单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28955 篇文献，本页显示第 261 - 280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2025-06-19 |
An Improved, High-Yield Method for Isolating Nuclei from Individual Zebrafish Embryos for Single-Nucleus RNA Sequencing
2025-Apr, Zebrafish
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/zeb.2024.0175
PMID:40040474
|
研究论文 | 本文介绍了一种改进的高效方法，用于从斑马鱼胚胎中分离高质量细胞核，以进行单核RNA测序 | 通过珠磨均质化在裂解缓冲液中高效分离细胞核，相比酶解方法有显著改进，并适用于广泛的发育阶段 | NA | 开发一种高效的方法，用于从斑马鱼胚胎中分离高质量细胞核，以支持单细胞测序研究 | 斑马鱼胚胎 | 基因组学 | NA | 单核RNA测序(snRNA-seq) | NA | RNA序列数据 | 在96孔板格式中处理的斑马鱼胚胎 |
| 262 | 2025-06-19 |
Coordinated regulation of cortical astrocyte maturation by OLIG1 and OLIG2 through BMP7 signaling modulation
2025-Mar-24, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2025.03.008
PMID:40139307
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研究论文 | 本研究揭示了转录因子OLIG1和OLIG2通过调控BMP7信号通路在皮质星形胶质细胞成熟中的协同作用 | 首次发现OLIG1和OLIG2通过直接结合Bmp7增强子抑制其表达来调控星形胶质细胞成熟 | 研究主要聚焦于皮质星形胶质细胞，其他脑区星形胶质细胞的成熟机制仍需进一步探索 | 阐明调控皮质星形胶质细胞成熟的分子机制 | 皮质星形胶质细胞 | 神经科学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序、基因敲除、体内过表达 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | 未明确说明样本数量，使用基因工程小鼠模型 |
| 263 | 2025-06-19 |
A Potential Contribution of S100A11 to Skin Fibrosis and Pulmonary Involvement in Systemic Sclerosis
2025-Jan, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.70026
PMID:40525602
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research paper | 本研究探讨了S100A11在系统性硬化症（SSc）皮肤纤维化和肺部受累中的潜在作用 | 首次发现S100A11在SSc皮肤成纤维细胞中高表达，并与细胞衰老相关基因共表达，同时发现血清S100A11水平与SSc皮肤厚度评分和间质性肺病参数显著相关 | 研究样本量未明确说明，功能机制尚未完全阐明 | 探究S100A11在系统性硬化症纤维化过程中的病理生理作用 | 系统性硬化症患者皮肤样本和血清 | 医学研究 | 系统性硬化症 | 免疫组织化学染色（IHC）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、酶联免疫吸附试验（ELISA） | NA | 组织样本、血清样本、基因表达数据 | 未明确说明患者和对照组的具体样本量 |
| 264 | 2025-06-19 |
Cellular origin and clonal evolution of human dedifferentiated liposarcoma
2024-09-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52067-1
PMID:39266532
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、DNA测序等技术，探索了人类去分化脂肪肉瘤（DDLPS）的细胞起源和克隆演化 | 首次鉴定了肿瘤脂肪干细胞（ASC）群体，并揭示了其与白色脂肪组织中脂肪基质祖细胞的相似性，以及这些祖细胞在DDLPS肿瘤克隆演化中的作用 | 研究样本仅限于原发性DDLPS肿瘤，未涉及转移性肿瘤或其他肉瘤亚型 | 阐明去分化脂肪肉瘤的细胞起源和克隆演化机制 | 人类去分化脂肪肉瘤（DDLPS）的肿瘤细胞及其微环境 | 肿瘤生物学 | 脂肪肉瘤 | 单细胞RNA测序, DNA测序, 原位多重免疫荧光, 功能实验 | NA | 单细胞转录组数据, DNA序列数据, 免疫荧光图像数据 | 配对的WD和DD成分的原发性DDLPS肿瘤样本 |
| 265 | 2025-06-19 |
Maf expression in B cells restricts reactive plasmablast and germinal center B cell expansion
2024-09-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52224-6
PMID:39266537
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研究论文 | 本研究探讨了Maf在B细胞中对浆母细胞和生发中心B细胞扩增的调控作用 | 揭示了Maf作为B细胞内在负调节因子，在浆母细胞增殖和生发中心B细胞形成中的新作用 | 研究仅限于小鼠模型，未涉及人类B细胞 | 探究Maf在B细胞分化中的调控机制 | B细胞（特别是边缘区B细胞、生发中心B细胞和浆母细胞） | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | 野生型对照和Maf缺陷型小鼠 |
| 266 | 2025-06-19 |
3D reconstruction of the mouse cochlea from scRNA-seq data suggests morphogen-based principles in apex-to-base specification
2024-06-17, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.03.028
PMID:38593801
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研究论文 | 通过分析单细胞RNA测序数据，研究小鼠耳蜗从顶端到基底端的形态发生素调控机制 | 首次从小鼠耳蜗的单细胞RNA测序数据中重建3D模型，揭示了视黄酸和hedgehog信号通路在耳蜗纵向轴形成中的共同作用 | 研究仅基于E12.5和E14.5两个时间点的数据，未覆盖耳蜗发育全过程 | 探索小鼠耳蜗顶端到基底端特异性基因表达的分子调控机制 | 小鼠耳蜗发育过程中的细胞 | 发育生物学 | NA | scRNA-seq | 3D重建模型 | 单细胞RNA测序数据 | E12.5和E14.5两个发育时间点的小鼠耳蜗细胞 |
| 267 | 2025-06-19 |
Cellular atlas of the human ovary using morphologically guided spatial transcriptomics and single-cell sequencing
2024-04-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adm7506
PMID:38578993
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research paper | 该研究通过形态学引导的空间转录组学和单细胞测序技术，构建了人类卵巢的细胞图谱 | 结合空间转录组学和单细胞测序技术，首次全面描绘了人类卵巢中不同细胞类型的基因表达特征和空间分布 | 样本量较小(仅5名供体)，且均为绝经前女性，可能无法完全代表卵巢细胞的全貌 | 解析卵巢中不同细胞类型的空间分布和功能特征 | 人类卵巢组织 | 空间转录组学 | 生殖系统疾病 | 空间转录组学，单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 257个卵巢区域(来自2名供体)和21,198个单细胞(来自另外3名供体) |
| 268 | 2025-06-19 |
col1a2+ fibroblasts/muscle progenitors finetune xanthophore countershading by differentially expressing csf1a/1b in embryonic zebrafish
2024-04-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adj9637
PMID:38578990
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research paper | 研究揭示了斑马鱼胚胎中调控黄色素细胞反阴影的机制，通过成纤维细胞和肌肉祖细胞差异表达csf1a/1b来调节黄色素细胞模式 | 首次发现成纤维细胞和肌肉祖细胞通过差异表达csf1a/1b调控黄色素细胞的反阴影模式 | 研究仅限于斑马鱼胚胎，未在其他生物或发育阶段验证 | 探索脊椎动物反阴影色素模式的调控机制 | 斑马鱼胚胎中的黄色素细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 斑马鱼胚胎 |
| 269 | 2025-06-19 |
Spatial transcriptomics identifies candidate stromal drivers of benign prostatic hyperplasia
2024-01-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.176479
PMID:37971878
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研究论文 | 通过空间转录组学技术识别良性前列腺增生（BPH）中潜在的基质驱动因子 | 首次利用激光显微切割和转录组分析技术，识别出BPH基质中可能介导前列腺腺上皮诱导的分泌因子IGF1和CXCL13，并验证了它们在BPH成纤维细胞中的共表达 | 研究仅部分支持历史关于BPH病因的推测，且未全面验证所有潜在分子靶点的治疗潜力 | 探究良性前列腺增生（BPH）的基质驱动因子及其分子机制 | 良性前列腺增生（BPH）的基质组织及腺上皮 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 激光显微切割、转录组分析、RNA原位杂交、3D培养 | NA | 转录组数据、组织样本 | 患者来源的BPH细胞类器官和BPH-1细胞球体 |
| 270 | 2025-06-19 |
Integrin β1-rich extracellular vesicles of kidney recruit Fn1+ macrophages to aggravate ischemia-reperfusion-induced inflammation
2024-01-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.169885
PMID:38258908
|
研究论文 | 本文研究了肾脏缺血再灌注损伤（IRI）中细胞外囊泡（EV）携带的蛋白质如何介导近端小管细胞（PTs）与单核吞噬细胞（MP）之间的细胞间通讯 | 通过多组学分析结合单细胞RNA测序和肾脏EV蛋白质谱，揭示了整合素β1富集的EV在招募Fn1+巨噬细胞并加剧炎症反应中的作用 | 缺乏对EV分泌阻断剂GW4869作用机制的详细探讨 | 阐明肾脏IRI中PTs与MP之间的细胞间通讯机制 | 近端小管细胞（PTs）和单核吞噬细胞（MP） | 细胞生物学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）、蛋白质谱分析 | NA | RNA测序数据、蛋白质数据 | NA |
| 271 | 2025-06-19 |
Multiomics characterization of breast angiosarcoma from an Asian cohort reveals enrichment for angiogenesis signaling pathway and tumor-infiltrating macrophages
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1515935
PMID:39872529
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研究论文 | 该研究通过多组学方法分析了亚洲人群中的乳腺血管肉瘤（AS-B），揭示了其与头颈部血管肉瘤（AS-HN）在分子和免疫特征上的差异 | 首次在亚洲人群中系统描述了AS-B的临床和分子特征，并发现其与血管生成信号通路和肿瘤浸润巨噬细胞的富集相关 | 样本量较小（AS-B仅16例），可能影响统计效力 | 阐明亚洲人群中AS-B的疾病特征及其潜在治疗靶点 | 176例血管肉瘤患者（其中AS-B 16例） | 数字病理学 | 乳腺癌 | 全基因组测序（WGS）、NanoString基因表达谱分析、10x Genomics Visium空间转录组学 | NA | 基因组数据、基因表达数据、空间转录组数据 | 176例血管肉瘤患者（AS-B 16例，AS-HN 104例） |
| 272 | 2025-06-18 |
Roles of central nervous system resident and recruited macrophages in the brain barrier system
2026-Mar-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-00986
PMID:39885670
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综述 | 本文综述了脑屏障系统中巨噬细胞的起源、发育、重要分子及功能，重点关注小胶质细胞和边界相关巨噬细胞 | 强调了单细胞测序技术和重要细胞标志物的最新进展 | 未提及具体实验数据或样本量，主要基于现有文献进行综述 | 探讨脑屏障系统中驻留和招募巨噬细胞的作用 | 脑屏障系统中的巨噬细胞（包括小胶质细胞、边界相关巨噬细胞和招募的巨噬细胞） | 神经免疫学 | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 273 | 2025-06-18 |
Molecular mechanisms after optic nerve injury: Neurorepair strategies from a transcriptomic perspective
2026-Mar-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-00794
PMID:40313107
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综述 | 本文综述了视神经损伤后的分子机制，以及通过转录组学视角探讨神经修复策略 | 利用单细胞转录组学技术揭示了视神经损伤和青光眼模型中视网膜神经节细胞损伤的分子机制，并鉴定了与神经保护和轴突再生相关的关键基因和转录因子 | 未来研究需要整合先进的单细胞测序与多组学方法，以更全面地研究视网膜神经节细胞损伤和再生的细胞特异性反应 | 探讨视神经损伤后的分子机制，并寻找神经修复的新策略 | 视网膜神经节细胞 | 神经科学 | 青光眼 | 微阵列分析、RNA测序、单细胞RNA测序、CRISPR-Cas9筛选、ATAC-seq分析 | 视神经挤压模型和青光眼模型 | 转录组数据 | NA |
| 274 | 2025-06-17 |
Data-informed insights into sex differences in peripheral blood mononuclear cells from single-cell transcriptomics
2025-Sep, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2025.101525
PMID:40520998
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 275 | 2025-06-17 |
Integrating spatial transcriptomics and single-cell RNA-sequencing reveals epithelial cell alterations in benign prostatic hyperplasia following finasteride treatment
2025-Sep, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2025.101526
PMID:40520997
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 276 | 2025-06-18 |
Suppression of the Prostaglandin I2-Type 1 Interferon Axis Induces Extramedullary Hematopoiesis to Promote Cardiac Repair After Myocardial Infarction
2025-Jun-17, Circulation
IF:35.5Q1
|
research paper | 本研究探讨了脾脏髓外造血（EMH）在心肌梗死（MI）后心脏修复中的作用及其机制 | 揭示了PGI2-IFN轴在MI后脾脏EMH中的作用，为缺血性心脏损伤提供了新的治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需验证 | 探究脾脏EMH在MI后心脏修复中的作用及其调控机制 | 小鼠模型中的脾脏造血干细胞/祖细胞（HSPCs） | 心血管疾病 | 心肌梗死 | 流式细胞术、液相色谱-串联质谱、单细胞RNA测序 | Tcf21CreER Scfflox/flox MI小鼠模型 | 转录组数据、脂质组数据 | 未明确提及具体样本数量，但使用了GFP+造血干细胞和Tcf21CreER Scfflox/flox小鼠 |
| 277 | 2025-06-18 |
Single-Cell RNA Sequencing Delineates Renal Anti-Fibrotic Mechanisms Mediated by TRPC6 Inhibition
2025-Jun-17, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202501175
PMID:40525246
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research paper | 该研究通过单细胞RNA测序技术揭示了TRPC6通道抑制在慢性肾脏病中的抗纤维化机制 | 发现了一种新型内皮细胞亚群ECRIN，并揭示了TRPC6抑制通过Prnp转录因子调控网络减轻肾纤维化的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类CKD样本，临床转化需要进一步验证 | 探究TRPC6通道抑制在慢性肾脏病中的治疗潜力及其分子机制 | 小鼠UUO模型、2个月慢性缺血再灌注损伤模型及人类CKD患者的肾脏样本 | digital pathology | chronic kidney disease | scRNA-Seq, immunofluorescence, western blot | NA | RNA-seq数据 | 小鼠模型和人类CKD患者的肾脏样本（具体数量未明确说明） |
| 278 | 2025-06-18 |
Endothelial Cell Phenotypic Plasticity in Cardiovascular Physiology and Disease: Mechanisms and Therapeutic Prospects
2025-Jun-16, American journal of hypertension
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/ajh/hpaf027
PMID:39989120
|
research paper | 本文探讨了内皮细胞在心血管生理和疾病中的表型可塑性及其机制与治疗前景 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了内皮细胞的分子多样性和转录异质性，并探讨了内皮细胞重编程等新型治疗策略 | 未具体说明研究中使用的样本数量或实验模型的局限性 | 研究内皮细胞的表型可塑性在心血管疾病中的作用及其治疗潜力 | 内皮细胞及其在心血管疾病中的表型转变 | 心血管生物学 | 心血管疾病 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 279 | 2025-06-18 |
LARP7 Protects Vascular Smooth Muscle Cell Contractile Phenotype in CKD by Coupling with P300
2025-Jun-16, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000761
PMID:40522739
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研究论文 | 本研究探讨了LARP7在维持血管平滑肌细胞（VSMC）收缩表型及缓解慢性肾病（CKD）相关血管病变中的作用 | 发现了LARP7作为内源性正调节因子通过其与P300的相互作用维持VSMC收缩表型的新机制 | 研究主要基于体外和动物模型，临床样本验证有限 | 探究LARP7在CKD相关血管病变中的作用机制 | 血管平滑肌细胞（VSMC） | 分子生物学 | 慢性肾病（CKD） | 单细胞RNA测序、免疫染色分析 | NA | RNA测序数据、免疫染色图像 | CKD患者及小鼠模型样本 |
| 280 | 2025-06-18 |
RIDDEN: Data-driven inference of receptor activity from transcriptomic data
2025-Jun-16, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013188
PMID:40522999
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研究论文 | 开发了一种名为RIDDEN的计算工具，用于从受体调控的基因表达谱中预测受体活性，而非基于配体和受体基因的表达 | RIDDEN是首个直接关注受体活性而非配体-受体相互作用的计算方法，且不依赖配体和受体的共表达来推断活性 | NA | 开发一种能够从转录组数据中推断受体活性的计算工具，以促进细胞间通讯的研究 | 受体活性的系统水平分析 | 生物信息学 | NA | 转录组数据分析 | RIDDEN | 转录组数据 | 229种不同受体的14463个扰动基因表达谱 |