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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
27301 2024-08-05
scInterpreter: a knowledge-regularized generative model for interpretably integrating scRNA-seq data
2023-Dec-16, BMC bioinformatics IF:2.9Q1
研究论文 本研究提出了一种基于深度学习的可解释模型scInterpreter,用于整合和注释scRNA-seq数据。 scInterpreter显著优于其他最新模型,并通过知识先验加速训练过程,同时提供可解释的细胞表示。 未提及具体的局限性 研究旨在提供一个有效且可解释的单细胞转录组数据整合工具。 本研究的对象为单细胞RNA-seq数据。 数字病理学 NA 深度学习 NA 单细胞RNA-seq数据 多个基准数据集 NA NA NA NA
27302 2024-08-07
Bioinformatics identification of a T-cell-related signature for predicting prognosis and drug sensitivity in hepatocellular carcinoma
2023-Dec, IET systems biology IF:1.9Q3
研究论文 本研究通过生物信息学方法识别出与T细胞相关的预后和药物敏感性标志物,用于肝细胞癌的预测 开发了一种综合使用10种机器学习算法的T细胞相关预后标志物(TRPS),并验证了其在肝细胞癌中的独立风险因素作用 NA 开发和验证一种新的生物标志物,用于预测肝细胞癌患者的预后和药物敏感性 肝细胞癌患者及其T细胞相关的预后和药物敏感性 生物信息学 肝细胞癌 单细胞RNA测序 机器学习算法 RNA序列数据 使用Cancer Genome Atlas队列中的7个T细胞相关标记物进行验证 NA NA NA NA
27303 2024-08-05
Leveraging diverse cell-death patterns to predict the prognosis, immunotherapy and drug sensitivity of clear cell renal cell carcinoma
2023-11-20, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本文提出了一种新的程序性细胞死亡相关特征(PRS)用于评估透明细胞肾癌的预后和药物敏感性 研究推出了一种结合多种细胞死亡模式的PCD模型,用于准确预测临床结果和免疫特征 NA 探讨透明细胞肾癌的预后、免疫疗法和药物敏感性 透明细胞肾癌患者和相关样本 数字病理学 肾癌 qRT-PCR, 单细胞测序 NA 基因表达数据 分析了来自E-MTAB-1980数据集和其他公共数据库的多个样本 NA NA NA NA
27304 2024-08-05
Characterizing the Macrophage Population in Patients With Idiopathic Subglottic Stenosis
2023-09, The Laryngoscope
研究论文 本研究旨在描述特发性声门下狭窄患者的巨噬细胞群体特征。 首次对特发性声门下狭窄中巨噬细胞的转录组进行表征,揭示S100A8/9作为关键生物标志物的作用。 在体内S100A8/9+巨噬细胞的作用仍需进一步研究。 研究特发性声门下狭窄中巨噬细胞的免疫特征及其相关生物标志物的纤维生成特性。 分析来自特发性声门下狭窄患者的气管活检样本以及非瘢痕组织。 数字病理学 特发性声门下狭窄 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 样本中细胞转录组数据 8个样本(4个特发性声门下狭窄瘢痕及4个匹配的非瘢痕区域) NA NA NA NA
27305 2024-08-05
Spatial Transcriptomic Analysis of a Diverse Patient Cohort Reveals a Conserved Architecture in Triple-Negative Breast Cancer
2023-01-04, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 本研究利用空间转录组学分析不同人种的三阴性乳腺癌患者的肿瘤架构 首次使用联合计数分析展示转录特征集群的非随机方向空间依赖性,支持三阴性乳腺癌中保守的空间转录结构 研究样本相对较小,且主要集中在特定人种群体上 定义三阴性乳腺癌的肿瘤架构,以便更好地理解疾病差异 来自14名患者的28个样本段的肿瘤组织 数字病理学 三阴性乳腺癌 空间转录组学 NA 空间特征数据 28个样本段,来自14名患者 NA NA NA NA
27306 2024-08-07
IER5L is a Prognostic Biomarker in Pan-Cancer Analysis and Correlates with Immune Infiltration and Immune Molecules in Non-Small Cell Lung Cancer
2023, International journal of general medicine IF:2.1Q2
研究论文 本研究探讨了IER5L在非小细胞肺癌中的预后生物标志物作用及其与免疫浸润和免疫分子的关系 首次揭示了IER5L在非小细胞肺癌中的预后价值及其与免疫浸润和免疫分子的关联 NA 研究IER5L在非小细胞肺癌中的预后作用及其与免疫浸润和免疫分子的关系 非小细胞肺癌中的IER5L表达及其与疾病进展、免疫浸润和免疫分子的关系 数字病理学 肺癌 qPCR, scRNA seq NA 基因表达数据, DNA甲基化数据, 临床信息 多个癌症数据库中的癌症样本 NA NA NA NA
27307 2024-08-07
Bioinformatics Prediction and Experimental Validation of the Role of Macrophage Polarization and Ferroptosis in Gestational Diabetes Mellitus
2023, Journal of inflammation research IF:4.2Q2
研究论文 本文通过生物信息学预测和实验验证,探讨了巨噬细胞极化和铁死亡在妊娠糖尿病中的作用 首次揭示了妊娠糖尿病中巨噬细胞极化和铁死亡在胎盘炎症中的作用,并识别了潜在的治疗靶点 研究基于回顾性队列和公开数据集,未来需在前瞻性队列中进一步验证 探究妊娠糖尿病中胎盘炎症的机制并寻找潜在的治疗靶点 妊娠糖尿病中的巨噬细胞极化和铁死亡 生物信息学 妊娠糖尿病 转录组测序分析,多重免疫荧光染色 NA 转录组数据,临床信息 多个公开数据集(GSE154414, GSE70493, GSE173193)和回顾性队列样本 NA NA NA NA
27308 2024-08-07
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Roles of Fibroblasts During Intestinal Injury and Repair in Rats with Severe Acute Pancreatitis
2023, Journal of inflammation research IF:4.2Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,探讨了严重急性胰腺炎大鼠模型中肠道损伤与修复过程中细胞异质性和组成的分子机制 发现纤维母细胞通过细胞间通讯影响肠道损伤与修复,并揭示了RNA结合蛋白在纤维母细胞功能中的潜在作用 NA 探索肠道损伤与治疗的分子机制 严重急性胰腺炎大鼠模型的肠道组织 数字病理学 胰腺炎 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 三组实验,包括健康对照组、模型组和治疗组的大鼠肠道组织样本 NA NA NA NA
27309 2024-08-07
Precursors of human CD4+ cytotoxic T lymphocytes identified by single-cell transcriptome analysis
2018-01-19, Science immunology IF:17.6Q1
研究论文 本文通过单细胞转录组分析,揭示了人类CD4+细胞毒性T淋巴细胞(CD4-CTL)的异质性、转录谱和克隆性 首次在人类中识别出CD4-CTL前体细胞群体,并探讨了其与CD4-CTL效应细胞的关系 NA 研究CD4-CTL的生物学特性及其在人类中的生成机制 人类CD4+细胞毒性T淋巴细胞及其前体细胞 免疫学 NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 超过9000个细胞 NA NA NA NA
27310 2024-08-07
Single-Cell Profiling Indicates a Proinflammatory Role of Meningeal Ectopic Lymphoid Tissue in Experimental Autoimmune Encephalomyelitis
2024-Jan, Neurology(R) neuroimmunology & neuroinflammation
研究论文 通过单细胞RNA测序技术,比较了脑膜异位淋巴组织(mELT)与次级淋巴器官(SLOs)在自发性慢性实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)中的基因表达谱,揭示了mELT在多发性硬化症进展中的关键作用 首次揭示了脑膜异位淋巴组织(mELT)在实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)中的促炎作用,并提出了mELT可能是中枢神经系统炎症的关键驱动因素 研究仅限于动物模型,尚未在人类多发性硬化症患者中验证 探究多发性硬化症进展的机制及如何预防 脑膜异位淋巴组织(mELT)与次级淋巴器官(SLOs)中的免疫细胞 数字病理学 多发性硬化症 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA NA NA NA
27311 2024-08-07
Empagliflozin targets Mfn1 and Opa1 to attenuate microglia-mediated neuroinflammation in retinal ischemia and reperfusion injury
2023-Dec-12, Journal of neuroinflammation IF:9.3Q1
研究论文 本研究评估了抗糖尿病药物恩格列净(EMPA)在视网膜缺血再灌注损伤中的治疗效果,发现其通过调节Mfn1和Opa1基因表达来减轻由小胶质细胞介导的神经炎症 本研究首次揭示了EMPA通过下调NLRP3信号通路和上调线粒体融合相关基因Mfn1和Opa1的表达,来恢复线粒体动态平衡,从而减轻视网膜缺血再灌注损伤中的神经炎症 NA 评估EMPA在视网膜缺血再灌注损伤中的治疗效果 视网膜缺血再灌注损伤中的神经炎症和线粒体功能障碍 NA 视网膜疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA 小鼠模型,体外实验使用BV2小胶质细胞 NA NA NA NA
27312 2024-08-05
SingleScan: a comprehensive resource for single-cell sequencing data processing and mining
2023-Dec-07, BMC bioinformatics IF:2.9Q1
研究论文 本研究开发了一个名为SingleScan的在线资源,以便更便捷地获取单细胞测序方法和数据处理流程的详细信息 提供了分类的单细胞转录组/基因组分析工具和流程,并总结了单细胞数据分析的典型工作流程 尚未提及特定的实验验证或工具有效性的评估 旨在为研究人员提供一个便利用于单细胞测序数据处理的资源 该资源旨在帮助没有计算经验的研究人员进入单细胞测序领域 数字病理 NA 单细胞测序 NA 文本 NA NA NA NA NA
27313 2024-08-07
The role of single-cell RNA sequencing in cardiac tumour - a case report
2023-Dec, JPMA. The Journal of the Pakistan Medical Association
病例报告 本文报告了一例65岁女性心脏肿瘤患者的病例,通过单细胞RNA测序(scRNA-seq)分析肿瘤性质 使用scRNA-seq技术分析心脏肿瘤的生长模式,有助于区分肿瘤的性质 NA 探讨单细胞RNA测序在心脏肿瘤中的应用 心脏肿瘤的细胞成分及相关的信号通路 数字病理学 心脏肿瘤 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA 一例心脏肿瘤患者 NA NA NA NA
27314 2024-08-05
Isolation, Purification, and Application of Protoplasts and Transient Expression Systems in Plants
2023-Nov-29, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
综述 本文提供了原生质体的分离、纯化及其瞬时表达系统在植物中的应用的全面概述 文章创新性地总结了原生质体在多种植物物种中的应用及其分离和瞬时表达系统的建立 文章未具体涉及不同植物物种在原生质体应用中的具体差异 旨在为植物科学社区提供关于原生质体分离和瞬时表达系统建立的有效资源 研究原生质体及其在植物中的应用 植物生物技术 NA 原生质体分离和瞬时表达系统 NA NA NA NA NA NA NA
27315 2024-08-07
Integrative Analysis of Machine Learning and Molecule Docking Simulations for Ischemic Stroke Diagnosis and Therapy
2023-Nov-22, Molecules (Basel, Switzerland)
研究论文 本研究利用加权基因共表达网络分析(WGCNA)和maSigPro R包确定与中风相关的基因模块和时间依赖性基因,结合三种机器学习算法识别中风特征基因,并构建诺模图模型评估中风患者。通过单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据分析中风中的小胶质细胞亚群,利用RNA速度、伪时间和基因集富集分析(GSEA)研究小胶质细胞亚群的关系,并通过连接图(CMap)分析和分子对接筛选中风的治疗药物。 本研究首次结合机器学习算法和分子对接模拟,构建了用于中风诊断的诺模图模型,并筛选出潜在的治疗分子AZ_628。 NA 研究中风的诊断和治疗方法 中风及其相关基因和小胶质细胞亚群 机器学习 中风 加权基因共表达网络分析(WGCNA)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、分子对接 诺模图模型 基因数据、单细胞RNA测序数据 NA NA NA NA NA
27316 2024-08-07
Mapping and Validation of scRNA-Seq-Derived Cell-Cell Communication Networks in the Tumor Microenvironment
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 本文综述了利用单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术推断细胞间通信网络的方法,并讨论了这些方法如何促进肿瘤微环境(TME)中免疫治疗干预的研究 介绍了将scRNA-seq衍生的交互网络与现有实验和计算方法整合的策略,以增强对TME中免疫抑制和免疫治疗改变信号的研究 验证假设的细胞间交互作用仍是一个中心挑战 探讨scRNA-seq技术在肿瘤微环境中细胞间通信网络的推断及其在免疫治疗中的应用 单细胞RNA测序技术及其在肿瘤微环境中细胞间通信的推断 生物信息学 癌症 scRNA-seq NA 转录组 NA NA NA NA NA
27317 2024-08-05
Glycolysis regulation in tumor-associated macrophages: Its role in tumor development and cancer treatment
2024-Feb-01, International journal of cancer IF:5.7Q1
研究论文 本文回顾了肿瘤相关巨噬细胞中糖代谢的现状,并总结了不同亚型的代谢特征 从单细胞组学的角度对肿瘤相关巨噬细胞的代谢特征进行了综合总结,探讨了糖酵解在肿瘤发展及治疗中的作用 对肿瘤相关巨噬细胞代谢特征的总结还不够全面,尚未深入探讨糖流对肿瘤进展的具体影响 研究肿瘤相关巨噬细胞中的糖代谢对肿瘤发展及癌症治疗的影响 肿瘤相关巨噬细胞及其不同亚型 数字病理学 NA 单细胞测序 NA NA NA NA NA NA NA
27318 2024-08-07
Targeted single-cell RNA sequencing analysis reveals metabolic reprogramming and the ferroptosis-resistant state in hematologic malignancies
2023-Dec, Cell biochemistry and function IF:2.8Q3
研究论文 本研究通过结合单细胞RNA测序(scRNA-seq)与靶向致癌基因面板,对急性髓系白血病进行转录组测序,揭示了血液恶性肿瘤中的代谢重编程和铁死亡抵抗状态 本研究克服了scRNA-seq在检测致癌突变方面的局限性,通过靶向方法识别了骨髓样本中每种细胞类型的致癌IDH1、IDH2和KRAS突变分布 NA 探讨血液恶性肿瘤中的代谢重编程和铁死亡抵抗状态的机制 急性髓系白血病患者的骨髓细胞 数字病理学 血液恶性肿瘤 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 转录组数据 多个患者的骨髓样本 NA NA NA NA
27319 2024-08-07
Integrated single cell transcriptome sequencing analysis reveals species-specific genes and molecular pathways for pig spermiogenesis
2023-Dec, Reproduction in domestic animals = Zuchthygiene
研究论文 本文通过综合睾丸单细胞RNA测序分析,比较了人类和猪的精子发生过程,特别是精子形成阶段,揭示了物种特异性的基因和分子通路 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了猪和人类的精子形成过程,识别了特定类型的精子细胞的标记基因和分子通路 NA 研究人类和猪的精子形成过程中特异性的基因和分子通路 人类和猪的精子形成过程 分子生物学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA序列 人类和猪的睾丸细胞被分为26个不同的组 NA NA NA NA
27320 2024-08-07
Distinct mononuclear diploid cardiac subpopulation with minimal cell-cell communications persists in embryonic and adult mammalian heart
2023-Oct, Frontiers of medicine IF:3.9Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了胚胎和成年哺乳动物心脏中的单核二倍体心肌细胞(MNDCMs)的异质性及其在发育过程中的变化 揭示了一种新的非增殖性MNDCM亚群,该亚群具有最小的细胞间通讯,并强调了微环境对心肌细胞成熟过程中命运的重要性 NA 阐明单核二倍体心肌细胞的异质性及其在心脏发育过程中的变化 胚胎和成年哺乳动物心脏中的单核二倍体心肌细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 12645个心脏细胞 NA NA NA NA
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