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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 2761 - 2780 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2761 | 2025-10-06 |
Effects of Cholesterol Metabolism on Corneal Endothelial Dysfunction in Patients With Type 1 Diabetes
2025-Aug-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.11.9
PMID:40762538
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研究论文 | 本研究从胆固醇代谢角度揭示糖尿病诱导角膜内皮功能障碍的机制 | 首次发现糖尿病通过抑制SREBF2/SQLE依赖的胆固醇生物合成途径导致角膜内皮功能障碍 | 研究主要基于动物模型和细胞实验，在人体中的直接证据有限 | 探究胆固醇代谢在糖尿病角膜内皮功能障碍中的作用机制 | 1型糖尿病小鼠模型、高糖培养的B4G12细胞、人和小鼠角膜内皮样本 | 眼科疾病研究 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序,RNA测序,RT-qPCR,Western blotting,免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据,图像数据 | 糖尿病小鼠模型和高糖培养细胞模型 | NA | single-cell RNA-seq,RNA-seq | NA | NA |
| 2762 | 2025-10-06 |
A lipid metabolism-related gene signature predicts prognosis after tamoxifen treatment in ER + breast cancer and reflects tumor microenvironment heterogeneity through single-cell analysis
2025-Jul-31, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-025-02194-5
PMID:40745642
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研究论文 | 本研究开发了一个基于脂质代谢相关基因的特征模型，用于预测ER阳性乳腺癌患者他莫昔芬治疗后的预后 | 整合脂质代谢基因表达和机器学习数据构建预后模型，并通过单细胞分析揭示肿瘤微环境异质性 | 研究样本量相对有限，需要更多独立队列验证 | 开发ER阳性乳腺癌患者他莫昔芬治疗后预后预测模型 | ER阳性乳腺癌患者 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞测序，机器学习 | 预后预测模型 | 基因表达数据 | TCGA-ER+BRCA数据集183例，验证数据集GSE17705(298例)、GSE22219(134例)、GSE42568(70例)、GSE58644(147例) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2763 | 2025-10-06 |
Dual lineage origins contribute to neocortical astrocyte diversity
2025-Jul-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61829-4
PMID:40738880
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和谱系追踪技术揭示了小鼠新皮质中星形胶质细胞的五种亚型及其双重谱系起源机制 | 首次发现新皮质星形胶质细胞存在两种不同的发育谱系，并鉴定出Olig2作为关键调控因子控制特定谱系的分化 | 研究仅聚焦于小鼠新皮质区域，尚未验证其他脑区或物种的普适性 | 探究星形胶质细胞多样性形成的发育机制 | 小鼠新皮质中的星形胶质细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 谱系追踪技术 | NA | 基因表达数据, 空间分布数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2764 | 2025-10-06 |
SETDB1 ensures the continuity of embryonic to adult neural stem cells through metabolic alterations in the dentate gyrus
2025-Jul-29, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2424315122
PMID:40699919
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研究论文 | 本研究揭示了SETDB1通过调控代谢状态确保胚胎神经祖细胞向成年神经干细胞连续转化的机制 | 首次发现SETDB1通过调控线粒体复合物组分COX6B2和氧化磷酸化过程，控制成年神经干细胞命运决定 | 研究主要聚焦于齿状回发育过程，其他脑区是否适用类似机制尚需验证 | 探索胚胎神经祖细胞向成年神经干细胞转化的分子机制 | 小鼠齿状回神经干细胞和星形胶质细胞 | 神经科学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2765 | 2025-10-06 |
Time-coexpress: temporal trajectory modeling of dynamic gene co-expression patterns using single-cell transcriptomics data
2025-Jul-29, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-025-06218-w
PMID:40731381
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研究论文 | 提出基于copula的TIME-CoExpress框架，用于建模单细胞转录组数据中基因共表达随细胞时间轨迹的非线性动态变化 | 首次将copula模型与数据驱动平滑函数结合，能够捕捉基因共表达的非线性动态变化，同时建模零膨胀率和平均表达水平的动态变化 | 方法性能仅在模拟分析和单个scRNAseq数据集上验证，需要更多真实数据验证其普适性 | 开发能够识别单细胞转录组数据中基因共表达动态变化的计算方法 | 基因共表达模式、零膨胀率、平均表达水平沿细胞时间轨迹的动态变化 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | copula模型、数据驱动平滑函数 | 单细胞转录组数据 | 垂体胚胎发育过程中的scRNAseq数据集，比较[公式：见正文]和野生型小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2766 | 2025-10-06 |
"Small extracellular vesicles: messengers at the service of breast cancer agenda in the primary and distant microenvironments"
2025-Jul-21, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-025-03471-y
PMID:40691627
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综述 | 本文综述了小细胞外囊泡在乳腺癌原发和远处微环境中的关键作用及其临床转化潜力 | 系统整合小细胞外囊泡在乳腺癌微环境通讯中的多功能角色，并探讨人工智能与多组学技术结合的解决方案 | 存在小细胞外囊泡异质性问题和追踪技术限制，临床转化仍面临靶向效率、体内稳定性等挑战 | 阐明小细胞外囊泡在乳腺癌进展和治疗抵抗中的分子机制及临床应用前景 | 乳腺癌相关的小细胞外囊泡及其携带的生物分子（蛋白质、脂质、非编码RNA等） | 肿瘤生物学 | 乳腺癌 | 超速离心、免疫亲和、微流控系统、单细胞转录组学、多组学分析 | NA | 分子生物学数据、临床数据 | NA | NA | 单细胞转录组学、多组学分析 | NA | NA |
| 2767 | 2025-10-06 |
Image-based inference of tumor cell trajectories enables large-scale cancer progression analysis
2025-Jul-18, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adv9466
PMID:40680117
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研究论文 | 开发基于人工智能的模型，利用H&E染色全切片图像推断肿瘤细胞轨迹并进行大规模癌症进展分析 | 首次利用常规病理切片中的细胞形态特征和组织学空间组织来推断肿瘤细胞分化状态和动态轨迹 | 方法依赖于图像质量，且在三组独立肺腺癌队列中验证但需进一步扩大验证范围 | 开发成本效益高的方法来分析肿瘤进展动态和肿瘤微环境细胞群体多样性 | 肺腺癌患者的H&E染色全切片图像和肿瘤细胞 | 数字病理 | 肺癌 | 人工智能模型，空间转录组学分析，批量转录组学分析 | AI模型 | 图像 | 三个独立肺腺癌队列 | NA | 空间转录组学，批量转录组学 | NA | NA |
| 2768 | 2025-10-06 |
Artifacts in spatial transcriptomics data: their detection, importance, prevalence, and prevention
2025-Jul-02, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf306
PMID:40748322
|
研究论文 | 开发了一种名为BLADE的空间转录组学数据伪影检测方法 | 首次提出跨平台的自动化统计方法，能够检测和去除三种类型的空间转录组数据伪影 | 仅验证了Visium和CosMx平台，在其他平台上的适用性尚未验证 | 开发空间转录组数据质量控制方法 | 空间转录组数据中的伪影 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组测序 | 统计方法 | 空间转录组数据 | 37个10x Visium样本（人类和小鼠的肝脏和脂肪组织） | 10x Genomics,Nanostring | 空间转录组学 | 10x Visium,CosMx | 10x Visium空间转录组平台，CosMx空间分子成像平台 |
| 2769 | 2025-10-06 |
PoweREST: Statistical power estimation for spatial transcriptomics experiments to detect differentially expressed genes between two conditions
2025-Jul, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013293
PMID:40729405
|
研究论文 | 开发了用于空间转录组学实验统计功效估计的工具PoweREST，支持10X Genomics Visium数据的差异表达基因检测功效计算 | 首个专门针对空间转录组学实验的统计功效估计工具，支持实验前和初步数据收集后的功效分析 | 目前仅支持10X Genomics Visium平台数据，未涵盖其他空间转录组学技术 | 解决空间转录组学实验中差异表达基因检测的统计功效计算问题 | 空间转录组学数据中的差异表达基因 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 统计功效分析模型 | 空间转录组学数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10X Genomics Visium空间转录组学平台 |
| 2770 | 2025-10-06 |
CrebA regulation of secretory capacity: Genome-wide transcription profiling coupled with in vivo DNA binding studies
2025-Jun-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.12.659381
PMID:40667345
|
研究论文 | 本研究通过DNA结合实验和单细胞RNA测序揭示了果蝇CrebA转录因子通过直接调控分泌途径组分基因来增强胚胎唾液腺分泌能力的机制 | 首次结合全基因组转录谱分析和体内DNA结合研究，系统阐明了CrebA转录因子在调控分泌能力中的功能保守性和组织特异性 | 尚不清楚功能性结合与非功能性结合的区别机制，以及CrebA是否在所有果蝇胚胎组织中都是驱动SPCG基因表达的主要因子 | 探究CrebA转录因子在调控分泌途径组分基因表达和增强分泌能力中的分子机制 | 果蝇胚胎唾液腺和哺乳动物组织中的分泌途径组分基因 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序, DNA结合测定, 表达分析, 结合位点诱变 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 野生型和CrebA缺失型果蝇胚胎 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2771 | 2025-10-06 |
Multiomics identifies tumor-intrinsic SREBP1 driving immune exclusion in hepatocellular carcinoma
2025-Jun-15, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-011537
PMID:40518290
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研究论文 | 通过多组学分析鉴定肝细胞癌中驱动免疫排斥的肿瘤内在因子SREBP1 | 首次通过大规模多组学分析发现SREBP1作为免疫排斥的核心调控因子，并通过功能实验验证其在巨噬细胞重编程和CD8 T细胞浸润中的作用 | 样本量相对有限（31个单细胞RNA-seq样本），主要依赖体外3D共培养模型验证 | 寻找克服肝细胞癌免疫检查点抑制剂耐药的新治疗靶点 | 肝细胞癌患者样本和体外细胞模型 | 多组学分析 | 肝细胞癌 | RNA测序, 蛋白质组学, 单细胞RNA测序, 成像质谱流式, 空间脂质组学, CRISPR基因敲除, 3D共培养 | 3D肿瘤-免疫共培养模型 | 基因组数据, 蛋白质组数据, 单细胞数据, 空间成像数据 | 900+人类样本, 31个肿瘤单细胞RNA-seq样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 质谱分析 | NA | 成像质谱流式技术, MALDI空间脂质组学分析 |
| 2772 | 2025-10-06 |
Systematic characterization of the ovarian landscape across mouse menopause models
2025-Jun-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.10.658920
PMID:40661543
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研究论文 | 本研究系统比较了三种小鼠绝经模型，揭示了卵巢衰老的分子特征和表型变化 | 首次系统比较三种不同绝经模型（自然衰老、化学诱导和遗传模型），结合单细胞转录组学和机器学习方法揭示模型特异性特征 | 研究仅限于小鼠模型，结果向人类转化的适用性需要进一步验证 | 建立可靠的临床前绝经模型以研究卵巢衰老的分子机制和系统性健康影响 | 三种小鼠绝经模型：自然衰老、VCD化学诱导和Foxl2单倍体不足遗传模型 | 生物医学研究 | 卵巢衰老相关疾病 | 组织学分析、血清激素分析、单细胞转录组学、机器学习 | 机器学习方法 | 组织图像、激素数据、单细胞转录组数据 | 三种不同小鼠模型的多年龄段样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2773 | 2025-10-06 |
Identifying Immunomodulatory Subpopulations of Adipose Stromal Vascular Fraction and Stem/Stromal Cells Through Single-Cell Transcriptomics and Bulk Proteomics
2025-Jun, Stem cell reviews and reports
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s12015-025-10889-6
PMID:40366552
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研究论文 | 通过单细胞转录组学和大体积蛋白质组学整合分析，识别脂肪基质血管组分中具有不同免疫调节表型的干细胞亚群 | 首次整合单细胞RNA测序和蛋白质组学数据，在未培养的基质血管组分中识别出与细胞因子激活的干细胞表型相似的亚群 | 研究样本量有限，主要基于体外实验数据 | 解析脂肪来源干细胞在基质血管组分中的异质性免疫调节潜能 | 脂肪来源的干细胞/基质细胞和基质血管组分 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 | Scissor算法 | 基因表达数据, 蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 大体积蛋白质组学 | NA | NA |
| 2774 | 2025-10-06 |
Prg4+ fibro-adipogenic progenitors in muscle are crucial for bone fracture repair
2025-May-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.14.654160
PMID:40462922
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研究论文 | 本研究揭示了肌肉中Prg4+纤维脂肪祖细胞在骨骨折修复中的关键作用 | 首次发现Prg4标记的FAP亚群能从肌肉迁移至骨折部位并分化为软骨细胞和骨细胞 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化价值需进一步验证 | 探究肌肉细胞在骨骨折修复中的贡献机制 | 小鼠肌肉组织和骨骨折模型 | 细胞生物学 | 骨损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2775 | 2025-10-06 |
Targeting FGFR4 Abrogates HNF1A-driven Metastasis in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma
2025-Feb-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.06.636643
PMID:39974881
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研究论文 | 本研究揭示了HNF1A通过上调FGFR4驱动胰腺导管腺癌转移的机制，并证明FGFR4抑制剂可有效阻断该转移过程 | 首次发现HNF1A通过调控FGFR4促进PDAC转移，并验证FGFR4抑制剂对转移的阻断作用 | 研究主要基于细胞系和动物模型，临床转化效果需进一步验证 | 探究HNF1A在PDAC转移中的作用机制并寻找靶向治疗策略 | 胰腺导管腺癌细胞系、患者来源PDAC细胞、小鼠移植瘤模型 | 癌症生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 组织芯片分析, UMAP空间分析, RNA干扰 | NA | 基因表达数据, 组织染色图像, 细胞迁移和侵袭数据 | ATCC细胞系、患者来源细胞及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组分析 | NA | NA |
| 2776 | 2025-10-06 |
Characteristics of a CCL21 Gene-Modified Dendritic Cell Vaccine Utilized for a Clinical Trial in Non-Small Cell Lung Cancer
2025-Feb-04, Molecular cancer therapeutics
IF:5.3Q1
DOI:10.1158/1535-7163.MCT-24-0435
PMID:39559833
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研究论文 | 本研究对CCL21基因修饰的树突状细胞疫苗进行了全面表征，并探讨了制造过程中多种因素对疫苗特性的影响 | 首次在非小细胞肺癌临床试验中采用CCL21基因修饰的树突状细胞疫苗，并通过单细胞RNA测序揭示了疫苗细胞的异质性特征 | 研究样本量有限，仅为I期临床试验结果，且使用健康供者血液可能影响疫苗特性的准确性 | 开发能够克服免疫治疗耐药性的新型树突状细胞疫苗 | 非小细胞肺癌患者 | 免疫治疗 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，腺病毒载体转导 | NA | 基因表达数据 | I期临床试验样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2777 | 2025-10-06 |
Identification of Nfel1a and Nfel3 as novel regulators for zebrafish thrombopoiesis
2025-02, Blood cells, molecules & diseases
DOI:10.1016/j.bcmd.2024.102897
PMID:39413675
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序发现斑马鱼血栓细胞与哺乳动物巨核细胞在基因表达上的相似性，并鉴定出Nfe2l1a和Nfe2l3作为调控血栓形成的新转录因子 | 首次在斑马鱼中鉴定出Nfe2l1a和Nfe2l3作为血栓形成的新型正调控转录因子 | 研究仅针对斑马鱼模型，未在哺乳动物中验证相关机制 | 探究Nfe2相关因子在斑马鱼血栓形成过程中的调控作用 | 斑马鱼血栓细胞 | 发育生物学 | 血液疾病 | 单细胞测序,基因敲低 | 斑马鱼模型 | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 2778 | 2025-10-06 |
TIME-CoExpress: Temporal Trajectory Modeling of Dynamic Gene Co-expression Patterns Using Single-Cell Transcriptomics Data
2025-Jan-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.23.634392
PMID:39896591
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研究论文 | 提出一种基于copula的方法来建模单细胞转录组数据中基因共表达模式沿细胞时间轨迹的非线性变化 | 使用数据驱动的平滑函数建模基因共表达的非线性变化，能够处理scRNAseq数据中的过度离散和零膨胀特征 | 仅通过模拟分析和单个数据集验证方法性能，需要更多真实数据验证 | 开发时序轨迹建模方法以识别细胞发育过程中差异共表达的基因组合 | 单细胞转录组数据中的基因共表达模式 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | copula模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2779 | 2025-10-06 |
SeqBMC: Single-cell data processing using iterative block matrix completion algorithm based on matrix factorisation
2025 Jan-Dec, IET systems biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1049/syb2.70003
PMID:39943646
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研究论文 | 提出基于矩阵分解的迭代块矩阵补全算法SeqBMC，用于处理单细胞RNA测序数据中的缺失值 | 使用基因频率对矩阵分块，通过矩阵分解算法完成分块后的小矩阵，同时保留块矩阵中可能存在的生物零值 | NA | 改进单细胞RNA测序数据中基因表达矩阵的缺失值补全方法 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达矩阵 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 矩阵分解算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2780 | 2025-10-06 |
Analysis of the Relationship Between NLRP3 and Alzheimer's Disease in Oligodendrocytes based on Bioinformatics and In Vitro Experiments
2025, Current Alzheimer research
IF:1.8Q4
|
研究论文 | 通过生物信息学分析和体外实验验证NLRP3在少突胶质细胞中与阿尔茨海默病的关联 | 首次结合生物信息学与分子生物学实验系统研究NLRP3在少突胶质细胞中与AD的关联，并构建了基于五个关键基因的诊断模型 | 研究主要基于公共数据库数据，需要进一步在体实验验证 | 探索NLRP3在少突胶质细胞中与阿尔茨海默病的潜在关联 | 阿尔茨海默病患者与健康对照的基因表达数据，少突胶质细胞 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 生物信息学分析，单细胞转录组学，RT-qPCR，免疫荧光，Western blot | LASSO回归，随机森林，支持向量机 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的AD相关公共数据集 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |