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当前共找到 37592 篇文献,本页显示第 2821 - 2840 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
2821 2026-02-13
Single-cell transcriptomic analysis of bloodstream Trypanosoma brucei reconstructs cell cycle progression and developmental quorum sensing
2021-09-06, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究利用单细胞转录组学分析布氏锥虫血液阶段从增殖型'细长体'向传播型'粗短体'的发育过程,重构了细胞周期进展和发育群体感应 首次通过单细胞转录组学在体外模型中系统解析了布氏锥虫异步发育过程中的转录动态和调控因子,并定位了粗短体细胞周期退出的精确阶段 研究基于体外诱导分化模型,可能无法完全模拟宿主体内的自然发育环境 解析布氏锥虫血液阶段发育分化的转录调控机制和细胞周期动态 布氏锥虫(Trypanosoma brucei) 单细胞组学 寄生虫感染(锥虫病) 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞转录组数据 8,599个寄生虫细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2822 2026-02-13
Application of single-cell transcriptomics to kinetoplastid research
2021-09, Parasitology IF:2.1Q2
综述 本文综述了单细胞转录组学在动质体寄生虫研究中的应用,包括技术选择、样本制备和数据分析挑战 首次系统性地总结了单细胞转录组学在动质体寄生虫研究中的潜力,并提供了实验设计和数据分析的实用指导 主要基于现有文献综述,缺乏原创实验数据,且技术应用仍处于早期阶段 探讨单细胞转录组学技术在动质体寄生虫研究中的应用潜力和方法学 动质体寄生虫(包括利什曼原虫、锥虫等)及其宿主相互作用 单细胞组学 寄生虫病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2823 2026-02-12
Consensus machine learning identifies cell death gene signature for carotid artery stenosis diagnosis
2026-Feb-20, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过整合多组学数据与机器学习方法,开发了一个基于细胞死亡基因的共识诊断分类器,用于颈动脉狭窄的早期检测 首次整合了内部RNA-seq队列与八个公共数据集,结合十种机器学习算法构建了105个模型配置,并识别出IRF1、FYCO1和FDFT1组成的诊断签名,通过单细胞测序和功能实验验证了FYCO1的下调及其在自噬和炎症信号中的作用 研究依赖于多个公共数据集,可能存在批次效应或数据异质性,且样本量相对有限(共696个样本),需要进一步在独立队列中验证MLDS的临床适用性 开发一种分子工具以改善颈动脉狭窄的早期诊断 颈动脉狭窄患者样本及相关分子数据 机器学习 心血管疾病 RNA-seq, 蛋白质组学分析, RT-qPCR, 单细胞测序, 基因沉默实验 逻辑回归, 共识机器学习(结合十种算法) RNA-seq数据, 蛋白质组数据, 单细胞测序数据, 实验验证数据 696个样本(整合一个内部队列和八个公共数据集) NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学(未明确指定,但涉及单细胞分析) NA NA
2824 2026-02-12
Pre-operative risk assessment of HCC recurrence in liver transplant recipients by non-invasive detection of pre-existing genetic lesions
2026-Feb-11, Clinical and molecular hepatology IF:14.0Q1
研究论文 本研究通过液体活检开发了一种基于无细胞DNA(cfDNA)拷贝数变异(CNA)特征的术前风险分层模型,用于预测肝细胞癌(HCC)患者肝移植后的复发风险 整合了cfDNA CNA特征与单细胞转录组数据,揭示了复发相关的cfDNA来源于肿瘤内特定恶性细胞亚群,并开发了结合传统临床因素和cfDNA CNA特征的ZJU Criteria风险预测工具 研究样本量相对有限(260例),且依赖于多中心数据,可能存在异质性 开发一种基于液体活检的术前风险分层模型,以预测HCC患者肝移植后的复发风险 260例HCC患者,包括临床数据、血浆cfDNA、匹配的肿瘤和非肿瘤组织 数字病理学 肝细胞癌 低覆盖度全基因组测序、全外显子测序、单核RNA测序、空间转录组学 风险分层模型(ZJU Criteria) 基因组数据、转录组数据、空间数据 260例HCC患者 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 全基因组测序, 全外显子测序 NA NA
2825 2026-02-12
Osteoarthritis and chondrosarcoma: Bioinformatics analysis based on single-cell RNA sequencing and molecular docking
2026-Feb-11, Advances in clinical and experimental medicine : official organ Wroclaw Medical University IF:2.1Q3
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和分子对接技术,分析了骨关节炎和软骨肉瘤的细胞异质性和分子机制,以识别潜在的治疗靶点 结合单细胞RNA测序和分子对接方法,首次在单细胞水平上比较骨关节炎和软骨肉瘤的细胞亚群分布和基因表达差异,并探索天然化合物与DAP3蛋白的相互作用 研究依赖于公开的单细胞RNA测序数据集,可能受数据质量和样本来源限制;分子对接结果为计算模拟,需实验验证 探究骨关节炎和软骨肉瘤的细胞异质性和分子机制,识别潜在治疗靶点 骨关节炎和软骨肉瘤的细胞亚群,包括神经元、软骨细胞和免疫细胞 生物信息学 骨关节炎,软骨肉瘤 单细胞RNA测序,分子对接 t-SNE,UMAP 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2826 2026-02-12
Exploring adenoid basal carcinoma to squamous cell carcinoma of the uterine cervix transformation using spatial transcriptomics
2026-Feb-11, The Journal of pathology IF:5.6Q1
研究论文 本研究利用空间转录组学探索了子宫颈腺样基底癌向鳞状细胞癌转化的分子机制 首次使用数字空间谱分析技术,在混合肿瘤中识别出区分过渡巢与其他亚型的关键差异表达基因CK13和SCCA2,并揭示了BCL-2在基底样细胞中的表达模式 样本量有限,仅对4例病例进行了DSP分析,未来需要更大规模的研究来指导临床决策 阐明子宫颈腺样基底癌与鳞状细胞癌之间的转化关系,以指导有效的治疗策略 20例子宫颈腺样基底癌病例,其中多数伴有鳞状细胞癌、过渡巢和高级别鳞状上皮内病变 数字病理学 宫颈癌 空间转录组学,免疫组织化学 NA 空间转录组数据,组织学图像 20例ABC病例,其中4例进行了DSP分析 NA 空间转录组学 NA 数字空间谱分析
2827 2026-02-12
Multi-omics characterization of benzo[a]pyrene toxicity networks identifies SERPINE1 and STK3 as prognostic biomarkers and therapeutic targets in head and neck squamous cell carcinoma
2026-Feb-11, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
研究论文 本研究通过多组学分析揭示了苯并[a]芘在头颈鳞状细胞癌中的毒性网络,并鉴定出SERPINE1和STK3作为预后生物标志物和治疗靶点 首次系统整合了机器学习、空间转录组学、单细胞RNA测序和分子对接模拟,全面解析了BaP诱导的毒性分子网络,并识别出核心毒性靶点 研究主要基于公共数据库和计算分析,缺乏体内实验验证;样本来源和数量可能限制结论的普适性 阐明苯并[a]芘在头颈鳞状细胞癌中的毒性机制,并寻找预后生物标志物和治疗靶点 头颈鳞状细胞癌患者样本及相关分子数据 生物信息学 头颈鳞状细胞癌 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 基因集富集分析, 分子对接, 分子动力学模拟 随机森林, 支持向量机 基因表达数据, 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 GSE30784数据集和TCGA-HNSC队列(具体样本数未明确说明) NA 空间转录组学, 单细胞RNA测序 NA NA
2828 2026-02-12
Distinct mural cells and fibroblasts drive fibrochondrogenesis in retrodiscal tissue following temporomandibular joint disc displacement
2026-Feb-10, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究利用猪模型和单细胞RNA测序技术,揭示了颞下颌关节盘前移位后盘后组织适应性重塑的细胞和分子机制,并筛选出潜在治疗化合物 首次通过单细胞RNA测序识别了盘后组织重塑中的关键成纤维细胞亚群FB2和壁细胞亚群MC4,并揭示了它们通过FGF2/BMP5信号通路的互作机制 研究基于猪模型,结果向人类临床转化的有效性需进一步验证 探究颞下颌关节盘前移位后盘后组织适应性重塑的细胞动力学和分子机制 猪颞下颌关节盘前移位模型中的盘后组织 单细胞组学 颞下颌关节疾病 单细胞RNA测序 P-NET, Seurat 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2829 2026-02-12
Cellular and transcriptional trajectories of neural fate specification in sea anemone uncover two modes of adult neurogenesis
2026-Feb-10, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究结合报告基因追踪和单细胞转录组学,揭示了海葵中成年神经发生的两种不同细胞谱系和转录轨迹 首次在海葵中鉴定出成年神经发生的两种独立机制:多能祖细胞直接分化为肽能神经元,以及刺细胞通过转录独特的中间阶段逐步成熟 研究仅限于海葵这一特定物种,其发现是否普遍适用于其他刺胞动物或更广泛的动物类群尚需验证 探究刺胞动物成年神经发生的细胞谱系和转录调控机制 海葵(Nematostella vectensis)的神经细胞 单细胞组学 NA 单细胞转录组测序 NA 单细胞转录组数据 未明确说明样本数量 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2830 2026-02-12
The single-cell transcriptional landscape of the pediatric cystic fibrosis lung from minimally invasive respiratory specimens
2026-Feb-10, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了儿童囊性纤维化肺部存在以中性粒细胞为主的失调性炎症和促炎性气道上皮细胞状态 首次在儿童囊性纤维化患者中,利用微创呼吸道标本进行单细胞转录组分析,揭示了疾病早期的共同病理程序 样本量较小(仅包含一名婴儿和一名青少年),且为观察性研究,难以确定因果关系 探究儿童囊性纤维化肺部的细胞组成、功能和细胞间通讯的异常变化 儿童囊性纤维化患者的呼吸道标本 单细胞转录组学 囊性纤维化 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 2名儿童囊性纤维化患者(一名婴儿和一名青少年) NA 单细胞RNA-seq NA NA
2831 2026-02-12
Identifying 3D signal overlaps in spatial transcriptomics data with ovrlpy
2026-Feb-10, Nature biotechnology IF:33.1Q1
研究论文 本文介绍了一种名为ovrlpy的计算工具,用于识别空间转录组学数据中的三维信号重叠,以解决细胞分割中的空间双重问题 开发了ovrlpy工具,首次通过分析三维转录本定位来识别重叠细胞、组织折叠和不准确的细胞分割 NA 解决成像空间转录组学中细胞分割在垂直维度上的空间双重问题,提高转录本分配的准确性 空间转录组学数据中的三维信号重叠 空间转录组学 NA 成像空间转录组学 NA 空间转录组学数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
2832 2026-02-12
Aging-induced decrease in progenitor B cells enhances the osteoclastogenesis of bone marrow macrophages via ROS-activated Fos/CCL3 signaling‌ pathway
2026-Feb-10, Immunity & ageing : I & A IF:5.2Q1
研究论文 本研究揭示了衰老过程中骨髓微环境中ROS水平升高导致祖B细胞减少,进而通过激活Fos/CCL3信号通路促进破骨细胞生成的新机制 首次通过单细胞多组学整合分析,阐明了衰老骨髓微环境中祖B细胞减少通过ROS激活的Fos/CCL3信号轴促进破骨细胞生成的分子机制 研究主要基于SAMP6小鼠模型,人体验证尚需进一步研究;体外细胞实验体系可能无法完全模拟体内复杂的骨髓微环境 探究免疫细胞变化在老年性骨质疏松症发生发展中的分子机制 SAMP6衰老加速小鼠、SAMR1对照小鼠、BaF3细胞系、RAW 264.7细胞系 单细胞组学 老年性骨质疏松症 单细胞RNA测序、转录组测序、流式细胞术、多色免疫荧光、多重细胞因子分析 NA 单细胞转录组数据、转录组数据、流式细胞数据、影像数据 SAMP6与SAMR1小鼠模型,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
2833 2026-02-12
Sustainable Cultivation of Rare and Endangered Medicinal Plant Multicellular Spheroids Producing Bioactive Therapeutics for Alcohol-Related Liver Disease Therapy
2026-Feb-10, Advanced healthcare materials IF:10.0Q1
研究论文 本研究开发了一种基于多细胞球体的培养策略,利用药用植物细胞高效生产生物活性代谢物,以濒危物种雪莲为例,并评估其在酒精相关肝病治疗中的潜力 首次采用多细胞球体培养策略可持续生产濒危药用植物的生物活性代谢物,结合单细胞转录组学和网络药理学系统解析其药理作用 研究主要基于体外和小鼠模型,尚未进行人体临床试验,且代谢物生产的长期稳定性和规模化可行性需进一步验证 开发可持续的生物制造方法,生产濒危药用植物的生物活性化合物,并探索其在酒精相关肝病治疗中的应用 雪莲(Saussurea involucrata)植物细胞及其衍生的次级代谢物 植物生物技术 酒精相关肝病 单细胞转录组学、超高效液相色谱-质谱联用、网络药理学 NA 转录组数据、代谢组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2834 2026-02-12
Inflammatory cytokines mediate thoracic aortic aneurysm formation via plasma metabolites: A two-step Mendelian randomization and single cell sequencing-based investigation
2026-Feb-06, Medicine IF:1.3Q2
研究论文 本研究通过孟德尔随机化和单细胞测序分析,揭示了炎症细胞因子通过血浆代谢物介导胸主动脉瘤形成的因果关联 首次结合双向两样本孟德尔随机化、两步孟德尔随机化中介分析和单细胞测序技术,系统性地研究了炎症细胞因子、血浆代谢物与胸主动脉瘤风险之间的因果关系及潜在机制 研究结果需要在更多样化的人群中进行验证,且中介分析的机制有待进一步实验阐明 阐明炎症细胞因子、血浆代谢物与胸主动脉瘤风险之间的潜在因果关联及作用机制 炎症细胞因子、血浆代谢物、胸主动脉瘤 生物信息学 心血管疾病 孟德尔随机化分析,单细胞测序 逆方差加权法 基因组关联研究数据,单细胞测序数据 炎症细胞因子数据涉及14,824人,血浆代谢物数据涉及8,299人,胸主动脉瘤数据涉及385,857人 NA 单细胞测序 NA NA
2835 2026-02-12
Identification and genetic validation of potential therapeutic targets for pulmonary hypertension through multi-omics causal inference
2026-Feb-06, Medicine IF:1.3Q2
研究论文 本研究采用多组学因果推断方法,系统识别了与肺动脉高压(PH)存在因果关系的循环蛋白,为药物开发提供了遗传学验证的候选靶点 首次将全蛋白质组孟德尔随机化(MR)方法应用于PH研究,整合大规模血浆蛋白质组数量性状位点(pQTL)数据和PH全基因组关联研究(GWAS)数据,并通过多层分析流程(蛋白质组MR、转录组MR、基于汇总数据的MR)和严格的贝叶斯共定位分析进行验证 研究依赖于已公开的汇总统计数据,无法直接验证蛋白质水平与PH表型之间的直接因果关系;样本量(2047例病例,8301例对照)虽较大,但对于某些罕见变异可能仍不足;功能机制验证主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证 通过多组学因果推断识别和遗传验证肺动脉高压的潜在治疗靶点 循环蛋白(4148种蛋白质)与肺动脉高压(PH)之间的因果关系 生物信息学 肺动脉高压 孟德尔随机化(MR)、全基因组关联研究(GWAS)、血浆蛋白质组数量性状位点(pQTL)分析、单细胞转录组学、表型组范围关联研究 孟德尔随机化模型、贝叶斯共定位分析 基因组数据、蛋白质组数据、转录组数据 2047例PH病例,8301例对照 NA 全基因组关联研究(GWAS)、血浆蛋白质组学、单细胞转录组学 NA NA
2836 2026-02-12
The Sixth Annual Symposium of the Midwest Aging Consortium
2026-Feb-05, The journals of gerontology. Series A, Biological sciences and medical sciences
会议记录 本文记录了2025年4月在梅奥诊所举行的中西部老龄化联盟第六届年度研讨会,重点展示了老龄化研究中的跨学科合作、关键机制探索及前沿方法应用 强调区域合作平台(MAC)在促进老龄化研究转化方面的持续影响力,并集中展示单细胞转录组学、空间转录组学等前沿方法在组织特异性衰老研究中的应用 NA 促进老龄化研究的跨学科合作与临床转化 老龄化研究人员(包括学员和早期职业研究者)及其研究成果 NA 老年疾病 单细胞转录组学、空间转录组学、代谢组学、类器官培养 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
2837 2026-02-12
Metabolic surgery mitigates early kidney injury in obese youth with diabetes by suppressing mTORC1/JAK-STAT signaling
2026-Feb-03, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 本研究探讨了垂直袖状胃切除术(VSG)对肥胖青少年2型糖尿病患者肾脏结构和分子变化的影响 通过单细胞RNA测序技术揭示VSG后肾脏近端小管和髓袢升支粗段细胞的代谢通路变化,并结合循环蛋白质组学数据关联JAK-STAT信号通路 样本量较小(仅5对肾脏活检样本),且依赖独立队列(Teen-LABS)进行验证 探究代谢手术对肥胖青少年2型糖尿病患者早期肾损伤的缓解机制 患有2型糖尿病和严重肥胖的青少年 数字病理学 糖尿病肾病 单细胞RNA测序(scRNAseq)、代谢分析、组织学评估、循环蛋白质组学 NA 肾脏活检样本、代谢参数、蛋白质组学数据 5对VSG前后的肾脏活检样本(来自IMPROVE-T2D队列),以及64名青少年肥胖患者(来自Teen-LABS队列) NA 单细胞RNA测序 NA NA
2838 2026-02-12
PIK3CA-related overgrowth spectrum (PROS) zebrafish models reveal pan-lineage developmental dysregulation
2026-Feb-02, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过构建PIK3CA相关过度生长谱系(PROS)的斑马鱼镶嵌模型,揭示了突变细胞在早期发育中通过非细胞自主机制导致跨谱系发育失调的机制 首次在活体斑马鱼模型中可视化PROS突变细胞的影响,并利用单细胞转录组学揭示了突变细胞虽占少数却能引起全局性细胞命运改变和基因表达异常 斑马鱼模型可能无法完全模拟人类PROS的所有病理特征,且机制研究仍需进一步验证 探究PIK3CA突变在PROS中导致过度生长的非细胞自主机制 斑马鱼胚胎和幼虫 发育生物学 过度生长谱系疾病 单细胞转录组学 斑马鱼镶嵌模型 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2839 2026-02-12
Rare TRAF5 coding variants in systemic lupus erythematosus patients aggravate pulmonary hypertension via endothelial dysfunction
2026-Feb-02, Innovation (Cambridge (Mass.))
研究论文 本研究通过全外显子测序和基因负荷分析,发现TRAF5罕见编码变异与系统性红斑狼疮相关肺动脉高压的发病机制相关,并通过动物模型验证了其通过内皮功能障碍加重疾病 首次在系统性红斑狼疮相关肺动脉高压患者中鉴定出TRAF5罕见编码变异,并通过单细胞RNA测序揭示了其在动脉内皮细胞中通过BMP/TGF-β信号通路诱导功能障碍的新机制 研究样本量相对有限,且主要基于中国人群的CSTAR队列,结果在其他人群中的普适性有待验证 探究系统性红斑狼疮相关肺动脉高压的遗传发病机制,并寻找潜在治疗靶点 系统性红斑狼疮患者(包括伴和不伴肺动脉高压者)、健康对照、以及TRAF5基因敲除和过表达的转基因小鼠模型 遗传学与分子生物学 系统性红斑狼疮与肺动脉高压 全外显子测序、单细胞RNA测序、基因敲除与过表达动物模型 基因负荷分析、转基因小鼠模型 基因组测序数据、单细胞转录组数据、动物表型数据 SLE-PAH患者241例,SLE-nonPAH患者736例,健康对照996例,以及转基因小鼠模型 NA 全外显子测序, 单细胞RNA测序 NA NA
2840 2026-02-12
Generating and characterizing human telencephalic brain organoids from stem cell-derived single neural rosettes
2026-Feb, Nature protocols IF:13.1Q1
研究论文 本文开发了一种从干细胞衍生的单个神经玫瑰花结生成人端脑类器官的方法 使用单个神经玫瑰花结生成类器官,模拟体内神经组织发育,提供一致且可重复的细胞组成,并实现功能成熟神经元的预测性组织 协议完成需5-6个月,且需要细胞培养经验 研究人端脑中不同神经细胞的规范与组织,以及模拟与神经网络紊乱相关的神经发育障碍 人端脑类器官,源自干细胞衍生的单个神经玫瑰花结 数字病理学 神经发育障碍 单细胞RNA测序,免疫组织化学,切片膜片钳电生理学 NA RNA序列数据,图像数据,电生理数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
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