单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 39702 篇文献，本页显示第 2761 - 2780 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2761 | 2026-04-25 |
Single-cell profiling in ovarian germ cell and sex cord-stromal tumours
2025-Jun, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03012-6
PMID:40269311
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序绘制卵巢生殖细胞肿瘤和性索间质肿瘤的微环境图谱 | 首次对罕见卵巢生殖细胞肿瘤和性索间质肿瘤进行单细胞水平免疫和基质景观描绘 | 样本量有限，新鲜肿瘤样本仅来自12例，且部分肿瘤类型仅有单一样本 | 探索罕见卵巢生殖细胞肿瘤和性索间质肿瘤的免疫和基质微环境 | 66,919个细胞来自12个新鲜肿瘤样本，包括7例成人颗粒细胞瘤、1例幼年颗粒细胞瘤、1例支持-间质细胞瘤、2例未成熟畸胎瘤和1例无性细胞瘤 | 数字病理 | 卵巢生殖细胞肿瘤和性索间质肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 12个新鲜肿瘤样本，共66,919个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2762 | 2026-04-25 |
Spatiotemporal transcriptomics reveals key gene regulation for grain yield and quality in wheat
2025-Apr-11, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03569-8
PMID:40217326
|
研究论文 | 通过空间转录组学揭示了小麦籽粒产量和品质的关键基因调控 | 首次对小麦籽粒早期发育阶段进行空间转录组分析，鉴定了10种细胞类型及192个标记基因，并识别了负调控胚胎和籽粒大小的转录因子TaABI3-B1 | NA | 理解小麦籽粒发育的时空转录调控，为改良小麦产量和品质提供遗传资源 | 小麦籽粒，授粉后4至12天 | 转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 多个时间点（授粉后4至12天）的小麦籽粒样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2763 | 2026-04-25 |
Male preference for TERT alterations and HBV integration in young-age HBV-related HCC: implications for sex disparity
2025-Apr, Clinical and molecular hepatology
IF:14.0Q1
DOI:10.3350/cmh.2024.0545
PMID:39743888
|
research paper | 本研究探讨了端粒酶逆转录酶遗传改变和乙肝病毒整合在年轻男性乙肝相关肝细胞癌中的优势，並揭示了其对性别差异的影响 | 首次揭示了年轻男性中TERT遗传改变和HBV整合在TERT位点的显著富集与性别差异的关联，并通过单细胞RNA测序数据加以验证 | NA | 探究端粒酶逆转录酶遗传改变和乙肝病毒整合在乙肝相关肝细胞癌性别差异中的作用 | 310例乙肝相关肝细胞癌组织样本及其性别和年龄分层的TERT启动子突变和HBV整合谱 | machine learning | liver cancer | 单细胞RNA测序 | NA | 基因测序数据 | 310例乙肝相关肝细胞癌组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 2764 | 2026-04-25 |
A single-cell atlas of circulating immune cells over the first 2 months of age in extremely premature infants
2025-Mar-05, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adr0942
PMID:40043141
|
研究论文 | 对极早产儿出生后2个月内循环免疫细胞进行纵向多组学单细胞图谱分析 | 首次利用微量全血（250微升）对极早产儿进行纵向多组学分析，揭示其外周免疫发育轨迹与足月儿的差异，并发现早期持续激活的免疫特征 | 样本量较小（10名极早产儿），且未明确说明样本选择偏差或结果普适性 | 描述极早产儿出生后2个月内外周免疫细胞的发育轨迹 | 10名极早产儿（孕周小于30周）的外周血免疫细胞，以及健康成人和早产/足月脐带血样本 | 数字病理学 | 早产儿相关疾病 | 单细胞RNA测序、T细胞和B细胞受体测序、磷蛋白质谱流式细胞术 | NA | 单细胞转录组、免疫受体序列、蛋白质组学数据 | 10名极早产儿（1周、1个月、2个月共30个时间点样本），健康成人和早产/足月脐带血样本若干 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞免疫受体测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'转录组和免疫受体测序，磷蛋白质谱流式细胞术 |
| 2765 | 2026-04-25 |
Integrating spatial transcriptomics and single-nucleus RNA-seq revealed the specific inhibitory effects of TGF-β on intramuscular fat deposition
2025-03, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2696-5
PMID:39422812
|
研究论文 | 通过整合空间转录组和单核RNA测序，揭示TGF-β对肌内脂肪沉积的特异性抑制作用 | 首次结合空间转录组与单核RNA-seq技术，揭示TGF-β信号通路在不同脂肪含量猪肌内脂肪中的空间异质性及其对脂肪沉积的抑制作用，并发现肥胖小鼠中TGF-β抑制可加速肌肉修复 | 体外实验仅使用猪内皮细胞模拟高脂环境，且体内实验局限于小鼠模型，需进一步验证在人类中的适用性 | 研究TGF-β信号通路对肌内脂肪沉积的调控机制，探索其对肌肉萎缩和修复的潜在治疗靶点 | 猪背最长肌组织（不同肌内脂肪含量）、肥胖小鼠肌肉损伤模型 | 数字病理学 | 肌营养不良、肥胖相关肌肉萎缩 | 空间转录组学、单核RNA测序 | NA | 空间转录组数据、单核RNA-seq数据 | 不同肌内脂肪含量的猪背最长肌样本（具体数量未说明）、肥胖小鼠样本（具体数量未说明） | NA | 空间转录组学、单核RNA测序 | NA | NA |
| 2766 | 2026-04-25 |
Inhibiting mechanotransduction prevents scarring and yields regeneration in a large animal model
2025-Feb-19, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adt6387
PMID:39970235
|
研究论文 | 通过抑制机械传导（YAP）防止大型动物模型瘢痕形成并促进伤口再生 | 首次在红杜洛克猪（最接近人类瘢痕模型）中证明单次使用YAP抑制剂维替泊芬即可防止瘢痕形成并驱动伤口再生，并结合单细胞RNA测序和空间蛋白质组学分析揭示了成纤维细胞动态变化及YAP/IL-33信号轴的作用 | 未提及具体局限性 | 阐明YAP抑制在大型动物伤口再生中的作用机制，为临床转化预防人类皮肤瘢痕提供依据 | 红杜洛克猪伤口模型及人类新生儿包皮异种移植伤口模型 | 数字病理学 | 皮肤瘢痕 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间蛋白质组学分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质空间分布数据 | 未具体说明样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间蛋白质组学 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 2767 | 2026-04-25 |
Transcriptional determinants of goal-directed learning and representational drift in the parahippocampal cortex
2025-01-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.115175
PMID:39792551
|
研究论文 | 本文通过双光子钙成像与空间转录组学技术，揭示了内嗅皮层中目标导向学习的转录决定因素及表征漂移机制 | 首次结合空间转录组学和钙成像技术，识别出即刻早期基因定义的神经元网络，并发现脑源性神经营养因子缺失会破坏该网络及学习能力 | 未说明 | 解析内嗅皮层中表征漂移的分子机制及其在目标导向学习中的作用 | 小鼠内嗅皮层神经元 | 神经科学 | NA | 双光子钙成像, 空间转录组学 | NA | 钙成像图像, 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 双光子成像 | NA | NA |
| 2768 | 2026-04-25 |
Dissecting the cell microenvironment of ovarian endometrioma through single-cell RNA sequencing
2025-01, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2638-9
PMID:39470923
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序解析卵巢子宫内膜瘤的细胞微环境 | 首次利用单细胞转录组学揭示卵巢子宫内膜瘤中IGFBP5巨噬细胞激活、NK细胞耗竭及IQCG和KLF2上皮异常增殖等关键细胞和分子特征 | 样本量有限且仅聚焦于组织水平，可能未完全反映疾病进展中的动态变化 | 阐明卵巢子宫内膜瘤的分子和细胞机制，以改善诊断和治疗策略 | 卵巢子宫内膜瘤患者和健康捐赠者的子宫内膜组织细胞 | 单细胞转录组学 | 卵巢子宫内膜瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 超过52,000个来自卵巢子宫内膜瘤患者和健康捐赠者的单个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 2769 | 2026-04-25 |
Resolving the developmental mechanisms of cardiac microthrombosis of SARS-CoV-2 based on single-cell transcriptome analysis
2025-01, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-023-2624-9
PMID:39470924
|
研究论文 | 利用单细胞转录组分析解析SARS-CoV-2引发心脏微血栓的发育机制 | 首次通过单细胞测序分析揭示了SARS-CoV-2感染后心脏微血栓形成的关键细胞类型（MYO1ERASGEF1B单核来源巨噬细胞）及其通过激活趋化因子CCL3和CCL5启动外源性凝血通路的机制，并发现铁含量升高、氧化应激和代谢改变在其中的作用 | 样本来源仅限于死亡患者，可能无法完全代表整体病程；缺乏对活体患者动态变化的验证 | 阐明SARS-CoV-2感染引起心脏微血栓的细胞和分子机制 | 健康捐赠者、COVID-19伴凝血异常高凝期死亡患者和纤溶期死亡患者的右心室游离壁组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 61,187个细胞，来自24种免疫细胞亚群和13种心脏驻留细胞亚群 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2770 | 2026-04-25 |
Lung macrophages in pulmonary homeostasis and disease: from basic biology to clinical applications
2025, Central-European journal of immunology
DOI:10.5114/ceji.2025.154651
PMID:42028388
|
综述 | 总结了肺巨噬细胞在肺部稳态和疾病中的基本生物学功能及其作用机制 | 通过单细胞转录组学、CRISPR基因编辑和蛋白质组学等先进技术，系统揭示了肺巨噬细胞的异质性、发育起源和功能景观 | 该领域仍面临挑战，未来研究需要跨学科努力以阐明巨噬细胞在疾病中的分子机制 | 探讨肺巨噬细胞在肺部疾病中的作用机制及临床应用的潜在治疗靶点 | 肺巨噬细胞 | machine learning | lung cancer, acute respiratory distress syndrome, asthma, chronic obstructive pulmonary disease, influenza, tuberculosis | 单细胞转录组学、CRISPR基因编辑、蛋白质组学 | NA | NA | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 2771 | 2026-04-25 |
[Current applications and translational prospects of omics technologies in urothelial carcinoma]
2024-Nov-01, Zhonghua wai ke za zhi [Chinese journal of surgery]
|
综述 | 本文综述了组学技术在尿路上皮癌诊断和治疗中的当前应用与转化前景 | 结合国家关键策略，深入探讨组学技术如何推动尿路上皮癌诊疗的新发展，包括单细胞组学和空间转录组学在细胞异质性和肿瘤微环境中的新见解 | 尚未提及具体局限性 | 探讨组学技术在尿路上皮癌诊疗中的应用和转化前景 | 尿路上皮癌 | 机器学习 | 尿路上皮癌 | 组学技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2772 | 2026-04-25 |
Single-cell transcriptomics of rectal organoids from individuals with perianal fistulizing Crohn's disease reveals patient-specific signatures
2024-10-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-75947-4
PMID:39477985
|
研究论文 | 通过对肛周瘘管型克罗恩病患者直肠类器官进行单细胞转录组测序，揭示了患者特异性基因表达特征 | 首次利用单细胞转录组技术对直肠类器官进行分析，发现了与疾病、性别和祖源相关的基因表达特征，并确认类器官保留了干细胞和扩增区的疾病信号 | 类器官缺乏在病变粘膜上皮细胞中观察到的许多炎症信号，可能限制了其模拟炎症微环境的能力 | 探讨肛周瘘管型克罗恩病患者直肠上皮干细胞区室在转录水平上的病理决定因素 | 肛周瘘管型克罗恩病患者和健康对照的直肠类器官与粘膜上皮细胞 | 单细胞转录组学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 13例患者（8例CD、5例对照）提供77,044个类器官细胞；29例患者（18例CD、11例对照）提供141,367个粘膜上皮细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 2773 | 2026-04-25 |
Characterization of cell states in biliary tract cancers identifies mechanisms of therapeutic resistance in a phase II trial of DKN-01/nivolumab
2024-Oct-08, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2024.10.08.24315092
PMID:39417106
|
临床试验/研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析胆道癌患者在接受DKN-01联合纳武利尤单抗治疗前后的细胞状态，揭示治疗耐药机制 | 首次系统分类胆道癌恶性细胞状态（包括此前未描述的神经样和内皮样状态），并阐明联合免疫治疗的耐药机制 | 单臂II期试验未观察到客观缓解，样本量有限，需进一步验证细胞状态分类的普适性 | 探索胆道癌对DKN-01/纳武利尤单抗联合治疗的耐药机制 | 晚期胆道癌患者配对的治疗前和治疗中活检样本 | 数字病理学 | 胆道癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 晚期胆道癌患者（具体数量未在摘要中提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2774 | 2026-04-25 |
A Prime-Boost Vaccination Approach Induces Lung Resident Memory CD8+ T Cells Derived from Central Memory T Cells That Prevent Tumor Lung Metastasis
2024-Oct-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-3257
PMID:39350665
|
研究论文 | 通过初免-加强疫苗接种策略诱导源自中央记忆T细胞的肺部常驻记忆CD8+ T细胞，从而预防肿瘤肺转移 | 发现通过肌肉注射DNA疫苗初免后鼻腔喷注减毒流感病毒载体疫苗加强的免疫策略，能高效诱导肺部CD8+常驻记忆T细胞，并证实这些细胞来源于DNA疫苗诱导的中央记忆T细胞，且通过单细胞RNA测序揭示了其转录组重编程过程 | 未提及具体限制 | 探究疫苗诱导的肺部常驻记忆T细胞的来源及其在预防肿瘤肺转移中的作用 | 小鼠模型中的中央记忆T细胞、肺部常驻记忆T细胞及转移性黑色素瘤和间皮瘤 | 免疫学 | 黑色素瘤、间皮瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠样本，具体数量未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 2775 | 2026-04-25 |
Periportal macrophages protect against commensal-driven liver inflammation
2024-05, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07372-6
PMID:38658756
|
研究论文 | 揭示了门静脉周围区域富含一种表达Marco的免疫抑制性巨噬细胞，该细胞由肠道微生物群诱导，通过白细胞介素-10和Marco受体抑制炎症，其功能缺失会促进肝脏炎性疾病 | 首次通过活体成像和区域特异性单细胞转录组学发现门静脉周围区域存在免疫抑制性巨噬细胞，并鉴定出Odoribacteraceae菌科及其后生元isoallolithocholic acid诱导该细胞亚群，阐明了共生菌与肝脏免疫稳态之间的新机制 | 研究主要基于动物模型和体外验证，缺乏直接的人类临床数据支持 | 探究肝脏门静脉周围与中央静脉周围区域免疫系统的功能差异及其在炎症调控中的作用机制 | 肝脏门静脉周围区域富含Marco的免疫抑制性巨噬细胞及其与肠道微生物群的互作关系 | 免疫学 | 原发性硬化性胆管炎、非酒精性脂肪性肝炎 | 活体成像、区域特异性单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型及体外培养细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'基因表达分析平台 |
| 2776 | 2026-04-25 |
spVC for the detection and interpretation of spatial gene expression variation
2024-04-19, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03245-3
PMID:38641849
|
研究论文 | 提出 spVC 方法，用于检测和解释空间基因表达变异 | 基于广义泊松模型，整合协变量的常数和空间变化效应，提高连续表达模式捕获能力和可解释性 | 未明确提及局限性 | 开发一种统计方法来检测和解释空间转录组数据中的基因表达变异 | 空间转录组数据中的基因表达模式 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 广义泊松模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2777 | 2026-04-25 |
[Prediction of prognosis of patients with radical resection of intrahepatic cholangiocarcinoma based on single cell omics]
2024-Apr-01, Zhonghua wai ke za zhi [Chinese journal of surgery]
|
研究论文 | 基于单细胞组学分析肝内胆管癌根治术后患者预后预测 | 首次通过单细胞测序整合多个数据集，识别与预后相关的关键上皮细胞亚群，并提出抗氧化型与非抗氧化型的ICC组织分型概念，构建预后预测模型 | 研究为回顾性病例系列，样本量有限，且模型验证仅基于公开数据集，可能需进一步外部验证 | 分析基于单细胞组学的肝内胆管癌根治术后患者预后预测 | 肝内胆管癌患者（46例单细胞测序、100例微阵列数据） | 计算机视觉, 机器学习 | 肝内胆管癌 | 单细胞测序, 微阵列分析, ssGSEA算法, Cox比例风险模型 | Cox比例风险模型 | 单细胞测序数据, 微阵列表达数据 | 46例患者（单细胞测序），100例患者（微阵列数据） | Gene Expression Omnibus数据库, EMBI数据库 | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2778 | 2026-04-25 |
Elucidating the changes in the heterogeneity and function of radiation-induced cardiac macrophages using single-cell RNA sequencing
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1363278
PMID:38601160
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序揭示辐射诱导心脏巨噬细胞的异质性和功能变化 | 首次在辐射诱导心脏损伤动物模型中，表征早期阶段巨噬细胞的多样性、特征及演化 | NA | 探究辐射后心脏功能的早期变化及心脏巨噬细胞在此过程中的作用 | 辐射诱导心脏损伤小鼠模型中的心脏巨噬细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠心脏组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2779 | 2026-04-25 |
ΔNp63 Regulates Homeostasis, Stemness, and Suppression of Inflammation in the Adult Epidermis
2024-01, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2023.07.005
PMID:37543242
|
研究论文 | 本研究揭示ΔNp63在成年表皮中调控稳态、干细胞性和抑制炎症的关键作用 | 首次通过急性基因敲除实验证明ΔNp63在成年表皮中维持角质形成细胞增殖和自我更新，并抑制银屑病样炎症 | 仅在小鼠模型中研究，未在人体表皮中验证；ΔNp63敲除后细胞消失机制未完全阐明 | 探究ΔNp63在成年表皮中的功能及其调控机制 | 成年小鼠表皮角质形成细胞 | 分子生物学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠表皮样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2780 | 2026-04-25 |
[Single-cell transcriptome analysis reveals development atlas of mouse molar pulp cells]
2023-May-09, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序分析小鼠磨牙发育过程，构建牙髓细胞时空发育图谱 | 首次构建小鼠磨牙牙髓细胞发育的时空图谱，揭示牙髓细胞分化为成熟牙髓细胞和成牙本质细胞的两条发育轨迹 | 仅使用小鼠模型，研究时间点有限（出生后第0、3、7天） | 研究牙齿发育过程中牙髓细胞的发育过程和调控机制 | C57BL/6小鼠的十颗下颌第一磨牙（出生后第0天和第3天）及之前研究中的第7天数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 10颗小鼠下颌第一磨牙（出生后第0天和第3天各5颗） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics平台进行单细胞RNA测序 |