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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 2841 - 2860 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2841 | 2025-10-06 |
"Molecular pigeon" network of lncRNA and miRNA: decoding metabolic reprogramming in patients with lung cancer
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1578927
PMID:40746614
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综述 | 本文综述了lncRNA和miRNA在肺癌患者代谢重编程中的关键作用及其分子调控网络 | 提出'分子信鸽'网络概念，系统阐述lncRNA-miRNA网络通过竞争性内源RNA机制调控肺癌代谢重编程的新机制 | NA | 解析lncRNA和miRNA在肺癌代谢重编程中的调控网络，为肺癌靶向治疗提供新见解 | 肺癌患者中的长链非编码RNA和微小RNA | 分子生物学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2842 | 2025-10-06 |
A low level of tumor necrosis factor α in tumor microenvironment maintains the self-renewal of glioma stem cells by Vasorin-mediated glycolysis
2024-Dec-05, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noae147
PMID:39093693
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研究论文 | 本研究探讨肿瘤微环境中低水平TNFα通过Vasorin介导的糖酵解维持胶质瘤干细胞自我更新的机制 | 首次揭示低水平TNFα通过VASN介导的糖酵解促进胶质瘤干细胞自我更新的新机制 | 未明确说明样本规模和研究局限性 | 探索肿瘤微环境中TNFα对胶质瘤干细胞自我更新的调控作用及其临床意义 | 胶质瘤干细胞和肿瘤相关巨噬细胞 | 肿瘤生物学 | 胶质母细胞瘤 | 空间转录组学,RNA测序,单细胞RNA测序,质谱分析 | 体外和体内模型 | 基因表达数据,蛋白质数据,单细胞数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2843 | 2025-10-06 |
Integrated immuno-transcriptomic analysis of ovarian cancer identifies a four-chemokine-dominated subtype with antitumor immune-active phenotype and favorable prognosis
2024-Oct, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-024-02803-7
PMID:39095528
|
研究论文 | 通过整合免疫转录组分析识别卵巢癌中由四种趋化因子主导的免疫活性亚型 | 首次在卵巢癌中发现由CXCL9、CXCL10、CXCL11和CXCL13四种趋化因子主导的免疫活性亚型，并揭示其与良好预后的关联 | 研究基于回顾性数据，需要前瞻性研究验证；样本来源多样可能存在批次效应 | 探索卵巢癌中Th-1免疫反应与临床预后的关系，识别免疫活性亚型 | 卵巢癌患者肿瘤样本 | 生物信息学 | 卵巢癌 | 转录组测序，单细胞RNA测序，免疫组织化学 | 免疫特征分类模型 | 基因表达数据，单细胞转录组数据，病理图像数据 | 2850个卵巢癌样本（来自19个数据集），39个单细胞测序样本，39个免疫组化验证样本 | NA | 单细胞RNA测序，转录组分析，免疫组织化学 | NA | NA |
| 2844 | 2025-10-06 |
Basophils Play a Protective Role in the Recovery of Skin Barrier Function from Mechanical Injury in Mice
2024-Aug, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2023.12.024
PMID:38286187
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研究论文 | 本研究揭示了嗜碱性粒细胞通过下调IL-17A表达在皮肤机械损伤后屏障功能恢复中的保护作用 | 首次发现嗜碱性粒细胞通过拮抗IL-17A对表皮和脂质代谢基因表达的影响，促进皮肤屏障功能恢复 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中得到验证 | 探究皮肤机械损伤后屏障功能恢复的分子机制 | 小鼠皮肤机械损伤模型 | 免疫学 | 皮肤损伤 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 细胞表型数据 | 小鼠皮肤组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2845 | 2025-10-06 |
Spock2 Functions as a Key Time-Series Gene of Endothelial Cells in Sepsis-Induced Cardiomyopathy
2024-Aug-01, Journal of cardiovascular pharmacology
IF:2.6Q2
DOI:10.1097/FJC.0000000000001577
PMID:39115722
|
研究论文 | 本研究通过分析脓毒症小鼠模型和单细胞测序数据，揭示了Spock2作为内皮细胞关键时间序列基因在脓毒症心肌病中的保护作用 | 首次发现Spock2是脓毒症心肌病中内皮细胞的关键时间依赖性差异表达基因，并证实其具有抗凋亡保护功能 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，尚未在人类脓毒症患者中进行验证 | 探究脓毒症心肌病的发病机制 | 脓毒症小鼠模型和人类脐静脉内皮细胞 | 生物信息学 | 脓毒症心肌病 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 加权基因共表达网络分析, 时间序列分析, 免疫荧光 | NA | 转录组数据, 单细胞测序数据 | GSE171546和GSE207363数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 2846 | 2025-10-06 |
Data-driven selection of analysis decisions in single-cell RNA-seq trajectory inference
2024-03-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae216
PMID:38725155
|
研究论文 | 开发了一个名为Escort的新框架，用于评估单细胞RNA测序数据是否适合轨迹推断并量化分析决策对轨迹属性的影响 | 提出了首个通过数据驱动评估来指导单细胞轨迹分析决策选择的框架，减少了方法选择的不确定性 | NA | 解决单细胞RNA测序轨迹推断中分析方法选择的不确定性问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2847 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA-seq data analysis reveals functionally relevant biomarkers of early brain development and their regulatory footprints in human embryonic stem cells (hESCs)
2024-03-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae230
PMID:38739758
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析人类胚胎干细胞早期神经元发育过程中的差异表达基因及其调控网络 | 首次在人类胚胎干细胞神经元分化过程中系统识别了539个差异表达基因，并构建了包含转录因子和miRNA的基因调控网络 | 研究仅基于体外培养的干细胞分化模型，未验证在体内环境中的适用性 | 阐明早期人类大脑发育的分子机制和转录调控动态 | 人类胚胎干细胞(hESCs)及其分化至神经元的细胞 | 单细胞组学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 人类胚胎干细胞分化第26天和第54天的单细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2848 | 2025-10-06 |
Error modelled gene expression analysis (EMOGEA) provides a superior overview of time course RNA-seq measurements and low count gene expression
2024-03-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae233
PMID:38770716
|
研究论文 | 提出一种名为EMOGEA的RNA-seq数据分析框架，专门用于处理时序RNA-seq数据和低计数基因表达分析 | 开发了能够整合测量不确定性的分析框架，特别适用于监测动态现象，并能处理低计数转录本和小倍数变化的基因表达 | NA | 改进时序RNA-seq数据的分析方法，提高对动态基因调控过程的理解 | 时序RNA-seq数据，包括斑马鱼胚胎发育和小鼠植入前胚胎的单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | EMOGEA框架 | RNA-seq数据，单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2849 | 2025-10-06 |
Revealing cell-cell communication pathways with their spatially coupled gene programs
2024-03-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae202
PMID:38706319
|
研究论文 | 提出一种名为IGAN的新方法，通过空间相邻细胞间的基因关联网络推断细胞间通讯及其上下游通路 | 首次实现估计两个特定空间相邻单细胞间的基因关联网络，并构建全景细胞互作-通路图谱 | NA | 开发能够探索细胞间通讯上下游通路的新计算方法 | 空间相邻的单个细胞 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 基因关联网络 | 空间转录组数据 | 多个公共数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2850 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing data imputation using bi-level feature propagation
2024-03-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae209
PMID:38706317
|
研究论文 | 提出一种用于单细胞RNA测序数据插值的双层特征传播方法 | 开发了scBFP方法，通过两步图特征传播同时利用基因-基因和细胞-细胞关系，避免影响非零值并减少噪声传播 | 未明确说明方法在极端稀疏数据或特定细胞类型中的性能限制 | 解决单细胞RNA测序数据中的技术噪声、丢失事件和稀疏性问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 图特征传播 | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 2851 | 2025-10-06 |
β-cell Jagged1 is sufficient but not necessary for islet Notch activity and insulin secretory defects in obese mice
2024-Mar, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2024.101894
PMID:38311286
|
研究论文 | 本研究探讨了Jagged1在肥胖小鼠胰岛Notch信号激活和胰岛素分泌缺陷中的作用 | 首次证明β细胞Jagged1足以但非必要引起肥胖小鼠的胰岛Notch活性和胰岛素分泌缺陷 | 遗传功能丧失实验表明β细胞可能不是Jagged1信号的主要来源，机制仍需进一步阐明 | 研究Jagged1在肥胖诱导的β细胞功能障碍中的作用机制 | 高脂饮食喂养小鼠、瘦素受体缺陷小鼠、2型糖尿病患者胰岛 | 分子生物学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序, 葡萄糖耐量测试, 葡萄糖刺激胰岛素分泌测定 | 转基因小鼠模型, 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 生理功能数据 | 多种小鼠模型和人类胰岛样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2852 | 2025-10-06 |
Data-driven selection of analysis decisions in single-cell RNA-seq trajectory inference
2023-Dec-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.18.572214
PMID:38187768
|
研究论文 | 开发了Escort框架用于评估单细胞RNA测序数据是否适合轨迹推断并量化分析决策对轨迹特性的影响 | 提出了首个通过数据驱动评估来指导单细胞轨迹分析决策的框架，减少了方法选择和参数优化的不确定性 | 未提及具体的性能验证数据集规模或与其他方法的详细比较结果 | 解决单细胞RNA测序轨迹推断中分析方法选择不确定性的问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 轨迹推断方法 | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 2853 | 2025-10-06 |
Spatial Transcriptomic Analysis Reveals HDAC Inhibition Modulates Microglial Dynamics to Protect Against Ischemic Stroke in Mice
2025-Sep, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.70035
PMID:40415727
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析揭示HDAC抑制剂通过调节小胶质细胞动态发挥抗缺血性脑卒中保护作用 | 首次结合空间转录组学和3D形态重建技术，阐明HDAC抑制剂对小胶质细胞表型和空间分布的调控机制 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探究HDAC抑制剂调控小胶质细胞在缺血性脑卒中中的保护机制 | 小鼠缺血性脑卒中模型中的小胶质细胞 | 空间转录组学 | 缺血性脑卒中 | 空间转录组学，3D形态重建 | NA | 空间转录组数据，形态学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2854 | 2025-10-06 |
Spatial heterogeneity in glioblastoma: Decoding the role of perfusion
2025-Sep, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2025.189383
PMID:40614878
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综述 | 本文综述了胶质母细胞瘤中灌注驱动的空间异质性及其对免疫调节和治疗抵抗的影响 | 聚焦于灌注作为胶质母细胞瘤空间异质性的关键决定因素，系统阐述了其对肿瘤微环境和治疗抵抗的影响机制 | 作为综述文章，主要基于现有文献分析，缺乏原始实验数据验证 | 探讨灌注驱动的差异如何影响胶质母细胞瘤的瘤内异质性，特别关注免疫调节和治疗抵抗方面 | 胶质母细胞瘤及其肿瘤微环境，包括癌细胞、免疫细胞和其他基质细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 第三代基因组学、高分辨率代谢组学、单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2855 | 2025-10-06 |
Proteomic profiling of nasal fluids and serum for type 2 nasal polyps diagnosis
2025-Aug, Annals of allergy, asthma & immunology : official publication of the American College of Allergy, Asthma, & Immunology
DOI:10.1016/j.anai.2025.04.007
PMID:40280274
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研究论文 | 本研究通过蛋白质组学分析和机器学习框架开发了基于鼻液和血清蛋白质表达的无创诊断模型，用于2型慢性鼻窦炎伴鼻息肉的诊断 | 首次结合蛋白质组学与机器学习方法，基于鼻液和血清样本开发了2型鼻息肉的无创诊断模型，并识别出关键生物标志物 | 样本量相对有限（82例患者），需要更大规模的研究验证模型的普适性 | 系统评估鼻液和血清中蛋白质表达对2型慢性鼻窦炎伴鼻息肉的预测价值 | 82例慢性鼻窦炎伴鼻息肉患者 | 机器学习 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 | 邻近延伸分析、免疫组织化学、单细胞RNA测序、逆转录定量聚合酶链反应 | 机器学习（LASSO回归） | 蛋白质表达数据、RNA测序数据 | 82例患者 | NA | 单细胞RNA测序、蛋白质组学分析 | NA | NA |
| 2856 | 2025-10-06 |
CCR2+ monocytes promote memory CD8+ T-cell differentiation via membrane-bound TGF-β
2025-Aug, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-025-01299-2
PMID:40461701
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示了CCR2+单核细胞通过膜结合TGF-β促进记忆CD8+ T细胞分化的新机制 | 首次发现单核细胞通过细胞间接触和膜结合TGF-β依赖的方式促进记忆CD8 T细胞分化，揭示了CD8 T细胞命运决定的空间机制 | 研究主要聚焦于急性感染模型中的脾脏环境，其他组织或慢性感染中的机制尚不明确 | 探究急性感染期间效应和记忆CD8 T细胞命运决定的空间决定因素 | CD8 T细胞、单核细胞、树突状细胞 | 免疫学 | 感染性疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2857 | 2025-10-06 |
Integrative exome sequencing and machine learning identify MICB and interferon pathway genes as contributors to SSc risk
2025-Aug, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.05.009
PMID:40514331
|
研究论文 | 通过整合外显子组测序和机器学习方法，识别出MICB和干扰素通路基因是系统性硬化症的风险因素 | 开发了进化行动-机器学习框架，整合多种基因组学数据识别新的蛋白质编码变异和致病通路 | 研究主要基于高加索人群，需要在其他人群中验证 | 识别系统性硬化症的新的遗传风险因素和致病机制 | 系统性硬化症患者和健康对照 | 机器学习 | 系统性硬化症 | 外显子组测序, 单细胞RNA测序, 表达数量性状位点分析 | 机器学习 | 基因组数据, 转录组数据 | 发现队列2,559例患者和893例对照，验证队列9,846例患者和18,333例对照 | NA | 外显子组测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2858 | 2025-10-06 |
From roots to nodules: regulation of organogenesis in nitrogen-fixing symbiosis
2025-Aug, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2025.102755
PMID:40582138
|
综述 | 本文综述了固氮植物根瘤器官发生的分子调控机制及其与侧根发育的进化关系 | 通过比较根瘤与侧根发育的调控网络，揭示器官特异性进化的分子基础，并整合单细胞转录组等新兴技术 | 主要聚焦于豆科植物蝶形花亚科，可能不适用于其他固氮植物类群 | 探索固氮共生中根瘤器官发生的调控机制及其进化起源 | 固氮植物根瘤器官发育过程 | 植物发育生物学 | NA | 单细胞转录组学、空间转录组学、先进成像技术、系统基因组学 | NA | 基因表达数据、成像数据、进化数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2859 | 2025-10-06 |
The Critical Role of APOE+ Macrophages in the Immune Microenvironment and Prognosis of Lung Adenocarcinoma
2025-Aug, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70731
PMID:40736341
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了APOE+巨噬细胞在肺腺癌免疫微环境中的关键作用，并开发了相关的风险预测模型 | 首次系统阐明APOE+巨噬细胞通过MIF信号通路塑造免疫抑制微环境的机制，并开发了具有最高预后准确度的风险模型 | NA | 阐明APOE+巨噬细胞在肺腺癌免疫微环境中的免疫调节功能及临床意义 | 肺腺癌肿瘤微环境中的APOE+巨噬细胞 | 数字病理 | 肺癌 | 单细胞转录组测序, 多重免疫荧光分析, 机器学习 | RSF, Ridge | 单细胞转录组数据, 突变谱数据, 免疫组化数据 | 7个公共队列和3个前瞻性免疫治疗队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2860 | 2025-10-06 |
Lymph-node-derived stem-like but not tumor-tissue-resident CD8+ T cells fuel anticancer immunity
2025-Aug, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-025-02219-2
PMID:40730900
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和遗传小鼠模型系统解析了肿瘤和引流淋巴结中CD8+ T细胞的异质性与功能 | 发现淋巴结来源的干细胞样CD8+ T细胞而非肿瘤组织驻留细胞驱动抗肿瘤免疫，并揭示TGFβ在限制干细胞样T细胞丰度中的核心作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类癌症中的发现需要进一步验证 | 阐明不同类型CD8+ T细胞在肿瘤控制和免疫检查点阻断治疗中的相对贡献 | 肿瘤和肿瘤引流淋巴结中的细胞毒性T细胞 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 遗传小鼠模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |