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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2026-06-10 |
Trichosanthes kirilowii extract alleviated liver fibrosis and acute myocardial infarction by inhibiting VCAN to restrain monocyte senescence: Insights from bioinformatic analyses and experimental validation
2026-Apr, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.157941
PMID:41720002
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研究论文 | 通过生物信息学分析和实验验证,揭示栝楼提取物通过抑制VCAN延缓单核细胞衰老,从而缓解肝纤维化和急性心肌梗死 | 首次发现VCAN是肝纤维化和急性心肌梗死的共享关键基因,并揭示栝楼提取物通过抑制VCAN介导的单核细胞衰老发挥双器官保护作用 | 未明确说明研究的局限性 | 探究栝楼提取物对肝纤维化和急性心肌梗死的共同保护机制 | 肝纤维化和急性心肌梗死的共享关键基因及单核细胞衰老 | 生物信息学 | 肝纤维化, 急性心肌梗死 | 差异表达分析, 加权基因共表达网络分析, 机器学习算法, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 小鼠模型:CCl₄诱导的肝纤维化和左前降支冠状动脉结扎诱导的急性心肌梗死模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 262 | 2026-06-10 |
Single-cell transcriptomics reveals the toxic mechanism and therapeutic target of ubiquitously distributed mycotoxin deoxynivalenol
2026-Apr, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.157927
PMID:41720013
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示呕吐毒素(DON)对睾丸的毒性机制及潜在治疗靶点 | 首次构建了DON诱导睾丸损伤的单细胞图谱,并鉴定KDM5A为霉菌毒素损害精子发生过程中调控网络的关键组分 | 未提及本研究的局限性 | 阐明呕吐毒素(DON)诱导睾丸毒性的细胞和分子机制,并寻找潜在治疗靶点 | 性成熟大鼠的睾丸细胞 | 单细胞转录组学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、核铺展免疫染色、Western blot、抑制剂补充 | NA | 单细胞基因表达数据 | 70,000个大鼠睾丸细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 263 | 2026-06-10 |
From laboratory bench to surgical room: Molecular profiling and single-cell technologies in precision surgery for colorectal cancer patients
2026-Apr, Surgical oncology
DOI:10.1016/j.suronc.2026.102382
PMID:41722207
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综述 | 本文综述了分子谱分析和单细胞技术在结直肠癌精准手术中的进展,探讨了如何整合这些技术到围手术期策略中以支持肿瘤学精准手术概念 | 将分子谱分析与单细胞技术综合应用于结直肠癌精准围手术期管理,强调手术切除作为转化肿瘤学最终整合步骤的新视角 | 未明确提及局限性,但作为综述可能缺乏原始实验验证,且技术整合的临床实施细节有待进一步探讨 | 总结结直肠癌生物学最新进展,阐述类器官和单细胞技术的转化机遇,并讨论其整合入围手术期策略以推动精准手术 | 结直肠癌肿瘤细胞、肿瘤微环境中的基质与免疫细胞、循环肿瘤DNA、类器官模型 | 数字病理学 | 结直肠癌 | NGS, 单细胞测序, 空间多组学, 液体活检, 类器官培养 | NA | 基因组数据、转录组数据、空间转录组数据、类器官功能数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 264 | 2026-06-10 |
Sex specific genomic insights into type 1 diabetes through GWAS and single cell transcriptome analysis
2026-Apr, Diabetes research and clinical practice
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.diabres.2026.113181
PMID:41724362
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研究论文 | 通过性别分层全基因组关联研究(GWAS)和单细胞转录组分析,揭示了1型糖尿病的性别特异性遗传结构,并优化了风险预测 | 首次在1型糖尿病中系统进行性别分层GWAS,整合scRNA-seq数据发现性别特异性基因表达模式,并验证性别特异性多基因风险分数(PRS)在独立队列中优于传统PRS的预测性能 | 样品量有限(9对男女儿童PBMC样本),PRS验证队列规模较小(471例病例,2300例对照),欧洲血统人群限制泛化性 | 探究1型糖尿病的性别特异性遗传机制并改善风险预测 | 1型糖尿病患者(6599例)及对照(12350例)的遗传数据,9对男女儿童的PBMC单细胞转录组数据,独立验证队列(471例病例,2300例对照) | 机器学习和单细胞转录组学 | 1型糖尿病 | GWAS, scRNA-seq | NA | 遗传变异数据, 单细胞转录组数据 | GWAS:6599例病例(3483男,3109女)和12350例对照(6665男,5658女);scRNA-seq:9对男女儿童患者;验证队列:471例病例和2300例对照 | NA | scRNA-seq | NA | NA |
| 265 | 2026-06-10 |
Postnatal upregulation of cyclooxygenase-2 (COX-2) drives anatomical closure of the ductus arteriosus
2026-Apr-01, American journal of physiology. Heart and circulatory physiology
DOI:10.1152/ajpheart.00647.2025
PMID:41730286
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序揭示出生后COX-2上调驱动动脉导管解剖闭合的分子机制 | 首次发现COX-2在出生后动脉导管平滑肌细胞中经氧化应激和血栓素A信号显著上调,并通过前列腺素E-EP4通路促进细胞增殖,从而驱动解剖闭合 | 未明确列出研究局限性 | 阐明出生后动脉导管解剖闭合的分子驱动机制 | 小鼠动脉导管平滑肌细胞(DASMCs) | 分子生物学 | 动脉导管未闭相关疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 未明确说明样本量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 266 | 2026-06-10 |
Attenuating age-related decline in dendritic cell migration improves vaccine efficacy via gut-immune crosstalk
2026-Apr, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-026-01068-4
PMID:41731121
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析,揭示衰老导致树突状细胞迁移缺陷进而降低疫苗效力,并发现口服酵母纳米颗粒可通过肠道-免疫串扰增强树突状细胞功能、提高老年动物疫苗免疫应答 | 首次鉴定出衰老过程中树突状细胞迁移缺陷及其与疫苗反应减弱的关联,并提出口服酵母纳米颗粒的非侵入性策略来改善树突细胞功能和疫苗效力 | 未明确说明具体局限性,但研究仅在老年小鼠模型中验证,可能需进一步在人类或更多模型中验证 | 研究衰老如何通过树突状细胞影响疫苗效力,并探索改善策略 | 年轻与老年小鼠的淋巴结细胞及树突状细胞 | 数字病理学 | 老年性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 年轻与老年小鼠的淋巴结样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 267 | 2026-06-10 |
Inflammasome adaptor ASC promotes sustained neuroinflammation and mild cognitive impairment in a closed-head injury model
2026-Apr-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI199818
PMID:41734021
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研究论文 | 本研究探讨了炎症小体适配器ASC在闭合性脑损伤模型中促进持续性神经炎症和轻度认知障碍的作用 | 首次通过单细胞RNA测序揭示ASC在轻度闭合性脑损伤后小胶质细胞中的选择性表达及其在维持神经炎症和认知缺陷中的关键作用 | 未明确提及研究局限性 | 探究炎症小体相关基因在轻度闭合性脑损伤模型中的细胞表达及其功能意义 | 闭合性脑损伤小鼠模型(野生型和Asc基因敲除小鼠) | 机器学习和数字病理学 | 神经退行性疾病、痴呆 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠脑组织样本(具体数量未提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 268 | 2026-06-10 |
PPAR-γ suppresses macrophage senescence and allergic airway inflammation through controlling lipid metabolic pathways
2026-Apr, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2026.106226
PMID:41864062
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研究论文 | 本研究探讨PPAR-γ通过调控脂质代谢途径抑制巨噬细胞衰老和过敏性气道炎症的机制 | 首次发现PPAR-γ通过调控脂质代谢途径抑制巨噬细胞衰老,并利用巨噬细胞靶向递送罗格列酮减轻过敏性气道炎症 | 未明确PPAR-γ调控巨噬细胞衰老的具体分子机制及其在人类哮喘中的直接验证 | 探究PPAR-γ在过敏性气道炎症中通过调控巨噬细胞衰老的作用及其机制 | 过敏性哮喘小鼠模型、巨噬细胞谱系特异性PPAR-γ条件敲除小鼠 | 机器学习和免疫学 | 过敏性哮喘 | 单细胞RNA测序、条件基因敲除、脂质代谢通路分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型,具体样本数量未在摘要中说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3 |
| 269 | 2026-06-10 |
Intracellular bacteria modulate the immune microenvironment of oral squamous cell carcinoma
2026-Mar-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117019
PMID:41722049
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研究论文 | 利用INVADEseq技术揭示细胞内细菌如何调节口腔鳞状细胞癌的免疫微环境,影响新辅助免疫检查点阻断疗法的效果 | 首次应用INVADEseq技术同时捕获宿主单细胞RNA测序数据和细菌特征,揭示细胞内细菌通过多种机制影响免疫检查点阻断疗法的疗效 | 未明确说明局限性,但研究中提及细胞内细菌可能降低治疗效果的机制仍需进一步验证 | 探索细胞内细菌在口腔鳞状细胞癌微环境中调节免疫功能的机制,特别是对新辅助免疫检查点阻断疗法的影响 | 口腔鳞状细胞癌患者的肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | INVADEseq、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据、细菌特征数据 | 未明确说明样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | INVADEseq技术基于10x Chromium平台进行单细胞RNA测序及细菌特征捕获 |
| 270 | 2026-06-10 |
Single-cell profiling of the subgingival bacteria reveals transcriptional heterogeneity and niche-specific programs
2026-Mar-11, Cell host & microbe
IF:20.6Q1
DOI:10.1016/j.chom.2026.01.017
PMID:41720093
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序框架分析龈下细菌异质性和生态位特异性程序,揭示牙周炎发病机制 | 首次在单细胞分辨率下分析龈下细菌的转录异质性,构建了包含285个物种、133,458个细胞的图谱,并鉴定出与疾病相关的功能亚群 | 未提及方法局限性,但可能存在低微生物量和宿主污染的技术挑战 | 探索健康与牙周炎状态下龈下细菌的功能异质性和生态位特异性程序 | 龈下细菌群落 | 单细胞转录组学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 16个龈下样本 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 271 | 2026-06-10 |
Distinct spatial patterning and transcriptomic landscapes of human neural organoids by localized delivery of morphogens
2026-Mar-05, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2026.01.008
PMID:41734763
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研究论文 | 本研究通过一种无Matrigel的被动扩散形态原梯度发生器(PdMG),在人类神经类器官中建立稳定的外源空间形态原梯度,模拟脑区域化模式 | 首次开发无Matrigel的被动扩散形态原梯度发生器,在人类神经类器官中可靠建立陡峭的外源空间形态原梯度,实现背腹前脑、吻尾前中脑和吻尾前后脑样模式化 | 未明确说明局限性 | 利用模式化神经类器官模型模拟调控关键细胞命运特化和轴形成的时空形态原动态 | 人类神经类器官 | 机器学习 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 空间转录组学分析平台 |
| 272 | 2026-06-10 |
Interferon-γ-Responsive Microglia-Derived Extracellular Vesicles Inhibited Neurogenesis After Stroke via MicroRNA-199a-5p/SIRT1 Axis
2026-Mar-03, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.125.043532
PMID:41717953
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研究论文 | 本研究揭示了干扰素-γ反应性小胶质细胞来源的细胞外囊泡通过miR-199a-5p/SIRT1轴抑制中风后神经发生 | 首次发现干扰素-γ反应性小胶质细胞来源的细胞外囊泡通过miR-199a-5p/SIRT1轴抑制中风后神经发生,为缺血性中风治疗提供了新靶点 | NA | 研究干扰素-γ反应性小胶质细胞在神经系统功能恢复中的作用及其机制 | 成年雄性小鼠的脑组织、神经干细胞(NSCs) | machine learning | 缺血性中风 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、miRNA测序、免疫染色、定量实时聚合酶链反应(qRT-PCR)、酶联免疫吸附测定(ELISA)、荧光素酶报告基因检测 | NA | 基因表达数据、miRNA表达数据 | 小鼠脑组织样本,具体数量未说明 | Illumina | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、miRNA测序 | Illumina NovaSeq | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)使用10x Genomics平台,miRNA测序使用Illumina NovaSeq |
| 273 | 2026-06-10 |
Nuclear condensates of BZU2/ZmMUTE modulate transcription to realize structural heterogeneity of the maize stomatal complex
2026-Mar-03, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koag040
PMID:41718014
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研究论文 | 本文揭示了玉米BZU2/ZmMUTE核凝聚体通过液-液相分离调控气孔复合体细胞异质性的机制 | 首次发现转录因子ZmMUTE通过液-液相分离形成核凝聚体,调控玉米四细胞气孔复合体的功能与空间异质性,并揭示其内在无序区IDR4在DNA结合、靶基因激活及细胞间移动中的多重作用 | 未明确说明具体局限性 | 探究转录因子ZmMUTE在玉米气孔发育中如何通过动态活性实现细胞命运决定的结构异质性 | 玉米四细胞气孔复合体及其发育过程中的细胞类型异质性 | 机器学习 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 基因表达数据 | 玉米样本的基因型和单细胞RNA-seq分析 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于细胞类型特异性转录程序分析 |
| 274 | 2026-06-10 |
A Chromosome-level Assembly and Functional Genomic Resources for the Model Annelid Capitella teleta
2026-Mar-02, Genome biology and evolution
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/gbe/evag041
PMID:41732109
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研究论文 | 结合长读长和短读长测序与Hi-C技术,构建了模式环节动物 Capitella teleta 的染色体级核基因组和线粒体基因组,并提供了功能基因组资源 | 首次利用Hi-C染色质构象捕获技术实现了环节动物 C. teleta 的染色体水平组装,揭示了核基因组与线粒体基因组的重排现象,并整合了多种组学数据(RNA-seq、ATAC-seq、EM-seq)以鉴定新细胞类型特异性基因标记 | 未提及具体限制 | 为模式环节动物 Capitella teleta 提供更新的高质量基因组组装和功能基因组资源,促进动物与基因组进化研究 | 实验室品系的环节动物 Capitella teleta | 基因组学 | 不适用 | 长读长测序, 短读长测序, Hi-C染色质构象捕获, RNA-seq, ATAC-seq, EM-seq | 不适用 | 基因组序列, RNA-seq数据, ATAC-seq数据, EM-seq数据 | 一个实验室品系样本 | 不适用 | 不适用 | 不适用 | 不适用 |
| 275 | 2026-06-10 |
Multifunctional LepR⁺ skeletal stem/progenitor cells for bone and marrow homeostasis
2026-Mar, Journal of bone and mineral metabolism
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s00774-026-01698-z
PMID:41711875
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综述 | 综述了LepR⁺骨骼干细胞/祖细胞(SSPCs)在骨形成和骨髓稳态中的多功能作用 | 通过Cre/loxP遗传小鼠模型和单细胞转录组学,揭示了LepR⁺ SSPCs在发育、成年、衰老和骨折愈合中的功能与谱系可塑性 | 未提及具体的局限性 | 总结LepR⁺ SSPCs的研究历史与进展,强调其在稳态和病理条件下的作用 | LepR⁺骨骼干细胞/祖细胞(SSPCs) | 机器学习 | NA | Cre/loxP遗传标记,单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 276 | 2026-06-10 |
BiGCN Learns B Cell Functional States by Integrating Single-Cell Transcriptomes and BCR Repertoires
2026-Mar, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202501919
PMID:41725270
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研究论文 | 提出BiGCN方法,通过图卷积网络融合单细胞转录组和BCR数据,高精度表征B细胞功能状态 | 首次将单细胞转录组和BCR数据在统一嵌入空间内显式整合,利用图卷积网络实现B细胞状态和克隆关系的高保真表征 | 未提及模型对大规模数据的计算效率或对新组织类型的泛化能力等局限性 | 开发整合单细胞转录组和BCR数据的计算方法,揭示B细胞完整功能多样性 | B淋巴细胞的功能状态和克隆关系 | 机器学习 | 传染病,自身免疫病,癌症 | 单细胞RNA测序(ScRNA-seq), 单细胞BCR测序(ScBCR-seq) | 图卷积网络(GCN) | 基因表达数据和BCR序列数据 | 未提及具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞BCR测序 | NA | NA |
| 277 | 2026-06-10 |
Single-cell transcriptomics reveals phenotypic and functional alterations of erythroid progenitor cells in tuberculosis patients
2026-Mar, Tuberculosis (Edinburgh, Scotland)
DOI:10.1016/j.tube.2026.102746
PMID:41734583
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研究论文 | 利用单细胞转录组学揭示结核病患者红细胞祖细胞的表型和功能改变 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘了不同结核病阶段和不同组织部位中红细胞祖细胞的异质性,揭示了其与免疫细胞的双向通讯,并建立了基于红细胞祖细胞特征基因的潜伏结核感染预测模型 | 主要基于公开数据集分析,缺乏独立的验证队列;部分发现(如代谢重编程)需要进一步的实验验证 | 探究结核病不同阶段(潜伏感染、活动性结核、播散性结核)红细胞祖细胞的动态变化及其与免疫细胞的相互作用 | 红细胞祖细胞及其与免疫细胞(巨噬细胞、树突状细胞、单核细胞)的相互作用 | 单细胞转录组学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | 分类和聚类模型 | 单细胞转录组数据 | 健康对照、潜伏结核感染、结核病、播散性结核病患者的外周血单核细胞样本,以及结核病肺组织和邻近未受累区域样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 278 | 2026-06-10 |
Aging-associated differences in mammary tumor-initiating populations and immune evasion pathways in breast cancer
2026-Feb-24, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2523254123
PMID:41719331
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研究论文 | 利用大鼠乳腺肿瘤模型整合多组学分析,揭示衰老如何影响乳腺癌起始细胞群体和免疫逃逸通路 | 首次在体内模型中揭示衰老通过染色体不稳定驱动抗原呈递缺陷促进免疫逃逸的分子机制,并发现人类乳腺癌中同源染色体区域缺失与预后相关性 | 主要基于大鼠模型,人类数据为关联分析,未进行功能验证实验 | 解析衰老对乳腺癌发生发展、分子表型和免疫逃逸的影响机制 | N-甲基-N-亚硝基脲诱导的大鼠乳腺肿瘤模型及对应的人类乳腺癌数据 | 肿瘤生物学 | 乳腺癌 | bulk和单细胞转录组测序、全外显子测序、组织病理分析 | NA | 转录组数据、外显子测序数据、组织病理图像 | 大鼠模型(具体样本量未提供),人类乳腺癌数据(具体数量未提供) | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, whole-exome sequencing | NA | NA |
| 279 | 2026-06-10 |
Integrating scRNA-seq and snRNA-seq with spatial transcriptomics to unlock the xylem puzzle
2026-Feb-23, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04007-z
PMID:41724975
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研究论文 | 整合scRNA-seq和snRNA-seq与空间转录组学技术,解析杨树次生木质部发育的完整历程 | 首次整合单细胞RNA测序和单细胞核RNA测序数据,克服了原生成分分离对晚期木质部细胞的限制,构建了从形成层祖细胞到次生细胞壁沉积和程序性细胞死亡的完整发育图谱 | 未提及 | 重建木质部形成的完整发育景观,揭示次生细胞壁沉积和程序性细胞死亡的转录协调机制 | 杨树茎发育中的木质部细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞核RNA测序, 激光捕获显微切割, 支持向量机 | 支持向量机 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞核RNA-seq | NA | NA |
| 280 | 2026-06-10 |
Single-cell immunophenotyping identifies CD8+GZMK+IFNG+ T cells as a key immune population in cutaneous Lyme disease
2026-Feb-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.196741
PMID:41729083
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研究论文 | 通过单细胞免疫表型分析,鉴定出CD8+GZMK+IFNG+ T细胞是皮肤莱姆病中的关键免疫群体 | 首次在莱姆病红斑迁移病变中发现克隆扩增的CD8+GZMK+IFNG+ T细胞,并揭示其炎症潜力和早期抗Borrelia burgdorferi防御作用 | 未提及具体限制 | 比较莱姆病红斑迁移病变与自体未受累皮肤中的T细胞反应,以深入理解皮肤屏障对蜱传病原体的防御机制 | 莱姆病患者的红斑迁移病变和自体未受累皮肤的T细胞 | 数字病理学 | 莱姆病 | 单细胞RNA测序、适应性免疫受体测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 扩大样本量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |