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当前共找到 32106 篇文献，本页显示第 2801 - 2820 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2801 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing analysis reveals the dynamic changes in the tumor microenvironment during NMIBC recurrence
2025-02, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-024-02044-2
PMID:39633115
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析非肌层浸润性膀胱癌复发过程中肿瘤微环境的动态变化 | 识别了复发NMIBC中高表达COL18A1的肿瘤相关成纤维细胞亚型和高表达IL-6的巨噬细胞亚型，并发现尿路上皮癌细胞中雌激素上调现象 | 样本量较小（仅10个样本），研究结果需要在更大规模研究中进一步验证 | 探究膀胱癌复发过程中肿瘤微环境的分子机制 | 非肌层浸润性膀胱癌患者样本 | 单细胞测序分析 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序，多重免疫荧光实验 | 伪时间轨迹分析，细胞间通讯分析，功能富集分析 | 单细胞转录组数据，免疫荧光图像数据 | 10个原发性和复发性NMIBC样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2802 | 2025-10-06 |
Deciphering the senescence-based tumoral heterogeneity and characteristics in pancreatic cancer: Results from parallel bulk and single-cell transcriptome data
2025-01, IUBMB life
IF:3.7Q2
DOI:10.1002/iub.70001
PMID:39865528
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研究论文 | 通过整合分析批量与单细胞RNA测序数据，揭示胰腺癌中基于细胞衰老的肿瘤异质性特征 | 首次在批量和单细胞水平并行分析胰腺癌的衰老相关异质性，识别关键衰老相关基因并验证其功能 | 基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证 | 解析胰腺癌中基于细胞衰老的肿瘤异质性及其特征 | 胰腺癌患者组织样本和胰腺癌细胞 | 生物信息学 | 胰腺癌 | RNA测序, 单细胞RNA测序, ssGSEA算法, infercnv算法 | 无监督聚类分析 | 转录组数据, 单细胞转录组数据 | 来自TCGA-PAAD、PACA-AU、PACA-CA和GSE154778数据集的胰腺癌患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 2803 | 2025-10-06 |
Integrated analysis of scRNA-seq and bulk RNA-seq data reveals the key targets of the combination of cisplatin and saikosaponin D in gastric cancer cells
2025-Sep-08, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152359
PMID:40674817
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据分析，揭示柴胡皂苷D联合顺铂治疗胃癌细胞的关键靶点 | 首次整合单细胞和批量RNA测序数据，系统分析柴胡皂苷D增强胃癌细胞对顺铂敏感性的分子机制，发现FAK/AKT/mTOR信号通路的关键作用 | 研究主要基于细胞系实验，缺乏体内动物模型验证；样本量相对有限 | 探究柴胡皂苷D增强胃癌细胞对顺铂敏感性的分子机制和潜在治疗靶点 | 胃癌细胞系（AGS和SGC-7901）及TCGA-GTEx数据库中的胃腺癌数据 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 实时PCR, 蛋白质印迹, 网络药理学, 分子对接 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | 胃癌细胞系和TCGA-GTEx数据库样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 2804 | 2025-10-06 |
HSD17B2 serves as a novel tumor-suppressive regulator in colorectal cancer progression
2025-Sep-08, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152396
PMID:40706248
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研究论文 | 本研究通过多组学分析发现HSD17B2是结直肠癌进展中的新型肿瘤抑制因子 | 首次系统鉴定HSD17B2在结直肠癌中的肿瘤抑制功能，并通过多数据集整合分析和功能验证证实其作用机制 | 研究主要基于数据库分析和细胞系实验，缺乏更深入的体内机制研究和临床前验证 | 探索结直肠癌发病机制中的关键分子调控因子 | 结直肠癌组织、人结直肠癌细胞系(Caco-2, HT-29, HCT-116)和AOM/DSS诱导的小鼠结直肠癌模型 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 转录组分析, 单细胞RNA测序, 差异表达分析, WGCNA分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 多个GEO数据集(GSE103512, GSE39923, GSE44076, GSE68468, GSE221575)和3个人类结直肠癌细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 2805 | 2025-10-06 |
Integrating transcriptomics, network analysis, and single-cell RNA sequencing to identify and validate key target genes of gynostemma in the treatment of non-alcoholic fatty liver disease
2025-Sep-01, European journal of pharmaceutical sciences : official journal of the European Federation for Pharmaceutical Sciences
IF:4.3Q1
DOI:10.1016/j.ejps.2025.107214
PMID:40706769
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研究论文 | 本研究通过整合转录组学、网络分析和单细胞RNA测序，探索绞股蓝治疗非酒精性脂肪肝的靶基因和机制 | 首次结合网络分析、机器学习算法和单细胞RNA测序系统鉴定绞股蓝治疗NAFLD的关键靶基因PIM1、TYMS和SLC29A1 | 研究主要基于生物信息学分析和体外细胞实验，缺乏体内动物模型验证 | 探索绞股蓝治疗非酒精性脂肪肝的分子机制和关键靶基因 | 非酒精性脂肪肝疾病相关的基因表达数据和HepG2、HuH7、QSG7701肝细胞系 | 生物信息学 | 非酒精性脂肪肝 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, 网络分析, 机器学习, RT-qPCR | 机器学习算法, WGCNA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 2569个差异表达基因, 1279个关键模块基因, 532个靶基因, 3种肝细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 2806 | 2025-10-06 |
Excitatory synaptic transmission is differentially modulated by opioid receptors along the claustro-cingulate pathway
2025-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.31.646444
PMID:40236172
|
研究论文 | 本研究探讨阿片受体在CLA-ACC神经通路中对兴奋性突触传递的调控机制 | 首次揭示KOR、MOR和DOR阿片受体在扣带皮层-屏状核通路中对兴奋性突触传递的差异化调控作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在更高阶物种中验证 | 阐明阿片受体在扣带皮层-屏状核神经环路中对谷氨酸能信号传递的调控机制 | 小鼠扣带皮层第五层锥体神经元和屏状核神经元 | 神经科学 | 疼痛感知障碍 | 空间转录组学, 脑片电生理学, 光遗传学, 药理学方法 | NA | 电生理信号, 基因表达数据 | 小鼠脑组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2807 | 2025-10-06 |
Benchmarking spatial transcriptomics technologies with the multi-sample SpatialBenchVisium dataset
2025-Mar-28, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03543-4
PMID:40156041
|
研究论文 | 本研究通过构建SpatialBenchVisium数据集，对10x Genomics Visium空间转录组技术进行基准测试 | 创建了首个包含多种组织处理方案的空间转录组参考数据集，系统比较了不同样本处理方法的数据质量 | 研究仅针对小鼠脾脏组织，未验证其他组织类型 | 评估空间转录组技术的性能和数据质量 | 小鼠脾脏组织在疟疾感染反应中的空间基因表达 | 空间转录组学 | 疟疾感染 | 空间转录组技术，单细胞RNA测序 | NA | 空间基因表达数据，单细胞RNA测序数据 | 多个小鼠脾脏组织样本 | 10x Genomics | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | 10x Visium | 10x Visium平台，包含新鲜冷冻和FFPE样本处理，支持手动和CytAssist组织放置 |
| 2808 | 2025-10-06 |
An insight into COVID-19 host immunity at single-cell resolution
2025, International reviews of immunology
IF:4.3Q2
DOI:10.1080/08830185.2024.2443420
PMID:39707914
|
综述 | 基于单细胞转录组学研究，系统描述COVID-19感染和疫苗接种过程中宿主免疫细胞的分子行为变化 | 首次在单细胞分辨率下系统总结先天性和适应性免疫细胞在COVID-19感染和疫苗接种过程中的动态变化 | 仅基于过去3-4年发表的研究，未包含最新进展 | 探究SARS-CoV-2感染过程中宿主免疫反应的细胞和分子机制 | 先天性和适应性免疫细胞类型及状态 | 单细胞生物学 | COVID-19 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2809 | 2025-10-06 |
Next-generation deconvolution of the tumor microenvironment with omnideconv
2025, Methods in cell biology
DOI:10.1016/bs.mcb.2025.01.003
PMID:40683686
|
研究论文 | 介绍了一个名为omnideconv的R软件包，用于整合多种肿瘤微环境细胞反卷积方法 | 开发了统一框架整合多种反卷积算法，简化了使用流程并统一了数据语义 | NA | 开发标准化工具来简化肿瘤微环境细胞组成的计算分析 | 乳腺癌肿瘤微环境中的恶性和正常细胞 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | 反卷积算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 2810 | 2025-10-06 |
VEGFA and APOE regulate distinct functional states of mast cells in hepatocellular carcinoma: A single-cell transcriptome analysis
2025-Sep, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.146131
PMID:40683486
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示肝细胞癌中肥大细胞的功能异质性及其对预后的影响 | 首次在肝细胞癌中鉴定出四种功能不同的肿瘤相关肥大细胞亚群，并发现VEGFA和APOE分别调控其促癌和抑癌功能状态 | 样本量相对有限，需要更大规模的研究验证发现 | 研究肝细胞癌中肥大细胞的异质性及其在肿瘤发展中的双重作用 | 肝细胞癌患者肿瘤组织和癌旁组织 | 单细胞转录组学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，多重免疫组化，细胞功能实验 | NA | 单细胞转录组数据，免疫组化数据，公共数据库数据 | 32例HCC患者肿瘤组织，5例癌旁组织，90对验证用肿瘤和癌旁组织 | NA | 单细胞RNA测序，多重免疫组化 | NA | NA |
| 2811 | 2025-10-06 |
Potential function exploration of lncRNAs in idiopathic pulmonary fibrosis: insights from whole transcriptome sequencing data analysis
2025-Aug-08, Clinics (Sao Paulo, Brazil)
DOI:10.1016/j.clinsp.2025.100732
PMID:40782499
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研究论文 | 通过全转录组测序数据分析探索长链非编码RNA在特发性肺纤维化中的潜在功能 | 首次系统识别IPF中差异表达lncRNAs并构建共表达网络，发现与炎症反应通路相关的关键lncRNAs | 样本量较小（12例患者和5例对照），需更大规模研究验证 | 探索lncRNAs在特发性肺纤维化发病机制中的功能作用 | 特发性肺纤维化患者和健康对照的RNA测序数据 | 生物信息学 | 特发性肺纤维化 | RNA-seq, scRNA-seq, WGCNA | 共表达网络分析 | RNA测序数据 | 12例IPF患者和5例对照 | NA | 全转录组测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2812 | 2025-10-06 |
Deciphering the role of CAPZA2 in neurodevelopmental disorders: insights from mouse models
2025-Jul-15, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08385-1
PMID:40659881
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研究论文 | 通过小鼠模型研究CAPZA2基因在神经发育障碍中的作用机制 | 首次系统揭示CAPZA2基因缺陷导致神经发育障碍的分子机制和表型特征 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类临床样本中验证 | 探究CAPZA2基因在神经发育障碍中的致病机制 | CAPZA2杂合敲除和点突变小鼠模型 | 神经科学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序,行为学分析,形态学分析 | 基因编辑小鼠模型 | 基因表达数据,行为数据,形态学数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2813 | 2025-10-06 |
AI-based phenotyping of hepatic fiber morphology to inform molecular alterations in metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease
2025-Apr-22, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001360
PMID:40262132
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研究论文 | 本研究利用人工智能技术对代谢功能障碍相关脂肪性肝病中的肝纤维形态进行表型分析，并探索其与分子改变的关系 | 开发了基于AI的FibroNest算法量化肝纤维形态表型，首次将纤维形态表型与空间单细胞转录组分析相结合揭示MASLD发病机制 | 样本量相对有限（94例活检样本），其中仅13%伴有HCC，需要更大样本验证 | 全面表征MASLD中肝纤维形态表型及其相关分子改变 | 94例MASLD患者的肝活检样本，其中12例并发肝细胞癌 | 数字病理学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | 全基因组转录组学，空间单细胞转录组，体外实验 | AI算法（FibroNest） | 组织图像，转录组数据，空间转录组数据 | 94例MASLD肝活检样本 | Nanostring | 空间单细胞转录组 | CosMx | CosMx空间分子成像平台 |
| 2814 | 2025-10-06 |
HMGA2 Expression Predicts Subtype, Survival, and Treatment Outcome in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma
2025-Feb-17, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-2200
PMID:39680021
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研究论文 | 本研究确立HMGA2作为胰腺导管腺癌基底样疾病的标志物，并探索其作为预后和治疗抵抗生物标志物的应用价值 | 首次发现HMGA2蛋白表达能预测胰腺癌基底样亚型、患者生存和治疗反应，优于传统标志物细胞角蛋白5/17 | 样本量相对有限，需要更多独立队列验证 | 建立HMGA2作为胰腺导管腺癌生物标志物，用于疾病分型、预后预测和治疗反应评估 | 胰腺导管腺癌患者组织样本 | 数字病理 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序，多重免疫组化 | NA | 基因表达数据，蛋白质表达数据，临床数据 | 主要队列580例PDAC样本，补充30例样本，多个独立单细胞RNA-seq数据库 | NA | 单细胞RNA-seq，多重免疫组化 | NA | NA |
| 2815 | 2025-10-06 |
Identification of the key targets for sepsis-associated acute kidney injury by RNA sequencing combined with bioinformatics methods
2024-11-30, BMC immunology
IF:2.9Q3
DOI:10.1186/s12865-024-00673-5
PMID:39616313
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研究论文 | 通过RNA测序结合生物信息学方法识别脓毒症相关急性肾损伤的关键靶点基因 | 首次将脓毒症差异表达基因与肾脏特异性基因进行交集分析，鉴定出CD74和IL32作为脓毒症相关肾损伤的新型生物标志物 | 样本量较小（10例健康对照和22例脓毒症患者），需要更大规模研究验证 | 探索脓毒症患者并发肾损伤的相关基因，为早期识别和预后研究提供可靠靶点 | 脓毒症患者和健康个体的外周血样本 | 生物信息学 | 脓毒症相关急性肾损伤 | RNA测序, 生物信息学分析, 单细胞RNA测序 | 差异表达分析, GO分析, KEGG分析, 生存分析, ROC分析 | RNA测序数据 | 32例样本（10例健康对照，22例脓毒症患者） | NA | RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2816 | 2025-10-06 |
From bioinformatics to clinical applications: a novel prognostic model of cuproptosis-related genes based on single-cell RNA sequencing data in hepatocellular carcinoma
2024-09-09, BMC immunology
IF:2.9Q3
DOI:10.1186/s12865-024-00649-5
PMID:39251909
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研究论文 | 基于单细胞RNA测序数据开发了一种铜死亡相关基因的肝细胞癌预后模型 | 首次结合单细胞RNA测序和RNA测序数据构建铜死亡相关基因的肝细胞癌预后模型 | 模型验证仍需更多临床队列验证 | 研究铜死亡相关基因与肝细胞癌预后的关系并构建预后模型 | 肝细胞癌患者和正常对照 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,RNA测序 | Cox回归,LASSO回归 | 基因表达数据 | GEO和TCGA数据库中的肝细胞癌患者和正常对照样本 | NA | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | NA |
| 2817 | 2025-10-06 |
Regulator of G-protein signaling expression in human intestinal enteroendocrine cells and potential role in satiety hormone secretion in health and obesity
2024-Sep, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2024.105283
PMID:39142076
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研究论文 | 本研究揭示了人肠道内分泌细胞中G蛋白信号调节因子的表达谱及其在饱腹激素分泌和肥胖中的潜在作用 | 首次在瘦型和肥胖个体中通过单细胞RNA测序揭示了肠道内分泌细胞独特的RGS表达谱，并发现RGS9表达与BMI正相关、与餐后GLP-1和PYY负相关 | 样本量相对有限（61例患者），部分数据依赖公开数据集，需要进一步验证RGS的具体作用机制 | 探究RGS在肠道内分泌细胞中的表达特征及其对饱腹激素分泌的调节作用 | 人结肠和空肠L型肠内分泌细胞、61例患者肠道黏膜组织、NCI-H716细胞系 | 单细胞生物学 | 肥胖症 | 单细胞RNA测序, RNA测序, 体外细胞培养, 激素检测 | NA | 转录组数据, 临床数据, 体外实验数据 | 61例患者（42例肥胖，19例瘦型），公开数据集GSE114853 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2818 | 2025-10-06 |
Single-cell analysis of ovarian myeloid cells identifies aging associated changes in macrophages and signaling dynamics
2024-Jun-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.13.598667
PMID:38915572
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和流式细胞术分析年轻与年老小鼠卵巢中的髓系细胞，揭示卵巢衰老过程中巨噬细胞亚群和信号通路的改变 | 首次在年老小鼠卵巢中发现独特的巨噬细胞亚群，并揭示ANNEXIN和TGFβ信号在卵巢衰老相关炎症和纤维化中的新机制 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究卵巢衰老过程中髓系细胞的功能特征和分子机制 | 年轻(3月龄)和年老(14-17月龄)小鼠卵巢中的CD45+CD11b+髓系细胞 | 单细胞生物学 | 卵巢衰老 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 年轻和年老小鼠卵巢样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2819 | 2025-10-06 |
Identification of four mitochondria-related genes in sepsis based on RNA sequencing technology
2024-05-16, BMC immunology
IF:2.9Q3
DOI:10.1186/s12865-024-00623-1
PMID:38755528
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研究论文 | 基于RNA测序技术鉴定脓毒症中四个线粒体相关基因 | 首次通过整合RNA测序数据和线粒体基因数据库，识别出与脓毒症预后相关的四个线粒体基因(FIS1, FKBP8, GLRX5, GUK1)，并通过单细胞测序明确其在免疫细胞中的分布 | 样本量较小（脓毒症20例，SIRS 12例），需更大规模研究验证 | 阐明脓毒症免疫机制并为临床治疗提供新思路 | 脓毒症和全身炎症反应综合征(SIRS)患者外周血细胞 | 生物信息学 | 脓毒症 | RNA测序，单细胞RNA测序，生物信息学分析 | NA | RNA测序数据，单细胞测序数据 | 脓毒症20例，SIRS 12例 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x单细胞测序平台 |
| 2820 | 2025-10-06 |
ScRNA-seq unveils the functional characteristics of glioma-associated macrophages and the regulatory effects of chlorogenic acid on the immune microenvironment-a study based on mouse models and clinical practice
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1494806
PMID:39867913
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示胶质瘤相关巨噬细胞的功能特征及绿原酸对免疫微环境的调控作用 | 首次结合小鼠模型和临床实践，系统揭示绿原酸通过JAK-STAT通路调控肿瘤相关巨噬细胞功能并改善免疫微环境 | 研究样本量有限，仅包含一个临床病例，需要更大规模的临床试验验证 | 探索胶质瘤免疫微环境特征及绿原酸的免疫调节作用 | 胶质瘤模型小鼠和临床患者 | 单细胞测序分析 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序, PPI网络分析, 分子对接 | 分子对接模型 | 单细胞转录组数据, 临床数据 | 模型小鼠和1例临床患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |