单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
261	2025-06-06	JARID1D-dependent androgen receptor and JunD signaling activation of osteoclast differentiation inhibits prostate cancer bone metastasis through demethylating H3K4 2025, Theranostics IF:12.4Q1 DOI:10.7150/thno.104135 PMID:39816691	research paper	该研究揭示了JARID1D通过去甲基化H3K4调控雄激素受体和JunD信号通路，抑制前列腺癌骨转移的机制	首次发现JARID1D通过H3K4me3去甲基化活性动态调控AR表达，并揭示其通过MAOA-RANKL通路影响破骨细胞分化的新机制	研究主要基于小鼠模型，尚未在人体临床试验中验证	探究前列腺癌骨转移的表观遗传调控机制	前列腺癌细胞和骨转移过程	肿瘤生物学	前列腺癌	ChIP, 免疫荧光, western blotting, 单细胞测序	小鼠模型	分子生物学数据	NA
262	2025-06-06	Study on DNA Damage Gene in Spermatogonial Stem Cells from Idiopathic Nonobstructive Azoospermia: A Bioinformatics Investigation Based on scRNA-seq Data 2025, Cytogenetic and genome research IF:1.7Q3 DOI:10.1159/000545275 PMID:40101697	研究论文	基于scRNA-seq数据，研究特发性非梗阻性无精子症中精原干细胞DNA损伤基因的生物信息学分析	揭示了睾丸微环境和DNA损伤在调控人类精原干细胞中的可预测机制，并提出了男性不育的潜在治疗靶点	需要进一步研究以确认预测的潜在机制、通路和治疗靶点	探究DNA损伤与男性不育之间的关系，特别是精原干细胞的基因组稳定性机制	特发性非梗阻性无精子症（NOA）和正常睾丸的精原干细胞	生物信息学	男性不育	scRNA-seq, WGCNA分析, LASSO回归, MNC计算算法	NA	单细胞RNA测序数据	特发性非梗阻性无精子症和正常睾丸的scRNA-seq数据集
263	2025-06-06	Bulk and single-cell RNA-sequencing analyses revealed potential key genes and the role of CCL19/CCL21-CCR7 axis in hidradenitis suppurativa 2025, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0322565 PMID:40455785	研究论文	通过批量RNA测序和单细胞RNA测序分析，揭示了化脓性汗腺炎(HS)中潜在的关键基因及CCL19/CCL21-CCR7轴的作用	整合三种机器学习方法并验证独立数据集，成功鉴定出AKR1B10、IGFL2、WNK2、SLAMF7和CCR7作为HS治疗的潜在枢纽基因和治疗靶点	NA	识别HS病变和周围血中的关键基因表达模式、枢纽基因，并分析CCL19/CCL21-CCR7轴的潜在作用	化脓性汗腺炎(HS)病变和周围血	生物信息学	化脓性汗腺炎	批量RNA测序, 单细胞RNA测序	机器学习	RNA测序数据	NA
264	2025-06-06	Targeting myeloid cells in pancreatic ductal adenocarcinoma: from primary tumors to liver metastasis 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1555036 PMID:40458409	综述	本文探讨了胰腺导管腺癌（PDAC）中原发肿瘤和肝转移中髓系细胞的靶向治疗策略	重点分析了PDAC不同阶段（原发肿瘤、转移前微环境和转移部位）的免疫抑制机制，并探讨了靶向髓系细胞的创新治疗策略	临床数据主要来自晚期疾病患者，与临床前研究主要关注原发肿瘤的情况存在差异	研究PDAC中髓系细胞在肿瘤微环境中的作用及靶向治疗策略	胰腺导管腺癌（PDAC）的原发肿瘤和肝转移	肿瘤免疫学	胰腺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组学	NA	NA	NA
265	2025-06-06	CX3CR1+ Monocytes/Macrophages Promote Regional Immune Injury in Mesangial Proliferative Glomerulonephritis through Crosstalk with Activated Mesangial Cells 2025, Research (Washington, D.C.) DOI:10.34133/research.0716 PMID:40458609	研究论文	本研究探讨了CX3CR1+单核细胞/巨噬细胞通过与激活的系膜细胞相互作用促进系膜增生性肾小球肾炎（MsPGN）区域免疫损伤的机制	揭示了CX3CL1-CX3CR1轴作为MsPGN治疗新靶点的证据，并验证了CX3CL1单克隆抗体quetmolimab的治疗效果	研究主要基于动物模型和临床标本，尚未进行大规模临床试验	探究MsPGN区域免疫损伤的机制并寻找潜在治疗靶点	系膜增生性肾小球肾炎（MsPGN）患者和动物模型	免疫学	肾小球肾炎	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、细胞通讯分析（cellchat analysis）、RNA-seq、Luminex多重免疫分析	动物模型	基因表达数据、蛋白质数据	临床标本和MsPGN动物模型
266	2025-06-06	CD151 Promotes Cancer Progression in Triple-Negative Breast Cancer by Inducing EMT through the MAPK Signaling Pathway 2025, Breast cancer (Dove Medical Press) DOI:10.2147/BCTT.S518760 PMID:40458675	研究论文	本研究探讨了CD151在三阴性乳腺癌（TNBC）中通过MAPK信号通路诱导上皮间质转化（EMT）从而促进癌症进展的机制	揭示了CD151通过与整合素α3β1结合激活MAPK信号通路进而诱导EMT的新机制	研究主要基于体外实验和临床样本分析，缺乏体内动物模型的验证	阐明CD151在TNBC中的促肿瘤作用及其分子机制	TNBC临床样本和细胞系	肿瘤生物学	乳腺癌	免疫组织化学、Western blotting、RNA干扰、单细胞RNA测序、免疫共沉淀	NA	蛋白质表达数据、基因表达数据	TNBC临床样本和细胞系（具体数量未明确说明）
267	2025-06-06	Cellular Heterogeneity and IL-17 Pathway Dynamics Reveal Insights into the Transition from Ulcerative Colitis to Colorectal Cancer Through scRNA-Seq Analysis 2025, Journal of inflammation research IF:4.2Q2 DOI:10.2147/JIR.S505313 PMID:40458692	research paper	通过单细胞RNA测序分析揭示了从溃疡性结肠炎到结直肠癌转变过程中的细胞异质性和IL-17通路动态	揭示了IL-17信号通路、Treg细胞扩增和C-MYC激活在疾病进展中的潜在作用	样本量较小，仅包括一名患者的组织样本	研究溃疡性结肠炎（UC）向结直肠癌（CACRC）转变过程中的分子和细胞变化	UC和CACRC患者的组织样本	digital pathology	colorectal cancer	scRNA-seq	NA	RNA-seq数据	一名患者的正常结肠、UC病变组织和CACRC组织样本
268	2025-06-06	[Donor T cell exhaustion and immune tolerance after allogeneic hematopoietic cell transplantation] 2025, [Rinsho ketsueki] The Japanese journal of clinical hematology DOI:10.11406/rinketsu.66.339 PMID:40467463	研究论文	本文探讨了同种异体造血细胞移植后供体T细胞耗竭与免疫耐受的机制	通过单细胞RNA测序发现钙调磷酸酶抑制剂（CNIs）抑制供体T细胞耗竭，同时诱导效应样耗竭T细胞，这些细胞在慢性GVHD发展中起关键作用	目前主要基于小鼠HCT模型，患者样本数据仍在积累和分析中	研究同种异体造血细胞移植后慢性GVHD的预防机制	供体T细胞	免疫学	血液系统恶性肿瘤	单细胞RNA测序	小鼠HCT模型	RNA测序数据	小鼠模型数据，患者样本数据正在积累
269	2025-06-06	Single-cell transcriptomics reveals aberrant skin-resident cell populations and identifies fibroblasts as a determinant in rosacea 2024-10-09, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-52946-7 PMID:39384741	research paper	该研究通过单细胞转录组学揭示了酒渣鼻患者面部皮肤中异常的细胞群，并发现成纤维细胞在酒渣鼻发展中起关键作用	首次构建了酒渣鼻患者面部皮肤的单细胞图谱，并鉴定出成纤维细胞作为酒渣鼻发展的关键决定因素	研究样本仅来自女性患者，可能限制了结果的普适性	探究酒渣鼻的细胞和分子机制	酒渣鼻患者和健康个体的面部皮肤细胞	digital pathology	rosacea	single-cell transcriptomics	NA	transcriptomic data	女性酒渣鼻患者和健康个体的面部皮肤样本
270	2025-06-06	Multiomic single-cell sequencing defines tissue-specific responses in Stevens-Johnson syndrome and toxic epidermal necrolysis 2024-10-08, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-52990-3 PMID:39379371	研究论文	通过单细胞多组学测序技术研究Stevens-Johnson综合征和中毒性表皮坏死松解症（SJS/TEN）的组织特异性反应	首次使用单细胞转录组、表面蛋白质组和T细胞受体（TCR）测序技术对SJS/TEN患者的未受影响皮肤、受影响皮肤和水疱液进行综合分析，揭示了HLA I类限制性CD8 T细胞的免疫病理机制	样本量较小（15名患者），且为罕见疾病，可能限制结果的普遍性	揭示SJS/TEN的细胞免疫病理机制并识别潜在的治疗靶点	15名SJS/TEN患者的未受影响皮肤、受影响皮肤和水疱液	单细胞测序	Stevens-Johnson综合征和中毒性表皮坏死松解症	单细胞转录组测序、表面蛋白质组测序、T细胞受体（TCR）测序	NA	单细胞多组学数据	15名SJS/TEN患者的109,888个细胞
271	2025-06-06	Single-cell RNA sequencing reveals the pro-inflammatory roles of liver-resident Th1-like cells in primary biliary cholangitis 2024-10-07, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-53104-9 PMID:39375367	研究论文	利用单细胞RNA测序技术揭示原发性胆汁性胆管炎（PBC）中肝脏驻留Th1样细胞的促炎作用	首次在PBC患者和小鼠PBC模型中鉴定出具有JAK-STAT激活的肝脏驻留Th1样细胞群，并通过阻断JAK-STAT通路减轻肝脏炎症	传统检测方法的局限性导致PBC的局部肝脏免疫发病机制尚未完全阐明	揭示PBC的免疫细胞景观和分子机制	PBC患者和小鼠PBC模型的肝脏细胞	单细胞转录组学	原发性胆汁性胆管炎	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	PBC患者和小鼠PBC模型的肝脏样本
272	2025-06-06	Distinctive CD39+CD9+ lung interstitial macrophages suppress IL-23/Th17-mediated neutrophilic asthma by inhibiting NETosis 2024-10-04, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-53038-2 PMID:39366998	研究论文	本文发现了一类独特的CD39+CD9+肺间质巨噬细胞，能够通过抑制NETosis来抑制IL-23/Th17介导的中性粒细胞性哮喘	首次揭示了CD39+CD9+间质巨噬细胞通过CD9依赖的附着和CD39依赖的ATP清除机制抑制NETosis和Th17细胞激活	研究主要基于小鼠模型，人类患者数据仅作为验证	探索中性粒细胞性哮喘的免疫调节机制	CD39+CD9+肺间质巨噬细胞和中性粒细胞	免疫学	哮喘	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	小鼠模型和哮喘患者样本
273	2025-06-06	Oncogenic Calreticulin Induces Immune Escape by Stimulating TGFβ Expression and Regulatory T-cell Expansion in the Bone Marrow Microenvironment 2024-Sep-16, Cancer research IF:12.5Q1 DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-3553 PMID:38885318	研究论文	该研究揭示了致癌性钙网蛋白（CALRdel52）通过刺激TGFβ表达和调节性T细胞扩增在骨髓微环境中诱导免疫逃逸的机制	发现CALRdel52通过ERK/Sp1/TGFβ1轴介导免疫抑制，并证明靶向该轴可增强T细胞活性和糖酵解能力	研究主要基于小鼠模型和体外实验，临床转化效果需进一步验证	探索致癌性CALR突变在骨髓增殖性肿瘤（MPN）中介导免疫逃逸的机制	CALRdel52突变、骨髓微环境、TGFβ1、调节性T细胞（Treg）	肿瘤免疫学	骨髓增殖性肿瘤	单细胞RNA测序	小鼠MPN模型	基因表达数据	四个独立患者队列的骨髓样本
274	2024-09-04	Hydatidiform mole identification using non-invasive single-cell sequencing of fetal circulating extravillous trophoblasts isolated from maternal blood 2024-09, Ultrasound in obstetrics & gynecology : the official journal of the International Society of Ultrasound in Obstetrics and Gynecology IF:6.1Q1 DOI:10.1002/uog.27615 PMID:38354218	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
275	2025-06-06	CYBB-Mediated Ferroptosis Associated with Immunosuppression in Mycobacterium leprae-Infected Monocyte-Derived Macrophages 2024-04, The Journal of investigative dermatology IF:5.7Q1 DOI:10.1016/j.jid.2023.10.012 PMID:37925067	研究论文	该研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了麻风分枝杆菌感染的单核细胞衍生巨噬细胞中CYBB介导的铁死亡与免疫抑制之间的关联	首次发现CYBB是促进麻风分枝杆菌感染巨噬细胞M2极化和铁死亡的关键分子，揭示了病原体通过诱导铁死亡逃避免疫的新机制	研究样本量较小（仅4名健康个体），且为体外实验，需进一步体内验证	探究麻风分枝杆菌感染巨噬细胞的极化机制及其与铁死亡的关系	人类单核细胞衍生巨噬细胞和麻风分枝杆菌	免疫学	麻风病	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	4名健康个体的单核细胞衍生巨噬细胞
276	2025-06-06	Spatial transcriptomics reveal neuron-astrocyte synergy in long-term memory 2024-Mar, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/s41586-023-07011-6 PMID:38326616	研究论文	本研究利用空间和单细胞转录组学揭示了基底外侧杏仁核在长期记忆形成中的细胞和分子结构	发现了神经元和星形胶质细胞亚群中记忆特异性的转录特征，并揭示了神经元与星形胶质细胞的相互作用对长期记忆编码的必要性	NA	阐明基底外侧杏仁核在长期记忆形成中的作用机制	基底外侧杏仁核中的神经元和星形胶质细胞	神经科学	NA	空间转录组学、单细胞RNA测序	NA	转录组数据	NA
277	2025-06-06	Multiomic single-cell sequencing defines tissue-specific responses in Stevens-Johnson Syndrome and Toxic epidermal necrolysis 2024-Feb-18, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2023.11.26.568771 PMID:38405793	研究论文	本研究通过单细胞多组学测序技术，定义了Stevens-Johnson综合征和中毒性表皮坏死松解症（SJS/TEN）在组织特异性中的反应	首次使用单细胞转录组、表面蛋白质组和TCR测序技术，全面评估SJS/TEN的细胞免疫病理机制，并发现SJS/TEN水疱液是驱动疾病病理的效应性CD8+ T细胞的丰富来源	样本量较小（17名患者），且仅针对SJS/TEN患者进行研究	研究SJS/TEN的细胞免疫病理机制	17名SJS/TEN患者的未受影响皮肤、受影响皮肤和水疱液	生物医学	Stevens-Johnson综合征和中毒性表皮坏死松解症	单细胞转录组测序、表面蛋白质组测序、TCR测序	NA	单细胞多组学数据	17名SJS/TEN患者的119,784个细胞
278	2025-06-06	Spatial analyses: Focusing on immune-stromal interactions to understand immunity in the tissue context 2024-02, Seminars in arthritis and rheumatism IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.semarthrit.2023.152319 PMID:38040516	研究论文	本文通过空间分析方法探讨免疫-基质相互作用，以理解组织环境中的免疫功能	结合多重免疫荧光组织学和机器学习方法识别罕见免疫细胞群，并发现其优先定位于纤维血管微环境	是否类似机制适用于其他纤维化相关疾病（如自身免疫性疾病）尚待进一步研究	理解免疫细胞在组织环境中的功能及其与微环境的相互作用	免疫细胞及其微环境	数字病理学	COVID-19诱导的肺纤维化	多重免疫荧光组织学、空间转录组学	机器学习	图像、转录组数据	多种人类组织
279	2025-06-06	A New Method for Constructing Macrophage-Associated Predictors of Treatment Efficacy Based on Single-Cell Sequencing Analysis 2024 Feb-Mar 01, Journal of immunotherapy (Hagerstown, Md. : 1997) DOI:10.1097/CJI.0000000000000497 PMID:37982646	研究论文	提出了一种基于单细胞测序分析构建巨噬细胞相关治疗疗效预测因子的新方法	开发了一种新的TAMs风险评分(TRS)模型，用于预测结直肠癌患者的预后及对免疫治疗和化疗的反应	研究依赖于公共数据库数据，缺乏独立验证队列	开发结直肠癌预后预测模型并评估其对治疗的预测价值	结直肠癌患者及其肿瘤微环境中的免疫细胞	数字病理学	结直肠癌	单细胞测序分析	Cox回归模型	基因表达数据	来自Gene Expression Omnibus和The Cancer Genome Atlas数据库的结直肠癌患者样本
280	2025-06-06	Targeting tumor cell-to-macrophage communication by blocking Vtn-C1qbp interaction inhibits tumor progression via enhancing macrophage phagocytosis 2024, Theranostics IF:12.4Q1 DOI:10.7150/thno.94537 PMID:38773982	research paper	该研究通过CRISPR筛选发现Vtn-C1qbp轴作为新的抗吞噬信号，并探索了其在肿瘤治疗中的潜在应用	揭示了Vtn-C1qbp轴作为新的抗吞噬信号，为肿瘤免疫治疗提供了新的分子靶点	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证	探索肿瘤细胞与巨噬细胞之间的通讯机制，并寻找新的免疫治疗靶点	肿瘤细胞和肿瘤相关巨噬细胞	肿瘤免疫学	乳腺癌	CRISPR筛选、流式细胞术、RNA测序、免疫沉淀、质谱分析、免疫荧光	小鼠肿瘤模型	基因表达数据、单细胞测序数据	NA