单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
261	2025-09-19	Single-cell RNA sequencing study reveals the potential role of the RPS26 gene in attention deficit hyperactivity disorder 2025-Aug-30, Progress in neuro-psychopharmacology & biological psychiatry IF:5.3Q1 DOI:10.1016/j.pnpbp.2025.111444 PMID:40653146	研究论文	通过单细胞RNA测序技术探索RPS26基因在注意力缺陷多动障碍（ADHD）中的潜在作用及其与心血管疾病的分子联系	首次应用单细胞RNA测序技术研究ADHD患者白细胞亚群的基因表达差异，并发现RPS26基因在单核细胞中的调控作用	样本量较小（仅一对异卵双胞胎），且主要基于体外实验验证，需要更大规模研究进一步确认	探索ADHD与心血管疾病之间的潜在生物学联系，重点关注单核/巨噬细胞生物学	ADHD患者（特别是异卵双胞胎中患病个体）的白细胞样本	生物信息学	注意力缺陷多动障碍	单细胞RNA测序（scRNA-seq），定量PCR（qPCR），体外功能实验	NA	RNA测序数据，基因表达数据	一对ADHD不一致的异卵双胞胎
262	2025-09-19	An updated and spatially validated somatic single-cell atlas of Hydractinia symbiolongicarpus 2025-Jun-07, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2025.06.03.657738 PMID:40502179	研究论文	本研究通过整合新数据集与已有数据，构建并验证了Hydractinia symbiolongicarpus的更新版体细胞单细胞图谱	发现了新的神经亚型、两个空间分布不同的腺细胞群体、一个匍匐茎特异性细胞类型以及一个推定的免疫细胞簇，并揭示了完整的刺细胞发育轨迹	NA	深化对刺胞动物细胞多样性和动态变化的理解，为干细胞和再生研究提供资源	Hydractinia symbiolongicarpus（一种刺胞动物模型）的摄食水螅体和匍匐茎组织	单细胞转录组学	NA	scRNA-seq（单细胞RNA测序）	NA	单细胞转录组数据	超过47,000个细胞
263	2025-09-19	Stem Cell Markers LGR5, LGR4 and Their Immediate Signalling Partners are Dysregulated in Preeclampsia 2025-Apr, Stem cell reviews and reports IF:4.5Q2 DOI:10.1007/s12015-024-10831-2 PMID:39688759	研究论文	本研究首次描述了LGR5和LGR4及其信号伴侣在人类胎盘中的表达，并发现它们在先兆子痫中失调	首次在人类胎盘中表征LGR5/LGR4及其配体/靶点，并发现其与先兆子痫和胎儿生长受限的关联	缺氧和促炎细胞因子处理未显著改变LGR5/LGR4表达，暗示其他机制可能参与	研究LGR5/LGR4在胎盘中的表达特征及其在先兆子痫和胎儿生长受限中的失调机制	人类胎盘组织、滋养层干细胞和不同妊娠期胎盘样本	生殖医学	先兆子痫	原位杂交、单细胞转录组学、单核RNA测序、转录组分析	NA	mRNA表达数据、测序数据	早孕期(n=11)、早产(n=9)、足月(n=11)胎盘样本，先兆子痫组(n=81)与对照组(n=19)等
264	2025-09-19	MFAP4 Deficiency Attenuates Liver Fibrosis by Regulating Hepatic Stellate Cell Fate Through Inhibition of the FAK/PI3K/NFκB Signaling Pathway 2025, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1 DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101548 PMID:40449846	研究论文	本研究探讨MFAP4通过调控肝星状细胞命运在肝纤维化中的作用机制	首次揭示MFAP4通过整合素αvβ3依赖的FAK/PI3K/NFκB信号通路调控肝星状细胞活化和凋亡抵抗的分子机制	研究主要基于小鼠模型和细胞实验，人类临床相关性需进一步验证	阐明MFAP4在肝纤维化发生发展中的功能作用和分子机制	野生型和Mfap4基因敲除小鼠、LX-2细胞系、肝星状细胞	肝脏病理学	肝纤维化	单细胞RNA测序、免疫荧光、流式细胞术、Western blot、qPCR	NA	基因表达数据、蛋白质数据、细胞表型数据	基因修饰小鼠模型和细胞系实验
265	2025-08-04	A Reflux Linked GATA Factor Fulcrum Dictates Lineage Commitment Through GPRC5B During the Esophageal Dysplastic Transition 2025, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1 DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101552 PMID:40490196	研究论文	本研究探讨了GATA家族转录因子在食管腺癌（EAC）和Barrett食管（BE）化生-异型增生转变过程中的作用机制	发现了GATA因子在食管腺癌发展中的关键作用，并识别了GATA诱导的GPRC5B作为功能性标记物和可能的驱动因子	研究主要基于体外实验和芯片器官模型，需要进一步的体内验证	阐明GATA家族成员在Barrett食管向食管腺癌转变过程中的分子机制	食管细胞系、病变来源的成体干细胞（ASCs）和癌症基因组图谱数据	癌症生物学	食管腺癌	RNA测序、shRNA或CRISPR介导的基因沉默、空间转录组学、芯片器官研究	NA	基因表达数据、空间转录组数据	癌症基因组图谱中的EAC病例、食管细胞系和病变来源的ASCs
266	2025-09-19	Regulatory TCRαβ+ Double Negative T Cells Suppress γδ T Cells and Alleviate Colitis 2025, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1 DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101553 PMID:40505772	研究论文	本研究探讨了调节性TCRαβ+双阴性T细胞（DNT细胞）通过抑制γδ T细胞缓解结肠炎的作用机制	首次揭示DNT细胞通过E-cadherin和NKG2D协同增强对γδ T细胞的细胞毒性，并证明异体DNT细胞移植可缓解结肠炎且不引发移植物抗宿主病	研究基于小鼠模型，人类临床应用效果仍需进一步验证	阐明调节性DNT细胞在结肠炎中的免疫调节作用及治疗潜力	小鼠结肠组织中的免疫细胞（DNT细胞和γδ T细胞）	免疫学	炎症性肠病	单细胞RNA测序，过继性细胞转移	NA	基因表达数据，细胞表型数据	小鼠模型（具体数量未在摘要中说明）
267	2025-09-19	Enhanced resistance to Listeria infection in mice surviving sepsis: the role of lipid metabolism and myeloid cell reprogramming 2025, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1 DOI:10.3389/fphar.2025.1588987 PMID:40520167	研究论文	本研究探讨脓毒症存活小鼠通过脂质代谢和髓系细胞重编程增强对李斯特菌感染的抵抗力	发现脓毒症存活诱导髓系细胞脂质代谢重编程，增强对胞内病原体的免疫防御	研究基于小鼠模型，人类临床相关性尚需进一步验证	探究脓毒症存活后免疫系统增强抵抗二次感染的机制	脓毒症存活小鼠及李斯特菌感染模型	免疫学	脓毒症及细菌感染	单细胞RNA测序、定量RT-PCR、免疫组化、血清细胞因子检测、血浆脂质组学	NA	基因表达数据、脂质组学数据、细胞表型数据	实验小鼠模型（具体数量未明确说明）
268	2025-09-19	Hepatocyte Apolipoprotein J Accelerates Injury-induced Liver Fibrosis by Activation Signal Transducer and Activator of Transcription 3 Through Ranbp2 Mediated-SUMOylation 2025, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1 DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101556 PMID:40545037	研究论文	本研究探讨肝细胞载脂蛋白J（ApoJ）通过RanBP2介导的SUMO化激活STAT3通路，从而加速损伤诱导的肝纤维化进程	首次揭示ApoJ通过促进STAT3的K679位点SUMO化并增强其核转位来激活STAT3通路，提出ApoJ/STAT3/RanBP2轴作为肝纤维化治疗新靶点	研究主要基于小鼠模型和体外实验，临床转化潜力需进一步验证	探究肝细胞ApoJ如何调控STAT3通路介导旁分泌信号激活肝星状细胞	肝细胞、肝星状细胞（HSCs）、小鼠模型、肝硬化患者单细胞RNA测序数据	分子病理学	肝纤维化/肝硬化	单细胞RNA测序、基因敲除/过表达模型、细胞培养上清处理	NA	基因表达数据、蛋白质互作数据	肝硬化患者与健康对照的单细胞RNA数据集、多种肝纤维化小鼠模型
269	2025-09-19	Histopathologic Evaluation and Single-cell Spatial Transcriptomics of the Colon Reveal Cellular and Molecular Abnormalities Linked to J-Pouch Failure in Patients With Inflammatory Bowel Disease 2025, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1 DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101563 PMID:40571096	研究论文	本研究通过组织病理学评估和单细胞空间转录组学分析结肠标本，揭示与炎症性肠病患者J型储袋失败相关的细胞和分子异常	首次结合传统组织病理学与单细胞空间转录组学技术，系统揭示J型储袋失败的分子机制和免疫微环境特征	回顾性研究设计，样本来源单一医疗中心，空间转录组学分析仅针对部分患者亚组	识别与回肠储袋-肛门吻合术失败相关的组织病理学特征并探究其分子机制	接受回肠储袋-肛门吻合术治疗的炎症性肠病患者	数字病理学	炎症性肠病	单细胞空间转录组学，免疫组织化学	NA	组织切片，基因表达数据	417例患者队列，其中部分进行空间转录组学分析
270	2024-11-22	Author Correction: Single-cell transcriptomics stratifies organoid models of metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease 2024-Dec, The EMBO journal DOI:10.1038/s44318-024-00308-w PMID:39567832	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
271	2025-09-19	Advancing toward a unified eosinophil signature from transcriptional profiling 2024-Nov-27, Journal of leukocyte biology IF:3.6Q2 DOI:10.1093/jleuko/qiae188 PMID:39213186	综述	本文总结了小鼠和人类嗜酸性粒细胞在血液和组织中的转录谱研究进展，并讨论了不同方法的优势和潜在问题	提出建立嗜酸性粒细胞研究的通用技术标准，推动领域发展并实现跨研究比较	嗜酸性粒细胞转录分析受细胞脆弱性和高质量RNA分离难度限制，人类样本研究仍存在知识空白	提高嗜酸性粒细胞相关疾病的诊断精确性和治疗选择	小鼠和人类嗜酸性粒细胞	转录组学	嗜酸性粒细胞相关疾病	单细胞RNA测序、bulk RNA测序、微阵列	NA	RNA序列数据	NA
272	2025-09-19	Sample multiplexing for retinal single-cell RNA sequencing 2024-Nov-15, iScience IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.isci.2024.111250 PMID:39569377	研究论文	本文建立了一种用于小鼠视网膜神经节细胞的单细胞RNA测序样本多重标记流程，利用胆固醇修饰寡核苷酸进行样本标记	开发了基于胆固醇修饰寡核苷酸的scRNA-seq样本多重标记方法，能够解析样本来源同时保留表型数据	NA	解决稀有细胞群体在单细胞RNA测序中的表征挑战，提高样本识别精度	小鼠视网膜神经节细胞	单细胞测序技术	NA	单细胞RNA测序(scRNA-seq)，胆固醇修饰寡核苷酸标记	NA	单细胞转录组数据	NA
273	2025-09-19	Nerve-associated macrophages control adipose homeostasis across lifespan and restrain age-related inflammation 2024-Oct-13, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.10.12.618004 PMID:39416197	研究论文	本研究通过单细胞测序揭示了脂肪组织中神经相关巨噬细胞（NAMs）在调控脂肪稳态和抑制年龄相关炎症中的关键作用	首次定义了CD169+神经相关巨噬细胞（NAMs）亚群，并证明其通过防止儿茶酚胺抵抗来抑制衰老相关炎症	NA	探究脂肪组织巨噬细胞（ATMs）如何调控年龄相关炎症（inflammaging）	小鼠内脏白色脂肪组织（VAT）中的巨噬细胞亚群	免疫学	老年性疾病	单细胞测序、血管内标记、正交验证	NA	单细胞测序数据	NA
274	2025-09-19	Endothelial-adipocyte Cx43 Mediated Gap Junctions Can Regulate Adiposity 2024-Sep-10, Function (Oxford, England) DOI:10.1093/function/zqae029 PMID:38984993	研究论文	研究内皮细胞与脂肪细胞间Cx43介导的间隙连接在调节肥胖中的作用	首次揭示内皮细胞Cx43通过间隙连接调控脂肪组织功能的具体机制，并发现Ser368磷酸化修饰的关键作用	研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证	探究脂肪毛细血管内皮细胞与脂肪细胞相互作用的机制及其对代谢功能的影响	小鼠模型、人类scRNAseq数据、体外共培养系统	代谢疾病研究	肥胖症	scRNAseq、TEM、遗传敲除、体外共培养	NA	基因表达数据、显微图像、代谢参数	高脂饮食小鼠模型及相应遗传修饰小鼠
275	2025-09-19	Vascular heterogeneity of tight junction Claudins guides organotropic metastasis 2024-Sep, Nature cancer IF:23.5Q1 DOI:10.1038/s43018-024-00813-1 PMID:39289595	研究论文	本研究揭示了血管内皮紧密连接蛋白Claudins的器官特异性异质性在决定乳腺癌器官趋向性转移中的关键作用	发现Ang2介导的Claudin 5抑制促进肺转移，而非Ang2响应的Claudin 2和10阻止肾转移，首次证明血管异质性独立于癌细胞内在机制指导转移	主要关注乳腺癌症模型，其他癌症类型的普适性尚未验证	探究器官特异性转移的机制，特别是乳腺癌向肺而非肾转移的原因	转移性乳腺癌症模型，包括自发和植入模型，以及炎症组织纤维化	癌症生物学	乳腺癌	单细胞测序分析，功能研究，抗体阻断实验	NA	测序数据，功能实验数据	NA
276	2025-09-19	Obesogenic diet disrupts tissue-specific mitochondrial gene signatures in the artery and capillary endothelium 2024-Feb-01, Physiological genomics IF:2.5Q2 DOI:10.1152/physiolgenomics.00109.2023 PMID:37982169	研究论文	本研究探讨了肥胖饮食对动脉和毛细血管内皮中线粒体基因表达的组织特异性影响	揭示了PPAR-γ在肥胖诱导的内皮细胞表型转换中的驱动作用，并通过人类数据验证了发现	NA	理解肥胖如何影响内皮细胞代谢表型，特别是线粒体基因表达	小鼠和人类的内皮细胞，特别是脂肪和肠系膜血管床	分子生物学	肥胖相关代谢疾病	bulk RNA测序, single-cell RNA测序, single-nuclei RNA测序	NA	RNA测序数据	小鼠脂肪和肠系膜血管内皮细胞，以及人类内脏脂肪单核RNA测序数据
277	2025-09-19	Isolation and Single-Cell Transcriptomic Analysis of Murine Regulatory B Cells 2024, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) DOI:10.1007/978-1-0716-3754-8_12 PMID:38622400	研究论文	本章介绍了从狼疮易感MRL/lpr小鼠中分离调节性B细胞（Breg）并进行单细胞RNA测序分析的实验方案	提供了针对狼疮模型小鼠的Breg细胞分离方案，并采用单细胞转录组分析技术深入表征Breg细胞	NA	研究调节性B细胞在自身免疫疾病和癌症免疫中的生物学功能与分子特征	狼疮易感MRL/lpr小鼠的调节性B细胞	NA	自身免疫疾病（狼疮）	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	转录组数据	NA
278	2025-09-19	Hyperactive mTORC1 in lung mesenchyme induces endothelial cell dysfunction and pulmonary vascular remodeling 2023-12-20, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1 DOI:10.1172/JCI172116 PMID:38127441	研究论文	本研究探讨肺间质中过度活跃的mTORC1如何通过旁分泌信号导致内皮细胞功能障碍和肺血管重塑	首次揭示LAM中间质细胞通过旁分泌信号与内皮细胞对话，驱动血管重塑的机制，并建立特异性Tsc2敲除小鼠模型模拟人类疾病	研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限；长期效应和临床转化需进一步研究	探究淋巴管平滑肌瘤病（LAM）中肺血管重塑的分子机制	肺间质细胞和内皮细胞，使用Tbx4LME-Cre Tsc2fl/fl基因工程小鼠模型和LAM患者肺组织	分子病理学	肺疾病	单细胞RNA测序（scRNA-Seq），基因敲除模型	NA	转录组数据，组织形态学数据	基因工程小鼠模型（年龄8周至1年）和人类LAM终末期肺移植样本
279	2025-09-19	Retrospective pharmacogenetic study of psoriasis highlights the role of KLK7 in tumour necrosis factor signalling 2023-12-20, The British journal of dermatology DOI:10.1093/bjd/ljad332 PMID:37672660	研究论文	一项回顾性药物遗传学研究，探索银屑病治疗反应相关的遗传通路，并揭示KLK7基因在肿瘤坏死因子信号通路中的作用	发现两个新型遗传标记与治疗反应相关，并首次通过整合多组学数据验证KLK7在抗TNF治疗响应中的生物学机制	回顾性研究设计，样本量相对有限（1942例），自我评估的治疗反应可能存在偏倚	探索银屑病药物反应相关的遗传通路，寻找预测治疗效果的生物标志物	1942例基因分型的银屑病患者	药物遗传学	银屑病	基因分型、表观基因组学、转录组学、免疫组化、单细胞RNA测序	线性回归	遗传数据、临床数据、表达数据	1942例银屑病患者
280	2025-09-19	Single-cell transcriptomics stratifies organoid models of metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease 2023-12-11, The EMBO journal DOI:10.15252/embj.2023113898 PMID:37962490	研究论文	本研究通过单细胞转录组学评估了三种代谢功能障碍相关脂肪性肝病（MASLD）的人肝类器官模型，比较了它们在炎症和纤维化模拟方面的差异	首次系统评估不同诱导条件（油酸、棕榈酸和TGF-β1）下MASLD类器官模型的翻译潜力，并建立单细胞参考基准	研究仅基于体外类器官模型，尚未进行体内验证或临床相关性研究	评估和分层MASLD肝类器官模型的疾病模拟能力	人肝类器官	数字病理学	代谢功能障碍相关脂肪性肝病	单细胞转录组学分析	类器官模型	单细胞基因表达数据	三种不同诱导条件下的肝类器官模型