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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2026-07-03 |
CD20+FCRL4+ B Cells Activate CD8+ T Cells via MHC-I Restriction in Nasopharyngeal Carcinoma Anti-Tumor Immunity
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202514982
PMID:41504259
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序数据鉴定鼻咽癌中CD20+FCRL4+ B细胞亚群,并揭示其通过MHC-I途径激活CD8+ T细胞的抗肿瘤免疫机制 | 首次发现CD20+FCRL4+ B细胞亚群在鼻咽癌中的存在及其通过MHC-I途径激活CD8+ T细胞的新机制,并揭示了IFNγ在此过程中的关键作用及与PD-1表达和免疫治疗反应的相关性 | 未说明具体局限性 | 探索鼻咽癌中B细胞亚型及其与CD8+ T细胞的相互作用,阐明其在抗肿瘤免疫中的功能 | 鼻咽癌组织样本及CD20+FCRL4+ B细胞亚群 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | 单细胞测序,免疫组化,流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据,组织切片图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 262 | 2026-07-03 |
Sinusoidal cell-derived biomarker scores predict diagnosis and prognosis in chronic liver disease
2026-02-28, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-026-04733-y
PMID:41764477
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研究论文 | 开发了来自窦状细胞的特异性生物标志物评分,用于慢性肝病的诊断和预后评估 | 首次利用单细胞RNA测序数据建立针对肝窦内皮细胞毛细血管化、肝星状细胞激活和巨噬细胞极化的细胞特异性评分系统,可从常规活检样本中测量 | 回顾性研究设计,需要前瞻性验证 | 开发用于慢性肝病诊断和预后的肝窦细胞特异性生物标志物 | 慢性肝病患者 | 机器学习 | 慢性肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 内部队列108例,三个独立验证队列共1008例,包括2年随访数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 263 | 2026-07-03 |
Protective Role of Apelin in a Mouse Model of Post-Intensive Care Syndrome
2026-02-01, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2025-0028OC
PMID:40920972
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研究论文 | 本研究探讨了Apelin在危重症后综合征小鼠模型中的保护作用,发现Apelin-APJ信号损伤通过破坏器官间稳态参与PICS发病机制 | 首次揭示Apelin-APJ信号通路在PICS发病中的关键作用,并证明肌肉特异性Apelin过表达可减轻PICS样症状 | 需要进一步研究阐明Apelin在不同组织中的具体作用机制 | 探索危重症后综合征的分子机制及潜在治疗靶点 | 危重症后综合征小鼠模型和ICU获得性衰弱的ARDS/COVID-19患者 | NA | 危重症后综合征, 急性呼吸窘迫综合征, COVID-19 | 单细胞RNA测序, 转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型;22例ICU获得性衰弱患者的外周血单个核细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 脑组织单细胞RNA测序 |
| 264 | 2026-07-03 |
Proteome-Wide Mendelian Randomization Implicates Shared Necroptosis-Ferroptosis Effectors in Causal Pathways of Multiple Sclerosis Susceptibility
2026-02, Annals of the New York Academy of Sciences
IF:4.1Q1
DOI:10.1111/nyas.70162
PMID:41387240
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研究论文 | 本研究通过蛋白质组范围的孟德尔随机化,鉴定出铁死亡和坏死性凋亡通路中的关键效应蛋白(IFNA4、TNFAIP3等)在多发性硬化症易感性中的因果作用,并揭示了上游免疫调节因子介导的完整因果通路 | 首次通过蛋白质组孟德尔随机化方法在多发性硬化症中建立铁死亡-坏死性凋亡通路与疾病易感性的因果关系,并验证了完整的免疫介导调控通路 | 因果推断基于遗传工具变量,可能存在水平多效性;转录组验证仅来自公开数据,缺乏独立队列验证 | 探究铁死亡/坏死性凋亡通路及其上游调控因子与多发性硬化症易感性之间的因果关系 | 多发性硬化症 | 机器学习 | 神经系统疾病 | 孟德尔随机化,RNA-seq,单细胞RNA-seq | NA | 遗传数据,转录组数据 | 蛋白质组范围孟德尔随机化分析(全基因组关联研究数据),转录组验证(批量RNA-seq和单细胞RNA-seq数据) | NA | 批量RNA-seq,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 265 | 2026-07-03 |
Spatial transcriptomics uncovers hybrid, proinflammatory, and profibrotic cellular niches in pulmonary granuloma of patients with chronic sarcoidosis
2026-02-01, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1093/ajrccm/aamaf089
PMID:41738160
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研究论文 | 利用空间转录组学揭示慢性结节病患者肺部肉芽肿中的混合性、促炎性和促纤维化细胞微环境 | 首次通过空间转录组学在慢性结节病肺部肉芽肿中识别出中心巨噬细胞微环境同时表达促炎和促纤维化基因,并揭示其与周围成纤维细胞的配体-受体互作 | 未提及局限性 | 阐明慢性结节病肺部肉芽肿内的细胞微环境及其分子特征 | 9例结节病患者的含肉芽肿肺组织样本 | 数字病理学 | 慢性结节病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据,组织图像 | 9个肺组织样本,含173个肉芽肿和30,587个基因表达点 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台 |
| 266 | 2026-07-03 |
MicroRNAs as potential prognostic biomarkers in acute lymphoblastic leukemia: a systematic review, meta-analysis, and bioinformatics study
2026-Jan-29, Systematic reviews
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s13643-026-03083-3
PMID:41612480
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系统综述与荟萃分析 | 通过系统综述、荟萃分析和生物信息学方法评估微小RNAs作为急性淋巴细胞白血病预后生物标志物的潜力 | 结合ceRNA网络和单细胞RNA测序分析验证的靶基因,扩展了miRNAs作为ALL预后标志物的研究 | 需要大型多中心试验确认,且miRNAs作用具有情境依赖性 | 评估微小RNAs作为急性淋巴细胞白血病预后生物标志物的价值 | ALL患者中miRNA表达与生存期的关联 | 生物信息学 | 急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序, ceRNA网络分析 | NA | 基因表达数据 | 22项研究,共计1974例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 267 | 2026-07-03 |
Exosome RAB10 inhibits JAK1/STAT1 to hinder macrophage M1 polarization and promote tumor immune escape
2026-Jan-26, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-026-02681-x
PMID:41588435
|
研究论文 | 研究乳腺肿瘤细胞通过外泌体传递RAB10抑制JAK1/STAT1通路,阻碍巨噬细胞M1极化并促进肿瘤免疫逃逸的机制 | 首次揭示外泌体RAB10通过结合干扰素受体IFNAR1抑制JAK1/STAT1磷酸化,调控巨噬细胞极化方向,并发现联合靶向RAB10和PD-L1可产生协同抑瘤效应 | 未详细说明RAB10在耐药乳腺癌细胞中上调的具体机制,以及外泌体RAB10对其他免疫细胞的影响 | 探讨外泌体介导的肿瘤-巨噬细胞互作机制,特别是RAB10在巨噬细胞极化及肿瘤免疫逃逸中的作用 | 乳腺癌细胞(耐药与非耐药)、巨噬细胞、CD8⁺ T细胞、小鼠肿瘤模型 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 268 | 2026-07-03 |
scSuperAnnotator: a platform for benchmarking comparison and visualizing automated cellular annotation methods for scRNA-seq data
2026-Jan-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1470
PMID:41495899
|
研究论文 | 开发了一个整合多种自动化细胞注释方法的单细胞RNA-seq数据在线平台scSuperAnnotator | 首个集成了基于标记基因和基于参考的多种细胞类型识别方法的在线平台,提供一键式注释和分析功能,无需编程知识 | 未提及具体局限性 | 为解决单细胞RNA-seq数据中自动化细胞类型注释方法缺乏集成平台的问题 | 单细胞RNA-seq数据中的细胞类型 | 机器学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 269 | 2026-07-03 |
A Transcriptional Map of Human Tonsil Architecture: Beyond the Sum of (Single Cell) Parts
2026-01, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.70121
PMID:41518352
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研究论文 | 利用成像型空间转录组学绘制人类扁桃体结构转录图谱,超越单细胞RNA-seq的细胞组成分析 | 建立了一个强调空间组织、细胞相互作用和功能的通用分析流程,揭示了扁桃体中52个细胞亚群的空间分布和信号通路活性 | 数据仍面临分析挑战且缺乏标准化,未明确提及 | 展示成像型空间转录组学在研究组织微环境和免疫反应中的优势,并提供空间免疫学的分析框架 | 人类扁桃体组织中的200万个细胞和52个细胞亚群 | 计算病理学 | 淋巴瘤 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组图像 | 人类扁桃体组织样本 | NA | 空间转录组学 | 成像型空间转录组学平台 | 基于成像的空间转录组学技术 |
| 270 | 2026-07-03 |
Single-Cell RNA Sequencing Revealing Dysregulated Perturbations of Tregs in Psoriasis and Construction of a Treg-Related Diagnostic Model via a 101- Combination Machine Learning Computational Framework
2026, Endocrine, metabolic & immune disorders drug targets
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序揭示银屑病中调节性T细胞的失调扰动,并通过101种组合机器学习框架构建Treg相关诊断模型 | 首次整合单细胞转录组学与101种机器学习算法构建银屑病Treg相关诊断模型,揭示Treg在银屑病中的代谢重编程、分化停滞及IL-16-CD4自分泌信号等新机制 | 未提及具体局限性,但可能包括样本量有限、体外模型验证的局限性及诊断模型需进一步临床验证 | 解析银屑病中Treg的细胞异质性和功能失调,并开发基于Treg相关基因的高准确度诊断模型 | 银屑病患者皮损及健康对照皮肤的Treg细胞单细胞转录组数据 | 机器学习 | 银屑病 | scRNA-seq, LASSO, XGBoost, hdWGCNA | LASSO, XGBoost, 多种机器学习算法 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本量,涉及银屑病患者和健康对照的皮肤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 271 | 2026-07-03 |
Mechanistic Investigation of Nitidine Chloride-Mediated Anti-Colorectal Cancer Activity: Centromere-Associated Protein E Targeting via Integrated Molecular Dynamics, Spatial Transcriptomic and Single-Cell Approaches
2026 Jan-Dec, IET systems biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1049/syb2.70054
PMID:41607031
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研究论文 | 通过整合分子动力学模拟、空间转录组学和单细胞RNA测序技术,系统性研究氯化两面针碱通过靶向着丝粒相关蛋白E发挥抗结直肠癌活性的分子机制 | 首次综合运用单细胞RNA测序、空间转录组学、大规模mRNA队列分析和免疫组化等多种先进技术全面表征CENPE在结直肠癌中的表达模式,并结合分子动力学模拟阐明氯化两面针碱与CENPE的结合模式 | 氯化两面针碱下调CENPE mRNA和蛋白质水平的结果需在更多实验系统中进一步验证 | 阐明氯化两面针碱与着丝粒相关蛋白E之间的相互作用机制,为开发基于中药活性成分的结直肠癌精准治疗方法提供科学依据 | 氯化两面针碱与着丝粒相关蛋白E的相互作用及其在结直肠癌中的作用机制 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 分子动力学模拟, 实时定量聚合酶链反应, 免疫组化 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | 大规模mRNA队列分析(具体样本量未明确)、结直肠癌细胞系和异种移植模型 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 272 | 2026-07-03 |
Cancer-Associated Fibroblasts in Prostate Cancer: Unraveling Mechanisms and Therapeutic Implications
2026, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2025.073265
PMID:41613792
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综述 | 综述前列腺癌中癌症相关成纤维细胞(CAFs)的起源、异质性、功能机制及治疗意义,特别关注肿瘤微环境调控与治疗抵抗 | 整合单细胞和空间转录组学最新进展,系统阐述CAFs在前列腺肿瘤微环境中的表型异质性及空间分布,并提出基质重编程作为辅助治疗的新策略 | 未提及具体的数据分析限制或研究空白,可能缺乏对CAFs靶向策略临床转化挑战的深入讨论 | 全面解析前列腺癌中CAFs的生物学机制,为靶向CAFs的治疗提供理论基础 | 前列腺癌微环境中的癌症相关成纤维细胞(CAFs) | 自然语言处理 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 273 | 2026-07-03 |
MAPRE2 is associated with macrophage-enriched innate immune dysregulation and malignant phenotypes in hepatocellular carcinoma
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1849407
PMID:42220486
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研究论文 | 通过多组学孟德尔随机化等方法,发现MAPRE2与肝细胞癌中巨噬细胞富集的先天免疫失调及恶性表型相关 | 首次整合双样本孟德尔随机化与多组学分析(包括转录组、蛋白质组、DNA甲基化和单细胞RNA测序),系统揭示MAPRE2在肝细胞癌中的风险增加作用及其与先天免疫微环境的关联 | 缺乏体内实验、移植队列和外部预后验证,且高频体细胞扩增罕见,需进一步功能验证 | 探究MAPRE2在肝细胞癌恶性行为与先天免疫微环境中的分子机制及潜在生物标志物和治疗靶点 | 肝细胞癌患者样本(包括肿瘤组织、血液)及HepG2和MHCC97细胞系 | 机器学习和生物信息学 | 肝细胞癌 | 孟德尔随机化、RNA-seq、DNA甲基化测序、单细胞RNA测序、功能缺失实验 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据、甲基化数据、单细胞RNA测序数据 | 两个样本的孟德尔随机化使用公开eQTL和pQTL数据,肿瘤转录组学分析多个队列(具体数量未提及),单细胞RNA测序数据来自公开数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 274 | 2026-07-03 |
Immune-tumor cell ligand-receptor axes driving metabolic reprogramming and therapeutic resistance in cancer
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1864068
PMID:42382771
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综述 | 综述免疫-肿瘤细胞配体-受体轴如何驱动癌症代谢重编程和治疗耐药 | 系统阐述了免疫-肿瘤细胞配体-受体信号轴在代谢重编程和治疗耐药中的核心驱动作用,并整合单细胞转录组学、空间组学等多技术进展来揭示相关耐药微环境 | 未明确指出具体研究局限性,可能包括对配体-受体轴的机制验证不足或缺乏大规模临床转化证据 | 探讨免疫-肿瘤细胞配体-受体轴在驱动癌症代谢适应和治疗耐药中的作用及技术解析方法 | 肿瘤微环境中的免疫细胞与肿瘤细胞之间的配体-受体信号交互 | 机器学习和计算生物学 | NA | 单细胞转录组学,空间组学,多重成像,代谢组学,计算建模 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,代谢组学 | NA | NA |
| 275 | 2026-07-03 |
Identification of MTFR1 as a Novel Prognostic Biomarker and Putative Oncogene for Breast Cancer: A Multi-Omics Analysis and in Vitro Experimental Validation
2026 Jan-Dec, IET systems biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1049/syb2.70080
PMID:42386672
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研究论文 | 通过多组学分析、空间转录组学和单细胞测序,系统鉴定MTFR1作为乳腺癌的新型预后生物标志物和假定致癌基因,并进行了体外实验验证 | 首次全面整合多组学数据、空间转录组学和单细胞测序揭示MTFR1在乳腺癌中的功能和临床意义,并发现其在抗PD-1免疫治疗过程中的预测性能优于治疗前 | 未提及具体局限性 | 探讨MTFR1在乳腺癌中的表达模式、生物学功能及其作为预后生物标志物和治疗靶点的潜力 | 乳腺癌组织样本及恶性细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 多组学分析,空间转录组学,单细胞测序 | NA | 多组学数据,空间转录组数据,单细胞测序数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞测序 | NA | NA |
| 276 | 2026-07-03 |
Beyond FoxP3-Identification of a Chicken Regulatory T Cell Signature
2025-12, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.70106
PMID:41416935
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研究论文 | 本研究通过RNA测序和单细胞RNA测序分析鸡脾细胞中的CD4+亚群,定义了一种新的鸡调节性T细胞标志组合 | 首次描述了鸡特异性CTLA-4抗体,该抗体仅能在细胞内区室中染色CTLA-4,与哺乳动物中的定位方式不同 | CTLA-4的细胞内表达限制了其在功能实验中的可用性 | 定义可靠标志物以鉴定和表征鸡调节性T细胞 | 鸡脾细胞中的CD4+ T细胞亚群 | 机器学习 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 未明确提及样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 277 | 2026-07-03 |
Wnt1's Differential Effects on Craniofacial Bone and Tooth Development
2025-11, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345251336191
PMID:40454459
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研究论文 | 研究Wnt1信号对颅面骨和牙齿发育的不同影响 | 揭示了Wnt1在颅面骨和牙齿发育中的差异性作用,特别是基于骨起源的差异,并通过体内外实验证明了Wnt1对破骨细胞生成的剂量依赖性抑制 | 主要基于小鼠模型,且长期胚胎诱导导致出生后死亡,限制了部分表型观察 | 探究Wnt1信号在颅面骨和牙齿发育中的具体作用和机制 | 小鼠门齿中的颅面骨和牙齿组织 | 机器学习 | NA | 单细胞测序、批量RNA测序、微计算机断层扫描 | 转基因小鼠模型 | 单细胞测序数据、基因表达数据、三维影像数据 | 公开的小鼠门齿单细胞测序数据及转基因小鼠样本 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 278 | 2026-07-03 |
Single-Cell Atlas of Immune Microenvironment in Orthodontic Tooth Movement
2025-11, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345251334583
PMID:40569824
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序解析正畸牙齿移动过程中的免疫微环境 | 首次在单细胞水平上全面描绘正畸牙齿移动过程中的免疫景观,揭示免疫细胞动态变化、功能及细胞间相互作用 | 研究仅基于小鼠模型,需进一步在人体中验证;未分析其他免疫细胞与基质细胞的相互作用 | 更全面地揭示正畸牙齿移动过程中的免疫微环境动态变化及细胞互作机制 | 正畸牙齿移动小鼠的牙周组织免疫细胞 | 单细胞组学 | 无特定疾病 | scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠样本,具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 279 | 2026-07-03 |
Dual oxic-anoxic co-culture enables direct study of anaerobe-host interactions at the airway epithelial interface
2025-05-14, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.01338-24
PMID:40366160
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研究论文 | 描述了一种双有氧-无氧共培养方法,用于直接研究厌氧菌与气道上皮细胞在转录水平上的相互作用 | 提出双有氧-无氧共培养方法,能够同时维持厌氧菌和宿主细胞的活性,从而克服实验模型中厌氧菌和宿主细胞对氧气需求冲突的限制 | 共培养时间限于约48小时,且主要聚焦于单一厌氧菌模型,可能限制了长期相互作用和其他厌氧菌种类的普适性 | 研究厌氧菌与气道上皮细胞在疾病中的相互作用机制 | 厌氧菌(如具核梭杆菌)和气道气道上皮细胞 | 数字病理学 | 气道疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | NA | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 280 | 2026-07-03 |
The trabecular and compact myocardium of adult vertebrate ventricles are transcriptionally similar despite morphological differences
2025-03, Annals of the New York Academy of Sciences
IF:4.1Q1
DOI:10.1111/nyas.15296
PMID:39934982
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研究论文 | 揭示了成年脊椎动物心室中致密心肌和小梁心肌在转录组水平上的相似性,尽管形态存在差异 | 通过空间转录组学和多物种转录组比较,首次系统证明成年心脏中致密层与小梁层心肌的转录组高度相似,挑战了传统认为致密心肌具有内在独特性的观点 | 未明确说明,但可能包括样本量有限、无法完全排除细微差异以及功能验证不足 | 研究脊椎动物心室致密心肌与小梁心肌在转录水平上是否存在根本差异 | 成年小鼠、人类胚胎、成年斑胸草雀、斑马鱼和金枪鱼的心脏组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组学、单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠胚胎和成年心脏样本,人类胚胎心脏数据,以及成年斑胸草雀、斑马鱼和金枪鱼的心脏样本 | 10x Genomics | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | 10x Visium | 10x Visium空间转录组技术用于小鼠胚胎心脏;单细胞转录组数据来自人类胚胎 |