节(DRG)神经元、巨噬细胞和人类DRG样本 | 神经科学 | 周围神经病变 | 空间转录组学分析 | Gpr37基因敲除小鼠模型 | mRNA表达数据、行为学数据 | 小鼠DRG神经元和巨噬细胞、人类DRG样本 |
| 2897 | 2025-05-01 |
Novel diagnostic biomarkers regulating macrophages autophagy in ischemic cardiomyopathy: An analysis integrating bulk RNA sequencing with single-cell RNA sequencing
2025-Apr-24, Immunobiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.imbio.2025.152907
PMID:40300424
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研究论文 | 本研究通过整合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，探索了缺血性心肌病(ICM)中巨噬细胞自噬相关的新型诊断生物标志物 | 首次整合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，识别出6个具有诊断意义的枢纽基因，并验证了其在ICM中的表达 | 研究结果需要在更大规模的临床样本中进行验证 | 探索缺血性心肌病中巨噬细胞自噬相关的生物标志物及其相关通路 | 缺血性心肌病患者组织和ICM大鼠模型 | 生物信息学 | 心血管疾病 | RNA测序(包括批量RNA测序和单细胞RNA测序)，RT-qPCR | WGCNA, PPI网络分析 | 基因表达数据 | 使用了GSE46224和GSE116250两个数据集，以及ICM大鼠模型 |
| 2898 | 2025-05-01 |
Semaphorin 6A phase separation sustains a histone lactylation-dependent lactate buildup in pathological angiogenesis
2025-Apr-22, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2423677122
PMID:40244673
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研究论文 | 本文研究了Semaphorin 6A通过相分离机制维持组蛋白乳酸化依赖的乳酸积累在病理性血管生成中的作用 | 揭示了SEMA6A通过相分离机制招募RHOA和P300，促进P300磷酸化和组蛋白乳酸化循环的新机制 | 研究主要聚焦于视网膜缺血性疾病中的血管生成，可能不适用于其他类型的血管疾病 | 探究病理性血管生成中组蛋白乳酸化修饰的调控机制 | 内皮细胞(ECs)和视网膜病理性血管生成 | 分子生物学 | 视网膜缺血性疾病 | CUT&Tag, scRNA-seq | NA | 基因组数据, 单细胞转录组数据 | NA |
| 2899 | 2025-05-01 |
St3gal5-mediated sialylation of glyco-CD177 on neutrophils restricts neuroinflammation following CNS injury
2025-Apr-22, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2426187122
PMID:40244680
|
研究论文 | 本研究揭示了St3gal5介导的中性粒细胞CD177糖基化在限制中枢神经系统损伤后神经炎症中的作用 | 首次发现CD177中性粒细胞作为抗炎亚群在中枢神经系统损伤后的作用，并鉴定St3gal5作为调控CD177糖基化的关键酶 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证仍需进一步扩展 | 探索中性粒细胞CD177糖基化在中枢神经系统损伤后神经炎症中的调控机制 | 人类和小鼠的中性粒细胞 | 免疫学 | 中枢神经系统损伤 | 单细胞RNA测序、糖蛋白组学 | 基因敲除小鼠模型 | RNA测序数据、蛋白质组学数据 | 未明确说明具体样本数量，涉及人类和小鼠样本 |
| 2900 | 2025-05-01 |
Cross-Species Multi-Omics Analysis Reveals Myeloid-Driven Endothelial Oxidative Stress in Ischemic Stroke
2025-Apr-16, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/FBL37429
PMID:40302336
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研究论文 | 通过跨物种多组学分析揭示缺血性中风中的髓系细胞驱动的内皮氧化应激 | 整合了bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq、空间转录组学和流式细胞术数据，揭示了髓系细胞在中风后如何通过炎症和代谢机制影响血脑屏障的破坏 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据的验证可能有限 | 探索缺血性中风中外周和中枢免疫反应的相互作用及其对血脑屏障的影响 | 人类和小鼠模型中的缺血性中风 | 生物医学研究 | 缺血性中风 | bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq、空间转录组学、流式细胞术 | 小鼠tMCAO模型 | RNA-seq数据、流式细胞数据、空间转录组数据 | 人类和小鼠模型中的缺血性中风样本 |