单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 2801 - 2820 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2801 | 2025-10-06 |
Single cell RNA-sequencing reveals BHLHE40 and NDRG1 as key regulatory molecules modulating the trophoblastic senescence in preeclampsia
2025-Aug, Placenta
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.placenta.2025.06.009
PMID:40517485
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现BHLHE40和NDRG1是调控先兆子痫中滋养细胞衰老的关键分子 | 首次通过整合单细胞RNA测序、ChIP检测和转录组数据分析，揭示BHLHE40和NDRG1在滋养细胞衰老中的关键调控作用 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验验证，需要进一步在体功能验证 | 探索先兆子痫中滋养细胞衰老的分子机制和关键调控靶点 | 先兆子痫患者胎盘组织、LPS诱导的先兆子痫大鼠模型和体外培养的滋养细胞 | 单细胞测序分析 | 先兆子痫 | 单细胞RNA测序, ChIP检测, 转录组测序, WGCNA分析 | 列线图模型 | 基因表达数据 | 多个GEO数据集(GSE173193, GSE24129, GSE75010)和实验验证样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2802 | 2025-10-06 |
Single-Cell Omics Analysis Reveals Immunological Dysregulation in COVID-19 and HIV: Identifying a Shared Abnormality of B Cell Activation via the Unfolded Protein Response and Diagnostic Biomarkers Using Machine Learning Algorithms
2025-Aug, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.70538
PMID:40757697
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示COVID-19和HIV患者B细胞中未折叠蛋白反应通路的异常激活，并开发机器学习诊断模型 | 首次在单细胞水平发现COVID-19和HIV共享的B细胞未折叠蛋白反应通路异常激活机制 | 分子机制仍需进一步深入研究 | 探究COVID-19和HIV共存时疾病加重的分子机制 | COVID-19和HIV感染患者的外周血细胞 | 单细胞组学 | COVID-19, HIV | 单细胞转录组测序 | 机器学习诊断模型 | 单细胞转录组数据，批量转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2803 | 2025-10-06 |
Preliminary Study on GZMA- and GSDMB-Associated Pyroptosis and CD8+ T Cell-Mediated Immune Evasion in Skin Cutaneous Melanoma
2025-Jul-31, Current topics in medicinal chemistry
IF:2.9Q3
|
研究论文 | 本研究探讨皮肤黑色素瘤中GZMA和GSDMB相关焦亡及CD8+ T细胞介导的免疫逃逸机制 | 首次在单细胞水平揭示CD8+ T细胞通过GZMA蛋白与黑色素瘤细胞相互作用促进肿瘤免疫逃逸的机制 | 未检测到显著焦亡相关差异表达基因，焦亡通路在肿瘤组未被激活 | 基于焦亡特征揭示皮肤黑色素瘤的发病机制 | 皮肤黑色素瘤患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 皮肤黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, qRT-PCR, CCK-8, 伤口愈合实验, Transwell实验 | 差异表达分析, 基因集富集分析, 细胞通讯分析 | 基因表达数据, 临床信息 | TCGA和GEO数据库中的SKCM患者数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 2804 | 2025-10-06 |
Traditional medicine Kuanxiong Aerosol alleviates atherosclerotic plaque inflammation by mitigating CX3CR1+ macrophage apoptosis via the cGAS-STING pathway
2025-Jul-30, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.157120
PMID:40753933
|
研究论文 | 本研究探讨宽胸气雾剂通过cGAS-STING通路减轻CX3CR1+巨噬细胞凋亡，从而缓解动脉粥样硬化斑块炎症的作用机制 | 首次揭示宽胸气雾剂对巨噬细胞亚群的调控作用及其抗凋亡功能 | NA | 探索宽胸气雾剂治疗动脉粥样硬化的潜力及其作用机制 | ApoE-/-小鼠模型 | 生物医学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,超高效液相色谱-高分辨质谱,生物信息学分析,分子对接 | NA | 基因表达数据,质谱数据,组织学图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2805 | 2025-10-06 |
Analyses of Nogo-Family Genes in Mouse and Human Microglia Omics Datasets Identify LINGO1 as a Candidate Drug Target in Alzheimer's Disease
2025-Jul-30, Current neuropharmacology
IF:4.8Q1
|
研究论文 | 通过分析小鼠和人类小胶质细胞组学数据，探索Nogo家族基因表达模式并鉴定LINGO1作为阿尔茨海默病的潜在药物靶点 | 首次发现LINGO1在人类AD小胶质细胞中高度富集，并系统分析了Nogo信号系统在小胶质细胞中的表达特征 | 研究主要基于公开数据集，需要进一步实验验证功能机制 | 探索Nogo家族基因在小胶质细胞中的表达模式及其在阿尔茨海默病中的作用 | 小鼠和人类小胶质细胞 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞测序，RNA-seq，RiboTag翻译谱分析 | NA | 基因表达数据，单细胞测序数据 | 整合21个人类脑细胞单细胞测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | CZ CellxGene Discover | 用于整合分析21个单细胞测序数据集的工具平台 |
| 2806 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptomics: Technical Advances, Applications and Challenges in Cancer Drug Discovery
2025-Jul-30, Current cancer drug targets
IF:2.3Q3
|
综述 | 本文全面概述单细胞RNA测序技术在癌症药物发现中的技术进展、应用与挑战 | 重点强调单细胞转录组学在解析肿瘤异质性和识别药物靶点方面的创新应用 | 讨论了单细胞RNA测序技术当前面临的技术挑战 | 促进读者对单细胞测序的理解，启发肿瘤药物开发新思路 | 癌症药物发现过程 | 单细胞组学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2807 | 2025-10-06 |
Renin Cells Drive Kidney Neurovascular Development and Arterial Remodeling when Renin Activity is Deficient
2025-Jul-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.08.663706
PMID:40672316
|
研究论文 | 本研究通过新型超亮肾素细胞特异性报告小鼠模型，揭示了肾素细胞在肾脏神经血管发育和动脉重塑中的关键作用 | 开发了超亮肾素细胞特异性tdTomato报告小鼠模型，首次实现了对稀有肾素细胞（仅占肾脏细胞0.01%）与神经纤维相互作用的3D可视化 | 研究主要基于小鼠模型，在人类中的适用性需要进一步验证 | 探索肾素细胞在肾脏神经血管发育和动脉重塑中的功能机制 | 肾素细胞、肾脏神经纤维、动脉血管 | 发育生物学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序, 高分辨率3D成像 | 转基因小鼠模型 | 基因表达数据, 影像数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2808 | 2025-10-06 |
Comparative ScRNA-Seq Profiling of Antigen-Specific CD4+ T cells in Semi-Allogeneic Transplantation and Pregnancy Reveals Intersecting Signatures of Rejection and Tolerance
2025-Jul-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.06.663404
PMID:40672265
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序比较半同种异体移植和妊娠中抗原特异性CD4+ T细胞的转录特征，揭示排斥和耐受的交叉特征 | 首次系统比较移植和妊娠模型中供体特异性CD4+ T细胞的单细胞转录组特征，发现排斥和成功妊娠中激活的滤泡和非滤泡效应表型存在显著重叠 | 研究基于小鼠模型，人类数据的验证仍需进一步研究 | 探究移植和妊娠免疫中抗原特异性CD4+ T细胞在排斥和耐受状态下的转录特征 | 供体特异性CD4+ T细胞（包括常规T细胞和调节性T细胞） | 免疫学 | 移植免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型（包括naïve或父系皮肤致敏妊娠模型、同种异体心脏移植模型） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2809 | 2025-10-06 |
Metabolic Analysis of Tumor Cells Within Ameloblastoma at the Single-Cell Level
2025-Jul, Oral diseases
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/odi.15239
PMID:39737843
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析成釉细胞瘤肿瘤细胞的代谢异质性 | 首次在单细胞水平揭示成釉细胞瘤肿瘤细胞的代谢异质性，发现线粒体编程和糖酵解的变异是肿瘤细胞代谢特征的主要贡献者 | 仅分析了3例患者样本，样本量较小；研究主要基于计算分析框架 | 表征成釉细胞瘤在单细胞分辨率下的代谢异质性 | 成釉细胞瘤肿瘤细胞 | 单细胞组学 | 成釉细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | 生物信息学分析 | 单细胞转录组数据 | 3例AB供体的17,284个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2810 | 2025-10-06 |
CCL19+ Fibroblasts Promote Tertiary Lymphoid Structure in Oral Lichen Planus: A Retrospective Study
2025-Jul, Oral diseases
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/odi.15266
PMID:39962879
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和多重免疫荧光染色揭示了口腔扁平苔藓中CCL19+成纤维细胞通过促进三级淋巴结构形成加剧疾病严重性的机制 | 首次在口腔扁平苔藓中发现CCL19+成纤维细胞在三级淋巴结构形成中的关键作用，并阐明其通过淋巴毒素激活促进T细胞趋化的机制 | 回顾性研究设计，样本量有限 | 阐明口腔扁平苔藓中适应性免疫的启动机制，特别关注诱导性三级淋巴结构和基质-免疫微环境的作用 | 口腔扁平苔藓患者 | 数字病理学 | 口腔扁平苔藓 | 单细胞RNA测序，多重免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据，图像数据 | 口腔扁平苔藓患者回顾性临床数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2811 | 2025-10-06 |
Exact Expectation of Complete Spatial Randomness for Nearest Neighbor G(r): A Scalable Alternative to Permutations
2025-Jun-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.11.659088
PMID:40666920
|
研究论文 | 提出一种无需排列检验即可计算最近邻G(r)函数完全空间随机性的解析解方法 | 提供了最近邻G(r)函数样本特异性完全空间随机性的均值和方差的闭式解析解 | NA | 开发快速可重复的空间分析方法，避免计算昂贵的排列检验 | 空间点模式分析中的最近邻分布 | 空间分析 | 肾细胞癌 | 多重免疫荧光，空间分析 | 解析解方法 | 空间点数据，图像数据 | 模拟样本30个点，真实透明细胞肾细胞癌样本 | NA | 多重免疫荧光，空间转录组学 | NA | NA |
| 2812 | 2025-10-06 |
Spatially-distinct programming of macrophage diversity within the granulomas of Mycobacterium tuberculosis infected nonhuman primates
2025-Jun-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.12.659348
PMID:40667206
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和免疫荧光技术研究非人灵长类动物结核病肉芽肿中巨噬细胞的空间分布和功能多样性 | 首次在早期结核病非人灵长类模型中揭示巨噬细胞在肉芽肿内的空间特异性分布模式及其与结核分枝杆菌感染的关联 | 研究仅限于早期结核病阶段和非人灵长类动物模型，结果可能不完全适用于人类疾病进展 | 探究结核病肉芽肿中巨噬细胞的表型和功能多样性及其空间分布特征 | 非人灵长类动物肺组织和结核病肉芽肿中的巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 结核病 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | 非人灵长类动物肺组织和肉芽肿样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2813 | 2025-10-06 |
Identification of the CD8 + T-cell Related Signature for Predicting the Prognosis of Gastric Cancer Based on Integrated Analysis of Bulk and Single-cell RNA Sequencing Data
2024-Sep-01, Journal of immunotherapy (Hagerstown, Md. : 1997)
DOI:10.1097/CJI.0000000000000528
PMID:38809517
|
研究论文 | 基于批量RNA测序和单细胞RNA测序数据整合分析，构建了预测胃癌预后的CD8+T细胞相关特征模型 | 首次整合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据构建CD8+T细胞相关特征模型，用于胃癌预后预测和免疫治疗指导 | 研究依赖于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 开发能够预测胃癌预后和免疫治疗反应的生物标志物 | 胃癌患者和相关的基因表达数据 | 生物信息学 | 胃癌 | RNA测序，单细胞RNA测序 | 风险模型，列线图 | 基因表达数据 | 来自TCGA数据库和GSE134520数据集的胃癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 2814 | 2025-10-06 |
TIGIT Blockade Reshapes the Tumor Microenvironment Based on the Single-cell RNA-Sequencing Analysis
2024-Jun-01, Journal of immunotherapy (Hagerstown, Md. : 1997)
DOI:10.1097/CJI.0000000000000511
PMID:38545758
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示TIGIT阻断如何重塑肿瘤微环境 | 首次在治疗前后使用单细胞测序全面分析TIGIT阻断对肿瘤免疫微环境的影响，揭示了TIGIT阻断通过抑制Treg细胞、激活NK细胞和促进cDC1成熟的多重机制增强抗肿瘤免疫 | 研究基于小鼠模型，尚未在人体中验证 | 探究TIGIT阻断治疗对肿瘤免疫微环境的影响机制 | 小鼠肿瘤模型中的免疫细胞 | 单细胞测序分析 | 恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 治疗前后的小鼠样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2815 | 2025-10-06 |
AI identifies potent inducers of breast cancer stem cell differentiation based on adversarial learning from gene expression data
2024-03-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae207
PMID:38701411
|
研究论文 | 基于对抗学习从基因表达数据中识别有效的乳腺癌干细胞分化诱导剂 | 开发了一种基于对抗学习的深度神经网络模型，能够有效消除不同数据域间的特异性偏差 | 仅基于转录组学数据，未考虑其他分子层面的信息 | 识别能够诱导乳腺癌干细胞分化的小分子化合物 | 乳腺癌干细胞(MDA-MB-231和MCF7细胞系) | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 深度神经网络, 对抗学习 | 基因表达数据 | 来自未处理人诱导多能干细胞不同分化阶段的公开单细胞RNA-Seq数据，以及LINCS数据库中的药物诱导基因表达谱 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2816 | 2025-10-06 |
scCRT: a contrastive-based dimensionality reduction model for scRNA-seq trajectory inference
2024-03-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae204
PMID:38701412
|
研究论文 | 提出了一种基于对比学习的降维模型scCRT，用于单细胞RNA测序数据的轨迹推断 | 整合了细胞级成对模块和集群级对比模块，充分利用上游分析的先验信息学习准确的细胞表示 | NA | 开发专门用于单细胞RNA测序轨迹推断的降维方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 对比学习降维模型 | 基因表达数据 | 54个真实数据集和81个合成数据集，总计135个数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2817 | 2025-10-06 |
scEWE: high-order element-wise weighted ensemble clustering for heterogeneity analysis of single-cell RNA-sequencing data
2024-03-27, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae203
PMID:38701413
|
研究论文 | 提出一种基于高阶元素加权策略的单细胞RNA测序数据集成聚类方法scEWE | 提出高阶元素加权策略，为单个细胞分配不同的基聚类权重，并提取细胞间的高阶信息增强相似性关系表示能力 | NA | 改进单细胞RNA测序数据的异质性分析性能 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 集成学习框架 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2818 | 2025-10-06 |
A New Method for Constructing Macrophage-Associated Predictors of Treatment Efficacy Based on Single-Cell Sequencing Analysis
2024 Feb-Mar 01, Journal of immunotherapy (Hagerstown, Md. : 1997)
DOI:10.1097/CJI.0000000000000497
PMID:37982646
|
研究论文 | 基于单细胞测序分析构建巨噬细胞相关治疗疗效预测因子的新方法 | 开发了基于单细胞测序的巨噬细胞相关风险评分(TRS)模型，能够预测结直肠癌患者的预后和治疗反应 | NA | 构建结直肠癌中肿瘤相关巨噬细胞的预后预测模型并评估其治疗预测价值 | 结直肠癌患者和肿瘤相关巨噬细胞 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞测序分析 | Cox回归, LASSO回归 | 基因表达数据 | 来自TCGA和GEO数据库的结直肠癌患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2819 | 2025-10-06 |
Spatial pattern enhanced cellular and tissue recognition for spatial transcriptomics
2025-Sep, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaf106
PMID:40746376
|
研究论文 | 开发了一种名为SPECTRUM的空间转录组数据分析方法，用于细胞类型识别和空间社区检测 | 结合了先验已知的细胞类型特异性标记和空间加权方法，增强了细胞和组织识别的空间模式分析能力 | NA | 开发空间转录组数据分析工具以揭示组织空间组织的关键因素和机制 | 空间转录组数据中的细胞类型和空间社区 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | SPECTRUM | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2820 | 2025-10-06 |
Identification of m5C-related genes and subclusters in recurrent pregnancy loss
2025-Aug-02, Journal of assisted reproduction and genetics
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10815-025-03580-9
PMID:40751792
|
研究论文 | 通过生物信息学方法识别复发性流产中m5C相关基因并分析其与免疫细胞的关联 | 首次将复发性流产患者分为两个亚群并分析其免疫微环境差异，建立了高精度的诊断模型 | 样本量较小（48例子宫内膜组织样本），需要进一步实验验证 | 阐明m5C相关基因与复发性流产发病机制的关系 | 复发性流产患者的子宫内膜组织样本 | 生物信息学 | 复发性流产 | 机器学习，单细胞RNA测序，基因集富集分析 | 机器学习模型，列线图 | 基因表达数据 | 48例子宫内膜组织样本（24例RPL样本） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |