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当前共找到 37403 篇文献，本页显示第 2681 - 2700 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2681 | 2026-02-08 |
Dynamic heterogeneity towards drug resistance in AML cells is primarily driven by epigenomic mechanism unveiled by multi-omics analysis
2026-Feb, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.05.038
PMID:40409464
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了急性髓系白血病（AML）细胞耐药性的动态异质性主要由表观基因组机制驱动 | 开发了一种新型多重单细胞RNA测序策略NAMUL-seq，并整合了scRNA-seq、scATAC-seq、DNA甲基化分析和全外显子组测序，首次系统揭示了AML细胞快速获得阿糖胞苷耐药性主要源于表观基因组变化，而非外显子突变 | 研究主要基于AML细胞系（KG-1a、Kasumi-1和HL-60），未在患者原代细胞或体内模型中充分验证 | 阐明AML细胞耐药性的细胞和分子机制 | 急性髓系白血病（AML）细胞 | 多组学分析 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、染色质可及性分析（scATAC-seq）、DNA甲基化分析、全外显子组测序（WES） | NA | 单细胞转录组数据、表观基因组数据、基因组数据 | 三种AML细胞系（KG-1a、Kasumi-1和HL-60） | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 全外显子组测序 | NA | NA |
| 2682 | 2026-02-08 |
Cluster-Guided Contrastive Learning With Masked Autoencoder for Spatial Domain Identification Based on Spatial Transcriptomics
2026-Feb, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2025.3586483
PMID:40622835
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研究论文 | 本文提出了一种名为STMCCL的自监督学习框架，结合掩码自编码器和聚类引导对比学习，用于空间转录组学数据中的空间域识别 | 提出了一种新颖的自监督学习框架STMCCL，联合训练掩码自编码器和聚类引导对比学习，并引入多聚类视角模块，考虑聚类间的几何和结构关系，以产生更可靠的聚类分配 | NA | 提高空间转录组学数据中空间域识别的准确性 | 空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学技术 | 掩码自编码器, 对比学习 | 基因表达谱, 空间信息 | 7个公共数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2683 | 2026-02-08 |
Nuclear receptor co-factor TBL1X/TBL1XR1 T cell activity protects against atherosclerosis
2026-Feb, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2026.102318
PMID:41539423
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序发现核受体共因子TBL1X/TBL1XR1在人类颈动脉斑块CD4 T细胞中表达显著，其缺失会促进动脉粥样硬化斑块形成 | 首次揭示TBL1X/TBL1XR1在CD4 T细胞中的表达与动脉粥样硬化发展的关联，并证明其缺失会加剧斑块形成 | 研究主要基于小鼠模型和人类组织样本，尚未在更大规模人群中验证，且具体分子机制有待进一步阐明 | 探究TBL1X/TBL1XR1在动脉粥样硬化中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 人类颈动脉斑块组织、小鼠CD4 T细胞、LDLR敲除小鼠模型 | 单细胞转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 人类颈动脉斑块样本（稳定与不稳定斑块及健康对照）、小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2684 | 2026-02-08 |
Metabolic adaptations rewire CD4+ T cells in a subset-specific manner in human critical illness with and without sepsis
2026-Feb, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-025-02390-6
PMID:41540263
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研究论文 | 本研究探讨了危重病患者CD4+ T细胞的代谢特性及其与免疫抑制的机制联系 | 揭示了CD4+ T细胞在危重病中的亚群特异性代谢可塑性，特别是调节性T细胞优先获得糖酵解能力，并发现ROS和犬尿氨酸代谢是T细胞重塑的驱动因素 | 研究样本可能有限，且机制联系仍需进一步验证 | 阐明危重病中CD4+ T细胞代谢与免疫抑制的机制联系 | 危重病患者（包括脓毒症和非脓毒症）及健康成年人的CD4+ T细胞 | 免疫学 | 危重病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 危重病患者和健康成年人的CD4+ T细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2685 | 2026-02-08 |
Innate immune cell subsets are enriched in synovial fluid of ACPA-negative rheumatoid arthritis and characterized by distinct type I IFN gene signatures
2026-Feb, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.07.029
PMID:41046204
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术，揭示了ACPA阴性类风湿关节炎患者滑膜液中独特的先天免疫细胞组成和I型干扰素基因特征 | 首次在ACPA阴性RA患者的滑膜液中鉴定出特定的先天免疫细胞亚群富集和I型干扰素基因特征，且这些特征在外周血中未观察到 | 样本量较小（发现队列每组4人，验证队列每组8人），且滑膜组织数据仅来自两个患者，可能限制结果的普遍性 | 探究ACPA阴性类风湿关节炎的先天免疫机制，特别是滑膜液中的细胞组成和干扰素反应 | 类风湿关节炎患者（包括ACPA阴性和ACPA阳性）的外周血单核细胞和滑膜液单核细胞，以及银屑病关节炎患者的滑膜液单核细胞作为对照 | 单细胞组学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞术数据 | 发现队列每组4人，验证队列每组8人（总计24名RA患者），外加银屑病关节炎患者对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2686 | 2026-02-08 |
Entheseal tissue signature in response to IL-17A inhibition in psoriatic arthritis: results from the EBIO entheseal biopsy study
2026-Feb, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.08.032
PMID:41107119
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研究论文 | 本研究通过影像质谱流式细胞术和空间转录组学分析，探讨了IL-17A抑制对银屑病关节炎患者附着点组织的细胞和分子响应 | 首次结合影像质谱流式细胞术和空间转录组学技术，在活体患者附着点组织中系统评估IL-17A抑制的免疫调节作用，并发现CD200+DKK3+成纤维细胞与2型先天淋巴细胞的抗炎生态位形成 | 样本量较小（仅10例患者），且仅针对外侧上髁附着点炎，可能限制结果的普遍适用性 | 研究IL-17A抑制对银屑病关节炎患者附着点组织微环境的免疫调节机制 | 患有活动性银屑病关节炎且伴有外侧上髁附着点炎的患者 | 数字病理学 | 银屑病关节炎 | 影像质谱流式细胞术, 空间转录组学 | NA | 组织图像, 转录组数据 | 10例患者 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2687 | 2026-02-08 |
Construction of a prognostic model and multidimensional analysis of hepatocellular carcinoma based on palmitoylation-related genes
2026-Jan-30, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04538-8
PMID:41618052
|
研究论文 | 本研究基于棕榈酰化相关基因构建了肝细胞癌的预后模型，并通过多维分析探索其分子机制 | 首次结合单细胞和批量转录组数据，分析肝细胞癌上皮细胞中棕榈酰化的调控网络 | NA | 构建肝细胞癌的预后模型并探索其分子机制 | 肝细胞癌上皮细胞 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞转录组测序，批量转录组测序 | LASSO回归，Cox回归，scAB反卷积算法，hdWGCNA | 转录组数据 | TCGA-LIHC和GEO数据集（包括GSE189903和GSE14520验证集） | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 2688 | 2026-02-08 |
Improving atlas-scale single-cell annotation models with hierarchical cross-entropy loss
2026-Jan-30, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-025-00945-z
PMID:41617882
|
研究论文 | 本文提出了一种分层交叉熵损失函数，用于改进单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释模型 | 引入分层交叉熵损失，将模型目标与生物层次结构对齐，无需额外计算成本即可提升分布外性能12-15% | 未提及具体局限性 | 提高单细胞RNA测序数据中细胞类型注释的准确性 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 线性模型、transformer | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2689 | 2026-02-08 |
Diversity and immune dynamics of choroid plexus macrophages are shaped by distinct developmental origins
2026-Jan-21, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-025-02158-z
PMID:41566006
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学结合谱系和空间追踪方法，揭示了脉络丛巨噬细胞的发育起源、生态位特化和免疫动态 | 首次通过单细胞转录组学识别了三种生物学上不同的脉络丛巨噬细胞亚群，并阐明了它们由不同造血波产生、依赖不同生存因子以及TGFβ信号在维持其身份中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本分析相对有限，可能未完全捕捉到物种间的所有差异 | 探究脉络丛巨噬细胞的多样性、发育起源和免疫功能 | 小鼠和人类的脉络丛巨噬细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞转录组学、谱系追踪、空间追踪方法 | NA | 转录组数据、空间数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2690 | 2026-02-08 |
Engrailed 1 promotes immune evasion and chemoresistance in glioma through single cell and CeRNA network analyses
2026-Jan-09, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-35553-y
PMID:41513764
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组分析、ceRNA网络构建及实验验证，揭示了转录因子EN1在胶质瘤免疫逃逸和化疗耐药中的关键作用 | 首次系统性地将EN1与胶质瘤免疫微环境特征、化疗反应预测联系起来，并构建了一个新的NEAT1/miR-9-5p/miR-128-3p/EN1 ceRNA调控轴来解释其失调机制 | 研究主要基于公共数据库和体外细胞实验，缺乏体内动物模型验证和更大规模的临床队列验证 | 全面研究EN1在胶质瘤中的功能，特别关注其在免疫逃逸和化疗耐药中的作用 | 胶质瘤细胞、公共转录组数据集（TCGA, GTEx, CGGA, GSE182109） | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, ceRNA网络分析, Western blot, CCK-8, Transwell实验 | NA | 转录组数据, 图像, 文本 | 多个公共数据集（TCGA, GTEx, CGGA, GSE182109），具体样本数未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 2691 | 2026-02-08 |
Airway immune profiles and therapeutic implications of IGF1 in eosinophilic granulomatosis with polyangiitis
2026-Jan-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-68104-6
PMID:41501017
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序比较了嗜酸性肉芽肿性多血管炎（EGPA）与重度嗜酸性哮喘（SEA）的气道免疫特征，揭示了EGPA中独特的干扰素驱动炎症机制，并发现IGF1巨噬细胞与疾病复发相关，提示IGF1作为潜在治疗靶点 | 首次在EGPA中识别出干扰素驱动的炎症通路，与SEA的TNF主导通路形成对比；发现IL1BMX1中性粒细胞促进三级淋巴结构形成；通过纵向分析揭示IGF1巨噬细胞与疾病复发的关联；在动物模型中验证IGF1阻断可减轻T2炎症 | 研究样本量未明确说明；动物模型结果需在人类临床试验中进一步验证；EGPA与SEA的病理生理差异机制仍需深入探究 | 探究EGPA与SEA的免疫特征差异，识别EGPA特有的炎症机制及潜在治疗靶点 | 嗜酸性肉芽肿性多血管炎（EGPA）和重度嗜酸性哮喘（SEA）患者的气道免疫细胞 | 单细胞组学 | 嗜酸性肉芽肿性多血管炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2692 | 2026-02-08 |
Uncovering the role of integrated stress in Alzheimer's disease through single-cell and transcriptomic analysis
2026-Jan-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-34997-6
PMID:41495191
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞测序和转录组数据，探索阿尔茨海默病中整合应激反应的分子机制 | 结合LASSO回归和随机森林算法筛选出六个关键基因，并揭示了它们与炎症通路及免疫细胞浸润的关联 | 研究样本量有限，且主要基于公共数据集分析，需要进一步实验验证 | 探索阿尔茨海默病中整合应激反应的分子机制及其临床意义 | 阿尔茨海默病患者和正常对照的脑细胞及血液样本 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞测序, 转录组分析 | LASSO回归, 随机森林 | 基因表达数据 | GSE264648数据集49例，GSE48350数据集253例，另加临床验证样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 2693 | 2026-01-06 |
A pseudouridine-related prognostic model of colorectal cancer based on single-cell sequencing analysis and transcriptome analysis
2026-Jan-04, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-34933-0
PMID:41486187
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2694 | 2026-02-08 |
A human pathophysiological 3D-bone marrow model reveals immune and stromal cell heterogeneity
2026-Jan-03, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09433-6
PMID:41484482
|
研究论文 | 本研究开发了一种标准化的三维人类骨髓模型，用于模拟骨髓微环境的关键特征并研究其生理和病理状态下的细胞动态 | 首次构建了能够模拟人类骨髓微环境异质性的标准化三维模型，并利用单细胞转录组学揭示了基质细胞和内皮细胞的异质性 | 模型仍需进一步验证其在更广泛疾病背景下的适用性，且长期培养效果有待更多数据支持 | 研究人类骨髓微环境中免疫细胞和基质细胞的异质性及其在病理状态下的动态变化 | 骨髓微环境中的基质细胞、内皮细胞、免疫细胞和造血祖细胞 | 单细胞组学 | 急性髓系白血病 | 单细胞转录组测序 | 三维骨髓模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2695 | 2026-02-08 |
ASTRO: Automated Spatial-Transcriptome whole RNA Output
2026-Jan-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf688
PMID:41495477
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研究论文 | 本文介绍了一种名为ASTRO的自动化流程，用于处理空间转录组学数据，特别优化了针对FFPE样本的全转录组分析 | 开发了首个专门针对FFPE样本空间转录组数据处理的自动化流程，能够同时检测编码和非编码RNA（如miRNA），并通过优化空间条形码识别和过滤步骤提高映射率 | 未明确说明该流程在其他样本类型或技术平台上的适用性限制 | 解决FFPE样本空间转录组数据分析的挑战，实现全转录组的空间定量分析 | 福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）组织样本 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 自动化数据处理流程 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2696 | 2026-02-08 |
scSNViz: visualization and analysis of cell-specific expressed SNVs
2026-Jan-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag023
PMID:41533688
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研究论文 | 介绍了一个名为scSNViz的R包，用于从单细胞RNA测序数据中探索、量化和可视化表达的单核苷酸变异 | 开发了一个专门针对单细胞水平表达SNVs的综合可视化与分析工具，填补了现有工具在单细胞变异表达模式研究方面的空白 | 未在摘要中明确提及具体限制，但可能依赖于现有单细胞分析框架的准确性 | 旨在促进对单细胞水平表达遗传变异的理解，包括转录异质性、等位基因调控和突变动力学 | 单细胞RNA测序数据中的表达单核苷酸变异 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2697 | 2026-02-08 |
Squidiff: predicting cellular development and responses to perturbations using a diffusion model
2026-Jan, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02877-y
PMID:41184550
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研究论文 | 本文介绍了一种基于扩散模型的生成框架Squidiff，用于预测不同细胞类型在环境变化下的转录组变化 | Squidiff通过连续去噪和语义特征集成，学习瞬态细胞状态，并预测跨时间和条件的高分辨率转录组景观 | NA | 预测细胞在环境刺激下的转录组变化，并阐明潜在的疾病机制 | 单细胞转录组数据 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 扩散模型 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2698 | 2026-02-08 |
KRAS Withdrawal in Cholangiocarcinoma Leads to Immune Infiltration and Tumor Regression
2026-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202511312
PMID:41332325
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研究论文 | 本研究通过构建条件性KRAS基因敲除的胆管癌小鼠模型，揭示了KRAS抑制导致肿瘤显著消退并伴随免疫细胞浸润的机制 | 首次利用转座子系统与CRISPR-Cas9技术构建了条件性TRE.Kras/Trp53敲除胆管癌小鼠模型，并系统揭示了KRAS抑制通过激活CD8 T细胞和诱导细胞衰老导致肿瘤消退的免疫机制 | 研究主要基于小鼠模型，其结论在人类胆管癌中的适用性仍需进一步验证；缺乏长期疗效观察数据 | 探究KRAS抑制在胆管癌治疗中的作用机制及潜在治疗价值 | 条件性KRAS/TP53敲除胆管癌小鼠模型、TKP细胞系 | 肿瘤免疫学 | 胆管癌 | CRISPR-Cas9基因编辑、单细胞RNA测序、bulk RNA测序、免疫组化、共聚焦免疫荧光、细胞因子阵列、慢病毒过表达 | 条件性基因敲除小鼠模型、同种移植模型 | 基因表达数据、免疫染色图像、细胞因子分泌数据 | 未明确说明具体样本数量，但包含小鼠模型和细胞系实验 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2699 | 2026-02-08 |
EPI-SauriCas9-based mouse ovarian cancer models recapitulating pten deletion in patients
2025-Dec-29, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09437-2
PMID:41466059
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研究论文 | 本研究开发并验证了使用EPI-SauriCas9系统构建的携带Pten和Trp53缺失的小鼠卵巢上皮模型（MEPP），用于模拟患者PTEN缺失的卵巢癌 | 利用EPI-SauriCas9系统创建了首个模拟PTEN和TP53缺失的小鼠卵巢癌模型，揭示了Pten缺失在促进肿瘤发生和转移中的作用，并通过单细胞RNA测序鉴定了具有不同转移潜能的独特上皮亚群 | 模型可能无法完全复制人类卵巢癌的所有复杂性，且研究主要聚焦于PTEN和TP53缺失的特定亚型 | 开发一个用于研究PTEN缺失卵巢癌的平台，并探索其肿瘤发生机制及潜在治疗方法 | 小鼠卵巢上皮细胞及由此衍生的肿瘤模型 | 癌症研究 | 卵巢癌 | EPI-SauriCas9基因编辑系统，单细胞RNA测序，高通量药物筛选 | 基因编辑小鼠模型 | 基因表达数据，药物反应数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2700 | 2026-02-08 |
ScRNA profiling of peripheral blood in kidney transplant recipients across rejection responses and treatments
2025-Dec-24, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-025-06489-1
PMID:41444247
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了肾移植受者外周血细胞，比较了不同排斥类型和治疗阶段的免疫细胞组成差异 | 首次提供了肾移植后不同排斥类型和治疗阶段的外周血单细胞转录组数据集，支持免疫细胞亚群的比较分析 | 样本量较小（仅5名参与者），且为初步分析，需要更大规模研究验证 | 探索肾移植受者外周血免疫细胞在排斥反应和免疫抑制治疗中的变化 | 肾移植受者的外周血细胞 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 5名肾移植受者，98,595个质量控制通过的细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |