单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 34720 篇文献，本页显示第 2741 - 2760 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2741 | 2025-11-21 |
Single-cell and spatial omics reveal progressive loss of xylem developmental complexity across seed plants
2025-Oct-31, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koaf253
PMID:41109686
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间组学技术揭示了裸子植物木质部发育的复杂性，并提出了种子植物维管发育的简化进化轨迹 | 首次在裸子植物中重建木质部分化轨迹，发现裸子植物特有的木质部细胞群体，提出轴向发育程序从裸子植物到被子植物逐渐简化的新理论 | 研究主要集中于针叶树类裸子植物，可能无法完全代表所有裸子植物的多样性 | 探究种子植物木质部发育的进化轨迹和复杂性变化 | 裸子植物（杉木）和被子植物的木质部细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞转录组学，空间转录组学，空间蛋白质组学，空间代谢组学 | Seurat, scVI | 单细胞RNA测序数据，空间多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学，空间蛋白质组学，空间代谢组学 | NA | NA |
| 2742 | 2025-11-21 |
Molecular subtypes and prognostic signature rooted in disulfidptosis highlight tumor microenvironment in lung adenocarcinoma
2025-Oct-30, Chinese journal of cancer research = Chung-kuo yen cheng yen chiu
|
研究论文 | 本研究基于二硫死亡相关基因识别肺腺癌分子亚型并构建预后特征模型 | 首次将新型细胞死亡方式二硫死亡应用于肺腺癌分子分型及预后模型构建 | 研究样本量有限，需进一步多中心验证 | 探索二硫死亡相关基因在肺腺癌肿瘤微环境及预后中的作用 | 肺腺癌患者组织样本和细胞系 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, Western blotting, 免疫组化, RT-qPCR | 多变量Cox回归模型, 风险评分模型, 列线图 | 基因表达数据, 临床数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2743 | 2025-11-21 |
[Traditional Chinese medicine for regulating glycolysis to remodel the tumor immune microenvironment: research progress and future prospects]
2025-Oct-20, Nan fang yi ke da xue xue bao = Journal of Southern Medical University
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综述 | 本文综述了中医药通过调控糖酵解重塑肿瘤免疫微环境的研究进展与未来展望 | 系统阐述了中医药通过多靶点调控糖酵解关键酶、代谢信号通路和非编码RNA来改善肿瘤免疫微环境的协同作用机制 | 中医药调控糖酵解与肿瘤微环境相互作用的动态机制尚未完全阐明 | 探讨中医药通过调控糖酵解重塑肿瘤免疫微环境的机制及未来研究方向 | 肿瘤细胞、免疫细胞、肿瘤微环境 | 肿瘤免疫学 | 肿瘤 | 单细胞测序、纳米递送系统 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2744 | 2025-11-21 |
MSR1 + macrophages passivate antitumor immunity by inducing ITM2A + CD4T exhaustion differentiation
2025-Oct-17, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001578
PMID:41104544
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研究论文 | 本研究揭示了MSR1+巨噬细胞通过调控ITM2A-ZAP70轴诱导CD4T细胞耗竭分化的机制，并开发了靶向CD4T的抗体药物偶联物 | 首次发现MSR1+巨噬细胞通过ITM2A-ZAP70轴调控CD4T细胞耗竭，并成功开发靶向该通路的新型ADC药物 | 研究主要聚焦于肝细胞癌模型，在其他肿瘤类型中的普适性需要进一步验证 | 探索膜蛋白在抗肿瘤免疫中的作用并挖掘可靶向的膜蛋白 | 肝细胞癌肿瘤微环境中的免疫细胞，特别是MSR1+巨噬细胞和ITM2A+CD4T细胞 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，TimiGP分析，分子动力学模拟，生物化学实验，生物工程技术 | 基因敲除小鼠模型，原位移植模型，质粒衍生自发肝癌模型 | 基因表达数据，单细胞转录组数据，蛋白质相互作用数据 | 基于TCGA和ICGC数据库的临床样本，基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2745 | 2025-11-21 |
Neutrophils predominate as IL1B-expressing cells in Schnitzler syndrome: Insights from the SCan study to evaluate the efficacy and safety of canakinumab in Japanese patients
2025-Oct, Allergology international : official journal of the Japanese Society of Allergology
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.alit.2025.04.003
PMID:40393905
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研究论文 | 本研究通过SCan试验揭示施尼茨勒综合征中IL1B表达细胞主要为中性粒细胞，并证实卡那单抗通过调节中性粒细胞动态改善临床症状 | 首次在施尼茨勒综合征患者中通过单细胞RNA测序和空间转录组学确定中性粒细胞是IL1B的主要表达细胞 | 样本量较小（仅5名日本患者），且仅对2例患者进行了单细胞分析 | 评估卡那单抗在日本施尼茨勒综合征患者中的疗效和安全性，并探究疾病发病机制 | 5名日本施尼茨勒综合征患者 | 单细胞组学 | 自身炎症性疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 细胞因子检测 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 临床数据 | 5名患者（其中2名进行了单细胞分析） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2746 | 2025-11-21 |
Scalable nonparametric clustering with unified marker gene selection for single-cell RNA-seq data
2025-Sep-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.11.579839
PMID:38405697
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研究论文 | 提出一种名为NCLUSION的非参数聚类方法，能够在单细胞RNA测序数据中同时进行细胞聚类和标记基因选择 | 使用无限混合模型结合贝叶斯稀疏先验，实现聚类与标记基因选择的同步进行，避免了传统方法中差异表达分析带来的假发现率膨胀问题 | NA | 开发可扩展的单细胞RNA测序数据分析方法，解决现有聚类方法的局限性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 无限混合模型，变分推断算法 | 基因表达数据 | 可达数百万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2747 | 2025-11-21 |
Diversity and heterogeneity in human pancreaticobiliary maljunction revealed by single-cell RNA sequencing
2025-Mar-21, Pediatric surgery international
IF:1.5Q3
DOI:10.1007/s00383-025-05997-w
PMID:40116982
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示人类胰胆管合流异常的细胞多样性和异质性 | 首次在单细胞水平系统描绘胰胆管合流异常的细胞图谱，发现成纤维细胞亚型的主导作用及WNT/TWEAK信号通路异常激活 | 样本量较小（仅6例患者），需更大规模研究验证 | 阐明胰胆管合流异常的病因和发病机制 | 胰胆管合流异常患者和非患者的胆管组织 | 单细胞组学 | 胰胆管合流异常 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6例患者（3例PBM，3例非PBM） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2748 | 2025-11-21 |
Immune Microenvironmental Differences Between Obese and Healthy People in a High-Altitude Hypoxic Environment
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S562386
PMID:41243986
|
研究论文 | 比较肥胖与正常体重个体在高海拔缺氧环境下的免疫微环境差异 | 首次在单细胞水平揭示肥胖个体在高海拔缺氧环境下Treg细胞比例减少的免疫机制 | 探索性研究，样本量有限，需要进一步验证 | 探索肥胖加剧高海拔缺氧反应的发病机制并寻找潜在生物标志物 | 肥胖与正常体重个体及动物模型 | 单细胞组学 | 高原病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2749 | 2025-11-21 |
The Role of Fibroblasts in Atopic Dermatitis: Establishing Proinflammatory Microenvironments and Mediating Cellular Crosstalk
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S558464
PMID:41243996
|
综述 | 本文总结了成纤维细胞在特应性皮炎中通过建立促炎微环境和介导细胞间通讯的作用机制 | 突破传统聚焦免疫细胞和角质形成细胞的研究局限，系统阐述成纤维细胞在AD中的主动免疫调节功能 | NA | 深入理解特应性皮炎的致病机制并为常规治疗反应不佳患者提供新治疗策略 | 特应性皮炎中的成纤维细胞 | NA | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 2750 | 2025-11-21 |
1-stearoyl-2-arachidonoyl-driven B Cell metabolic dysregulation in chronic rhinosinusitis with nasal polyps: insights from Mendelian randomization and single-cell RNA sequencing
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1719897
PMID:41244838
|
研究论文 | 通过孟德尔随机化和单细胞RNA测序研究慢性鼻窦炎伴鼻息肉中B细胞代谢失调的机制 | 首次发现HLA-DR+ CD33- B细胞和脂质代谢物1-硬脂酰-2-花生四烯酰在CRSwNP中的风险作用，并揭示代谢影响B细胞亚群塑造免疫微环境的新机制 | NA | 探讨慢性鼻窦炎伴鼻息肉的免疫代谢失调机制 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉患者的免疫细胞和代谢物 | 生物信息学 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 | 单细胞RNA测序,孟德尔随机化,基因集富集分析,机器学习 | 机器学习 | 单细胞RNA测序数据,代谢组数据,基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2751 | 2025-11-21 |
Decoding the immune microenvironment in osteosarcoma: new insights into checkpoints, vaccines, and CAR-T cells
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1702219
PMID:41244900
|
综述 | 本文全面概述骨肉瘤的免疫微环境特征及当前新兴的免疫治疗策略 | 整合单细胞转录组学对骨肉瘤免疫微环境的新见解，系统探讨检查点抑制剂、肿瘤疫苗和CAR-T细胞等联合治疗策略 | 作为综述文章，未提供原始实验数据验证提出的治疗策略 | 改善骨肉瘤患者临床预后的免疫治疗策略研究 | 骨肉瘤及其肿瘤微环境中的免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 骨肉瘤 | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2752 | 2025-11-21 |
Spatial transcriptomics reveals an unexpected impact of tau and tau pathology on the expression of transthyretin
2025, Frontiers in aging neuroscience
IF:4.1Q2
DOI:10.3389/fnagi.2025.1656850
PMID:41245137
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术揭示了tau蛋白对转甲状腺素蛋白(TTR)表达的意外调控作用 | 首次发现tau蛋白对Ttr mRNA和蛋白表达的调控作用，揭示了tau可能通过影响TTR参与Aβ疾病进展的反馈环路 | 研究仅使用小鼠模型，需要在人类样本中进一步验证 | 探究tau蛋白如何改变大脑中mRNA表达 | THY-Tau22转基因小鼠和TauKO基因敲除小鼠 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学，免疫荧光 | NA | 空间转录组数据，免疫荧光图像 | 两种小鼠模型（THY-Tau22和TauKO） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2753 | 2025-11-21 |
Fibroblast-derived interleukin-11 as a potential biomarker for intestinal fibrostenosis in Crohn's disease
2025, Therapeutic advances in gastroenterology
IF:3.9Q1
DOI:10.1177/17562848251391093
PMID:41245384
|
研究论文 | 本研究探讨白细胞介素-11作为克罗恩病肠道纤维狭窄潜在生物标志物的价值 | 首次发现成纤维细胞来源的IL-11在克罗恩病纤维狭窄组织中富集并促进肠道纤维化 | 观察性研究设计，样本量有限，需要更大规模研究验证 | 研究白细胞介素在检测克罗恩病相关肠道纤维狭窄中的价值 | 克罗恩病患者的肠道组织和血清样本 | 生物标志物研究 | 克罗恩病 | RNA测序,实时聚合酶链反应,免疫组织化学,单细胞RNA测序,Luminex血清检测 | NA | 转录组数据,血清蛋白数据,组织学数据 | 克罗恩病患者手术切除的配对组织样本（包含未受累和纤维狭窄段） | NA | bulk RNA-seq,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2754 | 2025-11-21 |
Functional analysis of TWIST1 domains regulating smooth muscle cell phenotype
2025, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2025.1659847
PMID:41246007
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研究论文 | 本研究通过分析TWIST1转录因子的不同结构域和二聚体组成对平滑肌细胞表型的调控机制 | 首次系统解析TWIST1不同结构域和不同二聚体组合对平滑肌细胞表型调控的独立功能 | 研究主要基于体外细胞实验，需要进一步体内验证 | 阐明TWIST1在血管疾病中调控平滑肌细胞表型的分子机制 | 人冠状动脉平滑肌细胞(HCASMCs) | 分子生物学 | 心血管疾病 | RNA测序, 增殖和迁移实验 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 2755 | 2025-11-21 |
Regulatory T cell therapies: from patient data to biological insights
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1675114
PMID:41246323
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综述 | 本文综述了调节性T细胞疗法的临床进展与优化策略，重点探讨如何通过临床数据和先进监测技术改进治疗效果 | 整合临床样本数据与单细胞多组学技术，提出将Treg疗法优化为能够建立免疫耐受的“活体药物” | NA | 改进调节性T细胞疗法，提升其治疗自身免疫性疾病和促进移植耐受的效果 | 调节性T细胞疗法及临床样本数据 | 自然语言处理 | 自身免疫性疾病 | 单细胞多组学分析、表观遗传分析、空间转录组学 | NA | 临床数据、多组学数据 | NA | NA | 单细胞多组学、空间转录组学 | NA | NA |
| 2756 | 2025-11-21 |
Cholesterol metabolism shapes immune low-response states in LUAD: a multi-omics cholesterol metabolism signature predicts immunotherapy benefit and identifies DHCR7 as a therapeutic target
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1696360
PMID:41246332
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研究论文 | 本研究开发了基于胆固醇代谢基因的特征模型，用于预测肺腺癌患者的预后和免疫治疗反应，并鉴定DHCR7作为潜在治疗靶点 | 首次在肺腺癌中建立多组学胆固醇代谢特征模型，发现DHCR7基因与免疫抑制的关联，并验证其作为免疫治疗增敏靶点的潜力 | 研究主要基于回顾性队列分析，需要更多前瞻性研究验证 | 探究胆固醇代谢在肺腺癌免疫微环境中的作用及其对免疫治疗的影响 | 肺腺癌患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 多组学分析，单细胞转录组，免疫组化，流式细胞术，体外和体内实验 | 特征模型 | 基因组数据，转录组数据，单细胞数据，实验数据 | 1,682例肺腺癌样本（包括7个初治队列和3个免疫治疗队列） | NA | 单细胞RNA-seq，多重免疫组化，流式细胞术 | NA | NA |
| 2757 | 2025-11-21 |
Single-cell and spatial transcriptomics integration reveals FAM49B promotes tumor-associated macrophages polarization in colorectal cancer via the MK pathway
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1682637
PMID:41246334
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和空间转录组学数据，揭示了FAM49B通过MDK-NCL轴促进结直肠癌中肿瘤相关巨噬细胞极化的机制 | 首次发现FAM49B通过MDK-NCL信号轴调控肿瘤相关巨噬细胞极化，揭示了其在塑造免疫抑制肿瘤微环境中的新功能 | 样本量相对有限（16例患者），需要更大规模的研究验证 | 探究FAM49B在结直肠癌免疫抑制肿瘤微环境形成中的作用机制 | 结直肠癌患者组织样本、恶性上皮细胞、肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、蛋白质组学分析 | CellChat分析、伪时间轨迹分析 | 单细胞RNA-seq数据、空间转录组数据、bulk RNA数据 | 16例结直肠癌患者的33个单细胞RNA-seq样本和2对配对空间转录组样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2758 | 2025-11-21 |
Lactylation-related gene AKR1A1 contributes to osteoporosis via metabolic-immune regulation: evidence from multi-omics integration, single-cell transcriptomics, and in vitro validation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1680305
PMID:41246341
|
研究论文 | 本研究通过多组学整合和单细胞转录组学发现AKR1A1基因通过乳酸化修饰在骨质疏松代谢-免疫调控中发挥关键作用 | 首次系统识别骨质疏松中乳酸化相关差异表达基因，从代谢-免疫双重角度揭示AKR1A1通过SPP1-CD44信号通路调控细胞间通讯的新机制 | 研究主要基于公共数据库和体外实验，缺乏体内实验验证和临床样本的直接证据 | 系统识别骨质疏松中乳酸化相关关键基因并探索其在疾病发病机制中的作用 | 骨质疏松相关基因表达数据、RAW264.7巨噬细胞 | 生物信息学 | 骨质疏松 | 单细胞RNA测序、qPCR、Western blot、免疫共沉淀 | 机器学习模型、UMAP聚类、CellChat分析 | 基因表达微阵列数据、单细胞转录组数据 | 5个骨质疏松相关基因表达数据集和1个单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2759 | 2025-11-21 |
Integrative multi-omics analysis of gastric cancer evolution from precancerous lesions to metastasis identifies a deep learning-based prognostic model
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1680517
PMID:41246350
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和深度学习技术，构建了胃癌从癌前病变到转移的演化图谱和预后模型 | 首次在胃癌中整合多组学数据揭示肿瘤微环境动态重塑过程，并开发基于深度学习的预后预测模型 | 样本量相对有限，仅包含6种组织类型的252,399个细胞 | 解析胃癌进展过程中肿瘤微环境的细胞异质性、空间组织和细胞间通讯 | 胃炎、肠化生、原发肿瘤、癌旁正常组织和转移病灶 | 数字病理 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, WGCNA, 深度学习 | 深度学习模型 | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 临床数据 | 252,399个细胞来自6种组织类型 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2760 | 2025-11-20 |
Immunomodulatory effects of a short-term gluten-free diet on pediatric celiac disease: Findings from a single-cell transcriptomics study
2025-Dec, The Journal of nutritional biochemistry
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jnutbio.2025.110063
PMID:40803542
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析探讨短期无麸质饮食对儿科乳糜泻患者免疫细胞的调节作用 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析儿科乳糜泻患者短期无麸质饮食后的免疫细胞转录变化 | 样本量较小（仅5名患者），结果需谨慎解读，需要更大规模队列研究验证 | 研究短期无麸质饮食对儿科乳糜泻患者免疫细胞的调节机制 | 儿科乳糜泻患者的外周血单个核细胞 | 单细胞转录组学 | 乳糜泻 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 5名儿科乳糜泻患者（治疗前后配对样本） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基于液滴的单细胞RNA测序技术 |