单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 38047 篇文献，本页显示第 28261 - 28280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 28261 | 2024-08-07 |
Integration of single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics to reveal the glioblastoma heterogeneity
2022, F1000Research
DOI:10.12688/f1000research.126243.2
PMID:36875988
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review | 本文综述了通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示的胶质母细胞瘤异质性的当前知识 | 强调了未来研究方向，以填补关于患者性别对疾病结果影响的知识的空白 | 目前的研究主要集中在揭示胶质母细胞瘤异质性的总体情况，未进一步探讨性别差异的影响 | 总结当前关于胶质母细胞瘤异质性的知识，并强调未来研究方向 | 胶质母细胞瘤的遗传、免疫学和性别依赖差异 | digital pathology | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 28262 | 2024-08-07 |
Biwhitening Reveals the Rank of a Count Matrix
2022, SIAM journal on mathematics of data science
IF:1.9Q1
DOI:10.1137/21m1456807
PMID:37576699
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研究论文 | 本文提出了一种名为Biwhitening的简单方法，用于估计包含计数随机变量的数据矩阵的秩，特别是在泊松随机矩阵的情况下 | 该方法通过同时缩放数据矩阵的行和列，使得相应的噪声谱与标准的Marchenko-Pastur定律一致，从而无需任何先验知识即可估计信号矩阵的秩 | NA | 研究如何在没有先验知识的情况下估计受污染数据矩阵的秩 | 泊松随机矩阵及其扩展到满足均值和方差之间二次关系的分布族 | 机器学习 | NA | Sinkhorn-Knopp算法 | NA | 计数矩阵 | 涉及单细胞RNA测序(scRNA-seq)、高通量染色体构象捕获(Hi-C)和文档主题建模等多个实际数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 28263 | 2024-08-05 |
Analysis of single-cell sequencing results of an elderly patient with myeloid leukemia reveals high expression of multiple oncogenes in monocytes and hematopoietic stem cells
2023-Dec, Hematology (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1080/16078454.2023.2240129
PMID:37535066
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研究论文 | 本研究分析了一名老年急性髓性白血病患者的单细胞基因组测序结果 | 该研究发现单核细胞和造血干细胞中多种癌基因的高表达，对急性髓性白血病的进展和治疗提供新见解 | 研究只针对一例老年急性髓性白血病患者，样本量较小，结果可能不具普遍性 | 分析老年急性髓性白血病患者的基因序列以提供新的治疗思路 | 一名64岁的急性髓性白血病患者的外周血和骨髓细胞 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 1名患者的外周血和骨髓细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 28264 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics reveals prominent expression of IL-14, IL-18, and IL-32 in psoriasis
2023-11, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202250354
PMID:37540729
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组分析揭示了牛皮癣中IL-14、IL-18和IL-32的重要表达。 | 首次在牛皮癣的不同细胞类型中部分确定IL-14、IL-18和IL-32的突出表达。 | 样本量仅限于八名患者，可能影响结果的普遍性。 | 深入描述牛皮癣中免疫细胞及其炎症介质的类型。 | 本研究的对象为牛皮癣患者的皮肤损伤及其相关免疫细胞。 | 数字病理学 | 牛皮癣 | 单细胞技术 | NA | 人类和小鼠的组织样本 | 8名牛皮癣患者的皮肤损伤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 28265 | 2024-08-05 |
Transcriptome-wide association study-derived genes as potential visceral adipose tissue-specific targets for type 2 diabetes
2023-11, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-023-05978-5
PMID:37540242
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研究论文 | 本研究评估了内脏肥胖与2型糖尿病之间的因果关系，并筛选了针对2型糖尿病的内脏脂肪组织特异性靶点 | 本研究通过转录组广泛关联研究筛选了10个与2型糖尿病相关的内脏脂肪特异性候选基因 | 本研究的限制在于尚需通过进一步的功能研究验证这些候选基因 | 研究内脏脂肪组织与2型糖尿病之间的因果关系 | 分析2型糖尿病患者及其对照组的数据 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | Mendelian随机化，转录组广泛关联研究（TWAS） | 无 | 基因组数据 | 74,124例病例和824,006例对照 | NA | NA | NA | NA |
| 28266 | 2024-08-05 |
Exploring the human microbiome - A step forward for precision medicine in breast cancer
2023-11, Cancer reports (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/cnr2.1877
PMID:37539732
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综述 | 这篇综述文章探讨了微生物失调对乳腺癌发生的影响及其与乳腺癌特定分子亚型的相互作用 | 文章创新地讨论了微生物组作为癌症生物标志物的潜力，并整合了最新的微生物组研究技术和人工智能的进展 | 文章可能没有提供具体的实验数据和临床案例来支持其假设 | 旨在描述微生物失调如何影响乳腺癌的发生以及其与肿瘤微生物群的关系 | 主要研究肠道微生物群与乳腺癌发生之间的关系 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 下一代测序(NGS)、基因组测序、单细胞测序、微生物代谢组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 28267 | 2024-08-07 |
Myofibroblasts: A New Factor Affecting the Hyperlipidemia-Induced Elastic Abnormality of Corpus Cavernosum in Rabbits Detected by 2-D Shear Wave Elastography
2023-11, Ultrasound in medicine & biology
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研究论文 | 本研究使用二维剪切波弹性成像（2-D SWE）和单细胞RNA测序（scRNA-seq）探讨了高脂血症诱导的兔阴茎海绵体弹性异常及其细胞学因素。 | 发现了高脂血症组中一种新的成纤维细胞亚型——肌成纤维细胞，并通过免疫荧光染色和基因本体分析验证了其存在。 | NA | 研究高脂血症对兔阴茎海绵体弹性的影响及其细胞学机制。 | 兔阴茎海绵体的弹性异常及其细胞学因素。 | 数字病理学 | 高脂血症 | 二维剪切波弹性成像（2-D SWE），单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 图像 | 新西兰白兔被随机分为高脂血症组和对照组 | NA | NA | NA | NA |
| 28268 | 2024-08-07 |
Uncovering the prominent role of satellite cells in paravertebral muscle development and aging by single-nucleus RNA sequencing
2023-Nov, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2023.01.005
PMID:37554180
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研究论文 | 本研究通过单核RNA测序构建了小鼠棘旁肌在胚胎至老年阶段的单核转录组图谱，揭示了卫星细胞在肌肉发育和衰老中的作用 | 首次构建了涵盖胚胎至老年阶段的小鼠棘旁肌单核转录组图谱，并发现了与肌肉能量代谢相关的基因集在卫星细胞中的富集 | NA | 揭示卫星细胞在棘旁肌发育和衰老中的作用 | 小鼠棘旁肌的卫星细胞、快肌细胞和慢肌细胞 | 数字病理学 | 骨骼肌疾病 | 单核RNA测序 | NA | 转录组 | 630,040个骨骼肌细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 28269 | 2024-08-05 |
Fate Specification of GFAP-Negative Primitive Neural Stem Cells and Their Progeny at Clonal Resolution
2023-10, Stem cells and development
IF:2.5Q2
DOI:10.1089/scd.2023.0038
PMID:37551982
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研究论文 | 本研究探讨了GFAP阴性原始神经干细胞及其后代的命运特性 | 通过克隆谱系追踪机制，提供了单细胞层面上对神经前体细胞谱系的解析 | 研究集中于小鼠大脑，可能不适用于其他物种或人类 | 深入理解神经干细胞的胚胎功能与谱系关系 | GFAP阴性原始神经干细胞及其后代的神经前体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 细胞谱系数据 | 从原始神经干细胞和成熟神经干细胞中获得的多克隆神经前体细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 28270 | 2024-08-05 |
Single-Cell RNA-seq Analysis of a Human Embryonic Stem Cell to Endothelial Cell System Based on Transcription Factor Overexpression
2023-Oct, Stem cell reviews and reports
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s12015-023-10598-y
PMID:37537495
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研究论文 | 本研究对一种高效的人类胚胎干细胞-内皮细胞诱导系统进行单细胞RNA测序分析 | 提出了一种新的FLI1-PKC诱导系统，具有不同于其他诱导方法的诱导路径 | 该研究主要集中在FLI1-PKC系统，未涵盖其他诱导系统的比较分析 | 研究人类胚胎干细胞向内皮细胞转化的转录谱和细胞动态 | 使用FLI1-PKC系统的分化细胞进行单细胞RNA测序分析 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达谱 | 在不同时间点进行的多次分化细胞样本分析 | NA | NA | NA | NA |
| 28271 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing of a poorly metastatic melanoma cell line and its subclones with high lung and brain metastasis potential reveals gene expression signature of metastasis with prognostic implication
2023-Oct, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.14900
PMID:37534569
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了一个低转移性黑色素瘤细胞系及其具有高肺和脑转移潜能的亚克隆，揭示了与转移相关的基因表达特征及其预后意义 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术，揭示了黑色素瘤细胞系中与转移潜能相关的基因表达特征，并发现这些特征与患者的预后相关 | 研究仅限于特定的黑色素瘤细胞系及其亚克隆，可能需要进一步的研究来验证这些发现是否适用于其他黑色素瘤细胞系或临床样本 | 阐明黑色素瘤转移过程中基因表达变化的机制，并鉴定出具有转移潜能的亚克隆 | 一个低转移性黑色素瘤细胞系WM239A及其具有高肺和脑转移潜能的亚克隆 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 8173个黑色素瘤细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 28272 | 2024-08-07 |
Enolase represents a metabolic checkpoint controlling the differential exhaustion programmes of hepatitis virus-specific CD8+ T cells
2023-10, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2022-328734
PMID:37541771
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研究论文 | 本文研究了肝炎病毒特异性CD8+ T细胞的代谢检查点，特别是酶醇，如何控制不同疲劳程序的差异，并探讨了抗病毒治疗对这些细胞代谢状态的影响。 | 首次识别酶醇作为疲劳T细胞的代谢检查点，并展示了代谢旁路如何改善糖酵解和T细胞效应功能。 | 研究主要集中在体外和动物模型中，需要进一步的人体临床试验来验证这些发现。 | 探讨代谢调控如何影响慢性肝炎B和C病毒感染中的T细胞疲劳状态，并评估抗病毒治疗对此的影响。 | 慢性HBV和HCV感染患者的病毒特异性CD8+ T细胞的代谢状态、疲劳程度和转录组。 | 免疫学 | 肝炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 转录组数据 | 慢性HBV感染患者31例，HCV感染患者52例 | NA | NA | NA | NA |
| 28273 | 2024-08-07 |
Function and therapeutic value of astrocytes in diabetic cognitive impairment
2023-10, Neurochemistry international
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.neuint.2023.105591
PMID:37543309
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综述 | 本文综述了星形胶质细胞在糖尿病认知障碍中的作用及其治疗价值 | 首次系统总结了糖尿病环境对脑星形胶质细胞的影响及其机制，并强调了反应性星形胶质增生对糖尿病认知障碍的贡献和潜在治疗靶点 | NA | 探讨星形胶质细胞在糖尿病认知障碍中的病理机制和潜在治疗价值 | 星形胶质细胞在糖尿病认知障碍中的作用 | NA | 糖尿病认知障碍 | 单细胞转录组、原位测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 28274 | 2024-08-07 |
Single-cell characterization of tumor evolution from precursor diseases
2023-10, Trends in cancer
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.trecan.2023.07.012
PMID:37544795
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研究论文 | 本文通过整合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和B细胞受体测序（scBCR-seq），研究了从癌前病变到多发性骨髓瘤（MM）的细胞和分子进化特征 | 利用单细胞测序技术深入研究癌前病变到多发性骨髓瘤的进化过程 | NA | 阐明癌前病变的特征，以理解肿瘤进展中的恶性转化 | 癌前病变到多发性骨髓瘤的细胞和分子进化 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），B细胞受体测序（scBCR-seq） | NA | RNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 28275 | 2024-08-07 |
Integrated analysis of multiple methods reveals characteristics of the immune microenvironment in medulloblastoma
2023-Oct, Brain tumor pathology
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s10014-023-00467-4
PMID:37558814
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研究论文 | 本文通过四种方法（流式细胞术、免疫组化、批量RNA表达和单细胞RNA测序）探索了髓母细胞瘤的免疫微环境特征，并与其他脑肿瘤进行了比较 | 本文采用了多种方法的综合分析，为高度异质性的肿瘤如髓母细胞瘤提供了更好的研究选择 | 每种方法都有其自身的优势和局限性 | 探索髓母细胞瘤的免疫微环境特征 | 髓母细胞瘤的免疫微环境 | NA | 髓母细胞瘤 | 流式细胞术、免疫组化、批量RNA表达、单细胞RNA测序 | NA | 组织样本 | 髓母细胞瘤、室管膜瘤、高级别胶质瘤和低级别胶质瘤的手术样本 | NA | NA | NA | NA |
| 28276 | 2024-08-05 |
Identifying spatial domains of spatially resolved transcriptomics via multi-view graph convolutional networks
2023-09-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad278
PMID:37544658
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研究论文 | 本文提出了一种名为STMGCN的新型无监督学习框架，通过多视图图卷积网络识别空间域 | STMGCN通过结合基因表达和邻接图，利用注意力机制自适应融合特定视图嵌入以增强潜在嵌入的表达能力 | 实验结果主要基于两个模拟数据集和五个真实空间转录组数据集，可能存在平台间的局限性 | 研究旨在通过有效整合基因表达数据与空间信息来识别空间域 | 研究对象为空间转录组数据中的基因表达图 | 数字病理学 | NA | 图卷积网络 | 多视图图卷积网络 | 数据集 | 两个模拟数据集和五个真实空间转录组数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 28277 | 2024-08-07 |
Single-cell causal network inferred by cross-mapping entropy
2023-09-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbad281
PMID:37544659
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研究论文 | 本文提出了一种新的因果关系准则——邻域交叉映射熵（NME），用于从稳态数据和时间序列数据中推断基因调控网络（GRNs） | NME能够量化变量间的‘连续因果关系’或功能依赖性，基于其函数连续性与变化的邻域大小，显示出比现有方法更优越的性能 | NA | 旨在解决由于数据噪声和分子非线性导致的基因间因果关系识别难题 | 基因调控网络（GRNs）及其在单细胞RNA测序数据中的应用 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 邻域交叉映射熵（NME） | 基因数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 28278 | 2024-08-07 |
Reanalysis of single-cell data reveals macrophage subsets associated with the immunotherapy response and prognosis of patients with endometrial cancer
2023-09-15, Experimental cell research
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.yexcr.2023.113736
PMID:37541419
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研究论文 | 本文通过分析单细胞RNA测序数据和批量RNA测序数据，揭示了与子宫内膜癌患者免疫治疗反应和预后相关的巨噬细胞亚群 | 首次识别出与子宫内膜癌免疫治疗反应相关的巨噬细胞亚群，并构建了一个预测子宫内膜癌患者预后的基因标志物 | NA | 研究子宫内膜癌的肿瘤微环境特征及其对免疫治疗反应和预后的影响 | 子宫内膜癌患者的巨噬细胞亚群及其与免疫治疗反应和预后的关系 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 83名子宫内膜癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 28279 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptome analysis and protein profiling reveal broad immune system activation in IgG4-related disease
2023-09-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.167602
PMID:37561593
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析和蛋白质谱分析揭示了IgG4相关疾病中的广泛免疫系统激活 | 首次综合分析IgG4-RD患者外周免疫细胞的基因表达与蛋白质特征，发现多种细胞类型的激活及其相互作用 | 样本量较小，仅涉及9例IgG4-RD患者和7例健康对照，结果的普遍适用性仍需进一步验证 | 探讨IgG4-RD中的免疫系统激活机制及其潜在的治疗靶点 | 9名治疗未干预的IgG4-RD患者及7名匹配的健康对照 | 数字病理学 | IgG4相关疾病 | 单细胞RNA测序，表面蛋白质组分析 | NA | 基因组数据，蛋白质组数据 | 共分析61,379个PBMCs样本来自9名患者和7名健康对照 | NA | NA | NA | NA |
| 28280 | 2024-08-05 |
Development of a versatile LCM-Seq method for spatial transcriptomics of fluorescently tagged cholinergic neuron populations
2023-Sep, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2023.105121
PMID:37536628
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研究论文 | 本文提出了一种激光捕获显微切割-测序(LCM-Seq)方法，用于荧光标记的胆碱能神经元群体的空间转录组学研究 | 提出了一种新的方法，通过空间位置定义的神经元池的批量RNA-Seq克服了现有单细胞转录组学的技术限制 | 仅涉及中等降解RNA的纳克量，可能限制了部分低丰度转录本的检测能力 | 开发一种新方法以提高神经元转录组的覆盖度和差异表达分析的准确性 | 荧光标记的胆碱能神经元群体 | 数字病理学 | NA | RNA-Seq | NA | 转录组数据 | 大约300个聚合神经元 | NA | NA | NA | NA |