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当前共找到 39758 篇文献，本页显示第 261 - 280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2026-05-28 |
Enhancer-driven gene regulatory networks reveal transcription factors governing T cell adaptation and differentiation in the tumor microenvironment
2025-Jul-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.04.030
PMID:40425012
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研究论文 | 通过对感染和癌症模型中T细胞受体匹配的CD8 T细胞进行配对单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序，揭示了增强子驱动的基因调控网络，阐明了在肿瘤微环境中调节T细胞适应和分化的转录因子 | 首次通过多组学分析构建增强子驱动的调控子，揭示了KLF2和BATF在终末分化的组织驻留记忆样肿瘤浸润淋巴细胞形成中的拮抗作用 | 主要基于小鼠模型，未在人类肿瘤样本中验证；TGF-β信号和CD103表达对Trm样TIL形成的必要性结论可能受限于体外实验条件 | 阐明肿瘤微环境中组织驻留记忆样CD8 T细胞分化的表观遗传和转录调控机制 | 感染和癌症模型中的CD8 T细胞（特别是肿瘤浸润淋巴细胞） | 机器学习, 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 多组学分析 | 调控子模型 | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 感染和癌症模型中T细胞受体匹配的CD8 T细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序平台 |
| 262 | 2026-05-28 |
Impaired primitive erythropoiesis and defective vascular development in Trim71-KO embryos
2025-04, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202402956
PMID:39909558
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研究论文 | 本研究揭示了Trim71基因敲除小鼠在器官发生初期出现中胚层衍生细胞严重缺陷，导致原始红细胞生成受损、卵黄囊血管发育异常及胚胎致死 | 首次发现Trim71通过NHL结构域直接抑制中胚层先锋转录因子Eomes的mRNA表达，阐明其在原肠胚阶段调控基因表达以支持器官发生的机制 | 未深入探究Trim71在特定细胞类型（如内皮祖细胞）中的非细胞自主性作用，且未能完全排除其他潜在靶基因的影响 | 阐明Trim71在胚胎发育从原肠胚到器官发生过渡期中的功能及其分子机制 | Trim71基因敲除小鼠胚胎及其衍生细胞（中胚层细胞、原始红细胞、卵黄囊血管内皮细胞） | 分子生物学与发育生物学 | 发育缺陷相关疾病 | 单细胞RNA测序、基因敲除小鼠模型、RNA免疫沉淀 | 基因敲除小鼠模型（全身性及条件性敲除） | 单细胞转录组数据、胚胎表型数据 | E7.5期Trim71全身敲除小鼠胚胎（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 263 | 2026-05-28 |
Single-cell transcriptomics reveals inter-ethnic variation in immune response to Falciparum malaria
2025-03-06, American journal of human genetics
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.ajhg.2025.01.020
PMID:39970911
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示富拉尼族与莫西族儿童对恶性疟原虫免疫应答的种族差异 | 首次从单细胞层面系统解析非洲不同种族对疟疾免疫保护的细胞和分子基础，并鉴定出种族特异性的单细胞表达数量性状位点 | 研究中未提及针对机制验证的进一步实验，单细胞数据规模可能未完全覆盖免疫系统的全部异质性 | 探究不同种族人群对恶性疟原虫免疫应答差异的分子和细胞机制 | 布基纳法索农村126名感染和未感染恶性疟原虫的富拉尼族和莫西族儿童的外周血单核细胞 | 机器学习 | 疟疾 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 126名儿童（感染和未感染的富拉尼族与莫西族）及超过7万个单细胞，涵盖30种亚型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台对PBMC进行转录组分析 |
| 264 | 2026-05-28 |
Genome-wide prediction of dominant and recessive neurodevelopmental disorder-associated genes
2025-03-06, American journal of human genetics
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.ajhg.2025.02.001
PMID:40015282
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研究论文 | 该研究开发了一种基于机器学习的计算方法（mantis-ml），利用单细胞RNA测序数据与三百种正交特征，预测与神经发育障碍相关的显性和隐性风险基因 | 首次基于单细胞RNA测序数据训练模型，并整合300种正交特征，区分单等位和双等位遗传模式预测神经发育障碍风险基因 | 仅基于计算预测，尚未进行实验验证；模型准确性受限于训练数据的质量和规模 | 加速神经发育障碍风险基因的识别，并强调考虑遗传模式的重要性 | 神经发育障碍，包括自闭症谱系障碍、发育性和癫痫性脑病、发育迟缓 | 机器学习 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序、机器学习 | 半监督机器学习模型（mantis-ml） | 单细胞RNA测序数据、基因不耐受指标、蛋白质相互作用数据等 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 265 | 2026-05-28 |
Mural cell dysfunction contributes to diastolic heart failure by promoting endothelial dysfunction and vessel remodelling
2025-02-07, Cardiovascular diabetology
IF:8.5Q1
DOI:10.1186/s12933-025-02623-w
PMID:39920783
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研究论文 | 发现壁细胞功能障碍通过促进内皮功能障碍和血管重塑导致舒张性心力衰竭 | 首次探究壁细胞在射血分数保留的心力衰竭（HFpEF）中微血管功能障碍的作用，并揭示壁细胞通过TNFα依赖旁分泌信号诱导内皮细胞生长停滞和炎症的新机制 | 未提供明确局限性，但可能包括动物模型的代表性和临床转化潜力未知 | 确定壁细胞功能障碍在HFpEF发展中的作用及其分子机制 | 糖尿病db/db小鼠模型，给予1%盐后诱导舒张功能不全的小鼠心脏组织及壁细胞 | 心血管疾病研究 | 舒张性心力衰竭（HFpEF） | 单细胞RNA测序、NicheNet分析、组织学分析 | NA | 基因表达数据、组织图像 | 小鼠模型实验，具体样本量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 266 | 2026-05-28 |
KLF2-dependent transcriptional regulation safeguards the heart against pathological hypertrophy
2025-02, Journal of molecular and cellular cardiology
IF:4.9Q2
DOI:10.1016/j.yjmcc.2024.12.010
PMID:39733990
|
研究论文 | 本研究揭示了转录因子KLF2作为心脏肥大的负调控因子，通过直接调节相关基因保护心脏免受病理性肥大的影响 | 首次证明KLF2在心肌细胞中作为心脏肥大的负调控因子，并发现辛伐他汀通过提升KLF2表达缓解心肌细胞肥大 | NA（摘要未明确说明局限性） | 探究转录因子KLF2在心肌细胞生物学中的作用及其对心脏肥大的保护机制 | 成年小鼠心脏、新生大鼠心室肌细胞、人胚胎干细胞来源的心肌细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | RNA-seq, CUT&Tag测序 | NA | RNA序列数据 | 雄性C57BL/6J小鼠（横向主动脉缩窄模型及对照组）与体外细胞模型（新生大鼠心室肌细胞、人胚胎干细胞来源的心肌细胞） | Illumina | bulk RNA-seq | Illumina NovaSeq | NovaSeq 6000平台进行RNA-seq测序 |
| 267 | 2026-05-28 |
A panoramic view of cell population dynamics in mammalian aging
2025-Jan-17, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adn3949
PMID:39607904
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研究论文 | 通过构建单细胞转录组图谱PanSci，分析了哺乳动物衰老过程中细胞种群动态变化 | 首次构建包含超过2000万个细胞、覆盖多个生命阶段、性别和基因型的综合单细胞转录组图谱，揭示3000多种细胞状态和200多种与衰老相关的细胞群，并识别免疫系统对衰老的调控作用 | 未明确说明局限性 | 阐明哺乳动物衰老过程中与细胞种群动态相关的机制 | 小鼠623个组织的细胞 | 机器学习 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 超过2000万个细胞，来自623个小鼠组织，涵盖不同生命阶段、性别和基因型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 268 | 2024-12-15 |
Cell type and dynamic state govern genetic regulation of gene expression in heterogeneous differentiating cultures
2024-Dec-11, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2024.100701
PMID:39626676
|
研究论文 | 研究探讨了在异质性分化培养物中，细胞类型和动态状态如何调控基因表达的遗传机制 | 利用异质性分化培养物系统，研究了53个人类供体的单细胞RNA测序数据，揭示了与发育和疾病相关基因的新型调控变异 | 研究主要集中在体外系统，可能无法完全反映体内复杂的调控机制 | 探讨人类遗传变异在不同细胞环境中的分子效应，以理解与疾病相关位点的机制 | 异质性分化培养物中的细胞类型和发育阶段 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 53个人类供体的900,000多个细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 269 | 2026-05-28 |
scTrends: A living review of commercial single-cell and spatial 'omic technologies
2024-Dec-11, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2024.100723
PMID:39667347
|
综述 | 对商业化单细胞和空间组学技术进行动态综述，涵盖从微流控到成像等多种方法，并讨论其在药物研发中的应用趋势 | 首次以“活综述”形式动态追踪单细胞和空间组学技术的商业化进展，系统整合微流控、组合索引、NGS和成像等多种平台方法，并特别强调新兴技术对药物机制发现的潜在扩展作用 | 文章未对具体平台性能进行量化比较，且作为动态综述可能难以完全覆盖所有最新技术细节 | 系统梳理单细胞和空间组学商业化技术的现状与趋势，为药物研发和学术研究提供资源参考 | 商业化单细胞技术（微流控、板基法、组合索引）和空间组学技术（测序和成像基方法） | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、微流控、组合索引、成像技术 | NA | 文本 | NA | 10x Genomics, Illumina, BGI, 布鲁克 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium, Illumina NovaSeq, BGI MGISEQ | 微流控单细胞平台、基于组合索引的plate-based方法、NGS空间转录组学（如10x Visium）、成像基空间转录组学（如MERFISH） |
| 270 | 2026-05-28 |
B cell heterogeneity in cancer comes of age
2024-Oct-14, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2024.09.013
PMID:39406185
|
评论 | 本文评论了三项最新研究，这些研究利用单细胞RNA测序技术描绘了肿瘤浸润B细胞亚群的泛癌图谱，为理解B细胞依赖性抗肿瘤免疫的深层机制铺平了道路 | 综合多项研究，首次定义了泛癌层面肿瘤浸润B细胞亚群的异质性，揭示了B细胞在癌症免疫中的潜在新功能 | 仅基于现有研究成果进行评述，未提供新的实验数据或验证结果 | 总结并强调近期关于B细胞异质性在癌症中作用的研究进展 | 肿瘤浸润B细胞亚群 | 机器学习和数字病理学交叉领域 | 癌症（泛癌） | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个研究中的肿瘤样本，具体数量未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 271 | 2026-05-28 |
Low protein diet protects the liver from Salmonella Typhimurium-mediated injury by modulating the mTOR/autophagy axis in macrophages
2024-09-30, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06932-w
PMID:39349819
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研究论文 | 研究低蛋白饮食对小鼠肝脏抵抗鼠伤寒沙门氏菌感染的保护作用及其机制 | 首次揭示低蛋白饮食通过调控巨噬细胞中mTOR/自噬轴来保护肝脏免受细菌感染损伤 | NA | 探究低蛋白饮食对先天免疫系统的影响及其在肝脏细菌感染中的保护机制 | 小鼠肝脏细胞及人类外周血单核细胞衍生的巨噬细胞 | NA | 感染性疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | 小鼠肝脏细胞及人外周血单核细胞衍生的巨噬细胞 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 272 | 2026-05-28 |
Full-length single-cell BCR sequencing paired with RNA sequencing reveals convergent responses to pneumococcal vaccination
2024-09-28, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-024-06823-0
PMID:39341987
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研究论文 | 提出一种从3'条形码单细胞RNA测序文库中恢复全长配对BCR可变区序列的方法，并应用于分析肺炎球菌疫苗诱导的B细胞应答 | 首次实现从广泛使用的3'条形码单细胞RNA测序文库中恢复全长配对BCR可变区序列，能够同时获取转录组和BCR信息，并揭示疫苗诱导的趋同应答 | 方法在婴儿恒河猴模型中验证，尚需在更大样本和更广泛疫苗接种场景中进一步验证 | 开发并验证从3'条形码单细胞RNA测序文库中恢复全长BCR序列的方法，以解析疫苗诱导的B细胞应答特征 | 5只婴儿恒河猴的B细胞（针对肺炎球菌血清型3荚膜多糖的糖缀合疫苗应答） | 单细胞测序、免疫学 | 肺炎球菌感染 | 单细胞RNA测序、BCR测序 | NA | 单细胞转录组数据、BCR序列数据 | 5只婴儿恒河猴 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 3'条形码单细胞RNA测序文库（具体版本未提及） |
| 273 | 2026-05-28 |
Historic obstacles and emerging opportunities in the field of developmental metabolism - lessons from Heidelberg
2024-06-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202937
PMID:38912552
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评论 | 本文总结了2023年EMBO研讨会“发育代谢：能量、物质和信息的流动”中的关键讨论，强调了现代发育生物学面临的挑战和机遇 | 提出了代谢组学、小分子传感器、单细胞RNA测序和计算建模等新技术在发育代谢领域中的应用，为探索细胞和组织特异性代谢网络、器官间代谢通信以及基因与代谢物在时空上的交互作用提供了新机会 | 本文为研讨会总结，未提供具体实验数据或验证，属于观点性文章 | 总结发育代谢领域的最新进展和未来研究方向 | 发育代谢中的代谢网络、器官间通信和基因-代谢物相互作用 | 其他 | NA | 代谢组学, 单细胞RNA测序, 计算建模 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 274 | 2026-05-28 |
A new dawn for the study of cell type evolution
2024-05-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.200884
PMID:38722217
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综述 | 探讨新技术如何促进细胞类型进化研究，强调发育同源性在识别同源细胞中的重要性，并总结单细胞转录组学在细胞类型进化研究中的最新发现和未来方向 | 结合基因编辑和单细胞基因组学等技术突破，系统分析细胞类型进化研究的新方法，并特别关注发育同源性对鉴定同源细胞的意义 | 未涉及实际实验数据或模型验证，仅基于文献综述提出观点，对同源性判断的潜在误区缺乏系统性量化分析 | 综述细胞类型进化研究的当前进展，指出关键问题和未来探索领域 | 细胞类型及其进化机制，涵盖多种研究生物体的同源细胞比较 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 275 | 2026-05-28 |
Identification of a myofibroblast differentiation program during neonatal lung development
2024-05-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202659
PMID:38602479
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研究论文 | 通过Fgf18CreER谱系追踪小鼠、单细胞RNA测序等技术，鉴定新生小鼠肺部肌成纤维细胞分化程序及其在肺泡发育中的作用 | 首次利用Fgf18CreER谱系追踪小鼠结合单细胞RNA测序，揭示新生肺间充质细胞中一个不成熟祖细胞向成熟肌成纤维细胞分化的独特程序，并发现内源性ROSA26位点可作为肌成纤维细胞成熟的敏感报告基因 | 未详细说明 | 探究肺泡发育过程中间充质细胞亚型及其分化机制 | 新生小鼠肺部间充质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, Fgf18CreER谱系追踪, 细胞分选, 原代细胞培养 | NA | 单细胞转录组数据 | 新生小鼠（具体数量未说明） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 276 | 2026-05-28 |
Semi-supervised integration of single-cell transcriptomics data
2024-01-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45240-z
PMID:38287014
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研究论文 | 提出一种名为STACAS的半监督单细胞转录组数据整合方法，利用先验细胞类型知识在批量校正中保留生物变异性 | 首次将先验细胞类型信息纳入单细胞数据的半监督批量效应校正，在开放基准测试中优于现有无监督和完全监督方法 | 对不完整或不精确的输入细胞类型标签具有一定鲁棒性，但极端情况下的性能边界未明确讨论 | 开发一种能保留生物变异性的半监督单细胞RNA-seq批量效应校正方法 | 单细胞RNA-seq数据中的批量效应和细胞类型标签 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | STACAS（基于先验细胞类型的半监督整合模型） | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 277 | 2026-05-28 |
RNA polymerase II pausing is essential during spermatogenesis for appropriate gene expression and completion of meiosis
2024-01-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45177-3
PMID:38287033
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研究论文 | 利用稳态、新生和单细胞RNA测序策略全面表征雄性生殖细胞群体的基因表达，揭示RNA聚合酶II暂停在精子发生和减数分裂中的关键作用 | 首次发现RNA聚合酶II暂停在精子分化早期建立基因活性景观的必要性，并揭示其在减数分裂中调控双链断裂形成和修复的新功能 | 未提供具体实验限制信息 | 解析雄性生殖细胞发育中基因表达的调控机制，为男性不育症治疗提供新见解 | 雄性小鼠生殖细胞群体 | 机器学习和基因组学 | 男性不育症 | RNA-seq | NA | RNA表达数据（稳态、新生和单细胞） | NA | NA | RNA-seq | NA | NA |
| 278 | 2026-05-28 |
Cebp1 and Cebpβ transcriptional axis controls eosinophilopoiesis in zebrafish
2024-01-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45029-0
PMID:38280871
|
研究论文 | 利用斑马鱼模型研究嗜酸性粒细胞的发育模式与调控机制 | 首次鉴定eslec为嗜酸性粒细胞谱系特异性标志物，建立Tg(eslec:eGFP)报告品系；通过单细胞RNA测序揭示嗜酸性粒细胞从祖细胞到成熟细胞的发育轨迹；发现Cebp1-Cebpβ转录轴调控嗜酸性粒细胞谱系决定和分化，并证明斑马鱼Cebp1是人C/EBPε的功能直系同源物 | 主要基于斑马鱼模型，结论向哺乳动物和人类的推广需进一步验证 | 解析嗜酸性粒细胞的发育模式、分布及转录调控机制 | 斑马鱼嗜酸性粒细胞谱系细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序系统 |
| 279 | 2026-05-28 |
The origin and structural evolution of de novo genes in Drosophila
2024-01-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-45028-1
PMID:38280868
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研究论文 | 本研究结合高质量全基因组比对和计算结构建模，分析了果蝇中新生基因的起源、进化及蛋白质结构变化，鉴定出555个新生基因候选。 | 首次系统性结合全基因组比对与计算结构建模，揭示果蝇亚科特异性新生基因的起源与蛋白质结构演化，并发现早期精原细胞在新生基因起源中的潜在重要角色 | 可能受限于基因组比对质量和结构预测准确性，部分候选基因的结构变化未充分捕捉 | 研究新生基因的起源、进化及蛋白质结构变化 | 果蝇（D. melanogaster）中果蝇亚科特异性新生基因 | 计算生物学, 基因组学 | NA | 全基因组比对, 计算结构建模, 祖先序列重建, 单细胞RNA-seq | 计算结构模型 | 基因组序列, 蛋白质结构数据, 单细胞转录组数据 | 果蝇属多个物种的基因组比对数据及果蝇睾丸单细胞RNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 280 | 2026-05-28 |
Trajectory inference across multiple conditions with condiments
2024-01-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-44823-0
PMID:38280860
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研究论文 | 提出condiments方法，用于跨多个条件的单细胞RNA测序数据轨迹推断与比较 | 首次提出一种统一框架，整合多条件下细胞轨迹的推断、比较及基因表达差异分析，支持大规模发育进程变化及细微基因行为改变的检测 | NA | 开发一种跨多个生物条件（如野生型与基因敲除）进行单细胞RNA测序轨迹推断与比较的方法 | 单细胞RNA测序数据中的细胞分化轨迹，特别是干细胞分化过程中的细胞状态连续体 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |