单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 37957 篇文献，本页显示第 27081 - 27100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 27081 | 2024-08-07 |
Single-cell analysis of a mutant library generated using CRISPR-guided deaminase in human melanoma cells
2020-Apr-02, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-020-0888-2
PMID:32242071
|
研究论文 | 本文开发了一种结合CRISPR RNA引导的脱氨酶和单细胞RNA测序技术的新平台，用于在多个基因中引入突变并评估突变相关信号 | 本文首次将CRISPR RNA引导的脱氨酶与单细胞RNA测序技术结合，用于评估替代突变 | 目前该平台仅在人黑色素瘤细胞系中进行了测试，尚未应用于其他细胞类型或疾病 | 开发一种新的平台，用于在多个基因中引入突变并评估突变相关信号 | 人黑色素瘤细胞系 | 基因编辑 | 黑色素瘤 | CRISPR-guided deaminase, scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 420个sgRNAs | NA | NA | NA | NA |
| 27082 | 2024-08-07 |
Model-based understanding of single-cell CRISPR screening
2019-May-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-10216-x
PMID:31110232
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研究论文 | 本文介绍了MUSIC，一个集成管道，用于基于模型的单细胞CRISPR筛选数据理解 | MUSIC能够准确量化和优先处理单细胞CRISPR筛选数据中的个体基因扰动效应，并能容忍数据分析中存在的显著噪声 | NA | 开发一个集成管道，以基于模型的方法分析单细胞CRISPR筛选数据，从而阐明扰动功能和生物电路 | 单细胞CRISPR筛选数据 | 生物信息学 | NA | CRISPR筛选, 单细胞RNA测序 | 集成管道 | 单细胞数据 | 使用所有公开可用的数据进行综合测试 | NA | NA | NA | NA |
| 27083 | 2024-08-07 |
Single-Cell RNA-Sequencing-Based CRISPRi Screening Resolves Molecular Drivers of Early Human Endoderm Development
2019-Apr-16, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2019.03.076
PMID:30995470
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研究论文 | 本文通过结合单细胞RNA测序和CRISPRi筛选技术，解析了人类内胚层早期发育的分子驱动因素 | 首次将单细胞RNA测序与CRISPRi筛选相结合，全面定义了内胚层发育中基因功能丧失的表型 | NA | 研究人类内胚层发育的分子基础 | 人类胚胎干细胞向内胚层的分化过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, CRISPRi | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 27084 | 2024-08-07 |
CRISPR Screening in Single Cells
2019, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-4939-9240-9_23
PMID:31028650
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研究论文 | 本文描述了在单细胞水平上使用CRISPR筛选技术的当前协议 | 结合单细胞RNA测序和CRISPR技术，可以高效地研究任意数量的基因 | 研究受限于测序能力 | 探索在单细胞水平上使用CRISPR筛选技术的方法 | 单细胞中的基因 | 基因编辑 | NA | CRISPR, 单细胞RNA测序 | NA | 测序数据 | 任意数量的基因，受限于测序能力 | NA | NA | NA | NA |
| 27085 | 2024-08-07 |
Large-scale reconstruction of cell lineages using single-cell readout of transcriptomes and CRISPR-Cas9 barcodes by scGESTALT
2018-Nov, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-018-0058-x
PMID:30353175
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scGESTALT的方法，该方法结合CRISPR-Cas9的累积编辑和基于液滴的单细胞RNA测序，用于大规模重建细胞系谱关系。 | scGESTALT技术通过在多个时间点使用Cas9和单导向RNA（sgRNAs）进行编辑，生成条形码阵列的编辑，从而与类似的Cas9系谱追踪方法区分开来。 | 生成转基因线需要6个月，进行条形码编辑和生成单细胞文库需要7天的手动操作时间。 | 提供一个可扩展的平台，用于在任何允许发育、再生或疾病期间进行基因组编辑的系统中映射细胞类型之间的系谱关系。 | 重建发育过程中产生的大量异质细胞类型的系谱关系。 | 基因组学 | NA | CRISPR-Cas9, 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 数千个细胞转录组和记录的系谱 | NA | NA | NA | NA |
| 27086 | 2024-08-07 |
On the design of CRISPR-based single-cell molecular screens
2018-Apr, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/nmeth.4604
PMID:29457792
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研究论文 | 本文探讨了基于CRISPR的单细胞分子筛选设计，特别是优化了CROP-seq方法，提高了引导RNA分配给细胞的效率 | 提出了CROP-seq方法的优化，使得引导RNA分配给细胞的效率提高到94% | NA | 优化基于CRISPR的单细胞分子筛选设计 | CRISPR引导RNA与单细胞RNA测序的结合 | NA | NA | CRISPR, 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 27087 | 2024-08-05 |
Integrative analysis reveals chemokines CCL2 and CXCL5 mediated shear stress-induced aortic dissection formation
2024-Jan-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2023.e23312
PMID:38163105
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研究论文 | 本研究通过定量生物信息学分析探讨了与剪切应力相关的主动脉夹层形成中的关键分子 | 通过整合分析确定了与剪切应力相关的核心AD差异基因及其潜在治疗剂 | 本研究未能完全阐明剪切应力对主动脉夹层的所有影响机制 | 探讨剪切应力诱导的主动脉夹层形成过程中关键分子的作用 | 主要研究与剪切应力诱导的主动脉夹层相关的化学因子和基因 | 心血管疾病 | 主动脉夹层 | RNA测序 | 无具体模型类型提及 | 基因表达数据 | 分析三个数据集的临床样本及公共RNA测序数据库，共计367个基因 | NA | NA | NA | NA |
| 27088 | 2024-08-07 |
Single-Cell Atlas of Neonatal Mouse Hearts Reveals an Unexpected Cardiomyocyte
2023-12-05, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.122.028287
PMID:38014657
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研究论文 | 本文通过设计新生小鼠心脏细胞的分离程序，提供了出生后四个不同阶段心脏细胞的单细胞分辨率详细图谱 | 本文发现了意外的红细胞样心肌细胞-终末期心肌细胞，并提供了心肌细胞与其他心脏细胞之间全面相互作用的初步蓝图 | NA | 研究心肌细胞的异质性并提供在不同生理条件和疾病中的参考 | 新生小鼠心脏的心肌细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞图谱 | 10,000个心肌细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 27089 | 2024-08-05 |
Unveiling Hypothalamic Molecular Signatures via Retrograde Viral Tracing and Single-Cell Transcriptomics
2023-12-04, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-023-02789-6
PMID:38049462
|
研究论文 | 本研究通过逆行病毒追踪和单细胞转录组学揭示了下丘脑分子的特征 | 本研究创新地结合了多样化数据集进行验证，提供了更细致的下丘脑细胞类型多样性 | 本研究的局限性未在摘要中提及 | 深入理解下丘脑神经回路及其分子身份 | 来自CRH-IRES-Cre小鼠的1,533个下丘脑细胞 | 数字病理学 | NA | 单核RNA测序（snRNA-seq） | NA | 细胞转录组数据 | 1,533个来自CRH-IRES-Cre小鼠的细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 27090 | 2024-08-05 |
Identification of efferocytosis-related subtypes in gliomas and elucidating their characteristics and clinical significance
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1295891
PMID:38161335
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研究论文 | 本研究识别了胶质瘤中的吞噬凋亡相关亚型，并探讨了其特征和临床意义 | 首次通过分析137个与吞噬凋亡相关的基因，建立了与吞噬凋亡相关的胶质瘤亚型分类，并探讨了其在免疫环境、细胞间通信和代谢过程中的特征 | 未提及特定实验设计或样本选择的限制 | 探讨胶质瘤中吞噬凋亡相关亚型的特征和临床意义 | 胶质瘤中的吞噬凋亡相关亚型及其相关特征 | 数字病理学 | NA | RNA-seq | NMF算法 | 基因表型数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 27091 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA landscape of osteoimmune microenvironment in osteoporotic vertebral compression fracture and Kümmell's disease
2023, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2023.1276098
PMID:38161331
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了骨质疏松性椎体压缩骨折和Kümmell病在骨免疫微环境中的细胞组成和相互作用 | 首次在单细胞水平上揭示了骨质疏松性椎体压缩骨折和Kümmell病在骨免疫微环境中的分子途径、细胞群组成和细胞间相互作用的差异 | NA | 探讨骨质疏松性椎体压缩骨折和Kümmell病在骨免疫微环境中的细胞组成和相互作用 | 骨质疏松性椎体压缩骨折和Kümmell病 | 数字病理学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 8741个单细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 27092 | 2024-08-07 |
APOL1 Induces Pyroptosis of Fibroblasts Through NLRP3/Caspase-1/GSDMD Signaling Pathway in Ulcerative Colitis
2023, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S437875
PMID:38161356
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研究论文 | 本研究探讨了APOL1通过NLRP3/Caspase-1/GSDMD信号通路诱导纤维母细胞焦亡在溃疡性结肠炎中的作用 | 首次揭示了APOL1通过NLRP3-Caspase1-GSDMD信号通路诱导纤维母细胞焦亡，并促进趋化因子CXCL1的释放，这一发现有助于理解溃疡性结肠炎的发病机制 | NA | 研究APOL1在溃疡性结肠炎中诱导纤维母细胞焦亡的作用及其分子机制 | 溃疡性结肠炎中的纤维母细胞 | NA | 溃疡性结肠炎 | 生物信息学分析、免疫组织化学、免疫荧光、Western blot | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | 使用了来自Gene Expression Omnibus (GEO)数据库的GSE193677和GSE231993数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 27093 | 2024-08-07 |
Urinary PART1 and PLA2R1 Could Potentially Serve as Diagnostic Markers for Diabetic Kidney Disease Patients
2023, Diabetes, metabolic syndrome and obesity : targets and therapy
DOI:10.2147/DMSO.S445341
PMID:38162802
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研究论文 | 本研究通过bulk-seq、scRNA-seq和snRNA-seq数据分析，识别出与糖尿病肾病相关的尿液-肾脏特异性基因，特别是PART1和PLA2R1，这些基因可能作为早期诊断糖尿病肾病的标志物 | 首次识别出尿液中的PART1和PLA2R1作为糖尿病肾病的潜在诊断标志物，并探讨了它们与肾脏损伤和蛋白尿的关系 | 研究样本量较小，且仅包括糖尿病肾病患者和健康对照组，未来研究需扩大样本量并考虑更多疾病阶段的患者 | 探索糖尿病肾病的非侵入性诊断方法，特别是早期诊断 | 糖尿病肾病患者和健康对照组的尿液样本 | NA | 糖尿病肾病 | bulk-seq, scRNA-seq, snRNA-seq | NA | 尿液样本 | 56个尿液样本，包括11个来自糖尿病肾病患者和11个来自健康对照组 | NA | NA | NA | NA |
| 27094 | 2024-08-07 |
Single-cell analyses EMP1 as a marker of the ratio of M1/M2 macrophages is associated with EMT, immune infiltration, and prognosis in bladder cancer
2023, Bladder (San Francisco, Calif.)
DOI:10.14440/bladder.2023.852
PMID:38163006
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研究论文 | 本研究探讨了单细胞分析中EMP1作为M1/M2巨噬细胞比例的标志物与膀胱癌的EMT、免疫浸润及预后的关联 | 首次研究了M1和M2巨噬细胞联合作用在膀胱癌发展、生长、进展和转移中的意义，并识别了EMP1作为关键基因 | 研究样本量较小，仅涉及32名患者 | 探究EMP1在膀胱癌中的作用及其作为预后标志物的潜力 | 膀胱癌中的M1/M2巨噬细胞比例及EMP1基因 | 数字病理学 | 膀胱癌 | Cibersortx算法、流式细胞术、Gene Set Enrichment Analysis (GSEA)、Gene Set Variation Analysis (GSVA)、Gene Ontology (GO)、单细胞转录组分析(scRNA-seq)、Cellchat | NA | 基因表达数据 | 32名膀胱癌患者 | NA | NA | NA | NA |
| 27095 | 2024-08-07 |
Deciphering the Divergent Gene Expression Landscapes of m6A/m5C/m1A Methylation Regulators in Hepatocellular Carcinoma Through Single-Cell and Bulk RNA Transcriptomic Analysis
2023, Journal of hepatocellular carcinoma
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JHC.S448047
PMID:38164510
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA转录组分析，探索了m6A/m5C/m1A甲基化调控基因在肝细胞癌中的表达差异 | 本研究首次在单细胞水平上探索了m6A/m5C/m1A甲基化调控基因的表达，并验证了其在癌组织和邻近非癌肝组织中的表达 | 本研究仅分析了m6A/m5C/m1A甲基化调控基因的表达差异，未深入探讨其具体功能和机制 | 探索m6A/m5C/m1A甲基化调控基因在肝细胞癌中的表达差异 | m6A/m5C/m1A甲基化调控基因在肝细胞癌中的表达 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 收集了成人肝细胞癌患者的癌组织和邻近非癌肝组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 27096 | 2024-08-07 |
Titration of 124 antibodies using CITE-Seq on human PBMCs
2022-12-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-24371-7
PMID:36460735
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研究论文 | 研究使用CITE-Seq技术在人外周血单个核细胞（PBMCs）上滴定124种抗体的最佳浓度 | 首次系统地评估了188种CITE-Seq抗体在PBMCs上的检测能力，并找到了最佳的染色浓度 | 研究仅限于人外周血单个核细胞，未涉及其他细胞类型 | 确定哪些CITE-Seq抗体能在PBMCs上检测到其抗原，并找到最佳的染色浓度 | 188种CITE-Seq抗体及其在PBMCs上的检测能力 | 单细胞测序 | NA | CITE-Seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 人外周血单个核细胞（PBMCs） | NA | NA | NA | NA |
| 27097 | 2024-08-07 |
Single-cell transcriptomes and T cell receptors of vaccine-expanded apolipoprotein B-specific T cells
2022, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2022.1076808
PMID:36684560
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了接种ApoB肽P6疫苗的小鼠中ApoB特异性T细胞的转录组和T细胞受体 | 首次深入表征了疫苗扩增的ApoB特异性T细胞，并揭示了T细胞受体与ApoB肽P6:MHC-II相互作用的特异性 | 研究仅限于C57BL/6J小鼠模型，尚未在人类中进行验证 | 探究疫苗接种对ApoB表位的诱导反应 | ApoB特异性T细胞的单细胞转录组和T细胞受体 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | C57BL/6J小鼠接种ApoB肽P6疫苗后的T细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 27098 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics reveals the pulmonary inflammation induced by inhalation of subway fine particles
2024-02-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2023.132896
PMID:37951166
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研究论文 | 本研究揭示了地铁细颗粒物如何引起肺部炎症。 | 首次实验研究地铁PM引起的肺部炎症损伤 | 研究主要在小鼠模型中进行，可能不完全适用于人类 | 探索地铁细颗粒物对肺部炎症的影响及其机制 | 小鼠及其免疫细胞亚群 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本和生物液体 | 小鼠样本，具体数量未提及 | NA | NA | NA | NA |
| 27099 | 2024-08-07 |
Isolation and functional identification of immune cells in hemolymph of blood clams Tegillarca granosa
2024-Jan, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2023.109320
PMID:38122950
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，对血蛤Tegillarca granosa的血液细胞进行了分子层面的分类和功能鉴定 | 首次报道了血蛤Tegillarca granosa免疫细胞的分离和鉴定，为理解其免疫防御机制提供了新视角 | NA | 旨在深入研究红血软体动物的先天免疫系统 | 血蛤Tegillarca granosa的免疫细胞 | NA | NA | 单细胞转录组测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 | NA | NA | NA | NA |
| 27100 | 2024-08-07 |
Convergent differentiation of multiciliated cells
2023-12-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-023-50077-5
PMID:38155158
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研究论文 | 研究通过跨物种数据整合分析了人类和小鼠的鼻上皮细胞、支气管、输卵管和室下区室管膜细胞的单细胞转录组数据，探讨了多纤毛细胞（MCCs）在不同组织中的相似性和差异性 | 研究确认了MCCs在最终分化步骤中具有收敛的基因集表达，为理解发育过程中的纤毛生成提供了新的见解 | NA | 理解多纤毛细胞在多个组织中的相似性和差异性 | 多纤毛细胞在不同组织中的分化过程 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 人类和小鼠的鼻上皮细胞、支气管、输卵管和室下区室管膜细胞 | NA | NA | NA | NA |