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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2026-05-31 |
Epac1 deletion attenuates Müller glial pathological activation and mitigates retinal neurodegeneration in ischemia-induced retinopathy
2026-Jun, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.09.031
PMID:40976555
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研究论文 | 本研究探讨了Epac1基因敲除在缺血诱导视网膜病变中减轻穆勒胶质细胞病理激活和视网膜神经退行性变的作用及其机制 | 首次揭示Epac1通过调节穆勒细胞中VEGF信号促进OIR小鼠模型视网膜神经退行性变的新角色 | 仅使用小鼠OIR模型,未在人类样本中验证;Epac1敲除对血管修复的影响机制仍需进一步研究 | 研究Epac1在缺血诱导视网膜病变中的作用及其分子机制 | 小鼠氧诱导视网膜病变模型中的视网膜神经元和穆勒胶质细胞 | 数字病理学 | 视网膜病变 | 单细胞RNA测序,免疫染色,qPCR,Western blot,邻近连接实验 | NA | 基因表达数据,图像数据 | 小鼠模型,未明确样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞RNA测序使用10x Chromium平台 |
| 262 | 2026-05-31 |
Single-Cell RNA Sequencing Informs Precision Targeting of Monogenic Lupus Associated With IKZF1 Haploinsufficiency
2026-Jun, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.70017
PMID:41392616
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序分析IKZF1单倍剂量不足所致的单基因狼疮患者的免疫失调机制 | 首次通过单细胞RNA测序揭示IKZF1单倍剂量不足导致Breg细胞几乎完全缺失和幼稚CD4+ T细胞比例增加,并识别出与狼疮相关的基因模块 | 研究仅基于一例单基因狼疮患者,样本量有限,结论的普适性需进一步验证 | 探究IKZF1单倍剂量不足导致单基因狼疮的免疫失调机制 | IKZF1单倍剂量不足患者、无已知基因突变的狼疮患者和健康对照者的外周免疫细胞 | 机器学习 | 狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 1例IKZF1单倍剂量不足患者,若干狼疮患者和健康对照者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 263 | 2026-05-31 |
Integrative Single-Cell RNA Sequencing and Spatial Transcriptomics Uncover Distinct Fibroblast-Macrophage Crosstalk in Human Hip Synovium Between Patients With Femoroacetabular Impingement and Osteoarthritis
2026-Jun, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.70033
PMID:41524472
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学,揭示股骨髋臼撞击症与骨关节炎患者人类髋关节滑膜中独特的成纤维细胞-巨噬细胞相互作用 | 首次在髋关节滑膜中识别出EREG+衬里成纤维细胞与COL1A1+IGFBP5+纤维化巨噬细胞之间的FGF2-SDC4特异性相互作用,并发现EREG+CCL20+MMP3hi衬里成纤维细胞是髋关节骨关节炎特有的细胞类型 | 样本量较小(每种疾病6例),且未进行功能验证实验来确认FGF2-SDC4相互作用的因果关系 | 探究股骨髋臼撞击症和髋关节骨关节炎中滑膜细胞组成、转录组谱及细胞-细胞相互作用的改变 | 股骨髋臼撞击症和髋关节骨关节炎患者的髋关节滑膜组织 | 自然语言处理 | 骨关节炎, 股骨髋臼撞击症 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 伪时间分析 | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 12例(每组6例,性别匹配) | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 264 | 2026-05-31 |
A systems biology framework uncovers multi-level genetic regulation of dizziness/vertigo through eQTL-GWAS integration and single-cell analysis
2026-Jun, The International journal of neuroscience
DOI:10.1080/00207454.2026.2627258
PMID:41640369
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研究论文 | 通过整合eQTL-GWAS和单细胞分析,构建系统生物学框架揭示头晕/眩晕的多层次遗传调控机制 | 首次将GWAS与脑单细胞类型、免疫细胞等多种组织的eQTL数据整合,并结合听觉神经单细胞RNA测序来解析头晕/眩晕的因果基因和细胞类型特异性调控网络 | 未明确提及具体局限性,但可能受限于样本来源的异质性和因果推断的统计效力 | 阐明头晕/眩晕的分子遗传机制并发现潜在治疗靶点 | 头晕/眩晕的遗传因果基因及其在单细胞类型中的表达调控 | 机器学习 | 神经系统疾病 | eQTL分析、GWAS、孟德尔随机化、共定位分析、单细胞RNA测序、伪时间轨迹分析、基因-基因相互作用网络、药物靶点筛选 | NA | 基因组数据、单细胞转录组数据、文本数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序系统用于听觉神经单细胞转录组分析 |
| 265 | 2026-05-31 |
Integrating bulk and single-cell transcriptome profiling to uncover diagnostic biomarkers and regulatory mechanisms of oxidative stress in spinal cord injury
2026-Jun-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-00693
PMID:41673791
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研究论文 | 整合批量转录组和单细胞转录组分析,揭示脊髓损伤中氧化应激的诊断标志物和调控机制 | 首次通过整合批量与单细胞转录组数据,系统识别脊髓损伤中与氧化应激相关的诊断标志物、动态表达模式及调控网络,并筛选潜在治疗药物 | 仅基于GEO数据库的人类血液样本和小鼠脊髓组织数据,缺乏独立临床队列验证;结果需进一步在人体组织中确认 | 探索氧化应激相关基因在脊髓损伤中的表达与调控机制,以改善诊断和治疗 | 人类血液样本(来自GEO数据库)和损伤小鼠脊髓组织 | 计算机视觉, 自然语言处理, 机器学习, 数字病理学 | 脊髓损伤 | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, 免疫荧光, 定量聚合酶链反应 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 来自GEO数据库的人类血液样本和损伤小鼠脊髓组织(具体样本量未提及) | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 266 | 2026-05-31 |
Single-Cell Analysis Reveals Peripheral Helper T Cells in Rheumatoid Arthritis-Related Interstitial Lung Disease
2026-Jun, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.70066
PMID:41629202
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research paper | 通过单细胞RNA测序分析类风湿关节炎相关间质性肺病的细胞和转录组特征,发现外周辅助T细胞在疾病中的独特作用 | 首次揭示类风湿关节炎相关间质性肺病肺部存在外周辅助T细胞,并发现肺组织Tph细胞与滑膜Tph细胞在激活、细胞毒性和耗竭特征上存在器官特异性差异 | NA | 阐明类风湿关节炎相关间质性肺病的上皮细胞和免疫细胞的细胞及转录组景观 | 类风湿关节炎相关间质性肺病患者的肺组织上皮细胞和免疫细胞 | machine learning | 类风湿关节炎相关间质性肺病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 4名对照者、3名非类风湿关节炎结缔组织病相关间质性肺病患者和5名类风湿关节炎相关间质性肺病患者的肺组织样本 | NA | single-cell RNA-seq | NA | 荧光激活细胞分选后对上皮细胞和免疫细胞进行单细胞RNA测序 |
| 267 | 2026-05-31 |
High MAP3K6 expression in spinal cord injury tissues enhances neuronal apoptosis: insights from multi-omics data integrating WGCNA, machine learning and experimental validation
2026-Jun, The International journal of neuroscience
DOI:10.1080/00207454.2026.2639364
PMID:41782555
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研究论文 | 通过整合多组学数据、WGCNA、机器学习和实验验证,发现MAP3K6高表达促进脊髓损伤后神经元凋亡 | 首次结合生物信息学分析与实验验证,系统揭示MAP3K6在脊髓损伤中作为关键调控因子及其诊断和治疗靶点潜力 | 研究基于公共数据库和体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证及更大样本人群确认 | 识别脊髓损伤的潜在生物标志物和治疗靶点 | 脊髓损伤组织及小鼠脊髓神经元细胞 | 机器学习 | 脊髓损伤 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 随机森林, WGCNA | 基因表达数据 | GSE226238数据集包含脊髓损伤与对照样本,GSE151371验证集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 268 | 2026-05-31 |
SMAD7 Downregulation Promotes Ferroptosis in Pulmonary Arterial Hypertension Via the TGF-β1-SMAD2/3 Pathway
2026-Jun-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002832
PMID:41886369
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研究论文 | 本研究整合单细胞转录组测序、蛋白质组学和孟德尔随机化方法,探讨SMAD7通过TGF-β1-SMAD2/3通路调控肺动脉高压中铁死亡的机制 | 首次揭示SMAD7作为铁死亡负调控因子参与肺动脉高压肺血管重塑,并整合多组学与孟德尔随机化方法提供多层次证据 | 仅提供初步证据,需进一步验证SMAD7在不同PAH模型中的普适性及长期治疗效果 | 阐明肺动脉高压中铁死亡的调控机制及SMAD7的作用 | 肺动脉内皮细胞、单细胞转录组数据、蛋白质组数据、PAH大鼠模型和缺氧诱导的PAEC模型 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞转录组测序、蛋白质组学、孟德尔随机化 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质组数据 | 单细胞转录组测序数据(具体数量和来源未提供)、大鼠模型和细胞模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 269 | 2026-05-31 |
Innate lymphoid cells in rheumatoid arthritis as mediators of pathology and resolution
2026-Jun, Nature reviews. Rheumatology
DOI:10.1038/s41584-026-01375-5
PMID:42115769
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研究论文 | 探讨先天淋巴样细胞在类风湿关节炎中作为病理和缓解中介的作用 | 首次系统综述ILC亚群在RA中的双重作用,包括ILC3促进炎症和ILC2促进修复,并探讨CAR-ILC2等新型细胞疗法 | 该领域仍处于临床前阶段,缺乏大规模临床验证 | 阐明先天淋巴样细胞在类风湿关节炎病理与缓解中的调控机制及治疗潜力 | 先天淋巴样细胞及其亚群(ILC2、ILC3、LTi细胞) | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 高维免疫表型分析、空间转录组学、单细胞多组学 | NA | 图像、文本 | NA | 10x Genomics | 单细胞多组学, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium Single Cell 3', 10x Visium FFPE |
| 270 | 2026-05-31 |
Single-cell transcriptomics reveals a differential response of human bronchial epithelial cell-types to cadmium chloride
2026-Jun, Archives of toxicology
IF:4.8Q1
DOI:10.1007/s00204-026-04344-9
PMID:41807791
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研究论文 | 利用单细胞转录组学分析氯化镉暴露下人支气管上皮细胞类型的差异性反应 | 首次在单细胞分辨率下揭示了氯化镉暴露对人类支气管上皮不同细胞类型的特异性转录组响应,发现了传统整体分析无法捕捉的细胞类型特异性特征 | 仅使用了三个独立供体样本,且只分析了急性暴露反应,未探讨长期暴露效应 | 评估单细胞转录组学在分析复杂组织中毒物响应中的附加价值,并细化不良结局通路 | 人类支气管上皮细胞(包括多纤毛细胞、分泌细胞和基底细胞) | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 3个独立供体的完全分化黏液纤毛上皮,共18,255个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 271 | 2026-05-31 |
Single-Cell RNA-Seq Combined With Bulk RNA-Seq Revealed the Involvement of Pancreatic Cancer Tissue-Resident Macrophages in Tumour Progression and the Immunotherapy Response
2026-Jun, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.71212
PMID:42210511
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,探究胰腺癌组织驻留巨噬细胞在肿瘤进展和免疫治疗反应中的作用 | 首次通过整合scRNA-seq和bulk-seq数据,鉴定出特定的组织驻留巨噬细胞亚群,并建立TAM评分系统,揭示TRM_C4亚群对免疫治疗反应的预测价值 | NA | 阐明胰腺癌组织驻留巨噬细胞的异质性及其在肿瘤进展和免疫治疗反应中的功能角色 | 胰腺癌细胞和组织中的巨噬细胞,特别是组织驻留巨噬细胞亚群 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | Illumina | 单细胞RNA测序 | Illumina NovaSeq | NA |
| 272 | 2026-05-31 |
Abnormal Stress Reduced miR-330 Supplementation Alleviates Osteoarthritis Progression by Suppressing Osteochondral Catabolism
2026-Jun, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70553
PMID:42212804
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研究文章 | 该研究揭示miR-330在异常机械应力下表达降低,并通过抑制CTGF、FGFR1、EPOR及炎症因子缓解骨关节炎进展,补充miR-330具有治疗作用 | 首次发现miR-330作为机械响应性miRNA在骨关节炎中发挥保护作用,并揭示其在软骨细胞和破骨细胞中的双重调控机制 | 未明确说明研究局限性 | 探索异常机械应力下调控骨关节炎进展的关键因子,特别是miR-330的作用及治疗潜力 | 颞下颌关节紊乱病患者滑液、骨关节炎临床标本及动物模型中的软骨和软骨下骨组织 | 机器学习 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 96名颞下颌关节紊乱病患者滑液样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 273 | 2026-05-31 |
Glutathione peroxidase 3 preserves hepatocyte mitochondrial quality control to enhance macrophage pro-regenerative phenotype during liver regeneration
2026-Jun, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70695
PMID:42216503
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研究论文 | 本文研究了谷胱甘肽过氧化物酶3在肝再生过程中通过维持线粒体质量控制并促进巨噬细胞促再生表型的作用机制 | 首次揭示GPX3通过结合VDAC1抑制其寡聚化,恢复线粒体钙离子稳态和质量控制,并防止线粒体DNA释放介导的cGAS-STING通路过度激活,从而促进肝再生 | 主要基于小鼠模型,人类肝再生中的机制仍需进一步验证 | 探究肝细胞中GPX3在肝再生中的作用及分子机制 | 小鼠肝细胞和巨噬细胞 | 机器学习 | 肝再生相关疾病 | 单细胞RNA测序、免疫共沉淀-质谱分析、MitoCarta3.0分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质互作数据 | 70%部分肝切除小鼠模型,具体样本数未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 274 | 2026-05-31 |
A clinically relevant SLC2A1-associated malignant epithelial cell state predicts prognosis and immunotherapy response in lung adenocarcinoma
2026-May-29, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-026-01897-x
PMID:42209795
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研究论文 | 该研究通过整合多组学分析,在肺腺癌中识别出一种与预后和免疫治疗反应相关的SLC2A1阳性恶性上皮细胞状态 | 首次利用整合多组学方法结合Scissor算法,在肺腺癌中鉴定出与预后和免疫治疗反应相关的恶性上皮细胞状态,并构建了基于该状态的风险评分模型SERS | 主要依赖于公开数据集和回顾性分析,功能性实验验证范围有限,SLC2A1-CAF-胶原信号轴的机制尚未完全阐明 | 探索肺腺癌中恶性上皮细胞异质性对预后和免疫治疗反应的影响 | 肺腺癌患者肿瘤组织样本(包括单细胞、空间转录组和批量转录组数据) | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、批量转录组分析 | Scissor算法、风险评分模型 | 基因表达数据、空间转录组数据 | 多个独立队列,包含免疫治疗数据集 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、批量RNA测序 | NA | NA |
| 275 | 2026-05-31 |
A gene signature derived from leukemia associated macrophages provides a compelling risk stratification for human AML patients
2026-May-29, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-026-00944-w
PMID:42210435
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研究论文 | 本研究基于FGFR1驱动的小鼠白血病模型,鉴定出白血病相关巨噬细胞(LAMs)的32个基因特征,并将其应用于人类AML患者的风险分层 | 首次利用单细胞RNA测序分析白血病相关巨噬细胞,开发出32基因特征评分系统,并将其整合到现有的欧洲白血病网风险分组标准中,为AML风险分层提供了独立的预后价值 | 未提及 | 开发一个基于白血病相关巨噬细胞基因特征的评分系统,用于急性髓系白血病患者的风险分层 | FGFR1驱动的小鼠白血病模型和838名新诊断的AML患者(接受CALGB/Alliance治疗方案) | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 838名新诊断的AML患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 276 | 2026-05-31 |
Mesenchymal Stromal Cell-Mediated Intercellular Communication: Mapping the Interactome for Skeletal Muscle Homeostasis and Regeneration
2026-May-29, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202507444
PMID:42210793
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研究论文 | 构建间充质基质细胞在骨骼肌稳态和再生过程中的相互作用图谱 | 采用系统生物学方法整合单细胞RNA测序图谱与先进计算分析,构建了全面的FAP相互作用组 | 未提及具体局限性 | 解析FAP在骨骼肌稳态和再生中的调控信号网络 | 骨骼肌中的纤维脂肪生成祖细胞(FAPs) | machine learning | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 277 | 2026-05-31 |
Single-cell analyses of tissue regeneration in two true jellyfish
2026-May-29, Molecular biology and evolution
IF:11.0Q1
DOI:10.1093/molbev/msag128
PMID:42212572
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序分析两种真水母(亚洲月水母和火焰海蜇)在截肢后的钟状体组织重塑/再生过程,揭示了12个细胞类群及其标记基因和信号通路 | 首次通过单细胞RNA测序技术在两种真水母中系统描绘细胞类型图谱,鉴定出保守的转录因子和Wnt/β-catenin信号通路,并发现两种保守的序贯激活模式 | 研究侧重于基因表达层面的分析,未涉及蛋白质或代谢层面的验证;物种特异性基因的功能尚未通过实验验证 | 阐明真水母再生的分子机制和细胞类型动态变化,揭示物种特异性遗传网络的进化 | 亚洲月水母(Aurelia coerulea)和火焰海蜇(Rhopilema esculentum)的钟状体组织 | 单细胞生物学、进化发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 两种水母物种的钟状体组织(具体样本量未在摘要中明确提及) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 278 | 2026-05-31 |
Network Pharmacological Analysis of Lentinan in Regulating Intervertebral Disc Degeneration: Combined with Machine Learning-Based Screening and Molecular Dynamics Validation
2026-May-29, Omics : a journal of integrative biology
IF:2.2Q3
DOI:10.1177/15578100261454407
PMID:42212606
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研究论文 | 整合网络药理学、机器学习、分子对接和分子动力学模拟,探究香菇多糖(LNT)调控椎间盘退变(IVDD)的分子机制 | 首次结合网络药理学与三种机器学习方法筛选核心靶点,并通过单细胞转录组虚拟敲除评估关键基因扰动对细胞状态和信号网络的重塑 | 未知 | 阐明香菇多糖治疗椎间盘退变的分子机制 | 椎间盘退变相关基因和香菇多糖作用靶点 | 机器学习 | 椎间盘退变 | 网络药理学、机器学习、分子对接、分子动力学模拟、单细胞转录组分析 | 机器学习模型(具体类型未提及) | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 数据集GSE176205共16361个潜在IVDD相关基因,97个LNT相关靶点 | 未提及 | 转录组测序 | 未提及 | 未提及 |
| 279 | 2026-05-31 |
MAL2 drives hepatocellular carcinoma progression by recruiting regulatory T cells via CCL22 and inducing the immunosuppressive microenvironment
2026-May-29, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2026095
PMID:42212623
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研究论文 | 研究MAL2通过CCL22招募调节性T细胞诱导免疫抑制微环境促进肝细胞癌进展的机制 | 首次阐明MAL2在肝细胞癌中通过CCL22介导的Treg招募驱动免疫抑制微环境形成,并提出其作为潜在治疗靶点 | 未在更多临床样本或体内模型中验证MAL2的机制,且缺乏对MAL2下游信号通路的深入解析 | 探讨MAL2在肝细胞癌中的功能角色及促进肿瘤进展的分子机制 | 肝细胞癌恶性细胞、Hep-3B和HCC-LM3细胞系、H22细胞皮下肿瘤模型 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、质谱流式、ELISA、免疫荧光染色 | NA | 单细胞基因表达数据、质谱流式数据 | 公开单细胞RNA测序数据(来源未明确);细胞系实验;小鼠皮下肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA-seq、质谱流式 | NA | NA |
| 280 | 2026-05-31 |
JUN Specifies the Local Differentiation and Maintenance of Pro-tumoral Monocyte-Derived Macrophages
2026-May-29, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-3974
PMID:42212681
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研究论文 | 本文发现AP-1因子JUN在单核细胞来源巨噬细胞的分化和维持中起关键作用,并指定促肿瘤营养功能,为癌症选择性靶向治疗提供新机会 | 首次明确JUN在单核细胞来源巨噬细胞分化和维持中的特异性作用,并揭示其与免疫调节功能的独立性 | 未提及具体局限性 | 探究JUN在肿瘤相关巨噬细胞分化中的作用及促肿瘤功能的分子机制 | 肿瘤相关巨噬细胞(包括常驻组织巨噬细胞和单核细胞来源巨噬细胞) | 机器学习 | 癌症 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |