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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2781 | 2026-03-05 |
Increased inflammation as well as decreased endoplasmic reticulum stress and translation differentiate pancreatic islets from donors with pre-symptomatic stage 1 type 1 diabetes and non-diabetic donors
2025-Jul, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-025-06417-3
PMID:40457096
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研究论文 | 本研究通过蛋白质组学分析比较了1型糖尿病前期(阶段1)与非糖尿病供体的胰岛蛋白质变化 | 首次在人类胰岛中应用无偏蛋白质组学方法,揭示1型糖尿病前期胰岛的分子变化,包括免疫反应增强和内质网应激及蛋白质翻译减少 | 样本量较小(n=3 vs n=3),存在供体间变异,统计分析的挑战性较大 | 识别胰岛中指示β细胞功能障碍的途径,了解1型糖尿病前期的分子机制 | 来自器官供体的胰岛组织,包括多自身抗体阳性(mAAb+)的1型糖尿病前期供体与非糖尿病(ND)对照供体 | 蛋白质组学 | 1型糖尿病 | 激光显微切割,质谱(MS)蛋白质组学,无标记定量,单细胞RNA-seq | NA | 蛋白质组数据,RNA-seq数据 | 10名器官供体(5名自身抗体阳性,5名非糖尿病对照),最终分析聚焦于3名多自身抗体阳性供体与3名匹配对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2782 | 2026-03-05 |
snRNA-seq of long-preserved FFPE samples from colorectal liver metastasis lesions with diverse prognoses
2024-12-26, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-024-04323-8
PMID:39725704
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研究论文 | 本研究利用snRandom-seq技术对长期保存的FFPE结直肠癌肝转移样本进行单核RNA测序,以探索预后差异的潜在影响因素 | 首次在保存至少三年(多数超过五年)的FFPE样本中成功应用单核RNA测序技术,克服了长期保存导致的RNA降解挑战 | 样本量相对有限(18例),且仅针对结直肠癌肝转移,可能限制了结果的普适性 | 探究结直肠癌肝转移患者预后差异的细胞异质性基础 | 结直肠癌肝转移患者的长期保存FFPE组织样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单核RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 18例结直肠癌肝转移病例的多个病灶样本,共82,285个细胞 | NA | 单核RNA-seq | snRandom-seq | 专门针对FFPE样本的单核RNA测序技术 |
| 2783 | 2026-03-05 |
Molecular Lineages and Spatial Distributions of Subplate Neurons in the Human Fetal Cerebral Cortex
2024-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202407137
PMID:39495628
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和单细胞RNA测序,揭示了人类胎儿大脑皮层中底板神经元的分子起源、谱系特化和空间分布特征 | 首次结合空间转录组学和单细胞RNA测序技术,系统描绘了人类胎儿大脑皮层底板神经元的分子轨迹和空间景观,并识别了人类特异性基因和细胞外基质基因在其中的稳定表达模式 | 研究仅覆盖妊娠10至25周的胎儿样本,未涉及更早期或更晚期的发育阶段,且样本量有限 | 探究人类胎儿大脑皮层中底板神经元的起源、发育谱系及其在皮层神经发生和早期结构折叠中的作用 | 人类胎儿大脑皮层中的底板神经元 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 妊娠10至25周的人类胎儿大脑皮层样本 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2784 | 2026-03-05 |
Sirtuin1 Suppresses Calcium Oxalate Nephropathy via Inhibition of Renal Proximal Tubular Cell Ferroptosis Through PGC-1α-mediated Transcriptional Coactivation
2024-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202408945
PMID:39498889
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了Sirtuin1通过PGC-1α介导的转录共激活抑制肾近端小管细胞铁死亡,从而减轻草酸钙晶体诱导的肾损伤的机制 | 首次在草酸钙肾病模型中应用单细胞转录组测序技术,并揭示了Sirt1/PGC-1α/NRF2/GPX4信号轴在调控肾小管细胞铁死亡中的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体样本或临床试验中得到验证 | 探究草酸钙晶体诱导肾损伤的分子机制,并寻找潜在的治疗靶点 | 草酸钙肾病小鼠模型的肾脏样本 | 数字病理学 | 肾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 草酸钙肾病小鼠的肾脏样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2785 | 2026-03-05 |
Single-Cell RNA Sequencing Uncovers Pathological Processes and Crucial Targets for Vascular Endothelial Injury in Diabetic Hearts
2024-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202405543
PMID:39475009
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了糖尿病心脏中血管内皮损伤的病理过程和关键调控靶点 | 首次在糖尿病小鼠心脏组织中构建单细胞转录图谱,识别了内皮细胞异质性并发现关键转录因子Ets1的保护作用 | 研究仅基于小鼠模型,未在人类样本中验证,且病理阶段覆盖可能有限 | 探究糖尿病心脏血管内皮损伤的机制和细胞异质性 | 瘦素受体敲除(db/db)糖尿病小鼠的心脏组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个病理阶段的db/db糖尿病小鼠心脏组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2786 | 2026-03-05 |
AIP1 Regulates Ocular Angiogenesis Via NLRP12-ASC-Caspase-8 Inflammasome-Mediated Endothelial Pyroptosis
2024-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202405834
PMID:39527457
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序,在氧诱导视网膜病变模型中,鉴定出血管内皮细胞特异性抗血管生成因子AIP1,并揭示其通过抑制NLRP12-ASC-caspase-8炎症小体介导的内皮细胞焦亡来调控病理性眼内血管生成 | 首次鉴定出AIP1作为血管内皮细胞特异性抗血管生成因子,并揭示了一个新的非经典炎症小体NLRP12-ASC-caspase-8在介导内皮细胞焦亡和促进视网膜新生血管形成中的作用机制 | NA | 探究炎症调控病理性眼内血管生成的分子机制 | 血管内皮细胞、氧诱导视网膜病变模型 | NA | 视网膜病变 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2787 | 2026-03-05 |
Spatiotemporal Molecular Architecture of Lineage Allocation and Cellular Organization in Tooth Morphogenesis
2024-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202403627
PMID:39535354
|
研究论文 | 本研究通过整合空间转录组和单细胞RNA测序,描述了牙齿形态发生中谱系分配和细胞组织的高分辨率全基因组分子模式 | 发现牙齿形态发生中88%的谱系物种在初始牙蕾中已出现,而非传统认为的顺序出现;揭示了牙乳头的一种先前未被识别的萌芽样模式,以及釉质结在时空中的连续分化层次;建立了指导牙齿形态发生的调控网络,涉及机械转导信号 | NA | 研究牙齿形态发生中的时空分子架构,包括谱系分配和细胞组织 | 牙齿形态发生过程中的细胞和组织 | 数字病理学 | 牙齿发育异常 | 空间转录组测序, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2788 | 2026-03-05 |
Sample multiplexing for retinal single-cell RNA sequencing
2024-Nov-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.111250
PMID:39569377
|
研究论文 | 本文建立了一种用于小鼠视网膜神经节细胞的单细胞RNA测序样本多重标记方法,以解决稀有细胞群体表征的挑战 | 利用胆固醇修饰的寡核苷酸进行样本多重标记,提高了数据精度,并展示了该方法在识别非标记样本中的多重细胞方面的应用 | 未明确说明样本大小或技术适用范围,可能仅限于小鼠视网膜神经节细胞研究 | 开发单细胞RNA测序样本多重标记方法,以高效表征稀有细胞群体并解析样本来源 | 小鼠视网膜神经节细胞 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2789 | 2026-03-05 |
Antigen specificity of clonally-enriched CD8+ T cells in multiple sclerosis
2024-Oct-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.07.611010
PMID:39282370
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和T细胞受体测序,分析了多发性硬化症患者脑脊液和血液中的CD8+ T细胞,揭示了其克隆扩增、抗原特异性及其与EB病毒抗原的关联 | 首次结合无偏倚和靶向抗原发现方法,鉴定出多发性硬化症来源的CD8+ T细胞克隆能识别EB病毒抗原及多种新型模拟表位 | 研究样本仅来自未接受治疗的患者,且样本量相对有限,未涵盖疾病不同阶段或治疗后的变化 | 探究多发性硬化症中CD8+ T细胞的克隆特性、功能及抗原特异性 | 多发性硬化症患者及对照参与者的脑脊液和血液样本 | 单细胞组学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA-seq, TCR-seq | NA | 单细胞转录组数据, T细胞受体序列数据 | 一组未接受治疗的多发性硬化症患者及对照参与者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2790 | 2026-03-05 |
Protocol for flow cytometry-assisted single-nucleus RNA sequencing of human and mouse adipose tissue with sample multiplexing
2024-03-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2024.102893
PMID:38416649
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研究论文 | 本文介绍了一种用于人和小鼠脂肪组织的流式细胞术辅助单核RNA测序协议,支持样本多重分析 | 开发了一种整合流式细胞术进行质量控制、计数和精确核池化的新工作流程,以直接加载到10x Chromium控制器,有效消除批次混淆、减少低质量核、环境RNA污染和试剂浪费 | NA | 优化脂肪组织的单细胞RNA测序方法,克服脂肪细胞大小、脆弱性和商业试剂盒成本限制 | 人和小鼠的脂肪组织 | 数字病理学 | NA | 单核RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium控制器 |
| 2791 | 2026-03-05 |
Niche-DE: niche-differential gene expression analysis in spatial transcriptomics data identifies context-dependent cell-cell interactions
2024-01-12, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-023-03159-6
PMID:38217002
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研究论文 | 本文提出了一种名为niche-DE的新统计方法,用于分析空间转录组数据中的细胞类型特异性生态位相关基因,并开发了niche-LR方法来揭示配体-受体信号机制 | 首次专注于识别由细胞间相互作用驱动的局部基因表达变化,而非全局基因表达变异,适用于不同分辨率的空间转录组数据 | 未在摘要中明确提及具体局限性 | 开发统计方法以分析空间转录组数据中的细胞类型特异性生态位相关基因和配体-受体信号机制 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | niche-DE, niche-LR | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2792 | 2026-03-05 |
Central lung gene expression associates with myofibroblast features in idiopathic pulmonary fibrosis
2023-02, BMJ open respiratory research
IF:3.6Q1
DOI:10.1136/bmjresp-2022-001391
PMID:36725082
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研究论文 | 本研究通过RNA测序分析特发性肺纤维化(IPF)中央与周边肺组织的基因表达差异,揭示了中央肺区肌成纤维细胞特征与疾病进展的关联 | 首次系统比较IPF中央与周边肺组织的转录组差异,并识别出85个中央IPF相关基因(CAG),这些基因在肌成纤维细胞中高度表达且与疾病信号通路相关 | 研究样本量有限,且依赖于计算细胞去卷积方法而非直接单细胞实验验证 | 探究中央肺组织在特发性肺纤维化发病机制中的作用 | 特发性肺纤维化患者的中央与周边肺组织活检样本,以及非IPF肺组织对照 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | RNA测序(RNA-seq),单细胞RNA测序分析 | 计算细胞去卷积分析,网络分析 | 基因表达数据,组织活检数据 | 未明确具体样本数量,但包括配对IPF中央与周边肺组织及非IPF对照 | NA | RNA-seq,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2793 | 2026-03-05 |
SARS-CoV-2 infection of the pancreas promotes thrombofibrosis and is associated with new-onset diabetes
2021-08-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.151551
PMID:34241597
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研究论文 | 本文研究了SARS-CoV-2感染胰腺与血栓纤维化及新发糖尿病之间的关联 | 首次通过单细胞RNA测序和免疫定位技术,在非人灵长类动物和人类中证实SARS-CoV-2可直接感染胰腺细胞,并揭示其与血栓纤维化及新发糖尿病的潜在机制 | 样本量较小(8只非人灵长类动物和5名COVID-19患者),且为观察性研究,因果关系需进一步验证 | 探究SARS-CoV-2感染是否直接导致胰腺功能障碍及新发糖尿病 | 非人灵长类动物和人类胰腺组织 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序,免疫定位 | NA | RNA测序数据,组织图像 | 8只非人灵长类动物和5名COVID-19患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2794 | 2026-03-05 |
Building and Regenerating the Lung Cell by Cell
2019-01-01, Physiological reviews
IF:29.9Q1
DOI:10.1152/physrev.00001.2018
PMID:30427276
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综述 | 本文综述了哺乳动物肺的细胞多样性和发育机制,探讨了单细胞RNA测序和高分辨率成像在揭示肺细胞异质性和基因表达中的作用 | 整合了最新的单细胞RNA测序数据和高分辨率成像技术,以揭示肺细胞类型的显著异质性和发育过程中的细胞选择性基因表达 | NA | 理解肺的细胞和分子机制,以揭示急性及慢性肺疾病的发病机制 | 哺乳动物肺的细胞类型和发育过程 | 数字病理学 | 肺疾病 | 单细胞RNA测序,高分辨率成像 | NA | RNA测序数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2795 | 2026-03-04 |
GPR56 Outperforms CD319 as a Discriminative Marker for CD4 + Cytotoxic T Lymphocytes and Is Elevated in Primary Sjögren's Syndrome
2026-Apr, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.70073
PMID:41324175
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研究论文 | 本研究探讨了GPR56作为CD4+细胞毒性T淋巴细胞(CTLs)的新型表面标记物,并评估其在原发性干燥综合征(pSS)中的表达和功能相关性 | 首次将GPR56识别为CD4 CTLs的功能性表面标记物,并证明其在pSS患者中表达升高且与疾病严重程度相关 | 研究样本可能有限,且机制研究尚需进一步深入验证 | 鉴定CD4 CTLs的表面标记物,并探索其在自身免疫性疾病中的作用 | CD4+细胞毒性T淋巴细胞和原发性干燥综合征患者 | 免疫学 | 原发性干燥综合征 | 单细胞RNA测序和流式细胞术 | NA | 基因表达数据和细胞表型数据 | 未明确指定样本数量,但涉及pSS患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2796 | 2026-03-04 |
Islet amyloid disrupts MHC class II antigen presentation and delays autoimmune diabetes in NOD mice
2026-Apr, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-025-06622-0
PMID:41423547
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研究论文 | 本研究探讨了胰岛淀粉样蛋白通过下调胰岛巨噬细胞中的MHC II类抗原呈递基因,从而延缓NOD小鼠自身免疫性糖尿病发病的机制 | 首次揭示了胰岛淀粉样蛋白在早期形成阶段通过减少抗原呈递来干扰β细胞自身免疫的新作用,挑战了其仅促炎的既定观点 | 研究主要基于小鼠模型,人类中的直接相关性尚需进一步验证;且机制细节如具体信号通路未完全阐明 | 理解胰岛淀粉样蛋白对胰岛巨噬细胞及β细胞自身免疫的影响,以阐明其在1型糖尿病发病中的作用 | 表达人胰岛淀粉样多肽(hIAPP)的NOD小鼠、胰岛巨噬细胞、树突状细胞及自身反应性T细胞 | 单细胞组学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 未明确指定样本数量,但涉及转基因与野生型NOD小鼠的比较组 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2797 | 2026-03-04 |
Phosphodiesterase ENPP2, which is co-upregulated in obese and pregnant mice, is essential for islet beta cell compensation during obesity
2026-Apr, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-025-06639-5
PMID:41454014
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,识别出在肥胖和妊娠小鼠胰岛β细胞中共同上调的磷酸二酯酶ENPP2,并证实其在肥胖期间β细胞代偿中的关键作用 | 首次利用单细胞RNA-seq技术比较肥胖和妊娠小鼠胰岛细胞的转录组,发现ENPP2作为共同上调基因,并揭示其通过LPA-Akt/mTOR信号通路促进β细胞增殖的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限,且ENPP2在糖尿病模型中表达下降,其治疗潜力需进一步临床验证 | 识别能适度增强肥胖期间β细胞代偿能力的关键分子 | 饮食诱导的肥胖小鼠、妊娠小鼠、Min6β细胞系、Enpp2基因敲除小鼠及β细胞过表达ENPP2的转基因小鼠 | 单细胞转录组学 | 糖尿病 | 单细胞RNA-seq, 定量PCR, 免疫荧光 | NA | RNA表达数据, 蛋白质表达数据 | 小鼠模型及人类参与者(具体数量未在摘要中明确) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2798 | 2026-03-04 |
RUNX1 is expressed in a subpopulation of dermal fibroblasts and is associated with disease severity of systemic sclerosis
2026-Mar, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.10.033
PMID:41381303
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研究论文 | 本研究探讨了RUNX1在系统性硬化症(SSc)皮肤纤维化中的作用,通过基因表达、DNA甲基化和单细胞RNA-seq数据分析,发现RUNX1表达与疾病严重程度相关,并通过实验验证其功能 | 首次证明RUNX1在SSc皮肤纤维化发病机制中的潜在作用,并揭示其在特定成纤维细胞亚群中的表达与疾病严重程度相关 | 研究主要基于体外细胞培养和数据分析,缺乏体内实验验证,且样本来源和数量可能限制结论的普适性 | 探究RUNX1在系统性硬化症皮肤纤维化进展中的角色 | 系统性硬化症患者的皮肤样本和成纤维细胞 | 数字病理学 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA-seq, DNA甲基化分析, siRNA, 药物抑制, CRISPR敲除 | NA | 基因表达数据, DNA甲基化数据, 单细胞RNA-seq数据 | 多个队列的SSc患者皮肤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2799 | 2026-03-04 |
Spatially Resolved Lipid Composition of the Human Brain Cortical Layers
2026-Mar, Neuroscience bulletin
IF:5.9Q1
DOI:10.1007/s12264-025-01486-1
PMID:40880037
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研究论文 | 本研究通过激光捕获显微切割结合质谱和质谱成像技术,分析了人类大脑皮层两个区域的脂质组组成,揭示了脂质分布与皮层层次结构之间的复杂关系 | 首次结合激光捕获显微切割、质谱和空间转录组学数据,系统解析了人类大脑皮层各层次脂质组成的空间分布模式及其与细胞类型的关联 | 研究仅关注了人类大脑皮层的两个区域和三个层次(L1、L3、L5),样本覆盖范围有限,且未深入探讨脂质功能机制 | 阐明人类大脑皮层脂质组组成的空间分布及其与皮层层次结构的关系 | 人类大脑皮层组织样本 | 空间组学 | NA | 激光捕获显微切割、质谱、质谱成像、空间转录组学 | NA | 质谱数据、成像数据、转录组数据 | 涉及人类大脑皮层两个区域的离散层次(L1、L3、L5)组织样本,检测了312种脂质 | NA | 质谱成像、空间转录组学 | NA | NA |
| 2800 | 2026-03-04 |
Single-Cell Sequencing Reveals Thalidomide-Induced Teratogenicity in Zebrafish via Endoplasmic Reticulum Stress and Dysregulated Angiogenic Signaling
2026 Mar-Apr 01, The Journal of craniofacial surgery
IF:1.0Q3
DOI:10.1097/SCS.0000000000011570
PMID:40549513
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了沙利度胺通过内质网应激和血管生成信号失调诱导斑马鱼畸形的分子机制 | 首次在单细胞水平构建了沙利度胺暴露下斑马鱼胚胎的转录组图谱,并鉴定了与氧化应激和抗血管生成相关的关键基因 | 研究仅基于转录组数据,缺乏蛋白质水平验证;样本时间点有限(仅1、2、5天) | 探究沙利度胺致畸性的分子机制,特别是氧化应激和抗血管生成相关基因的作用 | 斑马鱼胚胎 | 单细胞测序 | 先天性畸形 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、RT-qPCR | NA | 单细胞转录组数据 | 69,115个细胞(来自沙利度胺暴露组和野生型对照组) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |