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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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2721 | 2025-10-06 |
Role of pericytes in regulating penile angiogenesis and nerve regeneration
2025-01-01, Asian journal of andrology
IF:3.0Q1
DOI:10.4103/aja202455
PMID:39162179
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综述 | 本文综述了周细胞在阴茎血管生成和神经再生中的作用及其与勃起功能障碍的关系 | 首次系统分析周细胞在糖尿病性和神经性勃起功能障碍中的具体作用机制 | 主要基于文献综述,缺乏原始实验数据验证 | 分析周细胞在勃起功能障碍中的具体作用机制 | 周细胞在阴茎组织中的功能 | 病理生理学 | 勃起功能障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 文献数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2722 | 2025-10-06 |
Uncovering plaque-glia niches in human Alzheimer's disease brains using spatial transcriptomics
2025, Molecular neurodegeneration advances
DOI:10.1186/s44477-025-00002-z
PMID:40740481
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术揭示人类阿尔茨海默病脑中斑块-胶质细胞微环境的分子特征 | 首次在人类AD脑组织中系统描绘斑块-胶质细胞微环境的空间转录组特征,并整合多组学数据验证胶质细胞反应 | 样本来源于死后脑组织,可能无法完全反映疾病过程中的动态变化 | 解析阿尔茨海默病中斑块与胶质细胞相互作用的分子机制 | 人类阿尔茨海默病患者脑组织样本和iPSC来源的细胞培养模型 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学, 免疫组织化学, 单核RNA测序, 单细胞RNA测序, 基因集富集分析 | NA | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 组织图像数据 | 21名个体的78个死后脑切片 | NA | 空间转录组学, 单核RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2723 | 2025-10-06 |
Deciphering the role of SEMA4A/MAPK signaling in sepsis: insights from Mendelian randomization, transcriptomic, single-cell sequencing analyses, and vitro experiments
2025, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2025.1606509
PMID:40756031
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研究论文 | 通过孟德尔随机化、转录组学、单细胞测序分析和体外实验,揭示SEMA4A/MAPK信号通路在脓毒症发病机制中的关键作用 | 首次结合孟德尔随机化与多组学分析鉴定脓毒症核心基因,并通过单细胞测序明确其在单核细胞中的特异性表达 | 研究主要基于公共数据库和体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证 | 探索脓毒症的新治疗靶点 | 脓毒症患者转录组数据和THP-1人单核细胞 | 生物信息学 | 脓毒症 | 转录组测序,单细胞RNA测序,孟德尔随机化分析,体外实验 | 差异表达分析,富集分析,细胞模型 | 基因表达数据,单细胞测序数据 | 3个独立脓毒症患者转录组数据集 | NA | 单细胞RNA测序,转录组测序 | NA | NA |
2724 | 2025-10-06 |
To explore the potential of LOXL2 as a biomarker in glioma and construct a genomic integrated clinical prognostic model
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1602475
PMID:40756111
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研究论文 | 本研究探索LOXL2作为胶质瘤生物标志物的潜力并构建基因组整合的临床预后模型 | 首次系统评估LOXL2在胶质瘤中的生物学功能及其与患者预后的潜在关联,构建了基于LOXL2的预后预测模型 | 研究主要基于生物信息学分析,需要进一步实验验证LOXL2的具体分子机制 | 为改善胶质瘤诊疗策略提供新的理论基础 | 胶质瘤患者和LOXL2基因 | 生物信息学 | 胶质瘤 | 生物信息学分析,单细胞RNA测序,GO/KEGG通路分析,免疫浸润分析 | COX回归,KM生存分析,列线图,决策曲线分析 | 基因组数据,临床数据,单细胞测序数据 | CCGA探索队列和TCGA验证队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2725 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing using split-pool barcoding reveals transcriptional heterogeneity in Porphyromonas gingivalis with implications for periodontal pathogenesis
2025, Journal of oral microbiology
IF:3.7Q2
DOI:10.1080/20002297.2025.2540827
PMID:40756339
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研究论文 | 本研究首次通过单细胞RNA测序揭示了牙龈卟啉单胞菌的转录异质性 | 首次在单细胞水平绘制牙龈卟啉单胞菌转录图谱,发现具有功能意义的稀有亚群 | 仅使用W83菌株在厌氧条件下培养,未涵盖其他菌株或体内环境 | 探究牙龈卟啉单胞菌在单细胞水平的转录异质性及其与牙周病发病机制的关系 | 牙龈卟啉单胞菌W83菌株 | 单细胞转录组学 | 牙周病 | 单细胞RNA测序 | 聚类分析,差异表达分析 | 单细胞基因表达数据 | 1,942个牙龈卟啉单胞菌细胞 | NA | split-pool barcoding单细胞RNA测序 | NA | split-pool barcoding技术 |
2726 | 2025-10-06 |
New insights into acute ischemic stroke from the perspective of spatial omics
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.113396
PMID:40756344
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综述 | 从空间单细胞组学角度总结急性缺血性脑卒中后不同细胞类型在时空分布中的生物学功能和相互作用机制 | 首次从空间单细胞组学视角系统阐述急性缺血性脑卒中后中枢驻留细胞与外周免疫细胞亚群在时空分布中的动态互作机制 | NA | 理解急性缺血性脑卒中后复杂细胞间相互作用机制,为精准干预提供理论基础 | 小胶质细胞、星形胶质细胞、少突胶质细胞及其亚群、浸润外周免疫细胞 | 空间转录组学 | 急性缺血性脑卒中 | 空间转录组技术 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
2727 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing uncovers intestinal immune alterations and cellular diversity from chronic fluoride exposure in mice
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.116567
PMID:40756359
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示慢性氟暴露对小鼠肠道免疫和细胞多样性的影响 | 首次使用单细胞RNA测序技术系统分析慢性氟暴露对肠道细胞异质性和细胞间通讯的影响 | 研究仅针对小鼠模型,未涉及人类样本验证 | 探究慢性氟暴露对肠道细胞功能和免疫调节的影响机制 | 小鼠回肠组织细胞 | 单细胞组学 | 肠道疾病 | 单细胞RNA测序, 荧光原位杂交, 广谱抗生素处理 | NA | 单细胞转录组数据 | 56周50-ppm氟暴露的小鼠回肠组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2728 | 2025-10-06 |
Analysis of histone modifications in key cellular subpopulations in the context of azoospermia using spermatogenic single-cell RNA-seq data
2025, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2025.1626153
PMID:40756901
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序数据分析非梗阻性无精子症中关键细胞亚群的组蛋白修饰作用 | 首次在单细胞水平揭示NOA患者睾丸组织中特定细胞亚群(如Leydig细胞、PTM细胞和巨噬细胞)的组蛋白修饰相关基因异常表达 | 研究基于公共数据库数据,样本来源有限;未进行实验验证组蛋白修饰的功能机制 | 探究非梗阻性无精子症的分子机制,特别关注组蛋白修饰在疾病进展中的作用 | 非梗阻性无精子症患者和对照组的睾丸组织细胞 | 单细胞转录组学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序 | AUCell, CellChat | 单细胞RNA测序数据 | 来自GEO数据库GSE149512数据集的样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2729 | 2025-10-06 |
Integrated analysis of single-cell and bulk transcriptomic data reveals altered cellular composition and predictive cell types in ectopic endometriosis
2025, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2025.1641982
PMID:40757199
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研究论文 | 通过整合单细胞和批量转录组数据分析,揭示了子宫内膜异位症的细胞组成变化和关键预测细胞类型 | 首次通过整合单细胞和批量转录组数据识别MUC5B+上皮细胞和dStromal晚期间充质细胞作为子宫内膜异位症纤维化和炎症的双重驱动因子 | 依赖公共数据库数据,样本来源可能有限 | 研究子宫内膜异位症的细胞分类和组成,探索其诊断和治疗新方法 | 子宫内膜异位症患者的组织样本 | 生物信息学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序,批量转录组测序,免疫组织化学 | 随机森林 | 基因表达数据,图像数据 | GEO公共数据库中的样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
2730 | 2025-10-06 |
Spatially resolved analysis of pancreatic cancer identifies therapy-associated remodeling of the tumor microenvironment
2024-Nov, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-01890-9
PMID:39227743
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研究论文 | 本研究利用单细胞空间转录组学分析胰腺癌肿瘤微环境在治疗过程中的重塑过程 | 开发了空间约束最优输运相互作用分析(SCOTIA)模型,整合空间距离和配体-受体基因表达来解析细胞间相互作用 | NA | 解析胰腺癌肿瘤微环境在放化疗治疗过程中的重塑机制 | 人类胰腺癌组织样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞空间转录组学 | 最优输运模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
2731 | 2025-10-06 |
Biologically informed machine learning modeling of immune cells to reveal physiological and pathological aging process
2024-Oct-24, Immunity & ageing : I & A
IF:5.2Q1
DOI:10.1186/s12979-024-00479-4
PMID:39449067
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研究论文 | 本研究构建了涵盖人类生命周期的免疫细胞转录组图谱,开发了新型生物年龄预测模型PHARE,揭示了免疫细胞在生理和病理衰老过程中的变化 | 构建了首个涵盖从新生儿到超百岁老人的人类生命周期免疫细胞转录组图谱,开发了适用于单细胞和批量RNA-seq数据的生物年龄预测模型PHARE | NA | 研究衰老如何塑造免疫细胞功能,为不同生命阶段患者的精准治疗提供依据 | 人类免疫细胞,涵盖从新生儿到超百岁老人的不同年龄群体,以及COVID-19、川崎病和冠状动脉疾病患者 | 机器学习 | 衰老相关疾病 | RNA-seq, scRNA-seq | 机器学习模型 | 转录组数据 | 涵盖从新生儿到超百岁老人的人类生命周期样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
2732 | 2025-10-06 |
MerlinS13 phosphorylation regulates meningioma Wnt signaling and magnetic resonance imaging features
2024-09-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-52284-8
PMID:39251601
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研究论文 | 本研究揭示了Merlin丝氨酸13位点磷酸化通过调控Wnt信号通路影响脑膜瘤生长的机制,并发现了一种可用于指导治疗的MRI影像学生物标志物 | 首次发现Merlin S13去磷酸化通过减弱与β-连环蛋白的抑制性相互作用激活Wnt通路驱动脑膜瘤生长,并鉴定ADC作为Merlin完整脑膜瘤的影像学生物标志物 | 对Merlin完整脑膜瘤生长的生化机制理解仍不完全,缺乏可用于指导治疗降级或影像监测的非侵入性生物标志物 | 阐明Merlin完整脑膜瘤的生化机制并开发影像学生物标志物 | 脑膜瘤异种移植模型和患者样本 | 数字病理 | 脑膜瘤 | 单细胞RNA测序,邻近标记蛋白质组质谱,磁共振成像 | NA | 基因表达数据,蛋白质组数据,影像数据 | 脑膜瘤异种移植模型和患者样本 | NA | 单细胞RNA测序,蛋白质组质谱,空间转录组学 | NA | NA |
2733 | 2025-10-06 |
Cardiac Development at a Single-Cell Resolution
2024, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-031-44087-8_14
PMID:38884716
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在哺乳动物心脏发育研究中的应用与进展 | 利用单细胞RNA测序技术首次实现了对心脏发育过程中异质性细胞群体的精细解析 | NA | 探索哺乳动物心脏发育的分子机制和细胞多样性 | 人类和小鼠的心脏发育过程 | 单细胞生物学 | 先天性心脏病 | 单细胞RNA测序,单细胞多组学 | NA | 转录组数据,表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
2734 | 2025-10-06 |
Multi-omics profiling of acute Pseudomonas aeruginosa pneumonia unmasks conventional NK cell depletion and stage-specific therapeutic targets
2025-12, Virulence
IF:5.5Q1
DOI:10.1080/21505594.2025.2490206
PMID:40216004
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了铜绿假单胞菌肺炎中常规NK细胞的耗竭现象及其阶段特异性治疗靶点 | 首次发现铜绿假单胞菌肺炎早期常规NK细胞而非组织驻留NK细胞的特异性耗竭,并确定其为最早的免疫检查点失效 | 研究基于小鼠模型,临床转化需进一步验证 | 阐明吸入性铜绿假单胞菌感染后宿主天然免疫反应特征 | 铜绿假单胞菌肺炎小鼠模型 | 免疫学 | 肺炎 | RNA测序,单细胞RNA测序,蛋白质分析,细胞分析 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据,细胞计数数据 | 小鼠模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | NA |
2735 | 2025-10-06 |
Spatial Transcriptomics Unveils Regional Heterogeneity and Subclonal Dynamics in the Lung Adenocarcinoma Microenvironment
2025-Oct, Computer methods and programs in biomedicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1016/j.cmpb.2025.108929
PMID:40617150
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术揭示了肺腺癌微环境中的区域异质性和亚克隆动态 | 首次结合单细胞转录组学和空间转录组学,系统解析肺腺癌的空间功能异质性及肿瘤侵袭方向 | 仅分析了单个空间转录组学样本,样本量有限 | 探索肺腺癌微环境的空间异质性和肿瘤进展机制 | 肺腺癌组织样本 | 空间转录组学 | 肺腺癌 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | 细胞反卷积, 伪时间分析, 降维聚类 | 空间转录组数据, 单细胞转录组数据 | 125,203个单细胞和3,990个空间位点 | 10x Genomics | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | 10x Visium | 空间转录组学技术结合单细胞转录组数据分析 |
2736 | 2025-10-06 |
Integrative Analysis of Bulk Multiomics and Single-Cell Transcriptomics Elucidates Age-Related Molecular Landscape Alterations in Cervical Cancer
2025-Sep, Annals of surgical oncology
IF:3.4Q1
DOI:10.1245/s10434-025-17464-w
PMID:40415156
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研究论文 | 通过整合分析批量多组学和单细胞转录组数据,揭示宫颈癌中与年龄相关的分子景观变化 | 首次系统比较不同年龄段宫颈癌患者的分子特征差异,结合批量多组学和单细胞转录组数据进行综合分析 | 样本量相对有限,需要更大规模的研究验证 | 阐明年龄对宫颈癌分子特征的影响 | 307例宫颈癌患者(来自TCGA)和11例宫颈癌样本(来自GEO) | 生物信息学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序, 批量多组学分析 | 比较分析 | 转录组数据, 基因组数据, 表观遗传数据, 临床数据 | 307例批量多组学样本 + 11例单细胞RNA测序样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量多组学 | NA | NA |
2737 | 2025-10-06 |
Multi-omics characterization of prognostic signature and novel molecular subtypes associated with anoikis and in vitro validation of CDKN2A in thyroid carcinoma
2025-Sep, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.156956
PMID:40527061
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研究论文 | 通过多组学分析甲状腺癌中失巢凋亡相关基因的预后特征和分子亚型,并验证CDKN2A的功能作用 | 首次建立甲状腺癌的多组学驱动分子亚型,提供失巢凋亡的全面调控框架,并验证CDKN2A在失巢凋亡抵抗和免疫微环境调节中的关键作用 | 研究基于TCGA数据库,需要进一步实验验证 | 探索甲状腺癌中失巢凋亡相关基因的调控机制及其在分子分型和治疗敏感性中的作用 | 甲状腺癌患者 | 生物信息学 | 甲状腺癌 | 多组学分析,单细胞测序,转录组学,甲基化分析,miRNA分析 | 风险评分模型,无监督聚类 | 转录组数据,甲基化数据,miRNA数据,单细胞测序数据 | TCGA数据库中的甲状腺癌患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq,多组学分析 | NA | NA |
2738 | 2025-10-06 |
Glial cell crosstalk in the local microenvironment following spinal cord injury
2025-Sep, Brain research bulletin
IF:3.5Q2
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究脊髓损伤后局部微环境中胶质细胞的相互作用网络 | 首次在脊髓损伤微环境中鉴定出三种胶质细胞的多个亚型,并揭示了它们之间的复杂相互作用网络 | 胶质细胞相互作用的分子机制仍需进一步实验验证 | 阐明脊髓损伤后胶质细胞在局部微环境中的相互作用机制 | 脊髓损伤模型中的小胶质细胞、星形胶质细胞和少突胶质细胞 | 单细胞生物学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序,免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2739 | 2025-10-06 |
Formononetin enhances cisplatin chemotherapy sensitivity in osteosarcoma by inducing ferroptosis and reconstructing the immune microenvironment
2025-Sep, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.156960
PMID:40543234
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研究论文 | 本研究探讨了芒柄花素通过诱导铁死亡和重塑免疫微环境增强骨肉瘤对顺铂化疗敏感性的机制 | 首次证明芒柄花素可通过抑制MAZ/GPX4轴诱导铁死亡并重构肿瘤免疫微环境来增强骨肉瘤对顺铂的敏感性 | 研究基于PDX模型,尚未进行临床试验验证 | 探索芒柄花素增强骨肉瘤细胞对顺铂敏感性的作用机制 | 骨肉瘤PDX模型中的肿瘤细胞和免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | PDX模型 | 单细胞测序数据 | 7216个人源骨肉瘤细胞和89,558个小鼠源细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
2740 | 2025-10-06 |
Eriodictyol from Scutellariae Barbata alleviates inflammation and necrosis via ZBP1-dependent signaling in acute pancreatitis
2025-Sep, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.156926
PMID:40544733
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研究论文 | 本研究首次揭示黄芩中圣草酚通过ZBP1依赖性信号通路缓解急性胰腺炎的炎症和坏死 | 首次发现黄芩中的活性成分圣草酚通过靶向ZBP1依赖性信号通路缓解急性胰腺炎的胰腺坏死和炎症 | NA | 探究黄芩及其活性成分圣草酚对急性胰腺炎的治疗机制 | 急性胰腺炎动物模型和266-6细胞 | 生物医学研究 | 急性胰腺炎 | 转录组分析, 单细胞RNA测序, 分子对接, 分子动力学模拟, 细胞热位移分析, 药物亲和响应靶点稳定性分析, mtDNA分析 | NA | RNA测序数据, 蛋白质相互作用数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |