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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 | 
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2741 | 2025-10-06 | Identification and Construction of a R-loop Mediated Diagnostic Model and Associated Immune Microenvironment of COPD through Machine Learning and Single-Cell Transcriptomics 
          2025-Aug, Inflammation
          
          IF:4.5Q2
          
         
          DOI:10.1007/s10753-024-02232-x
          PMID:39798034
         | 研究论文 | 通过机器学习和单细胞转录组学构建R-loop介导的COPD诊断模型并分析其免疫微环境特征 | 首次系统研究R-loop调节因子在COPD中的作用,利用12种机器学习算法识别关键R-loop调节因子,建立基于14个R-loop调节因子的风险评分模型并发现两种不同COPD亚型 | 研究样本量未明确说明,部分发现仅在动物模型中验证 | 探索R-loop调节因子在慢性阻塞性肺疾病(COPD)发病机制中的作用并构建诊断模型 | COPD患者肺组织、小鼠肺组织 | 机器学习, 单细胞转录组学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序, RT-PCR | 机器学习算法(12种算法150种组合) | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA | 
| 2742 | 2025-10-06 | PD-L1 Promotes Immunological Tolerance and Enhances Visual Protection of hESC-RPE Grafts in Retinal Degeneration 
          2025-Aug, Cell proliferation
          
          IF:5.9Q2
          
         
          DOI:10.1111/cpr.70007
          PMID:39953740
         | 研究论文 | 本研究探讨PD-L1过表达在改善人胚胎干细胞来源视网膜色素上皮细胞移植治疗年龄相关性黄斑变性中的免疫保护作用 | 提出无需删除MHC基因仅通过PD-L1过表达即可增强hESC-RPE移植物存活和视觉保护的新策略 | 研究主要聚焦于PD-L1的免疫调节作用,未全面评估其他免疫检查点的潜在影响 | 探索PD-L1过表达对hESC-RPE移植免疫耐受和视觉功能保护的作用机制 | 人胚胎干细胞来源视网膜色素上皮细胞和视网膜退行性病变模型 | 细胞治疗 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 2743 | 2025-10-06 | Exploration of heterogeneity and recurrence signatures in hepatocellular carcinoma 
          2025-Aug, Molecular oncology
          
          IF:5.0Q1
          
         
          DOI:10.1002/1878-0261.70012
          PMID:40018995
         | 研究论文 | 本研究通过整合分析肝细胞癌的单细胞RNA测序数据,揭示了复发肿瘤的异质性特征并构建了复发预后模型 | 首次系统揭示肝细胞癌复发过程中的细胞异质性变化,识别MIF-(CD74+CXCR4)信号通路的关键作用,并开发了基于机器学习的新型复发风险评分模型 | 研究样本量有限,需要更大规模队列验证模型的普适性 | 探索肝细胞癌复发异质性特征并开发预后预测模型 | 肝细胞癌患者样本和小鼠移植模型 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq, 机器学习, RT-qPCR, 免疫组化 | 机器学习模型 | 基因表达数据, 单细胞数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA | 
| 2744 | 2025-10-06 | Time, the final frontier 
          2025-Aug, Molecular oncology
          
          IF:5.0Q1
          
         
          DOI:10.1002/1878-0261.70025
          PMID:40126098
         | 评论 | 本文主张将时间动态维度整合到癌症研究中,强调从传统终点实验向数据驱动的连续方法转变 | 提出将时间动态分析作为癌症研究的新前沿,强调开发活体成像技术、时间组学方法和计算工具来探索肿瘤演化过程 | NA | 推动癌症研究从静态分析向动态时间维度整合的范式转变 | 肿瘤生态系统及其时间演化过程 | 数字病理学 | 癌症 | 活体成像技术、时间组学方法、计算分析 | NA | 时间序列数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA | 
| 2745 | 2025-10-06 | Spatial transcriptomics reveals human cortical layer and area specification 
          2025-Aug, Nature
          
          IF:50.5Q1
          
         
          DOI:10.1038/s41586-025-09010-1
          PMID:40369074
         | 研究论文 | 通过空间转录组技术揭示人类胎儿大脑皮层分层和区域特化的分子机制 | 首次结合MERFISH技术和深度学习核分割,在空间单细胞分辨率下系统绘制人类胎儿皮层发育图谱,发现皮层区域特化的两种不同模式 | 研究仅聚焦胎儿发育阶段,未涵盖出生后皮层发育过程 | 解析人类大脑皮层分层和区域特化的空间分子机制 | 人类胎儿大脑皮层组织 | 空间转录组学 | NA | MERFISH, 单核RNA测序, 深度学习核分割 | 深度学习 | 空间转录组数据, 图像数据 | 超过1800万个单细胞,涵盖7个发育时间点和8个皮层区域 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 多重错误鲁棒荧光原位杂交(MERFISH) | 
| 2746 | 2025-10-06 | Taurine from tumour niche drives glycolysis to promote leukaemogenesis 
          2025-Aug, Nature
          
          IF:50.5Q1
          
         
          DOI:10.1038/s41586-025-09018-7
          PMID:40369079
         | 研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术发现肿瘤微环境中的牛磺酸通过驱动糖酵解促进白血病发生 | 首次系统描绘白血病进展过程中基质信号的动态变化,鉴定牛磺酸-TAUT轴作为侵袭性髓系白血病的关键依赖性通路 | 研究主要聚焦于髓系白血病,对其他类型白血病的适用性需进一步验证 | 探索肿瘤微环境对白血病干细胞的支持机制 | 白血病干细胞、骨髓基质细胞、小鼠模型和患者来源的急性髓系白血病细胞 | 单细胞生物学 | 白血病 | 单细胞RNA测序、CRISPR筛选、多组学分析 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据、基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 2747 | 2025-10-06 | Exploiting the endothelial-immune axis to improve radiotherapy efficacy 
          2025-Aug-01, The British journal of radiology
          
         
          DOI:10.1093/bjr/tqaf114
          PMID:40419861
         | 综述 | 探讨放射治疗中内皮细胞与免疫系统的相互作用机制及其对治疗效果的影响 | 提出通过靶向内皮-免疫轴来增强放射治疗疗效的新策略 | NA | 改善放射治疗的疗效并减少副作用 | 血管内皮细胞与免疫细胞在放射治疗中的相互作用 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA | 
| 2748 | 2025-10-06 | Cytokine-induced reprogramming of human macrophages toward Alzheimer's disease-relevant molecular and cellular phenotypes in vitro 
          2025-Jul-22, Cell reports
          
          IF:7.5Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.celrep.2025.115909
          PMID:40570367
         | 研究论文 | 研究细胞因子混合物对人THP-1巨噬细胞向阿尔茨海默病相关表型重编程的作用 | 首次使用特定细胞因子组合(IL-4、CSF1、IL-34和TGF-β)在体外将人巨噬细胞重编程为AD相关表型 | 研究仅限于体外THP-1巨噬细胞模型,未在体内验证 | 开发阿尔茨海默病相关的体外巨噬细胞模型 | 人THP-1巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序,转录组分析,功能测定 | NA | 基因表达数据,单细胞测序数据 | THP-1巨噬细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 2749 | 2025-10-06 | Generation and long-term culture of human cerebellar organoids from pluripotent stem cells 
          2025-06, Nature protocols
          
          IF:13.1Q1
          
         
          DOI:10.1038/s41596-024-01093-w
          PMID:39623220
         | 研究论文 | 开发了一种从人多能干细胞生成和长期培养人类小脑类器官的方案 | 首次建立了能够复制胎儿小脑细胞多样性和独特细胞结构特征的人类小脑类器官模型 | NA | 研究人类小脑发育和疾病 | 人类小脑类器官 | 发育神经生物学 | 小脑疾病 | 单细胞转录组学、免疫组织化学、钙动力学、电生理学 | NA | 转录组数据、图像数据、电生理数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA | 
| 2750 | 2025-10-06 | Targeting of arachidonic acid-modulated autophagy to enhance the sensitivity of ROS1 + or ALK + non-small cell lung cancer to crizotinib therapy 
          2025-Mar-31, Translational lung cancer research
          
          IF:4.0Q1
          
         
          DOI:10.21037/tlcr-2025-105
          PMID:40248722
         | 研究论文 | 本研究揭示了花生四烯酸通过调节自噬流促进ROS1+或ALK+非小细胞肺癌对克唑替尼耐药的机制 | 首次发现STAT3磷酸化失活和PTGS2下调导致花生四烯酸积累,进而通过促进自噬流驱动克唑替尼耐药的新机制 | 研究主要基于细胞系模型,尚未进行体内动物实验验证 | 阐明克唑替尼耐药机制并寻找克服耐药的新治疗策略 | ROS1+或ALK+非小细胞肺癌细胞系(HCC78和H3122) | 癌症生物学 | 非小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序,代谢组学分析 | 细胞耐药模型 | 基因表达数据,代谢物数据 | 2种细胞系,3个类器官样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 2751 | 2025-10-06 | Osteocyte connexin hemichannels and prostaglandin E2 release dictate bone marrow mesenchymal stromal cell commitment 
          2025-Feb-18, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
          
          IF:9.4Q1
          
         
          DOI:10.1073/pnas.2412144122
          PMID:39937859
         | 研究论文 | 本研究揭示了骨细胞连接蛋白43半通道通过释放前列腺素E2调控骨髓间充质干细胞谱系分化的关键机制 | 首次发现骨细胞Cx43半通道通过PGE2释放调控BM-MSPC命运决定,揭示了骨细胞与间充质干细胞间的新型通讯机制 | 研究主要基于转基因小鼠模型,人类组织验证尚不充分 | 探究骨细胞如何通过Cx43半通道调控骨髓间充质干细胞的谱系定向分化 | 转基因小鼠模型的骨髓间充质干细胞和祖细胞 | 细胞生物学 | 骨骼疾病 | 流式细胞术,单细胞RNA测序 | 转基因小鼠模型 | 基因表达数据,细胞表型数据 | 两种Cx43突变转基因小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 2752 | 2025-10-06 | Divergent Clinical and Immunologic Outcomes Based on STK11 Co-mutation Status in Resectable KRAS-Mutant Lung Cancers Following Neoadjuvant Immune Checkpoint Blockade 
          2025-Jan-17, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
          
          IF:10.0Q1
          
         
          DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-2983
          PMID:39545922
         | 研究论文 | 本研究探讨了可切除KRAS突变肺癌中STK11共突变状态对新辅助免疫检查点阻断治疗后临床和免疫学结果的影响 | 首次在可切除NSCLC新辅助免疫治疗背景下揭示KRAS/STK11共突变的临床意义,并通过单细胞转录组学发现T细胞转录命运的差异 | 样本量有限(7个KRASmut/STK11wt肿瘤和6个KRASmut/STK11mut肿瘤),需要更大规模研究验证 | 评估KRAS和STK11共突变对可切除非小细胞肺癌新辅助免疫治疗疗效的影响 | 可切除的KRAS突变非小细胞肺癌患者 | 癌症免疫学 | 肺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 13个肿瘤样本(7个KRASmut/STK11wt,6个KRASmut/STK11mut) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA | 
| 2753 | 2025-10-06 | Differential chromatin accessibility and transcriptional dynamics define breast cancer subtypes and their lineages 
          2024-11, Nature cancer
          
          IF:23.5Q1
          
         
          DOI:10.1038/s43018-024-00773-6
          PMID:39478117
         | 研究论文 | 通过多组学技术分析乳腺癌亚型及其谱系的染色质可及性和转录动态特征 | 首次在单细胞水平整合配对转录组和染色质可及性分析,揭示乳腺癌亚型特异性谱系的调控网络 | 样本量相对有限(37例患者),需要更大规模验证 | 研究乳腺癌亚型特异性肿瘤-正常谱系的转录调控网络 | 乳腺癌患者组织样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞多组学, 空间转录组学, 多重成像 | 调控网络分析 | 基因组, 转录组, 表观基因组, 图像 | 37例患者的61个样本 | NA | 单细胞多组学, 空间转录组学, 多重成像, bulk RNA-seq | NA | NA | 
| 2754 | 2025-10-06 | Exploring Cellular Heterogeneity: Single-Cell and Spatial Transcriptomics of Alzheimer Disease Brains and iPSC-Derived Microglia 
          2024-Oct-16, Research square
          
         
          DOI:10.21203/rs.3.rs-5045715/v1
          PMID:39483903
         | 研究论文 | 通过整合单细胞和空间转录组学数据,构建了阿尔茨海默病大脑和小胶质细胞的详细图谱 | 首次整合多个队列和脑区的单细胞与空间转录组数据,揭示了小胶质细胞状态的区域和病理特异性 | NA | 阐明阿尔茨海默病中小胶质细胞的异质性和空间分布特征 | 实验模型和人类大脑中的小胶质细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,免疫组织化学 | NA | 转录组数据,空间定位数据 | 多个队列和脑区域样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA | 
| 2755 | 2025-10-06 | Engineered extracellular vesicles enable high-efficient delivery of intracellular therapeutic proteins 
          2024-Oct-01, Protein & cell
          
          IF:13.6Q1
          
         
          DOI:10.1093/procel/pwae015
          PMID:38518087
         | 研究论文 | 开发了一种基于细胞外囊泡的高效细胞内治疗蛋白递送系统 | 提出无需支架蛋白即可高效包装和递送天然蛋白的IDEA方法 | NA | 开发高效的细胞内蛋白递送系统以扩展蛋白治疗应用 | 细胞外囊泡和环状GMP-AMP合酶(cGAS) | 生物医学工程 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个同系肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 2756 | 2025-10-06 | Stress-free single-cell transcriptomic profiling and functional genomics of murine eosinophils 
          2024-06, Nature protocols
          
          IF:13.1Q1
          
         
          DOI:10.1038/s41596-024-00967-3
          PMID:38504138
         | 研究论文 | 开发了一种无应激小鼠嗜酸性粒细胞单细胞转录组分析方案,并展示了其在结肠炎研究中的应用 | 建立了首个无应激的嗜酸性粒细胞单细胞转录组捕获方法,结合基因组CRISPR筛选技术研究其分化机制 | 方法主要针对小鼠模型,人类样本的适用性需要进一步验证 | 开发嗜酸性粒细胞单细胞转录组分析和功能基因组学研究方法 | 小鼠组织驻留嗜酸性粒细胞 | 单细胞组学 | 结肠炎 | 单细胞RNA测序, CRISPR筛选 | NA | 单细胞转录组数据 | 多组织来源的小鼠嗜酸性粒细胞 | BD Biosciences | 单细胞RNA-seq | BD Rhapsody | 微孔板单细胞RNA捕获系统 | 
| 2757 | 2025-10-06 | Integrative single-cell meta-analysis reveals disease-relevant vascular cell states and markers in human atherosclerosis 
          2023-11-28, Cell reports
          
          IF:7.5Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.celrep.2023.113380
          PMID:37950869
         | 研究论文 | 通过整合22个单细胞RNA测序库的元分析,构建了包含118,578个细胞的人类动脉粥样硬化综合图谱 | 首次通过大规模单细胞元分析揭示血管细胞状态与动脉粥样硬化的关联,并发现LTBP1和CRTAC1作为疾病进展标志物 | 基于已有数据集的元分析,可能受原始研究技术差异的限制 | 解析人类动脉粥样硬化中血管细胞状态与疾病关联机制 | 人类动脉粥样硬化组织中的血管和免疫细胞 | 单细胞基因组学 | 心血管疾病 | scRNA-seq, 全基因组关联研究, 空间成像分析 | 整合元分析 | 单细胞转录组数据, 基因组数据, 空间成像数据 | 118,578个细胞来自22个scRNA-seq文库 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 2758 | 2025-10-06 | Spatial proteo-transcriptomic profiling reveals the molecular landscape of borderline ovarian tumors and their invasive progression 
          2023-Nov-13, medRxiv : the preprint server for health sciences
          
         
          DOI:10.1101/2023.11.13.23298409
          PMID:38014221
         | 研究论文 | 本研究通过空间蛋白质组学和空间转录组学整合分析,揭示了卵巢交界性肿瘤向低级别浆液性癌侵袭进展的分子机制 | 首次整合空间蛋白质组学和空间转录组学技术,在分子水平上解析了卵巢交界性肿瘤向侵袭性癌转化的全过程 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证发现 | 阐明卵巢交界性肿瘤向低级别浆液性癌侵袭进展的分子机制 | 卵巢交界性肿瘤(SBT)和低级别浆液性癌(LGSC)患者组织样本 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 空间蛋白质组学, 空间转录组学, 基因敲低, 药物抑制 | NA | 空间蛋白质组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 空间蛋白质组学, 空间转录组学 | NA | NA | 
| 2759 | 2025-10-06 | Cell-intrinsic and -extrinsic effects of SARS-CoV-2 RNA on pathogenesis: single-cell meta-analysis 
          2023-10-24, mSphere
          
          IF:3.7Q2
          
         
          DOI:10.1128/msphere.00375-23
          PMID:37737611
         | 研究论文 | 通过单细胞RNA-seq数据的荟萃分析,研究SARS-CoV-2 RNA在细胞内外对COVID-19发病机制的影响 | 首次通过跨物种单细胞荟萃分析评估临床前模型模拟人类COVID-19的能力,并发现病毒RNA在多种非上皮细胞中的广泛传播 | 仅分析六个公开可用的单细胞RNA-seq数据集,样本量有限 | 评估SARS-CoV-2 RNA在细胞内外对COVID-19发病机制的影响 | 人类和五种动物模型(K18-hACE2小鼠、仓鼠、雪貂、猕猴等)的肺细胞 | 单细胞生物学 | COVID-19 | 单细胞RNA-seq, 双映射分析, 差异基因表达分析, 主成分分析 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 六个公开可用的单细胞RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA | 
| 2760 | 2025-10-06 | Multi-omic analysis of the cardiac cellulome defines a vascular contribution to cardiac diastolic dysfunction in obese female mice 
          2023-03-29, Basic research in cardiology
          
          IF:7.5Q1
          
         
          DOI:10.1007/s00395-023-00983-6
          PMID:36988733
         | 研究论文 | 通过多组学分析揭示平滑肌细胞盐皮质激素受体在肥胖雌性小鼠心脏舒张功能障碍中的关键作用 | 首次利用单细胞RNA测序技术系统分析非心肌细胞群体,揭示血管平滑肌细胞MR信号在肥胖相关心脏功能障碍中的核心机制 | 研究仅限于雌性小鼠模型,未涉及雄性动物及人类临床样本验证 | 探究平滑肌细胞特异性MR缺失对肥胖相关冠状动脉和心脏舒张功能的影响 | 雌性小鼠(西方饮食诱导的肥胖模型) | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,基因表达谱分析 | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据 | 雌性小鼠(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |