单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 32055 篇文献，本页显示第 261 - 280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2025-10-30 |
Enhanced RNA Preservation in Mouse Brain Tissue: A Strategy Combining Cardiac Perfusion with Hypersaline Immersion
2025-Oct-21, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c05379
PMID:41141763
|
研究论文 | 开发了一种结合心脏灌注和高渗盐水浸泡的策略，用于增强小鼠脑组织RNA保存效果 | 首次将心脏灌注与高渗盐水浸泡相结合，建立了标准化的RNA保存框架，显著延长了RNA在组织切片中的完整性保持时间 | 仅在小鼠脑组织中验证，未在其他组织类型或物种中测试 | 解决空间转录组学研究中RNA降解问题，建立标准化的RNA保存方法 | 小鼠脑组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，RNA完整性检测 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 262 | 2025-10-30 |
Commentary: Toward a global atlas of ocular surface biology: Rationale, design, and clinical applications
2025-Oct-21, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2025.110705
PMID:41130333
|
评论 | 提出构建全球眼表生物学图谱的倡议，通过整合多组学技术系统解析眼表组织在健康和疾病状态下的生物学特征 | 首次提出建立全球眼表生物学图谱，采用单细胞和空间组学技术系统解析眼表微环境动态，并制定了临床转化路线图 | NA | 构建全面的眼表生物学图谱，推动精准眼科诊断和治疗 | 眼表组织（角膜、结膜、泪膜装置）及其微环境 | 数字病理 | 眼科疾病 | 单细胞/单核RNA测序, ATAC测序, 空间转录组学, 泪液蛋白质组学/代谢组学 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学, 多组学整合 | NA | NA |
| 263 | 2025-10-30 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal intratumor heterogeneity and immune evasion in natural killer/T cell lymphoma
2025-Oct-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113626
PMID:41142990
|
研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学揭示自然杀伤/T细胞淋巴瘤的肿瘤内异质性和免疫逃逸机制 | 首次在NKTCL中鉴定出五个具有不同功能通路、分化轨迹和空间分布的恶性元程序亚群，并发现FABP5抑制剂可下调c-Myc抑制肿瘤生长 | NA | 探究自然杀伤/T细胞淋巴瘤的肿瘤内异质性和肿瘤微环境相互作用 | 自然杀伤/T细胞淋巴瘤患者组织样本 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 264 | 2025-10-30 |
Integration of elemental imaging and spatial transcriptomic profiling for proof-of-concept metals-based pathway analysis of colon tumor microenvironment
2025-Oct-14, Metallomics : integrated biometal science
IF:2.9Q3
DOI:10.1093/mtomcs/mfaf034
PMID:41042257
|
研究论文 | 本研究开发了一种整合元素成像和空间转录组学的多模态工作流程，用于探索结肠癌肿瘤微环境中金属-基因相互作用 | 首次将元素成像与空间转录组学整合，实现组织范围内金属-基因相互作用的全面探索 | 仅基于单个样本的初步概念验证研究，需要更大患者队列验证 | 探索肿瘤微环境中金属依赖性信号传导及其与基因表达的关联 | 结直肠癌肿瘤微环境 | 空间转录组学 | 结直肠癌 | 元素成像, 空间转录组学, 多模态整合分析 | 空间相关分析 | 元素成像数据, 基因表达数据, 细胞组成数据, 组织病理学特征 | 1例结直肠癌肿瘤样本 | NA | 元素成像, 空间转录组学 | NA | NA |
| 265 | 2025-10-30 |
Deciphering the cellular tumor microenvironment landscape in salivary gland carcinomas using multiplexed imaging mass cytometry
2025-Oct-13, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-025-03551-z
PMID:41083996
|
研究论文 | 利用多重成像质谱流式技术解析唾液腺癌肿瘤微环境的细胞景观 | 首次在唾液腺癌中应用13标志物成像质谱流式技术进行空间单细胞分析，发现基质癌相关成纤维细胞(mCAF)与内皮细胞的空间相互作用与转移相关 | 样本量相对有限(54例)，空间转录组数据仅包含3例病例 | 空间表征唾液腺癌单细胞肿瘤微环境并鉴定预后生物标志物 | 唾液腺癌患者组织样本，包括唾液腺导管癌、腺泡细胞癌、黏液表皮样癌和分泌性癌 | 数字病理 | 唾液腺癌 | 成像质谱流式技术，空间转录组学，RNA测序 | CAF算法，空间分析，Cox回归分析 | 多通道图像数据，单细胞数据，RNA测序数据 | 54例原发灶和淋巴结转移病例，验证队列包含67例唾液腺导管癌病例 | NA | 成像质谱流式，空间转录组学，bulk RNA-seq | NA | 13标志物成像质谱流式面板 |
| 266 | 2025-10-30 |
EED226 treatment targets key immune genes to suppress LPS response in Chinese tongue sole splenocytes
2025-Oct-10, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2025.110927
PMID:41076212
|
研究论文 | 本研究探索EED226通过靶向关键免疫基因抑制中华半滑舌鳎脾细胞中LPS诱导的免疫反应 | 首次在硬骨鱼中揭示EED蛋白及其抑制剂EED226的免疫调节功能，发现跨物种保守的EED靶向治疗潜力 | 研究局限于中华半滑舌鳎这一特定鱼种，未验证其他硬骨鱼类的适用性 | 探究表观遗传机制在硬骨鱼LPS免疫应答中的调控作用 | 中华半滑舌鳎脾细胞 | 免疫学 | 细菌感染 | 单细胞RNA测序,转录组分析,定量RT-PCR,系统发育分析 | NA | 基因表达数据,序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 267 | 2025-10-30 |
Linking ion channel gene expression to neuronal firing patterns through a statistical-biophysical model
2025-Oct-10, Patterns (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.patter.2025.101390
PMID:41142910
|
研究论文 | 通过统计生物物理模型建立离子通道基因表达与神经元放电模式之间的定量联系 | 开发了基于生物物理模拟和现代机器学习技术的新型统计生物物理模型 | NA | 建立转录组特性与生理特性之间的机制联系 | 神经元 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序, 电生理记录, 形态学重建 | 统计生物物理模型, 机器学习 | 基因表达数据, 电生理数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 268 | 2025-10-30 |
Combined statistical-biophysical modeling links ion channel genes to physiology of cortical neuron types
2025-Oct-10, Patterns (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.patter.2025.101323
PMID:41142913
|
研究论文 | 开发了一种结合统计和机制模型的混合建模方法，通过基因表达模式预测皮层神经元类型的电生理活动 | 首次将统计模型与基于Hodgkin-Huxley的机制模型相结合，通过可解释的线性稀疏回归模型将基因表达与生物物理模型参数联系起来 | 模型与数据之间存在不匹配问题，需要克服这一挑战 | 建立基因表达与神经元生理特性之间的联系 | 多种皮层细胞类型 | 计算神经科学 | NA | 单细胞转录组学，仿真推断，多模态Patch-seq数据 | Hodgkin-Huxley模型，线性稀疏回归模型 | 基因表达数据，电生理数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 269 | 2025-10-30 |
Tumor-derived CD109 orchestrates reprogramming of tumor-associated macrophages to dampen immune response
2025-Oct, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2025.03.035
PMID:40220905
|
研究论文 | 本研究揭示了肿瘤源性可溶性CD109通过重编程肿瘤相关巨噬细胞抑制免疫反应的机制 | 首次发现sCD109作为'分泌性免疫检查点'通过双重机制调控CD73表达，并证明CD109与PD-L1双重阻断可增强免疫治疗效果 | 研究主要在临床前模型中进行，需要进一步临床验证 | 探索iCCA免疫抑制机制并开发新的免疫治疗靶点 | 肝内胆管癌(iCCA)及其肿瘤免疫微环境 | 肿瘤免疫学 | 肝内胆管癌 | 蛋白质组学分析、单细胞转录组学、飞行时间质谱流式细胞术、RNA测序、质谱分析 | NA | 蛋白质组数据、转录组数据、单细胞数据 | NA | NA | 单细胞转录组学、蛋白质组学 | NA | NA |
| 270 | 2025-10-30 |
Immunopathogenesis of IgG4-related disease in the era of single-cell RNA sequencing and highly multiplex immunofluorescence
2025-Oct, Expert review of clinical immunology
IF:3.9Q2
DOI:10.1080/1744666X.2025.2567589
PMID:40999941
|
综述 | 本文总结了单细胞RNA测序和高重免疫荧光技术在IgG4相关疾病免疫发病机制研究中的最新进展 | 利用单细胞技术发现了新的免疫细胞亚群，包括GZMK+细胞毒性Tfh细胞、MKI67+B细胞和双阴性3型B细胞 | 尚未将机制发现与靶向治疗完全衔接，需要改进动物模型和开展转化研究 | 探讨IgG4相关疾病的免疫发病机制 | 浆母细胞、活化B细胞、细胞毒性T淋巴细胞、T滤泡辅助细胞、巨噬细胞、树突状细胞、成纤维细胞等免疫细胞 | 免疫学 | IgG4相关疾病 | 单细胞RNA测序, 高重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 免疫荧光图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 271 | 2025-10-30 |
RELA Haploinsufficiency Manifesting as an Atypical Phenotype of Crohn's Disease
2025-Oct-01, Inflammatory bowel diseases
IF:4.5Q1
DOI:10.1093/ibd/izaf159
PMID:40876844
|
研究论文 | 本研究报道了一例由RELA单倍体不足引起的克罗恩病非典型表型病例，通过基因组学和免疫学分析揭示了其发病机制 | 首次将RELA单倍体不足与克罗恩病样表型联系起来，揭示了Th1/Th17极化和干扰素驱动炎症的新机制 | 单病例研究，样本量有限，需要更大规模研究验证发现 | 表征由RELA单倍体不足驱动的非典型克罗恩病样表型的临床、基因组和免疫学特征 | 一名17岁男性患者，诊断为全肠克罗恩病伴肛周瘘管、慢性皮肤黏膜念珠菌病和慢性淋巴细胞减少症 | 医学遗传学 | 克罗恩病 | 全外显子组测序, Sanger测序, 蛋白质建模, Western blotting, 免疫荧光, NF-κB激活试验, 质谱流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 蛋白质数据, 单细胞转录组数据 | 1例患者 | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 272 | 2025-10-30 |
Immunophenotypic changes in the tumor and tumor microenvironment during progression to multiple myeloma
2025-Oct, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1011848
PMID:41056512
|
研究论文 | 通过单细胞分析研究多发性骨髓瘤进展过程中肿瘤细胞和肿瘤微环境的免疫表型变化 | 首次在未分选的骨髓单核细胞样本中结合单细胞RNA测序、表面蛋白分析和B淋巴细胞抗原受体分析，构建了骨髓微环境的细胞图谱 | 样本量相对有限，需要进一步验证研究结果 | 研究多发性骨髓瘤前驱疾病向活动性疾病进展过程中的细胞和分子机制 | 健康志愿者和单克隆丙种球蛋白病、冒烟型多发性骨髓瘤、多发性骨髓瘤患者 | 单细胞组学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序, 表面蛋白分析, B淋巴细胞抗原受体分析 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白表达数据 | 123名受试者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 273 | 2025-10-30 |
Liquid Biopsy-Multiomics Link Adhesion Pathway Dysregulation to Kidney Injury Severity
2025-Oct, Kidney international reports
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.ekir.2025.07.021
PMID:41141506
|
研究论文 | 本研究通过液体活检多组学分析揭示细胞粘附通路失调与急性肾损伤严重程度的关联 | 首次结合尿液蛋白质组学、血浆蛋白质组学和尿液沉淀单细胞转录组学，系统识别严重急性肾损伤的细胞特异性机制 | 样本量相对有限，特别是单细胞转录组学样本仅40例 | 预测急性肾损伤严重结局并探索其分子机制 | COVID相关和非COVID相关的急性肾损伤患者 | 机器学习 | 肾脏疾病 | 蛋白质组学，单细胞转录组学，机器学习 | 随机森林 | 蛋白质组数据，单细胞转录组数据 | 169例尿液蛋白质组学样本，437例血浆蛋白质组学样本，40例尿液沉淀单细胞转录组学样本 | NA | 单细胞RNA-seq，蛋白质组学 | NA | NA |
| 274 | 2025-10-30 |
Single-cell multi-omic and spatial profiling of esophageal squamous cell carcinoma reveals the immunosuppressive role of GPR116+ pericytes in cancer metastasis
2025-Oct, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-025-02341-9
PMID:41073785
|
研究论文 | 通过单细胞多组学和空间转录组学揭示食管鳞癌中GPR116+周细胞通过免疫抑制促进肿瘤转移的机制 | 首次发现GPR116+周细胞亚群在食管鳞癌转移中的关键作用，阐明其通过分泌EGFL6激活整合素β1/NF-κB通路促进转移的分子机制 | 样本量相对有限（16个单细胞多组学样本，5个空间转录组样本），动物模型结果需进一步临床验证 | 探究食管鳞癌肿瘤微环境中细胞多样性和空间结构对肿瘤转移的影响机制 | 食管鳞癌患者组织样本（人类）和Prrx1基因敲除小鼠模型 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞多组学测序，空间转录组学，基因敲除技术 | NA | 单细胞多组学数据，空间转录组数据 | 16个单细胞多组学样本（117,169个细胞），5个空间转录组样本（195,366个细胞） | NA | 单细胞多组学，空间转录组学 | NA | NA |
| 275 | 2025-10-30 |
Identifying senescent cells as prognostic biomarkers and therapeutic targets of nasopharyngeal carcinoma by integrated analysis of single-cell and bulk-RNA sequencing data
2025-Sep-30, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-659
PMID:41158214
|
研究论文 | 通过整合分析单细胞和bulk-RNA测序数据，识别鼻咽癌中的衰老细胞作为预后生物标志物和治疗靶点 | 首次在单细胞水平表征鼻咽癌中的衰老细胞，发现衰老上皮C3细胞和SPP1+巨噬细胞与肿瘤进展相关 | 样本量较小（15例初治患者和1例慢性鼻咽炎患者） | 阐明鼻咽癌中衰老细胞的表型特征及其在肿瘤发生中的作用 | 鼻咽癌患者组织样本 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据，bulk RNA测序数据 | 16例患者（15例初治鼻咽癌，1例慢性鼻咽炎） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 276 | 2025-10-30 |
APOA2 mediates immune therapy tolerance in hepatocellular carcinoma by inhibiting the antigen-presenting function of dendritic cells through the PPAR signaling pathway
2025-Sep-30, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-321
PMID:41158225
|
研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学和单细胞RNA测序数据，揭示了APOA2通过PPAR信号通路抑制树突状细胞抗原呈递功能，从而介导肝细胞癌免疫治疗耐受的机制 | 首次发现APOA2通过PPAR信号通路抑制树突状细胞抗原呈递功能，阐明了肝细胞癌免疫治疗耐受的新机制 | 研究样本量有限，机制验证主要依赖生物信息学分析，需要进一步实验验证 | 探究肝细胞癌对联合靶向治疗和免疫治疗产生耐受的分子机制 | 接受卡博替尼-纳武利尤单抗治疗的肝细胞癌患者 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 生物信息学分析 | RCTD算法, hdWGCNA, ISCHIA算法, Misty框架, CellChat | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 批量RNA测序数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 277 | 2025-10-30 |
Integration analysis of single-cell transcriptome reveals SPP1+ and TFF3+ macrophage subsets contributing to the brain metastasis from lung cancer
2025-Sep-30, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2024-2489
PMID:41158243
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示了SPP1+和TFF3+巨噬细胞亚群在肺癌脑转移中的作用机制 | 首次发现SPP1+和TFF3+巨噬细胞亚群在肺癌脑转移组织中显著上调，并揭示了其促进肿瘤进展的潜在分子机制 | 研究基于公共数据库数据，缺乏实验验证；样本来源和数量未明确说明 | 探究肺癌脑转移中肿瘤相关巨噬细胞亚群的异质性及其作用机制 | 肺癌脑转移组织中的巨噬细胞亚群 | 单细胞转录组学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 278 | 2025-10-30 |
Demystifying programmed cell death in lung adenocarcinoma: combined prognostic model construction
2025-Sep-30, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-309
PMID:41158258
|
研究论文 | 本研究构建了基于程序性细胞死亡基因的肺腺癌联合预后模型 | 首次结合坏死性凋亡和焦亡基因构建联合预后模型，并识别PKP2和AHSA1作为关键预后生物标志物 | 研究基于回顾性数据，需要前瞻性研究验证模型的临床适用性 | 开发肺腺癌预后模型以改善风险分层和识别治疗靶点 | 肺腺癌患者 | 生物信息学 | 肺腺癌 | LASSO回归，多变量Cox回归，机器学习，单细胞RNA测序 | LASSO回归模型，联合预后模型，机器学习模型 | 基因表达数据 | TCGA和8个GEO数据集 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 279 | 2025-10-30 |
Development and validation of a lipid metabolism-related prognostic model for gastric adenocarcinoma
2025-Sep-30, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-1540
PMID:41158277
|
研究论文 | 开发并验证了一个基于脂质代谢的胃腺癌预后模型 | 首次构建了胃腺癌脂质代谢相关预后特征模型，揭示了其与肿瘤微环境和免疫治疗反应的关系 | 需要整合单细胞测序和多中心临床数据来提升模型适用性 | 构建胃腺癌脂质代谢相关预后模型并评估其临床相关性 | 胃腺癌患者 | 生物信息学 | 胃腺癌 | LASSO回归分析，Cox回归分析，功能富集分析，肿瘤突变负荷分析 | 预后特征模型 | 基因表达数据，临床数据 | 来自TCGA数据库的胃腺癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 280 | 2025-10-30 |
Integrative analysis of programmed cell death pathways reveals prognostic biomarkers and immune infiltration signatures in coronary artery disease
2025-Sep-30, Journal of thoracic disease
IF:2.1Q3
DOI:10.21037/jtd-2024-2283
PMID:41158406
|
研究论文 | 通过整合基因表达数据和机器学习方法，系统分析程序性细胞死亡通路在冠状动脉疾病中的作用并识别预后生物标志物 | 首次将多种程序性细胞死亡通路整合分析，开发了PCDscore预后评分系统，并结合单细胞RNA测序数据提供新见解 | 基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证 | 阐明程序性细胞死亡通路在冠状动脉疾病中的预后价值并识别关键生物标志物 | 冠状动脉疾病患者基因表达数据和免疫细胞浸润特征 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 基因表达分析，单样本基因集富集分析，单细胞RNA测序 | 机器学习 | 基因表达数据 | 来自TCGA和GEO数据库的冠状动脉疾病样本 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA-seq | NA | NA |