单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 39535 篇文献,本页显示第 261 - 280 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
261 2026-05-17
KIF11 prevents retinal endothelial ferroptosis in familial exudative vitreoretinopathy by inhibiting phosphorylation-driven PRDX1 phase separation
2026-Mar-24, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 通过bulk RNA测序和单细胞RNA测序分析,发现KIF11是家族性渗出性玻璃体视网膜病变中视网膜内皮细胞的关键下游效应因子,并通过抑制磷酸化驱动的PRDX1相分离来阻止铁死亡 首次揭示β-catenin/KIF11/PRDX1轴依赖的铁死亡机制在家族性渗出性玻璃体视网膜病变中的作用,并强调铁死亡靶向和抗氧化策略作为潜在疗法 未提及 探究家族性渗出性玻璃体视网膜病变的发病机制,特别是下游致病机制 视网膜内皮细胞和小鼠模型 数字病理学 家族性渗出性玻璃体视网膜病变 bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠组织样本(具体数量未提及) Illumina bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq Illumina NovaSeq 使用bulk RNA测序和单细胞RNA测序分析视网膜内皮细胞
262 2026-05-17
Pseudomonas plecoglossicida disrupts intestinal homeostasis through manipulation of palmitoleic acid microbial metabolism
2026-Mar-24, NPJ biofilms and microbiomes IF:7.8Q1
研究论文 本研究利用单细胞测序、16S rDNA测序和代谢组学方法,探究非肠道病原菌Pseudomonas plecoglossicida通过调控棕榈油酸微生物代谢破坏斜带石斑鱼肠道稳态并导致疾病相关厌食症的机制 首次揭示非肠道病原菌通过消耗棕榈油酸破坏肠道稳态并诱导厌食症的机制,提出外源补充棕榈油酸可作为恢复鱼类食欲的治疗策略 未检测到与色氨酸衍生代谢物相关的关键细菌,且研究仅在鱼类模型中进行,其机制在其他物种中的通用性有待验证 阐明非肠道病原菌感染如何通过肠道微生物代谢紊乱引发厌食症的机制 感染Pseudomonas plecoglossicida的斜带石斑鱼 机器学习 感染性疾病 单细胞测序, 16S rDNA测序, 代谢组学 NA 测序数据, 代谢物数据 感染组和对照组的斜带石斑鱼肠道样本 NA 单细胞RNA测序, 16S rDNA测序 NA NA
263 2026-05-17
Asymmetric histone inheritance regulates olfactory stem cell fates during regeneration
2026-Mar-23, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文揭示了小鼠嗅觉上皮再生过程中水平基底细胞(HBCs)的不对称组蛋白遗传模式及其对干细胞命运和功能恢复的影响 首次在哺乳动物成体干细胞中证明组蛋白H4、H3和H3.3的不对称遗传,并揭示其通过p63转录因子调控细胞命运和神经组织再生的机制 未明确说明限制 探究嗅觉干细胞在再生过程中的组蛋白不对称遗传及其生物学意义 小鼠嗅觉上皮中的水平基底细胞(HBCs)及其子代细胞 机器学习 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠嗅觉上皮组织和培养的HBC子代细胞对 NA 单细胞RNA测序 NA NA
264 2026-05-17
Ganglioside-Mediated Neural-Acinar Crosstalk Facilitates Pancreatic Carcinogenesis via Metaplastic Niche Remodeling
2026-Mar-16, Gastroenterology IF:25.7Q1
研究论文 本研究揭示了神经-腺泡细胞间通过神经节苷脂介导的相互作用在胰腺癌发生中的作用机制 首次阐明神经节苷脂GM3在腺泡-导管化生与神经重塑双向串扰中的关键作用,发现β-1,4-半乳糖基转移酶5在胰腺癌早期病变中的过表达及其作为治疗靶点的潜力 未提供具体局限性信息 系统研究胰腺导管腺癌发生过程中腺泡-导管化生与神经重塑之间的相互作用机制 小鼠ADM模型、胰腺上皮内瘤变病变、PDAC病变、小鼠及人类细胞系和组织标本 数字病理学 胰腺癌 质谱脂质组学分析、单细胞RNA测序、基因过表达/敲低、免疫组化、免疫印迹 NA 转录组数据、脂质组数据、图像数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
265 2026-05-17
Integrated multi-omics analysis reveals that MARCKS reprograms the immunosuppressive microenvironment to drive hepatocellular carcinoma progression
2026-Mar-11, NPJ precision oncology IF:6.8Q1
科研论文 通过多组学综合分析揭示MARCKS在肝细胞癌中重编程免疫抑制微环境以驱动肿瘤进展的机制 首次整合批量转录组学、单细胞RNA测序和空间转录组学,系统阐明MARCKS在肝细胞癌免疫微环境中的调控作用及其通过JAK/STAT3信号通路促进M2型巨噬细胞极化的新机制 主要依靠临床样本和细胞系实验,缺乏大规模前瞻性队列验证,MARCKS作为治疗靶点的体内药效学验证尚不充分 阐明MARCKS在肝细胞癌免疫抑制微环境中的作用机制及其作为治疗靶点的潜力 肝细胞癌患者肿瘤组织样本和肝癌细胞系 机器学习 肝细胞癌 RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多免疫荧光 NA 转录组数据, 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 免疫荧光图像 多组肝细胞癌临床样本(具体数量未在摘要中说明) NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
266 2026-05-17
COL8A1-positive cancer-associated fibroblasts are drivers of 5-fluorouracil resistance in colorectal cancer
2026-03-05, Apoptosis : an international journal on programmed cell death IF:6.1Q1
研究论文 本研究揭示了COL8A1阳性癌症相关成纤维细胞通过COL8A1/ITGB1介导的上皮间质转化轴驱动结直肠癌5-氟尿嘧啶耐药 首次鉴定出COL8A1阳性成纤维细胞亚群通过分泌COL8A1与肿瘤细胞ITGB1互作,激活EMT程序,从而驱动5-FU耐药的新机制 NA 探究特定癌症相关成纤维细胞亚群是否驱动结直肠癌对5-氟尿嘧啶的获得性耐药 结直肠癌患者样本中的癌症相关成纤维细胞和恶性细胞 数字病理学 结直肠癌 多组学分析、单细胞RNA测序、CRISPR/Cas9、siRNA干扰、异种移植、免疫化学分析 NA 多组学数据、单细胞RNA测序数据 24个结直肠癌队列 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA测序、批量RNA测序 10x Chromium, Illumina NovaSeq 10x Chromium单细胞RNA测序平台进行单细胞转录组分析
267 2026-05-17
Tumor-infiltrating natural killer cell profiling for therapeutic stratification in patients with resectable non-small cell lung cancer
2026-Mar-04, The Journal of thoracic and cardiovascular surgery IF:4.9Q1
研究论文 通过对非小细胞肺癌患者肿瘤浸润自然杀伤细胞进行分析,为治疗分层提供依据 首次鉴定出与吸烟相关的两种自然杀伤细胞亚型,并揭示其在不同治疗方案中的预测价值 待补充(摘要未明确提及局限性) 识别吸烟相关的免疫细胞决定因素,以指导非小细胞肺癌的治疗策略 可切除的非小细胞肺癌患者 机器学习 非小细胞肺癌 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA 基因表达数据 61例肺组织用于单细胞RNA测序,19例侵袭性肺腺癌用于验证,102例手术切除患者和24例新辅助治疗患者的批量RNA测序数据 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
268 2026-05-17
Diversity and immune dynamics of choroid plexus macrophages are shaped by distinct developmental origins
2026-Mar, Nature neuroscience IF:21.2Q1
研究论文 利用单细胞转录组学、谱系追踪和空间定位方法,揭示了脉络丛巨噬细胞的发育起源、生态位特化和免疫动力学特征 首次鉴定出三种生物学功能不同的脉络丛巨噬细胞亚群(CD163⁺、MHCII⁺和CD9⁺),阐明了其各自独立的造血起源、解剖定位差异及对CSF1和IL-34的差异依赖性生存机制 未具体说明,但可能包括小鼠模型与人类样本之间的潜在差异,以及神经炎症模型中细胞相互作用机制的进一步验证需求 解析脉络丛巨噬细胞的免疫异质性、发育起源及其在神经炎症中的功能动态 小鼠和人类脉络丛中的巨噬细胞 单细胞转录组学 神经炎症 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据、空间转录数据 未提供具体数量,包括小鼠脉络丛和人类脉络丛样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
269 2026-05-17
Tumoroid model recreates clinically relevant phenotypes of high grade serous ovarian cancer cells, carcinoma associated fibroblasts, and macrophages
2026-03, Acta biomaterialia IF:9.4Q1
研究论文 开发了包含HGSC癌细胞、成纤维相关间充质干细胞和巨噬细胞的三组分肿瘤类器官模型,重现了高级别浆液性卵巢癌的临床相关表型 首次构建了可调控的三组分肿瘤类器官模型,整合基质细胞与癌细胞,能更准确地模拟肿瘤微环境中的细胞间相互作用,并兼容高通量药物筛选 未明确提及模型的长期稳定性及与体内模型的完全等效性验证 研究卵巢癌肿瘤微环境中细胞间相互作用对化疗耐药、侵袭转移和干细胞表型的影响 高级别浆液性卵巢癌(HGSC)细胞系(OVCAR3、OVCAR4、OVCAR8)、原代间充质干细胞(MSCs)、U937来源的M2样巨噬细胞 数字病理学 卵巢癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 3D肿瘤类器官模型(三组分共培养) 单细胞转录组数据 包含HGSC细胞、MSCs和M2巨噬细胞的三组分肿瘤类器官,具体样本数量未说明 NA 单细胞RNA测序 NA 使用384孔悬滴阵列生成三组分肿瘤类器官,scRNA-seq分析的具体平台未提及
270 2026-05-17
Predictable clonal hierarchies from restricted progenitors provide a framework for cell type-specific therapies in glioblastoma
2026-Feb-23, bioRxiv : the preprint server for biology
research paper 通过整合高复杂性组合DNA条形码与单细胞转录组学,在IDH1野生型胶质母细胞瘤患者来源样本中解析谱系分辨的祖细胞组织架构,揭示肿瘤由多个非冗余祖细胞群体维持生长,并提出基于层级结构的细胞类型特异性联合疗法 首次在人类肿瘤微环境背景下,利用高复杂性DNA条形码与单细胞转录组学整合方法,建立了胶质母细胞瘤的谱系分辨功能模型,揭示了多祖细胞层级驱动肿瘤生长的机制,而非单一主导群体 样本量有限(9个肿瘤),且依赖体外培养和异种移植模型,可能无法完全反映体内肿瘤微环境的动态复杂性 阐明胶质母细胞瘤中细胞谱系的时间组织规律及其对肿瘤传播和治疗反应的影响 IDH1野生型胶质母细胞瘤患者来源的恶性肿瘤细胞 machine learning glioblastoma single-cell RNA-seq, DNA barcoding NA 单细胞转录组数据、DNA条形码数据 9个肿瘤的235,155个恶性细胞 10x Genomics single-cell RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
271 2026-05-17
Stable isotope tracing in human plasma-like medium reveals metabolic and immune modulation of the glioblastoma microenvironment
2026-Feb-01, Neuro-oncology IF:16.4Q1
研究论文 通过人体血浆样培养基中的稳定同位素示踪揭示胶质母细胞瘤微环境的代谢与免疫调节 在体外使用人体血浆样培养基(HPLM)结合稳定同位素示踪技术,模拟生理营养条件和完整肿瘤微环境,揭示传统培养条件下被抑制的代谢和免疫程序 未提及具体局限性,但可能包括体外模型与体内真实环境的差异 研究胶质瘤代谢在完整肿瘤微环境下的特点及其与免疫微环境的相互作用 人IDH野生型胶质母细胞瘤外植体及胶质瘤干细胞样细胞系 机器学习 胶质母细胞瘤 稳定同位素示踪, 空间转录组学 NA 文本, 图像 人胶质母细胞瘤外植体和胶质瘤干细胞样细胞系(具体数量未提供) NA 空间转录组学 NA NA
272 2026-05-17
Progenitor CD8+ T cells and hyper-Treg crosstalk: a driver of immune checkpoint inhibitor resistance in esophageal squamous cell carcinoma
2026-01-12, Apoptosis : an international journal on programmed cell death IF:6.1Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序研究食管鳞状细胞癌中免疫检查点抑制剂耐药机制,揭示祖细胞CD8+ T细胞与超强Treg之间的相互作用 首次发现抗原递呈恶性上皮细胞与T细胞之间的交互作用在食管鳞癌免疫检查点抑制剂耐药中的关键作用,以及超强Treg通过CLEC2C-KLRB1轴调节CD8 T细胞活化的新机制 基于公开数据库的scRNA-seq数据,样本量有限(24例),且缺乏功能性验证实验 阐明食管鳞状细胞癌中肿瘤抗原呈递和肿瘤微环境内细胞间相互作用如何驱动免疫检查点抑制剂耐药 接受化疗和免疫检查点抑制剂治疗的食管鳞状细胞癌患者 机器学习 食管鳞状细胞癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 24例食管鳞癌患者 NA 单细胞RNA测序 NA NA
273 2026-05-17
Patient-derived liver organoids recapitulate liver epithelial heterogeneity and enable precision modeling of alcohol-related liver disease
2026-01, Journal of hepatology IF:26.8Q1
研究论文 本研究开发了一种从酒精性肝病患者肝脏穿刺活检样本中衍生的类器官模型,该模型能够重现肝上皮异质性,并用于酒精性肝病的精准建模 首次从酒精性肝病患者的穿刺活检样本中生成类器官,并证明其能捕捉肝上皮细胞的异质性和疾病阶段特异性特征,从而为个性化疾病建模和药物测试提供新的平台 未提及具体局限性 开发一种能够捕捉肝上皮异质性和患者特异性特征的人类模型,以推进酒精性肝病的精准建模和个性化治疗 酒精性肝病患者的穿刺活检样本及其衍生的类器官 数字病理学 酒精性肝病 单细胞RNA测序、免疫荧光 类器官模型 图像、文本 早期阶段患者28例,晚期阶段患者34例 NA 单细胞RNA测序 NA NA
274 2026-05-17
Integrative bioinformatic analysis prioritizes TIMP1 and FN1 as angiogenesis-related candidate genes in diabetic foot ulcers
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 通过整合生物信息学分析,优先识别TIMP1和FN1作为糖尿病足溃疡中血管生成相关的候选基因 首次将批量转录组数据、机器学习基因优先级排序和单细胞RNA测序相结合,系统表征糖尿病足溃疡中血管生成损伤相关的分子特征 FN1 mRNA表达下降趋势未达到统计学显著性,且结论基于生物信息学探索性分析,需进一步实验验证 探索糖尿病足溃疡中与血管生成损伤和修复受损相关的分子特征 糖尿病足溃疡的转录组数据及单细胞表达模式 机器学习, 数字病理学 糖尿病足溃疡 RNA-seq, 单细胞RNA测序, 机器学习 LASSO逻辑回归模型 转录组数据, 单细胞转录组数据 使用GSE199939和GSE134431数据集(含发现队列和复制队列) NA 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
275 2026-05-17
UBE2S emerges as a key driver in an NK cell-based prognostic model for clear cell renal cell carcinoma
2026, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究整合单细胞RNA测序与多队列转录组验证,构建基于NK细胞和UBE2S的肾透明细胞癌预后模型 首次通过单细胞RNA测序揭示NK细胞亚群在ccRCC肿瘤微环境中的关键作用,并发现UBE2S作为驱动基因参与肿瘤进展;基于CoxBoost算法构建的12基因预后模型在多独立数据集中验证了高预测准确性 未提供明显的局限性信息 探索肾透明细胞癌的免疫微环境异质性,建立稳健的预后分子标志物和治疗靶点 肾透明细胞癌患者肿瘤及癌旁组织 机器学习, 数字病理学 肾细胞癌, 肾透明细胞癌 单细胞RNA测序, 转录组测序, CoxBoost, 体外敲低实验 CoxBoost, 加权基因共表达网络分析 单细胞转录组数据, 转录组数据 多队列转录组验证,具体样本数未说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
276 2026-05-17
Influence of Age on Fracture Healing in Young and Middle-Aged Mice in a Proximal Femur Fracture Model
2025-12, Journal of orthopaedic research : official publication of the Orthopaedic Research Society IF:2.1Q2
研究论文 研究年龄对年轻和中年小鼠股骨近端骨折愈合的影响 利用空间转录组学结合多重细胞因子分析,揭示了中年小鼠骨折愈合能力下降与衰老相关分泌表型(SASP)因子的关联 仅使用雄性C57BL/6J小鼠,未包括雌性小鼠及更年长小鼠,且未深入探讨SASP因子的具体分子机制 确定年龄对小鼠股骨近端骨折愈合的影响,并评估该模型是否适用于研究年龄相关性延迟骨折愈合的分子机制 12周龄(年轻)和52周龄(中年)雄性C57BL/6J小鼠 机器学习 骨质疏松, 骨折 空间转录组学, 多重细胞因子分析, μCT分析, 组织形态计量学, 免疫染色 NA 基因表达数据, 图像数据 12周龄和52周龄雄性C57BL/6J小鼠(具体数量未提及) 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium空间转录组学平台用于骨折后14天的组织分析
277 2026-05-17
ETV1 is a key regulator of enteroendocrine PYY production
2025-12-01, Disease models & mechanisms IF:4.0Q1
研究论文 本研究发现ETS变异转录因子1(ETV1)是肠内分泌L细胞中PYY产生的关键调节因子 首次揭示ETV1在L细胞中特异调节PYY表达的转录调控机制,而对GLP-1表达无影响 未明确说明 探究肠内分泌L细胞中ETV1对激素PYY和GLP-1的转录调控作用 小鼠小肠和类器官培养中的L细胞 医学 代谢疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、定量PCR NA 基因表达数据 小鼠小肠组织样本和类器官培养样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
278 2026-05-17
MIG-6 Plays a Critical Role as a PGR Mediator in Maintaining Epithelial and Stromal Cells for Uterine Receptivity
2025-Sep-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 该研究通过单细胞RNA测序探究MIG-6在子宫容受性维持中对上皮和基质细胞的调节作用 首次通过单细胞RNA测序揭示MIG-6缺失导致非容受性子宫内膜的细胞组成和功能改变,发现LRP2表达降低是MIG-6缺失和子宫内膜异位症不孕患者的共同特征 NA 评估MIG-6缺乏是否破坏子宫中特定细胞群体的复杂动态功能 子宫特异性Mig-6敲除小鼠及子宫内膜异位症不孕女性的子宫内膜细胞 数字病理学 子宫内膜异位症 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 Mig-6敲除小鼠与对照小鼠,以及子宫内膜异位症不孕女性样本 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
279 2026-05-17
Progress and new challenges in image-based profiling
2025-Aug-07, ArXiv
PMID:40799808
综述 本文综述了基于成像的表型分析在计算领域的最新进展,包括深度学习、单细胞分析及批次效应校正等技术创新,并探讨了该领域面临的主要挑战与未来方向 创新点在于系统回顾了深度学习如何重塑基于成像的表型分析流程,提升了特征提取、可扩展性和多模态数据整合能力,并借鉴单细胞转录组学方法改进了单细胞分析和批次效应校正技术 主要限制在于未广泛涵盖生物学应用细节,仅聚焦于技术演进,可能忽略实际应用中的特定问题与需求 为研究人员提供基于成像的表型分析领域进展与新挑战的技术路线图 基于成像的表型分析技术及其计算流程 计算机视觉 不适用 不适用 深度学习 图像 不适用 不适用 不适用 不适用 不适用
280 2026-05-17
TCF7 functions as a prognostic biomarker in bladder cancer by strengthening EMT and stemness associated with TGF-β/SMAD3 signaling
2025-Jul, Molecular and cellular biochemistry IF:3.5Q3
research paper 本研究探究TCF7在膀胱癌中通过调控TGF-β/SMAD3信号通路促进上皮间质转化和干性,作为预后生物标志物的作用机制 首次揭示TCF7通过转录调控TGFBR1影响TGF-β/SMAD3通路,驱动膀胱癌上皮间质转化和干性的新机制 NA 阐明TCF7在膀胱癌进展中的生物学功能和转录调控机制 膀胱癌患者样本及TCF7相关分子机制 machine learning bladder cancer 单细胞测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
回到顶部