单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 37403 篇文献,本页显示第 2841 - 2860 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
2841 2026-02-06
Selective modulation of murine intestinal M1 and M3 muscarinic receptor expression has divergent effects on specialized epithelial cells and body weight
2026-Feb-01, American journal of physiology. Cell physiology
研究论文 本研究通过选择性调控小鼠肠道M1和M3毒蕈碱受体的表达,探讨了其对特化上皮细胞分布和体重的影响 首次创建了条件性肠道上皮细胞MR和MR缺失的小鼠模型,并利用单细胞RNA测序揭示了肠道杯状细胞和簇细胞中MR表达的差异 研究主要基于小鼠模型,未涉及人类样本;体重比较先前多仅使用雄性小鼠,且常缺乏同窝对照 探究肠道上皮细胞中M1和M3毒蕈碱受体选择性缺失对特化上皮细胞分布和体重的调控作用 小鼠肠道上皮细胞,特别是杯状细胞和簇细胞 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 条件性敲除小鼠和对照小鼠的组织样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2842 2026-02-06
A novel stromal cell source of RANKL during sustained osteoclast activation in disuse osteoporosis
2026-Feb, The Journal of physiology
研究论文 本研究利用小鼠模型揭示了废用性骨质疏松症中,脂肪生成性CAR细胞是RANKL的新型细胞来源,并阐明了破骨细胞介导的骨吸收在疾病早期进展中的关键作用 首次发现并证实脂肪生成性C-X-C基序趋化因子配体12富集的网状(adipo-CAR)细胞是废用性骨质疏松中RANKL表达的特异性新型细胞来源,而非传统的成骨细胞或骨细胞 研究主要基于小鼠螺旋线固定模型,其结论在人体中的普适性有待进一步验证;单细胞测序分析聚焦于骨髓细胞,未全面涵盖所有骨微环境细胞类型 阐明废用性骨质疏松症的细胞与分子机制,特别是骨吸收持续增强的细胞来源和调控通路 使用螺旋线固定(SWI)模型的小鼠,重点研究其骨组织、骨髓细胞及特定的adipo-CAR细胞 骨生物学 骨质疏松症 单细胞RNA测序,转录组分析,RANKL命运图谱技术,抗体干预 NA 基因表达数据,测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2843 2026-02-06
Keratinocyte-Associated Biomarkers Reveal Pathogenic Mechanisms in Acne
2026-Feb, FASEB bioAdvances IF:2.5Q3
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序、基因共表达网络分析和机器学习算法,揭示了痤疮病变中角质形成细胞的异质性及其相关的生物标志物,并探索了潜在的治疗靶点 开发了一个整合的计算框架,结合了scRNA-seq、WGCNA和两种互补的机器学习算法(SVM-RFE、LASSO),首次系统地描绘了痤疮中角质形成细胞的转录程序和调控网络,并识别出六个具有高诊断准确性的角质形成细胞相关生物标志物 研究主要基于转录组数据,缺乏蛋白质水平的功能验证;识别出的生物标志物和药物再利用潜力需要在临床前和临床研究中进一步验证 阐明痤疮的致病机制,并识别潜在的诊断生物标志物和治疗靶点 痤疮病变组织 数字病理学 痤疮 单细胞RNA测序(scRNA-seq),基因共表达网络分析(WGCNA) SVM-RFE, LASSO 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2844 2026-02-06
Targeting LUM-mediated inflammatory cell communication and fibroblast apoptosis with SFI in Heart Failure
2026-Jan-30, SLAS technology IF:2.5Q3
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序、转录组学和机器学习,揭示了心力衰竭中LUM介导的炎症细胞通讯和成纤维细胞凋亡机制,并验证了参附注射液的保护作用 首次将LUM(Lumican)鉴定为心力衰竭中连接细胞凋亡、炎症和细胞通讯的关键枢纽基因,并阐明了参附注射液通过调控LUM/p38/p53轴发挥心脏保护作用的新机制 研究主要基于小鼠模型,人体临床验证尚不充分;单细胞测序样本量有限;LUM介导信号通路的上下游调控网络仍需进一步解析 阐明心力衰竭的病理微环境机制,探索参附注射液的心脏保护作用分子基础 心力衰竭小鼠模型、心脏组织细胞(特别是成纤维细胞和免疫细胞) 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、转录组学、机器学习 LASSO回归 单细胞转录组数据、批量转录组数据 未明确说明具体样本数量,使用小鼠心力衰竭模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2845 2026-02-06
Single-cell spatial transcriptomics uncovers niches that govern response to PD-1/PD-L1 blockade in cutaneous squamous cell carcinoma
2026-Jan-30, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究利用单细胞空间转录组学技术,揭示了皮肤鳞状细胞癌中六个不同的空间生态位,这些生态位能比PD-L1状态更准确地预测免疫治疗反应 首次在cSCC中应用单细胞空间转录组学识别出六个预测免疫治疗反应的空间生态位,超越了传统PD-L1生物标志物的预测能力 样本量相对较小(27例患者),且研究基于组织微阵列的1.7毫米组织核心,可能无法完全代表肿瘤异质性 探究皮肤鳞状细胞癌患者对PD-1/PD-L1阻断疗法反应差异的机制,并开发预测生物标志物 接受PD-1/PD-L1阻断治疗的晚期皮肤鳞状细胞癌患者肿瘤样本 数字病理学 皮肤鳞状细胞癌 单细胞空间转录组学 空间聚类分析、基因集富集分析、空间相关性分析 空间转录组数据 27例患者,来自两个II期临床试验的三个队列 NA 单细胞空间转录组学 NA NA
2846 2026-02-06
Ningxue shengban decoction regulates T-cell immune balance in immune thrombocytopenia via the bone marrow hematopoietic microenvironment
2026-Jan-29, Computational biology and chemistry IF:2.6Q2
研究论文 本研究探讨了宁血升板汤通过调节骨髓造血微环境中的T细胞免疫平衡来治疗免疫性血小板减少症的机制 首次结合网络药理学、单细胞RNA测序分析和分子对接技术,系统揭示了宁血升板汤通过多靶点(RELA、IKBKB、AKT1等)作用于造血干细胞,调控其向巨核细胞和T淋巴细胞分化的分子机制 研究主要在ITP小鼠模型中进行,其结论在人体中的适用性有待进一步临床验证 探索宁血升板汤治疗免疫性血小板减少症的作用机制 免疫性血小板减少症小鼠模型、骨髓造血干细胞、T淋巴细胞亚群、巨核细胞 数字病理学 免疫性血小板减少症 流式细胞术、HE染色、ELISA、质谱分析、网络药理学、单细胞RNA测序、拟时序分析、分子对接 NA 单细胞RNA测序数据、流式细胞数据、组织染色图像、血清细胞因子数据 ITP小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2847 2026-02-06
NRF2-COX2-PGE 2 axis drives immune cold tumors and predicts resistance to combination immunotherapy in hepatocellular carcinoma
2026-Jan-15, Hepatology (Baltimore, Md.)
研究论文 本研究通过整合小鼠模型和人类肝癌组织数据,揭示了NRF2-COX2-PGE2轴驱动免疫冷肿瘤微环境并介导Atezolizumab联合贝伐珠单抗耐药的新机制 首次在异质性肝癌小鼠模型中结合条形码技术、单细胞RNA测序和空间转录组学,系统鉴定了NRF2-COX2-PGE2轴作为免疫冷肿瘤和联合免疫治疗耐药的关键驱动因素,并发现血浆PGE2可作为非侵入性生物标志物 研究主要基于回顾性队列和动物模型,需要前瞻性临床试验进一步验证靶向该通路的治疗策略 鉴定驱动免疫冷肿瘤微环境和Atezolizumab联合贝伐珠单抗耐药的肿瘤内在机制 肝癌小鼠模型、人类肝癌组织样本、接受Atez/Bev治疗的晚期肝癌患者队列 数字病理学 肝癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序, 条形码分析 NA RNA测序数据, 空间转录组数据, 临床数据 小鼠模型、549名Atez/Bev治疗患者、199名手术切除患者、247名IMbrave150/GO30140试验患者 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq NA NA
2848 2026-02-06
Mapping clinical CAR-T cells: insights from scRNA-seq
2026-Jan-15, Trends in molecular medicine IF:12.8Q1
综述 本文综述了利用单细胞RNA测序技术分析临床CAR-T细胞的研究,重点关注T细胞耗竭、细胞毒性、记忆、扩增、克隆多样性及细胞因子等特征 首次系统性地总结了已发表的利用scRNA-seq分析临床CAR-T细胞的研究,并整合了其在T细胞耗竭、细胞毒性、记忆、扩增、克隆多样性及细胞因子等多个维度的发现 作为一篇综述文章,其局限性在于未提供新的实验数据,且依赖于现有已发表研究的质量和覆盖范围 总结和评估单细胞RNA测序在临床CAR-T细胞研究中的应用、发现及未来方向 临床CAR-T细胞 自然语言处理 NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2849 2026-02-06
Impaired Mitophagy-Induced Apoptosis of Gingival Fibroblasts Exacerbates Diabetic Periodontitis Via THBS-1/CD36-Dependent Macrophage Activation
2026-Jan-14, Inflammation IF:4.5Q2
研究论文 本研究揭示了糖尿病牙周炎中牙龈成纤维细胞线粒体自噬受损导致凋亡,并通过THBS-1/CD36轴激活巨噬细胞,加剧炎症和组织破坏的机制 首次通过单细胞测序分析发现糖尿病牙龈组织中牙龈成纤维细胞的凋亡激活与线粒体失调密切相关,并阐明了THBS-1/CD36依赖的巨噬细胞激活新通路 研究主要基于体外和动物模型,临床样本验证有限,且THBS-1/CD36轴在其他细胞类型中的作用未充分探索 探究高血糖如何通过线粒体功能障碍和细胞间通讯加剧糖尿病牙周炎的炎症反应 糖尿病牙周炎患者的牙龈组织、牙龈成纤维细胞和巨噬细胞 NA 糖尿病牙周炎 单细胞测序、分子建模、基因沉默 NA 单细胞测序数据、分子相互作用数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
2850 2026-02-06
Molecular characterization of directly reprogrammed neurons from human fibroblasts using single cell RNA sequencing
2026-Jan-09, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,分析了通过PTBP1敲降从人皮肤成纤维细胞直接重编程为神经元的分子特征和细胞异质性 首次在人类细胞中应用单细胞RNA测序技术系统解析直接神经元重编程过程中的细胞异质性和分子转变轨迹,并开发了适用于单样本数据的统计稳健性分析框架 研究仅基于单个时间点(第14天)的样本进行分析,未涵盖重编程全过程的动态变化 探究人类成纤维细胞直接重编程为神经元的分子机制和细胞状态转变 经过PTBP1敲降处理的人皮肤成纤维细胞及其重编程产生的神经元 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序 伪时间分析 单细胞转录组数据 第14天处理后的单细胞样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2851 2026-02-06
Boron neutron capture therapy preserves immune cells and induces robust anti-tumour immunity in preclinical mouse model
2026-Jan-08, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究比较了硼中子俘获疗法与X射线照射对免疫细胞的影响,揭示了BNCT通过诱导免疫原性肿瘤细胞死亡和重塑肿瘤微环境来增强抗肿瘤免疫的机制 首次在临床前模型中系统比较BNCT与传统X射线放疗对免疫系统的差异影响,并利用单细胞RNA测序技术解析BNCT重塑肿瘤微环境的机制 研究仅基于小鼠肿瘤模型,尚未在人体中进行验证;BNCT的长期免疫效应仍需进一步探索 探究硼中子俘获疗法的免疫学机制及其与传统放疗的差异 小鼠肿瘤模型中的免疫细胞和肿瘤微环境 肿瘤免疫学 癌症 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠肿瘤模型(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
2852 2026-02-06
Spatial information matters: are traditional imputation methods effective for spatial transcriptomics data?
2026-Jan-07, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 本文系统评估了七种先进的插补方法在五种新兴空间转录组学平台上的表现,并提出了一种结合空间信息的新方法SpaMean-Impute以更有效地处理丢失值 首次系统评估了现有先进插补方法在新型空间转录组学技术数据上的表现,并提出了一种专门针对空间转录组学数据、结合空间信息的新插补方法SpaMean-Impute,该方法在多项评估指标上优于现有方法且计算效率更高 研究主要基于23个数据集进行评估,可能未覆盖所有类型的空间转录组学数据;新方法SpaMean-Impute虽然表现优异,但其在不同生物学场景中的普适性仍需进一步验证 评估现有插补方法在空间转录组学数据上的有效性,并开发一种专门针对此类数据的新插补方法 空间转录组学数据 空间转录组学 NA 空间转录组学技术 NA 空间转录组学数据 23个数据集 NA 空间转录组学 NA 五种新兴空间转录组学平台
2853 2026-02-06
PathCLAST: pathway-augmented contrastive learning with attention for interpretable spatial transcriptomics
2026-Jan-07, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 提出PathCLAST框架,通过整合基因表达、病理图像和通路图进行双模态对比学习,实现可解释的空间转录组学分析 首次结合通路结构和空间匹配的病理学图像,通过双模态对比学习实现准确且生物学可解释的空间域识别 未在摘要中明确提及 开发可解释的空间转录组学方法,以理解肿瘤进化和微环境相互作用 空间转录组学数据,包括基因表达、病理图像和通路图 数字病理学 肿瘤 空间转录组学 对比学习,注意力机制 基因表达数据,病理图像,通路图 多个公共数据集,具体样本数量未在摘要中提及 NA 空间转录组学 NA NA
2854 2026-02-06
sc-eQTL unveil immunogenetic architecture of polycystic ovary syndrome
2026-Jan-06, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过整合GWAS数据和多种免疫细胞的单细胞表达数量性状位点分析,揭示了多囊卵巢综合征在细胞水平的遗传和免疫机制 首次在单细胞分辨率下系统解析PCOS的免疫遗传结构,识别出被批量eQTL分析掩盖的T细胞亚群和NK细胞特异性因果基因 研究主要基于已有数据集的二次分析,缺乏实验验证;样本来源和种群特异性可能影响结果普适性 阐明多囊卵巢综合征的遗传基础和免疫细胞特异性机制 多囊卵巢综合征患者相关的遗传变异和免疫细胞 计算生物学 多囊卵巢综合征 全基因组关联研究,单细胞表达数量性状位点分析,单细胞RNA测序 统计遗传学模型,共定位分析 基因组数据,单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2855 2026-02-06
Novel insights into meningioma brain invasion with spatial transcriptomic profiling
2026-Jan-04, Acta neuropathologica communications IF:6.2Q1
研究论文 本研究利用空间转录组学技术探究脑膜瘤脑侵袭的分子特征,重点关注肿瘤细胞和免疫细胞在脑-瘤边界的基因表达变化 首次应用空间转录组学分析脑膜瘤脑侵袭的分子机制,揭示了KRT18、CSF1R等关键基因在侵袭过程中的空间特异性表达模式 样本量较小(16例肿瘤),需要更大规模研究验证发现;空间转录组学分辨率有限,无法达到单细胞水平 探究脑膜瘤脑侵袭的分子机制及其与预后的关系 脑膜瘤患者肿瘤组织(包括侵袭性和非侵袭性病例) 数字病理学 脑膜瘤 空间转录组学 NA 空间转录组数据 16例脑膜瘤肿瘤(8例侵袭性,8例非侵袭性) NanoString 空间转录组学 GeoMx Digital Spatial Profiling NanoString GeoMx数字空间分析平台,使用1800基因panel
2856 2026-01-04
Exploring molecular mechanisms of radioactive iodine therapy in thyroid cancer using single-cell RNA sequencing data
2026-Jan-03, Discover oncology IF:2.8Q2
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
2857 2026-02-06
Integrated experimental and computational workflows for single-cell transcriptomics in plants
2026-Jan-03, Plant methods IF:4.7Q1
研究论文 本研究通过系统性地基准测试玉米中的批量与单细胞转录组工作流程,建立了一个优化的集成框架,以解决植物单细胞转录组学中的组织制备、核分离和转录组质量挑战 开发了改进的批量RNA-seq协议作为单细胞数据集的参考,比较了原生质体、新鲜核和冷冻核三种输入类型在组织中的转录组谱可比性,并利用批量RNA-seq提供额外生物背景以验证单细胞分析结果 所有实验数据均来自玉米,可能限制了在其他植物物种中的直接适用性 优化植物单细胞转录组学的实验和计算工作流程,以解决细胞异质性解析中的挑战 玉米组织中的细胞类型,包括原生质体、新鲜核和冷冻核 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
2858 2026-02-06
Comprehensive profiling of lactylation-associated genes in pulmonary hypertension through bulk and single-cell RNA sequencing integration
2026-Jan-03, Respiratory research IF:4.7Q1
研究论文 本研究通过整合bulk和单细胞RNA测序数据,全面分析了肺动脉高压中乳酰化相关基因,并鉴定出LCP1作为核心诊断标志物 首次在肺动脉高压中整合bulk和单细胞RNA测序数据来系统研究乳酰化相关基因,并揭示了免疫细胞中的乳酰化水平变化 研究主要基于生物信息学分析,实验验证仅限于体外细胞模型,缺乏更深入的体内功能验证 探究乳酰化在肺动脉高压发生发展中的作用及其分子机制 肺动脉高压患者和对照组的bulk RNA-seq及单细胞RNA-seq数据,以及缺氧诱导的肺动脉平滑肌细胞 生物信息学 肺动脉高压 bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, RT-PCR, western blot NA RNA测序数据, 基因表达数据 来自多个数据集(GSE113439, GSE186996, GSE210248)的肺动脉高压患者和对照组样本 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
2859 2026-02-06
SLPI⁺ AT2-Like Cells Orchestrate Lung Adenocarcinoma Invasion via Wnt Pathway Activation and Stromal Crosstalk in a Spatially Defined Margin Niche
2026-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过整合空间转录组学和单细胞RNA测序数据,揭示了肺腺癌侵袭前沿中一种表达SLPI的AT2样细胞亚群及其与肿瘤微环境中其他细胞的相互作用机制 首次在肺腺癌侵袭边缘鉴定出表达SLPI的AT2样细胞亚群,并阐明了其通过Wnt通路激活和与基质细胞(如MRC1+巨噬细胞和肌成纤维细胞)的空间协同作用驱动肿瘤侵袭的机制 研究主要基于转录组学数据,功能验证和体内实验可能有限,且样本来源和数量未在摘要中明确说明 探究肺腺癌侵袭过程中的关键细胞类型、空间分布及其功能相互作用 肺腺癌肿瘤组织,重点关注侵袭边缘的肿瘤细胞和肿瘤微环境细胞 数字病理学 肺癌 空间转录组学,单细胞RNA测序 NA 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据 NA NA 空间转录组学,单细胞RNA-seq NA NA
2860 2026-02-06
TMEM131-Mediated Soluble TRAIL Triggered Type II Alveolar Epithelial Cell Senescence in Radiation-Induced Lung Injury
2026-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究揭示了TMEM131介导的可溶性TRAIL通过抑制线粒体自噬导致II型肺泡上皮细胞衰老,在辐射诱导的肺损伤发病机制中起关键作用 首次发现TMEM131介导TRAIL从内质网向高尔基体的运输过程,并阐明可溶性TRAIL通过死亡受体5激活mTOR通路抑制线粒体自噬的新机制 研究主要基于小鼠模型,临床样本验证相对有限;TMEM131介导的运输机制在人体中的普适性需进一步验证 阐明辐射诱导肺损伤的发病机制并寻找潜在治疗靶点 辐射诱导肺损伤小鼠模型、II型肺泡上皮细胞、临床患者血浆样本 单细胞组学 肺损伤 单细胞RNA测序, 定量蛋白质组学, 免疫沉淀质谱 基因敲除小鼠模型 (Trail;Sftpc-Cre) 转录组数据, 蛋白质组数据, 单细胞测序数据, 免疫荧光图像 未明确样本数量,包含小鼠模型和临床患者样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
回到顶部