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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2761 | 2025-11-20 |
[Single cell sequencing technology for analyzing the interaction between type 3 innate lymphoid cells and regulatory T cells in patients with fibrostenotic Crohn's disease]
2025-Nov-25, Zhonghua yi xue za zhi
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术分析纤维狭窄型克罗恩病患者中3型先天淋巴细胞与调节性T细胞的相互作用 | 首次在纤维狭窄型克罗恩病患者中利用单细胞测序技术系统分析ILC3与Treg细胞的相互作用及其对肠道免疫微环境的影响 | 样本量较小(共7例患者),且为回顾性研究设计 | 研究纤维狭窄型克罗恩病患者中ILC3与Treg细胞的相互作用机制 | 纤维狭窄型克罗恩病患者的肠道纤维化组织和非纤维化组织样本 | 单细胞生物学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 7例纤维狭窄型克罗恩病患者(温州组1例,瑞金组6例) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2762 | 2025-11-20 |
Nerandomilast, a PDE4B inhibitor, alleviates silica-induced lung inflammation and fibrosis by inhibition of NLRP3 inflammasome and TGF-β/Smad signalling
2025-Nov-19, British journal of pharmacology
IF:6.8Q1
DOI:10.1111/bph.70240
PMID:41255094
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研究论文 | 本研究评估了PDE4B抑制剂Nerandomilast在矽肺模型中通过抑制NLRP3炎症小体和TGF-β/Smad信号通路减轻肺部炎症和纤维化的作用 | 首次发现PDE4B是矽肺发病机制的关键调控靶点,并证实其抑制剂Nerandomilast通过双重抑制经典/非经典NLRP3炎症小体通路和TGF-β/Smad信号发挥治疗作用 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系,尚未在人体中进行验证 | 探究PDE4B抑制剂Nerandomilast治疗矽肺的疗效和作用机制 | 雄性C57BL/6N小鼠、THP-1巨噬细胞、MRC-5细胞 | 医学研究 | 矽肺 | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序、转录组分析 | 动物模型、细胞模型 | 基因表达数据、功能测试数据 | 小鼠模型和细胞系实验 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 2763 | 2025-11-20 |
LPS-Binding Hydrogel for TLR4-Mediated Microbiota-Immune Modulation
2025-Nov-19, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202514484
PMID:41255157
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研究论文 | 开发了一种结合抗菌和免疫调节功能的LPS结合水凝胶,用于治疗微生物失调引起的炎症并促进复杂粘膜伤口愈合 | 开发了协同LPS结合水凝胶(OCMC-PMBP),结合多粘菌素B靶向脂质A的细菌裂解和聚乙烯亚胺的静电LPS捕获功能 | NA | 解决微生物失调引起的炎症并增强复杂粘膜伤口的再生愈合 | 口鼻穿孔伤口(与腭裂修复相关的复杂易感染状况) | 生物材料 | 伤口愈合障碍 | 16S rRNA测序,宏基因组学,单细胞转录组学 | NA | 微生物组数据,基因表达数据,单细胞数据 | 临床微生物组分析和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2764 | 2025-11-20 |
Methodologies for Sample Multiplexing and Computational Deconvolution in Single-Cell Sequencing
2025-Nov-19, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202513396
PMID:41255264
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综述 | 本文全面综述单细胞测序中的样本多重标记技术和计算解卷积方法 | 首次提供单细胞多重标记领域实验策略与计算算法的整合视角,强调实验设计与计算准确性的关键联系 | 作为综述文章,未涉及原始实验数据验证 | 指导研究人员选择合适方法加速疾病机制、治疗反应和发育生物学研究 | 单细胞测序技术及其在生物医学研究中的应用 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,单细胞多组学 | NA | NA |
| 2765 | 2025-11-20 |
C-X-C chemokine receptor CXCR4 mediates diurnal changes in the aggregation and dispersion of CD8+ T cells within the tumor microenvironment
2025-Nov-19, International journal of cancer
IF:5.7Q1
DOI:10.1002/ijc.70252
PMID:41257391
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研究论文 | 本研究揭示了CXCR4受体介导CD8+ T细胞在肿瘤微环境中昼夜节律性聚集与分散的机制 | 首次发现CXCR4介导的CD8+ T细胞在肿瘤微环境中的昼夜分布变化,并揭示TGF-β-SMAD信号通路通过SMAD7时间依赖性调控CXCR4表达的机制 | 研究主要聚焦于肺癌模型,未验证其他癌症类型中是否存在相同机制 | 探究昼夜节律如何调控CD8+ T细胞在肿瘤微环境中的空间定位及其对免疫检查点抑制剂疗效的影响 | CD8+ T细胞、肿瘤微环境、肺癌患者T细胞 | 免疫学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 肺癌患者T细胞单细胞RNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2766 | 2025-11-20 |
FMT promotes type 2 mucosal immune responses with colonic epithelium proliferation in recurrent CDI patients
2025-Nov-18, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.195678
PMID:41252206
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研究论文 | 本研究通过分析复发性艰难梭菌感染患者接受粪菌移植治疗后的样本,揭示了FMT通过促进结肠上皮增殖和2型免疫反应发挥治疗作用的机制 | 首次发现FMT通过上调IL-33和双调蛋白表达,激活Myc和mTORC1通路,促进结肠上皮增殖,从而驱动组织再生 | 样本量较小(n=16),缺乏长期随访数据,机制研究仍需进一步验证 | 探究粪菌移植治疗复发性艰难梭菌感染的分子机制 | 复发性艰难梭菌感染患者(n=16)和健康对照 | 微生物组学 | 肠道感染 | 高通量测序,流式细胞术,空间转录组学 | NA | 基因表达数据,微生物组数据,免疫表型数据 | 16名rCDI患者及健康对照 | NA | 空间转录组学,单细胞基因集 | NA | NA |
| 2767 | 2025-11-20 |
TNF Superfamily Member 14 Drives Post-Influenza Depletion of Alveolar Macrophages Enabling Secondary Pneumococcal Pneumonia
2025-Nov-18, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI185390
PMID:41252214
|
研究论文 | 本研究揭示了TNF超家族成员14(TNFSF14)在流感后肺泡巨噬细胞耗竭及继发肺炎链球菌肺炎中的关键作用机制 | 首次发现TNFSF14配体-受体轴是驱动流感后组织驻留肺泡巨噬细胞死亡的关键因素,并证明靶向该通路可减轻疾病严重程度 | 研究主要基于动物模型,人类患者数据有限 | 阐明流感后继发细菌性肺炎的分子机制并探索治疗靶点 | 流感病毒感染和流感/肺炎链球菌共感染的小鼠模型,以及病毒诱导ARDS患者的支气管肺泡灌洗液 | 免疫学 | 肺炎 | 单细胞转录组学,细胞特异性PCR分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,基因表达数据 | 动物模型和人类患者样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2768 | 2025-11-20 |
Cell-dependent contributions of thrombospondin-1 to the rupture of abdominal aortic aneurysm in mice
2025-Nov-18, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaf243
PMID:41252281
|
研究论文 | 本研究通过细胞特异性基因敲除技术探讨了不同细胞来源的血栓反应蛋白-1对小鼠腹主动脉瘤破裂的影响 | 首次揭示髓系细胞来源的TSP1在抑制动脉瘤破裂中的关键保护作用,而传统认为TSP1主要促进动脉瘤形成 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中得到验证;使用的动脉瘤诱导方法可能不完全模拟人类疾病自然进程 | 研究不同细胞类型中TSP1缺失对腹主动脉瘤破裂的影响机制 | 高胆固醇血症小鼠模型及细胞特异性TSP1敲除小鼠 | 心血管疾病研究 | 腹主动脉瘤 | 单细胞RNA测序,组织学分析,基因敲除技术 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,组织病理数据 | 多种基因修饰小鼠模型,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2769 | 2025-11-20 |
Single-Cell and Spatial Transcriptomic Analysis Reveals Shared and Cancer-Type-Specific Cellular Interactions and Chemokine Signaling Associated With Tertiary Lymphoid Structures in Colorectal and Gastric Cancers
2025-Nov-18, Molecular carcinogenesis
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/mc.70058
PMID:41252687
|
研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学分析结直肠癌和胃癌中三级淋巴结构的细胞相互作用和趋化因子信号 | 首次在单细胞分辨率下揭示结直肠癌和胃癌中三级淋巴结构的空间分布特征和癌症类型特异性免疫招募回路 | 研究样本量有限,调控机制仍需进一步验证 | 阐明胃肠道恶性肿瘤中三级淋巴结构的空间分布和趋化因子信号调控机制 | 结直肠癌和胃癌组织样本 | 数字病理学 | 结直肠癌,胃癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 2770 | 2025-11-20 |
Lactylation-Related Gene Signature and Immune Infiltration Crosstalk in Heart Failure: Insights from Bulk and Single-Cell Transcriptomics
2025-Nov-18, Journal of cardiovascular pharmacology
IF:2.6Q2
DOI:10.1097/FJC.0000000000001775
PMID:41252712
|
研究论文 | 本研究通过批量转录组和单细胞转录组分析,探讨了乳酰化相关基因特征与心力衰竭免疫浸润的相互作用 | 首次系统研究蛋白质乳酰化修饰在心力衰竭免疫微环境中的作用,并建立了14基因乳酰化相关基因诊断模型和鉴定出6个枢纽基因 | 需要进一步研究验证这些基因通过免疫微环境机制在心力衰竭中的调控作用 | 探索乳酰化修饰在心力衰竭免疫微环境中的作用机制 | 心力衰竭患者样本和心力衰竭小鼠模型 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | 基因特征模型 | 基因表达数据 | 200例心力衰竭样本和166例非心力衰竭对照样本 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 2771 | 2025-11-20 |
T cell immune dysfunction and progression to severe COVID-19 in asthma revealed by single-cell RNA sequencing
2025-Nov-18, Tuberculosis and respiratory diseases
IF:2.5Q2
DOI:10.4046/trd.2025.0099
PMID:41253375
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究哮喘患者中T细胞免疫功能障碍与进展为重症COVID-19的关联 | 首次使用单细胞RNA测序揭示哮喘患者中T细胞比例减少和细胞毒性CD8+ T细胞扩增与重症COVID-19发展的关联 | 样本量较小(仅12名患者),特别是哮喘/重症COVID-19组仅有1名患者 | 评估哮喘患者免疫功能障碍与进展为重症COVID-19之间的关联 | 哮喘和非哮喘COVID-19患者的外周免疫细胞 | 单细胞组学 | COVID-19, 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 12名患者(4名哮喘,8名非哮喘),共155,565个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2772 | 2025-11-20 |
BM-MSC-derived migrasomes reverse stroke-induced thymic atrophy and immunosuppression via Pin1 delivery to thymic epithelial cells
2025-Nov-15, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03604-2
PMID:41241718
|
研究论文 | 本研究揭示骨髓间充质干细胞通过分泌迁移体递送Pin1蛋白,逆转中风诱导的胸腺萎缩和免疫抑制 | 首次发现BM-MSC来源的迁移体能够穿越血胸屏障,通过递送细胞周期调节蛋白Pin1特异性促进胸腺上皮细胞增殖 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中验证 | 解决中风后神经保护与免疫抑制之间的临床困境 | 骨髓间充质干细胞、迁移体、胸腺上皮细胞、T细胞 | 细胞生物学 | 中风 | 单细胞RNA测序、液相色谱-串联质谱、体外实验 | 动物模型 | 基因表达数据、蛋白质组数据 | 中风模型小鼠 | NA | 单细胞RNA测序、蛋白质组学 | NA | NA |
| 2773 | 2025-11-20 |
Inferring pathway activity from single-cell and spatial transcriptomics data with PaaSc
2025-Nov, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013666
PMID:41212919
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研究论文 | 开发了一种名为PaaSc的计算方法,用于从单细胞和空间转录组数据推断通路活性 | 使用多重对应分析将细胞和基因同时投影到共同潜在空间,并通过线性回归选择通路相关维度来推断通路活性得分 | NA | 将高维单细胞和空间转录组数据转化为功能性通路见解 | 单细胞和空间转录组数据 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,scATAC-seq | 多重对应分析,线性回归 | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学,scATAC-seq | NA | NA |
| 2774 | 2025-11-20 |
Enhancing Spatial Transcriptomics via Spatially Constrained Matrix Decomposition with EDGES
2025-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202508346
PMID:40842021
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研究论文 | 本文开发了一种名为EDGES的空间约束矩阵分解框架,用于增强空间转录组数据的基因表达预测和去噪 | 通过图拉普拉斯正则化整合空间信息,同时协同整合细胞表示和基因特异性表示,确保预测基因表达与真实ST分布紧密对齐 | NA | 解决成像基空间转录组技术在基因检测能力和表达谱测量准确性方面的局限性 | 空间转录组数据 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 非负矩阵分解 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2775 | 2025-11-20 |
stTrace: detecting spatial-temporal domains from spatial transcriptome to trace developmental path
2025-Nov-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf606
PMID:41241818
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研究论文 | 提出一种从空间转录组数据中检测时空域以追踪发育路径的算法stTrace | 整合细胞发育程度、基因表达和空间位置信息识别时空域,并揭示其层次发育关系 | NA | 开发从空间转录组数据追踪发育路径的算法 | 小鼠胚胎和人类乳腺癌数据 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | stTrace算法 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2776 | 2025-11-20 |
Characterization of tertiary lymphoid structure identifies competitive binding of CD40 and STING with TRAF2 driving IRF4-mediated B cell activation in esophageal squamous cell carcinoma
2025-Nov, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-025-00944-2
PMID:40855365
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研究论文 | 本研究通过分析食管鳞状细胞癌中三级淋巴结构的特征,揭示了CD40和STING与TRAF2竞争性结合通过非经典NF-κB信号通路驱动IRF4介导的B细胞激活机制 | 首次发现CD40和STING与TRAF2的竞争性结合关系,阐明其通过调节IRF4表达促进B细胞激活的新机制 | 研究主要基于体外实验,需要进一步体内验证 | 探索三级淋巴结构在食管鳞状细胞癌中的临床意义及其抗肿瘤作用的生物学机制 | 食管鳞状细胞癌患者样本和体外培养的B细胞 | 癌症免疫学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,转录组分析,体外实验 | NA | 转录组数据,单细胞RNA测序数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2777 | 2025-11-02 |
Duplicated genes find their space: Spatial transcriptomics illuminates evolutionary fates
2025-Oct-31, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koaf265
PMID:41175099
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2778 | 2025-11-20 |
Medium-Chain Fatty Acid exposure in non-transformed mammary glands leads to pro-tumorigenic alterations associated with aging
2025-Oct-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.01.679891
PMID:41256444
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现中链脂肪酸暴露会导致非转化乳腺组织出现类似衰老的前肿瘤性改变 | 首次揭示中链脂肪酸辛酸通过改变细胞间连接和细胞外基质相互作用,诱导乳腺组织产生与衰老相关的前肿瘤性变化 | 研究主要关注非转化乳腺组织,未在肿瘤模型中验证这些变化对癌症发展的直接影响 | 探索乳腺局部环境中影响乳腺癌发生的病因学和生物学因素 | 非转化乳腺组织 | 单细胞测序分析 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2779 | 2025-11-20 |
Mechanisms of Sepsis From a Metabolic Immunology Perspective: A Bidirectional Mendelian Randomization and Single-Cell Sequencing Study of CD39 + Cells
2025-Oct-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002633
PMID:40663487
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研究论文 | 本研究通过双向孟德尔随机化和单细胞测序分析,探讨了CD39+细胞在脓毒症发病机制中的代谢免疫作用 | 首次整合双向孟德尔随机化和单细胞转录组学方法,揭示CD39+CD8+T细胞通过代谢中间产物如雄酮硫酸盐驱动脓毒症进展的机制 | 研究样本量相对有限,需要进一步验证代谢物与免疫表型之间的因果关系 | 研究脓毒症发病机制中免疫表型与代谢物之间的相互作用 | 脓毒症患者与对照组的免疫细胞,特别是CD39+CD8+T细胞 | 生物信息学 | 脓毒症 | 双向孟德尔随机化,单细胞RNA测序 | MR分析,单细胞聚类分析 | 基因组关联研究数据,代谢组数据,单细胞转录组数据 | 11,643例脓毒症病例,GSE167363数据集(脓毒症vs对照组) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2780 | 2025-11-20 |
Single-Cell Sequencing Identifies the Crucial Role of Mitochondrial Fission-Fusion Imbalance in Heart Failure Progression
2025-Oct, Journal of cardiovascular translational research
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12265-025-10662-7
PMID:40711504
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研究论文 | 通过单细胞测序比较病理性和生理性心脏肥大的分子机制差异,揭示线粒体融合/分裂失衡在心力衰竭进展中的关键作用 | 首次在单细胞水平系统比较病理性和生理性心脏肥大的线粒体动态变化,发现融合/分裂比率的时间动态变化是决定心脏命运的关键因素 | 研究主要基于动物模型,需要进一步验证在人类心脏疾病中的适用性 | 阐明病理性和生理性心脏肥大的分子机制差异,揭示心力衰竭的发病机制 | TAC诱导的病理性心脏肥大和运动诱导的生理性心脏肥大小鼠模型 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序, bulk转录组测序 | NA | 转录组数据 | 多个时间点(2周、5-8周、11周)的小鼠心脏组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |