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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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2701 | 2025-10-06 |
Deciphering antigen-specific T cell navigation tactics and cancer immune evasion in co-cultures
2025-Jul-31, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08568-w
PMID:40745217
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研究论文 | 本研究通过共培养系统揭示了抗原特异性T细胞的导航策略和癌细胞免疫逃逸机制 | 首次系统研究了共培养后T细胞运动行为的演变,揭示了T细胞方向持久性增强和与癌细胞形成持久相互作用的新机制 | 研究基于2.5D共培养系统,可能与体内真实微环境存在差异 | 阐明T细胞在肿瘤微环境中的导航策略和癌细胞免疫逃逸机制 | 抗原特异性T细胞和癌细胞 | 癌症免疫学 | 癌症 | 定量细胞轨迹分析,计算建模,RNA测序 | 计算模型 | 细胞轨迹数据,基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
2702 | 2025-10-06 |
Single-cell map of the healthy human immune system across the lifespan reveals unique infant immune signatures
2025-Jul-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.28.667181
PMID:40766403
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研究论文 | 通过单细胞技术绘制健康人类免疫系统在整个生命周期中的变化图谱,揭示婴儿期独特的免疫特征 | 首次在生命周期尺度上结合单细胞转录组和染色质可及性分析,系统揭示婴儿免疫系统的独特组成和SOX4+ naïve T细胞群的特征 | 样本量相对有限(95人),仅分析外周血单个核细胞,未涉及组织驻留免疫细胞 | 阐明人类免疫系统从婴儿期到老年期的连续重塑过程 | 95名健康个体(2个月至88岁)的外周血单个核细胞,包括婴儿、儿童、成人和老年人 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞核ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据, 表观基因组数据 | 95名健康个体(婴儿27人, 儿童23人, 成人18人, 老年人27人) | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
2703 | 2025-10-06 |
Maternal opioid use with and without hepatitis C infection disrupts the structure and immune landscape of the maternal-fetal interface
2025-Jul-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.30.667651
PMID:40766448
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研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示母体阿片类药物使用障碍对胎盘结构和免疫环境的破坏作用 | 首次结合空间转录组学和单细胞转录组学系统分析OUD对母胎界面的影响,并考虑HCV感染的协同作用 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证发现 | 探究母体阿片类药物使用障碍对胎盘组织结构和免疫功能的影响 | 胎盘组织及母胎界面细胞 | 空间生物学 | 成瘾性疾病与肝炎 | 流式细胞术,组织学,空间转录组学,单细胞转录组学,CellChat分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据,流式细胞数据,组织学图像 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
2704 | 2025-10-06 |
A Novel 14-Gene Panel Associated With Efferocytosis for Predicting Pancreatic Cancer Prognosis Through Bulk and Single-Cell Databases
2025-Jul-30, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/FBL40818
PMID:40765357
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据,识别了一个与胞葬作用相关的14基因预后特征面板,用于预测胰腺癌预后 | 首次构建了基于胞葬作用的14基因预后特征面板,并通过深度学习建立了ER风险评分系统 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证相对有限,需要进一步的功能研究确认机制 | 探索胞葬作用在胰腺导管腺癌进展中的作用,并建立预后预测模型 | 胰腺导管腺癌(PDAC)患者样本和肿瘤微环境中的细胞 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序, 免疫组织化学, 细胞周期分析, 多重免疫荧光染色 | LASSO回归, 随机生存森林, 深度学习 | 基因表达数据, 临床生存数据 | 来自TCGA和GEO数据库的多个数据集,包含167个ER特征 | NA | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序 | NA | NA |
2705 | 2025-10-06 |
Targeting FGFR4 abrogates HNF1A-driven metastasis in pancreatic ductal adenocarcinoma
2025-Jul-29, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02408-5
PMID:40731412
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研究论文 | 本研究揭示了HNF1A通过上调FGFR4驱动胰腺导管腺癌转移的机制,并证明FGFR4抑制剂可有效阻断该转移过程 | 首次发现HNF1A通过调控FGFR4促进PDAC转移,并验证了FGFR4抑制剂在阻断转移中的治疗潜力 | 研究主要基于细胞系和动物模型,临床转化效果需进一步验证 | 探究HNF1A在胰腺导管腺癌转移中的作用机制并寻找靶向治疗策略 | 胰腺导管腺癌细胞系、患者来源的PDAC细胞、小鼠移植瘤模型 | 癌症生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 组织芯片分析, UMAP空间分析, RNA干扰, 药物抑制实验 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据, 免疫组化数据 | ATCC细胞系、患者来源细胞及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
2706 | 2025-10-06 |
Evaluating Integrative Strategies for Incorporating Phenotypic Features in Spatial Transcriptomics
2025-Jul-29, ArXiv
PMID:40766882
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研究论文 | 本研究评估了在空间转录组学中整合表型特征的策略,特别关注在现实实验约束条件下的多模态数据整合方法 | 使用最小调参的变分自编码器从细胞图像中提取信息丰富的低维表示,并与转录计数进行整合,展示了在受限条件下学习表示优于手工特征的优势 | 研究基于公开的小鼠回肠MERFISH数据集,数据集规模有限且存在类别不平衡问题,使用基于边界框的分割方法 | 评估在空间转录组学中整合表型特征和成像模态的最佳策略 | 小鼠回肠组织细胞 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学,成像分析 | 变分自编码器(VAE),岭回归模型 | 空间转录组数据,细胞图像数据(核染色,膜染色) | 公开可用的MERFISH小鼠回肠数据集 | NA | 空间转录组学,MERFISH | NA | NA |
2707 | 2025-10-06 |
Single-cell antigen receptor sequencing in pigs with influenza
2025-Jul-26, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08507-9
PMID:40715353
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研究论文 | 本研究开发了猪特异性T细胞和B细胞受体富集引物,利用单细胞测序技术分析流感感染猪的免疫受体库 | 开发了与10x Genomics VDJ测序协议兼容的猪特异性TCR和BCR富集引物,首次在猪模型中实现高通量单细胞免疫受体测序 | 研究样本量有限,仅针对特定基因型猪和流感感染模型 | 研究自然杀伤T细胞对肺T细胞和B细胞受体库的影响,追踪流感感染后克隆扩增 | CD1D表达和CD1D缺陷猪的肺细胞及肺液T细胞 | 免疫学 | 流感 | 单细胞RNA测序, VDJ测序 | NA | 单细胞测序数据 | CD1D表达和CD1D缺陷猪的肺细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, VDJ测序 | 10x Chromium | 10x Genomics VDJ测序协议 |
2708 | 2025-10-06 |
Identification and Mechanistic Studies of Key Genes in Thalamic Hemorrhage Pain by Multi-omics
2025-Jul-25, Journal of integrative neuroscience
IF:2.5Q3
DOI:10.31083/JIN38130
PMID:40767016
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研究论文 | 通过多组学方法识别丘脑出血疼痛的关键基因并研究其机制 | 首次采用整合多组学方法(转录组学、蛋白质组学、代谢组学、核糖体分析和单细胞RNA测序)系统研究丘脑出血疼痛的分子机制 | 研究仅使用小鼠模型,尚未在人类患者中验证 | 阐明丘脑出血疼痛发病机制中的关键基因 | 丘脑出血疼痛小鼠模型 | 多组学分析 | 丘脑出血疼痛 | 转录组学, 蛋白质组学, 代谢组学, 核糖体分析, 单细胞RNA测序 | 小鼠疾病模型 | 多组学数据 | THP组和对照组小鼠 | NA | 单细胞RNA测序, 多组学分析 | NA | NA |
2709 | 2025-10-06 |
Rs61731397-C in OR2A25 increases the risk of chronic rhinosinusitis in the Chinese population
2025-Jul-14, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2025.06.032
PMID:40669566
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研究论文 | 本研究通过全基因组关联分析发现OR2A25基因中的rs61731397-C变异会增加中国人群慢性鼻窦炎的发病风险 | 首次在中国人群中鉴定出OR2A25基因变异与慢性鼻窦炎的关联,并通过功能实验证实该变异通过降低蛋白质稳定性影响基因表达 | 研究主要聚焦于中国人群,结果在其他人群中的普适性需要进一步验证 | 识别中国人群慢性鼻窦炎的遗传风险变异并阐明其作用机制 | 中国人群(昆山队列和北京队列) | 遗传学 | 慢性鼻窦炎 | 全基因组关联分析, 单细胞RNA测序, 蛋白质结构预测, 体外表达研究, Western blot分析 | NA | 基因组数据, 单细胞RNA测序数据, 蛋白质表达数据 | 两个独立队列(昆山基于人群队列和北京基于临床队列) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2710 | 2025-10-06 |
KMT2D Regulates Tooth Enamel Development
2025-Jul, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345251320922
PMID:40103013
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研究论文 | 本研究通过构建KMT2D条件性敲除小鼠模型,揭示了KMT2D在牙釉质发育中的关键调控作用 | 首次系统阐明KMT2D通过直接激活成釉细胞分化关键基因调控牙釉质发育的分子机制 | 研究仅使用小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 | 探究KMT2D基因在牙釉质发育过程中的具体功能机制 | KMT2D条件性敲除小鼠模型及其牙釉质组织 | 发育生物学 | 牙釉质发育不全 | 条件性基因敲除, micro-CT, 扫描电镜, RNA测序, CUT&RUN测序, 单细胞RNA测序 | 条件性敲除小鼠模型 | 影像数据, 转录组数据, 表观遗传数据 | KMT2D条件性敲除小鼠及对照小鼠 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 表观遗传测序 | NA | NA |
2711 | 2025-10-06 |
Mechanism and Efficacy of Etanercept in Treating Autoimmune-like Manifestations of Coronavirus Disease 2019 in elderly individuals
2025-05, Immunobiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.imbio.2025.152898
PMID:40168796
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研究论文 | 评估依那西普治疗老年COVID-19患者自身免疫样表现的作用机制和疗效 | 首次通过单细胞测序揭示老年COVID-19患者的自身免疫样表现,并发现依那西普通过抑制PF4和TNF-α发挥治疗作用 | 基于同情使用病例的观察性分析,样本量有限(仅7名治疗患者) | 评估TNF抑制剂依那西普在老年COVID-19患者中的治疗效果 | 老年COVID-19患者(特别是有自身免疫样表现者) | 医学研究 | COVID-19 | 单细胞测序,转录组分析,分子对接 | 观察性分析 | 临床指标数据,单细胞测序数据 | 7名依那西普治疗患者+2名未感染个体,共40万个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2712 | 2025-10-06 |
Novel diagnostic biomarkers regulating macrophages autophagy in ischemic cardiomyopathy: An analysis integrating bulk RNA sequencing with single-cell RNA sequencing
2025-05, Immunobiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.imbio.2025.152907
PMID:40300424
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研究论文 | 本研究通过整合bulk RNA测序和单细胞RNA测序分析,探索缺血性心肌病中巨噬细胞自噬相关的诊断生物标志物 | 首次整合bulk RNA测序和单细胞RNA测序技术,系统识别缺血性心肌病中巨噬细胞自噬相关的诊断生物标志物 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证仅限于大鼠模型,需要进一步临床验证 | 探索缺血性心肌病中巨噬细胞自噬相关的诊断生物标志物及其作用机制 | 缺血性心肌病患者组织样本和大鼠模型 | 生物信息学 | 心血管疾病 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, RT-qPCR, WGCNA分析 | PPI网络分析, WGCNA | 基因表达数据 | 使用GSE46224和GSE116250数据集,并在大鼠模型中验证 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
2713 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA and TCR repertoire analysis identify markers of virus-specific T cells
2025-05, Immunobiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.imbio.2025.152904
PMID:40305898
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研究论文 | 通过单细胞RNA和TCR谱分析识别病毒特异性T细胞的标志物 | 发现7个上调基因可作为早期识别增殖性抗原特异性T细胞的标志物,准确率达93.52% | 样本仅来自健康供体,未在患者群体中验证 | 鉴定用于识别抗原特异性T细胞的生物标志物 | 健康供体的外周血单个核细胞和CD3/CD8 T细胞 | 单细胞分析 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序, TCR谱分析, CFSE染色 | NA | 单细胞RNA测序数据, TCR序列数据 | 健康供体外周血单个核细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2714 | 2025-10-06 |
Interpretable Machine Learning reveals the Role of PANoptosis in the Diagnosis and Subtyping of NAFLD
2025-05, Immunobiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.imbio.2025.152909
PMID:40311345
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研究论文 | 本研究通过可解释机器学习揭示了PANoptosis在NAFLD诊断、分型及免疫微环境重塑中的关键作用 | 首次整合多组学数据和可解释机器学习方法,系统解析PANoptosis在NAFLD中的作用机制,并识别出9个枢纽基因和潜在治疗药物 | NA | 探究PANoptosis在非酒精性脂肪肝病诊断、分型和免疫微环境重塑中的作用 | 非酒精性脂肪肝病患者 | 机器学习 | 非酒精性脂肪肝病 | 单细胞测序,分子对接,pan-cancer分析 | 可解释机器学习,无监督共识聚类 | 基因表达数据,单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2715 | 2025-10-06 |
Epitope Tagging with Genome Editing in Mice Reveals That the Proton Channel OTOP1 Is Apically Localized and Not Restricted to Type III "Sour" Taste Receptor Cells
2025-Feb-05, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.1560-24.2024
PMID:39592233
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研究论文 | 通过基因编辑在小鼠中标记OTOP1蛋白,揭示其在味觉细胞中的顶端定位和细胞类型分布 | 首次通过内源性蛋白标记技术证明OTOP1质子通道严格定位于味觉细胞顶端,且不局限于III型味觉受体细胞 | 研究仅限于小鼠模型,人类中的定位可能有所不同 | 探究OTOP1质子通道在味觉系统中的细胞和亚细胞定位 | HA-OTOP1基因编辑小鼠的味觉细胞 | 神经科学 | NA | 基因组编辑、高分辨率成像、免疫组织化学、单细胞RNA测序 | NA | 图像、基因表达数据 | 雄性和雌性HA-OTOP1小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2716 | 2025-10-06 |
Brain aging and rejuvenation at single-cell resolution
2025-Jan-08, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2024.12.007
PMID:39788089
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综述 | 本文综述了单细胞组学技术在脑衰老和年轻化研究中的应用与发现 | 首次从单细胞分辨率系统梳理脑衰老的细胞类型特异性变化和年轻化干预策略 | 主要基于现有研究综述,缺乏原始实验数据验证 | 探讨脑衰老的细胞机制和年轻化干预策略 | 大脑细胞 | 单细胞组学 | 神经退行性疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞组学数据 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
2717 | 2025-10-06 |
Resolving Resident Colonic Muscularis Macrophage Diversity and Plasticity During Colitis
2025-01-06, Inflammatory bowel diseases
IF:4.5Q1
DOI:10.1093/ibd/izae155
PMID:39102823
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序解析了结肠炎期间结肠肌层巨噬细胞的多样性和可塑性 | 首次在单细胞水平揭示了结肠肌层巨噬细胞在生理和结肠炎状态下的转录组特征,发现Lyve1+巨噬细胞亚群在结肠炎期间消失而Cx3cr1+巨噬细胞保留并表现炎症可塑性 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限 | 解析结肠炎期间肠道肌层免疫细胞群的异质性和动态变化 | 结肠肌层巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学,流式细胞术,细胞谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据,流式数据 | 正常结肠和葡聚糖硫酸钠诱导的结肠炎模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
2718 | 2025-10-06 |
FlyRNAi.org 2025 update-expanded resources for new technologies and species
2025-Jan-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae917
PMID:39435987
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研究论文 | 介绍FlyRNAi数据库2025年更新,扩展了支持新技术和物种的资源 | 新增单细胞转录组学数据挖掘分析资源,将CRISPR试剂和基因中心生物信息学方法应用于传染病节肢动物载体 | NA | 支持功能基因组学研究,促进生物和生物医学理解 | 果蝇、节肢动物载体、常见遗传模型物种、人类生物学 | 生物信息学 | 传染病 | RNAi筛选、CRISPR、单细胞转录组学 | NA | 组学数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
2719 | 2025-10-06 |
Construction of a New Ferroptosis-related Prognosis Model for Survival Prediction in Colorectal Cancer
2025, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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研究论文 | 本研究构建了一个基于11个铁死亡相关基因的预后模型,用于结直肠癌患者的生存预测 | 首次结合单细胞RNA测序和转录组数据分析铁死亡相关基因在结直肠癌中的预后价值,并开发了11基因特征模型 | 研究依赖于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 开发结直肠癌的铁死亡相关基因预后特征并探索其分子功能 | 结直肠癌患者样本 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 转录组测序, ssGSEA, WGCNA, Cox回归分析 | 预后预测模型, 列线图 | 基因表达数据, 临床数据 | 来自GSE161277、GSE17537和TCGA-CRC数据库的结直肠癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
2720 | 2025-10-06 |
Role of pericytes in regulating penile angiogenesis and nerve regeneration
2025-01-01, Asian journal of andrology
IF:3.0Q1
DOI:10.4103/aja202455
PMID:39162179
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综述 | 本文综述了周细胞在阴茎血管生成和神经再生中的作用及其与勃起功能障碍的关系 | 首次系统分析周细胞在糖尿病性和神经性勃起功能障碍中的具体作用机制 | 主要基于文献综述,缺乏原始实验数据验证 | 分析周细胞在勃起功能障碍中的具体作用机制 | 周细胞在阴茎组织中的功能 | 病理生理学 | 勃起功能障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 文献数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |