单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
261	2025-09-13	Canonical Wnt Pathway Enhanced Dental Pulp Mesenchymal Stem Cells-Mediated Cementum Regeneration 2025-Oct, Journal of oral rehabilitation IF:3.1Q1 DOI:10.1111/joor.14001 PMID:40369784	研究论文	本研究探讨了经典Wnt通路增强牙髓间充质干细胞介导的牙骨质再生的分子机制	发现Wnt3a通过激活经典Wnt通路促进DPSCs的牙骨质生成分化，揭示了非经典Wnt通路限制再生效率的新机制	NA	阐明Wnt信号通路在牙骨质再生中的表达差异和功能机制	牙髓间充质干细胞(DPSCs)、牙骨质、牙髓和牙周组织	组织再生医学	牙周组织疾病	RNA Smart转录组测序、单细胞测序、western blotting	NA	基因表达数据、蛋白质数据	NA
262	2025-09-13	Precision Medicine in Surgery: Immunomodulation and Cellular Regeneration Strategies for Immunologic and Surgical Diseases 2025-Oct-01, Annals of surgery IF:7.5Q1 DOI:10.1097/SLA.0000000000006849 PMID:40698837	研究论文	本文提出了一种研究lacritin肽对β细胞增殖、胰岛存活和免疫调节作用的方法学框架	结合体外和体内模型系统研究lacritin肽的双重免疫调节和再生功能	NA	探索精准医疗在免疫和外科疾病中的应用，特别是lacritin肽的治疗潜力	胰岛细胞、免疫细胞、糖尿病小鼠模型	精准医疗	自身免疫疾病、糖尿病	mass cytometry, imaging mass cytometry, single-cell RNA sequencing	NA	分子数据、细胞成像数据	使用糖尿病小鼠模型进行临床前评估
263	2025-09-13	Complete Response to BET Inhibitor in Primary Pulmonary NUT Carcinoma With Single-Cell Sequencing-Based Analysis: A Case Report 2025-Oct, JTO clinical and research reports IF:3.0Q2 DOI:10.1016/j.jtocrr.2025.100885 PMID:40926997	病例报告	一例原发性肺NUT癌患者通过BET抑制剂NHWD-870单药治疗实现完全缓解，并利用单细胞测序分析其免疫微环境变化	首次报道BET抑制剂单药治疗实现NUT癌完全缓解，并通过单细胞测序揭示其通过激活CD8+ T细胞调控肿瘤微环境的双重作用机制	单病例报告，样本量有限，需要更大规模研究验证	探讨BET抑制剂在NUT癌治疗中的疗效及作用机制	36岁IIIB期原发性肺NUT癌患者	肿瘤学	肺癌	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	1例患者肿瘤组织
264	2025-09-13	Fueling fibrosis: metabolic dysregulation in systemic sclerosis 2025-Sep-15, Current opinion in rheumatology IF:5.2Q1 DOI:10.1097/BOR.0000000000001123 PMID:40916994	综述	本综述探讨代谢重编程如何驱动系统性硬化症（SSc）中的纤维化和免疫失调，重点关注营养感知和能量通路在疾病进展中的作用	揭示了SSc中从分解代谢向合成代谢的转变机制，强调了代谢物（如αKG、琥珀酸和富马酸盐）在表观遗传调控和纤维化信号中的非传统作用，并指出单细胞转录组学发现不同成纤维细胞亚型具有独特的代谢程序	NA	分析代谢重编程在系统性硬化症纤维化和免疫失调中的作用机制	系统性硬化症（SSc）相关的代谢通路、免疫细胞和成纤维细胞	代谢组学与纤维化疾病机制	系统性硬化症	代谢组学分析、单细胞转录组学	NA	代谢组数据、转录组数据	NA
265	2025-09-13	Spatiotemporal Proliferative Heterogeneity of Intraorgan Endothelial Cells 2025-Sep-12, Circulation research IF:16.5Q1 DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.326748 PMID:40814781	研究论文	本研究揭示了心脏、肝脏和肺脏中内皮细胞增殖的时空异质性及其分子机制	首次发现同一器官内不同区域内皮细胞存在显著增殖异质性，并鉴定出区域特异性基因表达程序	研究主要聚焦于三种器官，其他器官的异质性尚未探索；体内抑制实验可能存在脱靶效应	探究同一器官内内皮细胞的增殖异质性及其调控机制	心脏、肝脏和肺脏中的内皮细胞	细胞生物学	血管相关疾病	RNA测序、空间转录组学、单细胞RNA测序、MAPK信号通路抑制	NA	基因表达数据、空间转录数据	利用多种损伤模型（主动脉缩窄、心肌梗死、部分肝切除、肺切除）进行研究
266	2025-09-13	Customized Design and Preparation of Bionic Drug Delivery System Leveraging Single-Cell RNA Sequencing for Precisely Targeted Therapy 2025-Sep-12, Advanced healthcare materials IF:10.0Q1 DOI:10.1002/adhm.202501497 PMID:40936355	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术指导设计和制备了一种仿生药物递送系统，用于急性肾损伤的精准靶向治疗	首次采用scRNA-seq识别急性肾损伤的关键细胞亚型(PTIs)并确定特异性靶向介质(VCAM1和ICAM1)，实现了个性化仿生DDS的设计	NA	开发针对急性肾损伤关键细胞亚型的精准靶向药物递送系统	急性肾损伤(AKI)的肾小管上皮细胞亚型(PTIs)	生物医学工程	急性肾损伤	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	基因表达数据	NA
267	2025-09-13	Retinoic Acid Inhibition Alters Intestinal Composition in Zebrafish: A Non-genetic Model to Study Hirschsprung Disease? 2025-Sep-12, Neurogastroenterology and motility IF:3.5Q2 DOI:10.1111/nmo.70155 PMID:40937495	研究论文	本研究通过抑制斑马鱼体内的视黄酸合成，探究其对肠道细胞组成的广泛影响及其作为先天性巨结肠疾病模型的潜力	首次在斑马鱼模型中系统揭示视黄酸抑制不仅影响ENS细胞，还显著改变非神经元细胞群组成，并对比了ret突变模型与药物抑制模型的差异	研究基于斑马鱼模型，结果向人类疾病的直接转化需进一步验证；未探讨视黄酸抑制的长期效应	探究视黄酸在肠道发育中的作用及其与先天性巨结肠疾病的关联	斑马鱼幼虫（DEAB处理组、野生型、ret突变HSCR模型）	发育生物学	先天性巨结肠疾病	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	斑马鱼幼虫（具体数量未明确说明）
268	2025-09-13	Single-cell RNA sequencing reveals developmental trajectories and environmental regulation of callus formation in Arabidopsis 2025-Sep-12, Stress biology DOI:10.1007/s44154-025-00255-4 PMID:40938467	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了拟南芥愈伤组织形成过程中的发育轨迹和环境调控机制	首次在关键发育阶段（起始、增殖和绿化）系统解析愈伤组织细胞的转录组动态，并通过伪时间分析揭示独特的转录因子调控网络	研究聚焦于拟南芥模型，结论在其他植物物种中的普适性仍需验证	探究植物愈伤组织发育的调控网络和细胞命运机制	拟南芥愈伤组织细胞	单细胞组学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）, UMAP聚类, 伪时间分析, 基因本体分析	NA	单细胞转录组数据	未明确样本数量，但涵盖愈伤组织发育三个关键阶段
269	2025-09-13	Novel Genetic Loci for Nontuberculous Mycobacterial Pulmonary Disease and Potential Protective Effect of Body Mass Index 2025-Sep-12, American journal of respiratory and critical care medicine IF:19.3Q1 DOI:10.1164/rccm.202406-1253OC PMID:40938630	研究论文	通过全基因组关联研究识别与非结核分枝杆菌肺病相关的遗传位点，并探讨体重指数的潜在保护作用	发现两个新的遗传位点（rs60084385和rs1479595）并验证一个已知位点（rs194792）与NTM-PD显著相关，首次揭示BMI与NTM-PD存在负向遗传相关和潜在因果关系	研究主要基于东亚（韩国、日本）和欧洲人群，结果在其他人群中的普适性需进一步验证	探究非结核分枝杆菌肺病（NTM-PD）的遗传基础及其与风险因素的关联	人类基因组变异与NTM-PD易感性	遗传学	肺部疾病	全基因组关联研究（GWAS）、数量性状位点分析、孟德尔随机化、单细胞转录组分析	统计遗传学模型	基因组数据、临床数据	总计5,900人（包括1,949例NTM-PD患者和2,955名健康对照，并在日本和欧洲队列中验证）
270	2025-09-13	Insulin signalling-associated cell fate promotes neoplastic invasiveness in non-functioning pituitary gonadotroph adenoma via cis-regulatory elements activation 2025-Sep-11, British journal of cancer IF:6.4Q1 DOI:10.1038/s41416-025-03122-1 PMID:40935899	研究论文	本研究通过整合单细胞转录组和染色质可及性数据，揭示了胰岛素信号相关细胞命运通过顺式调控元件激活促进无功能垂体促性腺激素腺瘤的侵袭性	首次发现胰岛素信号相关细胞命运是肿瘤侵袭性的驱动因素，并鉴定出SREBF1和IGF2BP2相关的顺式调控元件在染色质互作重建中的关键作用	样本量较小（仅3例患者进行单细胞分析），需要更大规模研究验证发现	探究无功能垂体促性腺激素腺瘤侵袭性的细胞机制和分子基础	无功能垂体促性腺激素腺瘤患者肿瘤组织和原代细胞系	肿瘤生物学	垂体腺瘤	scRNA-seq, scATAC-seq, 顺式共可及网络分析	NA	单细胞转录组数据、染色质可及性数据	3例患者进行单细胞测序，210例患者队列验证，3个原代细胞系
271	2025-09-13	AP2X-1 is a negative regulator of Toxoplasma gondii sexual commitment 2025-Sep-10, mBio IF:5.1Q1 DOI:10.1128/mbio.00052-25 PMID:40823841	研究论文	本研究揭示AP2X-1作为弓形虫有性发育的关键负调控因子，通过调控染色质可及性抑制缓殖子和有性阶段基因表达	首次发现AP2X-1通过HDAC3/MORC复合物调控染色质压缩，从而抑制弓形虫有性发育的新机制	研究主要基于基因敲除模型，体内具体调控网络和上下游信号通路仍需进一步验证	探究弓形虫生命周期转换的调控机制，特别是AP2X-1在发育阶段转换中的作用	弓形虫（Toxoplasma gondii）的速殖子、缓殖子、裂殖子和子孢子等发育阶段	分子寄生虫学	寄生虫感染	基因敲除、单细胞测序、CUT&Tag、ATAC-seq	NA	基因组学数据、表观遗传学数据	弓形虫野生型和AP2X-1敲除株系
272	2025-09-13	Next-gen tools in cancer neuroscience 2025-Sep-10, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2025.116258 PMID:40934086	综述	本文综述了推动癌症神经科学领域发展的新一代技术工具	整合单细胞与空间转录组学、光遗传学、化学遗传学及神经元活动可视化等前沿技术，革新神经与癌症交互作用的研究方法	NA	探讨连接肿瘤学与神经科学的关键技术，推动癌症神经科学领域发展	神经与癌症交互系统的组成成分	癌症神经科学	癌症	单细胞转录组学, 空间转录组学, 光遗传学, 化学遗传学, 工程病毒, 神经元活动可视化	NA	NA	NA
273	2025-09-13	Single-cell sequencing reveals the immune microenvironment in osteoarthritis: from heterogeneity to therapeutic targets 2025-Sep-10, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2025.115521 PMID:40934543	综述	本文系统总结了单细胞RNA测序技术在解析骨关节炎免疫微环境中的关键进展，包括免疫细胞异质性、动态轨迹及细胞间互作网络	利用scRNA-seq技术首次在单细胞分辨率下揭示OA关节中免疫微环境的异质性及细胞间通讯网络	未明确提及具体数据量或技术验证的局限性，主要侧重于技术应用的系统性综述	深化对骨关节炎免疫微环境的理解并推动临床转化	骨关节炎患者的关节组织免疫细胞（如巨噬细胞、T细胞等）及关节常驻细胞（滑膜成纤维细胞、软骨细胞、成骨细胞）	单细胞组学	骨关节炎	scRNA-seq（单细胞RNA测序）	NA	单细胞转录组数据	NA（未明确样本数量，聚焦技术应用综述）
274	2025-09-13	Embracing the heterogeneity of neural stem cells in the subventricular zone 2025-Sep-09, Stem cell reports IF:5.9Q2 DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102452 PMID:40118056	研究论文	本研究整合多个单细胞RNA测序数据集，分析小鼠脑室下区神经干细胞（NSCs）的异质性及标记物选择偏好	首次系统比较不同NSC标记物对特定细胞状态的选择性，并提供了优化NSC富集策略的框架	研究仅基于已发表数据集，未进行实验验证；仅使用小鼠模型，人类NSCs的适用性未知	评估不同神经干细胞标记物对细胞状态的选择性，并开发最佳富集策略	成年小鼠脑室下区（SVZ）的神经干细胞	神经科学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	六个已发表的小鼠SVZ单细胞RNA测序数据集
275	2025-09-13	Endothelin B receptor inhibition rescues aging-dependent neuronal regenerative decline 2025-Sep-09, eLife IF:6.4Q1 DOI:10.7554/eLife.100217 PMID:40924015	研究论文	本研究揭示了抑制内皮素B受体（ETBR）可改善衰老导致的神经元轴突再生能力下降	首次发现卫星胶质细胞表达ETBR，并通过FDA批准药物Bosentan逆转年龄相关的轴突再生衰退	机制尚未完全阐明，且研究主要基于小鼠模型	探究衰老过程中神经元再生能力下降的机制及干预策略	背根神经节中的感觉神经元和卫星胶质细胞	神经再生生物学	衰老相关神经退行性疾病	单细胞RNA测序，单核RNA测序，电子显微镜分析	NA	基因表达数据，显微图像数据	成年和老年小鼠的背根神经节样本
276	2025-09-13	Computational pathology annotation enhances the resolution and interpretation of breast cancer spatial transcriptomics data 2025-Sep-09, NPJ precision oncology IF:6.8Q1 DOI:10.1038/s41698-025-01104-3 PMID:40925915	研究论文	本研究提出一种计算病理图像分析流程，用于增强乳腺癌空间转录组数据的解析和解释	利用机器学习算法在Visium平台数据上实现高分辨率肿瘤、间质和免疫区室注释，提升单细胞水平数据分析能力	研究仅基于4名患者的23个肿瘤切片，样本规模有限	解析乳腺癌空间异质性并提升空间转录组数据解释精度	乳腺癌组织切片	数字病理	乳腺癌	空间转录组学（Visium平台），H&E染色成像	机器学习算法	图像，测序数据	4名患者的23个乳腺癌组织切片
277	2025-09-13	Computationally resolved neuroprogenitor cell biomarkers associate with human disorders 2025-Sep-09, Stem cell reports IF:5.9Q2 DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102606 PMID:40845852	研究论文	通过计算算法识别神经祖细胞生物标志物，并探索其与人类神经系统疾病的关联	利用计算数字分选算法（DSA）从复杂基因表达数据中解析出129个小鼠NPC富集基因，并发现其中25个人类同源基因与孟德尔神经疾病相关	基于小鼠模型推导人类同源基因，可能存在物种间差异；依赖已发表的scRNA-seq数据，未进行独立实验验证	发现定义神经干细胞和祖细胞（NPCs）的特异性基因，并探索其与人类神经系统疾病的关联	小鼠和人类的神经干细胞和祖细胞（NPCs）	生物信息学	神经系统疾病	计算数字分选算法（DSA）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）	模式识别算法	基因表达数据	基于已发表scRNA-seq数据，具体样本量未明确说明
278	2025-09-13	Single-cell transcriptome and surfaceome profiling of the adult human retinal pigment epithelium 2025-Sep-09, Stem cell reports IF:5.9Q2 DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102611 PMID:40882639	研究论文	本研究通过单细胞转录组和表面蛋白分析，揭示了成人视网膜色素上皮（RPE）细胞的亚群多样性及其功能差异	首次利用CITE-seq技术同时分析成人RPE的单细胞转录组和表面蛋白，发现具有独特空间分布和功能特征的RPE亚群，并证实培养过程中亚群保持	NA	探索成人视网膜色素上皮细胞的亚群多样性及其对视网膜生物学的意义	成人视网膜色素上皮细胞	单细胞组学	年龄相关性黄斑变性	CITE-seq（转录组和表位测序索引技术），免疫组化分析	NA	单细胞转录组数据，表面蛋白数据	NA
279	2025-09-13	Integrated spatial transcriptomic profiling to dissect the cellular characteristics of tumor-associated tertiary lymphoid structures 2025-Sep-09, Cell reports IF:7.5Q1 DOI:10.1016/j.celrep.2025.116250 PMID:40934085	研究论文	通过整合23种癌症的空间转录组数据，构建泛癌TA-TLS图谱，解析肿瘤相关三级淋巴结构的细胞特征和空间组织	首次构建泛癌TA-TLS图谱，发现CCL19+血管周细胞可能作为淋巴组织组织者细胞，并揭示动脉内皮细胞在Notch信号抑制下获得高内皮静脉样表型	NA	解析肿瘤相关三级淋巴结构（TA-TLS）的细胞特征和形成机制	23种癌症的肿瘤相关三级淋巴结构	空间转录组学	癌症	空间转录组学	NA	空间转录组数据	23种癌症的整合数据
280	2025-09-13	Dynamic interaction of oligodendrocyte precursor cells with other cell types in the central nervous system 2025-Sep-08, Neurochemistry international IF:4.4Q1 DOI:10.1016/j.neuint.2025.106050 PMID:40930164	综述	本文系统梳理了少突胶质前体细胞（OPCs）与中枢神经系统其他细胞类型的动态相互作用及其功能多样性	整合单细胞测序和活体成像技术揭示OPCs在发育、稳态和病理状态下的空间特异性功能可塑性	NA	探讨OPCs的非髓鞘形成功能及其在神经再生医学中的治疗靶点	少突胶质前体细胞（OPCs）、神经元、星形胶质细胞、小胶质细胞、血管内皮细胞	神经科学	多发性硬化症、脑缺血	单细胞测序、活体成像	NA	NA	NA