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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
2781 2026-02-07
Mechanistic Insights into Threonine Tyrosine Kinase Mediated Cell Cycle Regulation in Triple-negative Breast Cancer
2026 Jan-Feb, Cancer genomics & proteomics IF:2.6Q3
研究论文 本研究探讨了苏氨酸酪氨酸激酶(TTK)在三阴性乳腺癌(TNBC)中通过调控细胞周期和Wnt/β-catenin信号通路驱动肿瘤进展的机制 结合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据,揭示了TTK在细胞周期S期和G2/M期特异性高表达,并通过维持β-catenin-Cyclin D1信号轴促进TNBC增殖的新机制 研究主要基于体外细胞实验和生物信息学分析,缺乏体内动物模型验证和临床样本的直接功能验证 阐明TTK在三阴性乳腺癌发生发展中的分子机制,并评估其作为预后生物标志物和治疗靶点的潜力 三阴性乳腺癌细胞系、正常乳腺上皮细胞、公共乳腺癌RNA-seq数据集(包括bulk和单细胞数据) 癌症生物学 乳腺癌(三阴性亚型) RNA测序(bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq)、siRNA敲低、细胞增殖/克隆形成/迁移实验、细胞周期分析、免疫荧光、Western blot、功能富集分析、蛋白质-蛋白质相互作用分析、拟时序轨迹分析 NA 基因表达数据(RNA-seq)、蛋白质表达数据、细胞功能表型数据 未明确指定具体样本数量,使用了公共数据集、TNBC细胞系和正常乳腺上皮细胞 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
2782 2026-02-07
Exosomes Transfer ST6GAL1-mediated Therapeutic Resistance in Rectal Cancer Cells
2026 Jan-Feb, Cancer genomics & proteomics IF:2.6Q3
研究论文 本研究揭示了直肠癌细胞通过外泌体转移ST6GAL1蛋白介导放化疗耐药的机制 首次证明ST6GAL1蛋白可通过外泌体在直肠癌细胞间转移,导致治疗耐药性扩散 研究主要基于细胞系和类器官模型,缺乏临床样本验证 探究直肠癌放化疗耐药性的传播机制 结直肠癌细胞系和类器官 肿瘤生物学 直肠癌 单细胞RNA测序,流式细胞术 NA RNA测序数据,流式细胞数据 4个重复实验 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2783 2026-02-07
Adding highly variable genes to spatially variable genes can improve cell type clustering performance in spatial transcriptomics data
2026, Bioinformatics advances IF:2.4Q2
研究论文 本研究探讨在空间转录组学数据中,将高变异基因与空间变异基因结合是否能提升细胞类型聚类性能 首次系统评估了高变异基因与空间变异基因联合使用对空间转录组学数据聚类性能的影响,覆盖了超过50个真实数据集和多种平台 未详细探讨不同基因组合策略(如加权或集成方法)对聚类性能的潜在影响,且可能受限于所选数据集的代表性 评估高变异基因与空间变异基因结合在空间转录组学数据中提升细胞类型聚类性能的效果 空间转录组学数据集中的基因表达数据 空间转录组学 NA 空间转录组学技术 NA 转录组数据 超过50个真实空间转录组学数据集 NA 空间转录组学 NA NA
2784 2026-02-07
Single-Cell Sequencing Reveals the Immunosuppressive Trajectory in the Tumor Microenvironment of Human Giant Cell Tumor of Bone
2026, BioMed research international IF:2.6Q3
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了骨巨细胞瘤肿瘤微环境中的细胞异质性、免疫抑制轨迹及细胞间相互作用 首次在骨巨细胞瘤中应用单细胞RNA测序技术,系统描绘了其肿瘤微环境的细胞图谱,并揭示了肿瘤相关巨噬细胞、T细胞亚群的分化轨迹及细胞间通讯网络 样本量有限(仅一个肿瘤样本的7091个细胞),缺乏多中心或大样本验证,且为术后样本,可能无法完全反映体内原始状态 解析骨巨细胞瘤肿瘤微环境的复杂细胞组成、基因表达模式及免疫抑制机制 骨巨细胞瘤手术切除后的肿瘤组织细胞 单细胞组学 骨巨细胞瘤 单细胞RNA测序 伪时间轨迹分析,CellPhoneDB细胞互作分析 单细胞转录组数据 7091个细胞(来自一个骨巨细胞瘤样本) NA 单细胞RNA-seq NA NA
2785 2026-02-07
A Narrative Review of Synaptic Transmission and Its Role in Neurological and Psychiatric Disorders: A Molecular Perspective
2026-Jan, Cureus
综述 本文从分子角度,综述了突触传递在多种神经和精神疾病中的作用,并整合了分子遗传学、突触蛋白质组学、神经影像学和系统神经科学的最新进展,提出了一个跨诊断的系统级框架 整合了不同疾病背景下关于突触功能障碍的分散知识,提出了一个跨神经和精神疾病的、以突触为中心的系统级统一框架,并指出了具有转化潜力的新兴工具 作为一篇叙述性综述,其结论主要基于对现有文献的综合分析,而非原始研究数据,且所提出的框架仍需未来实验验证 旨在弥合关于突触功能障碍在神经和精神疾病中作用的现有知识鸿沟,提供一个整合的、跨疾病的分子视角 突触传递的分子过程及其在精神分裂症、自闭症谱系障碍、阿尔茨海默病、癫痫、重度抑郁症和帕金森病等疾病中的功能障碍 神经科学 神经和精神疾病(包括精神分裂症、自闭症谱系障碍、阿尔茨海默病、癫痫、重度抑郁症、帕金森病) 分子遗传学, 突触蛋白质组学, 神经影像学, 系统神经科学, 单细胞RNA测序, 空间蛋白质组学, 突触正电子发射断层扫描成像 NA NA NA NA 单细胞RNA测序, 空间蛋白质组学 NA NA
2786 2026-02-07
Diabetic kidney disease: integrating multi-omics insights, artificial intelligence, and novel therapeutics for precision medicine
2026, Frontiers in genetics IF:2.8Q2
综述 本文综述了糖尿病肾病研究的最新进展,重点整合了多组学见解、人工智能应用及新型治疗策略,以推动精准肾病学的发展 整合单细胞RNA测序、空间转录组学、代谢组学等多组学数据与人工智能深度学习模型,揭示了疾病异质性、早期代谢紊乱及免疫失调机制,并探讨了针对炎症、纤维化和代谢通路的新型治疗靶点 作为一篇综述文章,未涉及原始实验数据或具体模型验证,主要基于现有文献进行综合评述,可能未涵盖所有最新研究 旨在通过整合多组学技术、人工智能和新型治疗方法,实现糖尿病肾病的早期检测、精准风险分层和个性化管理 糖尿病肾病(DKD)的分子机制、生物标志物、疾病进展路径及治疗策略 数字病理学 糖尿病肾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间转录组学、代谢组学 深度学习模型(如DeepDKD) 图像(视网膜图像)、多组学数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
2787 2026-02-07
Synthetic Assessment of Transfer Learning Method From Cell Lines to Single-Cell on Drug Response Prediction
2026 Jan-Feb, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
研究论文 本研究首次对基于迁移学习的单细胞药物反应预测代表性模型进行了全面评估 首次系统性地比较和评估了从细胞系到单细胞的药物反应预测迁移学习方法,填补了该领域缺乏系统性评估的空白 研究依赖于公开数据集,可能无法覆盖所有临床场景;评估主要基于现有方法,未提出新的算法 评估迁移学习方法在单细胞药物反应预测中的效果,为模型选择和设计提供方法学指导 单细胞表达数据与药物敏感性预测模型 机器学习 癌症(泛指肿瘤疾病) 单细胞测序 迁移学习模型 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2788 2026-02-07
Identification of common genes and biomarkers between Dermatomyositis and rheumatoid arthritis through integrated bioinformatics
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究通过整合生物信息学和机器学习方法,鉴定了皮肌炎和类风湿关节炎共有的关键基因、生物标志物及免疫微环境特征 首次通过整合多组学数据、加权基因共表达网络分析和机器学习模型,系统性地揭示了皮肌炎与类风湿关节炎共有的分子机制和免疫微环境重塑特征,并识别出具有诊断潜力的核心基因 研究主要基于公共数据库的转录组数据,缺乏实验验证;样本量有限,且外部验证队列的规模有待扩大 阐明皮肌炎与类风湿关节炎共病的分子机制,并识别潜在的诊断生物标志物 皮肌炎和类风湿关节炎患者的基因表达数据及免疫微环境 生物信息学 自身免疫性疾病 微阵列基因表达分析,单细胞RNA测序,加权基因共表达网络分析,机器学习建模 LASSO回归,随机森林 基因表达数据 基于多个GEO数据集(GSE55235, GSE55457, GSE12021, GSE159117),具体样本数未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2789 2026-02-07
Cellular plasticity and regenerative mechanisms in the lung
2026-Jan, European respiratory review : an official journal of the European Respiratory Society IF:9.0Q1
综述 本文综述了肺组织在应对环境损伤时,其上皮细胞(尤其是驻留干细胞和祖细胞)的可塑性与再生机制,并探讨了这些机制在慢性肺病中的作用及治疗潜力 整合了动物模型和人类肺研究的最新发现,利用单细胞和空间转录组学揭示了新的祖细胞状态和过渡中间态,强调了细胞可塑性在正常修复和疾病发病机制中的核心作用 NA 阐明肺上皮细胞在损伤后的再生机制,并探讨其在慢性肺病(如特发性肺纤维化和COPD)中的病理意义及治疗靶点 肺组织中的驻留干细胞和祖细胞(如基底细胞、肺泡II型细胞、变异克拉拉细胞、细支气管肺泡干细胞等)及其在损伤修复中的行为 数字病理学 肺病 单细胞转录组学,空间转录组学 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
2790 2026-02-07
Multi-omics analysis identifies a microbiota-bile acid-TLR signaling axis driving bladder injury in interstitial cystitis
2025-Dec-29, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文通过多组学分析揭示了一种微生物-胆汁酸-TLR信号轴在间质性膀胱炎中驱动膀胱损伤的机制 首次整合宏基因组测序、靶向代谢组学和单细胞RNA测序,识别出Enterococcus avium富集的微生物特征和胆汁酸代谢改变,并证实其通过TLR3激活导致膀胱上皮损伤 研究主要基于实验模型验证,人类样本的直接临床转化和长期效果需进一步评估 探究间质性膀胱炎/膀胱疼痛综合征(HIC)的上游驱动机制,以寻找生物标志物和靶向治疗机会 Hunner型间质性膀胱炎患者的尿液、血清样本及实验模型 多组学分析 间质性膀胱炎 宏基因组测序、靶向代谢组学、单细胞RNA测序 NA 基因组、代谢组、转录组数据 NA NA 宏基因组测序, 靶向代谢组学, 单细胞RNA测序 NA NA
2791 2026-02-07
Construction of a single-cell transcriptome atlas for Pogostemon cablin embryoids reveals PcNAC048 as a dual regulator coordinating lateral root morphogenesis and patchouli alcohol biosynthesis
2025-Dec-29, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序构建了广藿香胚状体的单细胞转录组图谱,揭示了PcNAC048作为协调侧根形态发生和广藿香醇生物合成的双重调控因子 首次在广藿香中应用单细胞RNA测序技术构建胚状体转录组图谱,并鉴定出PcNAC048作为同时调控发育和次生代谢的新转录因子 研究主要基于体外培养的胚状体,可能无法完全反映自然生长条件下的基因表达模式,且转基因验证仅在拟南芥中进行 探究广藿香胚状体发育的细胞分化轨迹及调控广藿香醇生物合成的分子机制 广藿香(Pogostemon cablin)的胚状体,包括球形胚、心形胚、鱼雷形胚和子叶胚 植物生物学 NA 单细胞RNA测序,酵母单杂交,双荧光素酶报告基因检测,病毒诱导基因沉默 NA 单细胞转录组数据 未明确指定样本数量,但包括球形胚和子叶胚阶段的单细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2792 2026-02-07
CYP27A1 suppresses brain metastasis via ferroptosis in lung adenocarcinoma: a six-gene signature predicting the immunotherapy response and clinical outcomes
2025-Dec-10, Cancer cell international IF:5.3Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞和批量RNA-seq数据,识别了肺腺癌脑转移的分子驱动因素,构建了一个六基因预后模型,并验证了CYP27A1通过铁死亡抑制脑转移的功能 首次整合单细胞和批量RNA-seq数据识别肺腺癌脑转移相关基因,构建了六基因预后模型,并揭示了CYP27A1通过调控铁死亡抑制脑转移的新机制 样本量相对较小(仅4例患者的单细胞数据),功能验证仅限于体外实验,缺乏体内模型验证 识别肺腺癌脑转移的分子驱动因素,构建预后模型并评估免疫治疗反应 肺腺癌患者及其脑转移相关细胞 数字病理学 肺癌 scRNA-seq, bulk RNA-seq LASSO Cox回归模型 基因表达数据 4例LUAD患者的scRNA-seq数据(GSE117570)和TCGA-LUAD队列的批量RNA-seq数据 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
2793 2026-02-07
Liver Sinusoidal Endothelial Cells Promote Metabolic Dysfunction-associated Steatohepatitis Progression via Interleukin-1R1-mediated Chemokine Production Induced by Macrophage-derived Interleukin-1β
2025-Dec-02, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究揭示了巨噬细胞来源的IL-1β通过作用于肝窦内皮细胞上的IL1R1受体,诱导趋化因子产生,从而驱动代谢功能障碍相关脂肪性肝炎的炎症和纤维化进程 首次阐明了在MASH中,巨噬细胞-肝窦内皮细胞通过IL1B-IL1R1轴相互作用的具体机制,并利用空间转录组学证实了门静脉周围炎症-纤维化微生态位的形成 研究主要基于细胞系和小鼠模型,人类样本分析为回顾性,且空间转录组数据来源于肝癌患者的非肿瘤区域,可能不能完全代表单纯MASH的病理状态 阐明IL-1β在代谢功能障碍相关脂肪性肝炎病理进展中的作用机制,并探索其治疗靶点 THP-1巨噬细胞系、TMNK-1肝窦内皮细胞系、内皮细胞特异性Il1r1敲除小鼠、系统性Cxcl10敲除小鼠、西方饮食诱导的MASH小鼠模型、MASLD患者肝组织RNA测序数据、MASH相关肝癌样本的非肿瘤区域空间转录组数据 数字病理学 代谢功能障碍相关脂肪性肝病/脂肪性肝炎 RNA测序,空间转录组学 NA 基因表达数据,空间基因表达数据 涉及小鼠模型、细胞系以及人类患者数据集(具体样本数量未在摘要中明确给出) NA 空间转录组学 NA NA
2794 2026-02-07
Accumulation of Lymphoid Progenitors with Defective B Cell Differentiation and of Putative Natural Killer Progenitors in Aging Human Bone Marrow
2025-Oct-28, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了人类骨髓中淋巴祖细胞在衰老过程中积累缺陷性B细胞分化和记忆样自然杀伤祖细胞的新特征 首次发现衰老人类骨髓中淋巴轨迹下游积累了一个独特细胞群,该群细胞包含B细胞分化标记缺陷的细胞以及具有记忆样自然杀伤祖细胞转录组特征的细胞 样本量较小(15名健康受试者),年龄范围较宽(19-74岁),且仅限于骨髓样本分析 探究人类骨髓造血干细胞和祖细胞在衰老过程中的变化,特别是淋巴分化轨迹的年龄相关差异 人类骨髓中的造血干细胞和祖细胞(HSPCs,CD34阳性) 单细胞转录组学 衰老相关疾病 单细胞RNA测序,功能转录组分析,发育轨迹研究 NA 单细胞RNA测序数据 15名健康人类受试者的骨髓样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2795 2026-02-07
Hypertension-Induced Neurovascular and Cognitive Dysfunction at Single-Cell Resolution
2025-Sep-19, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,在高血压小鼠模型中揭示了高血压诱导神经血管和认知功能障碍的早期分子机制 首次在单细胞分辨率下揭示了高血压诱导的早期内皮细胞、中间神经元和少突胶质细胞脆弱性,为神经血管功能障碍和认知障碍提供了分子基础 研究基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类;样本时间点有限,未涵盖更长期的动态变化 探究高血压如何通过影响脑细胞导致神经血管和认知功能障碍的分子机制 高血压小鼠模型(由血管紧张素II诱导)中的新皮质细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞转录组数据 高血压小鼠模型在不同时间点(3天和42天)的新皮质样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2796 2026-02-07
Recent Advances in Deciphering Normal and Diseased Aortic Valve Biology Using Transcriptomic Technologies
2025-Sep, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2
综述 本文综述了转录组学技术在揭示正常与病变主动脉瓣生物学机制方面的最新进展 强调了利用单细胞测序等转录组学技术解析主动脉瓣细胞可塑性、异质性及细胞间相互作用的新视角,并首次系统性地提出将健康基线特征作为疾病解读的参照标准 作为综述文章,未涉及原始实验数据,依赖已有研究的整合分析 通过整合转录组学发现,识别关键分子靶点以推动钙化性主动脉瓣疾病的有效疗法开发 主动脉瓣的正常与病变生物学机制,重点关注瓣膜内皮细胞与单核细胞的相互作用 数字病理学 心血管疾病 RNA测序(RNAseq),单细胞测序(scRNAseq) NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq NA NA
2797 2026-02-07
DNA methylation changes during acute COVID-19 are associated with long-term transcriptional dysregulation in patients' airway epithelial cells
2025-May, EMBO molecular medicine IF:9.0Q1
研究论文 本研究通过分析COVID-19患者急性期鼻细胞的DNA甲基化组和单细胞RNA测序数据,揭示了与长期转录失调相关的表观遗传变化 首次将急性COVID-19期间的DNA甲基化变化与患者气道上皮细胞长达12个月的长期转录失调联系起来,并发现纤毛功能基因的持续抑制与症状相关 样本量相对较小(急性期n=19,随访样本更少),且为观察性研究,无法确定甲基化变化与长期症状之间的因果关系 探究SARS-CoV-2感染后持续健康影响的分子机制,特别是表观遗传调控在长期转录失调中的作用 COVID-19患者和对照组的鼻细胞(气道上皮细胞) 表观遗传学 COVID-19 酶促DNA甲基化组测序,单细胞RNA测序 NA DNA甲基化数据,单细胞转录组数据 急性期:COVID-19患者19人(其中14人进行scRNA-seq),对照组14人(其中10人进行scRNA-seq);随访:感染后3个月7人,12个月5人;独立验证队列:感染后6个月15人 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2798 2026-02-07
Single cell RNA sequencing of haematopoietic cells in fresh and frozen human atheroma tissue
2025-Apr-29, Cardiovascular research IF:10.2Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序比较了新鲜和冷冻保存的人类动脉粥样硬化斑块组织中造血细胞的活性和转录组谱 首次评估了冷冻保存对脆弱和坏死动脉粥样硬化组织在单细胞RNA测序分析中的可行性,证明了冷冻保存可作为生物样本库的可行方法 颈动脉样本中缺失LYVE1+巨噬细胞,可能由于动脉内膜切除术中丢失外膜层;冷冻保存轻微影响细胞完整性,导致线粒体RNA相对丰度增加 确定冷冻保存是否影响动脉粥样硬化组织中造血细胞的活性和转录组谱,以支持大规模生物样本库的建立 人类动脉粥样硬化斑块组织中的造血细胞 单细胞组学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 5对新鲜和冷冻保存的动脉粥样硬化样本(3个来自冠状动脉,2个来自颈动脉) 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Genomics scRNA-seq workflow 10× Genomics单细胞RNA测序工作流程
2799 2026-02-07
FLASH radiation reprograms lipid metabolism and macrophage immunity and sensitizes medulloblastoma to CAR-T cell therapy
2025-Mar, Nature cancer IF:23.5Q1
研究论文 本研究揭示了FLASH放疗通过重编程巨噬细胞脂质代谢,逆转髓母细胞瘤的免疫抑制,并增强CAR-T细胞疗法疗效的机制 首次阐明FLASH放疗通过抑制脂质氧化酶表达和氧化低密度脂质生成,降低PPARγ活性,从而促进巨噬细胞向促炎表型极化,并增强CAR-T细胞浸润与活化的机制 研究基于基因工程小鼠模型,尚未在人类患者中进行验证;FLASH放疗对肿瘤免疫的影响机制仍需在其他肿瘤类型中进一步探索 探究FLASH放疗对肿瘤免疫微环境的影响及其与CAR-T细胞疗法联合治疗的潜力 髓母细胞瘤的基因工程小鼠模型 肿瘤免疫学 髓母细胞瘤 单细胞转录组分析 基因工程小鼠模型 转录组数据 未明确说明具体样本数量 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2800 2026-02-07
Consequences of training data composition for deep learning models in single-cell biology
2025-Feb-24, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究系统探讨了训练数据组成对单细胞转录组学深度学习模型行为的影响 首次系统研究训练数据组成对单细胞基础模型性能的影响,揭示了模型泛化能力与数据多样性的关系 研究主要聚焦于人类造血系统,结论在其他生物系统或疾病中的普适性有待验证 探究训练数据组成如何影响单细胞转录组学深度学习模型的性能 人类造血系统的单细胞转录组数据 单细胞生物学 NA 单细胞转录组测序 深度学习模型 单细胞转录组数据 包含成体和发育组织、疾病状态及扰动图谱的多种细胞类型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
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