单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 37892 篇文献，本页显示第 28081 - 28100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 28081 | 2024-08-07 |
Heterogeneity in quiescent Müller glia in the uninjured zebrafish retina drive differential responses following photoreceptor ablation
2023, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2023.1087136
PMID:37575968
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）探讨了斑马鱼视网膜中静息状态的Müller胶质细胞在光感受器选择性消融后的基因表达异质性及其对再生反应的影响 | 首次揭示了斑马鱼视网膜中静息状态的Müller胶质细胞在不同区域的基因表达异质性，并展示了这些细胞在神经消融后的独特激活和再生特征 | 尚未完全阐明Müller胶质细胞激活及视网膜再生的分子机制 | 探究斑马鱼视网膜中Müller胶质细胞在神经消融后的激活及再生特征 | 斑马鱼视网膜中的Müller胶质细胞及光感受器 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 涉及斑马鱼视网膜中不同区域的Müller胶质细胞样本 | NA | NA | NA | NA |
| 28082 | 2024-08-07 |
Integrative single-cell analysis of cardiac and pulmonary sarcoidosis using publicly available cardiac and bronchoalveolar lavage fluid sequencing datasets
2023, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2023.1227818
PMID:37576111
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研究论文 | 本研究利用公开的心脏和支气管肺泡灌洗液单细胞RNA测序数据集，对心脏和肺部结节病进行了综合单细胞分析 | 首次综合分析了心脏和肺部结节病的单细胞转录组数据，揭示了两种结节病之间的共享转录趋势 | 研究依赖于公开数据集，可能无法涵盖所有相关细胞类型和病理情况 | 探讨心脏和肺部结节病的病理机制及其在转录水平上的差异和共性 | 心脏结节病（CS）和肺部结节病（PS）的细胞类型及其转录特征 | 数字病理学 | 结节病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 使用了两个公开的支气管肺泡灌洗单细胞RNA测序数据集和两个公开的心脏单核RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 28083 | 2024-08-07 |
A Novel Prognostic Signature of comprising Nine NK Cell signatures Based on Both Bulk RNA Sequencing and Single-Cell RNA Sequencing for Hepatocellular Carcinoma
2023, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.85873
PMID:37576389
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，开发了一种基于九个NK细胞标志物的肝细胞癌预后模型 | 首次基于单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，开发了一种新的肝细胞癌预后标志物模型 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序识别NK细胞标记基因，并开发肝细胞癌的预后标志物 | 肝细胞癌的NK细胞标记基因及预后标志物 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | LASSO-COX算法 | RNA测序数据 | 单细胞RNA测序数据来自10名患者，批量RNA测序数据来自786名患者 | NA | NA | NA | NA |
| 28084 | 2024-08-07 |
Nicotinamide N-Methyl Transferase as a Predictive Marker of Tubular Fibrosis in CKD
2023, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S420706
PMID:37576910
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研究论文 | 本研究旨在验证尼克酰胺N-甲基转移酶（NNMT）作为慢性肾脏病（CKD）进展的预测标志物 | 首次验证NNMT作为CKD进展的预测标志物，并探讨其在肾小管间质纤维化中的作用 | 研究样本量较小，需要进一步的大规模研究验证 | 验证NNMT作为CKD进展的预测标志物 | NNMT表达与CKD相关结果变量的关系 | NA | 慢性肾脏病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 37名CKD患者 | NA | NA | NA | NA |
| 28085 | 2024-08-07 |
Identification of novel gene signature for lung adenocarcinoma by machine learning to predict immunotherapy and prognosis
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1177847
PMID:37583701
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研究论文 | 本研究通过机器学习方法识别出与肺腺癌（LUAD）免疫治疗和预后相关的新基因标志物，并构建了一个风险模型以指导LUAD患者的个性化治疗 | 本研究首次通过机器学习方法识别出27个与预后相关的免疫细胞标志基因，并构建了一个七基因风险模型，用于指导LUAD患者的免疫治疗和预后评估 | NA | 构建一个风险模型以有效指导肺腺癌（LUAD）患者的免疫治疗 | 肺腺癌（LUAD）患者的免疫治疗和预后 | 机器学习 | 肺腺癌 | RNA测序（RNA-seq）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、微阵列数据分析 | NA | RNA测序数据、单细胞RNA测序数据、微阵列数据 | 使用了来自TCGA和GEO数据库的LUAD Bulk RNA-seq数据、scRNA-seq数据（GSE203360）和微阵列数据（GSE31210） | NA | NA | NA | NA |
| 28086 | 2024-08-07 |
Hepatocellular carcinoma cell differentiation trajectory predicts immunotherapy, potential therapeutic drugs, and prognosis of patients
2023, Open life sciences
IF:1.7Q3
DOI:10.1515/biol-2022-0656
PMID:37589009
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研究论文 | 本研究旨在探索肝细胞癌（HCC）细胞的新分类及其临床意义，通过分析综合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，将HCC细胞分为三个不同的分化状态子群，并基于HCC分化相关基因（HDRGs）识别出三种分子类别，揭示了免疫检查点基因表达和HCC患者的总体生存率 | 本研究通过细胞轨迹分析将HCC细胞分为三个不同的分化状态子群，并基于HDRGs识别出三种分子类别，进一步筛选出潜在的治疗药物，为HCC的个性化治疗提供了方向 | NA | 探索肝细胞癌细胞的新分类及其临床意义 | 肝细胞癌（HCC）细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | HCC样本 | NA | NA | NA | NA |
| 28087 | 2024-08-07 |
Integration of single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics to reveal the glioblastoma heterogeneity
2022, F1000Research
DOI:10.12688/f1000research.126243.2
PMID:36875988
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review | 本文综述了通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示的胶质母细胞瘤异质性的当前知识 | 强调了未来研究方向，以填补关于患者性别对疾病结果影响的知识的空白 | 目前的研究主要集中在揭示胶质母细胞瘤异质性的总体情况，未进一步探讨性别差异的影响 | 总结当前关于胶质母细胞瘤异质性的知识，并强调未来研究方向 | 胶质母细胞瘤的遗传、免疫学和性别依赖差异 | digital pathology | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 28088 | 2024-08-07 |
Biwhitening Reveals the Rank of a Count Matrix
2022, SIAM journal on mathematics of data science
IF:1.9Q1
DOI:10.1137/21m1456807
PMID:37576699
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研究论文 | 本文提出了一种名为Biwhitening的简单方法，用于估计包含计数随机变量的数据矩阵的秩，特别是在泊松随机矩阵的情况下 | 该方法通过同时缩放数据矩阵的行和列，使得相应的噪声谱与标准的Marchenko-Pastur定律一致，从而无需任何先验知识即可估计信号矩阵的秩 | NA | 研究如何在没有先验知识的情况下估计受污染数据矩阵的秩 | 泊松随机矩阵及其扩展到满足均值和方差之间二次关系的分布族 | 机器学习 | NA | Sinkhorn-Knopp算法 | NA | 计数矩阵 | 涉及单细胞RNA测序(scRNA-seq)、高通量染色体构象捕获(Hi-C)和文档主题建模等多个实际数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 28089 | 2024-08-05 |
Analysis of single-cell sequencing results of an elderly patient with myeloid leukemia reveals high expression of multiple oncogenes in monocytes and hematopoietic stem cells
2023-Dec, Hematology (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1080/16078454.2023.2240129
PMID:37535066
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研究论文 | 本研究分析了一名老年急性髓性白血病患者的单细胞基因组测序结果 | 该研究发现单核细胞和造血干细胞中多种癌基因的高表达，对急性髓性白血病的进展和治疗提供新见解 | 研究只针对一例老年急性髓性白血病患者，样本量较小，结果可能不具普遍性 | 分析老年急性髓性白血病患者的基因序列以提供新的治疗思路 | 一名64岁的急性髓性白血病患者的外周血和骨髓细胞 | 数字病理学 | 急性髓性白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 1名患者的外周血和骨髓细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 28090 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics reveals prominent expression of IL-14, IL-18, and IL-32 in psoriasis
2023-11, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202250354
PMID:37540729
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组分析揭示了牛皮癣中IL-14、IL-18和IL-32的重要表达。 | 首次在牛皮癣的不同细胞类型中部分确定IL-14、IL-18和IL-32的突出表达。 | 样本量仅限于八名患者，可能影响结果的普遍性。 | 深入描述牛皮癣中免疫细胞及其炎症介质的类型。 | 本研究的对象为牛皮癣患者的皮肤损伤及其相关免疫细胞。 | 数字病理学 | 牛皮癣 | 单细胞技术 | NA | 人类和小鼠的组织样本 | 8名牛皮癣患者的皮肤损伤样本 | NA | NA | NA | NA |
| 28091 | 2024-08-05 |
Transcriptome-wide association study-derived genes as potential visceral adipose tissue-specific targets for type 2 diabetes
2023-11, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-023-05978-5
PMID:37540242
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研究论文 | 本研究评估了内脏肥胖与2型糖尿病之间的因果关系，并筛选了针对2型糖尿病的内脏脂肪组织特异性靶点 | 本研究通过转录组广泛关联研究筛选了10个与2型糖尿病相关的内脏脂肪特异性候选基因 | 本研究的限制在于尚需通过进一步的功能研究验证这些候选基因 | 研究内脏脂肪组织与2型糖尿病之间的因果关系 | 分析2型糖尿病患者及其对照组的数据 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | Mendelian随机化，转录组广泛关联研究（TWAS） | 无 | 基因组数据 | 74,124例病例和824,006例对照 | NA | NA | NA | NA |
| 28092 | 2024-08-05 |
Exploring the human microbiome - A step forward for precision medicine in breast cancer
2023-11, Cancer reports (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/cnr2.1877
PMID:37539732
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综述 | 这篇综述文章探讨了微生物失调对乳腺癌发生的影响及其与乳腺癌特定分子亚型的相互作用 | 文章创新地讨论了微生物组作为癌症生物标志物的潜力，并整合了最新的微生物组研究技术和人工智能的进展 | 文章可能没有提供具体的实验数据和临床案例来支持其假设 | 旨在描述微生物失调如何影响乳腺癌的发生以及其与肿瘤微生物群的关系 | 主要研究肠道微生物群与乳腺癌发生之间的关系 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 下一代测序(NGS)、基因组测序、单细胞测序、微生物代谢组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 28093 | 2024-08-07 |
Myofibroblasts: A New Factor Affecting the Hyperlipidemia-Induced Elastic Abnormality of Corpus Cavernosum in Rabbits Detected by 2-D Shear Wave Elastography
2023-11, Ultrasound in medicine & biology
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研究论文 | 本研究使用二维剪切波弹性成像（2-D SWE）和单细胞RNA测序（scRNA-seq）探讨了高脂血症诱导的兔阴茎海绵体弹性异常及其细胞学因素。 | 发现了高脂血症组中一种新的成纤维细胞亚型——肌成纤维细胞，并通过免疫荧光染色和基因本体分析验证了其存在。 | NA | 研究高脂血症对兔阴茎海绵体弹性的影响及其细胞学机制。 | 兔阴茎海绵体的弹性异常及其细胞学因素。 | 数字病理学 | 高脂血症 | 二维剪切波弹性成像（2-D SWE），单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 图像 | 新西兰白兔被随机分为高脂血症组和对照组 | NA | NA | NA | NA |
| 28094 | 2024-08-07 |
Uncovering the prominent role of satellite cells in paravertebral muscle development and aging by single-nucleus RNA sequencing
2023-Nov, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2023.01.005
PMID:37554180
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研究论文 | 本研究通过单核RNA测序构建了小鼠棘旁肌在胚胎至老年阶段的单核转录组图谱，揭示了卫星细胞在肌肉发育和衰老中的作用 | 首次构建了涵盖胚胎至老年阶段的小鼠棘旁肌单核转录组图谱，并发现了与肌肉能量代谢相关的基因集在卫星细胞中的富集 | NA | 揭示卫星细胞在棘旁肌发育和衰老中的作用 | 小鼠棘旁肌的卫星细胞、快肌细胞和慢肌细胞 | 数字病理学 | 骨骼肌疾病 | 单核RNA测序 | NA | 转录组 | 630,040个骨骼肌细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 28095 | 2024-08-05 |
Fate Specification of GFAP-Negative Primitive Neural Stem Cells and Their Progeny at Clonal Resolution
2023-10, Stem cells and development
IF:2.5Q2
DOI:10.1089/scd.2023.0038
PMID:37551982
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研究论文 | 本研究探讨了GFAP阴性原始神经干细胞及其后代的命运特性 | 通过克隆谱系追踪机制，提供了单细胞层面上对神经前体细胞谱系的解析 | 研究集中于小鼠大脑，可能不适用于其他物种或人类 | 深入理解神经干细胞的胚胎功能与谱系关系 | GFAP阴性原始神经干细胞及其后代的神经前体细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 细胞谱系数据 | 从原始神经干细胞和成熟神经干细胞中获得的多克隆神经前体细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 28096 | 2024-08-05 |
Single-Cell RNA-seq Analysis of a Human Embryonic Stem Cell to Endothelial Cell System Based on Transcription Factor Overexpression
2023-Oct, Stem cell reviews and reports
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s12015-023-10598-y
PMID:37537495
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研究论文 | 本研究对一种高效的人类胚胎干细胞-内皮细胞诱导系统进行单细胞RNA测序分析 | 提出了一种新的FLI1-PKC诱导系统，具有不同于其他诱导方法的诱导路径 | 该研究主要集中在FLI1-PKC系统，未涵盖其他诱导系统的比较分析 | 研究人类胚胎干细胞向内皮细胞转化的转录谱和细胞动态 | 使用FLI1-PKC系统的分化细胞进行单细胞RNA测序分析 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达谱 | 在不同时间点进行的多次分化细胞样本分析 | NA | NA | NA | NA |
| 28097 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing of a poorly metastatic melanoma cell line and its subclones with high lung and brain metastasis potential reveals gene expression signature of metastasis with prognostic implication
2023-Oct, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.14900
PMID:37534569
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了一个低转移性黑色素瘤细胞系及其具有高肺和脑转移潜能的亚克隆，揭示了与转移相关的基因表达特征及其预后意义 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术，揭示了黑色素瘤细胞系中与转移潜能相关的基因表达特征，并发现这些特征与患者的预后相关 | 研究仅限于特定的黑色素瘤细胞系及其亚克隆，可能需要进一步的研究来验证这些发现是否适用于其他黑色素瘤细胞系或临床样本 | 阐明黑色素瘤转移过程中基因表达变化的机制，并鉴定出具有转移潜能的亚克隆 | 一个低转移性黑色素瘤细胞系WM239A及其具有高肺和脑转移潜能的亚克隆 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 8173个黑色素瘤细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 28098 | 2024-08-07 |
Enolase represents a metabolic checkpoint controlling the differential exhaustion programmes of hepatitis virus-specific CD8+ T cells
2023-10, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2022-328734
PMID:37541771
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研究论文 | 本文研究了肝炎病毒特异性CD8+ T细胞的代谢检查点，特别是酶醇，如何控制不同疲劳程序的差异，并探讨了抗病毒治疗对这些细胞代谢状态的影响。 | 首次识别酶醇作为疲劳T细胞的代谢检查点，并展示了代谢旁路如何改善糖酵解和T细胞效应功能。 | 研究主要集中在体外和动物模型中，需要进一步的人体临床试验来验证这些发现。 | 探讨代谢调控如何影响慢性肝炎B和C病毒感染中的T细胞疲劳状态，并评估抗病毒治疗对此的影响。 | 慢性HBV和HCV感染患者的病毒特异性CD8+ T细胞的代谢状态、疲劳程度和转录组。 | 免疫学 | 肝炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 转录组数据 | 慢性HBV感染患者31例，HCV感染患者52例 | NA | NA | NA | NA |
| 28099 | 2024-08-07 |
Function and therapeutic value of astrocytes in diabetic cognitive impairment
2023-10, Neurochemistry international
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.neuint.2023.105591
PMID:37543309
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综述 | 本文综述了星形胶质细胞在糖尿病认知障碍中的作用及其治疗价值 | 首次系统总结了糖尿病环境对脑星形胶质细胞的影响及其机制，并强调了反应性星形胶质增生对糖尿病认知障碍的贡献和潜在治疗靶点 | NA | 探讨星形胶质细胞在糖尿病认知障碍中的病理机制和潜在治疗价值 | 星形胶质细胞在糖尿病认知障碍中的作用 | NA | 糖尿病认知障碍 | 单细胞转录组、原位测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 28100 | 2024-08-07 |
Single-cell characterization of tumor evolution from precursor diseases
2023-10, Trends in cancer
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.trecan.2023.07.012
PMID:37544795
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研究论文 | 本文通过整合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和B细胞受体测序（scBCR-seq），研究了从癌前病变到多发性骨髓瘤（MM）的细胞和分子进化特征 | 利用单细胞测序技术深入研究癌前病变到多发性骨髓瘤的进化过程 | NA | 阐明癌前病变的特征，以理解肿瘤进展中的恶性转化 | 癌前病变到多发性骨髓瘤的细胞和分子进化 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），B细胞受体测序（scBCR-seq） | NA | RNA序列 | NA | NA | NA | NA | NA |