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当前共找到 40969 篇文献，本页显示第 2781 - 2800 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2781 | 2026-05-29 |
stGNN: Spatially Informed Cell-Type Deconvolution Based on Deep Graph Learning and Statistical Modeling
2026-Jun, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-025-00728-0
PMID:40571903
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研究论文 | 提出基于深度图学习和统计建模的stGNN方法，用于空间转录组数据的细胞类型反卷积 | 创新性地结合图卷积网络与自编码器的双编码模块，以及自适应注意力机制，从低阶到高阶捕捉多尺度空间结构；采用负对数似然损失函数对齐ST与scRNA-seq参考数据的分布 | 依赖性于高质量scRNA-seq参考数据；未明确讨论计算效率或大规模数据扩展性 | 开发利用空间信息的细胞类型反卷积方法，提升空间转录组数据中细胞类型组成预测准确性 | 10x Visium、Slide-seqV2、Visium HD等多个平台的六套空间转录组数据集，以及小鼠脑组织样本 | 机器学习 | NA | 空间转录组测序 | 图卷积网络、自编码器 | 空间转录组基因表达数据 | 六套来自多种平台的空间转录组数据集 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium, Slide-seqV2, Visium HD | 10x Visium、Slide-seqV2、Visium HD等不同分辨率的空间转录组平台 |
| 2782 | 2026-05-29 |
A Novel Dual-Level Momentum Distillation Method with Extreme Thresholding for Imputing Single-Cell RNA Sequencing Data
2026-Jun, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-025-00754-y
PMID:40841490
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研究论文 | 提出了一种名为MoDET的新方法，用于填补单细胞RNA测序数据中的缺失值，以提高数据质量和后续分析准确性 | 提出双重水平动量蒸馏与极端阈值机制相结合的方法，有效提升了细胞表征学习能力和对稀有细胞类型的识别精度 | 未提及跨平台或更大规模数据集验证，且对极端阈值机制的普适性未作深入讨论 | 解决单细胞RNA测序数据因缺失现象导致的稀疏性问题，提升下游聚类分析和稀有细胞类型识别的准确性 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达矩阵 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 双重水平动量蒸馏模型 | 基因表达矩阵 | 七个真实世界数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2783 | 2026-05-29 |
Joint Low Rank Representation with Symmetric Orthogonal Decomposition for Clustering of scRNA-seq Data
2026-Jun, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-025-00767-7
PMID:41131369
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研究论文 | 提出一种结合低秩表示与对称正交分解的单细胞RNA测序数据聚类新方法LRRS | 引入新的正交对称分解策略，无需预设聚类数量，通过测量正交空间下的加权距离自适应表征局部特性 | 未在更大规模或更复杂的数据集上验证，且迭代优化方法可能增加计算复杂度 | 开发高效的单细胞RNA测序数据聚类方法以准确识别细胞类型，揭示复杂疾病分子机制 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型组成 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 低秩表示与对称正交分解模型 | 基因表达数据 | 11个基准数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2784 | 2026-05-29 |
Beyond Suppression: The Plasticity, Dysfunction, and Therapeutic Reprogramming of Regulatory T Cells in Inflammatory Bowel Disease
2026-May-28, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiag067
PMID:42203202
|
综述 | 系统性阐述调节性T细胞在炎症性肠病中的可塑性、功能缺陷及治疗性重编程策略 | 提出以谱系缺陷性ex-Tregs和耗竭性效应Tregs（eTregs）的关键区分为核心的新概念框架，并整合多组学见解重新定义IBD中Treg的功能衰竭 | 未提及具体局限性 | 阐述Treg在IBD中的复杂生物学特性、异常变化及新兴治疗策略 | 调节性T细胞（Tregs） | 自然语言处理 | 炎症性肠病 | 单细胞多组学、空间转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞多组学、空间转录组学 | NA | NA |
| 2785 | 2026-05-29 |
scFAST-seq reveals a wide diversity of transcripts, CNV events, and regulatory activity in adrenocortical tumor
2026-May-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-44117-z
PMID:42203806
|
研究论文 | 比较10X Chromium 3' scRNA-seq和SeekGene scFAST-seq在肾上腺皮质肿瘤配对样本中的表现，发现scFAST-seq检测到更多长链非编码RNA、基因和转录本 | 首次系统比较scFAST-seq与主流10X Chromium 3' scRNA-seq技术在肾上腺皮质肿瘤单细胞转录组分析中的差异，揭示了scFAST-seq在检测长链非编码RNA、基因和转录本方面的优势 | 仅使用两个配对样本，样本量较小；未对不同肿瘤类型的适用性进行验证；对RNA动态和拷贝数变异检测差异的机制解释不够深入 | 比较两种高通量液滴式单细胞RNA测序技术在肾上腺皮质肿瘤研究中的性能差异 | 来自肾上腺皮质肿瘤的两个配对样本 | 单细胞转录组学 | 肾上腺皮质肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 两个肾上腺皮质肿瘤配对样本 | 10x Genomics, SeekGene | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium 3', SeekGene scFAST-seq | 10x Chromium 3' 单细胞RNA测序, SeekGene scFAST-seq单细胞RNA测序 |
| 2786 | 2026-05-29 |
Microplastic Exposure Aggravates Cardiomyopathy Under Hemodynamic Stress Through the Gut-Heart Axis
2026-May-28, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 本研究揭示了双酚F通过肠道微生物代谢产物N-乙酰腐胺经肠心轴加重心肌病的机制 | 首次阐明双酚F通过肠道菌群依赖的Sat1-NAP途径引发心脏毒性的分子机制，并发现Akkermansia muciniphila及其代谢产物色醇可缓解该毒性 | 未明确讨论样本量大小及模型代表性等潜在局限性 | 探究双酚F对心血管系统及肠道屏障的毒性作用及其机制 | 双酚F对小鼠心血管及肠道系统的影响，以及人体样本验证 | 机器学习和生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞测序、非靶向代谢组学、空间代谢组学、粪便微生物移植 | NA | 基因表达数据、代谢物数据、临床尿液数据 | 285例人尿液样本 | NA | 单细胞RNA测序、代谢组学 | NA | NA |
| 2787 | 2026-05-29 |
ZNF469 drives TGF-β1/SMAD3-mediated extracellular matrix regulation in pulmonary fibrosis
2026-May-28, Biomolecules & biomedicine
DOI:10.17305/bb.2026.14165
PMID:42206677
|
研究论文 | 本文发现ZNF469通过TGF-β1/SMAD3信号通路调控肺成纤维细胞中细胞外基质的转录，促进肺纤维化进程 | 首次揭示ZNF469在肺纤维化中的促纤维化作用，并阐明其通过TGF-β1/SMAD3轴调控ECM基因表达的机制 | 研究基于体外细胞实验和公共数据库分析，缺乏体内动物模型验证及临床试验数据 | 探究ZNF469在肺纤维化中调控成纤维细胞活化和ECM沉积的分子机制 | 肺成纤维细胞及特发性肺纤维化、系统性硬化症患者的肺组织样本 | 数字病理学 | 肺纤维化 | RNA测序、CUT&RUN检测 | NA | 转录组数据 | 特发性肺纤维化和系统性硬化症患者的肺组织样本（具体数量未提及） | NA | 批量RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2788 | 2026-05-29 |
Intrathecal Allogeneic B7-H3-targeted CAR γδ T Cells for Leptomeningeal Metastasis from Solid Tumors: Safety, Efficacy, and Immunological Dynamics in a Phase 1 Trial
2026-May-28, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-26-0738
PMID:42207176
|
研究论文 | 评估异体B7-H3靶向嵌合抗原受体γδ T细胞鞘内注射治疗软脑膜转移瘤的安全性、有效性和免疫动力学 | 首次在临床试验中评估异体B7-H3-CAR γδ T细胞疗法通过鞘内给药治疗软脑膜转移瘤，并展示了早期安全性、临床活性、局部持久性和IFN-γ相关的脑脊液免疫重塑 | 样本量小，仅有三名患者，且为单臂试验，缺乏对照组，初步概念验证性质 | 评估鞘内注射异体B7-H3靶向CAR γδ T细胞治疗软脑膜转移瘤的临床反应、安全性、总生存期、生活质量和药代动力学/药效学特征 | 三名来自B7-H3阳性实体瘤的软脑膜转移瘤患者，包括两名肺腺癌患者和一名三阴性乳腺癌患者 | 机器学习 | 肺癌, 乳腺癌 | 单细胞测序 | NA | 文本 | 3名患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2789 | 2026-05-29 |
Exploratory multiomics analysis identifies WDR17 as a potential biomarker of tyrosine kinase inhibitor resistance in lung adenocarcinoma
2026-May-28, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05286-5
PMID:42207214
|
研究论文 | 利用多组学分析探索WDR17作为肺腺癌酪氨酸激酶抑制剂耐药潜在生物标志物的研究 | 首次通过多组学分析识别WDR17与肺腺癌TKI耐药相关，并发现其通过维持蛋白质稳态和代谢平衡影响药物敏感性 | 样本量小且为探索性研究，结果需在更大独立队列中验证 | 识别肺腺癌中TKI耐药相关的常见失调基因，为新型治疗策略提供机制见解 | TCGA LUAD患者TKI治疗队列及公开单细胞数据集中的TKI耐药细胞系 | 机器学习 | 肺癌 | RNA-seq, 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 8例TCGA LUAD患者（TKI治疗后），以及公开数据集中的细胞系样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2790 | 2026-05-29 |
Protocol for the isolation of human buccal cells for single-cell applications
2026-May-27, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2026.104601
PMID:42201808
|
研究论文 | 描述了一种从人体颊粘膜活检组织中分离高活力单细胞悬浮液的温和解离方案，适用于单细胞应用 | 结合可控酶消化（胶原酶和核酸酶）与优化的速度、温度和孵育时间，高效释放异质性细胞群同时最小化细胞损伤，获得≥80%活力的单细胞悬浮液 | NA | 建立一种可靠的人体颊粘膜细胞分离方案用于单细胞RNA测序和流式细胞术 | 人体颊粘膜活检组织中的上皮细胞、基质细胞和驻留免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据、细胞表型数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2791 | 2026-05-29 |
AdPrST:An Adversarial Graph Deep Learning Pre-clustering Framework for Deciphering Spatiotemporal Structures in Spatially Resolved Transcriptomics
2026-May-27, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3697726
PMID:42202195
|
研究论文 | 提出一种名为AdPrST的对抗性图深度学习预聚类框架，用于从空间分辨转录组学数据中解码时空结构，包括空间域识别、轨迹推断和伪时空图谱构建 | 通过对抗性自监督对比学习结合Wasserstein距离GAN和双重视图图结构，实现鲁棒的时空结构推断 | 未明确提及 | 解决空间分辨转录组学中复杂组织时空结构推断的挑战 | 空间分辨转录组学数据中的空间域、发育轨迹和时空特征 | 数字病理学 | 未指定 | 空间转录组学 | 生成对抗网络 | 基因表达数据 | 多个数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2792 | 2026-05-29 |
Recurrence in the chemotherapy regimen of bladder carcinoma originates from quiescent epidermoid-like cells
2026-May-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-73632-w
PMID:42203766
|
研究论文 | 通过整合高分辨率CRISPR/Cas9进化谱系追踪与单细胞RNA测序，研究膀胱癌在化疗下的演化及复发机制 | 首次识别出类表皮样细胞状态群体作为化疗后复发的起源，并揭示其可塑性和进化动态 | 未提及局限性 | 解析膀胱癌在化疗过程中自然进展和复发的关键事件与进化动力学 | 膀胱癌小鼠模型的肿瘤细胞 | 机器学习 | 膀胱癌 | CRISPR/Cas9谱系追踪、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型中的肿瘤样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 2793 | 2026-05-29 |
Scoring gene importance by interpreting single-cell foundation models
2026-May-27, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-026-03112-5
PMID:42204361
|
研究论文 | 提出SIGnature框架，通过解释单细胞基础模型来评估基因功能重要性 | 首次利用单细胞RNA测序基础模型的归因评分来量化基因重要性，降低技术噪音、强调调控基因并实现跨数据集比较 | 未明确提及局限性 | 开发一种通过解释单细胞基础模型来评分基因重要性的方法，并展示其在跨疾病分析中的应用 | 单细胞RNA测序数据中的基因及其功能重要性 | 机器学习 | COVID-19, 脓毒症, 川崎病 | 单细胞RNA测序 | 基础模型（foundation model） | 单细胞转录组数据 | 来自400项研究的单细胞RNA测序图谱数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2794 | 2026-05-29 |
Microglial state transitions dominate the brain immune response in the subacute phase after cardiac arrest
2026-May-27, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-026-03874-4
PMID:42204534
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示心脏骤停后亚急性期大脑免疫反应中小胶质细胞状态的转变 | 首次描绘了心脏骤停后年轻和老年大脑在第三天的免疫景观，发现了五类心脏骤停相关小胶质细胞状态，并揭示了SPP1阳性小胶质细胞的时空动态特征 | 未提及具体局限 | 探究心脏骤停后大脑免疫反应中不同免疫细胞群体的贡献 | 心脏骤停后小鼠大脑免疫细胞 | 单细胞组学 | 心脏骤停相关脑损伤 | scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 年轻和老年小鼠（未具体说明数量） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2795 | 2026-05-29 |
Thyroid-stimulating hormone receptor mediates peripheral-central neuroimmune crosstalk in autoimmune thyroid diseases
2026-May-27, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-026-04957-y
PMID:42204533
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研究论文 | 通过多组学整合分析揭示促甲状腺激素受体在自身免疫性甲状腺疾病中介导外周-中枢神经免疫串扰的分子机制 | 首次从多组学层面系统证明TSHR作为分子枢纽连接外周与中枢神经免疫串扰，并鉴定出三种潜在的再利用化合物 | 样本量有限，缺乏纵向随访和体内验证，结果需谨慎解释并进一步研究 | 阐明促甲状腺激素受体如何连接外周自身免疫与中枢神经系统特征 | Graves病、Graves眼病患者及小鼠模型 | 自然语言处理 | 甲状腺疾病 | GWAS, RNA-seq, 单细胞转录组, 空间转录组 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 脑影像数据 | NA | NA | 单细胞转录组测序, 空间转录组测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 2796 | 2026-05-29 |
MicroRNA-7: a versatile player and core target in brain disorders
2026-May-27, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08313-9
PMID:42204625
|
review | 系统综述了MicroRNA-7在神经系统疾病中的生物特性、调控机制及作用 | 综合分析了miR-7在脑疾病中的多面性作用及临床转化潜力 | 机制复杂性、递送系统靶向性不足以及缺乏临床转化标准 | 探讨MicroRNA-7在脑疾病中的调控机制和临床转化潜力 | MicroRNA-7（miR-7）及其在脑疾病中的作用 | machine learning | 帕金森病、阿尔茨海默病、缺血性卒中、脑出血、胶质母细胞瘤 | NA | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 2797 | 2026-05-29 |
Integrative single-cell and bulk analyses reveal ATF4-associated immune suppression and WNT/β-catenin signaling in osteosarcoma
2026-May-27, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-026-00797-1
PMID:42204636
|
研究论文 | 整合单细胞和批量分析揭示骨肉瘤中ATF4相关的免疫抑制和WNT/β-catenin信号通路 | 首次通过整合单细胞RNA-seq和批量转录组数据，系统揭示ATF4在骨肉瘤中连接应激相关肿瘤程序、免疫抑制和WNT/β-catenin激活的关键作用，并构建了ATF/CREB相关风险评分（ACS）用于预后分层 | 主要依赖公开数据集进行生物信息学分析，缺乏大规模前瞻性临床验证；ATF4在骨肉瘤中的具体分子机制和调控网络仍需进一步实验验证 | 探究ATF/CREB应激反应网络（特别是ATF4）在骨肉瘤免疫抑制微环境和预后的作用机制 | 骨肉瘤（OS）肿瘤样本的单细胞RNA-seq和批量转录组数据 | 机器学习 | 骨肉瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 分子动力学模拟 | NA | 单细胞基因表达数据, 批量转录组数据 | 多个公共数据集，包括TARGET和GEO队列，具体样本量未详细列出 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 2798 | 2026-05-29 |
Syrosingopine enhances immune checkpoint blockade efficacy by inhibition of MCTs and metabolic reprogramming in triple-negative breast cancer
2026-May-26, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2026.168308
PMID:42202910
|
研究论文 | 研究西罗辛平通过抑制MCTs和代谢重编程增强三阴性乳腺癌免疫检查点阻断疗效 | 首次证明双MCT1/MCT4抑制剂西罗辛平可通过阻断乳酸输出重新编程肿瘤微环境，增强抗肿瘤免疫，与抗PD-1协同抑制三阴性乳腺癌生长 | 基于模型和细胞系研究，临床验证尚需进一步开展 | 探索MCT抑制作为三阴性乳腺癌免疫治疗增敏策略的潜力 | 三阴性乳腺癌肿瘤细胞、CD8 T细胞、NK细胞、免疫活性小鼠模型 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 批量转录组学、单细胞转录组学、组织分析 | NA | 转录组数据、组织切片数据 | 多个三阴性乳腺癌模型和免疫活性小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 2799 | 2026-05-29 |
Predicting neoadjuvant breast cancer therapy response using BRIDGE from tumor transcriptomics and histopathology
2026-May-26, Annals of oncology : official journal of the European Society for Medical Oncology
IF:56.7Q1
DOI:10.1016/j.annonc.2026.05.700
PMID:42203036
|
研究论文 | 开发BRIDGE框架，利用肿瘤转录组学和组织病理学预测乳腺癌新辅助治疗反应 | 首次整合转录组去卷积与组织病理学深度学习，实现低成本快速预测新辅助治疗病理完全缓解，并优于现有商业标志物 | 需在前瞻性队列中进一步验证，特别是免疫检查点抑制剂治疗场景的泛化性 | 利用预处理肿瘤转录组和组织病理学图像预测乳腺癌新辅助治疗反应 | 乳腺癌患者肿瘤样本的转录组数据和组织病理学H&E染色切片 | 数字病理学, 机器学习 | 乳腺癌 | RNA测序, 空间转录组学, 深度学习 | CNN | 转录组数据, 组织病理学图像 | 训练集10个转录组数据集，测试集24个数据集，6个含组织切片数据的独立数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2800 | 2026-05-29 |
Characterization of natural killer (NK) cells in lung adenocarcinoma and construction of an NK risk signature based on single-cell and macromolecular RNA-seg data
2026-May-25, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04552-w
PMID:42184019
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研究论文 | 基于单细胞和大分子RNA测序数据，研究肺腺癌中自然杀伤细胞的特性并构建其风险特征 | 首次利用单细胞RNA测序数据识别肺腺癌中NK细胞亚群，并建立基于NK细胞相关基因的风险特征用于预后预测 | 该研究主要基于公共数据库的数据，尚未在独立外部队列中进行验证 | 分析肺腺癌中NK细胞特征并建立基于NK细胞的风险特征以预测患者预后 | 肺腺癌患者的NK细胞及其基因表达数据 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, RNA测序, 微阵列 | Cox回归, Lasso回归 | 基因表达数据 | 未明确指定样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |