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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2721 | 2026-05-04 |
Titration of RAS alters senescent state and influences tumour initiation
2024-09, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07797-z
PMID:39112713
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研究论文 | 通过体内外模型研究致癌RAS剂量滴定如何改变衰老状态并影响肿瘤起始 | 首次开发RAS剂量递增模型,揭示低剂量RAS驱动的非连续性下游表型,并发现NRAS(G12V)水平降低可导致肝细胞免疫逃逸与肿瘤形成 | 未明确说明局限性 | 探究致癌RAS剂量变化对衰老表型及肿瘤起始的影响 | 肝细胞衰老模型中的小鼠肝细胞及肿瘤 | 机器学习 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠肝细胞样本及肿瘤样本(具体数量未提供) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2722 | 2026-05-04 |
Osteostaticytes: A novel osteoclast subset couples bone resorption and bone formation
2024-Jul, Journal of orthopaedic translation
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.jot.2024.06.010
PMID:39027343
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建人皮质骨细胞图谱,发现一种新型破骨细胞亚群——骨静细胞(OSCs),其具有高趋化活性,可招募间充质干细胞,参与骨重塑中的逆转阶段 | 首次鉴定出IDO1高表达/CCL3高表达/CCL4高表达的破骨细胞前体亚群(骨静细胞),并证明其在骨重塑逆转期具有最强的间充质干细胞趋化能力,揭示了破骨细胞系早期阶段与骨形成偶联的新机制 | 该研究主要基于单细胞转录组数据和体外共培养实验,骨静细胞在体内骨重塑中的具体功能及其作为治疗靶点的可行性仍需进一步验证 | 阐明骨髓炎后骨重塑失败的细胞和分子机制,探索破骨细胞系在骨形成与骨吸收偶联中的作用 | 人皮质骨(正常、感染和重建状态)样本,以及正常小鼠胫骨骨折模型和骨髓炎相关胫骨骨折模型 | 数字病理学, 机器学习 | 骨髓炎, 骨延迟愈合 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据(单细胞转录组)、图像(免疫荧光、生物发光成像) | 人皮质骨样本(具体数量未提及,包含正常、感染和重建三种状态),小鼠模型样本(正常骨折和骨髓炎骨折模型) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2723 | 2026-05-04 |
Machine learning-based selection of immune cell markers in osteosarcoma: prognostic determination and validation of CLK1 in disease progression
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1468875
PMID:39742274
|
研究论文 | 通过机器学习选择骨肉瘤免疫细胞标志物,构建预后模型并验证CLK1在疾病进展中的作用 | 利用多算法计算框架结合20种机器学习算法构建基于肿瘤浸润免疫细胞的预后模型,并发现CLK1作为潜在癌基因促进骨肉瘤细胞增殖和迁移 | 未提及具体的局限性 | 提高对骨肉瘤肿瘤微环境的理解,开发预后模型并识别新的治疗靶点 | 骨肉瘤患者临床和RNA表达数据、单细胞RNA测序数据以及人骨肉瘤细胞系MG63和U2OS | 机器学习 | 骨肉瘤 | RNA测序、单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | RNA表达数据、单细胞RNA测序数据 | 11例骨肉瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2724 | 2026-05-04 |
High-throughput identification of Toxoplasma gondii effector proteins that target host cell transcription
2023-10-11, Cell host & microbe
IF:20.6Q1
DOI:10.1016/j.chom.2023.09.003
PMID:37827122
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研究论文 | 结合混合CRISPR敲除筛选与双宿主-微生物单细胞RNA测序方法(dual perturb-seq),高通量鉴定弓形虫效应蛋白并揭示其调控宿主细胞转录的机制 | 首次将混合CRISPR敲除筛选与双宿主-微生物单细胞RNA测序结合为dual perturb-seq技术,实现高通量鉴定病原体效应蛋白并直接从转录组数据推断其功能 | 方法在弓形虫特定效应蛋白的验证上仍有待进一步扩展至其他病原体系统 | 高通量鉴定细胞内病原体产生的、靶向宿主细胞转录的效应蛋白及其功能 | 弓形虫及其感染宿主细胞 | 数字病理学 | 弓形虫病 | CRISPR敲除筛选、单细胞RNA测序、dual perturb-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 弓形虫混合CRISPR敲除文库感染宿主细胞后的单细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 2725 | 2026-05-04 |
Single-cell sequencing of rotavirus-infected intestinal epithelium reveals cell-type specific epithelial repair and tuft cell infection
2021-11-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2112814118
PMID:34732579
|
研究论文 | 利用单细胞测序技术探究轮状病毒感染后肠道上皮的细胞特异性修复机制及簇细胞的感染情况 | 首次发现轮状病毒感染可感染簇细胞,并揭示簇细胞通过干扰素相关通路应对病毒感染;同时发现特定细胞亚群增殖频率增加并伴随隐窝扩张和不成熟肠细胞增多 | 未阐明簇细胞感染在肠道修复中的具体功能角色,且仅基于轮状病毒模型,其他病原体相关修复机制需进一步验证 | 在单细胞水平上探索轮状病毒引起的肠道上皮损伤后再生修复的转录反应 | 轮状病毒感染的肠道上皮细胞(包括簇细胞、肠干细胞、不成熟肠细胞等特定亚群) | 数字病理学 | 轮状病毒感染相关肠道疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 轮状病毒感染小鼠的肠道上皮细胞样本(具体数量未提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 2726 | 2026-05-03 |
Plasma Proteomics Identifies Thousand-and-One-Amino Acid Kinase 3 as a Potential Biomarker of Rheumatoid Arthritis Activity and a Novel Therapeutic Target
2026-May, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.70020
PMID:41429590
|
research paper | 通过血浆蛋白质组学鉴定TAOK3作为类风湿关节炎活动性的潜在生物标志物和新治疗靶点 | 首次发现TAOK3与活动性类风湿关节炎的骨破坏相关,并验证其作为诊断生物标志物和治疗靶点的潜力 | 研究样本量有限,功能研究主要在体外和动物模型中进行,需进一步临床验证 | 识别与活动性类风湿关节炎骨破坏相关的新型生物标志物和治疗靶点 | 类风湿关节炎患者血浆样本、成纤维样滑膜细胞、胶原诱导关节炎小鼠模型 | machine learning | 类风湿关节炎 | 蛋白质组学、单细胞RNA测序、酶联免疫吸附试验、多重免疫组化 | NA | 蛋白质组学数据、单细胞RNA测序数据 | 160例RA患者和40例健康对照,两个独立验证队列(N1=50, N2=10) | NA | NA | NA | NA |
| 2727 | 2026-05-03 |
Activation of the Cerebrospinal Fluid-Contacting Nucleus Mitigates Systemic Inflammation Induced by Sepsis
2026-May-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002665
PMID:41457044
|
研究论文 | 本研究揭示脑脊液接触核在脓毒症中通过调节全身炎症反应发挥保护作用 | 首次发现脑脊液接触核在脓毒症免疫调节中的关键作用,并通过单细胞RNA测序鉴定其调控系统性炎症的关键组分 | 未明确脑脊液接触核调控免疫下游的具体分子通路,且动物模型可能不完全反映人类脓毒症复杂性 | 探究脑脊液接触核在脓毒症中调控全身炎症的机制 | 脓毒症小鼠模型的脑脊液接触核 | 神经免疫学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光, 化学遗传学 | NA | 单细胞转录组数据, 免疫荧光图像, 细胞因子水平 | 脓毒症小鼠模型(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2728 | 2026-05-03 |
A CD57+CD8+ T cell subset links T cell cytotoxicity to fibrotic lung disease in systemic sclerosis
2026-May-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI194288
PMID:41701649
|
研究论文 | 鉴定出一种CD57+CD8+ T细胞亚群,该亚群通过细胞毒性作用与系统性硬化症相关纤维化肺病相关联 | 首次发现并表征了CD57+效应记忆T细胞在系统性硬化症相关间质性肺病中显著扩增,并明确其与CD155/CD226共刺激通路介导的细胞毒性功能之间的关联 | 未提及 | 探究系统性硬化症相关间质性肺病的免疫病理机制,特别是T细胞在肺损伤中的作用 | 系统性硬化症伴或不伴间质性肺病患者外周血T细胞,以及独立患者肺组织样本 | 数字病理学 | 间质性肺病,系统性硬化症 | 单细胞RNA测序,免疫染色 | NA | 基因表达数据,组织图像 | 包括系统性硬化症伴间质性肺病患者、系统性硬化症不伴间质性肺病患者及对照个体的血液样本,以及独立患者的肺活检或外植体样本;同时分析多个间质性肺病队列的公开单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2729 | 2026-05-03 |
Intra- and inter-organ communications in aging and cancer: Local and global spatial perspectives
2026-May, Seminars in cell & developmental biology
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.semcdb.2026.103672
PMID:41794017
|
综述 | 探讨衰老和癌症中细胞间通信的局部和全局空间视角,重点分析配体-受体相互作用和器官内及器官间通信推断工具 | 首次系统整合衰老和癌症转移过程中配体-受体相互作用,并综述器官内和器官间通信推断工具,揭示局部和全局通信机制对疾病进程的协同影响 | 未提供具体实验验证或定量分析,仅基于现有文献总结,缺乏对新通信轴线的实证数据支撑 | 阐明衰老和癌症进展中细胞间通信的动态变化及其在组织微环境重塑中的作用,探索潜在治疗靶点 | 衰老和癌症转移过程中的细胞间相互作用,包括器官内和器官间通信 | 单细胞与空间转录组学 | 衰老相关疾病、癌症 | NA | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 2730 | 2026-05-03 |
SPT6 maintains epidermal homeostasis by inhibiting an NF-κB-positive feedback loop to prevent excessive inflammation
2026-May, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-026-01410-1
PMID:41922599
|
研究论文 | 研究SPT6通过抑制RELA基因增强子来阻断NF-κB正反馈环路,维持表皮免疫稳态和防止过度炎症的机制 | 首次发现SPT6作为转录延伸因子,通过结合RELA基因增强子抑制NF-κB正反馈环路,在表皮干细胞和祖细胞中主动抑制促炎信号通路以维持免疫静息状态 | 未提及具体局限性,但研究主要基于小鼠模型,需在人类皮肤疾病中进一步验证 | 探讨SPT6在表皮免疫稳态维持中的作用及其分子机制 | 表皮干细胞和祖细胞(EPSCs)、角质形成细胞 | 分子生物学 | 银屑病 | 条件性基因敲除、单细胞RNA测序 | 条件性敲除小鼠模型(K14-CreERT; Supt6) | 单细胞转录组数据 | 条件性敲除小鼠(K14-CreERT; Supt6) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2731 | 2026-05-03 |
Plasma ceramide mediates the association of peripheral T cells with Alzheimer's disease
2026-May, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.08.027
PMID:40835004
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research paper | 该研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术鉴定了阿尔茨海默病(AD)进展中外周T细胞亚群的动态变化,并发现血浆神经酰胺介导了CD4效应记忆(EM)T细胞与AD风险之间的关联 | 首次整合单细胞RNA测序、流式细胞术和孟德尔随机化方法,揭示CD4 EM和CD8 CM T细胞通过神经酰胺代谢途径影响AD风险,并提出免疫代谢通路的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和人群遗传数据,可能无法完全反映人类复杂疾病中的免疫-代谢相互作用,且神经酰胺介导效应仅占11.20%,其他潜在介质未充分探索 | 确定外周T细胞亚群对AD风险的因果贡献,并探究血液代谢物是否介导这种关联 | 阿尔茨海默病(AD)患者和APP/PS1小鼠模型中的T细胞亚群及血液代谢物 | machine learning | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,孟德尔随机化 | NA | 单细胞基因表达数据,流式细胞术数据,遗传变异数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 2732 | 2026-05-03 |
Lung-Targeted HGF mRNA Restores Alveolar Structure in Experimental Emphysema
2026-May-01, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.02323-2025
PMID:42067211
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研究论文 | 通过临床阶段SM92脂质纳米颗粒递送HGF mRNA,在实验性肺气肿模型中恢复肺泡结构 | 首次利用临床阶段SM92脂质纳米颗粒平台实现HGF mRNA的靶向肺部递送,并证明通过雾化和气管内滴注两种方式均能有效治疗肺气肿,通过激活肺泡II型细胞内源性修复通路 | 研究仅限于小鼠模型和患者来源肺类器官,临床转化性需进一步验证 | 评估HGF mRNA疗法在肺气肿治疗中的可行性和疗效 | 人类数据集、肺组织样本、弹性蛋白酶诱导和香烟烟雾诱导的小鼠模型、患者来源肺类器官 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病,肺气肿 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、图像、文本 | 人类数据集和肺组织样本,以及弹性蛋白酶诱导和香烟烟雾诱导的小鼠模型,具体数量未明确 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2733 | 2026-05-03 |
The role of CD34-high endothelial cells and FGF2 in vasa vasorum angiogenesis of Takayasu arteritis
2026-May-01, Clinical rheumatology
IF:2.9Q2
DOI:10.1007/s10067-026-08140-9
PMID:42067750
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研究论文 | 研究CD34高表达内皮细胞和FGF2信号在Takayasu动脉炎血管外膜新生血管中的作用 | 首次在TAK患者主动脉壁中鉴定出CD34hi_ECs的显著扩增,并揭示FGF2-FGFR1轴可能介导TAK中的病理性血管新生 | 样本量较小,仅纳入3名TAK患者和3名对照进行scRNA-seq分析 | 探讨CD34高表达内皮细胞和FGF2信号在Takayasu动脉炎病理性血管外膜新生血管及炎症进展中的作用 | Takayasu动脉炎患者和健康对照者的主动脉组织和血清 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学,细胞因子微球阵列 | NA | 基因表达数据,图像数据 | 3名TAK患者和3名对照用于scRNA-seq和免疫组化,48名TAK患者和24名健康对照用于血清细胞因子测量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2734 | 2026-05-03 |
CD109 is associated with an immunosuppressive microenvironment and M2 macrophage polarization: pan-cancer analysis and functional validation
2026-May-01, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-026-16100-4
PMID:42067796
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研究论文 | 通过泛癌分析及功能验证揭示了CD109与免疫抑制微环境和M2型巨噬细胞极化的关联 | 首次在泛癌水平系统评估CD109的表达、预后相关性及免疫调节作用,并结合单细胞RNA测序和体外功能验证阐明其与M2型巨噬细胞极化和免疫抑制微环境的关系 | 巨噬细胞相关功能效应仅在肺癌模型中验证,仍需在其他肿瘤类型中进一步研究 | 探讨CD109在多种癌症中的预后价值及其免疫调节作用 | CD109基因及其在肿瘤免疫微环境中的角色 | 生物信息学 | 泛癌,非小细胞肺癌 | RNA-seq,单细胞RNA测序,siRNA敲低,共培养实验,流式细胞术,qPCR,ELISA,迁移实验 | NA | 基因表达数据,单细胞转录组数据 | GTEx和TCGA数据库中的多癌种样本,以及非小细胞肺癌队列的单细胞RNA测序样本 | NA | bulk RNA-seq,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2735 | 2026-05-03 |
Deep-learning-based de novo discovery and design of therapeutics that reverse disease-associated transcriptional phenotypes
2026-Apr-30, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2026.02.016
PMID:41850287
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研究论文 | 提出基于深度学习的药物发现平台GPS,通过逆转疾病相关的转录表型实现从头药物发现和优化 | 首次将转录组特征直接用于从头药物发现而非仅药物重定位,并开发仅从化学结构预测转录扰动特征的方法 | 未充分讨论模型在复杂疾病中的泛化性及化合物合成可行性 | 开发基于深度学习的药物发现平台,通过逆转疾病相关转录特征实现新药发现 | 肝细胞癌和特发性肺纤维化疾病模型 | 机器学习 | 肝细胞癌, 特发性肺纤维化 | RNA-seq | 深度学习模型(具体架构未明确)、树搜索优化方法 | 转录组数据、化学结构数据 | 多个疾病案例及两项验证(肝细胞癌:两个化合物系列;特发性肺纤维化:一个重定位候选和一种新抗纤维化化合物) | NA | NA | NA | NA |
| 2736 | 2026-05-03 |
Comprehensive analysis of ATF3 as a diagnostic and prognostic biomarker from pan-cancer to clear cell renal cell carcinoma
2026-Apr-30, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05113-x
PMID:42056650
|
研究论文 | 全面分析ATF3从泛癌到肾透明细胞癌作为诊断和预后生物标志物的作用 | 首次系统评估ATF3在多种癌症类型中的表达、诊断效能、预后意义及其与肿瘤免疫微环境的关联,并利用单细胞RNA测序阐明其在肾透明细胞癌细胞水平的具体作用 | 主要依赖公共数据库分析,缺乏大规模临床样本验证;ATF3在泛癌中的功能机制尚未深入阐明 | 评估ATF3在泛癌和肾透明细胞癌中的诊断和预后价值,并探索其在肿瘤免疫微环境中的作用 | ATF3基因在多种癌症中的表达及功能 | 机器学习 | 肾透明细胞癌 | 实时荧光定量PCR, Western blot, 免疫荧光, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 公共数据库中多种癌症的样本数据及肾透明细胞癌细胞系 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 2737 | 2026-05-03 |
PEBP1 inhibition as a therapeutic target for neurological recovery in ischemic stroke
2026-Apr-30, Neurotherapeutics : the journal of the American Society for Experimental NeuroTherapeutics
IF:5.6Q1
DOI:10.1016/j.neurot.2026.e00912
PMID:42066623
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析,确定PEBP1为缺血性卒中后神经恢复的治疗靶点,并通过实验验证其抑制效果 | 首次结合单细胞转录组学与大规模遗传学数据(孟德尔随机化)系统识别PEBP1为卒中后神经损伤的关键介质,并利用药理学抑制(FerroLOXIN-1)和基因敲低(AAV-BI30介导的shRNA)双重策略验证其治疗潜力 | 潜在脱靶效应需进一步验证;研究仅基于欧洲生物信息学研究所和英国生物银行的数据集,缺乏其他人群(如亚洲人群)的验证;体内模型仅采用大脑中动脉闭塞模型,可能无法完全模拟人类卒中异质性 | 探索缺血性卒中后神经功能恢复的新基因靶点,评估PEBP1抑制的治疗潜力 | 缺血性卒中患者(欧洲人群)、小鼠大脑中动脉闭塞模型、内皮细胞 | 数字病理学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序、孟德尔随机化、共定位分析、定量PCR、免疫荧光 | NA | 基因表达数据、遗传变异数据 | 初始数据集:34,593例病例和624,214例对照;验证数据集:86,668例病例和1,503,898例对照;英国生物银行:26,052例病例和487,214例对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2738 | 2026-05-03 |
A conserved re-epithelialization program underlies malignancy in pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-Apr-30, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2026.03.021
PMID:42066759
|
研究论文 | 利用高分辨率空间转录组学识别胰腺导管腺癌中保守的再上皮化程序MP10,并揭示其在PanIN向PDAC进展中的作用机制 | 首次发现保守的再上皮化程序MP10标记侵袭性胰腺癌细胞,并揭示其与伤口边缘角质细胞再上皮化的相似性,以及FOSL1转录因子在侵袭中的驱动作用 | 未明确提及研究限制,可能包括样本数量有限或机制验证不足 | 探究胰腺导管腺癌从PanIN进展为侵袭性癌症的分子机制 | 人类胰腺导管腺癌组织和小鼠PanIN向PDAC进展模型 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 高分辨率空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2739 | 2026-04-30 |
Characterizing Infiltrating Macrophages in Intracranial Aneurysm with IA Animal Models and Spatial Transcriptomics
2026-Apr-29, Translational stroke research
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s12975-026-01437-6
PMID:42053685
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2740 | 2026-05-03 |
GPR124 regulates hyaloid blood vessel regression and is associated with endothelial-mesenchymal transition
2026-Apr-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-50835-1
PMID:42056280
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研究论文 | 本研究揭示了GPR124在调节玻璃体血管退化中的作用,并发现其与内皮-间质转化相关 | 首次识别GPR124作为玻璃体血管退化的关键调节因子,并发现其通过WNT/β-catenin信号和内皮-间质转化促进血管重塑 | 未明确GPR124下游的具体分子机制,且仅在小鼠模型中验证,缺乏人类数据 | 阐明GPR124在玻璃体血管退化过程中的功能和机制 | 小鼠玻璃体血管内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、免疫染色 | 基因敲除小鼠模型(Gpr124条件性敲除) | 基因表达数据、图像 | 使用他莫昔芬诱导的内皮特异性Gpr124敲除小鼠模型,具体样本量未在摘要中提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞RNA测序用于分析玻璃体血管内皮细胞 |