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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2801 | 2026-05-02 |
Serial Thermal Ablation Induces Abscopal Antitumor Immunity and Reveals Targetable CSF1R-Dependent Resistance in Pancreatic Cancer
2026-Apr-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.05.713683
PMID:41993287
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研究论文 | 本研究探讨了连续热消融在胰腺导管腺癌中诱导的远隔抗肿瘤免疫效应及CSF1R依赖性耐药机制 | 首次揭示了连续射频消融能诱导全身性远隔抗肿瘤免疫应答,并识别出CSF1驱动的髓系免疫抵抗程序,提出联合免疫治疗策略可增强消融的系统性疗效 | 研究仅基于双侧肿瘤小鼠模型,尚未在人体中验证;CD8 T细胞耗竭实验虽证实关键作用,但其他免疫机制可能未被完全涵盖 | 探究热消融诱导全身抗肿瘤免疫的能力及限制该反应的机制,并开发有效的联合免疫治疗策略 | 双侧flank肿瘤小鼠模型中的胰腺导管腺癌细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 射频消融, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 双侧flank肿瘤小鼠模型,具体数量未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 2802 | 2026-05-02 |
Spatially Anchored Regulatory State Inference in Melanoma
2026-Apr-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.05.716552
PMID:41993479
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研究论文 | 提出一种空间锚定的调控状态推断框架,整合空间转录组与单细胞多组学数据,推断黑色素瘤组织中的空间分辨调控程序 | 首次将空间转录组与单细胞多组学数据结合,实现空间锚定的调控状态推断,并通过空间正则化细胞-点映射传播染色质可及性和转录因子基序活性 | 未提及具体局限性 | 开发一种模块化方法,整合空间转录组和单细胞多组学数据,以推断组织空间中的调控程序并评估其稳定性 | 黑色素瘤组织切片 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 空间转录组学、单细胞多组学 | GraphST | 空间转录组数据、单细胞多组学数据(染色质可及性、转录因子基序活性) | 黑色素瘤组织切片样本 | 10x Genomics | 空间转录组学、单细胞多组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组平台 |
| 2803 | 2026-05-02 |
Emergent latent neurotoxic effects of manganese following nominal chronic exposures in human stem cell and Caenorhabditis elegans models
2026-Apr-07, Toxicological sciences : an official journal of the Society of Toxicology
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/toxsci/kfag040
PMID:42033779
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研究论文 | 本文通过人诱导多能干细胞和秀丽隐杆线虫模型,揭示了慢性锰暴露后出现的潜在神经毒性效应 | 首次在两种遗传和机制可操作的系统中证实,慢性锰暴露停止后会出现此前未检测到的潜在神经毒性效应,且其程度远超慢性锰暴露本身的影响 | 尚未明确潜在效应的具体分子机制,且需要进一步验证其在人体中的相关性 | 研究慢性锰暴露后潜在神经毒性效应的存在及机制 | 人诱导多能干细胞衍生的皮层培养物和秀丽隐杆线虫 | 机器学习 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据和行为数据 | 人诱导多能干细胞衍生的皮层培养物(具体数量未明确)和秀丽隐杆线虫(具体数量未明确) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 2804 | 2026-05-02 |
Human Lymph Node Cellular Senescence Atlas Reveals Age-Dependent Alteration in Germinal Center B Cell Function and Niches
2026-Apr-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.02.716161
PMID:41993351
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research paper | 通过整合单细胞和空间多组学技术,系统描绘了人类淋巴结中与年龄相关的细胞衰老图谱,揭示了衰老过程中生发中心B细胞功能及生态位的年龄依赖性变化 | 首次构建人类淋巴结衰老相关免疫状态的空间多组学图谱,结合单细胞转录组、空间蛋白质组、转录组、表观基因组和代谢成像,揭示了衰老细胞类型的空间异质性和从滤泡外到生发中心的逐步定位转变 | 未提供具体局限性信息 | 系统描述人类淋巴结中与年龄相关的细胞衰老状态及其对免疫微环境的影响 | 人类淋巴结组织,来自18至100岁供体 | digital pathology | geriatric disease | 单细胞转录组学、高多重免疫荧光、空间转录组学、空间表观基因组学、代谢成像 | NA | 单细胞转录组数据、空间蛋白质组数据、空间转录组数据、空间表观基因组数据、代谢成像数据 | 单细胞转录组:来自18-100岁供体;空间蛋白质组:51名供体(18-86岁)的99个淋巴结切片,约2000万个细胞 | NA | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | NA | NA |
| 2805 | 2026-05-02 |
Thymic stromal lymphopoietin promotes ozone-induced inflammation in the airway
2026-Apr-01, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2025-0281OC
PMID:41025995
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research paper | 本研究探讨了胸腺基质淋巴细胞生成素(TSLP)在臭氧诱导的气道炎症中的作用机制 | 首次通过单细胞RNA测序发现TSLP通过调节cDC1细胞中Fscn1的表达促进臭氧诱导的中性粒细胞性气道炎症 | 未涉及人体样本验证,且具体分子通路细节尚需进一步探索 | 阐明TSLP在臭氧诱导的2型低炎症表型气道高反应性和中性粒细胞炎症中的作用 | BALB/c小鼠、TSLP受体缺陷小鼠、Batf3缺陷小鼠以及骨髓来源的cDC1细胞 | machine learning | 哮喘、气道炎症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多组小鼠(如BALB/c、TSLP受体缺陷、Batf3缺陷)每组至少6只,具体数量未详细说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台用于单细胞转录组分析 |
| 2806 | 2026-05-02 |
Temporal modulation of microglial repopulation attenuates retinal degeneration in retinitis pigmentosa
2026-04, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2026.107295
PMID:41690604
|
研究论文 | 探究时间性调控小胶质细胞再增殖在视网膜色素变性中对视网膜变性的缓解作用 | 首次发现小胶质细胞再增殖的时间依赖性表型可塑性,并提出两轮连续清除-再增殖策略以维持小胶质细胞稳态并保护视功能 | 研究主要基于rd10小鼠模型,需进一步验证在人类RP中的适用性;长期再增殖小胶质细胞恢复促炎表型的机制未完全阐明 | 评估时间性调控小胶质细胞清除与再增殖对视网膜色素变性小鼠模型视网膜变性的影响及其治疗潜力 | rd10小鼠视网膜小胶质细胞 | 机器学习 | 视网膜色素变性 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | rd10小鼠视网膜样本(具体数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2807 | 2026-05-02 |
Multi-omics analysis of the lactylation-driven microenvironment and non-invasive clinical translation in hepatocellular carcinoma
2026-Apr, Hepatology international
IF:5.9Q1
DOI:10.1007/s12072-025-11016-w
PMID:41699363
|
研究论文 | 通过整合多组学策略,研究赖氨酸乳酸化驱动的微环境及非侵入性临床转化在肝细胞癌中的价值 | 首次构建基于赖氨酸乳酸化的风险模型,并整合超声影像组学实现非侵入性预测,揭示乳酸化驱动的免疫抑制微环境与增殖性肿瘤表型 | 未在独立大规模外部队列中验证模型普适性,超声影像组学参数可能受设备差异影响 | 探究乳酸化相关风险模型在肝细胞癌中的临床预后评估及非侵入性预测潜力 | 肝细胞癌患者 | 机器学习 | 肝癌 | 多组学分析, 免疫组化, Western blot, 单细胞测序, 超声影像组学 | 风险模型, 影像组学模型 | 转录组, 蛋白质组, 乳酸化修饰组, 单细胞测序数据, 超声图像 | 本地队列及公开肝癌队列(具体数量未提及) | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 2808 | 2026-05-02 |
Aberrant medial ganglionic eminence (MGE) GABAergic neurogenesis contributes to Huntington's disease pathogenesis
2026-04, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2026.107297
PMID:41654201
|
研究论文 | 利用BACHD小鼠模型揭示内侧神经节隆起(MGE)来源的GABA能神经发生异常是亨廷顿病发病机制的关键发育机制 | 首次通过单细胞转录组分析和谱系特异性遗传挽救实验,证明MGE神经发生早期功能障碍是HD发病机制中的关键发育事件,并发现基础中间祖细胞是突变亨廷顿蛋白的主要易感细胞群 | 论文未提及相关局限性 | 探究MGE来源的GABA能神经元发育异常对亨廷顿病发病机制的影响 | BACHD小鼠模型及E12.5天MGE祖细胞 | 机器学习 | 亨廷顿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多只BACHD小鼠及其对照,包括E12.5、出生后第13天和第30天样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2809 | 2026-05-02 |
Direct Cardiac Reprogramming in the Omics Era: Advances, Mechanisms, and Applications
2026-Apr, Cellular reprogramming
IF:1.2Q4
DOI:10.1177/21524971261427184
PMID:41766575
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综述 | 本文综述组学时代中心脏直接重编程的进展、机制与应用 | 整合多组学(单细胞转录组、表观基因组、蛋白组、代谢组)研究,系统揭示成纤维细胞向诱导心肌样细胞转化的屏障与促进因子 | 未提及具体局限性,但作为综述可能缺乏原始实验验证 | 总结组学方法对直接心脏重编程机制的理解,并讨论其临床应用前景 | 成纤维细胞转化为诱导心肌样细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | 单细胞转录组学, 表观基因组学, 蛋白组学, 代谢组学 | NA | NA |
| 2810 | 2026-05-02 |
Single cell omics identify an anti-inflammatory niche in macrophages of mild to moderate chronic obstructive pulmonary disease
2026-Apr-01, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2025-0134OC
PMID:41071173
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研究论文 | 通过单细胞组学分析,发现轻中度慢性阻塞性肺疾病中巨噬细胞存在抗炎微环境 | 首次发现并定义了一种名为间质COPD相关巨噬细胞(ICM)的新亚群,并揭示了SCGB3A2-MARCO通路在轻中度COPD中的抗炎保护作用 | 研究仍处于发现阶段,ICM在COPD中的具体功能机制及临床转化潜力尚未完全阐明 | 探究轻中度慢性阻塞性肺疾病中巨噬细胞和分泌细胞的协同抗炎作用 | 轻中度COPD患者和对照组的肺组织样本 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | Microwell-seq, 微流控单细胞RNA测序, snHH-seq, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 轻中度COPD患者和对照组的肺组织样本(具体数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | Microwell-seq平台, 微流控单细胞RNA测序平台, snHH-seq平台 | Microwell-seq用于单细胞转录组分析,微流控单细胞RNA测序用于小鼠验证,snHH-seq用于人重度COPD肺组织总RNA测序 |
| 2811 | 2026-05-02 |
Macrophage CCL18 promotes lung inflammation in checkpoint inhibitor pneumonitis
2026-Apr-01, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2025-0405OC
PMID:41072117
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研究论文 | 本研究探讨了巨噬细胞CCL18在检查点抑制剂肺炎(CIP)中促进肺部炎症的作用机制 | 首次发现CCL18在CIP患者肺泡巨噬细胞中高表达,并且在小鼠模型中证实CCL18过表达可诱导类似人类CIP的肺部炎症表型 | 未提及具体局限性 | 探究CIP患者肺泡炎症的潜在机制 | CIP患者和对照组患者的支气管肺泡灌洗液(BALF)样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),流式细胞术,ELISA | NA | 文本 | 人类BALF样本及多中心外部验证队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2812 | 2026-05-02 |
Circulating exhausted CD8+ effector memory cells differentiate immune checkpoint inhibitor-induced liver injury from other acute immune-mediated liver injuries
2026-Mar-27, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-014178
PMID:41895713
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研究论文 | 本研究识别出一种循环CD8+效应记忆T细胞亚群,可区分免疫检查点抑制剂诱导的肝损伤与其他急性免疫介导的肝损伤 | 首次发现循环CD8+效应记忆T细胞亚群(高表达CD38、HLA-DR和CXCR3)可作为区分ChILI与DILI和AIH的生物标志物 | 样本量有限,且未提供具体验证队列规模 | 探索区分免疫检查点抑制剂诱导肝损伤与其他急性免疫介导肝损伤的生物标志物 | 接受免疫治疗的癌症患者(发生与未发生ChILI者)、DILI患者、AIH患者和健康对照 | 机器学习 | 免疫相关肝损伤 | 质谱流式细胞技术、流式细胞术、单细胞RNA测序、批量RNA测序、细胞因子分析 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | 包括多个队列的ChILI、DILI、AIH患者及健康对照,具体数量未说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 2813 | 2026-05-02 |
CX3CL1-CX3CR1 signaling orchestrates malignant progression of prostate cancer through luminal progenitor-macrophage crosstalk
2026-Mar-23, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-026-01179-5
PMID:41870750
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学和基因工程小鼠模型,揭示了CX3CL1-CX3CR1信号轴在管腔祖细胞与肿瘤相关巨噬细胞互作中驱动前列腺癌恶性进展的机制 | 首次鉴定出管腔-2祖细胞与CX3CR1+巨噬细胞通过CX3CL1-CX3CR1轴形成免疫抑制微环境,并证明该信号轴在去势抵抗性前列腺癌进展中的关键角色 | 主要基于小鼠模型,人类样本验证不足,且未深入探讨该信号轴在临床样本中的预后价值 | 阐明前列腺癌治疗抵抗和转移过程中,肿瘤微环境中特异性细胞互作机制 | 前列腺癌细胞、管腔祖细胞、肿瘤相关巨噬细胞 | 机器学习和数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞转录组学、基因编辑小鼠模型、原位同种异体移植模型 | NA | 单细胞转录组数据、动物模型实验数据 | NA | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium Single Cell 3' 结合Illumina NovaSeq测序 |
| 2814 | 2026-05-02 |
Deciphering lung adenocarcinoma heterogeneity: a multi-omics approach reveals nuclear division fibroblasts as prognosticators and therapeutic targets
2026-Mar-20, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08022-3
PMID:41862916
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研究论文 | 通过多组学方法解析肺腺癌异质性,发现核分裂成纤维细胞作为预后标志物和治疗靶点 | 首次系统鉴定肺腺癌中核分裂成纤维细胞亚群,并基于此构建五基因预后模型,该模型优于49个已发表模型 | 高nLRS评分患者对免疫治疗的抵抗性需在肺腺癌特异性队列中前瞻性验证 | 系统表征肺腺癌相关成纤维细胞亚群,构建基于成纤维细胞的预后标志物 | 肺腺癌患者中的成纤维细胞亚群及其预后价值 | 机器学习 | 肺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 机器学习算法组合(100种) | 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 2719例患者(19个队列)的bulk RNA数据,368,904个细胞(93个样本)的单细胞RNA数据,15,673个点(6个样本)的空间转录组数据 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2815 | 2026-05-02 |
Secondary analysis of influenza a virus-infected cells at single-cell resolution reveals host BANF1 response to individual and combinations of detected segments
2026-Mar-20, Virology journal
IF:4.0Q2
DOI:10.1186/s12985-026-03140-2
PMID:41862961
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研究论文 | 通过分析单细胞RNA测序数据集,研究甲型流感病毒感染对宿主细胞代谢通路及基因表达的影响 | 利用单细胞分辨率揭示甲型流感病毒不同基因片段及组合对宿主基因表达的差异化影响 | 未明确提及局限性 | 理解甲型流感病毒复制对宿主细胞的细胞内效应,尤其是不同病毒片段对宿主反应的分子机制 | 感染H9N2甲型流感病毒的哺乳动物MDCK细胞 | 自然语言处理 | 传染病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 2041个MDCK细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 公开可用的scRNAseq数据集 |
| 2816 | 2026-03-18 |
Decoding clone evolution in HER2 amplified breast cancer through single-cell and spatial transcriptomics analysis of copy number variations
2026-Mar-16, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-44476-7
PMID:41840060
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2817 | 2026-05-02 |
Telocyte Deletion Associated With Loss of Lymphatic Drainage and Exacerbation of Inflammatory-Erosive Arthritis in Mice
2026-Mar-16, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.70131
PMID:41838025
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研究论文 | 该研究通过转基因小鼠模型,发现滑膜淋巴系统(SLS)中端粒细胞(telocyte)的缺失与淋巴引流功能丧失及炎性糜烂性关节炎加重相关 | 首次发现关节周围淋巴管存在端粒细胞网络,并证明其缺失导致淋巴引流障碍和关节炎加剧,提出端粒细胞作为类风湿性关节炎新药物靶点 | 研究主要基于小鼠模型,可能限制向人类应用的直接转化;未深入探讨端粒细胞缺失的具体分子机制 | 阐明类风湿性关节炎中淋巴管收缩功能丧失的病因机制 | 转基因小鼠(Efhd1-CreERT2和Myoc-CreERT2小鼠)的关节引流淋巴系统 | 机器学习 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序、免疫荧光显微术、电子显微镜、共聚焦显微镜、近红外成像、超声、显微CT | NA | 图像数据、基因表达数据 | 涉及多种转基因小鼠品系,具体样本量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2818 | 2026-05-02 |
Inhibition of 5αR2 promotes postoperative wound repair in BPH patients after TURP by alleviating fibrosis and inflammation
2026-03-01, Asian journal of andrology
IF:3.0Q1
DOI:10.4103/aja202561
PMID:41147439
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研究论文 | 探究5αR2抑制剂促进良性前列腺增生患者经尿道前列腺切除术后伤口修复的机制,通过减轻纤维化和炎症 | 首次结合临床试验和动物模型,从单细胞层面揭示5αR2抑制通过减少炎症、抑制纤维化和促进尿路上皮再生来加速术后修复 | 临床试验样本量较小(87例),动物模型为12只比格犬,且分子标志物分析依赖特定技术(如单细胞RNA测序),结果可能缺乏普适性 | 评估5αR2抑制剂对良性前列腺增生患者TURP术后伤口愈合、炎症控制和纤维化减少的影响 | 良性前列腺增生患者及比格犬模型 | 机器学习 | 良性前列腺增生 | 单细胞RNA测序、酶联免疫吸附测定(ELISA)、组织学分析 | NA | 基因表达数据、组织学图像 | 87例患者(47例治疗组、42例安慰剂组)和12只比格犬 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2819 | 2026-05-02 |
Temporal and Spatial Gene Expression Dynamics in Neonatal HI Hippocampus with Focus on Arginase
2026-Jan-28, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15030253
PMID:41677619
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研究论文 | 利用空间单细胞转录组学分析新生小鼠缺氧缺血后海马中与精氨酸酶相关的时间与空间基因表达动态 | 首次在新生小鼠缺氧缺血模型中通过空间分辨单细胞转录组学(seqFISH)揭示微胶质细胞从早期效应吞噬到晚期的纤维化重塑转变,并发现精氨酸酶-1(ARG1)相关信号通路的关键调控作用 | 未提及 | 表征新生小鼠缺氧缺血后微胶质细胞中精氨酸酶-1相关的通路,识别不同阶段的效应吞噬和纤维化进程 | 新生小鼠(P9)海马组织 | 空间转录组学, 计算生物学 | 缺氧缺血性脑损伤 | seqFISH(空间分辨单细胞转录组学) | NA | 基因表达数据 | 新生小鼠(P9)脑样本,评估时间点为缺氧缺血后24小时(D1)和5天(D5) | NA | 单细胞RNA测序(空间转录组学) | NA | NA |
| 2820 | 2026-05-02 |
Tumor-infiltrating natural killer cell profiling for therapeutic stratification in patients with resectable non-small cell lung cancer
2026-Jan-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.01.696292
PMID:41509400
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research paper | 通过对肿瘤浸润自然杀伤细胞的单细胞RNA测序分析,研究吸烟相关的免疫细胞特征在可切除非小细胞肺癌患者治疗分层中的作用 | 首次鉴定出两种与吸烟和慢性阻塞性肺病严重程度相关的自然杀伤细胞亚型(应激反应性NK细胞和适应性免疫调节NK细胞),并揭示它们在不同治疗策略中的预测价值 | 样本量相对较小,且为回顾性研究,需要前瞻性队列验证;此外,未明确NK细胞亚型的功能机制 | 寻找吸烟相关的免疫细胞决定因素,以指导非小细胞肺癌患者的治疗策略优化 | 非小细胞肺癌患者的肿瘤组织和免疫细胞 | machine learning | lung cancer | single-cell RNA sequencing, bulk RNA sequencing | NA | sequencing data | 61份肺组织用于单细胞RNA测序,19份浸润性肺腺癌样本用于验证,102份手术切除的非小细胞肺癌和24例新辅助化疗免疫治疗患者样本用于反卷积和结果分析 | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |