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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2026-06-04 |
Cancer-associated fibroblast subtypes in the tumor microenvironment of prostate cancer and associations to patient outcomes
2026-Apr, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.70023
PMID:41588654
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序、空间转录组学及多重免疫荧光等技术,鉴定前列腺癌微环境中癌症相关成纤维细胞亚型(apCAF、iCAF、myCAF),并分析其与生化复发风险的关系 | 首次在前列腺癌中系统鉴定并验证三种CAF亚型(apCAF、iCAF、myCAF),发现apCAF和iCAF水平与生化复发风险独立相关,提出其作为风险分层生物标志物的潜力 | 基于公开数据集和回顾性队列,样本量有限(n=235及240),且未涵盖晚期或转移性前列腺癌,未揭示CAF亚型的功能机制 | 探究前列腺癌中CAF亚型的鉴定及其与患者预后的关联 | 前列腺癌患者根治性前列腺切除标本(两个队列分别含235例和240例) | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、多重免疫荧光、数字病理学分析 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据、组织影像数据 | 队列1共235例,队列2共240例前列腺癌根治术后标本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 利用公开的单细胞RNA测序和空间转录组学数据集 |
| 262 | 2026-06-04 |
Substantially Altered Local and Systemic Immunity in Ischemia-Free Versus Conventional Liver Transplantation
2026-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202502854
PMID:41589704
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研究论文 | 与常规肝移植相比,无缺血肝移植显著改变了局部和全身免疫反应 | 首次通过单细胞RNA测序和多重细胞因子分析,系统比较无缺血肝移植与常规肝移植对局部和全身免疫的影响,揭示ANXA1-FPR1信号通路在减轻移植物炎症中的作用 | 未提及样本量和临床队列的详细信息,机制验证可能缺乏体内实验支持 | 探究无缺血肝移植手术相比常规肝移植如何影响局部和全身免疫 | 肝移植患者的移植物组织和循环单核细胞 | 数字病理学、机器学习 | 肝移植相关疾病 | 单细胞RNA测序、多重细胞因子分析、免疫组织化学、免疫荧光染色 | NA | 单细胞转录组数据、组织图像数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 263 | 2026-06-04 |
Engineered ETS1-Nanoconjugate Restores Immune Homeostasis through Dual Immune-Vascular Modulation in Relapsing and Progressive Multiple Sclerosis
2026-Apr, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202504951
PMID:41589763
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研究论文 | 本文开发了一种基于工程化ETS1纳米缀合物的双免疫-血管调节平台,用于恢复复发性和进行性多发性硬化症中的免疫稳态 | 首次通过单细胞RNA测序发现IL7R是内皮细胞和致病T细胞的共同靶点,并构建了多功能纳米递送平台(IMNP),实现同时调节内皮细胞和T淋巴细胞的双重血管-免疫调节 | 未在摘要中明确提及局限性 | 开发一种能够同时调节血管和免疫系统的新型纳米平台,用于治疗多发性硬化症 | 内皮细胞和致病T细胞,以及复发-缓解型多发性硬化症(RRMS)和继发性进行性多发性硬化症(SPMS)模型 | 纳米医学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 264 | 2026-06-04 |
Hist2Cell: Deciphering fine-grained cellular architectures from histology images
2026-Mar-11, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.101137
PMID:41592568
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研究论文 | 提出Hist2Cell框架,从组织学图像直接解码精细细胞结构 | 首次利用视觉图变换器从组织学图像精确预测精细细胞类型,无需额外训练即可泛化到大规模TCGA数据集 | 未提及在除肺癌和乳腺癌外的其他癌症类型中的表现,也未讨论基因表达预测的准确性 | 开发一种从组织学图像预测细胞类型丰度的成本效益方法,用于大规模空间生物学研究和癌症预后 | 人类肺癌和乳腺癌组织学图像及空间转录组数据 | 计算机视觉 | 肺癌, 乳腺癌 | 空间转录组学, 组织学成像 | 视觉图变换器 | 图像, 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 265 | 2026-06-04 |
RPS14 as an aging-related biomarker for early-onset alterations of testicular senescence-associated genes in spermatogenic dysfunction at childbearing age
2026-Mar-10, The journals of gerontology. Series A, Biological sciences and medical sciences
DOI:10.1093/gerona/glag020
PMID:41592225
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研究论文 | 将RPS14识别为儿童期生育年龄男性精子发生功能障碍中睾丸衰老相关基因早发表型变化的衰老相关生物标志物 | 首次发现RPS14作为衰老相关生物标志物,用于年轻男性精子发生功能障碍睾丸中衰老相关基因的及早变化,并揭示其在睾丸免疫微环境及与睾丸肥大细胞的显著相关性 | 研究未提供具体局限性信息 | 识别年轻男性精子发生功能障碍中睾丸衰老相关基因的衰老相关生物标志物及其功能 | 睾丸组织来自老年小鼠、老年男性、具有完整精子过程或精子发生功能障碍的生育年龄患者 | 数字病理学 | 男性不育 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、批量微阵列、免疫荧光 | NA | 基因表达数据、组织样本图像 | 包含两个scRNA-seq数据集、三个批量微阵列数据集以及多种睾丸组织样本 | 10x Genomics、Illumina | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium、Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞3'测序、Illumina NovaSeq批量RNA测序 |
| 266 | 2026-06-04 |
Busulfan plus cyclophosphamide induced spermatogenic dysfunction and recovery: A dynamic change perspective
2026-Mar, Toxicology letters
IF:2.9Q2
DOI:10.1016/j.toxlet.2026.111833
PMID:41587595
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研究论文 | 利用布舒凡联合环磷酰胺(BuCy)处理小鼠模型,纵向表征睾丸损伤及恢复的动态变化,并结合单细胞转录组分析揭示生殖细胞群体的逐步衰退 | 首次在模拟临床BuCy预处理方案的小鼠模型中系统研究睾丸损伤与恢复的多时间点动态,并通过单细胞转录组学提供细胞水平的补充观察 | 未明确提及局限性 | 研究BuCy处理对小鼠睾丸的损伤模式及恢复过程 | BuCy处理的小鼠睾丸组织及生殖细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型,未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 267 | 2026-06-04 |
Phf6 truncating mutation drives leukemogenesis via disrupted epigenetic regulation in mice
2026-Mar, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-025-02828-8
PMID:41588055
|
研究论文 | 通过构建携带Phf6截短突变的转基因小鼠模型,揭示其通过破坏表观遗传调控驱动白血病发生的机制 | 首次证明PHF6截短突变通过获得功能效应驱动白血病发生,而非功能缺失,并发现KAT6B乙酰转移酶活性增强介导的H3K27ac全基因组分布改变 | 未提及具体局限性 | 阐明PHF6截短突变在白血病发生中的具体作用及潜在治疗靶点 | Phf6截短突变转基因小鼠及其造血干细胞/祖细胞 | 机器学习 | 血液恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 转基因小鼠模型(具体数量未说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 268 | 2026-06-04 |
HFFST: A Hierarchical Feature Fusion Algorithm for Spatial Gene Expression Prediction Using Histopathology Images
2026 Mar-Apr, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3658320
PMID:41591852
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research paper | 提出HFFST算法,从H&E染色的病理图像中预测空间基因表达,利用层次化特征融合方法提高预测性能 | 提出层次化特征融合算法,采用粗到细的回归框架,充分利用全切片图像的多级特征来预测空间转录组谱 | 研究未提及具体局限性 | 从H&E染色病理图像预测空间基因表达,降低空间转录组学的高成本和技术复杂性 | H&E染色的病理图像及对应的空间转录组数据 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 层次化特征融合算法 | 图像 | 五个公开数据集和10X Genomics的高分辨率Visium数据 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 高分辨率Visium数据 |
| 269 | 2026-06-04 |
Humoral IgG1 responses to tumor antigens underpin clinical outcomes in immune checkpoint blockade
2026-Mar, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-025-04177-6
PMID:41593194
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研究论文 | 本研究探讨了抗PD-1治疗肝细胞癌患者中IgG1浆细胞的体液免疫应答及其对临床结局的影响 | 首次揭示抗PD-1治疗诱导肿瘤特异性IgG1浆细胞反应,并与T细胞活性协同促进临床获益,建立了体液-细胞免疫轴的新机制 | 样本量较小(38例肝细胞癌患者),且主要基于新辅助治疗队列,可能无法完全代表晚期或不同治疗背景的患者群体 | 阐明抗PD-1免疫检查点抑制治疗中体液免疫应答(特别是IgG1浆细胞)的作用及其与临床结局的关系 | 接受新辅助抗PD-1治疗的肝细胞癌患者的肿瘤组织、血清及外周血样本 | 机器学习 | 肝细胞癌 | 单细胞测序、批量RNA测序、空间转录组学、血清学分析 | NA | 基因组数据、转录组数据、空间转录组数据、蛋白质数据 | 38例肝细胞癌患者(主要队列),额外7个独立队列共500例单细胞/批量测序数据、7例空间转录组数据及1582例生存分析数据 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 270 | 2026-06-04 |
Inhibition of CDC25C attenuates IL-17A-driven keratinocyte hyperproliferation and psoriasis progression
2026-Feb-26, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2026.153342
PMID:41587503
|
研究论文 | 本文揭示CDC25C在IL-17A驱动的角质形成细胞过度增殖和银屑病进展中的关键作用,并验证其作为治疗靶点的潜力 | 首次发现CDC25C在非经典IL-17A信号通路中促进表皮增生,并证明其选择性抑制可减轻银屑病症状而不影响经典炎症因子表达 | 研究主要基于体外和动物模型,临床样本验证有限,且NSC95397的长期安全性未知 | 探索CDC25C作为银屑病治疗靶点的潜力 | 银屑病患者角质形成细胞、IMQ诱导的银屑病小鼠模型 | 机器学习和数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 银屑病患者皮损和非皮损皮肤样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 271 | 2026-06-04 |
RORγt+ dendritic cells are a distinct lymphoid-derived lineage
2026-Feb-20, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.aed7439
PMID:41591258
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研究论文 | 本文通过谱系追踪和单细胞转录组学,揭示了小鼠中RORγt+树突状细胞作为淋巴来源的独特谱系,对维持肠道免疫耐受至关重要 | 首次鉴定出RORγt+树突状细胞是淋巴来源的独特谱系,并发现其前体包括RORγt先天淋巴祖细胞和pre-RORγt树突状细胞前体,以及调控其发育的关键增强子和转录因子 | 研究主要基于小鼠模型,结论在人类中的适用性尚未验证;且未深入探讨RORγt树突状细胞在疾病状态下的功能变化 | 阐明耐受性树突状细胞谱系如何建立以维持肠道免疫稳态 | 小鼠骨髓中的树突状细胞及其前体细胞,以及RORγt+树突状细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠骨髓样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 测序平台 |
| 272 | 2026-06-04 |
A temporal and spatial atlas of adaptive immune responses in the lymph node following viral infection
2026-Feb-03, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2504742123
PMID:41587309
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研究论文 | 提出AIR-SPACE方法,结合高分辨率空间转录组学与配对长读长测序,构建病毒感染后淋巴结适应性免疫应答的时空图谱 | 同时分析细胞转录组和适应性免疫受体库在其天然空间背景下的状态,揭示感染早期干扰素-γ产生的异质性激活生态位,以及抗体产生浆细胞通过生发中心暗区分化和迁出的新证据 | 该研究仅在鼠后膝窝淋巴结中对牛痘病毒感染进行分析,可能需在其他模型或人类样本中验证普遍性 | 理解病毒感染后淋巴结中适应性免疫细胞的空间组织和动态过程 | 小鼠后膝窝淋巴结(在牛痘病毒足垫感染后的五个时间点) | 数字病理学 | 病毒感染 | 空间转录组学, 长读长测序 | NA | 空间转录组数据, 免疫受体库测序数据 | 多个小鼠后膝窝淋巴结,在感染后五个时间点采集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 273 | 2026-06-04 |
Olfactory inputs to appetite neurons in the hypothalamus
2026-Feb-03, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2524926123
PMID:41591908
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研究论文 | 研究嗅觉信号如何通过神经通路影响下丘脑弓状核中与食欲相关的AgRP和POMC神经元 | 首次利用多突触病毒示踪和单细胞转录组学揭示嗅觉皮层向食欲神经元传递特异性信号的多条路径 | 未明确各上游神经环路的功能验证,且仅基于小鼠模型 | 阐明嗅觉输入对食欲神经元调控的神经回路机制 | 小鼠下丘脑弓状核中的AgRP神经元和POMC神经元 | 神经科学 | NA | 多突触病毒示踪, 单细胞转录组学, RNA定位 | NA | 基因表达数据, 神经通路数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 274 | 2026-06-04 |
Integrated immune profiling of chordomas reveals spatially organized niches and functional heterogeneity
2026-Feb-01, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf213
PMID:41586579
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序、TCR分析和多重免疫荧光技术,对脊索瘤的免疫景观进行整合分析,揭示了其空间组织生态位和功能异质性 | 首次整合空间、转录组和TCR数据,揭示脊索瘤中肿瘤相关巨噬细胞和T细胞的功能状态及相互作用,并发现纤维隔作为免疫相互作用枢纽 | 样本量较小(35个脊索瘤样本和6个配对肿瘤-PBMC样本),可能限制结果的普适性 | 阐明脊索瘤的免疫微环境特征,为开发个性化免疫治疗提供基础 | 35例脊索瘤组织和6例配对的外周血单核细胞样本 | 数字病理学 | 脊索瘤 | 单细胞RNA测序, T细胞受体分析, 多重免疫荧光, 加权基因共表达网络分析 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | 35个脊索瘤样本和6个配对肿瘤-PBMC样本 | NA | 单细胞RNA测序, 多重免疫荧光 | NA | NA |
| 275 | 2026-06-04 |
Single-immunocyte transcriptomics reveal the role of natural killer cell-dependent exogenous antigen presentation in ankylosing spondylitis severity
2026-Feb, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-025-01619-6
PMID:41593306
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示自然杀伤细胞依赖性外源抗原呈递在强直性脊柱炎严重程度中的作用 | 首次发现并深入解析APC-NK细胞亚群通过抗原呈递驱动CD4 T细胞活化从而加剧强直性脊柱炎严重程度的新机制,并建立先天防御与NK依赖性抗原呈递之间的权衡模型 | 研究主要基于外周血单核细胞,未涉及组织驻留免疫细胞;动物模型使用SKG小鼠可能无法完全模拟人类疾病复杂性 | 探究强直性脊柱炎发病、加重和缓解过程中的免疫学特征及内在规律 | 健康供体及不同疾病阶段的强直性脊柱炎患者外周血单核细胞 | 单细胞转录组学 | 自身免疫性疾病,强直性脊柱炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个健康供体和不同疾病阶段患者 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3'测序平台 |
| 276 | 2026-06-04 |
GCSH promotes colorectal cancer progression by inhibiting Cuproptosis through the PI3K/AKT-FDX1 axis
2026-Jan-27, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-025-01808-6
PMID:41591502
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研究论文 | GCSH通过PI3K/AKT-FDX1轴抑制铜凋亡促进结直肠癌进展 | 首次发现GCSH是铜凋亡的新型调节因子,并揭示其通过PI3K/AKT-GCSH/FDX1轴抑制铜凋亡以促进结直肠癌进展的机制 | 文章摘要未明确提及局限性 | 探究GCSH在结直肠癌中的作用及其对铜凋亡的调控机制 | 结直肠癌组织、血液样本及结直肠癌细胞系 | 机器学习 | 结直肠癌 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | TCGA数据集689例,4个独立GEO数据集共709例,以及临床组织、血液样本和细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 277 | 2026-06-04 |
Prediction of tumor-infiltrating lymphocytes through habitat radiomics and exploration of response mechanisms in neoadjuvant immunochemotherapy-treated lung cancer
2026-Jan-27, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04291-x
PMID:41591567
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研究论文 | 开发并验证了一种基于栖息地影像组学的方法,用于无创预测新辅助免疫化疗后非小细胞肺癌患者的肿瘤浸润淋巴细胞状态 | 首次将栖息地影像组学与机器学习结合,用于无创预测新辅助免疫化疗后非小细胞肺癌的TIL状态,并通过单细胞RNA测序探索了免疫抑制微环境的机制 | 回顾性研究设计、样本量相对有限、数据来自单一机构,可能导致选择偏倚 | 开发并验证一种基于栖息地影像组学的方法,用于无创预测TIL状态以评估新辅助免疫化疗反应 | 238名接受新辅助免疫化疗的非小细胞肺癌患者(其中201名纳入影像组学分析) | 数字病理学 | 肺癌 | CT影像组学,单细胞RNA测序 | 随机森林 | CT图像,单细胞RNA测序数据 | 238名患者(201名纳入影像组学分析,140名训练集,61名测试集) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 278 | 2026-06-04 |
FAP expression as a marker of malignant transformation enabling in vivo characterization in peripheral nerve sheath tumors: a multimodal and translational study
2026-Jan-27, Acta neuropathologica
IF:9.3Q1
DOI:10.1007/s00401-026-02979-7
PMID:41591566
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研究论文 | 通过多模态分析研究FAP在恶性周围神经鞘瘤中作为恶性转化标志物的表达 | 首次整合批量转录组学、空间转录组学、单细胞RNA测序及免疫组化,并结合FAP靶向PET/CT成像,全面验证FAP在MPNST中的表达及临床转化潜力 | 样本量有限,仅在一名NF-1患者中验证PET/CT,缺乏大规模前瞻性临床验证 | 评估成纤维细胞活化蛋白α作为周围神经鞘瘤恶性转化生物标志物及治疗靶点的潜力 | 恶性周围神经鞘瘤与良性神经纤维瘤的肿瘤样本 | 数字病理学 | 神经纤维瘤病1型,恶性周围神经鞘瘤 | 批量转录组学,空间转录组学,单细胞RNA测序,免疫组化,PET/CT成像 | NA | 转录组数据,空间转录组数据,单细胞转录组数据,组织切片图像,PET/CT图像 | 多个公开数据集及独立存档组织样本 | NA | 批量RNA-seq,空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 279 | 2026-06-04 |
Kynurenine mediates the chemotherapy-induced intestinal toxicity through modulation of gut microbiota
2026-Jan-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68741-5
PMID:41593057
|
研究论文 | 该研究揭示了犬尿氨酸在化疗诱导的肠道毒性中的关键作用,通过调节肠道菌群导致肠道损伤 | 首次发现髓系细胞来源的犬尿氨酸通过导致肠道菌群失调(特别是约氏乳杆菌减少)激活TNFα/JNK通路,加重化疗引起的肠道毒性 | 尚未充分探讨其他肠道微生物群体的变化及其与犬尿氨酸的相互作用,需要进一步动物模型和临床验证 | 阐明化疗诱导肠道毒性中系统性代谢与局部肠道损伤之间的联系机制 | 化疗后出现严重肠道毒性的患者、髓系细胞特异性基因敲除小鼠模型 | 数字病理学 | 化疗相关性肠道毒性 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 化疗后出现严重肠道毒性的患者样本及髓系细胞特异性基因敲除小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 280 | 2026-06-04 |
A spatially resolved atlas of gastric cancer characterises a lymphocyte-aggregated region
2026-Jan-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68612-z
PMID:41593079
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研究论文 | 通过整合单细胞和空间转录组学,识别胃癌微环境中的四个空间区域,并重点描述了一个淋巴细胞聚集区域 | 首次以空间分辨率绘制胃癌微环境图谱,并识别出淋巴细胞聚集区域及其与不同淋巴细胞亚群和转录组类型相关的分布模式 | 未明确提及限制 | 探究胃癌肿瘤微环境的细胞组成和空间组织 | 胃癌组织中的肿瘤微环境细胞 | 计算机视觉, 自然语言处理, 机器学习, 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 未提及 | 单细胞数据, 空间转录组数据 | 未提及 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |