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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2761 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA-Seq Analysis of Retinal Development Identifies NFI Factors as Regulating Mitotic Exit and Late-Born Cell Specification
2019-06-19, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2019.04.010
PMID:31128945
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析视网膜发育过程,发现NFI转录因子调控有丝分裂退出和晚生细胞特化 | 首次在视网膜发育过程中系统鉴定NFI转录因子对双极中间神经元和Müller胶质细胞命运特化的调控作用 | 研究主要基于转录组数据,缺乏直接的功能验证实验 | 揭示神经元前体细胞中基因表达的精确时序调控机制 | 视网膜发育过程中的神经元前体细胞和各类视网膜细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 10个发育阶段的视网膜样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2762 | 2025-10-06 |
Decomposing Cell Identity for Transfer Learning across Cellular Measurements, Platforms, Tissues, and Species
2019-05-22, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2019.04.004
PMID:31121116
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研究论文 | 开发了scCoGAPS和projectR工具,通过潜在空间表示和迁移学习实现跨细胞测量、平台、组织和物种的细胞身份分析 | 提出基于潜在空间分解的细胞身份分析方法,能够避免批次效应和技术特征干扰,实现跨数据集和物种的生物学特征比较 | 方法依赖于源数据集的质量和代表性,潜在空间的解释仍需进一步验证 | 开发单细胞RNA测序数据的探索性分析工具,实现跨数据集和物种的细胞身份比较 | 小鼠视网膜发育数据、成年小鼠视网膜、人类视网膜发育时间序列、发育中大脑scRNA-seq数据、染色质可及性数据和小鼠细胞类型图谱 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 潜在空间模型, 迁移学习 | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 多个单细胞RNA测序数据集,包括小鼠和人类样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2763 | 2025-10-06 |
Shared Lineage, Distinct Outcomes: Yap and Taz Loss Differentially Impact Schwann and Olfactory Ensheathing Cell Development Without Disrupting GnRH-1 Migration
2025-Oct, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.70057
PMID:40631762
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示嗅鞘细胞和雪旺细胞的共同起源及发育差异,并探讨Yap/Taz缺失对这两种细胞发育的影响 | 首次发现Yap/Taz缺失对嗅鞘细胞和雪旺细胞发育产生不同影响,同时证明GnRH-1神经元迁移在此过程中不受影响 | 研究仅使用小鼠胚胎模型,尚未在人类或其他物种中验证 | 探究Hippo通路在嗅鞘细胞发育中的作用及其对嗅觉系统发育的影响 | 小鼠胚胎鼻组织中的嗅鞘细胞、雪旺细胞、黑色素细胞和GnRH-1神经元 | 发育生物学 | 神经系统发育疾病 | 单细胞RNA测序, 条件性基因敲除 | Sox10-Cre转基因小鼠模型 | 单细胞转录组数据, 组织学图像 | 小鼠胚胎鼻组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2764 | 2025-10-06 |
Diverse Subpopulations of Reactive Astrocytes Following Chronic Toxoplasma Infection
2025-Oct, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.70053
PMID:40635167
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了慢性弓形虫感染后反应性星形胶质细胞的多样性亚群及其功能特征 | 首次发现表达转甲状腺素蛋白的Lcn2CreERT2+星形胶质细胞亚群在慢性神经炎症中的免疫调节作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类慢性神经炎症中的星形胶质细胞亚群演化仍需进一步验证 | 探究慢性神经炎症过程中反应性星形胶质细胞亚群的演化规律和功能特征 | 慢性弓形虫感染小鼠模型中的反应性星形胶质细胞 | 单细胞生物学 | 神经感染性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | Lcn2CreERT2报告基因小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2765 | 2025-10-06 |
ChemPerturb-seq screen identifies a small molecule cocktail enhancing human beta cell survival after subcutaneous transplantation
2025-Aug-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.06.002
PMID:40562034
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研究论文 | 开发了化学扰动测序技术,通过单细胞RNA测序筛选出能增强人β细胞皮下移植后存活的小分子组合 | 将化学筛选与单细胞RNA测序相结合,创建ChemPerturb-seq平台,实现系统性分析小分子处理后人β细胞的分子变化 | 发现的小分子组合仅对雌性小鼠有效,对雄性小鼠无效 | 筛选能增强人β细胞移植后存活和功能的小分子组合 | 人β细胞和原代胰岛 | 单细胞组学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | 人工智能 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2766 | 2025-10-06 |
Impact of Curcumin on the IL-17A-Mediated p53-Fibrinolytic System: Mouse Proteomics and Integrated Human Fibrosis scRNAseq Insights
2025-Aug, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-024-02167-3
PMID:39424752
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研究论文 | 本研究探讨姜黄素通过调节IL-17A介导的p53-纤溶系统对急性肺损伤向特发性肺纤维化发展的影响机制 | 首次整合小鼠蛋白质组学与人类肺纤维化单细胞RNA测序数据,揭示IL-17A在p53-纤溶系统中的新作用及姜黄素的调节机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据验证相对有限 | 阐明IL-17A在急性肺损伤向肺纤维化进展中的作用机制及姜黄素的治疗潜力 | C57BL/6小鼠和人类IPF肺组织标本 | 生物信息学 | 肺纤维化 | 蛋白质组学,单细胞RNA测序,分子对接 | Schroedinger分子对接模型 | 蛋白质组数据,单细胞RNA测序数据 | 20例IPF患者和10例对照肺组织标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2767 | 2025-10-06 |
Multiple Machine Learning Identifies Key Gene PHLDA1 Suppressing NAFLD Progression
2025-Aug, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-024-02164-6
PMID:39496918
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研究论文 | 本研究通过多种机器学习方法鉴定出PHLDA1基因在抑制非酒精性脂肪肝疾病进展中的关键作用 | 首次通过整合多种机器学习策略和单细胞RNA测序数据,系统鉴定PHLDA1作为NAFLD的新型生物标志物,并验证其在细胞和小鼠模型中的功能 | 研究主要基于公共数据库数据,临床样本验证有限,机制研究仍需深入 | 识别非酒精性脂肪肝疾病的新型生物标志物和治疗靶点 | 非酒精性脂肪肝疾病相关基因表达数据、细胞模型和小鼠模型 | 机器学习 | 非酒精性脂肪肝疾病 | 差异表达分析,WGCNA,机器学习,ROC分析,单细胞RNA测序,基因集富集分析 | 多种机器学习策略 | 基因表达数据,转录组数据,单细胞RNA测序数据 | 三个NAFLD数据集中的23个重叠差异表达基因 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2768 | 2025-10-06 |
Comprehensive Analysis of Sialylation-Related Gene Profiles and Their Impact on the Immune Microenvironment in Periodontitis
2025-Aug, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-024-02177-1
PMID:39609348
|
研究论文 | 通过综合分析唾液酸化相关基因谱及其对牙周炎免疫微环境的影响 | 首次系统鉴定牙周炎中唾液酸化相关核心基因并构建诊断模型,结合单细胞测序揭示唾液酸化对单核细胞发育和细胞通讯的影响 | 研究基于公共数据集,需要实验验证;样本量有限 | 识别与牙周炎相关的唾液酸化相关基因并探索其对牙周免疫微环境的影响 | 牙周炎患者 | 生物信息学 | 牙周炎 | 单细胞测序,差异表达分析,机器学习,加权基因共表达网络分析,伪时间序列分析,细胞通讯分析 | 机器学习诊断模型 | 基因表达数据,单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2769 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA-seq Reveals Increased and Activated Post-Capillary Venule Endothelial Cells in Erythrodermic Psoriasis
2025-Aug, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-024-02216-x
PMID:39786459
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了红皮病型银屑病中毛细血管后微静脉内皮细胞显著增加和激活的现象 | 首次在单细胞水平发现红皮病型银屑病中毛细血管后微静脉内皮细胞的异常增加和激活状态 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证 | 探究红皮病型银屑病中血管内皮细胞的病理变化 | 人类和小鼠的红皮病型银屑病皮肤组织样本 | 单细胞组学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序,免疫荧光,流式细胞术 | 轨迹分析 | 单细胞转录组数据,图像数据,流式数据 | 人类患者活检样本和小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2770 | 2025-10-06 |
A Functional Variant rs2122031 in ATG7 Is Associated with the Risk of Radiation Pneumonitis
2025-Aug, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2024-0238OC
PMID:39847703
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研究论文 | 本研究探讨了自噬相关基因ATG7的功能性变异rs2122031与放射性肺炎风险的关联 | 首次发现ATG7基因的功能性变异与放射性肺炎风险相关,并通过多组学方法验证了其分子机制 | 样本量相对有限(301例患者),仅分析了5个自噬相关基因的13个SNP | 研究自噬相关基因遗传变异与放射性肺炎风险的关联 | 接受放疗的301例患者、成纤维细胞和条件性基因敲除小鼠 | 医学遗传学 | 放射性肺炎 | MassArray基因分型、Sanger测序、qRT-PCR、免疫组化、单细胞RNA测序 | Cox风险比例模型 | 基因型数据、临床影像数据、基因表达数据 | 301例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2771 | 2025-10-06 |
Gene regulatory networks and essential transcription factors for de novo-originated genes
2025-Aug, Nature ecology & evolution
IF:13.9Q1
DOI:10.1038/s41559-025-02747-y
PMID:40659874
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研究论文 | 本研究通过计算方法和单细胞RNA测序数据识别调控de novo基因表达的关键转录因子 | 首次揭示了转录因子在调控de novo基因表达中的特异性作用,并发现某些转录因子更倾向于调控de novo基因 | 研究主要基于果蝇模型,在哺乳动物中的普适性需要进一步验证 | 探究de novo起源基因的调控网络和关键转录因子 | 果蝇中的de novo基因及其调控机制 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 计算方法, 遗传学工具, 基因组学工具 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2772 | 2025-10-06 |
Resolving the design principles that control post-natal vascular growth and scaling
2025-Jul-16, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101324
PMID:40628258
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研究论文 | 本研究通过多尺度实验和计算方法揭示了出生后主动脉生长的设计原则 | 发现了主动脉扩张遵循独特的生长原则,包括与血流对齐的两个时空协调的增殖波,以及通过细胞挤出维持稳态尺寸的新机制 | 研究主要关注主动脉,其他器官的生长原则可能不同 | 解析控制出生后血管生长和尺寸缩放的设计原则 | 小鼠主动脉组织 | 计算生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 数学建模 | 数学模型 | 基因表达数据, 细胞增殖数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2773 | 2025-10-06 |
Unveiling the mechanisms of CEBPD-orchestrated TAM polarization through RGS2/PAR2 pathway and its impact on ICB efficacy in clear cell renal cell carcinoma
2025-Jul-13, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010898
PMID:40659446
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研究论文 | 本研究揭示CEBPD通过RGS2/PAR2轴调控透明细胞肾细胞癌中肿瘤相关巨噬细胞极化并影响免疫检查点阻断剂疗效的机制 | 首次发现CEBPD作为关键转录因子通过RGS2/PAR2轴调控TAM极化状态,并证实其与ICB疗效的关联 | NA | 探索CEBPs在ccRCC免疫微环境中调控TAM极化的机制及其对免疫检查点阻断治疗的影响 | 透明细胞肾细胞癌中的肿瘤相关巨噬细胞 | 肿瘤免疫学 | 肾细胞癌 | 单细胞转录组测序, 蛋白质印迹, 免疫荧光, 体外极化实验, 染色质免疫沉淀测序, 双荧光素酶报告实验, 电泳迁移率变动分析 | NA | 转录组数据, 蛋白质数据, 临床标本数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2774 | 2025-10-06 |
Neuroprotectin D1 and GPR37 protect against chemotherapy-induced peripheral neuropathy and the transition from acute to chronic pain
2025-Jun, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2025.107746
PMID:40287118
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研究论文 | 本研究揭示了神经保护素D1及其受体GPR37在化疗引起的周围神经病变中对急性疼痛向慢性疼痛转变的保护作用 | 首次发现GPR37在初级感觉神经元中的表达及其在化疗神经病变中防止疼痛慢性化的关键作用,并证实NPD1通过GPR37依赖机制保护感觉神经元 | 研究主要基于动物模型,人类样本验证有限;GPR37在不同细胞类型中的具体作用机制仍需进一步阐明 | 探究NPD1/GPR37信号通路在化疗引起的周围神经病变和疼痛慢性化过程中的保护机制 | 小鼠背根神经节神经元和巨噬细胞,人类背根神经节样本 | 神经科学 | 化疗引起的周围神经病变 | 空间转录组学,基因敲除,原代细胞培养,行为学测试 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,行为学数据,组织学数据 | 野生型和Gpr37敲除小鼠,人类背根神经节样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2775 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics reveal unique subpopulations of infiltrating macrophages and dendritic cells following AKI
2025-Jun-01, American journal of physiology. Renal physiology
DOI:10.1152/ajprenal.00059.2025
PMID:40331777
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了急性肾损伤后肾脏浸润巨噬细胞和树突状细胞的独特亚群特征 | 首次结合单细胞RNA测序、空间转录组学和CITE测序技术,系统揭示了肾脏浸润免疫细胞在缺血性急性肾损伤中的时空动态变化和转录特征 | 研究聚焦于缺血再灌注损伤模型,可能不适用于其他类型的肾损伤 | 阐明急性肾损伤后肾脏浸润巨噬细胞和树突状细胞的时空分布和转录特征 | 肾脏浸润巨噬细胞(KIMs)和肾脏树突状细胞(KDCs) | 单细胞生物学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, CITE测序 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 2776 | 2025-10-06 |
Chevreul: An R Bioconductor Package for Exploratory Analysis of Full-Length Single Cell Sequencing
2025-Jun-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.27.656486
PMID:40501968
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研究论文 | 介绍Chevreul——一个用于单细胞RNA测序数据处理和可视化的R Bioconductor包及交互式Shiny应用 | 专门支持全长RNA测序数据的分析,包括外显子覆盖度和转录本异构体推断,并提供批处理校正功能 | NA | 开发一个易于使用的单细胞RNA测序数据分析工具 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2777 | 2025-10-06 |
Constructing a cross-tissue human knee single-cell atlas identified osteoarthritis reduces regenerative tissue stem cells while increasing inflammatory pain macrophages
2025-May-05, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6247502/v1
PMID:40386432
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研究论文 | 构建首个跨组织人类膝关节单细胞图谱,揭示骨关节炎减少再生性组织干细胞同时增加炎症疼痛巨噬细胞 | 首次构建包含关节软骨、半月板、滑膜和软骨下骨的膝关节骨关节炎综合单细胞图谱,发现组织间活跃通讯机制 | NA | 研究骨关节炎的跨组织分子机制和细胞组成变化 | 人类膝关节组织(关节软骨、半月板、滑膜、软骨下骨) | 单细胞组学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2778 | 2025-10-06 |
CHST4 associates with high-abundance immune infiltration in hormone receptor-positive breast cancer
2024-12-31, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiae190
PMID:39213175
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研究论文 | 本研究揭示了CHST4在激素受体阳性乳腺癌中通过调节免疫细胞浸润影响肿瘤进展的新机制 | 首次发现CHST4在HR+ BRCA中异常下调并与淋巴结转移相关,揭示了其通过调节硫酸化外周淋巴结地址素增强免疫细胞浸润的新功能 | 研究主要基于生物信息学分析和免疫组化验证,缺乏体内功能实验直接证明CHST4的因果作用 | 探究CHST4在激素受体阳性乳腺癌免疫浸润调控中的作用机制 | 激素受体阳性乳腺癌组织和相关免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 免疫组化染色、富集分析、单细胞测序分析 | NA | 组织样本、单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2779 | 2025-10-06 |
Immune landscape of isocitrate dehydrogenase-stratified primary and recurrent human gliomas
2024-Dec-05, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noae139
PMID:39126294
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研究论文 | 通过单细胞转录组学和光谱流式细胞术解析人类胶质瘤的免疫景观 | 发现表达颗粒溶素的新型炎症性小胶质细胞亚群,建立超越M1/M2范式的巨噬细胞极化基因组框架,提供胶质瘤特异性肿瘤免疫微环境参考特征 | 样本量相对有限,未完全阐明遗传差异和治疗效果对免疫的长期影响 | 解析IDH分层的人类原发性和复发性胶质瘤的免疫特征 | 48例人类胶质瘤样本中的免疫细胞 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞转录组测序, 光谱流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞术数据 | 144,678个单细胞转录组, 超过200万个免疫细胞, 来自48例人类胶质瘤 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2780 | 2025-10-06 |
Targeting immune-fibroblast cell communication in heart failure
2024-Nov, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08008-5
PMID:39443792
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研究论文 | 本研究通过多组学单细胞分析揭示了心力衰竭中免疫-成纤维细胞通讯的分子机制 | 首次在人类心脏疾病中系统描绘免疫-成纤维细胞通讯机制,并发现IL-1β信号通路在驱动FAP/POSTN成纤维细胞形成中的关键作用 | 研究样本量有限(45例),体外培养系统未能完全重现人类疾病表型 | 探索心力衰竭中免疫细胞与成纤维细胞间的通讯机制及其治疗潜力 | 健康供体、急性梗死和慢性心力衰竭的人类心脏组织 | 单细胞多组学 | 心血管疾病 | 单细胞基因表达谱、表位图谱、染色质可及性分析、空间转录组学 | NA | 单细胞多组学数据、空间转录组数据 | 45例人类心脏样本(包括健康供体、急性梗死和慢性心力衰竭) | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |