单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27241 篇文献，本页显示第 27161 - 27180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 27161 | 2024-08-09 |
Clonal architecture of secondary acute myeloid leukemia defined by single-cell sequencing
2014-Jul, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1004462
PMID:25010716
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研究论文 | 本文通过单细胞测序技术验证了次级急性髓系白血病的克隆结构 | 本文通过单细胞突变分析，解决了最初不明确的单核苷酸变异的克隆归属，并发现了之前未被重视的复杂区域 | NA | 验证通过深度测序未分选材料分析肿瘤克隆性的关键假设 | 次级急性髓系白血病患者 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 3名患者 |
| 27162 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq highlights intratumoral heterogeneity in primary glioblastoma
2014-Jun-20, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.1254257
PMID:24925914
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了五例原发性胶质母细胞瘤中的430个细胞，揭示了肿瘤内异质性及其对疾病生物学、预后和治疗的影响 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描绘了胶质母细胞瘤内部的多重调控程序异质性，并揭示了其对疾病预后的潜在影响 | NA | 揭示胶质母细胞瘤内部的异质性及其对疾病生物学、预后和治疗的影响 | 原发性胶质母细胞瘤中的细胞 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 430个细胞，来自五例原发性胶质母细胞瘤 |
| 27163 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq reveals dynamic paracrine control of cellular variation
2014-Jun-19, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/nature13437
PMID:24919153
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了小鼠骨髓来源的树突状细胞在不同实验条件下的基因表达变异 | 揭示了细胞间旁分泌信号在控制细胞异质性中的重要作用，并展示了多细胞群体建立复杂动态响应的一般策略 | NA | 探索单细胞水平上基因表达变异的本质及其功能 | 小鼠骨髓来源的树突状细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 超过1,700个单细胞样本 |
| 27164 | 2024-08-09 |
ExSPAnder: a universal repeat resolver for DNA fragment assembly
2014-Jun-15, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btu266
PMID:24931996
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为ExSPAnder的算法，用于在标准和单细胞测序项目中准确解析重复序列 | ExSPAnder算法能够有效利用来自单个或多个读对库的信息，解决了传统组装器在处理单细胞项目时假设均匀读覆盖的问题 | NA | 开发一种能够在单细胞测序项目中准确解析重复序列的算法 | 下一代测序技术中的重复序列解析问题 | 生物信息学 | NA | NGS | NA | DNA序列 | NA |
| 27165 | 2024-08-09 |
EGFR variant heterogeneity in glioblastoma resolved through single-nucleus sequencing
2014-Aug, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-13-0879
PMID:24893890
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研究论文 | 本文通过单核全基因组测序技术研究了EGFR扩增的胶质母细胞瘤中的基因组异质性 | 开发了一种新的单细胞测序方法，能够从存档的冷冻临床标本中识别独特的、非重叠的亚克隆改变 | NA | 研究EGFR扩增的胶质母细胞瘤中的基因组异质性及其对治疗抵抗的影响 | EGFR扩增的胶质母细胞瘤 | 数字病理学 | 脑瘤 | 单细胞全基因组测序 | NA | 基因组数据 | 约50%的新诊断病例 |
| 27166 | 2024-08-09 |
CD8+ TCR transgenic strains expressing public versus private TCR targeting the respiratory syncytial virus K(d)M2(82-90) epitope demonstrate similar functional profiles
2014, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0099249
PMID:24897427
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研究论文 | 本文通过单细胞测序选择T细胞受体序列，生成针对呼吸道合胞病毒K(d)M2(82-90)表位的公共和私有T细胞受体转基因小鼠，并评估这些转基因小鼠的CD8+ T细胞的增殖、细胞因子和细胞溶解活性 | 本文生成了新的、特征明确的转基因小鼠品系，为研究CD8+ T细胞反应的分子机制提供了新的机会 | NA | 研究CD8+ T细胞反应的分子机制 | 针对呼吸道合胞病毒K(d)M2(82-90)表位的公共和私有T细胞受体转基因小鼠的CD8+ T细胞功能 | NA | 呼吸道疾病 | 单细胞测序 | T细胞受体转基因小鼠 | 细胞 | TRBV13-1（私有）和TRBV13-2（公共）TCR转基因小鼠的细胞 |
| 27167 | 2024-08-09 |
Deciphering developmental processes from single-cell transcriptomes
2014-May-12, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2014.04.032
PMID:24823374
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术研究了小鼠肺部发育过程中的肺泡形成 | 首次应用单细胞RNA测序技术解析小鼠肺部发育中肺泡的胚胎起源 | NA | 探讨肺泡在肺部发育过程中的胚胎起源 | 小鼠肺部的发育过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 27168 | 2024-08-09 |
Methods, Challenges and Potentials of Single Cell RNA-seq
2012-Nov-16, Biology
DOI:10.3390/biology1030658
PMID:24832513
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）的当前进展，讨论了实验协议、挑战和潜力 | 单细胞RNA测序技术使得对细胞分化、细胞间变异和基因调控的深入生物学洞察成为可能 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在转录组学中的应用及其带来的新生物学见解 | 单细胞RNA测序技术及其在细胞分化、细胞间变异和基因调控中的应用 | 转录组学 | NA | RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 27169 | 2024-08-09 |
Behavioral abnormalities and circuit defects in the basal ganglia of a mouse model of 16p11.2 deletion syndrome
2014-May-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2014.03.036
PMID:24794428
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研究论文 | 研究通过删除小鼠同源区域，揭示了16p11.2缺失综合征小鼠模型基底神经节的电路缺陷和行为异常 | 首次揭示了16p11.2缺失对基底神经节电路功能的影响，并通过行为实验验证了这些缺陷 | NA | 探讨16p11.2缺失综合征的神经生理机制及其与自闭症谱系障碍的关系 | 16p11.2缺失综合征小鼠模型的基底神经节和行为表现 | NA | 自闭症谱系障碍 | MRI和高通量单细胞转录组学 | NA | 图像和转录组数据 | 幼年突变小鼠（16p11(+/-)） |
| 27170 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing reveals T helper cells synthesizing steroids de novo to contribute to immune homeostasis
2014-May-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2014.04.011
PMID:24813893
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和定量PCR分析，揭示了T辅助2细胞（Th2细胞）在体内外产生孕烯醇酮，并探讨了其在免疫抑制中的作用 | 首次报道了Th2细胞能够从头合成孕烯醇酮，并提出孕烯醇酮作为“淋巴类固醇”的概念 | NA | 探讨Th2细胞合成孕烯醇酮的机制及其在免疫调节中的作用 | T辅助2细胞（Th2细胞）及其合成的孕烯醇酮 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序，定量PCR | NA | RNA | NA |
| 27171 | 2024-08-09 |
How to infer relative fitness from a sample of genomic sequences
2014-Jul, Genetics
IF:3.3Q2
DOI:10.1534/genetics.113.160986
PMID:24770330
|
研究论文 | 本文展示了通过分析从适应性多样但无结构的无性群体中随机抽取的中等数量基因组样本的重构谱系树形状，来预测样本内个体相对适应性的方法 | 提出了一种启发式算法，通过识别重构树中快速合并的谱系来推断适应性排序，并验证了其与实际适应性的强相关性 | 推断准确性随样本大小单调增加，但样本量达到200时性能接近饱和 | 开发一种方法来推断从单细胞测序肿瘤和监测病毒爆发中获得的基因组的相对适应性 | 基因组序列的相对适应性 | NA | NA | 单细胞测序 | 线性判别器 | 基因组序列 | 中等数量（约200） |
| 27172 | 2024-08-09 |
Microfluidic single-cell whole-transcriptome sequencing
2014-May-13, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1402030111
PMID:24782542
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研究论文 | 本文介绍了一种在微流控平台上进行的单细胞全转录组测序技术，该技术提高了mRNA检测的灵敏度和测量精度 | 将单细胞RNA-Seq技术与微流控平台结合，提高了检测灵敏度和实验通量 | NA | 验证微流控技术在单细胞全转录组分析中的优势 | 单个小鼠胚胎细胞的转录组 | 数字病理学 | NA | RNA-Seq | NA | 文本 | 94个单细胞文库 |
| 27173 | 2024-08-09 |
Validation of noise models for single-cell transcriptomics
2014-Jun, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/nmeth.2930
PMID:24747814
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研究论文 | 本文通过单分子荧光原位杂交技术验证了用于校正单细胞转录组学中技术变异性的噪声模型 | 提出了用于校正单细胞转录组学中采样噪声和全局细胞间测序效率变异的噪声模型 | NA | 验证噪声模型在单细胞转录组学中的应用 | 单细胞转录组学中的技术变异性 | 单细胞转录组学 | NA | 单分子荧光原位杂交 | 噪声模型 | 基因表达数据 | 小鼠胚胎干细胞 |
| 27174 | 2024-08-09 |
Reconstructing lineage hierarchies of the distal lung epithelium using single-cell RNA-seq
2014-May-15, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/nature13173
PMID:24739965
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，重建了小鼠远端肺上皮细胞的分化谱系层次结构 | 采用微流控单细胞RNA测序技术，避免了传统转录组分析中的集合平均效应，能够直接测量发育中的肺内各种细胞类型及其层次结构 | NA | 揭示控制肺祖细胞沿不同谱系分化为成熟肺泡细胞类型的机制 | 小鼠远端肺上皮细胞的分化谱系 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 198个单细胞 |
| 27175 | 2024-08-09 |
The dynamics and regulators of cell fate decisions are revealed by pseudotemporal ordering of single cells
2014-Apr, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/nbt.2859
PMID:24658644
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Monocle的无监督算法，该算法利用单细胞RNA-Seq数据提高转录组动态的时间分辨率 | Monocle算法能够揭示细胞分化过程中的开关样表达变化、连续的基因调控波以及未知的调控因子 | NA | 定义细胞分化等时间过程的转录动力学 | 单细胞RNA-Seq数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 无监督算法 | 转录组数据 | 多个时间点的单细胞RNA-Seq数据 |
| 27176 | 2024-08-09 |
Massively parallel single-cell RNA-seq for marker-free decomposition of tissues into cell types
2014-Feb-14, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.1247651
PMID:24531970
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研究论文 | 本文介绍了一种自动化的大规模并行单细胞RNA测序方法，用于分析数千个单细胞在体内的转录状态，并结合无监督分类算法，对脾脏组织的细胞类型进行从头鉴定。 | 本文创新性地使用大规模并行单细胞RNA测序技术，结合无监督分类算法，实现了对复杂组织中细胞类型的全面分解。 | NA | 研究目的是开发一种新的方法，用于解析多细胞生物中由异质细胞类型组成的复杂器官的细胞组成。 | 研究对象包括脾脏组织中的树突状细胞和其他造血细胞类型。 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 无监督分类算法 | 转录组数据 | 数千个单细胞 |
| 27177 | 2024-08-09 |
Single-cell sequencing
2014-Jan, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/nmeth.2771
PMID:24524131
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 27178 | 2024-08-09 |
Entering the era of single-cell transcriptomics in biology and medicine
2014-Jan, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/nmeth.2764
PMID:24524133
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 27179 | 2024-08-09 |
The promise of single-cell sequencing
2014-Jan, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/nmeth.2769
PMID:24524134
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 27180 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq reveals dynamic, random monoallelic gene expression in mammalian cells
2014-Jan-10, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.1245316
PMID:24408435
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research paper | 本文通过单细胞RNA测序技术，揭示了哺乳动物细胞中动态且随机的单等位基因表达现象 | 首次在单细胞水平上进行全基因组范围内的等位基因表达分析，发现了大量的单等位基因表达现象，并揭示了其随机性和动态性 | NA | 研究哺乳动物细胞中单等位基因表达的动态性和随机性 | 小鼠着床前胚胎的单细胞 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 混合背景的小鼠着床前胚胎细胞 |