单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 34325 篇文献，本页显示第 2781 - 2800 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2781 | 2025-11-11 |
Multi-omics analyses identify mannose phosphate isomerase-centered hypoxia-induced angiogenesis signature in colorectal cancer
2025-Nov-07, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07291-8
PMID:41204349
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了结直肠癌中缺氧诱导血管生成的转录调控机制，并鉴定出甘露糖磷酸异构酶(MPI)在这一过程中的关键作用 | 首次系统识别了12个HIFs转录激活的HIA相关基因，构建了HIAscore预后评分系统，并发现MPI通过LDHA相互作用激活JAK2/STAT3信号通路促进血管生成的新机制 | 研究主要基于计算分析和体外实验验证，需要更多临床样本和机制研究进一步证实 | 探索结直肠癌中缺氧诱导血管生成的调控网络、分子机制和预后价值 | 结直肠癌患者和细胞系 | 生物信息学 | 结直肠癌 | ChIP-seq, bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 微阵列, RT-qPCR, Co-IP, western blot, 集落形成实验, 管形成实验, 皮下异种移植瘤模型 | ssGSEA, SRGA, 共识聚类 | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq, ChIP-seq | NA | NA |
| 2782 | 2025-11-11 |
The multifaceted roles of non-coding RNAs in cell-cell communication in cardiovascular health and disease
2025-Nov-07, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-025-01484-w
PMID:41204346
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综述 | 探讨非编码RNA在心血管系统细胞间通讯中的多重作用及其在心脏发育、功能和疾病进展中的调控机制 | 系统对比已确立的microRNA通讯机制与新兴长链非编码RNA的重要性，并强调测序技术对解析非编码RNA通讯网络的革新性贡献 | 长链非编码RNA及其载体在心脏细胞间信号传导中的作用研究不足，非编码RNA摄取机制及其影响的理解存在空白 | 阐明非编码RNA通过细胞外囊泡等载体介导心血管系统细胞间通讯的分子机制 | 心血管系统中的非编码RNA（包括microRNA和长链非编码RNA）及其载体（细胞外囊泡、RNA结合蛋白、脂蛋白复合物） | 自然语言处理 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2783 | 2025-11-11 |
Identification of gene modules associated with B cell activation and tissue remodeling in primary Sjögren's syndrome
2025-Nov-07, BMC immunology
IF:2.9Q3
DOI:10.1186/s12865-025-00765-w
PMID:41204409
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析识别与原发性干燥综合征中B细胞激活和组织重塑相关的基因模块 | 首次应用高维加权基因共表达网络分析(hdWGCNA)和scRank方法在单细胞水平解析pSS的基因调控网络 | 样本量较小(仅3例患者和3例对照), 需要未来功能验证 | 探索pSS中B细胞相关基因模块并发现新的治疗靶点 | 原发性干燥综合征患者的唇唾液腺细胞 | 单细胞转录组学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序, 加权基因共表达网络分析, Gene Ontology富集分析 | hdWGCNA, scRank | 单细胞基因表达数据 | 32,337个细胞(来自3例pSS患者和3例健康对照) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2784 | 2025-11-11 |
CXCR6 sustains TRM-driven psoriasis relapse by CXCL16 chemotaxis and curcumol targeting
2025-Nov-01, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.10.066
PMID:41177431
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研究论文 | 本研究揭示CXCR6/CXCL16轴通过调控组织驻留记忆T细胞（TRM）介导银屑病复发，并证实姜黄醇可通过靶向该轴抑制疾病复发 | 首次整合单细胞RNA测序、空间转录组学和CXCR6基因敲除模型，系统阐明CXCR6/CXCL16轴在TRM细胞维持和银屑病复发中的核心调控机制，并发现姜黄醇的靶向治疗潜力 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，临床样本验证相对有限，姜黄醇的临床转化效果需进一步验证 | 阐明CXCR6/CXCL16轴在银屑病复发中的作用机制并探索靶向治疗策略 | 银屑病患者临床样本、imiquimod诱导的小鼠银屑病模型、TRM细胞 | 单细胞生物学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 流式细胞术, 免疫荧光, 基因敲除 | CXCR6基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 空间转录组数据, 细胞表型数据 | 未明确样本数量，包含临床样本和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2785 | 2025-11-11 |
Spatial Transcriptomics Reveals Injured Cells, Signature Genes, and Communication Patterns in the Cyst Microenvironment of Polycystic Kidney Disease
2025-Oct-10, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000894
PMID:41071604
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2786 | 2025-11-11 |
Single-cell sequencing analysis and multiple machine learning methods identified immune-associated SERPINB1 and CPEB4 as novel biomarkers for COVID-19-induced ARDS
2025-Sep-02, Die Naturwissenschaften
DOI:10.1007/s00114-025-02016-9
PMID:40892227
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研究论文 | 通过单细胞测序分析和多种机器学习方法鉴定SERPINB1和CPEB4作为COVID-19诱发ARDS的新型免疫相关生物标志物 | 首次通过整合单细胞RNA测序和三种机器学习算法(LASSO、SVM-RFE、随机森林)识别出COVID-19诱发ARDS的新型免疫相关生物标志物 | 研究基于公共数据集，需要进一步实验验证 | 识别COVID-19诱发急性呼吸窘迫综合征的有效分子生物标志物 | COVID-19诱发的急性呼吸窘迫综合征患者 | 机器学习 | COVID-19 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 加权基因共表达网络分析 | LASSO, SVM-RFE, 随机森林 | RNA测序数据 | 来自三个公共数据集(GSE172114、GSE149878、GSE213313)的样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2787 | 2025-11-11 |
Correction: Exposing the cellular situation: findings from single-cell RNA sequencing in breast cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1709624
PMID:41208986
|
correction | 对乳腺癌单细胞RNA测序研究文章的更正 | NA | NA | NA | NA | NA | breast cancer | single-cell RNA sequencing | NA | NA | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 2788 | 2025-11-11 |
CORTADO: Hill Climbing Optimization for Cell-Type Specific Marker Gene Discovery
2024-Dec-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.23.630040
PMID:39763976
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于爬山优化算法的计算框架CORTADO，用于高效发现细胞类型特异性标记基因 | CORTADO通过优化差异表达、基因表达谱独特性和稀疏性三个关键特性，克服了传统方法仅依赖p值排序的局限性 | NA | 开发高效发现细胞类型特异性标记基因的计算方法 | 单细胞RNA测序数据中的细胞亚群和标记基因 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 爬山优化算法 | 基因表达数据 | 多个数据集（包括DLPFC 151507、Zeisel小鼠脑数据集和外周血单核细胞数据集） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2789 | 2025-11-11 |
Wnt 3a-Modified Scaffolds Improve Nerve Regeneration by Boosting Schwann Cell Function
2024-Nov-20, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.4c15013
PMID:39520323
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析发现Wnt信号通路激活可促进修复性雪旺细胞转化，并开发了Wnt3a修饰的聚合物支架以改善周围神经再生 | 首次将Wnt3a蛋白整合到电纺纤维支架表面，并通过单细胞测序揭示了Wnt通路在促进雪旺细胞修复功能中的作用机制 | 研究仅在大鼠坐骨神经缺损模型中进行验证，尚未在更大型动物或临床环境中测试 | 探索Wnt信号通路在周围神经再生中的作用，并开发新型神经支架材料 | 雪旺细胞和大鼠坐骨神经缺损模型 | 组织工程 | 周围神经损伤 | 单细胞测序，电纺丝技术，氨化处理 | NA | 单细胞测序数据，组织学数据，神经电生理数据 | 大鼠坐骨神经缺损模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2790 | 2025-11-10 |
Exploring the therapeutic role of thiabendazole in lung adenocarcinoma via network pharmacology and single-cell analysis
2025-Dec, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102548
PMID:41130017
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研究论文 | 通过网络药理学和单细胞分析探索噻苯达唑在肺腺癌中的治疗作用 | 首次结合网络药理学和单细胞RNA测序技术系统研究抗寄生虫药物噻苯达唑在肺腺癌中的抗癌机制 | 研究主要基于生物信息学分析，缺乏实验验证 | 探索噻苯达唑在肺腺癌治疗中的作用机制 | 肺腺癌相关基因和免疫细胞 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 网络药理学, 分子对接 | LASSO回归, 支持向量机, 随机森林 | 基因表达数据, 单细胞数据 | 多个GEO数据集(GSE136103, GSE10072, GSE19188, GSE19804, GSE30219, GSE40791) | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 2791 | 2025-11-10 |
Recent advances in reproductive biology: European innovations in embryo development and research†
2025-Nov-07, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioaf245
PMID:41206649
|
综述 | 本文综述欧洲在生殖生物学领域的创新贡献，重点关注胚胎发育研究和单细胞转录组学技术的应用 | 开发合成胚胎模型展示多能细胞自组织能力，并利用高通量单细胞RNA测序揭示早期胚胎发育的分子通路 | 在实现模型可重复性和建立更稳健的植入模型方面仍存在挑战 | 推进生殖生物学和胚胎学研究，改善人类和动物的生育结果 | 哺乳动物早期胚胎发育过程和多能干细胞 | 生殖生物学 | 不孕症 | 单细胞RNA测序，干细胞技术，生物工程技术 | 合成胚胎模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2792 | 2025-11-10 |
3D-generation of high-purity midbrain dopaminergic progenitors and lineage-guided refinement of grafts supports Parkinson's disease cell therapy
2025-Nov-06, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.10.001
PMID:41151578
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研究论文 | 开发了一种三维分化方法SphereDiff，用于生成高纯度中脑多巴胺能祖细胞，并通过谱系引导优化提高帕金森病细胞治疗的安全性和有效性 | 开发了SphereDiff三维分化方法生成高纯度mDA祖细胞；利用单细胞空间转录组学揭示移植后细胞分布模式；采用交叉移植单细胞分裂条形码技术解析供体细胞克隆谱系命运 | 研究主要在PD模型小鼠中进行，尚未进行人体临床试验 | 提高帕金森病细胞治疗中中脑多巴胺能神经元的分化效率和移植后存活率 | 人类多能干细胞、中脑多巴胺能祖细胞、PD模型小鼠 | 再生医学 | 帕金森病 | 三维分化、单细胞空间转录组学、交叉移植单细胞分裂条形码 | NA | 转录组数据、空间分布数据 | PD模型小鼠 | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 2793 | 2025-11-10 |
Venetoclax plus gilteritinib is effective in preclinical models of FLT3-mutant BCL11B-a lineage-ambiguous leukemia
2025-Nov-06, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025028985
PMID:40811853
|
研究论文 | 本研究评估维奈托克联合吉列替尼在BCL11B-a谱系不明白血病临床前模型中的疗效 | 首次证明BCL-2抑制剂维奈托克与FLT3抑制剂吉列替尼联合治疗对BCL11B-a谱系不明白血病具有协同作用 | 研究仅限于临床前模型，尚未进行临床试验验证 | 探索BCL11B-a谱系不明白血病的靶向治疗策略 | BCL11B-a谱系不明白血病临床前模型 | 血液肿瘤学 | 白血病 | 单细胞RNA测序，BH3分析 | 临床前疾病模型 | 基因表达数据 | 多个临床前模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2794 | 2025-11-10 |
Mapping CMV-related immune signatures in blood, aorta and perivascular mediastinal adipose tissue
2025-Nov-06, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2024.0401
PMID:41194668
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研究论文 | 本研究通过分析心脏手术患者的血液、主动脉和血管周围纵隔脂肪组织，揭示了巨细胞病毒感染对免疫特征的系统性影响 | 首次在人类主动脉组织中揭示CMV感染导致HLA-C表达下降和干扰素-α信号通路抑制，同时发现表达CD57、GPR56和CX3CR1的CD8 T细胞在血液中增加 | 样本量较小（仅11名参与者），属于初步研究，需要更大规模研究验证 | 探究巨细胞病毒感染如何驱动系统性和组织特异性免疫变化，及其与心血管疾病的潜在关联 | 心脏手术患者的血液、主动脉组织和血管周围纵隔脂肪组织 | 免疫学 | 心血管疾病 | 流式细胞术、单细胞RNA测序、ELISA、MiloR分析、差异基因表达分析 | NA | 单细胞RNA测序数据、流式细胞术数据、血清学数据 | 11名心脏手术患者（4名CMV阴性，7名CMV阳性） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2795 | 2025-11-10 |
Molecular profiling of ex vivo prostate cancer CAF models captures stromal heterogeneity and drug vulnerabilities
2025-Nov-06, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02792-3
PMID:41198614
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研究论文 | 通过对前列腺癌相关成纤维细胞进行多组学分析，揭示其转录异质性并识别药物敏感性靶点 | 首次对初治前列腺癌患者来源的原代CAFs进行整合性单细胞多组学分析，发现SOX/FOX/STAT3转录因子网络调控促肿瘤CAF状态，并通过高通量药物筛选鉴定出靶向基质细胞的候选药物 | 仅纳入7例初治患者样本，样本量有限；研究局限于体外模型，未进行体内验证 | 探索前列腺癌相关成纤维细胞的表型异质性和药物敏感性 | 7例初治前列腺癌患者来源的原代癌症相关成纤维细胞 | 单细胞组学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序，高通量药物敏感性检测 | NA | 单细胞转录组数据，药物筛选数据 | 7例初治前列腺癌患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2796 | 2025-11-10 |
Integration of Single-cell and bulk RNA sequencing data uncovers lymphatic metastasis-related prognostic genes and a predictive model in bladder cancer
2025-Nov-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-22803-8
PMID:41198839
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk RNA测序数据，揭示了膀胱癌淋巴转移相关的预后基因并建立了预测模型 | 首次结合单细胞和bulk RNA测序数据识别膀胱癌淋巴转移关键基因亚群，并构建了九基因预后模型 | NA | 识别膀胱癌关键预后基因和免疫微环境因子以提升临床评估能力 | 膀胱癌患者的原发肿瘤和淋巴结转移样本 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | 风险预测模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2797 | 2025-11-10 |
Suppression of 6-pyruvoyl-tetrahydropterin synthase promotes remyelination in multiple sclerosis
2025-Nov-06, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-025-04351-0
PMID:41199250
|
研究论文 | 本研究揭示6-丙酮酰四氢蝶呤合酶(PTS)通过抑制少突胶质前体细胞增殖阻碍多发性硬化症髓鞘再生 | 首次发现PTS是少突胶质前体细胞增殖的负调控因子，并阐明其通过胆固醇生物合成途径影响髓鞘再生的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床转化价值需进一步验证 | 探究PTS在多发性硬化症髓鞘再生障碍中的作用机制 | 少突胶质前体细胞和多发性硬化症小鼠模型 | 神经科学 | 多发性硬化症 | 单细胞测序、条件性基因敲除、转录组分析 | 实验性自身免疫性脑脊髓炎小鼠模型 | 单细胞测序数据、组织染色图像、转录组数据 | 人类和小鼠少突胶质细胞谱系细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2798 | 2025-11-10 |
Trypanosoma brucei cattle infections contain cryptic transmission-adapted bloodstream forms at low parasitaemia
2025-Nov-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-64750-y
PMID:41193429
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和显微镜技术发现牛感染布氏锥虫时存在具有传播适应性的隐秘血液形式 | 在低寄生虫血症的牛感染中发现具有锥虫传播适应性的隐秘血液形式，挑战了基于啮齿动物模型的现有假设 | 研究主要基于实验室观察，需要进一步验证这些发现在自然传播环境中的重要性 | 研究布氏锥虫在自然宿主（牛）中的发育和传播机制 | 布氏锥虫在牛和鼠类感染中的发育形式 | 寄生虫学 | 非洲动物锥虫病 | 单细胞RNA测序，显微镜观察 | NA | 转录组数据，显微镜图像 | 牛和鼠类感染样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2799 | 2025-11-10 |
Research on the expression, prognostic value, and regulatory effects on immune microenvironment of NETO2 in oral squamous cell carcinoma
2025-Nov-05, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-15164-y
PMID:41193984
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研究论文 | 本研究探讨NETO2基因在口腔鳞状细胞癌中的表达、预后价值及其对肿瘤免疫微环境的调控作用 | 首次系统研究NETO2在OSCC中的表达特征，结合单细胞RNA测序分析其在免疫细胞中的表达模式，并探索其与免疫治疗反应和药物敏感性的关联 | 研究主要基于公共数据库分析，实验验证部分有限，需要更多临床样本验证 | 阐明NETO2在口腔鳞状细胞癌中的生物学功能和临床意义 | 口腔鳞状细胞癌组织和细胞 | 生物信息学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, Kaplan-Meier生存分析, 分子对接, 细胞功能实验 | 列线图预测模型 | 基因表达数据, 临床数据, 单细胞测序数据 | TCGA和GEO队列数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2800 | 2025-11-10 |
MaskGraphene: an advanced framework for interpretable joint representation for multi-slice, multi-condition spatial transcriptomics
2025-Nov-05, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03850-w
PMID:41194133
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研究论文 | 提出MaskGraphene框架，通过图神经网络和自监督学习实现多切片空间转录组数据的可解释联合表征 | 结合掩码自监督学习、三元组损失和聚类级局部对齐，通过软链接和硬链接建立跨切片连接，生成具有高几何保真度的联合嵌入 | NA | 开发能够保持空间几何结构并校正批次效应的空间转录组数据整合方法 | 多切片、多条件的空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 图神经网络(GNN) | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |