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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2721 | 2025-11-21 |
Multiplexed RNA imaging and in situ profiling in living cells
2025-Nov-19, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d5sc06220a
PMID:41210282
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综述 | 本文探讨活细胞多重RNA成像技术及其与固定细胞空间转录组学方法的比较 | 开发了能够在活细胞中进行多重RNA成像的先进荧光探针技术,实现RNA定位、相互作用和浓度变化的实时监测 | 传统空间转录组学方法需要细胞固定和透化,只能提供静态快照 | 推进时空RNA分析技术,追踪RNA动态变化并揭示多种RNA物种间的时间关系 | 活细胞中的RNA分子 | 空间转录组学 | NA | 多重RNA成像,荧光原位杂交,测序 | NA | RNA图像,基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞RNA分析 | NA | NA |
| 2722 | 2025-11-21 |
Targeting the origins of multiple myeloma along hematopoietic stem cell lymphoid lineage differentiation
2025-Nov-19, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adu0114
PMID:41259534
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序追踪多发性骨髓瘤在B细胞谱系分化过程中的恶性转化机制 | 首次在B细胞分化过程中识别了1q扩增和17p缺失的起源阶段,并发现FCRL5通过IRF4/SPI1复合物驱动恶性转化 | 未明确说明样本规模和实验设计的局限性 | 探索多发性骨髓瘤起始细胞的恶性转化机制和驱动基因 | 多发性骨髓瘤患者的造血干细胞至淋巴谱系分化各阶段细胞 | 单细胞基因组学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞测序, 遗传示踪分析 | NA | 单细胞基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2723 | 2025-11-21 |
Integrated transcriptome profiling of plasma exosomes reveals molecular stratification of exocrine and endocrine disorders and S100A8-mediated cell interactions in chronic pancreatitis
2025-Nov-18, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-025-00832-x
PMID:41249153
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研究论文 | 通过血浆外泌体转录组测序建立慢性胰腺炎分子分型系统并揭示miR-24-3p/S100A8轴在疾病进展中的作用机制 | 首次建立基于血浆外泌体12个miRNA表达的3阶段分型系统,并发现外泌体miR-24-3p通过调控中性粒细胞S100A8影响胰腺星状细胞纤维化和巨噬细胞炎症的新机制 | 分型系统仅完成初步验证,需要更大样本量的前瞻性研究确认临床适用性 | 开发慢性胰腺炎外分泌和内分泌功能障碍的分子分型方法并探索其发病机制 | 慢性胰腺炎患者血浆外泌体、胰腺病变组织、CP小鼠模型 | 生物信息学 | 慢性胰腺炎 | 转录组测序, 单细胞测序 | NA | RNA测序数据, 单细胞测序数据 | CP患者队列和外部验证队列 | NA | 外泌体转录组测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2724 | 2025-11-21 |
Butyrate modifies epigenetic and immune pathways in peripheral mononuclear cells from children with neurodevelopmental disorders associated with chromatin dysregulation
2025-Nov-18, Neurotherapeutics : the journal of the American Society for Experimental NeuroTherapeutics
IF:5.6Q1
DOI:10.1016/j.neurot.2025.e00792
PMID:41260988
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研究论文 | 本研究探讨了丁酸盐对染色质相关神经发育障碍儿童外周血单核细胞表观遗传和免疫通路的调控作用 | 首次在染色质相关神经发育障碍中鉴定出共同的核糖体-免疫RNA特征,并证明丁酸盐能逆转这些异常通路 | 样本量较小(总样本数21,单细胞测序仅6个样本),且仅针对外周血细胞进行研究 | 研究丁酸盐作为组蛋白去乙酰化酶抑制剂对神经发育障碍的治疗潜力 | 染色质相关神经发育障碍儿童(Kabuki综合征、CHARGE综合征、Rett综合征)和非单基因诊断神经发育障碍儿童的外周血单核细胞 | 表观遗传学 | 神经发育障碍 | RNA-seq, scRNA-seq | NA | RNA测序数据 | 总样本21个(患者19个,对照2个),单细胞测序101,539个外周免疫细胞 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 2725 | 2025-11-21 |
Disruption of E-cadherin in the airway led to dysplastic stressed cells and asthma-like phenotypes
2025-Nov-17, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.06.030
PMID:40683251
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研究论文 | 本研究揭示E-钙黏蛋白缺失通过上皮细胞内在机制和上皮-免疫互导导致气道重塑和哮喘样表型 | 首次发现E-钙黏蛋白在气道上皮祖细胞中的特异性缺失可诱发无需过敏原暴露的哮喘样表型,并识别出上皮细胞感知连接破坏并启动免疫防御的内在能力 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 探究E-钙黏蛋白在气道细胞命运决定和哮喘样表型形成中的作用机制 | 小鼠气道上皮细胞(特别是club细胞和纤毛细胞) | 单细胞生物学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2726 | 2025-11-21 |
Single-cell and spatial multiomics identifies heterogeneous xylem development driven by mechanical stress in Populus
2025-Nov-17, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.06.038
PMID:40701155
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间多组学技术揭示了机械应力驱动的杨树木材异质性发育机制 | 首次结合单细胞RNA测序、空间转录组学、代谢组学和磷酸化蛋白质组学,系统解析了张力木形成的细胞类型、谱系关系和分子调控网络 | 研究主要聚焦于杨树特定发育阶段,在其他树种或发育时期的普适性有待验证 | 探究机械应力下木材形成的细胞异质性发育机制 | 杨树正常木材、张力木和对侧木材的木质部组织 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 代谢组学, 磷酸化蛋白质组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间基因表达数据, 代谢物数据, 蛋白质磷酸化数据 | 杨树正常木材、张力木和对侧木材样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2727 | 2025-11-21 |
Single-cell transcriptomics identifies chondrocyte differentiation dynamics in vivo and in vitro
2025-Nov-17, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.06.031
PMID:40712580
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组技术分析体内外软骨细胞分化动态,建立评估和优化体外软骨生成方案的框架 | 首次结合胚胎长骨单细胞RNA测序数据与公共数据构建软骨内骨化图谱,并通过轨迹比对揭示体外分化中的脱靶现象 | 研究主要基于人类胚胎干细胞模型,尚未在更多细胞类型或临床样本中验证 | 优化体外软骨生成方案以更好地模拟体内发育过程 | 胚胎长骨组织、人类胚胎干细胞分化细胞 | 单细胞组学 | 肌肉骨骼疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 单核RNA测序(snRNA-seq) | 轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | 胚胎长骨样本及公共数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 2728 | 2025-11-21 |
Single-cell mapping reveals age-related alterations in periosteal progenitor cells and immune microenvironment
2025-Nov-17, Cell regeneration (London, England)
DOI:10.1186/s13619-025-00263-9
PMID:41247564
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序绘制了小鼠骨膜衰老过程中的细胞图谱,揭示了祖细胞和免疫微环境的年龄相关变化 | 首次在单细胞水平系统描绘骨膜衰老过程,发现不同祖细胞亚群具有独特的衰老轨迹,并揭示祖细胞-免疫细胞相互作用在骨稳态中的关键作用 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 探究骨膜衰老的细胞和分子机制 | 3月、9月和18月龄小鼠的骨膜组织 | 单细胞生物学 | 骨骼老化疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 三个年龄组的小鼠骨膜样本(3月、9月、18月龄) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2729 | 2025-11-21 |
Breast cancer remodels lymphatics in sentinel lymph nodes
2025-Nov-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-64981-z
PMID:41249124
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析乳腺癌患者前哨淋巴结中淋巴管内皮细胞亚群的重塑过程 | 首次在人类乳腺癌样本中揭示肿瘤转移导致淋巴结淋巴管内皮细胞亚群重塑,并发现MGP基因在转移过程中的关键作用 | 研究仅限于初治乳腺癌女性患者,样本来源相对单一 | 探究乳腺癌转移对前哨淋巴结淋巴管内皮细胞的影响机制 | 乳腺癌女性患者的配对转移和非转移前哨淋巴结 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 乳腺癌患者配对的转移和非转移前哨淋巴结样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2730 | 2025-11-21 |
Single-cell and spatial dissection of necroptosis spatiotemporal evolution driving lymph node metastasis in gastric cancer
2025-Nov-17, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02815-z
PMID:41249133
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析揭示了胃癌淋巴结转移过程中肿瘤细胞异质性和坏死性凋亡的时空演化机制 | 首次整合单细胞和空间分析技术揭示胃癌淋巴结转移过程中坏死性凋亡的时空演化特征,发现CHMP3基因和MDK-NCL信号通路在转移中的关键作用 | 样本量较小(仅4例患者),需要更大规模研究验证发现 | 探究胃癌淋巴结转移的驱动机制和肿瘤微环境异质性 | 胃癌患者原发肿瘤和配对转移淋巴结组织 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫荧光 | 伪时序分析 | 单细胞基因表达数据, 空间转录组数据, 临床数据 | 4例胃癌患者(4个原发肿瘤和2个配对转移淋巴结) | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2731 | 2025-11-21 |
Single-cell RNA sequencing reveals that kimchi dietary intervention modulates human antigen-presenting and CD4⁺ T cells
2025-Nov-17, NPJ science of food
IF:6.3Q1
DOI:10.1038/s41538-025-00593-7
PMID:41249184
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示泡菜饮食干预调节人类抗原呈递细胞和CD4⁺ T细胞 | 首次在人类随机双盲安慰剂对照试验中使用单细胞RNA测序技术揭示泡菜对免疫系统的调节机制 | 样本量较小(13名超重成人),研究周期为12周 | 探究泡菜饮食干预对人类免疫功能的调节作用 | 超重成人的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 代谢相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 13名超重成人 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2732 | 2025-11-21 |
Engineered long-acting Irisin-albumin binding domain fusion protein for enhanced anti-inflammatory efficacy in lipopolysaccharide-induced systemic inflammation
2025-Nov-17, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09000-z
PMID:41249468
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研究论文 | 本研究开发了一种白蛋白结合域融合的鸢尾素蛋白,显著延长其半衰期并增强抗炎疗效 | 首次将白蛋白结合域与鸢尾素融合,显著延长血浆半衰期从<1小时至约10小时,并增强抗炎效果 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未进行人体临床试验 | 开发长效鸢尾素融合蛋白以增强抗炎治疗效果 | 脂多糖诱导的系统性炎症小鼠模型 | 生物医学工程 | 炎症性疾病 | 单细胞RNA测序,蛋白质印迹,药代动力学研究 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据,病理数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2733 | 2025-11-21 |
The Wnt/β-catenin-P2-HNF4α feedback loop facilitates colorectal tumorigenesis and malignancy
2025-Nov-17, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07133-7
PMID:41250108
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研究论文 | 本研究揭示了Wnt/β-catenin信号通路通过P2-HNF4α形成正反馈环路促进结直肠癌发生发展的新机制 | 首次发现P2-HNF4α作为Wnt/β-catenin通路的下游效应因子,并鉴定出Wnt/β-catenin-P2-HNF4α正反馈环路 | NA | 探究HNF4α不同亚型在结直肠癌中对Wnt/β-catenin信号通路的调控作用 | 结直肠癌细胞系、裸鼠皮下移植瘤模型、临床肿瘤样本 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | RNA测序, 单细胞RNA测序, ChIP测序, 免疫组织化学 | NA | 基因表达数据, 表观遗传数据, 临床病理数据 | 临床肿瘤样本和正常对照组织 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, ChIP-seq | NA | NA |
| 2734 | 2025-11-21 |
Molecular features of congenital cytomegalovirus infection in neonatal mouse brain at single-cell resolution
2025-Nov-17, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-025-02158-x
PMID:41250226
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析先天性巨细胞病毒感染的新生小鼠大脑,揭示了病毒对不同细胞类型的感染特征及其对神经发育的影响 | 首次在单细胞分辨率下系统揭示先天性巨细胞病毒感染对新生小鼠大脑不同细胞类型的影响,特别是发现神经祖细胞和单核源性巨噬细胞是最易感染细胞类型 | 研究基于小鼠模型,结果向人类临床转化的适用性需要进一步验证 | 探究先天性巨细胞病毒感染的分子特征及其对神经发育的影响机制 | 先天性巨细胞病毒感染的新生小鼠大脑组织 | 单细胞生物学 | 先天性巨细胞病毒感染 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 新生小鼠大脑22种细胞类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2735 | 2025-11-21 |
Unravelling cell heterogeneity and gene regulation mechanisms in multiple myeloma through single-cell RNA-seq
2025-Nov-16, Methods (San Diego, Calif.)
DOI:10.1016/j.ymeth.2025.11.006
PMID:41253222
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究多发性骨髓瘤的细胞异质性和基因调控机制 | 首次整合四个公共scRNA-Seq数据集,识别24个MM细胞簇并预测651个调控子 | 仅使用公共数据集,缺乏实验验证 | 解析多发性骨髓瘤的细胞异质性和基因调控机制 | 多发性骨髓瘤细胞 | 生物信息学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 四个数据集共包含597、172、477和51,840个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2736 | 2025-11-21 |
Exhausted KLRG1hi CD8+ T and pathogenic GZMA+ Th17 cells are associated with the mild Mycoplasma pneumoniae pneumonia in children
2025-Nov, The Journal of infection
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.jinf.2025.106642
PMID:41173398
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和高维流式细胞术揭示了儿童轻度肺炎支原体肺炎中T细胞和B淋巴细胞的功能障碍特征 | 首次在MPP患儿中系统描述了耗竭性KLRG1hi CD8+ T细胞和致病性GZMA+ Th17细胞的免疫特征 | 研究仅限于轻度肺炎支原体肺炎患儿,未涉及重症病例 | 阐明适应性免疫在儿童肺炎支原体肺炎发病机制中的作用 | 肺炎支原体单一感染的轻度肺炎患儿 | 免疫学 | 肺炎支原体肺炎 | 单细胞RNA测序, 高维流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2737 | 2025-11-21 |
The cervicovaginal microbiome associates with spatially restricted host transcriptional signatures throughout the human ectocervical epithelium and submucosa
2025-Nov, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1013677
PMID:41218071
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析揭示宫颈阴道微生物组与人类宫颈上皮及黏膜下组织转录特征的空间关联 | 首次发现微生物组定植虽局限于腔面,但其转录影响贯穿整个黏膜层,在基底膜两侧最为显著 | 样本量较小(n=21),仅针对肯尼亚女性性工作者群体 | 探究宫颈阴道微生物组对宫颈转录景观的影响及其与HIV易感性的关联 | 肯尼亚女性性工作者的宫颈组织样本 | 空间转录组学 | HIV感染 | 空间转录组学 | 加权基因共表达分析 | 空间转录组数据 | 21例宫颈组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2738 | 2025-11-21 |
Comparative genomics, integrated with single-cell sequencing and genetic analyses, reveal roles of transcription factor AP2-M2 in asexual replication of Babesia parasite
2025-Nov, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1013699
PMID:41231960
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研究论文 | 本研究通过比较基因组学、单细胞测序和遗传分析揭示了转录因子AP2-M2在巴贝斯虫无性繁殖阶段的关键调控作用 | 首次构建了新疆巴贝斯虫染色体级别参考基因组,结合单细胞RNA测序揭示了寄生虫无性发育阶段的转录异质性和BxAP2-M2的持续表达特征 | 研究主要聚焦于单一巴贝斯虫物种,调控机制的具体分子通路仍需进一步验证 | 探索巴贝斯虫无性繁殖阶段的分子调控机制 | 新疆巴贝斯虫及其无性发育阶段 | 基因组学 | 巴贝斯虫病 | 单细胞RNA测序, 比较基因组学, 遗传分析 | 伪时间分析 | 基因组数据, 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2739 | 2025-11-21 |
Library size-stabilized metacells construction enhances co-expression network analysis in single-cell data
2025-Nov, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013697
PMID:41231963
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研究论文 | 提出一种通过稳定文库大小构建元细胞的计算框架LSMetacell,用于改善单细胞数据中共表达网络分析的准确性 | 首次在元细胞构建过程中显式稳定文库大小,有效减少组成性噪声同时保持细胞异质性 | 仅通过数学建模和模拟验证,需要在更多实际数据集上进一步验证 | 解决单细胞RNA测序数据中的组成性偏差问题,提高共表达网络分析的可靠性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | LSMetacell框架 | 基因表达数据 | 死后阿尔茨海默病大脑单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2740 | 2025-11-21 |
Single-Cell RNA Seq in Sydenham Chorea Shows B Cell HLA-DR/DQ Upregulation and Plasma Cell Proteasomal Activation
2025-Nov, Annals of clinical and translational neurology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/acn3.70179
PMID:40859454
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析Sydenham舞蹈症患者外周免疫细胞,发现B细胞HLA-DR/DQ上调和浆细胞蛋白酶体通路激活 | 首次在Sydenham舞蹈症中应用单细胞RNA测序技术揭示B细胞和浆细胞的特定分子通路异常 | 样本量较小(仅1例患者和2例对照),需要更大规模研究验证 | 探究Sydenham舞蹈症的免疫病理机制 | Sydenham舞蹈症患者和性别匹配对照的外周免疫细胞 | 单细胞组学 | 神经系统自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 30,794个外周免疫细胞(来自1例患者和2例对照) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |