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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
27981 2024-08-07
Tubular-specific expression of HIV protein Vpr leads to severe tubulointerstitial damage accompanied by progressive fibrosis and cystic development
2023-03, Kidney international IF:14.8Q1
研究论文 本研究利用一种新型诱导性管状上皮细胞特异性Vpr转基因小鼠模型,展示了Vpr表达导致渐进性管间质损伤、间质炎症和纤维化以及管状囊肿发展的过程 首次详细研究了Vpr在体内的管状损伤和慢性肾脏疾病(CKD)发病机制,并揭示了Vpr介导的转录组响应在特定管状亚群中的作用 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中进行验证 探讨HIV病毒蛋白Vpr在管状细胞中的表达对肾脏疾病进展和纤维化的影响 HIV病毒蛋白Vpr在管状上皮细胞中的表达及其对肾脏疾病的影响 NA 慢性肾脏疾病 单细胞RNA测序 转基因小鼠模型 RNA 小鼠模型 NA NA NA NA
27982 2024-08-07
Glioma epileptiform activity and progression are driven by IGSF3-mediated potassium dysregulation
2023-03-01, Neuron IF:14.7Q1
研究论文 本研究探讨了恶性胶质瘤中癫痫样活动和进展的分子机制,发现IGSF3介导的钾失调是关键因素 首次揭示了IGSF3通过与Kir4.1相互作用抑制钾缓冲,导致肿瘤进展和癫痫样活动 NA 探究恶性胶质瘤中癫痫样活动和肿瘤进展的分子机制 恶性胶质瘤患者肿瘤中的基因表达和神经电路功能 数字病理学 脑肿瘤 scRNA-seq, ECoG记录 NA 基因表达数据, 电生理数据 人类和鼠类样本 NA NA NA NA
27983 2024-08-07
Tubular Epithelial Cell HMGB1 Promotes AKI-CKD Transition by Sensitizing Cycling Tubular Cells to Oxidative Stress: A Rationale for Targeting HMGB1 during AKI Recovery
2023-03-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN IF:10.3Q1
研究论文 本文研究了高迁移率族蛋白B1(HMGB1)在管状上皮细胞中通过使循环中的管状细胞对氧化应激敏感,从而促进急性肾损伤(AKI)向慢性肾脏病(CKD)的转变,并提出针对HMGB1在AKI恢复期间的治疗策略。 本文首次提出细胞内HMGB1通过降低管状细胞对长时间缺血应激的适应性,从而在AKI-CKD转变中发挥作用,并探讨了针对细胞内和细胞外HMGB1的治疗潜力。 研究主要基于小鼠模型和体外实验,需要进一步的人体研究来验证这些发现。 探讨HMGB1在AKI向CKD转变中的作用,并寻找新的治疗策略。 研究对象包括人及小鼠的急性肾损伤和慢性肾脏病。 NA 肾脏病 单细胞转录组分析 NA 转录组数据 涉及人及小鼠的AKI和CKD样本,具体数量未详细说明。 NA NA NA NA
27984 2024-08-07
Multi-resolution characterization of molecular taxonomies in bulk and single-cell transcriptomics data
2021-09-27, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 本文介绍了一种名为K2Taxonomer的新型无监督递归分区算法及其相关的R包,该算法利用集成学习在类似分类结构的层次中识别稳健的子组 K2Taxonomer算法能够适应不同的数据范式,适用于批量和单细胞转录组学以及其他‘组学’数据的分析 NA 开发一种新算法以在大型生物医学项目中高效识别分子亚型 批量和单细胞转录组学数据 组学 乳腺癌 转录组学 集成学习 转录组数据 包括模拟数据和人类组织数据,具体样本数量未明确 NA NA NA NA
27985 2024-08-05
Development of a novel head and neck squamous cell carcinoma prognostic signature by bulk/single-cell sequencing data integration
2024-Mar, Oral diseases IF:2.9Q1
研究论文 本研究旨在为头颈鳞状细胞癌(HNSCC)开发一种新的预后标志物 通过整合单细胞和大规模转录组数据,识别与不良预后相关的特定癌细胞亚群,并开发了一种包含六个基因的新预后标志物 独立验证仅在我们的患者队列中进行,可能需要更广泛的样本验证 识别与癌症不良预后相关的细胞亚群并开发预后签名 头颈鳞状细胞癌(HNSCC)患者的特定癌细胞亚群 数字病理学 头颈癌 RNA测序 Cox回归模型 转录组数据 NA NA NA NA NA
27986 2024-08-05
Single-cell transcriptomics dissects premalignant progression in proliferative verrucous leukoplakia
2024-Mar, Oral diseases IF:2.9Q1
研究论文 该研究利用单细胞转录组技术剖析了增生性疣状白斑(PVL)的前恶性进展 首次描绘了PVL的细胞景观,发现了两个新的细胞亚型(INSR+内皮细胞和ASPN+成纤维细胞)在微环境重塑中的关键作用 研究仅基于三个活检样本,可能无法全面代表PVL进展的所有特征 旨在勾勒PVL进展过程中的分子特征变化及关键细胞亚型 研究对象为三份来自大面积PVL病变的活检样本 数字病理学 前恶性病变 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 来自一个大PVL病变的三个活检样本,共27,611个细胞 NA NA NA NA
27987 2024-08-05
Single-cell and spatial transcriptomics in endocrine research
2024-Feb-28, Endocrine journal IF:1.3Q4
综述 本综述探讨了单细胞和空间转录组学在内分泌研究中的应用及其局限性 提出了单细胞和空间转录组学在研究内分泌器官及其疾病中的潜在未来应用 这些技术在内分泌研究中的应用仍然有限 揭示内分泌器官中细胞异质性及其细胞间相互作用的功能角色 主要研究内分泌器官的细胞类型及其互作 数字病理学 NA 单细胞转录组学和空间转录组学 NA NA NA NA NA NA NA
27988 2024-08-07
Identification of common stria vascularis cellular alteration in sensorineural hearing loss based on ScRNA-seq
2024-Feb-27, BMC genomics IF:3.5Q2
研究论文 本研究利用单细胞转录组测序(scRNA-seq)数据,分析了耳蜗血管纹(SV)在感音神经性听力损失(SNHL)中的细胞间通讯变化及其在病理发生中的作用。 发现了新的保守基因和下调通路,并预测了转录因子Nfe2l2作为多个共享细胞通路的上游调控因子。 NA 旨在通过分析公共可用的单细胞转录组测序数据,识别感音神经性听力损失中常见的调控信号通路。 耳蜗血管纹(SV)的细胞间通讯及其在感音神经性听力损失(SNHL)病理发生中的作用。 数字病理学 感音神经性听力损失 单细胞转录组测序(scRNA-seq) NA 转录组数据 来自感音神经性听力损失小鼠和正常成年小鼠的耳蜗血管纹(SV)样本 NA NA NA NA
27989 2024-08-07
Normalizing need not be the norm: count-based math for analyzing single-cell data
2024-Feb, Theory in biosciences = Theorie in den Biowissenschaften
研究论文 本文提出了一种不进行归一化处理,而是利用基于计数的代数方法来分析单细胞数据的新方法 本文创新地避免了归一化和转换步骤,采用基于计数的代数方法来分析单细胞RNA测序数据,这种方法更简单直观,且避免了常见转换带来的问题 NA 探索不进行归一化处理的新方法来分析单细胞RNA测序数据 单细胞RNA测序数据 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 NA 计数数据 NA NA NA NA NA
27990 2024-08-04
Dissecting cellular states of infiltrating microenvironment cells in melanoma by integrating single-cell and bulk transcriptome analysis
2023-12-12, BMC immunology IF:2.9Q3
研究论文 本文利用单细胞RNA-seq数据解析黑色素瘤微环境细胞状态的组成 首次识别了三种不同的肿瘤微环境免疫表型,并揭示其与临床结果的关系 使用的样本仅限于463个黑色素瘤肿瘤样本,可能不具有广泛适用性 研究微环境细胞状态对黑色素瘤免疫活动的影响 463个皮肤黑色素瘤的肿瘤样本 数字病理学 黑色素瘤 单细胞RNA-seq CIBERSORT 基因表达数据 463个黑色素瘤样本 NA NA NA NA
27991 2024-08-07
Integrated genomic and single-cell transcriptomic analyses reveal clonal evolution and immune signature in donor cell leukemia after haploidentical allogeneic hematopoietic stem cell transplantation
2023-10, Leukemia & lymphoma IF:2.2Q3
研究论文 本文报道了一例罕见的在同种异体造血干细胞移植后发生的供者细胞白血病病例,通过全基因组测序和单细胞RNA测序揭示了克隆进化和免疫特征。 首次通过全基因组测序和单细胞RNA测序技术,揭示了供者细胞白血病中的克隆进化和免疫特征,为理解其发病机制提供了新的视角。 研究基于单一病例,其普遍性和可重复性有待进一步验证。 探讨同种异体造血干细胞移植后供者细胞白血病的发病机制。 供者细胞白血病中的克隆进化和免疫特征。 数字病理学 白血病 全基因组测序, 单细胞RNA测序 NA 基因组数据, 转录组数据 单一病例 NA NA NA NA
27992 2024-08-05
mRNA vaccination boosts S-specific T cell memory and promotes expansion of CD45RAint TEMRA-like CD8+ T cells in COVID-19 recovered individuals
2023-08-15, Cell reports. Medicine
研究论文 这篇文章研究了mRNA疫苗如何影响COVID-19感染者的T细胞记忆及CD8+ T细胞的扩增 本研究揭示了感染引发的S特异性CD8 T细胞记忆在疫苗接种后影响T细胞反应的程度和克隆组成 未提及具体的样本限制或实验设计的局限性 分析COVID-19感染者接种mRNA疫苗后的T细胞反应 之前感染的疫苗接种者与未感染的疫苗接种者的对比研究 免疫学 COVID-19 mRNA疫苗 NA T细胞反应数据 NA NA NA NA NA
27993 2024-08-07
Single-cell analysis reveals an Angpt4-initiated EPDC-EC-CM cellular coordination cascade during heart regeneration
2023-05-08, Protein & cell IF:13.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析揭示了斑马鱼心脏再生过程中由Angpt4启动的EPDC-EC-CM细胞协调级联反应 首次全面分析了不同细胞和信号如何相互作用和协调以调节心脏再生,并揭示了Angpt4在心脏再生中的关键作用 NA 探讨斑马鱼心脏再生过程中细胞和信号的相互作用机制 斑马鱼心脏细胞类型及其在发育和再生过程中的分子进展 数字病理学 心血管疾病 单细胞转录组分析 NA 转录组 斑马鱼心脏细胞类型 NA NA NA NA
27994 2024-08-07
Inhibitory CD161 receptor identified in glioma-infiltrating T cells by single-cell analysis
2021-03-04, Cell IF:45.5Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了31名IDH野生型胶质母细胞瘤和IDH突变型胶质瘤患者的肿瘤浸润T细胞的基因表达和克隆景观 首次揭示了胶质瘤浸润T细胞中CD161作为候选抑制性受体的表达,并证明了其作为免疫治疗靶点的潜力 NA 探索胶质瘤中T细胞的基因表达模式及其在癌症免疫治疗中的作用 胶质瘤浸润T细胞的基因表达和克隆景观 数字病理学 胶质瘤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 31名患者 NA NA NA NA
27995 2024-08-07
Microglia-endothelial cross-talk regulates diabetes-induced retinal vascular dysfunction through remodeling inflammatory microenvironment
2024-Mar-15, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序技术揭示了糖尿病视网膜病变中微胶质细胞和内皮细胞的转录组特征,并探讨了它们之间的相互作用及其在炎症反应和血管发育中的作用 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了糖尿病视网膜病变中微胶质细胞和内皮细胞的亚群及其相互作用,特别是在CSF1和CSF1R信号通路中的作用 NA 阐明糖尿病诱导的视网膜血管功能障碍中微胶质细胞和内皮细胞之间的相互作用及其在炎症微环境重塑中的作用 微胶质细胞和内皮细胞在糖尿病视网膜病变中的相互作用及其分子机制 NA 糖尿病视网膜病变 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA NA NA NA NA
27996 2024-08-04
Single-Cell RNA Sequencing Transcriptomics Revealed HCMV IE2-Related Microglia Responses in Alzheimer's-Like Disease in Transgenic Mice
2024-Mar, Molecular neurobiology IF:4.6Q1
研究论文 本文研究了人类巨细胞病毒IE2蛋白如何促进小胶质细胞激活,从而导致类似阿尔茨海默病的疾病。 建立了IE2转基因小鼠模型,揭示HCMV IE2对小胶质细胞的激活作用及其与阿尔茨海默病的关系 研究主要集中在转基因小鼠模型,可能未能全面反映人类AD的复杂性 探讨HCMV IE2蛋白与阿尔茨海默病之间的关系及其机制 转基因小鼠,特别是表达IE2蛋白的小鼠 数字病理学 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序 转基因小鼠 基因表达数据 IE2转基因小鼠的脑组织样本 NA NA NA NA
27997 2024-08-07
Single-cell RNA sequencing identifies senescence as therapeutic target in rhabdomyolysis-induced acute kidney injury
2024-Feb-28, Nephrology, dialysis, transplantation : official publication of the European Dialysis and Transplant Association - European Renal Association
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,在横纹肌溶解诱导的急性肾损伤模型中,识别出与细胞衰老相关的过渡性巨噬细胞亚群,并探讨了衰老抑制剂的治疗潜力。 首次揭示了横纹肌溶解诱导的急性肾损伤中存在与细胞衰老相关的过渡性巨噬细胞亚群,并证明了衰老抑制剂在肾保护中的作用。 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类中进行验证;衰老抑制剂的具体作用机制和长期效果仍需进一步研究。 探索横纹肌溶解诱导的急性肾损伤中免疫细胞的变化,特别是细胞衰老在其中的作用,并评估衰老抑制剂的治疗效果。 横纹肌溶解诱导的急性肾损伤中的免疫细胞,特别是巨噬细胞和肾小管上皮细胞。 数字病理学 肾损伤 单细胞RNA测序 NA RNA 约17,000个单细胞 NA NA NA NA
27998 2024-08-04
Single-cell RNA sequencing reveals roles of unique retinal microglia types in early diabetic retinopathy
2024-Feb-26, Diabetology & metabolic syndrome IF:3.4Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了独特的视网膜小胶质细胞类型在早期糖尿病视网膜病变中的作用 首次定义了三种新的小胶质细胞亚型,并构建了一个涉及小胶质细胞和其他视网膜细胞的炎症网络 样本量较小,仅包含五个视网膜标本,可能影响结果的普适性 探讨早期糖尿病视网膜病变中小胶质细胞的变化及其在炎症反应中的作用 采用SD大鼠捐赠的视网膜标本分析早期糖尿病视网膜病变中的细胞变化 数字病理学 糖尿病视网膜病变 单细胞RNA测序 NA 细胞 五个视网膜标本 NA NA NA NA
27999 2024-08-07
Single-cell multi-omics analysis of lineage development and spatial organization in the human fetal cerebellum
2024-Feb-26, Cell discovery IF:13.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序和空间转录组学分析,探讨了人类胎儿小脑从妊娠第13周到第18周的细胞多样性和发育程序的涌现。 本研究首次鉴定了跨物种保守的过渡性颗粒细胞前体,并揭示了小脑叶的物种特异性基因表达模式,以及小脑中潜在的神经上皮新簇。 NA 探索人类胎儿小脑的细胞多样性和发育程序。 人类胎儿小脑的细胞多样性和发育程序。 数字病理学 NA scRNA-seq, scATAC-seq, 空间转录组学分析 NA 基因表达数据 妊娠第13周到第18周的胎儿样本 NA NA NA NA
28000 2024-08-07
Human cytomegalovirus exploits STING signaling and counteracts IFN/ISG induction to facilitate infection of dendritic cells
2024-Feb-26, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 研究人巨细胞病毒(HCMV)如何利用STING信号通路并对抗干扰素/干扰素刺激基因(IFN/ISG)的诱导,以促进树突状细胞的感染 首次揭示了HCMV通过激活STING信号通路并抑制干扰素-β的转录,从而促进其在树突状细胞中的复制 研究主要集中在单核细胞衍生的树突状细胞上,可能无法完全代表所有树突状细胞类型对HCMV的反应 探讨HCMV如何影响树突状细胞的免疫反应,以及病毒如何调控宿主的抗病毒反应 人巨细胞病毒(HCMV)和单核细胞衍生的树突状细胞 NA NA 单细胞RNA测序 NA RNA 涉及的样本包括单核细胞衍生的树突状细胞的三个亚群 NA NA NA NA
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