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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2026-01-18 |
Reconstruction and analysis of the gene network regulating apoptosis in hepatocellular carcinoma based on scRNA-seq data and the ANDSystem knowledge base
2025-Dec, Vavilovskii zhurnal genetiki i selektsii
IF:0.9Q3
DOI:10.18699/vjgb-25-102
PMID:41541554
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研究论文 | 本研究基于单细胞转录组测序数据和ANDSystem知识库,重建并分析了肝细胞癌中调控肝细胞凋亡的基因网络 | 结合scRNA-seq数据和人工智能驱动的知识库,重建了肝细胞癌凋亡调控网络,并识别了未在Gene Ontology中标注为凋亡参与者的关键蛋白(如CDKN1A、ERBB2、IL8、EGR1)在凋亡中的作用 | 研究依赖于计算分析和现有知识库注释,未进行实验验证;网络重建可能受数据质量和知识库完整性的限制 | 分析肝细胞癌中凋亡过程的分子机制,识别关键调控基因和蛋白,为寻找新的治疗靶点提供依据 | 肝细胞癌中的肝细胞(肿瘤肝细胞与正常肝组织肝细胞) | 计算系统生物学 | 肝细胞癌 | 单细胞转录组测序 | 基因网络重建与分析 | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 262 | 2026-01-18 |
Loss of Intestinal Endosome-associated Protein Sorting Nexin 27 Disrupts Epithelial Barrier and Promotes Inflammation
2025-Nov-17, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101682
PMID:41260570
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研究论文 | 本研究探讨了SNX27在肠道稳态、上皮屏障完整性和炎症反应中的未知作用 | 首次揭示了SNX27在肠道中的关键功能,包括维持上皮屏障和防止炎症,并建立了肠道上皮细胞特异性SNX27敲除小鼠模型 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据来自公共数据库,需要进一步验证SNX27在人类IBD中的具体机制 | 确定SNX27在调节肠道稳态、上皮屏障完整性和炎症反应中的作用 | 人类炎症性肠病(IBD)患者数据和肠道上皮细胞特异性SNX27敲除小鼠 | NA | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 263 | 2026-01-18 |
Human iPSC-derived spinal neural progenitors enhance sensorimotor recovery in spinal cord-injured NOD-SCID mice via differentiation and microenvironment regulation
2025-Aug-22, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07961-x
PMID:40846836
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研究论文 | 本研究开发了一种通过移植人iPSC来源的脊髓神经祖细胞治疗脊髓损伤的方法,并在小鼠模型中验证了其通过促进神经元分化和调节微环境来改善感觉运动功能恢复的双重机制 | 首次利用人iPSC来源的脊髓神经祖细胞在脊髓损伤模型中同时实现神经元分化和损伤微环境调节,并通过单细胞测序技术系统揭示了细胞移植后的分化轨迹和宿主微环境的变化 | 研究在免疫缺陷小鼠模型中进行,未能完全模拟人类脊髓损伤后的免疫反应;长期安全性和疗效仍需进一步验证 | 开发基于干细胞移植的脊髓损伤治疗新策略 | 脊髓损伤的NOD-SCID小鼠模型 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序, 单核转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单核转录组学 | NA | NA |
| 264 | 2026-01-18 |
Spatial Transcriptomics Advances the Use of Canine Patients in Cancer Research: Analysis of Osteosarcoma-Bearing Pet Dogs Enrolled in a Clinical Trial
2025-Jul-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-0687
PMID:40392977
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研究论文 | 本研究首次将GeoMx犬类癌症图谱应用于骨肉瘤临床试验中犬类患者的预后相关样本,通过空间转录组学分析揭示了与疾病无进展间隔相关的基因和通路 | 首次在犬类骨肉瘤临床试验样本中应用GeoMx犬类癌症图谱进行空间转录组学分析,验证了犬类模型在人类癌症研究中的价值 | 样本量较小(n=16),仅基于疾病无进展间隔进行分组,可能未涵盖所有临床变量 | 利用犬类骨肉瘤模型研究人类骨肉瘤的分子机制和预后标志物 | 犬类骨肉瘤患者的原发性肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 16个犬类骨肉瘤样本(高DFI组8个,低DFI组8个) | NA | 空间转录组学 | GeoMx Digital Spatial Profiler | GeoMx犬类癌症图谱,用于福尔马林固定石蜡包埋组织的空间转录组分析 |
| 265 | 2026-01-18 |
Myeloid Fatty Acid Metabolism Activates Neighboring Hematopoietic Stem Cells to Promote Heart Failure With Preserved Ejection Fraction
2025-May-20, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本文通过比较患者样本和动物模型,揭示了骨髓脂肪酸代谢如何激活邻近造血干细胞,从而促进射血分数保留的心力衰竭(HFpEF)的机制 | 首次发现骨髓脂肪酸代谢通过重塑Vcam1启动子激活造血干细胞,促进HFpEF的系统性炎症和心脏舒张功能障碍 | 研究主要基于动物模型和体外实验,人类样本验证有限,且HFpEF的复杂病理机制可能涉及其他未被探索的因素 | 探究HFpEF中骨髓脂肪酸代谢对造血干细胞激活的因果机制 | HFpEF患者样本、小鼠模型、骨髓细胞和造血干细胞 | 心血管疾病 | 心力衰竭 | 流式细胞术、单细胞RNA测序、质谱分析、碳标记 | NA | 基因表达数据、代谢数据、细胞表型数据 | 患者样本和小鼠模型,具体数量未在摘要中明确 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 266 | 2026-01-18 |
The Dyson equalizer: adaptive noise stabilization for low-rank signal detection and recovery
2025-Mar, Information and inference : a journal of the IMA
DOI:10.1093/imaiai/iaae036
PMID:39830802
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研究论文 | 本文提出了一种自适应噪声稳定化方法,用于低秩信号在异方差噪声下的检测与恢复 | 开发了一种基于随机矩阵理论和Dyson方程的自适应归一化程序,能均衡数据矩阵行列间的平均噪声方差,支持广泛的噪声分布和信号结构 | NA | 解决异方差噪声环境下低秩信号检测与恢复的挑战 | 数据矩阵中的低秩信号 | 机器学习 | NA | NA | NA | 矩阵数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 267 | 2025-12-02 |
Single-cell RNA sequencing reveals tumor microenvironment characteristics in ovarian malignant Brenner tumor
2026-Mar, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2025.101635
PMID:41322338
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 268 | 2026-01-17 |
Integrative transcriptome profiling elucidates molecular and immunovascular characteristics of macrotrabecular HCC
2026-Feb-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001284
PMID:40009602
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研究论文 | 本研究通过整合大规模bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据,深入解析了肝细胞癌(HCC)中侵袭性亚型(特别是巨梁状HCC)的分子和免疫血管特征 | 整合bulk和单细胞数据细化HCC分类,首次通过基因调控网络和细胞组成分析揭示p53和MYC在侵袭性HCC中的核心作用,并在小鼠模型中验证血管靶向与免疫检查点阻断联合治疗策略 | 研究样本量相对有限(6个单细胞数据集和691个肿瘤样本),且主要基于转录组数据,可能未涵盖其他分子层面的异质性 | 阐明肝细胞癌侵袭性亚型的分子机制和肿瘤微环境特征,探索潜在治疗策略 | 肝细胞癌(HCC)肿瘤细胞、免疫细胞及小鼠模型 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、bulk RNA测序、基因调控网络分析、基因集富集分析 | NA | RNA-seq数据(单细胞和bulk)、小鼠模型数据 | 228,564个活细胞(来自6个scRNA-seq数据集)和691个肿瘤样本(bulk RNA-seq) | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 269 | 2026-01-17 |
Hepatic CD4 T Cells Predict Hepatocellular Carcinoma Risk on Metabolic Dysfunction-Associated Steatohepatitis Patients
2026-Feb, United European gastroenterology journal
IF:5.8Q1
DOI:10.1002/ueg2.70159
PMID:41386633
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研究论文 | 本研究通过分析MASH患者的肝活检样本,发现CD4+ T细胞浸润增加与HCC风险相关,并结合临床参数构建了预测模型 | 首次在MASH患者中鉴定出CD4+ T细胞浸润作为HCC风险的预测性免疫标志,并开发了结合免疫和临床变量的高精度预测模型 | 样本量较小(预HCC组n=10,对照组n=13),且为回顾性研究,需要更大规模的前瞻性验证 | 识别MASH患者发展为HCC的预测性免疫特征 | MASH患者的肝活检样本 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 多重免疫组化,单细胞RNA测序 | 预测模型(基于逻辑回归或类似方法) | 图像,基因表达数据 | 23例MASH患者肝活检样本(预HCC组10例,对照组13例) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 270 | 2026-01-17 |
Crotonylation and the Risk of Head and Neck Cancer: Insights from a Two-Sample Mendelian Randomization Study
2026-Feb, International dental journal
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.identj.2025.109341
PMID:41447823
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研究论文 | 本研究通过两样本孟德尔随机化分析,探讨了巴豆酰化相关基因表达与头颈癌风险的潜在因果关系 | 首次利用孟德尔随机化方法评估巴豆酰化相关基因对头颈癌风险的因果影响,并结合单细胞RNA测序和代谢组学数据进行多维度验证 | 研究结果仍需通过共定位分析和功能实验进一步验证,且未发现显著的代谢物中介效应 | 探究巴豆酰化相关基因表达与头颈癌风险之间的因果关系 | 头颈癌患者及正常组织样本 | 生物信息学 | 头颈癌 | 两样本孟德尔随机化、单细胞RNA测序、定量PCR、代谢组学分析 | 孟德尔随机化模型 | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、代谢组数据 | TCGA数据集中的头颈癌样本及正常组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 271 | 2026-01-17 |
Characterising the Periodontal Granulation Tissue Using scRNAseq
2026-Feb, Journal of clinical periodontology
IF:5.8Q1
DOI:10.1111/jcpe.70048
PMID:41055332
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了牙周肉芽组织的细胞组成和分子机制,旨在加深对牙周病发病机制的理解并识别再生治疗的潜在靶点 | 发现了一种新型内皮细胞亚群,该亚群特异性表达NOTCH3并参与骨化通路,为牙周病发病机制提供了新见解 | 样本量较小(n=3),可能限制结果的普遍性 | 研究牙周肉芽组织的细胞组成和分子机制,以理解牙周病发病机制并识别再生治疗的潜在靶点 | 牙周肉芽组织样本 | 数字病理学 | 牙周病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 3例牙周手术患者的肉芽组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 272 | 2026-01-17 |
Circadian Control of Neutrophils Drives Collateral Perfusion and Stroke Outcome
2026-Jan-16, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.326438
PMID:41293815
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研究论文 | 本研究探讨了昼夜节律如何通过调控中性粒细胞功能影响侧支灌注和卒中结局 | 首次揭示中性粒细胞的昼夜节律性活动通过调控NET形成影响卒中侧支灌注,为卒中治疗提供了新的时间依赖性治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型,人类患者数据为观察性关联分析,需进一步验证因果机制 | 探究昼夜节律调控中性粒细胞功能对卒中侧支灌注和临床结局的影响机制 | 小鼠卒中模型和540例缺血性卒中患者 | 神经科学 | 卒中 | 流式细胞术、单细胞RNA测序、共聚焦显微镜、激光散斑成像 | NA | 基因表达数据、影像数据、临床数据 | 小鼠模型及540例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 273 | 2026-01-17 |
A gene-expression module identifies circulating immune cells with enhanced recruitment to sites of inflammation
2026-Jan-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.114227
PMID:41531734
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研究论文 | 本研究通过纵向单细胞转录组学分析,在肾移植受者外周血中发现了一个保守的基因模块ALARM,该模块协调免疫细胞向炎症部位的招募和效应功能 | 首次鉴定出ALARM基因模块,该模块整合了转录因子、归巢受体和早期激活标志物,揭示了其在免疫细胞招募和代谢重编程中的核心作用 | 研究主要基于肾移植受者和动物模型,在更广泛人群中的普适性有待进一步验证 | 探究循环免疫细胞基因表达程序如何影响其向炎症组织的招募过程 | 肾移植受者的外周血免疫细胞、移植排斥组织、猪模型以及公共数据集中的健康个体和感染患者 | 单细胞转录组学 | 肾脏移植排斥、COVID-19感染、肺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 肾移植受者外周血样本、移植排斥组织、猪模型及公共数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 274 | 2026-01-17 |
CD19 CAR T-Cell Therapy for Autoimmune Hemolytic Anemia
2026-Jan-15, The New England journal of medicine
DOI:10.1056/NEJMoa2509820
PMID:41534043
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研究论文 | 本研究评估了CD19 CAR T细胞疗法在治疗多药难治性自身免疫性溶血性贫血患者中的安全性和有效性 | 首次将CD19 CAR T细胞疗法应用于多药难治性自身免疫性溶血性贫血患者,并进行了多组学分析以探索复发机制 | 样本量较小(仅11例患者),且随访时间中位数为12.2个月,长期疗效和安全性尚需进一步观察 | 评估CD19 CAR T细胞疗法在多药难治性自身免疫性溶血性贫血患者中的安全性和疗效 | 多药难治性自身免疫性溶血性贫血患者 | NA | 自身免疫性溶血性贫血 | 流式细胞术、单细胞RNA测序、配对B细胞受体测序 | NA | 临床数据、多组学数据 | 11例患者(5例来自同情使用项目,6例来自1期研究) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 275 | 2026-01-17 |
scII: Dual-Threshold Adaptive Integration of Single-Cell Multiomics Data Driven by Imputation
2026-Jan-15, Journal of chemical information and modeling
IF:5.6Q1
DOI:10.1021/acs.jcim.5c02396
PMID:41537610
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研究论文 | 本文提出了一种名为scII的自适应框架,用于整合单细胞多组学数据,特别是scRNA-seq和scATAC-seq数据,以解决现有方法在准确性、可解释性和可扩展性方面的挑战 | scII框架引入了多项关键创新:scRNA-seq引导的信号插补以增强scATAC-seq信息完整性;使用带Maxout激活函数的多层感知器建模复杂非线性关系并缓解梯度消失问题;动态双阈值自适应选择机制联合评估跨模态特征相似性和分类可靠性以选择高质量细胞;以及基于贝叶斯信息准则的优化动态确定高斯混合模型组件数量,消除对预设参数的依赖 | NA | 开发一个自适应框架以高效整合未配对的单细胞RNA测序和染色质可及性测序数据,并实现细胞类型注释的准确转移 | 单细胞多组学数据,包括基因表达数据和染色质可及性数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 | 多层感知器,高斯混合模型 | 基因表达数据,染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 276 | 2026-01-17 |
Transient ER stress cell-autonomously promotes beta cell cycling in mice
2026-Jan-15, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-025-06649-3
PMID:41537777
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型发现,短暂的内质网应激可自主促进β细胞增殖,为糖尿病治疗提供了新的潜在策略 | 首次揭示了转基因过表达、内质网应激、葡萄糖与β细胞周期激活之间的关联,并证明短暂内质网应激可独立于血管恢复促进β细胞增殖 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中验证;且内质网应激诱导的长期效应和安全性仍需进一步评估 | 探究内分泌胰腺实验性低血管化恢复是否能触发小鼠β细胞增殖 | 转基因小鼠模型中的胰腺β细胞 | 糖尿病研究 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序,定量RT-PCR,免疫染色,BrdU/Edu标记 | 转基因小鼠模型 | 基因表达数据,图像数据 | 未明确指定样本数量,但使用了转基因小鼠模型和体外胰岛实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 277 | 2026-01-17 |
Single-cell atlas of axial skeletal immune-matrix interaction in spondylitis
2026-Jan-15, Immunologic research
IF:3.3Q3
DOI:10.1007/s12026-025-09743-1
PMID:41537924
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学技术,构建了强直性脊柱炎患者中轴骨骼的免疫-基质相互作用图谱,揭示了致病性细胞毒性T淋巴细胞与基质成纤维细胞之间的相互作用轴 | 首次在强直性脊柱炎患者的中轴骨骼组织中,通过整合单细胞RNA-seq和ATAC-seq技术,在空间和基质背景下解析了细胞毒性T淋巴细胞与骨基质微环境的原位相互作用 | 研究样本来源于手术患者,可能无法完全代表疾病早期阶段;研究为横断面设计,因果关系需进一步验证 | 解析强直性脊柱炎中轴骨骼受累的免疫-基质相互作用机制 | 强直性脊柱炎患者和年龄匹配对照者的中轴骨骼组织(椎体骨髓、附着点纤维软骨、邻近终板基质组织) | 单细胞多组学 | 强直性脊柱炎 | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | 整合聚类分析、差异基因表达分析、染色质可及性分析、拟时序轨迹分析、配体-受体网络推断 | 单细胞转录组数据、单细胞表观基因组数据 | 24名活动性强直性脊柱炎患者和12名年龄匹配对照者,共108,752个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 278 | 2026-01-17 |
Subventricular zone radial glial cells maintain inhibitory neuron production in the human brain
2026-Jan-15, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adw1803
PMID:41538440
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研究论文 | 本研究通过空间和单细胞转录组学分析人脑中内侧神经节隆起,揭示了抑制性神经元生成的进化独特性机制 | 发现了人脑室下区存在一种进化上独特的放射状胶质细胞祖细胞类型,该细胞在整个大脑发育过程中持续产生抑制性神经元和胶质细胞 | NA | 探究人类抑制性神经元生成的机制及其在脑进化中的独特性 | 人脑中内侧神经节隆起(hMGE)及其衍生的细胞 | 单细胞组学 | NA | 空间转录组学, 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 279 | 2026-01-17 |
Targeting the CMKLR1-Mediated Signaling Rebalances Immunometabolism State in Middle-Age Testicular Macrophages
2026-Jan-15, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202515166
PMID:41538650
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了CMKLR1介导的巨噬细胞代谢重编程在中年睾丸免疫代谢失衡中的作用,并验证了CMKLR1作为治疗靶点 | 首次在人和小鼠睾丸中鉴定出保守的CD206MHCII巨噬细胞亚群,并发现CMKLR1介导的代谢重编程导致其向糖酵解和促炎状态转变,进而损害精子发生 | NA | 探究脂肪介导的信号如何与局部睾丸免疫相互作用,以及CMKLR1在调节睾丸免疫代谢平衡中的作用 | 人和小鼠的睾丸组织,特别是其中的巨噬细胞亚群 | NA | 男性性腺功能减退症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 280 | 2026-01-17 |
Single-Cell Profiling of ANKRD26 Thrombocytopenia Reveals Progenitor Expansion and Polyploid Apoptosis via JUNB-p21
2026-Jan-15, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025030017
PMID:41538704
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和功能分析,揭示了ANKRD26相关血小板减少症的病理机制,包括巨核细胞祖细胞扩增和多倍体巨核细胞凋亡 | 首次在多个患者中整合单细胞转录组学与功能分析,发现ANKRD26通过JUNB-p21轴诱导多倍体巨核细胞凋亡,独立于经典p53-PIDDosome通路 | 样本量较小(仅四名患者),且巨核细胞稀有、脆弱且异质性强,可能限制统计效力 | 探究ANKRD26相关血小板减少症的细胞和分子机制,以理解缺陷的巨核细胞生成 | ANKRD26相关血小板减少症患者的骨髓样本,包括CD34⁺造血干细胞和祖细胞以及原代巨核细胞 | 数字病理学 | 血小板减少症 | 单细胞转录组学,空间转录组学,共聚焦成像 | NA | 单细胞RNA-seq数据,空间转录组数据,成像数据 | 四名独立患者,分析包括47,281个THC2-HSPCs与51,907个对照细胞,以及7,309个THC2-pMKs与5,077个对照细胞 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |