单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 32476 篇文献，本页显示第 261 - 280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2025-11-10 |
Ciao3 knockout causes acute lung injury through immune activation using single cell sequencing
2025-Nov-02, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2025.124063
PMID:41187899
|
研究论文 | 通过单细胞测序技术研究Ciao3基因敲除通过免疫激活导致急性肺损伤的机制 | 首次在Ciao3条件性敲除小鼠模型中结合单细胞RNA测序揭示免疫细胞在急性肺损伤中的核心作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本数量有限 | 阐明Ciao3基因在免疫激活和急性肺损伤中的作用机制 | Ciao3条件性敲除小鼠和携带CIAO3突变的纯合子患者 | 单细胞测序分析 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 免疫组织化学 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据, 批量RNA测序数据 | 条件性敲除小鼠和1名纯合子患者 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 262 | 2025-11-10 |
Decoding melanoma's cellular mosaic to unlock immunotherapy potential
2025-Nov, Trends in cell biology
IF:13.0Q1
DOI:10.1016/j.tcb.2025.01.009
PMID:40023663
|
综述 | 本文综述了单细胞多组学技术如何揭示皮肤黑色素瘤的细胞异质性及其对免疫治疗耐药机制的理解 | 将单细胞多组学技术应用于解析黑色素瘤的细胞异质性，类比庞贝城马赛克解读来阐释癌症研究的突破性视角 | NA | 探讨单细胞多组学技术对黑色素瘤生物学特性及免疫治疗耐药机制的研究进展 | 皮肤黑色素瘤的肿瘤细胞异质性及肿瘤微环境 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞测序, 空间多组学 | NA | 单细胞多组学数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 263 | 2025-11-10 |
S100A12 correlates with inflammatory and pain symptoms in patients with chronic prostatitis/chronic pelvic pain syndrome
2025-Nov, The journal of pain
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jpain.2025.105536
PMID:40914239
|
研究论文 | 本研究探讨了警报素S100A12在慢性前列腺炎/慢性盆腔疼痛综合征(CP/CPPS)中作为炎症和疼痛生物标志物的潜力 | 首次发现S100A12在CP/CPPS患者精浆和血清中显著升高，并证实其与炎症标志物和疼痛评分相关，诊断性能优于传统指标 | 回顾性病例对照研究设计，样本量相对较小(90例患者)，需要更大规模前瞻性研究验证 | 寻找CP/CPPS的可靠生物标志物，理解炎症与神经性疼痛的机制联系 | 慢性前列腺炎/慢性盆腔疼痛综合征患者 | 生物医学研究 | 前列腺疾病 | 单细胞RNA测序，生物标志物分析，受试者工作特征分析 | 病例对照研究 | 生物样本数据，临床评分数据 | 90例CP/CPPS患者和90例年龄匹配的健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 264 | 2025-11-10 |
Transcriptomic profiling of mink spleen infected by Aleutian mink disease virus: Insight into immune response
2025-Nov, Research in veterinary science
IF:2.2Q1
DOI:10.1016/j.rvsc.2025.105842
PMID:41005216
|
研究论文 | 本研究通过转录组分析探究水貂感染阿留申水貂病毒后脾脏的免疫反应机制 | 首次系统揭示AMDV感染后水貂脾脏的转录组动态变化，识别出8个直接参与免疫反应的关键差异表达基因 | 研究仅关注脾脏组织，未涉及其他靶器官；采用传统RNA-seq而非单细胞测序技术 | 识别与宿主对阿留申病毒感染反应相关的基因和通路 | 阿留申病毒感染的黑色雄性水貂脾脏组织 | 转录组学 | 病毒性疾病 | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 12只AMDV阴性黑色雄性水貂（4组全同胞，每组3只） | Illumina | bulk RNA-seq | Illumina TruSeq™ RNA kit, HiScanSQ | Illumina TruSeq™ RNA建库试剂盒，HiScanSQ测序仪，101 bp双端测序 |
| 265 | 2025-11-10 |
Branch-specific gene discovery in cell differentiation using multi-omics graph attention
2025-Nov, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013664
PMID:41183107
|
研究论文 | 提出基于异构图注意力机制的BranchKGN框架，用于识别细胞分化轨迹中的分支特异性关键基因 | 开发了基于异构图变换器的多组学整合方法，能够识别细胞分化分支点及其后代谱系中持续提供信息的关键基因 | NA | 解析细胞分化过程中的基因调控机制 | 细胞分化轨迹中的分支特异性关键基因 | 机器学习 | NA | scRNA-seq, scATAC-seq | 图变换器, 注意力机制 | 单细胞多组学数据 | 三个独立数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 266 | 2025-11-10 |
Continuous cell-type diversification in mouse visual cortex development
2025-Nov, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09644-1
PMID:41193844
|
研究论文 | 本研究构建了小鼠视觉皮层发育的高分辨率转录组和表观基因组细胞类型图谱 | 通过大规模单细胞测序数据重建了视觉皮层所有细胞类型的发育轨迹图，识别了细胞多样化的分子特征和基因调控网络 | 研究仅限于小鼠视觉皮层，未涉及其他脑区或物种 | 揭示哺乳动物皮层细胞类型多样化发育的分子机制 | 小鼠视觉皮层发育过程中的兴奋性神经元、抑制性神经元和非神经元细胞 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序，单核多组学测序 | 发育轨迹重建分析 | 单细胞转录组数据，表观基因组数据 | 568,654个高质量单细胞转录组和200,061个高质量单核多组学数据 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq，单核多组学 | 10x Chromium | 单细胞RNA测序和单核Multiome测序技术 |
| 267 | 2025-11-10 |
A comprehensive molecular atlas of the mesenchymal cell types in the mouse liver
2025-Nov, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s44319-025-00580-9
PMID:40954217
|
研究论文 | 通过深度单细胞RNA测序构建了成年小鼠肝脏主要细胞类型的全面分子图谱 | 首次系统揭示肝脏内皮细胞和间充质细胞的多样性，发现门静脉区具有混合动静脉表型，识别出纤维化疾病中扩张的先前未知的被膜肝星状细胞群 | 研究仅限于小鼠模型，人类肝脏的适用性需要进一步验证 | 解析肝脏细胞分子结构，为肝病治疗提供理论基础 | 成年小鼠肝脏细胞 | 单细胞组学 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 成年小鼠肝脏细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 268 | 2025-11-10 |
Cationic nanoparticle targets cGAS-STING axis to drive functional orofacial muscle regeneration
2025-Nov-01, Biomaterials
IF:12.8Q1
|
研究论文 | 本研究开发了阳离子纳米颗粒MSN-PEI用于清除细胞游离DNA，通过调控cGAS-STING轴促进口面部肌肉功能性再生 | 首次利用阳离子纳米颗粒靶向清除cfDNA调控肌肉再生微环境，揭示cfDNA通过TLR9和cGAS-STING信号通路影响巨噬细胞-肌肉卫星细胞交互作用的新机制 | 研究仅使用小鼠冷冻损伤模型，尚未在更大型动物或临床环境中验证 | 探究cfDNA清除如何促进口面部肌肉再生及影响微环境与肌肉卫星细胞的相互作用 | 小鼠口面部肌肉（咬肌）损伤模型 | 再生医学 | 肌肉纤维化 | 单细胞RNA测序，组织学分析，功能分析，分子分析，转录组分析 | NA | 基因表达数据，组织图像数据，功能测量数据 | 小鼠肌肉损伤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 269 | 2025-11-10 |
Liver Macrophage Changes during Early Adaptation to Alcohol Exposure
2025-Oct-31, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2025.10.004
PMID:41177326
|
研究论文 | 本研究通过小鼠模型和人类肝脏样本探讨酒精暴露早期对肝脏巨噬细胞（包括库普弗细胞和浸润巨噬细胞）表型变化的影响 | 首次系统比较酒精暴露早期库普弗细胞与浸润巨噬细胞的动态变化差异，并揭示库普弗细胞通过适应性变化维持肝脏稳态的新机制 | 研究主要关注早期酒精暴露效应，对长期酒精暴露的影响仍需进一步验证 | 探究酒精暴露早期对肝脏巨噬细胞亚群的影响及其在维持肝脏稳态中的作用 | 小鼠模型和人类肝脏组织样本 | 免疫学 | 酒精性肝病 | 流式细胞术、离体细胞培养、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞数据、组织学数据 | 小鼠模型和人类尸检及移植肝脏样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 270 | 2025-11-10 |
Dexamethasone-induced immunosuppression in Pneumocystis pneumonia reprograms neutrophil metabolism and impairs antimicrobial function
2025-Oct-30, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152889
PMID:41205576
|
研究论文 | 本研究揭示地塞米松通过重编程中性粒细胞代谢状态，特别是抑制脂肪酸氧化通路，损害其在肺孢子菌肺炎中的抗菌功能 | 首次在单细胞水平揭示地塞米松诱导的免疫抑制通过代谢重编程（脂肪酸氧化抑制）特异性损害中性粒细胞抗菌功能的机制 | 研究仅使用小鼠模型，尚未在人类临床样本中验证 | 探究地塞米松在肺孢子菌肺炎中改变肺部免疫的免疫学和代谢机制 | 地塞米松诱导的免疫缺陷小鼠肺组织中的中性粒细胞 | 单细胞生物学 | 肺孢子菌肺炎 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,RT-qPCR,批量RNA测序,代谢组学 | NA | 基因表达数据,代谢数据 | 对照组和地塞米松处理组小鼠肺组织 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 271 | 2025-11-10 |
Integrated bulk and single-cell RNA profiling implicates MFAP5+ CAFs in potential role in peritoneal metastasis of gastric cancer
2025-Oct-28, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152841
PMID:41205579
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk RNA测序分析，揭示了MFAP5+ CAFs在胃癌腹膜转移中的关键作用 | 首次在胃癌腹膜转移中系统鉴定CAF亚群，发现MFAP5+ CAFs作为终末促转移亚群的特异性富集 | 研究样本量有限，功能验证主要基于体外实验 | 探究胃癌腹膜转移的基质微环境机制 | 胃癌原发灶和腹膜转移灶组织 | 单细胞生物学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 多重免疫组化, 传统免疫组化 | 轨迹分析, 共培养实验 | 单细胞RNA-seq数据, bulk RNA-seq数据, 免疫组化图像 | 配对的胃癌原发灶和腹膜转移灶组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 272 | 2025-11-10 |
scMapNet: Marker-based cell type annotation of scRNA-seq data via vision transfer learning with tabular-to-image transformations
2025-Oct-27, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.10.056
PMID:41161490
|
研究论文 | 提出一种基于视觉迁移学习和表格到图像转换的标记基因细胞类型注释方法scMapNet | 结合掩码自编码器和视觉变换器，通过树状图转换利用细胞标记基因信息，并在大量未标记数据上进行预训练 | NA | 开发能够充分学习细胞标记基因知识和未标记数据信息的单细胞RNA测序数据细胞类型注释方法 | 单细胞RNA测序数据 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | 掩码自编码器(MAE), 视觉变换器(ViT) | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 273 | 2025-11-10 |
Spatial and Single-Cell Transcriptomics Reveal Keratinocytes as Key Players in Vulvar Lichen Sclerosus Pathogenesis
2025-Aug-29, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.08.022
PMID:40886965
|
研究论文 | 本研究通过空间和单细胞转录组学技术揭示角化细胞在外阴硬化性苔藓发病机制中的核心作用 | 首次整合空间和单细胞转录组学技术系统揭示外阴硬化性苔藓中角化细胞的双重角色及多细胞类型的统一分子变化 | 未明确说明样本量大小和研究人群特征 | 阐明外阴硬化性苔藓的分子发病机制 | 外阴硬化性苔藓病变组织、非病变组织和健康外阴皮肤组织 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 空间转录组学,单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 274 | 2025-11-10 |
Circadian clock-gated cell renewal controls time-dependent changes in taste sensitivity
2025-May-13, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2421421122
PMID:40339128
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了小鼠舌上皮细胞类型的昼夜节律变化，发现生物钟调控的细胞周期进程驱动味觉细胞群体的时间依赖性变化 | 首次发现味觉细胞群体存在昼夜节律性变化，并证明这种变化由生物钟调控的细胞周期进程驱动，且影响味觉敏感性的时间依赖性变化 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类或其他物种中验证 | 探究生物钟如何通过调控细胞更新影响味觉敏感性的时间依赖性变化 | 小鼠舌上皮细胞，特别是II型味觉细胞和味蕾干细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序，味蕾类器官培养，基因敲低，味觉测试 | NA | 单细胞RNA测序数据，行为学数据 | 小鼠舌上皮细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 275 | 2025-11-10 |
Single-cell sequencing reveals the response mechanisms of vascular endothelial cells to glucocorticoids in diabetic retinopathy
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0334230
PMID:41196918
|
研究论文 | 通过单细胞测序技术揭示糖皮质激素在糖尿病视网膜病变中对血管内皮细胞的响应机制 | 首次在单细胞水平系统分析糖皮质激素活性在糖尿病视网膜病变血管内皮细胞中的变化特征 | 基于公共数据库的回顾性分析，需要实验验证 | 探究糖皮质激素在糖尿病视网膜病变发病机制中的作用 | 糖尿病视网膜病变组织中的血管内皮细胞 | 生物信息学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序 | 伪时间分析、转录因子分析、细胞通讯分析 | 单细胞RNA测序数据 | GEO数据库数据集GSE178121 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 276 | 2025-11-10 |
Single-cell transcriptomics in metastatic breast cancer: mapping tumor evolution and therapeutic resistance
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1669741
PMID:41199747
|
综述 | 本文综述单细胞转录组学在转移性乳腺癌研究中的应用，重点阐述其在描绘肿瘤进化、揭示治疗抵抗机制方面的作用 | 采用单细胞转录组学技术高分辨率解析转移性乳腺癌的肿瘤异质性、细胞进化轨迹和治疗抵抗机制，整合空间转录组学和多组学平台提供肿瘤生态系统全景视图 | 存在技术挑战，临床应用的标准化和推广仍需进一步研究 | 探讨单细胞转录组学如何重塑对转移性乳腺癌生物学特性的理解并指导精准治疗 | 转移性乳腺癌肿瘤细胞、肿瘤微环境中的免疫细胞、基质细胞和内皮细胞 | 单细胞组学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 多组学 | NA | NA |
| 277 | 2025-11-10 |
Integrative multi-omics identifies MEIS3 as a diagnostic biomarker and immune modulator in hypertrophic cardiomyopathy
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1675467
PMID:41200169
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学分析鉴定MEIS3作为肥厚型心肌病的诊断生物标志物和免疫调节因子 | 首次发现MEIS3在HCM中作为基质中心免疫调节因子的关键作用，并构建了lncRNA-miRNA-MEIS3调控网络 | 样本量较小（HCM患者n=4，健康对照n=3），需要更大规模研究验证 | 表征转录因子MEIS3在肥厚型心肌病中的临床和免疫学作用 | 肥厚型心肌病患者和健康对照的外周血样本及心肌组织 | 生物信息学 | 心血管疾病 | RNA测序,单细胞RNA测序,机器学习算法 | LASSO,随机森林 | 基因表达数据,单细胞数据 | 7个样本（4例HCM患者，3例健康对照） | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 278 | 2025-11-10 |
Identification and validation of plasma protein biomarkers as therapeutic targets in acute myeloid leukemia: an integrative multi-omics study
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1659811
PMID:41200167
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学方法识别并验证了急性髓系白血病中具有因果作用的新型循环蛋白生物标志物 | 首次提供TNFAIP8、TCL1A、WFDC1和TNFSF8在AML中因果作用的遗传证据，并发现13种靶向这些蛋白的候选药物 | 研究主要基于欧洲人群数据（deCODE、UK Biobank、FinnGen），可能限制结果在其他人群的普适性 | 识别和验证AML中具有因果作用的循环蛋白生物标志物，为靶向治疗开发和疾病监测提供新见解 | 急性髓系白血病患者和健康对照 | 多组学整合分析 | 急性髓系白血病 | 蛋白质组范围孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序、ELISA、药物重定位分析、全表型关联研究 | 孟德尔随机化模型 | 蛋白质定量性状位点数据、全基因组关联研究数据、单细胞RNA测序数据、血浆蛋白水平数据 | 来自deCODE、UK Biobank Pharma Proteomics Project、FinnGen和UK Biobank四个大型队列的数据，包含AML患者和健康对照 | NA | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 基因组关联分析 | NA | NA |
| 279 | 2025-11-10 |
Differential gene expression profiling and machine learning-based discovery of key genetic markers in VTE and CKD
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1654673
PMID:41200172
|
研究论文 | 通过转录组学和机器学习分析识别静脉血栓栓塞和慢性肾脏病共享的关键基因标记 | 首次结合三种机器学习算法(LASSO、SVM-RFE、随机森林)识别VTE和CKD共享的关键基因，并构建诊断列线图 | 研究依赖公共数据集，需要进一步实验验证基因功能机制 | 揭示静脉血栓栓塞和慢性肾脏病之间的遗传特征和分子通路联系 | VTE和CKD患者的基因表达谱数据 | 机器学习 | 静脉血栓栓塞,慢性肾脏病 | 转录组分析,单细胞RNA测序 | LASSO,SVM-RFE,随机森林 | 基因表达数据 | 使用多个数据集(GSE37171和GSE48000)的患者样本 | NA | 单细胞RNA测序,转录组分析 | NA | NA |
| 280 | 2025-11-10 |
Immune cell communication networks and memory CD8+ T cell signatures sustaining chronic inflammation in COVID-19 and Long COVID
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1689507
PMID:41200182
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析COVID-19和长新冠患者的免疫细胞通讯网络，揭示记忆CD8+ T细胞在维持慢性炎症中的关键作用 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘COVID-19和长新冠的免疫景观，识别出记忆CD8+ T细胞在MHC-I介导的通讯网络中的核心地位，并发现7个预测慢性免疫失调的关键基因 | 样本量相对有限，仅包含73,110个外周血单个核细胞，且疾病状态分类可能不够细致 | 探究COVID-19和长新冠中持续性免疫失调和慢性炎症的分子机制 | 来自健康、暴露、感染和住院四个疾病状态个体的外周血单个核细胞 | 生物信息学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序，机器学习 | XGBoost, SHAP解释框架 | 单细胞转录组数据，批量转录组数据 | 73,110个外周血单个核细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |