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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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261 | 2025-10-05 |
Atypical B cells consist of subsets with distinct functional profiles
2023-Dec-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.108496
PMID:38098745
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研究论文 | 通过单细胞测序技术识别了非典型B细胞中三个功能各异的亚群 | 首次在慢性疟疾暴露人群中鉴定出三个具有不同转录和功能特征的非典型B细胞新亚群 | 研究聚焦于疟疾慢性感染人群,结果可能不适用于其他免疫激活状态 | 阐明非典型B细胞在人类适应性免疫应答中的具体作用 | 慢性疟疾寄生虫暴露个体的非典型B细胞 | 单细胞生物学 | 疟疾 | 单细胞测序 | NA | 转录组、细胞表面标志物、B细胞受体 | 慢性疟疾暴露个体(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
262 | 2025-10-05 |
Single-cell sequencing of a novel model of neonatal bile duct ligation in mice identifies macrophage heterogeneity in obstructive cholestasis
2023-08-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-41207-0
PMID:37644108
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研究论文 | 本研究开发了一种新型新生小鼠胆道梗阻模型,并通过单细胞测序揭示了梗阻性胆汁淤积中巨噬细胞的异质性 | 创建了死亡率低的新生儿胆道结扎模型,首次通过单细胞RNA测序比较不同病因胆汁淤积中巨噬细胞功能的特异性差异 | 研究仅限于小鼠模型,需要进一步与人类数据进行比较验证 | 阐明梗阻性胆汁淤积中巨噬细胞亚群的特异性功能和作用机制 | 新生BALB/c小鼠胆道结扎模型和轮状病毒诱导的胆道闭锁模型 | 单细胞生物学 | 梗阻性胆汁淤积 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,组织学染色 | 动物模型 | 单细胞转录组数据,流式细胞数据,组织学图像数据 | 新生BALB/c小鼠胆道结扎模型和对照组 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
263 | 2025-10-05 |
A mineralizing pool of Gli1-expressing progenitors builds the tendon enthesis and demonstrates therapeutic potential
2022-12-01, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2022.11.007
PMID:36459968
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了小鼠肌腱附着点发育过程中的细胞类型和转录调控机制,并验证了Gli1表达祖细胞的治疗潜力 | 首次在单细胞分辨率下定义了小鼠肌腱附着点的发育转录组,识别了六种驻留细胞类型及其转录调控网络,并证实Gli1谱系细胞具有克隆性和多能性 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类或其他物种中验证 | 探索肌腱附着点的发育机制并开发促进其再生的治疗方法 | 小鼠肌腱附着点发育过程中的细胞类型和Gli1谱系细胞 | 单细胞生物学 | 肌腱附着点损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠产后发育阶段的肌腱附着点组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
264 | 2025-10-05 |
Integration of Single-Cell RNA- and CAGE-seq Reveals Tooth-Enriched Genes
2022-05, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345211049785
PMID:34806461
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和CAGE测序技术识别牙齿特异性表达基因 | 首次结合scRNA-seq和CAGE-seq技术鉴定牙齿发育关键基因,开发新型生物信息学分析方法 | 仅使用出生后第1天小鼠磨牙数据,未验证其他发育阶段 | 鉴定牙齿发育过程中的重要功能基因 | 小鼠牙齿胚和磨牙细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, CAGE测序 | NA | 基因表达数据 | 12,212个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, CAGE-seq | NA | NA |
265 | 2025-10-05 |
Bioinformatics Analysis of Transcriptomic Data (Bulk and scRNA-Seq) for Immuno-Oncology
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4734-9_18
PMID:41028272
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综述 | 本章提供了免疫学研究中生物信息学工具和技术的全面指南 | 整合了转录组数据分析(包括bulk和单细胞RNA测序)在免疫肿瘤学中的多种生物信息学方法 | NA | 促进免疫学研究中有效的数据分析和解读 | 免疫系统动态、免疫细胞异质性、基因表达模式和免疫受体库 | 生物信息学 | 肿瘤 | 下一代测序(NGS), 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 质谱流式细胞术 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 多组学整合 | NA | NA |
266 | 2025-10-05 |
CAR T cell engineering impacts antigen-independent activation and co-inhibition
2025-Dec-11, Molecular therapy. Methods & clinical development
DOI:10.1016/j.omtm.2025.101586
PMID:41020262
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研究论文 | 比较慢病毒载体和睡美人转座子系统在CAR-T细胞工程中的差异及其对T细胞特性的影响 | 首次系统比较病毒和非病毒CAR-T细胞工程技术对T细胞抗原非依赖性激活和共抑制状态的影响 | 样本量有限,主要基于健康供者和CLL患者的T细胞研究 | 评估不同CAR-T细胞工程技术对T细胞功能特性的影响 | 健康供者和慢性淋巴细胞白血病患者来源的T细胞 | 免疫工程 | 白血病 | 流式细胞术, 单细胞测序 | NA | 流式细胞数据, 单细胞测序数据 | 健康供者和CLL患者来源的T细胞 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
267 | 2025-10-05 |
Illuminating lymphoid tissue HIV reservoirs: advanced assays and their relevance to achieving an HIV cure
2025-Nov-01, Current opinion in HIV and AIDS
IF:4.5Q1
DOI:10.1097/COH.0000000000000974
PMID:40891589
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综述 | 本综述探讨了用于可视化和表征淋巴组织中HIV病毒库的先进检测方法及其在实现HIV治愈中的意义 | 整合了活体显微镜、空间转录组学、新一代测序和多重单细胞分析等创新技术,揭示病毒库的异质性和病毒持久性机制 | NA | 评估当前和新兴检测方法在表征淋巴组织HIV病毒库中的应用价值 | 淋巴组织中的HIV病毒库 | NA | HIV/艾滋病 | 活体显微镜、空间转录组学、新一代测序、单细胞分析 | NA | 图像、序列数据、单细胞数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞分析 | NA | NA |
268 | 2025-10-05 |
Integrated Analysis of Single-cell and Bulk RNA-Sequencing Identifies a Signature Based on Cancer-related Fibroblast Marker Genes to Predict Prognosis and Therapy Response in Lung Adenocarcinoma
2025 Nov-Dec 01, Journal of immunotherapy (Hagerstown, Md. : 1997)
DOI:10.1097/CJI.0000000000000577
PMID:40831319
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk RNA测序数据,基于癌症相关成纤维细胞标志基因构建了一个预测肺腺癌预后和治疗反应的签名 | 首次基于癌症相关成纤维细胞标志基因构建肺腺癌预后签名,整合单细胞和bulk RNA测序数据进行综合分析 | 研究样本量相对有限,需要更多独立队列验证签名的普适性 | 分析肺腺癌中癌症相关成纤维细胞标志基因表达并构建预后预测模型 | 肺腺癌患者 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,qRT-PCR | 预后签名模型,列线图 | 基因表达数据 | 716例肺腺癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
269 | 2025-10-05 |
Single-cell multiomics reveals multiple adipogenic pathways and diverse multilineage specializations during embryonic fat tail morphogenesis
2025-Oct-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113496
PMID:41019374
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研究论文 | 通过单细胞多组学技术揭示胚胎期脂肪尾形态发生过程中的多种脂肪生成途径和多样化的多谱系特化 | 首次在脂肪尾绵羊胚胎发育过程中应用单细胞多组学测序,揭示了脂肪沉积的三种主要细胞来源和关键增强子驱动的基因调控网络 | 研究受限于胚胎组织的时间敏感性、有限的组织体积和伦理考量 | 探究哺乳动物胚胎期脂肪生成的细胞起源和分子调控机制 | 脂肪尾绵羊胚胎发育过程中的脂肪组织 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞多组学测序, scRNA-seq, snATAC-seq | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 | 胚胎期E50至E80所有脂肪生成阶段的样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 单细胞多组学 | NA | NA |
270 | 2025-10-05 |
eNAMPT Is a Novel DAMP and Therapeutic Target in Human and Murine Pulmonary Fibrosis
2025-Oct, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2024-0342OC
PMID:40126452
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研究论文 | 本研究探讨eNAMPT作为特发性肺纤维化治疗靶点的潜力,并通过ALT-100单克隆抗体验证其治疗效果 | 首次将eNAMPT识别为肺纤维化的新型损伤相关分子模式蛋白和治疗靶点,并证明其中和抗体可逆转纤维化过程 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本,需要更大规模的临床验证 | 评估eNAMPT作为肺纤维化治疗靶点的可行性和ALT-100单抗的治疗效果 | 人类IPF患者样本和C57Bl6小鼠博来霉素诱导的肺纤维化模型 | 病理生物学 | 肺纤维化 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 组织学数据, 生化测量数据 | 人类IPF患者血液、PBMC和肺组织样本,小鼠肺纤维化模型 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
271 | 2025-10-05 |
The Role of p53 in Adipocyte Differentiation and Lipid Metabolism in Obese Mice via Transcriptional Regulation of Lgals3
2025-Oct, Obesity (Silver Spring, Md.)
DOI:10.1002/oby.24363
PMID:40897545
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研究论文 | 本研究探讨p53通过转录调控Lgals3在肥胖小鼠脂肪细胞分化和脂质代谢中的作用 | 首次揭示p53通过转录抑制Lgals3调控脂肪细胞分化和脂质代谢的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和3T3-L1细胞系,人类临床相关性需进一步验证 | 研究p53对Lgals3表达的调控作用及其在肥胖代谢中的功能 | 高脂饮食诱导的肥胖小鼠和3T3-L1前脂肪细胞 | 分子生物学 | 肥胖症 | 单细胞RNA测序, 生物信息学分析, 双荧光素酶报告基因检测, 染色质免疫沉淀, RT-qPCR, Western blot | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 代谢表型数据 | 6个肥胖相关微阵列数据集和单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序, 微阵列 | NA | NA |
272 | 2025-10-05 |
Alpha Linolenic and Stearic Acids Modulate Genes Related to Viral Entry and Inflammatory Response in THP-1 Derived Macrophages Exposed to SARS-CoV-2
2025-Oct, Food science & nutrition
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/fsn3.70529
PMID:41019181
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研究论文 | 探讨α-亚麻酸和硬脂酸对THP-1来源巨噬细胞暴露于SARS-CoV-2时病毒进入和炎症反应相关基因的调控作用 | 首次通过单细胞RNA-seq数据发现巨噬细胞在COVID-19中基因表达的关键变化,并验证游离脂肪酸对病毒进入和炎症反应的调控作用 | 研究仅限于体外细胞实验,未进行动物模型或临床试验验证 | 阐明肥胖影响COVID-19预后的分子机制 | THP-1来源巨噬细胞和Beas2B支气管上皮细胞 | 分子生物学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序, 体外细胞实验 | NA | 基因表达数据, 细胞实验数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
273 | 2025-10-05 |
Platelet-derived growth factor signaling in porcine testicular tubular somatic cells
2025-Oct, Cell and tissue research
IF:3.2Q3
DOI:10.1007/s00441-025-04004-x
PMID:40839115
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研究论文 | 本研究探讨血小板衍生生长因子信号通路在猪睾丸管状体细胞中的作用及其对细胞功能和形态发生的影响 | 首次在高等哺乳动物猪中系统研究PDGF信号通路在睾丸体细胞间的通讯机制,并发现其对细胞骨架和初级纤毛的调控作用 | 初级纤毛调控的PDGF信号在睾丸中的具体作用机制尚未明确 | 阐明PDGF信号通路在猪睾丸体细胞相互作用和形态发生中的功能 | 1周龄猪睾丸管状体细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
274 | 2025-10-05 |
Single-Cell RNA Sequencing Identifies a Unique Macrophage Population in a Mouse Model of Ozone-induced Asthma Exacerbation
2025-Oct, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2024-0358OC
PMID:40106801
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术识别了臭氧诱导哮喘加重小鼠模型中独特的巨噬细胞群体 | 首次在臭氧暴露的哮喘小鼠模型中鉴定出独特的肺泡巨噬细胞和单核细胞亚群,并揭示了这些细胞在气道高反应性中的新作用机制 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 探究臭氧暴露导致哮喘气道高反应性的免疫细胞机制 | 尘螨、豚草和臭氧暴露的小鼠肺部免疫细胞 | 单细胞组学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 暴露于DRA、臭氧或DRA+臭氧的小鼠肺部细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
275 | 2025-10-05 |
The multifaceted role of YAP in the tumor microenvironment and its therapeutic implications in cancer
2025-Oct-01, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-025-01551-9
PMID:41028521
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综述 | 本文综述了YAP在肿瘤微环境中的多面性作用及其在癌症治疗中的意义 | 系统阐述了YAP/TAZ作为机械转导器和转录共激活因子在肿瘤微环境重塑中的核心调控作用,及其与免疫检查点抑制剂联合治疗的潜力 | 肿瘤选择性和耐药机制等挑战仍然存在 | 探讨YAP在肿瘤微环境中的作用机制及其治疗意义 | 肿瘤微环境中的YAP/TAZ信号通路 | 肿瘤生物学 | 癌症 | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
276 | 2025-10-05 |
Spatial Transcriptomics of Human Decidua Identifies Molecular Signatures in Recurrent Pregnancy Loss
2025-Oct-01, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf080
PMID:41031483
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研究论文 | 通过空间转录组学分析人类蜕膜组织,揭示复发性妊娠丢失的分子特征 | 首次通过空间转录组学识别人类蜕膜中两个功能不同的空间区域,并发现FOSL2作为调控dNK1细胞空间转化的关键因子 | 研究样本仅限于早期妊娠组织,未涵盖其他妊娠阶段 | 探究人类蜕膜中免疫耐受的空间分布特征及其在复发性妊娠丢失中的失调机制 | 健康供者和复发性妊娠丢失患者的早期妊娠蜕膜组织 | 空间转录组学 | 复发性妊娠丢失 | 空间转录组学, 单细胞染色质可及性分析, 转录因子占据分析 | NA | 空间转录组数据, 单细胞表观基因组数据 | 健康供者和RPL患者的早期妊娠蜕膜组织 | NA | 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
277 | 2025-10-05 |
Thymic Stromal Lymphopoietin Promotes Ozone-induced Inflammation in the Airway
2025-Sep-30, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2025-0281OC
PMID:41025995
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研究论文 | 本研究探讨了胸腺基质淋巴细胞生成素在臭氧诱导的气道炎症中的作用机制 | 首次揭示了cDC1来源的XCR1通过TSLP通路介导臭氧诱导的中性粒细胞气道炎症 | 研究主要基于小鼠模型,人类相关性尚需验证;部分基因表达机制仍需进一步阐明 | 阐明TSLP在臭氧诱导的气道炎症中的分子机制 | BALB/c小鼠、TSLP受体缺陷小鼠、C57BL/6J小鼠 | 免疫学 | 气道炎症 | 单细胞RNA测序, 细胞因子分析 | NA | 基因表达数据, 细胞计数数据 | 多种基因型小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
278 | 2025-10-05 |
Neutrophil-enriched gene signature correlates with teplizumab therapy resistance in different stages of type 1 diabetes
2025-Sep-30, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI176403
PMID:41026533
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析揭示了与teplizumab治疗反应相关的免疫基因特征,发现中性粒细胞富集特征与治疗抵抗相关 | 首次在1型糖尿病不同阶段中鉴定出与teplizumab治疗抵抗相关的中性粒细胞富集基因特征,并开发了26基因血液标志物预测模型 | 研究样本量有限,需要在更大队列中验证预测模型的普适性 | 探索teplizumab在1型糖尿病治疗中反应异质性的免疫学机制 | 非肥胖糖尿病(NOD)小鼠和1型糖尿病患者的血液及胰腺样本 | 生物信息学 | 1型糖尿病 | 单细胞转录组测序,弹性网络逻辑回归模型 | 弹性网络逻辑回归 | 单细胞RNA测序数据,全血测序数据 | NOD小鼠配对外周血和胰腺样本,人类TN10(阶段2)和AbATE(阶段3)队列 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
279 | 2025-10-05 |
Mechanisms of immune escape and extramedullary tropism in leukemia cutis
2025-Sep-30, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025029121
PMID:41026928
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研究论文 | 本研究通过转录组分析揭示了白血病皮肤浸润的免疫逃逸机制和髓外趋向性特征 | 首次系统比较了髓外急性髓系白血病与骨髓复发白血病的免疫微环境差异,发现T细胞耗竭特征和HLA II类分子下调等免疫逃逸机制 | 样本量较小(10例患者,23份活检),仅针对皮肤和皮下组织的髓外疾病 | 探究急性髓系白血病髓外趋向性的机制和免疫微环境特征 | 10例孤立性髓外疾病患者的23份皮肤和皮下组织活检样本 | 数字病理学 | 白血病 | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | 转录组数据 | 10例患者的23份活检样本,另包括7例骨髓复发对照 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
280 | 2025-10-05 |
Impaired immune metabolism in COPD driven by dysfunction of CXCL16 + alveolar macrophages: multivariate causal evidence
2025-Sep-30, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s00335-025-10163-7
PMID:41028288
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研究论文 | 本研究通过多组学方法发现CXCL16+肺泡巨噬细胞功能障碍是驱动COPD免疫代谢异常的关键因果机制 | 首次通过孟德尔随机化分析确定CXCL16在肺泡巨噬细胞中的下调与COPD风险存在因果关联,并揭示其通过破坏免疫代谢稳态驱动疾病进展 | 研究样本量相对有限,且主要基于欧洲和东亚人群,需要在更广泛人群中验证 | 识别COPD中肺泡巨噬细胞功能障碍的关键分子驱动因素 | 人类肺组织样本和肺泡巨噬细胞 | 生物信息学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 孟德尔随机化分析, 细胞间通讯分析 | 孟德尔随机化模型 | 基因表达数据 | 1,283个肺泡巨噬细胞特异性基因 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |