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当前共找到 33643 篇文献，本页显示第 261 - 280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2025-12-03 |
Transcriptional and temporal heterogeneity of developing α cells revealed by single-cell RNA sequencing
2025-Dec-15, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152996
PMID:41242298
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了发育中α细胞的转录和时间异质性 | 利用时间分辨报告小鼠系“Gcg-Timer”进行单细胞转录组分析，首次展示了α细胞生成过程中的转录动态和细胞异质性，并发现线粒体转录本在α细胞中比在发育中的β细胞中表达更显著 | 研究主要基于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类；单细胞测序技术本身存在技术噪音和批次效应 | 探索胰腺α细胞在发育过程中的转录动态和细胞异质性 | 小鼠胚胎中的Gcg表达α细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 262 | 2025-12-03 |
Identification and Validation of Phagocytosis-Regulating Factors as Potential Prognostic and Diagnostic Biomarkers for Intracerebral Hemorrhage Through Single-Cell and Bulk Transcriptomic
2025-Dec-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202502582RR
PMID:41329043
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量转录组学分析，识别并验证了吞噬作用调控因子作为脑出血潜在预后和诊断生物标志物 | 首次结合单细胞RNA测序和机器学习方法，系统识别了与脑出血相关的吞噬调控基因，并构建了ceRNA调控网络 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，缺乏前瞻性临床验证 | 探索吞噬作用调控因子在脑出血中的诊断和预后价值 | 脑出血患者与正常脑组织的转录组数据 | 生物信息学 | 脑出血 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 机器学习 | 机器学习特征选择算法, CIBERSORT算法 | 转录组数据 | 来自GEO数据库的多个数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 263 | 2025-12-03 |
CASP1 as a potential target of Dendrobium in Sjögren's syndrome: Multi-omics analysis and preliminary experimental evidence
2025-Dec-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115670
PMID:41101222
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研究论文 | 本研究通过多组学整合分析，探讨了CASP1在原发性干燥综合征(pSS)发病机制中的潜在作用，以及中药成分石斛的可能治疗机制 | 首次通过多组学整合分析（包括转录组、网络药理学、单细胞测序和分子对接）系统性地识别了CASP1作为pSS的潜在治疗靶点，并验证了石斛活性成分与CASP1的结合潜力 | 研究主要基于生物信息学分析和初步实验验证，因果关系和治疗效果需要进一步的功能验证研究 | 探索CASP1在pSS发病机制中的作用及石斛的治疗机制 | 原发性干燥综合征(pSS)患者 | 生物信息学 | 干燥综合征 | 转录组测序, 单细胞测序, RT-qPCR, 分子对接 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 65名pSS患者及健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 264 | 2025-12-03 |
IRF5 siRNA Nanoimmunotherapy: Restoring Macrophage Efferocytosis in Atherosclerosis
2025-Dec-02, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究开发了一种靶向IRF5的siRNA纳米免疫治疗平台，用于恢复动脉粥样硬化斑块中巨噬细胞的胞葬功能 | 利用工程化siRNA纳米颗粒平台特异性抑制斑块不稳定巨噬细胞分子IRF5，首次实现通过siIRF5纳米免疫治疗增强斑块巨噬细胞的胞葬能力并改善斑块稳定性 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体中验证疗效和安全性 | 开发治疗动脉粥样硬化的新型免疫治疗方法 | 动脉粥样硬化斑块中的巨噬细胞（特别是Cd11c+和Trem2hi亚群） | 纳米医学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 2个独立的ApoE-/-小鼠动脉粥样硬化模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 265 | 2025-12-03 |
A comparative review of single-cell atlases: mapping cellular diversity across species and tissues
2025-Dec-02, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-025-05952-x
PMID:41326763
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综述 | 本文对当前单细胞图谱进行了深入的比较分析，评估了其范围、优势和局限性 | 基于Hrovatin等人更新的框架，系统性地比较了不同单细胞图谱在生物学焦点、物种代表性和数据集规模上的差异，并提出了未来扩展、整合和标准化的关键建议 | 现有图谱在物种和组织类型方面存在代表性不足的空白 | 系统比较和评估现有单细胞图谱，以指导未来图谱计划的扩展、整合和标准化，增强其转化应用价值 | 单细胞图谱，包括人类细胞图谱和小鼠细胞图谱等参考资源 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序技术 | NA | 转录组学、表观基因组学和空间分析数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 266 | 2025-12-03 |
scRNA-seq and Proteomics Uncover Glycolytic Dysregulation Linking Skin and Systemic Inflammation in Dermatomyositis
2025-Dec-02, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljaf486
PMID:41329255
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和蛋白质组学分析，揭示了皮肌炎中皮肤与系统性炎症之间的糖酵解失调机制 | 首次构建了皮肌炎皮肤病变的高分辨率单细胞图谱，并识别了炎症性成纤维细胞亚群及IFN-I信号通路与CXCL10-糖酵解轴的核心作用 | 研究主要基于成人经典皮肌炎患者样本，可能无法完全代表所有皮肌炎亚型；动物模型验证虽有效，但人体治疗应用仍需进一步研究 | 定义皮肌炎的系统性和皮肤病变炎症景观，并探究其致病机制 | 经典成人皮肌炎患者的皮肤病变样本及实验性自身免疫性肌炎小鼠模型 | 数字病理学 | 皮肌炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、蛋白质组学、转录组学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据、蛋白质组数据、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 267 | 2025-12-03 |
Profiling Cell-state Fingerprints Based on Deep Learning Model with Meta-programs of Pan-cancer
2025-Dec-02, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf123
PMID:41329499
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研究论文 | 本研究基于深度学习模型StateNet，利用泛癌元程序生成细胞状态指纹，以分析癌症细胞状态的共性与个体差异 | 开发了深度学习模型StateNet，首次基于泛癌元程序生成细胞状态指纹，用于揭示癌症细胞的共享特征和个体特性，并识别了ACAT2作为缺氧与脂质代谢通路的关键介导因子 | 研究主要依赖单细胞RNA测序数据，可能未涵盖所有细胞状态或组织类型，且样本量虽大但仍有扩展空间 | 旨在解析泛癌中细胞状态的共同机制和个体差异，开发工具用于癌症分析和预后预测 | 159,372个细胞，来自245个细胞系，覆盖14种组织类型，以及3,210个癌症样本 | 机器学习 | 泛癌 | 单细胞RNA测序 | 深度学习模型StateNet | 单细胞RNA测序数据 | 159,372个细胞（来自245个细胞系）和3,210个癌症样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 268 | 2025-12-03 |
Spatiotemporal liver dynamics shape hepatocellular heterogeneity and impact in vivo gene engineering
2025-Dec, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2025.06.018
PMID:40617259
|
研究论文 | 本研究通过克隆追踪、单细胞和空间转录组学技术，探索了小鼠肝脏生长过程中肝细胞异质性的演变及其对体内基因工程的影响 | 揭示了新生肝脏中克隆性肝细胞在空间生态位中的定位及其对成年组织生成的贡献，并展示了靶向这些细胞可提高基因编辑效率 | 研究主要基于小鼠模型，结果在人类肝脏中的适用性尚需进一步验证 | 探究肝细胞异质性在肝脏生长中的动态变化及其对体内基因治疗策略的影响 | 不同年龄阶段的小鼠肝脏组织 | 数字病理学 | NA | 克隆追踪、单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | 转录组数据、空间数据 | 不同年龄的小鼠肝脏样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 269 | 2025-12-03 |
Spatial Transcriptomics of Developing Wheat Seed Reveals Concentric Gene Expression Zones and Subgenome Biased Expression of Key Genes
2025-Dec, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70351
PMID:40904198
|
研究论文 | 本研究利用STOmics空间转录组平台，可视化小麦种子在灌浆关键期的基因表达空间模式，揭示了胚乳中的同心表达区域和亚基因组偏向表达的关键基因 | 首次在小麦种子中应用空间转录组技术，实现了亚细胞分辨率的转录本定位，识别了与八个功能细胞群相关的基因表达簇，并发现了胚乳内四个同心区域的表达模式 | 研究仅聚焦于14 DPA（花后天数）的小麦种子，未覆盖整个发育过程，且样本量有限 | 探究小麦种子发育过程中基因表达的空间组织，以理解营养储存、胁迫耐受和萌发等关键过程 | 小麦（Triticum aestivum）种子，特别是在灌浆关键期的发育阶段 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 超过4,000,000个空间解析的转录本 | STOmics | 空间转录组学 | STOmics空间转录组平台 | NA |
| 270 | 2025-12-03 |
Spatial Cross-talk Modeling of the Tumor Microenvironment Identifies CCR5-Mediated Glia-to-Glia Signaling as a Key Regulator of Brain Metastatic Progression
2025-Dec-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-0237
PMID:40960488
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和细胞间通讯分析，揭示了脑转移瘤微环境中胶质细胞间信号传导的关键作用，并提出了靶向CCR5介导的胶质细胞信号传导作为治疗新策略 | 首次结合单细胞RNA测序与空间转录组学，系统解析脑转移进展中胶质细胞间的空间交互作用，并发现CCL4-CCR5信号轴可作为治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证不足；靶向治疗的长效性和潜在脱靶效应未充分评估 | 探究脑转移瘤微环境中胶质细胞间信号传导机制及其对肿瘤进展的调控作用 | 脑转移瘤微环境中的星形胶质细胞、小胶质细胞和少突胶质细胞 | 空间转录组学 | 脑转移瘤 | RNA测序, 空间转录组学, 细胞间通讯分析 | NA | 转录组数据, 空间表达数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 271 | 2025-12-03 |
Combining Mendelian randomization and network toxicology to decipher the causal role and molecular mechanisms of environmental pollutants in breast cancer: A focus on Methyl-4-hydroxybenzoate
2025-Dec, Cancer epidemiology
IF:2.4Q2
DOI:10.1016/j.canep.2025.102953
PMID:41183465
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研究论文 | 本研究通过整合孟德尔随机化和网络毒理学方法，探讨了环境污染物甲基对羟基苯甲酸酯在乳腺癌中的因果作用及分子机制 | 首次结合孟德尔随机化和网络毒理学，提出了一种非雌激素受体依赖的致癌机制假说，涉及生长因子信号传导失调和代谢重编程 | 研究主要基于遗传数据和计算分析，缺乏直接的实验验证，且样本来源有限（如FinnGen联盟） | 探究甲基对羟基苯甲酸酯在乳腺癌中的因果角色及其非雌激素机制 | 乳腺癌患者及尿液甲基对羟基苯甲酸酯硫酸盐的遗传数据 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 孟德尔随机化分析、网络毒理学、转录组分析、单细胞/空间RNA测序、分子对接 | NA | 遗传数据、转录组数据、单细胞RNA测序数据、空间转录组数据 | 尿液MEP硫酸盐数据n=8285，FinnGen联盟乳腺癌风险数据n=182,927 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 272 | 2025-12-03 |
Integrated bulk and single-cell RNA sequencing analysis reveals cuproptosis-related proteins in Crohn's disease
2025-Dec, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.148990
PMID:41232892
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研究论文 | 本研究通过整合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，揭示了克罗恩病中与铜死亡相关的蛋白标志物及其与代谢和免疫的关联 | 首次将铜死亡相关蛋白与克罗恩病联系起来，并整合批量与单细胞数据构建诊断模型，揭示了CD274、PDK1、CP和SLC31A2等新标志物 | 研究主要基于生物信息学分析，缺乏实验验证；单细胞分析仅为初步探索性结果，需进一步功能研究确认 | 探索铜死亡相关蛋白在克罗恩病中的作用，并构建诊断模型 | 克罗恩病患者炎症组织与非炎症组织 | 生物信息学 | 克罗恩病 | RNA测序，单细胞RNA测序，RT-qPCR | 诊断模型 | 基因表达数据 | 494例组织样本（批量数据）和25,121个细胞（单细胞数据） | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 273 | 2025-12-03 |
Single-cell RNA sequencing reveals tumor cell and immune cell variations associated with lymphatic metastasis in papillary thyroid cancer
2025-Dec-01, Endocrine connections
IF:2.6Q3
DOI:10.1530/EC-25-0514
PMID:41257484
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了甲状腺乳头状癌中与淋巴转移相关的肿瘤细胞和免疫细胞变异 | 首次在单细胞水平上系统分析了PTC中淋巴转移相关的肿瘤和免疫细胞异质性，并识别了CD8+常驻记忆T细胞作为关键调节因子 | 样本量较小（仅6例），且仅基于单细胞RNA测序数据，缺乏功能验证实验 | 探究甲状腺乳头状癌中淋巴转移的细胞分子机制 | 甲状腺乳头状癌患者的肿瘤样本 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 6例PTC患者肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 274 | 2025-12-03 |
Stereo cell: A new approach to the next generation of clinical precision medicine
2025-Dec, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70537
PMID:41316703
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评论 | 本文提出“立体细胞生物医学”作为新一代精准医学的新方法，强调从基因组数据转向单细胞的多维时空复杂性 | 引入“立体细胞生物医学”概念，整合Stereo单细胞多组学、空间转录组学和单细胞表面组学，聚焦细胞器间及细胞间的立体动态相互作用 | NA | 推动新一代精准医学的发展，通过理解分子的时空位置和相互作用来定义细胞功能 | 单细胞及其细胞器、组织中的细胞相互作用 | 数字病理学 | NA | Stereo单细胞多组学（Stereo Cell-seq）、空间转录组学（Stereo-seq）、单细胞表面组学（sc-surfaceome） | NA | 多组学数据、空间数据 | NA | NA | 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 275 | 2025-12-03 |
Systematically Revealing Quantitative Multi-Target Integrative Effects of Plants With Artificial Intelligence Method
2025-Dec, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70321
PMID:40824771
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研究论文 | 本研究开发了一种基于人工智能的新方法，以山楂为例，系统揭示了植物在单细胞水平上对疾病的多靶点潜在整合效应 | 提出了一种基于深度自编码神经网络模型的新方法，将植物与疾病之间多个共同靶点在单细胞转录组中的表达水平编码为一个整合值（MTIS），首次在单细胞水平上实现了植物多靶点潜在整合效应的景观和定量图谱 | 该方法目前仅以山楂和动脉粥样硬化为例进行了验证，其广泛适用性有待更多植物和疾病模型的进一步测试 | 系统揭示植物对疾病的定量多靶点整合效应 | 山楂（植物）对动脉粥样硬化疾病的影响 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序 | 深度自编码神经网络 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 276 | 2025-12-03 |
Oxidative Stress and Pyroptosis Mediated by CEBPB/HMGB1 Signaling in Sepsis-Exacerbated Coronary Atherosclerosis
2025-Dec, Antioxidants & redox signaling
IF:5.9Q1
DOI:10.1177/15230864251380263
PMID:41167615
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研究论文 | 本研究探讨了氧化应激和CEBPB/HMGB1/VCAM1信号轴在脓毒症加剧的冠状动脉疾病中的作用 | 揭示了CEBPB/HMGB1/VCAM1轴在脓毒症中连接全身炎症与氧化血管损伤的新机制，为CAD并发症提供了治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型和细胞实验，人类临床验证有限 | 探索脓毒症加剧冠状动脉粥样硬化的分子机制，特别是氧化应激和细胞焦亡的作用 | 雄性ApoE小鼠、THP-1来源的巨噬细胞、人主动脉内皮细胞 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、批量转录组学、染色质免疫沉淀、双荧光素酶报告基因检测、酶联免疫吸附试验、活性氧检测、流式细胞术 | NA | RNA测序数据、蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 277 | 2025-12-03 |
Tumor and Immune Dynamics Following Sequential CDK4/6 and PD-1 Inhibition: Results from a Phase 2 Study in Dedifferentiated Liposarcoma
2025-Dec-01, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-25-0334
PMID:41325133
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研究论文 | 本研究通过一项2期临床试验，评估了CDK4/6抑制剂帕博西尼与PD-1抑制剂瑞替法利单抗在晚期去分化脂肪肉瘤中的联合治疗效果，并利用单细胞RNA测序和高参数流式细胞术分析了肿瘤和免疫动态变化 | 首次在晚期去分化脂肪肉瘤患者中，采用帕博西尼先导给药后联合PD-1抑制剂的序贯治疗策略，并通过单细胞RNA测序和高参数流式细胞术全面评估了肿瘤和宿主免疫的动态响应 | 研究因42%的免疫相关毒性率而提前终止，样本量较小（12例患者），且仅部分患者有配对肿瘤活检分析，可能限制了统计功效和结论的普适性 | 评估CDK4/6抑制剂与PD-1抑制剂序贯联合治疗在晚期去分化脂肪肉瘤中的疗效，并探究肿瘤和免疫系统的动态变化机制 | 晚期去分化脂肪肉瘤患者 | 数字病理学 | 脂肪肉瘤 | 单细胞RNA测序, 高参数流式细胞术 | NA | RNA测序数据, 流式细胞术数据 | 12例患者，其中9例有至少1次肿瘤活检分析，3例有配对活检，10例有配对血液样本分析 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 278 | 2025-12-03 |
Guided Co-clustering Transfer Across Unpaired and Paired single-cell Multi-omics Data
2025-Dec-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf639
PMID:41325188
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研究论文 | 本文提出了一种名为GuidedCoC的新框架，用于将未配对单细胞RNA-seq数据中的结构知识迁移到配对的单细胞多组学数据中，以改进细胞聚类和特征对齐 | 提出了一种通过统一信息论目标联合跨模态和跨域共聚类细胞与特征的新框架，能够自动对齐未配对和配对数据集中的细胞群体，无需显式注释 | 未在摘要中明确说明 | 改进配对单细胞RNA-seq和scATAC-seq数据的整合，提高聚类准确性和生物学可解释性 | 单细胞多组学数据（包括未配对scRNA-seq和配对scRNA-seq/scATAC-seq数据） | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞ATAC测序（scATAC-seq） | NA | 基因表达数据，染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，单细胞ATAC-seq，单细胞多组学 | NA | NA |
| 279 | 2025-12-03 |
Chemosensory protein 3 is a brain host factor for the induction of enhanced-locomotory activity in the BmNPV-silkworm infection model
2025-Dec-01, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1013701
PMID:41325423
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了家蚕感染BmNPV后，其大脑中化学感受蛋白3（CSP3）的上调是诱导增强运动行为的关键宿主因子 | 首次在单细胞分辨率下解析了杆状病毒感染昆虫大脑的转录组图谱，并发现CSP3作为大脑宿主因子在调控病毒感染诱导的行为变化中发挥关键作用，揭示了CSP蛋白在昆虫大脑中的新功能 | 研究主要聚焦于感染后96小时的时间点，缺乏感染过程的动态观察；体外结合实验验证的配体种类有限；行为变化的神经环路机制尚未完全阐明 | 探究杆状病毒感染诱导昆虫行为变化的宿主分子机制 | 家蚕幼虫及其大脑细胞 | 单细胞转录组学 | 病毒感染 | 单核RNA测序，靶向代谢组学，结构建模，分子动力学模拟，体外结合实验 | NA | 单细胞转录组数据，代谢组数据，蛋白质结构数据 | 家蚕幼虫大脑细胞 | NA | 单核RNA-seq | NA | NA |
| 280 | 2025-12-03 |
Long-read sequencing transcriptome quantification with lr-kallisto
2025-Dec-01, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013692
PMID:41325434
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研究论文 | 本文介绍了lr-kallisto，一种用于长读长测序数据的转录本定量方法，旨在提高全长转录异构体定量的准确性和效率 | 开发了lr-kallisto，将kallisto方法适配到长读长测序技术，并证明外显子捕获能改善定量准确性 | 未明确提及具体的数据集规模或验证范围，可能局限于ONT平台数据 | 实现长读长测序数据中转录异构体的快速准确定量 | RNA转录本，特别是全长转录异构体 | 自然语言处理 | NA | 长读长测序，外显子捕获 | kallisto适配模型 | RNA-seq数据 | NA | Oxford Nanopore Technologies | 长读长测序 | ONT平台 | NA |