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当前共找到 39345 篇文献，本页显示第 261 - 280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2026-05-09 |
Spatial multi-omics identifies a NOTCH3-mediated capillary-mCAF crosstalk driving immune exclusion in hepatocellular carcinoma
2026-Apr, iMeta
IF:23.7Q1
DOI:10.1002/imt2.70117
PMID:42099451
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研究论文 | 通过空间多组学数据分析，发现NOTCH3介导的毛细血管-mCAF相互作用导致肝细胞癌免疫排斥 | 首次利用空间多组学结合泛癌单细胞测序数据，揭示NOTCH3信号通路在肝细胞癌中通过毛细血管与基质产生型癌相关成纤维细胞（mCAF）的相互作用，驱动免疫排斥微环境形成 | NA | 阐明肝细胞癌中纤维化介导的免疫排斥机制，探索NOTCH信号通路在癌相关成纤维细胞极化中的作用 | 肝细胞癌组织样本及小鼠模型 | 机器学习 | 肝细胞癌 | 空间多组学、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 262 | 2026-05-09 |
Single-cell transcriptomics reveals cellular heterogeneity and phenotypic transitions of smooth muscle cells in aortic dissection
2026-Apr, iMeta
IF:23.7Q1
DOI:10.1002/imt2.70124
PMID:42099453
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 263 | 2026-05-09 |
IGSF9 drives malignant transformation and predicts early-stage lung adenocarcinoma in integrated transcriptomic analyses
2026-Mar-29, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04836-1
PMID:41904745
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研究论文 | 通过整合转录组分析，发现IGSF9驱动恶性转化并可预测早期肺腺癌 | 首次发现IGSF9作为早期肺腺癌的诊断生物标志物，并揭示其在恶性转化中的多重作用，包括免疫逃逸、肿瘤细胞迁移和侵袭以及干细胞样AT2亚群向恶性状态的转化 | 未明确阐述研究样本数量、平台具体配置等细节，可能需要在更大规模队列中验证 | 阐明早期肺腺癌的分子机制并识别有效的诊断生物标志物 | 早期肺腺癌患者样本及肿瘤微环境中的肺泡细胞 | 机器学习和单细胞转录组学 | 肺腺癌 | scRNA-seq,机器学习 | 随机森林和LASSO | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 264 | 2026-03-28 |
Preterm birth skews the developmental trajectory of myeloid-derived suppressor cells in the first 48 hours of life: single-cell transcriptomics and inferred intercellular communication
2026-Mar-27, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-026-01459-8
PMID:41888646
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 265 | 2026-05-09 |
Analysis and validation of mast cells and enriched genes in colorectal cancer with liver metastasis by multi-omics data
2026-Mar-27, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04916-2
PMID:41894110
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研究论文 | 通过多组学数据分析和验证结直肠癌肝转移中的肥大细胞及其富集基因的作用 | 首次结合批量测序和单细胞RNA测序数据，系统分析肥大细胞在结直肠癌肝转移中的比例变化，并构建基于三个富集基因（APOC1、SPP1、CLU）的预测模型 | 未明确提及样本来源或外部验证的局限性，可能缺少对不同亚型肥大细胞的深入功能验证 | 确定肥大细胞及富集基因在结直肠癌肝转移中的作用 | 结直肠癌患者的原发肿瘤和肝转移组织样本 | 数字病理学 | 结直肠癌、肝转移 | 批量测序、单细胞RNA测序、免疫组化 | 预测模型（基于基因表达） | 基因表达数据、组织样本图像 | 四个批量测序数据集共223个样本，一个单细胞RNA测序数据集，以及临床样本 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 266 | 2026-05-09 |
Transcriptional mechanisms of sex-biased gene expression and their connections to disease-associated variation
2026-Mar-23, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddag019
PMID:41934611
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研究论文 | 利用单细胞RNA-seq分析480个淋巴母细胞系，发现1200个性别偏向表达基因及其与疾病关联的转录调控机制 | 首次大规模系统揭示性别偏向表达的转录调控机制，发现4个X染色体剂量调控的转录因子（FOSL1、ZNF730、ZFX、ZNF726）贡献了79%的性别偏向表达，并鉴定了2390个性别偏向eQTL及其在多种疾病中的富集 | 独立数据集的验证结果较为有限，且主要基于淋巴母细胞系数据，组织特异性验证仅部分覆盖 | 探究人类性别差异表达的转录调控机制及其与疾病遗传变异的关联 | 480个人类淋巴母细胞系（LCLs）以及来自GTEx项目的多种组织样本 | 机器学习 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA-seq | 线性模型 | 转录组 | 480个淋巴母细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 267 | 2026-03-23 |
crocketa: an automated Snakemake framework for integrated single-cell transcriptome and immune-repertoire analysis
2026-Mar-21, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-026-12767-y
PMID:41864892
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 268 | 2026-05-09 |
Spatial transcriptomics uncovers vasculature-centered cellular interactions driving Japanese encephalitis progression in a mouse model
2026-Mar-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70047-5
PMID:41844605
|
研究论文 | 利用空间转录组技术构建日本脑炎发病机制的综合时空图谱 | 首次同时原位捕获宿主和病毒转录组，构建日本脑炎发病的综合时空图谱，并揭示Ly6c2单核细胞和Ackr1内皮细胞在病毒传播和神经炎症中的关键作用 | 仅在小鼠模型中验证，需要进一步在人类样本中验证；未详细讨论其他细胞类型和信号的潜在贡献 | 研究日本脑炎病毒（JEV）感染引起的神经病理过程中的细胞互作机制 | 日本脑炎病毒感染的小鼠大脑 | 数字病理学 | 日本脑炎 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 雌性BALB/c小鼠，具体样本数量未提及 | 华大基因 | 空间转录组学 | Stereo-seq | Stereo-seq空间转录组技术 |
| 269 | 2026-05-09 |
A blueprint for local and distal invasion programs in glioblastoma
2026-Mar-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70470-8
PMID:41844611
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序、空间转录组学和多重复用成像技术，探讨胶质母细胞瘤的局部和远端侵袭程序 | 首次将单细胞RNA测序、空间转录组学和多重复用成像结合，系统解析胶质母细胞瘤的远端和局部侵袭潜力及其转录程序 | 研究主要基于异种移植小鼠模型，可能无法完全模拟人类胶质母细胞瘤的微环境 | 阐明胶质母细胞瘤侵袭的分子机制，区分侵袭潜力与侵袭过程相关的转录特征 | 20种患者来源的胶质瘤球体模型及小鼠原位异种移植模型 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、多重复用成像 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据、成像数据 | 20种患者来源的胶质瘤球体模型 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 270 | 2026-05-09 |
Multimodal imaging reveals a lysosomal drug reservoir that drives heterogeneous distribution of PARP inhibitors
2026-Mar-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70558-1
PMID:41844641
|
研究论文 | 使用多模态成像揭示溶酶体药物储库导致PARP抑制剂在肿瘤内呈异质性分布 | 首次通过患者来源的外植体多模态成像管线，在单细胞水平上显示PARP抑制剂积累的高度异质性，并发现溶酶体作为弱碱性PARP抑制剂的药物储库影响核内药物浓度和疗效 | 未提及具体局限性 | 研究肿瘤异质性对药物分布和疗效的影响，特别是PARP抑制剂在高级别浆液性卵巢癌中的细胞内在积累差异 | 患者来源的外植体、高级别浆液性卵巢癌肿瘤组织 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 多模态成像、空间转录组学 | NA | 图像、转录组数据 | 多个患者来源的外植体样本（具体数量未明确） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 271 | 2026-05-09 |
Local antibody feedback enforces a checkpoint on affinity maturation in the germinal center and promotes epitope spreading
2026-Mar-10, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2026.01.011
PMID:41690309
|
研究论文 | 研究局部抗体反馈如何通过种系中心调节亲和力成熟并促进表位扩散 | 首次揭示局部表位特异性竞争通过抗体反馈回路直接影响种系中心反应，低亲和力B细胞在特定条件下比高亲和力B细胞更持久，并促进免疫反应向替代表位扩散 | 该研究基于小鼠模型，可能无法完全代表人类免疫系统的复杂性，且未深入探讨长期免疫记忆形成的影响 | 探究局部抗体反馈如何在种系中心中调控亲和力成熟的检查点并影响表位扩散 | 小鼠模型及携带特定亲和力B细胞受体的B细胞 | 机器学习 | 人类免疫缺陷病毒感染 | NA | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型，具体数量未提供 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 272 | 2026-05-09 |
Deep Learning Enabled 3D Multi-Omic Analysis Reveals Molecular Signatures of Heterogeneous Response to Chemotherapy in Pancreatic Cancer
2026-Mar-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.03.709150
PMID:41867770
|
研究论文 | 通过深度学习三维多组学分析揭示胰腺癌化疗异质性反应的分子特征 | 首次开发结合深度学习的三维分析流程，利用形态学特征自动分类敏感和持续性肿瘤细胞群体，并进行后续分子表征 | NA | 识别胰腺癌对化疗耐药的新机制 | 人类胰腺癌临床样本 | 计算机视觉 | 胰腺癌 | 空间蛋白质组学，空间转录组学 | 深度学习 | 图像 | 接受新辅助化疗的人类胰腺癌样本队列 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | NA |
| 273 | 2026-05-09 |
Acute Inflammation Drives Corneal Pathological Regeneration
2026-Mar-02, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.67.3.58
PMID:41910526
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序描绘急性炎症诱导的角膜病理再生过程中的转录组和表观遗传组图谱 | 首次提供炎症角膜的时间分辨单细胞转录组和表观遗传组综合图谱，揭示细胞类型特异性基因调控元件和顺式调控染色质相互作用 | 未明确说明局限性 | 表征急性炎症诱导的角膜转录组和表观遗传组重塑 | 脂多糖或PBS处理后第5天和第10天的角膜缘-角膜组织 | 数字病理学 | 角膜炎症性疾病 | scRNA-seq, scATAC-seq, 免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞染色质可及性数据 | 未明确说明样本量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序 |
| 274 | 2026-05-09 |
Spatiotemporal transcriptomic profiling reveals upregulation of glycolysis pathway genes before overt tauopathy in the PS19 mouse model
2026-Mar, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-026-01652-z
PMID:41688738
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研究论文 | 利用空间转录组分析PS19小鼠模型在tau蛋白病变发生前的代谢变化，发现糖酵解通路基因在易感脑区早于可见病理变化出现上调 | 首次通过空间转录组学揭示CA3区域糖酵解通路基因Pgk1在可检测的tau蛋白缠结出现前即发生上调，且与缠结严重程度相关，区域特异性代谢失调为tau蛋白病变早期标志 | 研究基于小鼠模型，结果需在人类样本中验证；未深入探讨早期糖酵解上调的确切机制 | 研究tau蛋白病变与脑区特异性转录组变化的关系，特别是代谢功能障碍在疾病早期的作用 | PS19 tau P301S转基因小鼠模型的海马区和皮层区域 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | PS19小鼠模型在2、4、6个月等不同时间点的海马和皮层样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组技术用于PS19小鼠脑组织切片分析 |
| 275 | 2026-05-09 |
Deconvolving cell-type-specific gene expression profiles from bulk RNA-seq samples
2026-Mar, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014101
PMID:41886524
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研究论文 | 开发基于U-Net的深度学习算法BLUE，从bulk RNA-seq样本中解卷积出细胞类型比例和细胞类型特异性基因表达谱 | 提出U-Net架构的深度学习算法BLUE，能同时预测细胞类型比例和细胞类型特异性基因表达谱，显著优于现有解卷积算法 | NA | 整合bulk RNA-seq和scRNA-seq的优势，从bulk RNA-seq数据中推断细胞类型特异性基因表达信息 | bulk RNA-seq样本和scRNA-seq数据集 | 机器学习 | 癌症 | RNA-seq | U-Net | 基因表达数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 276 | 2026-05-09 |
IL4I1+ macrophages drive hepatocellular carcinoma progression by responding to biomechanical cues
2026-Feb-11, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2026.101782
PMID:42096911
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和空间转录组学，鉴定出IL4I1+巨噬细胞能感知肿瘤微环境中的生物力学信号并驱动肝细胞癌进展 | 首次从生物力学角度鉴定出IL4I1+巨噬细胞作为力学敏感性亚群，揭示其将力学信号转化为免疫抑制和促肿瘤信号的新机制 | 未明确IL4I1+巨噬细胞感知力学信号的具体分子机制，且仅基于临床前模型验证治疗靶点 | 探究肝细胞癌微环境中生物力学信号对巨噬细胞亚群的调控作用及其在肿瘤进展中的功能 | IL4I1+巨噬细胞在肝细胞癌肿瘤微环境中的空间分布、表型可塑性和力学响应行为 | 机器学习 | 肝癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 原子力显微镜 | NA | 基因表达数据, 空间转录数据, 力学数据 | 临床前模型包括肿瘤细胞增殖（n=3）、迁移能力（n=3）、干细胞特性（n=6）及SB505124治疗组（n=5） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium用于单细胞RNA测序，10x Visium用于空间转录组学分析 |
| 277 | 2026-05-09 |
Histotripsy-initiated immune response synergizes with chemotherapy in a neuroblastoma murine model
2026-Feb-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.30.702878
PMID:41676730
|
研究论文 | 探究组织碎化术与化疗联合治疗神经母细胞瘤小鼠模型的免疫协同效应 | 首次揭示组织碎化术通过机械性气泡云消融肿瘤后，能诱发系统性抗肿瘤免疫反应，增强化疗对转移性神经母细胞瘤的疗效，并在未靶向的远端肿瘤中也观察到生长延迟 | 该研究基于小鼠模型，其结果向人类临床转化的有效性尚需验证；未提供长期随访数据或作用机制的完整分子通路 | 研究组织碎化术诱导的肿瘤微环境变化能否改善转移性神经母细胞瘤对化疗的应答 | 雌性A/J小鼠双侧接种Neuro-2a神经母细胞瘤细胞，一侧肿瘤接受组织碎化术治疗，对侧肿瘤作为非靶向转移模型 | 生物医学 | 神经母细胞瘤 | 组织碎化术, 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 免疫组化 | NA | 基因表达数据, 细胞计数数据 | NA（未明确样本量，涉及多组小鼠） | NA | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | NA |
| 278 | 2026-05-09 |
Tumor and Immune Dynamics Following Sequential CDK4/6 and PD-1 Inhibition: Results from a Phase 2 Study in Dedifferentiated Liposarcoma
2026-Feb-01, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-25-0334
PMID:41325133
|
研究论文 | 一项第二阶段临床试验，评估CDK4/6抑制剂palbociclib和PD-1抑制剂retifanlimab联合治疗去分化脂肪肉瘤的效果，分析了肿瘤和免疫细胞的动态变化 | 首次在去分化脂肪肉瘤中系统评估CDK4/6和PD-1抑制剂的联合治疗，结合单细胞RNA测序和流式细胞术深入分析肿瘤微环境和免疫变化 | 样本量小（仅12名患者），研究因42%的免疫相关毒性而提前终止，无对照组 | 评估palbociclib和retifanlimab联合治疗去分化脂肪肉瘤的安全性和有效性，并探究肿瘤和宿主动态变化 | 晚期去分化脂肪肉瘤患者 | 数字病理学 | 去分化脂肪肉瘤 | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 基因表达数据，细胞免疫表型数据 | 12名患者接受治疗；9名患者有肿瘤活检分析（其中3名有配对样本）；10名患者有配对血液样本 | NA | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | NA |
| 279 | 2026-05-09 |
Distinct sympathetic projections to brown fat regulate thermogenesis and glucose tolerance
2026-Feb, Nature metabolism
IF:18.9Q1
DOI:10.1038/s42255-025-01429-0
PMID:41559445
|
研究论文 | 本研究揭示了星状神经节中两种不同的交感神经元亚群分别调控棕色脂肪组织的产热和葡萄糖耐受功能 | 首次通过化学遗传学和单细胞转录组学结合逆行示踪技术，识别出支配棕色脂肪组织实质和血管的不同交感神经元亚群，并证明它们分别控制产热-血流和葡萄糖代谢 | 研究仅在动物模型中进行，人类棕色脂肪组织神经支配的复杂性可能不同，且未探索长期刺激的影响 | 解析棕色脂肪组织中产热与葡萄糖代谢功能的神经调控机制 | 小鼠肩胛间棕色脂肪组织和星状神经节中的交感神经元 | 神经科学 | 代谢性疾病 | 化学遗传学、单细胞转录组学、逆行示踪技术 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型（具体样本量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 280 | 2026-05-09 |
NEXT-scASV: a Nextflow pipeline for allele-specific variant calling from single-cell RNA-seq data
2026-Jan-21, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giag042
PMID:41947412
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研究论文 | 提出NEXT-scASV，一个用于从单细胞RNA测序数据中检测等位基因特异性变异的可扩展Nextflow流程 | 自动化整个等位基因特异性变异检测流程，无需预先基因分型即可进行从头检测，具有模块化设计支持大规模并行化处理 | 未明确提及局限性 | 开发一个可重复、易部署且高效处理大规模单细胞数据的等位基因特异性变异检测流程 | 来自57个供体的135,000个外周血单核细胞的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 135,000个外周血单核细胞，来自57个供体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 5'单细胞RNA测序 |