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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2801 | 2026-02-07 |
Single-cell transcriptomics of X-ray irradiated Drosophila wing discs reveals heterogeneity related to cell-cycle status and cell location
2025-Feb-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.10.627868
PMID:39990483
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学分析了X射线辐射对果蝇翅盘的影响,揭示了基于细胞周期状态和细胞位置的异质性 | 首次在果蝇翅盘中应用单细胞RNA测序研究X射线辐射效应,并采用Herfindahl-Hirschman Index量化基因表达异质性,发现辐射响应在区域间和区域内均存在非均匀性 | 研究仅聚焦于果蝇翅盘这一相对简单的组织,可能无法完全代表更复杂组织或哺乳动物系统的辐射响应 | 探究X射线辐射对组织细胞异质性的影响,特别是基因表达在空间和功能上的差异 | 果蝇翅盘中的上皮细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确指定样本数量,但涉及果蝇翅盘细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2802 | 2026-02-07 |
Exploring the Expanded Role of Astrocytes in Primate Brain Evolution via Changes in Gene Expression
2025, Brain, behavior and evolution
DOI:10.1159/000544004
PMID:39907990
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综述 | 本文探讨了灵长类大脑进化中星形胶质细胞基因表达和调控的变化,以解释其形态学表型差异 | 聚焦于灵长类进化中星形胶质细胞的基因表达和调控变化,结合诱导多能干细胞和单细胞RNA测序等新技术,动态解析其复杂性 | NA | 理解灵长类进化中星形胶质细胞的变化及其在神经系统疾病中的作用 | 灵长类大脑中的星形胶质细胞 | 自然语言处理 | 阿尔茨海默病, 帕金森病 | 诱导多能干细胞, 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2803 | 2026-02-07 |
Dissecting the immune evasion and therapeutic resistance mechanisms in EGFR/TP53 co-mutated non-small cell lung cancer: implications for targeted and immunotherapy strategies
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1652213
PMID:40948762
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,揭示了EGFR/TP53共突变非小细胞肺癌中促进免疫逃逸和治疗抵抗的协调转录网络 | 首次在单细胞水平上解析了EGFR/TP53共突变NSCLC的免疫微环境,并发现了由STAT1/ETS1转录程序调控的关键免疫抑制和耐药基因网络 | 样本量较小(仅4个样本用于单细胞分析),需要在更大的患者队列和功能研究中进一步验证 | 探究EGFR/TP53共突变非小细胞肺癌中导致侵袭性亚型和治疗抵抗的分子机制 | 非小细胞肺癌患者的肿瘤样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,靶向二代测序 | NA | RNA测序数据 | 40例NSCLC患者样本(其中4例用于单细胞分析) | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Genomics平台 | NA |
| 2804 | 2026-02-07 |
Spatial regulation of ribosomal protein gene expression revealed by spatial transcriptomic analysis in the water fern Ceratopteris richardii
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1728120
PMID:41635689
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术分析水蕨Ceratopteris richardii的孢子体发育,揭示了核糖体蛋白基因在组织间的空间表达调控 | 首次在水蕨中应用空间转录组学技术,并发现核糖体相关功能在几乎所有组织域中普遍富集,且核糖体蛋白基因及其旁系同源物在不同组织间存在差异表达模式 | 研究仅针对水蕨一种植物,且未深入探讨核糖体蛋白基因差异表达的具体功能机制 | 阐明植物发育过程中基因表达的空间调控机制 | 水蕨Ceratopteris richardii的孢子体发育组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2805 | 2026-02-07 |
Comprehensive analysis of IGFL1 in colorectal cancer and its promotion of tumour progression via inhibition of lipophagy
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1719525
PMID:41635856
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证,揭示了IGFL1在结直肠癌中的表达上调及其通过抑制脂噬促进肿瘤进展的机制 | 首次全面阐明IGFL1在结直肠癌中的致癌作用,并发现其通过抑制脂噬这一新机制促进肿瘤进展 | 研究主要基于细胞系实验和公共数据库分析,缺乏体内动物模型验证和更大规模的临床队列验证 | 阐明IGFL1在结直肠癌中的功能作用及其分子机制 | 结直肠癌组织样本、TCGA和GEO数据库数据、结直肠癌细胞系SW620和HCT116 | 生物信息学 | 结直肠癌 | RNA测序、免疫组化、单细胞RNA测序、生物信息学分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据、单细胞测序数据 | TCGA和GEO数据库中的结直肠癌样本、临床组织样本、SW620和HCT116细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2806 | 2026-02-07 |
Hematopoietic stem cell heterogeneity and age-related platelet bias: implications for bone marrow transplantation and blood disorders
2024-12-02, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-024-04084-6
PMID:39623507
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综述 | 本文综述了造血干细胞(HSCs)的异质性,特别是与年龄相关的血小板偏向性(P-HSCs),并探讨了其对骨髓移植和血液疾病的临床意义 | 聚焦于Claus Nerlov团队的研究,揭示了血小板偏向性HSCs在物种间的进化保守性及其在衰老过程中的扩增 | 讨论了当前研究方法(如单细胞RNA测序和分子条形码技术)的局限性,并提出了未来研究方向 | 优化基于HSC的疗法,改善血液疾病的临床结果 | 造血干细胞(HSCs),特别是血小板偏向性HSCs(P-HSCs) | NA | 血液疾病 | 单细胞RNA测序,分子条形码 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2807 | 2026-02-07 |
N-CADHERIN+/CD168- subpopulation determines therapeutic variations of UC-MSCs for cardiac repair after myocardial infarction
2024-11-13, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-024-04032-4
PMID:39533355
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,鉴定了脐带间充质干细胞中N-CADHERIN+/CD168-亚群在心肌梗死后心脏修复中的关键作用,并揭示了其与治疗疗效差异的关联 | 首次利用单细胞RNA测序技术识别出UC-MSCs中N-CADHERIN+/CD168-亚群作为促进血管生成的功能亚群,并证实其比例与治疗心肌梗死的疗效正相关 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体临床试验中验证;样本量相对有限,且仅针对脐带来源的MSCs | 探究间充质干细胞治疗心肌梗死疗效不一致的机制,并筛选出关键功能亚群以提高治疗效果 | 脐带来源的间充质干细胞(UC-MSCs)及其亚群,以及心肌梗死小鼠模型 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、GSEA分析、Scissor分析、管形成实验、迁移和增殖实验 | NA | 单细胞RNA测序数据、蛋白质分泌数据、细胞功能实验数据 | 10,463个UC-MSCs进行单细胞RNA测序,使用不同供体的UC-MSCs治疗心肌梗死小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2808 | 2026-02-07 |
Phenotypic and transcriptomic profiling of induced pluripotent stem cell (iPSC)-derived NK cells and their cytotoxicity against cancers
2024-11-13, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-024-04029-z
PMID:39533434
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研究论文 | 本研究开发了一种高效、无饲养层的单层分化方案,从诱导多能干细胞生成自然杀伤细胞,并评估了其表型、转录组特征及对胆管癌和乳腺癌细胞的细胞毒性 | 开发了一种新的、更高效的无饲养层单层分化方案来生成iNK细胞,避免了传统胚状体培养方案的劳动密集性和异质性,并通过单细胞RNA测序证实了其转录组特征与PB-NK细胞高度相似 | NA | 开发一种更高效、均一的iPSC来源NK细胞生成方法,并评估其作为'现货'免疫治疗产品的潜力 | 诱导多能干细胞来源的自然杀伤细胞 | NA | 胆管癌, 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 转录组数据, 表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2809 | 2026-02-07 |
High-Dimensional Overdispersed Generalized Factor Model With Application to Single-Cell Sequencing Data Analysis
2024-11-10, Statistics in medicine
IF:1.8Q1
DOI:10.1002/sim.10213
PMID:39237124
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研究论文 | 本文提出了一种用于高维非线性因子分析的过离散广义因子模型(OverGFM),以处理过离散混合类型数据,并应用于单细胞测序数据分析 | 引入额外误差项以捕获因子无法解释的过离散性,并开发了一种结合拉普拉斯和泰勒近似的新型变分EM算法,解决了高维非线性模型中的计算挑战 | 未明确讨论模型在极端过离散或稀疏数据场景下的鲁棒性,且应用仅限于基因组学领域 | 开发一种能够处理高维过离散混合类型数据的非线性因子分析方法 | 过离散混合类型数据,特别是单细胞测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 过离散广义因子模型(OverGFM) | 混合类型数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2810 | 2026-02-06 |
Single-cell transcriptomics and machine-learning reveal M1 macrophage-driven progression from minimal change disease to focal segmental glomerulosclerosis
2026-Dec, Renal failure
IF:3.0Q1
DOI:10.1080/0886022X.2026.2620204
PMID:41622775
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和机器学习,揭示了M1巨噬细胞驱动从微小病变肾病向局灶节段性肾小球硬化进展的关键基因 | 首次结合单细胞转录组学和机器学习识别出六个与M1巨噬细胞激活相关的关键基因,作为预测疾病进展的潜在生物标志物 | 研究主要基于小鼠和SD大鼠模型,人类样本验证有限,且疾病进展机制可能涉及更多因素 | 探究微小病变肾病向局灶节段性肾小球硬化进展的分子机制,并识别预测性生物标志物 | MCD和FSGS患者的单细胞转录组数据,以及SD大鼠模型 | 机器学习 | 肾病综合征 | 单细胞转录组学,qRT-PCR,免疫组织化学染色 | 机器学习算法 | 单细胞转录组数据,基因表达数据 | 基于公开数据集GSE213030和GSE176465,以及SD大鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2811 | 2026-02-06 |
Research on tissue-resident macrophages in the field of cancer research: a bibliometric analysis from 2004 to 2025
2026-Dec, Cell adhesion & migration
IF:3.3Q3
DOI:10.1080/19336918.2026.2624204
PMID:41627832
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综述 | 本研究通过文献计量学方法分析了2004年至2025年间肿瘤研究中组织驻留巨噬细胞的研究现状与趋势 | 采用VOSviewer、CiteSpace、R软件和WoSCC构建可视化文献计量网络,对TRMs在肿瘤学领域的研究进行定量分析,并深入探讨未来研究方向 | NA | 分析肿瘤微环境中组织驻留巨噬细胞的研究现状、热点和趋势 | 组织驻留巨噬细胞(TRMs),特别是小胶质细胞和库普弗细胞等亚群 | 肿瘤学 | 癌症 | 文献计量分析,单细胞测序 | NA | 文献数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2812 | 2026-02-06 |
Efferocytosis-associated transcriptomic patterns characterize prognosis and immune landscape in osteosarcoma
2026-Apr, Journal of bone oncology
IF:3.1Q2
DOI:10.1016/j.jbo.2026.100743
PMID:41631009
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据,构建了一个与胞葬作用相关的骨肉瘤预后特征,并揭示了MAGEA11通过Gas6-MERTK/AXL通路促进免疫抑制的机制 | 首次在骨肉瘤中系统性地将胞葬作用与预后、免疫微环境及单细胞/空间转录组特征联系起来,并鉴定出关键基因MAGEA11的功能机制 | 研究结论主要基于生物信息学分析和有限的实验验证,需要在更大规模的独立队列和更深入的体内外模型中进一步确认 | 阐明胞葬作用在骨肉瘤进展和免疫微环境重塑中的作用,并开发相关的预后标志物 | 骨肉瘤患者(来自TARGET-OS和GEO数据库的队列)及相关的细胞与动物模型 | 生物信息学,计算生物学,肿瘤免疫学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,加权基因共表达网络分析,机器学习模型,体内外功能实验 | StepCox + Ridge 回归模型,机器学习模型 | 转录组数据,单细胞RNA-seq数据,空间转录组数据 | 多个公共数据库队列(TARGET-OS及三个GEO数据集)用于建模与验证,额外包括6名骨肉瘤患者的单细胞RNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 2813 | 2026-02-06 |
Oyster cellular architecture and innate immune programs resolved by single-cell RNA sequencing
2026-Mar, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2026.111128
PMID:41539414
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序解析了香港牡蛎的组织细胞结构及其先天免疫程序 | 首次在海洋无脊椎动物中构建了组织分辨的单细胞图谱,定义了二十种细胞类型,揭示了吞噬细胞谱系的三种终末策略以及神经、上皮和免疫细胞群之间以NCAM和PTPRM为中心的关键通讯通路 | 研究聚焦于单一物种(香港牡蛎),其发现向其他海洋无脊椎动物的普适性有待验证 | 解析海洋无脊椎动物屏障黏膜组织的细胞结构、功能分工及先天免疫程序 | 香港牡蛎(Crassostrea hongkongensis)的组织细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2814 | 2026-02-06 |
Overexpression, clinical significance and potential mechanisms of protein kinase D1 in hepatocellular carcinoma: multi-omic analyses and pharmacological insights
2026-Feb-05, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-026-01825-z
PMID:41639489
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研究论文 | 本研究通过多组学分析和药理学实验,揭示了蛋白激酶D1 (PRKD1) 在肝细胞癌中的过表达、临床意义、潜在机制及其作为治疗靶点的潜力 | 首次在肝细胞癌中系统整合了免疫组化、bulk RNA测序、单细胞RNA测序和体外功能实验,全面阐明了PRKD1在肿瘤进展、免疫微环境调控和酪氨酸激酶抑制剂反应中的多面性作用,并发现了硝基氯喹啉作为潜在抑制剂 | 研究主要基于体外实验和回顾性数据分析,缺乏体内动物模型验证和前瞻性临床队列的验证 | 探究PRKD1在肝细胞癌中的表达、功能、临床意义及其作为治疗靶点的潜力 | 肝细胞癌组织、细胞系 (包括THP-1细胞) 及相关转录组数据 | 数字病理 | 肝细胞癌 | 免疫组织化学, bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 体外功能实验, 分子对接 | NA | 图像, 转录组数据 | 339对肝细胞癌组织与癌旁组织,以及多中心bulk转录组数据和单细胞转录组数据 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2815 | 2026-02-06 |
Dissecting the development of bovine testicular tissue using spatial transcriptomics
2026-Feb-05, Journal of animal science and biotechnology
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s40104-025-01340-4
PMID:41639718
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研究论文 | 本研究首次构建了牛睾丸组织的空间转录图谱,系统描述了精子发生过程中的动态转录变化 | 首次利用Stereo-seq技术构建牛睾丸组织的空间转录图谱,揭示了牛生殖细胞群体的动态转录过程 | NA | 研究牛睾丸组织的发育过程,特别是精子发生期间的转录动态 | 牛睾丸组织,包括两个年龄段的样本(小牛和成年公牛) | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 两个年龄段的牛睾丸组织样本(小牛和成年公牛) | NA | 空间转录组学 | Stereo-seq | NA |
| 2816 | 2026-02-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals the heterogeneity and microenvironment of temporal bone squamous cell carcinoma
2026-Feb-05, Clinical and experimental otorhinolaryngology
IF:2.9Q1
DOI:10.21053/ceo.2025-00324
PMID:41639753
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研究论文 | 本研究首次利用单细胞RNA测序技术揭示了颞骨鳞状细胞癌的肿瘤异质性和微环境特征 | 首次报道了颞骨鳞状细胞癌的单细胞RNA测序数据,揭示了其肿瘤异质性、细胞分化轨迹以及免疫细胞间通讯特征 | 样本量较小(仅6名患者),且为罕见疾病,限制了结果的普适性 | 揭示颞骨鳞状细胞癌的肿瘤异质性和微环境特征,以寻找诊断和治疗生物标志物 | 颞骨鳞状细胞癌患者组织样本 | 数字病理学 | 颞骨鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6名患者的9个样本(5个癌组织,4个癌旁正常组织),共计113,344个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2817 | 2026-02-06 |
XCR1+ Conventional type 1 dendritic cells exacerbate the inflammation in osteogenic arthritis through IL-17A+CD8+ T cells
2026-Feb-05, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.70069
PMID:41640334
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和TCR分析,揭示了XCR1+传统1型树突状细胞通过IL-17A+CD8+ T细胞加剧骨性关节炎炎症的机制 | 首次发现cDC1s在骨性关节炎中通过MHC I抗原呈递与CD8+ T细胞相互作用,并利用versican衍生肽建立新型AS小鼠模型 | 样本量较小(33例患者标本),且小鼠模型可能无法完全模拟人类疾病复杂性 | 探究强直性脊柱炎和附着点炎相关关节炎的病理机制,特别是免疫细胞在骨重塑关节炎中的作用 | 早期类风湿关节炎和强直性脊柱炎患者的病变组织,以及新型AS小鼠模型 | 数字病理学 | 骨性关节炎 | 单细胞RNA-seq, TCR分析, 流式细胞术, 多重免疫荧光 | NA | RNA序列数据, 图像数据 | 33例患者标本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2818 | 2026-02-06 |
Single-Cell Sequencing Reveals Varying Cell-Mediated Immunity Profiles in Individuals with Distinct Antibody Responses Following Ad5-nCoV Booster
2026-Feb-05, The Journal of infectious diseases
IF:5.0Q1
DOI:10.1093/infdis/jiag078
PMID:41640352
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术,分析了Ad5-nCoV加强针接种后不同抗体反应个体的细胞介导免疫特征,揭示了细胞免疫在疫苗免疫应答中的关键作用 | 首次在Ad5-nCoV加强针接种背景下,结合单细胞测序技术系统比较了高、低抗体滴度个体的细胞动态、转录组谱、免疫受体库和细胞通讯差异,为疫苗效力评估提供了整合体液和细胞免疫的新视角 | 研究样本仅基于PBMC,未涉及组织特异性免疫反应;队列规模为144人,可能限制了对罕见细胞亚群的检测;研究为观察性设计,未进行机制验证实验 | 探究Ad5-nCoV加强针接种后个体间免疫应答差异的细胞和分子机制,以完善疫苗效力评估框架 | 144名Ad5-nCoV加强针接种者的外周血单个核细胞(PBMC)样本,按抗体滴度分为高反应组和低反应组 | 单细胞组学 | 传染病(COVID-19) | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据、免疫受体序列数据 | 144名参与者的PBMC样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2819 | 2026-02-06 |
Novel insights into the mechanism of formaldehyde-induced lung cancer: a network toxicology and molecular docking approach
2026-Feb-05, Toxicology mechanisms and methods
IF:2.8Q2
DOI:10.1080/15376516.2026.2621747
PMID:41641566
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研究论文 | 本研究通过网络毒理学和分子对接技术,探索甲醛对肺癌的复杂影响,揭示其分子机制 | 结合网络毒理学、分子对接和单细胞RNA测序数据挖掘,从生物网络角度系统分析甲醛致肺癌的分子机制,发现传统毒理学方法难以揭示的复杂关系 | 研究主要基于数据库信息和计算模拟,缺乏实验验证,且样本来源和具体技术细节未明确说明 | 理解甲醛影响肺癌的分子机制,为预防甲醛暴露引起的肺癌提供策略见解 | 甲醛与肺癌相关的潜在靶点基因及信号通路 | 生物信息学 | 肺癌 | 网络毒理学、分子对接、单细胞RNA测序数据挖掘 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2820 | 2026-02-06 |
HPV Integration in Head and Neck Cancer: Downstream Splicing Events and Expression Ratios Linked with Poor Outcomes
2026-Feb-04, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-0645
PMID:41269209
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研究论文 | 本研究通过分析头颈鳞状细胞癌(HNSCC)中的HPV整合事件,揭示了其与致癌基因网络、RNA剪接事件及临床预后的关联 | 首次基于大规模HNSCC队列,通过RNA而非DNA分析HPV整合,识别了致癌基因网络和HPV RNA特征(如剪接融合转录本和基因表达比)作为预后生物标志物 | HPV整合与临床结局的关系先前未确认,且研究可能受样本异质性或队列差异影响 | 探究HPV整合在HPV相关头颈癌中对人类和HPV基因表达及临床结局(复发和总生存)的影响 | 261个HPV相关HNSCC的bulk和单细胞RNA测序样本,包括来自五个队列的数据,其中62个来自新密歇根大学队列 | 数字病理学 | 头颈癌 | RNA测序(包括bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq) | NA | RNA测序数据 | 261个HPV相关HNSCC样本(包括bulk和单细胞RNA-seq),以及102个HPV阳性HNSCC参与者的DNA HPV整合事件数据 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |