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当前共找到 32658 篇文献，本页显示第 261 - 280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2025-11-15 |
Single-cell clonal lineage tracing identifies the transcriptional program controlling the cell-fate decisions by neoantigen-specific CD8+ T cells
2025-Oct-13, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-25-0203
PMID:41081433
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研究论文 | 通过单细胞克隆谱系追踪揭示新抗原特异性CD8+ T细胞命运决定的转录调控程序 | 首次结合单细胞转录组和T细胞受体谱分析，系统描绘了新抗原特异性CD8+ T细胞在肿瘤和引流淋巴结中的克隆扩增与分化轨迹 | 研究基于小鼠前列腺癌模型，人类临床样本验证有限 | 解析新抗原特异性CD8+ T细胞命运决定的转录调控机制 | 小鼠前列腺癌模型中的新抗原特异性CD8+ T细胞 | 单细胞生物学 | 前列腺癌 | 单细胞转录组测序, T细胞受体谱分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, T细胞受体序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 262 | 2025-11-15 |
Precisely defining disease variant effects in CRISPR-edited single cells
2025-Oct, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09313-3
PMID:40702188
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研究论文 | 开发了一种多组学单细胞测序方法，用于精确识别CRISPR编辑的疾病变异效应 | 结合基因组DNA编辑识别、转录组分析和细胞表面蛋白表达测量的多模态单细胞功能基因组学方法 | 未明确说明样本量限制或技术适用范围 | 识别疾病相关非编码等位基因的功能后果并确定因果变异 | 人类T细胞中的基因破坏、调控区域缺失、非编码单核苷酸多态性等位基因 | 功能基因组学 | 自身免疫疾病 | CRISPR-Cas编辑, 多组学单细胞测序 | NA | 基因组DNA, 转录组, 蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 263 | 2025-11-15 |
Comprehensive Analysis of scRNA-Seq and Bulk RNA-Seq Identified TIMP1 as a Prognostic Marker in Colorectal Cancer
2025-Oct, Immune network
IF:4.3Q2
DOI:10.4110/in.2025.25.e38
PMID:41220845
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，构建结直肠癌免疫预后模型并鉴定TIMP1作为预后标志物 | 首次结合scRNA-seq和bulk RNA-seq数据构建结直肠癌免疫预后模型，并实验验证TIMP1的生物学功能 | NA | 解析结直肠癌免疫异质性并开发预后预测模型 | 结直肠癌患者 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,差异表达分析,功能富集分析,随机森林分析,LASSO方法 | 随机森林,LASSO | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 264 | 2025-11-15 |
[RNA Sequencing Reveals Molecular Alternations of Splenocytes Associated with Anti-FⅧ Immune Response in Hemophilia A Murine Model]
2025-Oct, Zhongguo shi yan xue ye xue za zhi
|
研究论文 | 通过RNA测序技术研究血友病A小鼠模型中与抗FⅧ免疫反应相关的脾细胞分子变化 | 首次结合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq技术系统分析血友病A小鼠抗FⅧ免疫反应的分子机制 | 研究仅限于小鼠模型，未在人类样本中验证 | 探究血友病A中抗FⅧ免疫反应的分子机制 | 血友病A小鼠模型的脾细胞 | 生物信息学 | 血友病A | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据 | 血友病A小鼠模型 | Illumina | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | CASAVA碱基识别技术 |
| 265 | 2025-11-15 |
[Research Progress of Epigenetic Modification in Hematopoietic Stem Cell Functional Regulation--Review]
2025-Oct, Zhongguo shi yan xue ye xue za zhi
|
综述 | 本文综述了表观遗传修饰在造血干细胞发育、功能调控和扩增中的研究进展 | 整合了单细胞测序、空间转录组和追踪技术等新兴技术对造血干细胞表观遗传调控机制的最新研究成果 | NA | 探讨表观遗传修饰在造血干细胞功能调控中的作用机制 | 造血干细胞 | 表观遗传学 | NA | 单细胞测序技术, 空间转录组技术, 追踪技术 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 266 | 2025-11-15 |
SIGEL: a context-aware genomic representation learning framework for spatial genomics analysis
2025-Sep-22, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03748-7
PMID:40983914
|
研究论文 | 提出SIGEL框架，通过利用空间基因组上下文从空间转录组数据中学习基因表示 | 开发了成本效益高的空间感知基因表示学习框架，生成的基因表示具有上下文感知、生物学意义明确和跨样本鲁棒性强的特点 | NA | 解决空间转录组学中生成空间信息基因表示的方法有限且计算密集的问题 | 空间转录组数据中的基因表示 | 空间基因组学 | NA | 空间转录组学 | 基因组表示学习框架 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 267 | 2025-11-15 |
KEGNI: knowledge graph enhanced framework for gene regulatory network inference
2025-Sep-22, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03780-7
PMID:40983951
|
研究论文 | 提出一种知识图谱增强的基因调控网络推断框架KEGNI，利用图自编码器从单细胞RNA测序数据中推断细胞类型特异性基因调控网络 | 首次将知识图谱与图自编码器相结合用于基因调控网络推断，能够识别驱动基因并阐明不同细胞背景下的调控机制 | NA | 开发更准确的细胞类型特异性基因调控网络推断方法 | 基因调控网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序 | 图自编码器 | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 268 | 2025-11-15 |
scooby: Modeling multi-modal genomic profiles from DNA sequence at single-cell resolution
2025-Jul-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.19.613754
PMID:39345504
|
研究论文 | 提出首个从DNA序列建模单细胞分辨率多组学数据的框架scooby | 首个在单细胞分辨率从序列建模scRNA-seq覆盖度和scATAC-seq插入谱的框架，通过细胞特异性解码器和预训练模型微调实现 | NA | 理解调控DNA元件如何影响单个细胞中的基因表达，建立统一的基因调控模型 | 造血系统数据集中的单细胞多组学数据 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 多组学分析 | 基于Borzoi预训练模型的深度学习框架 | 基因组序列, 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 269 | 2025-11-15 |
Integrative machine learning and multi-omics framework identifies shared biomarkers for rheumatoid arthritis and ulcerative colitis
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0336243
PMID:41212891
|
研究论文 | 通过整合机器学习和多组学方法识别类风湿关节炎和溃疡性结肠炎的共享生物标志物 | 开发了包含12种算法和交叉验证的综合机器学习框架，首次系统识别RA和UC的共享生物标志物，并通过单细胞RNA测序验证 | 研究主要基于公共基因表达数据集，需要进一步实验验证生物标志物的临床适用性 | 识别类风湿关节炎和溃疡性结肠炎的共享诊断生物标志物 | 类风湿关节炎和溃疡性结肠炎患者的基因表达数据 | 机器学习 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 机器学习 | 集成学习框架(包含12种算法) | 基因表达数据 | 公共基因表达数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 270 | 2025-11-15 |
Metalloproteinase-9 as a Pyroptosis-Hypoxia Synergy Effector Drives Immune Remodeling in Ischemic Stroke: A Multi-Omics Validated Diagnostic Biomarker and Therapeutic Target
2025, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S550007
PMID:41220599
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析鉴定基质金属蛋白酶-9(MMP9)作为缺血性脑卒中诊断生物标志物和治疗靶点 | 首次系统探索细胞焦亡与缺氧在缺血性脑卒中中的协同调控作用，并通过多组学验证MMP9的诊断价值 | 研究样本量有限，需要更大规模临床验证 | 探索缺血性脑卒中早期诊断生物标志物和治疗靶点 | 缺血性脑卒中患者外周血样本 | 生物信息学 | 缺血性脑卒中 | 转录组测序,单细胞测序,RT-qPCR,分子对接 | LASSO,支持向量机,随机森林 | 基因表达数据 | 三个独立数据集(GSE66724,GSE58294,GSE16561)和RT-qPCR验证样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 271 | 2025-11-15 |
Intratumoral heterogeneity and potential treatment strategies in small cell lung cancer
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1657441
PMID:41220942
|
综述 | 本文综述了小细胞肺癌的分子亚型分类、瘤内异质性、肿瘤可塑性及相关治疗策略的最新研究进展 | 通过基因组学和单细胞测序技术揭示了SCLC存在动态分子亚型及其空间互斥与共存关系，提出了肿瘤可塑性的新视角 | NA | 探讨小细胞肺癌的瘤内异质性特征及潜在治疗策略 | 小细胞肺癌细胞系、动物模型和肿瘤组织 | 肿瘤学 | 肺癌 | 基因组学，单细胞测序 | NA | 基因组数据，单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 272 | 2025-11-15 |
SPP1+ TAM: CD8+ T Cell Crosstalk Associates with Blocking Radiotherapy Efficacy in Lung Cancer
2025, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0851
PMID:41221295
|
研究论文 | 本研究揭示了SPP1+肿瘤相关巨噬细胞通过抑制CD8+ T细胞浸润限制肺癌放疗疗效的机制 | 首次发现放疗后上调的SPP1是免疫抑制性巨噬细胞的关键因子，并证明靶向SPP1可增强放疗效果 | NA | 探索肺癌放疗疗效受限的免疫机制并寻找联合治疗策略 | 非小细胞肺癌肿瘤微环境中的巨噬细胞和CD8+ T细胞 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 273 | 2025-11-15 |
Inflammatory Monocytes Increase Prior to Detectable HIV-1 Rebound Viremia
2024-Dec-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.24.630257
PMID:39763863
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研究论文 | 本研究通过分析HIV-1治疗中断后病毒反弹前后的血浆蛋白质组和单细胞转录组，发现可检测病毒血症前炎症单核细胞增加 | 首次在可检测HIV-1病毒反弹前观察到CD16单核细胞增加和独特转录特征 | 研究样本量有限，仅关注外周血单个核细胞 | 识别治疗停止后病毒反弹的早期信号，为延长HIV-1缓解期提供策略 | HIV-1感染者的外周血单个核细胞和血浆样本 | 单细胞组学 | HIV-1感染 | 单细胞转录组测序, 血浆蛋白质组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 274 | 2025-11-15 |
Genetically Engineered Mouse Models for Alzheimer Disease and Frontotemporal Dementia: New Insights from Single-Cell and Spatial Transcriptomics
2024-Dec-19, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2024.11.006
PMID:39743215
|
综述 | 本文综述了阿尔茨海默病和额颞叶痴呆的基因工程小鼠模型，重点总结了单细胞转录组学、多组学和空间转录组学研究的新发现 | 整合单细胞转录组学、多组学和空间转录组学技术为神经退行性疾病小鼠模型提供新见解 | 承认没有任何小鼠模型是完美的，存在模型局限性 | 研究神经退行性疾病的病因学和潜在治疗方法 | 基因工程小鼠模型，特别是阿尔茨海默病和额颞叶痴呆模型 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组学, 多组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多组学 | NA | NA |
| 275 | 2025-11-15 |
Apoptosis recognition receptors regulate skin tissue repair in mice
2023-12-21, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.86269
PMID:38127424
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示凋亡识别受体在小鼠皮肤组织修复中的调控机制 | 首次在皮肤伤口炎症期间系统描绘细胞动态图谱，发现Axl和Timd4两种胞葬受体在组织修复中的不同作用机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类糖尿病足伤口数据有限，TLR3非依赖性机制尚未完全阐明 | 探究凋亡细胞识别与清除机制如何调控组织修复过程 | 小鼠皮肤伤口模型和人类糖尿病足伤口样本 | 单细胞生物学 | 糖尿病足溃疡 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 276 | 2025-11-15 |
Single-cell characterization of human GBM reveals regional differences in tumor-infiltrating leukocyte activation
2023-12-21, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.92678
PMID:38127790
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示了人类胶质母细胞瘤中肿瘤浸润白细胞的区域差异 | 首次在配对样本中揭示了GBM肿瘤中心、外周浸润区和血液中免疫细胞的区域特异性转录特征 | 样本量较小（仅5例患者），需要更大规模验证 | 解析胶质母细胞瘤肿瘤微环境中免疫细胞的区域异质性 | 人类胶质母细胞瘤患者 | 单细胞组学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 5例原发性GBM患者的配对样本（肿瘤中心、外周浸润区、血液） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 277 | 2025-11-15 |
Single-cell sequencing highlights heterogeneity and malignant progression in actinic keratosis and cutaneous squamous cell carcinoma
2023-12-15, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.85270
PMID:38099574
|
研究论文 | 通过单细胞测序技术揭示光化性角化病和皮肤鳞状细胞癌的异质性及恶性进展机制 | 首次通过单细胞RNA测序全面描绘从正常皮肤到光化性角化病再到侵袭性皮肤鳞癌的完整进展过程，发现基底细胞恶性亚型并鉴定关键驱动基因 | 样本量较小（仅6名患者的13个样本），需要更大规模研究验证发现 | 解析皮肤鳞状细胞癌的发病机制和恶性进展过程 | 光化性角化病、原位鳞状细胞癌、皮肤鳞状细胞癌患者组织样本 | 单细胞测序 | 皮肤鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 免疫组织化学, 免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 表观基因组数据, 组织图像 | 6名患者的13个样本，共138,982个细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 278 | 2025-11-15 |
Neural tube-associated boundary caps are a major source of mural cells in the skin
2023-12-14, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.69413
PMID:38095361
|
研究论文 | 本研究揭示神经管相关边界帽细胞是小鼠皮肤血管壁细胞的主要来源 | 首次发现边界帽细胞衍生物沿神经迁移至皮肤并分化为血管周细胞和血管平滑肌细胞 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类或其他物种中验证 | 探索边界帽细胞在皮肤血管发育中的新功能 | 小鼠胚胎和新生小鼠的边界帽细胞及其衍生物 | 发育生物学 | NA | Cre报告基因细胞追踪，单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据，细胞追踪数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 279 | 2025-11-15 |
Avoiding false discoveries in single-cell RNA-seq by revisiting the first Alzheimer's disease dataset
2023-12-04, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.90214
PMID:38047913
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研究论文 | 重新分析首个阿尔茨海默病单细胞RNA-seq数据集，通过改进数据处理和差异表达分析方法显著减少假阳性发现 | 采用最佳实践方法重新分析首个AD单核RNA-seq数据，将假发现率0.05下的差异表达基因减少549倍 | 仅针对单个数据集进行重新分析，未涉及其他独立验证数据集 | 评估质量控制和分析方法对疾病相关基因发现的影响，纠正先前研究中的假阳性发现 | 阿尔茨海默病患者脑组织单细胞RNA-seq数据 | 单细胞转录组学 | 阿尔茨海默病 | 单核RNA-seq | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单核RNA-seq | NA | NA |
| 280 | 2025-11-15 |
Epicardioid single-cell genomics uncovers principles of human epicardium biology in heart development and disease
2023-12, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01718-7
PMID:37012447
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研究论文 | 本研究通过人类多能干细胞衍生的心外膜类器官揭示人类心外膜在心脏发育和疾病中的生物学原理 | 开发了自组织人类多能干细胞衍生的心外膜类器官模型，首次实现了左心室壁典型的心外膜和心肌形态、分子和功能模式 | 类器官模型可能无法完全模拟体内真实心脏环境的复杂性 | 探索人类心外膜在心脏发育和疾病中的生物学功能和作用机制 | 人类多能干细胞衍生的心外膜类器官 | 单细胞基因组学 | 心脏疾病 | 谱系追踪, 单细胞转录组测序, 染色质可及性分析 | 类器官模型 | 单细胞转录组数据, 表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |