单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27648 篇文献，本页显示第 26921 - 26940 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 26921 | 2024-08-09 |
Three-step transcriptional priming that drives the commitment of multipotent progenitors toward B cells
2018-01-15, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.309575.117
PMID:29440259
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研究论文 | 本研究通过使用含有tamoxifen诱导型Id3的多能前体细胞体外系统，揭示了B细胞系承诺过程中转录因子网络的“时间流逝”动态变化 | 发现了在关键转录因子程序启动之前存在的意外转录前激活现象，并提出了三步转录因子网络模型 | NA | 揭示B细胞系承诺过程中转录因子网络的动态变化 | 多能前体细胞向B细胞的分化过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组, 蛋白质相互作用组, 表观基因组 | NA |
| 26922 | 2024-08-09 |
Identification of Disease Susceptibility Alleles in the Next Generation Sequencing Era
2018, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-4939-7471-9_1
PMID:29423790
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研究论文 | 本文综述了下一代测序（NGS）技术在识别疾病易感等位基因中的应用 | NGS技术的发展使得快速且经济地分析全基因组和外显子成为可能，并能解决如体细胞变异等特定问题 | 尽管NGS技术存在局限性，但其对识别致病变异的影响是显著的 | 探讨NGS技术如何与实验和计算策略结合，以识别对疾病发展和进展有因果效应的变异 | 研究对象包括罕见单基因疾病和常见异质性疾病中的致病变异 | NA | NA | NGS | NA | 基因组数据 | NA |
| 26923 | 2024-08-09 |
Using Fluidigm C1 to Generate Single-Cell Full-Length cDNA Libraries for mRNA Sequencing
2018, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-4939-7471-9_11
PMID:29423800
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研究论文 | 本文描述了一种使用微流控设备（C1™ IFC）合成单细胞全长cDNA的方法，用于mRNA测序 | 采用微流控技术自动化合成单细胞全长cDNA，提高了数据质量和实验效率 | NA | 研究单细胞RNA测序技术，以深入理解细胞异质性、细胞分化、疾病进展和基因调控 | 单细胞全长cDNA的合成 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | 单细胞 |
| 26924 | 2024-08-09 |
Gene Manipulation with Micro RNAs at Single-Human Cancer Cell
2018, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-4939-7601-0_18
PMID:29435936
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研究论文 | 本文描述了一种使用微小RNA（miRNA）在单个人类癌细胞中操纵多个与癌症相关基因的协议，以研究这些基因在致癌过程中的相互作用 | 首次提出使用miRNA在单个细胞水平上操纵多个癌症相关基因，以深入研究致癌过程中的基因交互作用 | NA | 研究多个基因在致癌过程中的相互作用 | 单个人类癌细胞中的多个癌症相关基因 | NA | 癌症 | miRNA | NA | 转录组 | 单个细胞 |
| 26925 | 2024-08-09 |
How to design a single-cell RNA-sequencing experiment: pitfalls, challenges and perspectives
2019-07-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bby007
PMID:29394315
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序实验的设计方法、计算工具及其在不同实验设计和生物问题中的应用 | 提供了针对特定实验设计的分析框架建议，并评估了该领域的挑战和未来展望 | 大多数方法尚未进行性能基准测试，增加了选择最优实验和分析流程的难度 | 旨在概述当前可用于处理单细胞RNA测序数据的实验和计算方法 | 单细胞RNA测序实验的设计和数据分析方法 | 测序技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 26926 | 2024-08-09 |
scEpath: energy landscape-based inference of transition probabilities and cellular trajectories from single-cell transcriptomic data
2018-06-15, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/bty058
PMID:29415263
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研究论文 | 本文介绍了scEpath算法，该算法通过计算能量景观和概率有向图来重建发育轨迹，从单细胞转录组数据中推断细胞状态转换路径和概率 | scEpath算法通过结合单细胞能量和基于距离的度量，提供了比现有方法更稳健和准确的伪时间排序，并能高分辨率地揭示细胞状态转换的动态 | NA | 开发一种新算法，用于从单细胞转录组数据中推断细胞状态转换路径和概率 | 单细胞转录组数据中的细胞状态转换路径和概率 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 26927 | 2024-08-09 |
Single-cell Transcriptome Analyses Reveal Molecular Signals to Intrinsic and Acquired Paclitaxel Resistance in Esophageal Squamous Cancer Cells
2018-04-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2018.01.059
PMID:29410067
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research paper | 本研究通过低剂量长期处理紫杉醇诱导食管鳞状细胞癌KYSE-30细胞产生紫杉醇耐药性，并利用群体RNA测序和单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析基因表达谱，揭示了内在和获得性紫杉醇耐药的分子信号。 | 本研究首次发现卡非佐米（CFZ）通过激活HIF-1信号通路，能够减弱紫杉醇耐药性，为食管鳞状细胞癌等癌症的治疗提供了一种新的联合疗法。 | NA | 揭示食管鳞状细胞癌中紫杉醇耐药的分子机制，并探索新的联合疗法。 | 食管鳞状细胞癌KYSE-30细胞及其紫杉醇耐药细胞。 | digital pathology | 食管癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 37个KYSE-30细胞和73个紫杉醇耐药KYSE-30细胞（Taxol-R） |
| 26928 | 2024-08-09 |
High-throughput single-cell fate potential assay of murine hematopoietic progenitors in vitro
2018-04, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2018.01.005
PMID:29410050
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research paper | 本文详细介绍了开发一种体外高通量单细胞培养 assay，用于测量单个小鼠骨髓前体细胞向五个髓系分化的能力 | 本文开发了一种新的体外高通量单细胞培养 assay，用于评估小鼠造血前体细胞的命运潜力 | NA | 测试基于单细胞转录组学提出的高分辨率造血系统模型的预测 | 小鼠骨髓造血前体细胞的单细胞命运潜力 | digital pathology | NA | flow cytometry | NA | single-cell transcriptomics | 单个小鼠骨髓前体细胞 |
| 26929 | 2024-08-09 |
Graded Arrays of Spinal and Supraspinal V2a Interneuron Subtypes Underlie Forelimb and Hindlimb Motor Control
2018-02-21, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2018.01.023
PMID:29398364
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research paper | 本文研究了脊髓和脊上V2a中间神经元亚型的分级排列如何影响前肢和后肢的运动控制 | 发现了两种主要的V2a中间神经元类型，它们在发育过程中形成，并通过单细胞RNA测序揭示了这些神经元包含多个亚型 | NA | 揭示脊髓中V2a中间神经元的分子和解剖组织，以及它们如何影响特定区域的运动输出 | 脊髓和脊上V2a中间神经元及其在运动控制中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序（RNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 26930 | 2024-08-09 |
Chromatin Modification and Global Transcriptional Silencing in the Oocyte Mediated by the mRNA Decay Activator ZFP36L2
2018-02-05, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2018.01.006
PMID:29408237
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研究论文 | 本文报道了在卵母细胞中，ZFP36L2这一mRNA降解激活因子介导的染色质修饰和全局转录沉默的机制 | 首次发现卵母细胞中的全局转录沉默依赖于一个mRNA降解激活因子ZFP36L2 | NA | 揭示ZFP36L2在卵母细胞生长过程中的作用及其对染色质修饰和全局转录的影响 | 卵母细胞中的ZFP36L2及其对转录和染色质修饰调控因子的影响 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠卵母细胞 |
| 26931 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing of Glioblastoma Cells
2018, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-4939-7659-1_12
PMID:29392698
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研究论文 | 本文描述了使用C1 Fluidigm系统从单个患者来源的胶质母细胞瘤细胞生成和分析cDNA文库的方法 | 采用单细胞RNA测序技术（sc-RNASeq），相较于传统的批量RNASeq，能更好地理解高度异质性细胞群中的基因表达模式，并识别稀有细胞的转录特征 | NA | 探索单细胞RNA测序技术在胶质母细胞瘤细胞中的应用 | 单个患者来源的胶质母细胞瘤细胞 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序（sc-RNASeq） | NA | RNA | 单个患者来源的胶质母细胞瘤细胞 |
| 26932 | 2024-08-09 |
Recent advances in understanding evolution of the placenta: insights from transcriptomics
2018, F1000Research
DOI:10.12688/f1000research.13115.1
PMID:29416852
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研究论文 | 本文通过转录组学研究探讨了哺乳动物胎盘的进化，特别是在真兽类和有袋类哺乳动物中的进化，并扩展到脊椎动物中胎生和胎盘形成的趋同进化 | 文章提出未来研究应关注胎盘早期发育阶段的基因表达，并尝试涵盖所有主要哺乳动物群体，以及通过单细胞转录组学技术在人类和老鼠以外的物种中进行研究 | 目前的研究主要集中在真兽类胎盘成熟期、真兽类和有袋类的繁殖策略以及子宫在植入期的蜕膜反应，尚未全面覆盖所有哺乳动物群体 | 旨在通过基因转录研究深入理解胎盘的结构与功能关系，以及其在不同哺乳动物中的进化 | 研究对象包括真兽类和有袋类哺乳动物的胎盘，以及脊椎动物中胎生和胎盘形成的趋同进化 | 转录组学 | NA | 转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 26933 | 2024-08-09 |
Single-Cell Sequencing of the Healthy and Diseased Heart Reveals Cytoskeleton-Associated Protein 4 as a New Modulator of Fibroblasts Activation
2018-07-10, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本文介绍了一种从成年小鼠心脏组织中获取高质量RNA的方法，用于健康和病变心脏的自动单细胞测序。 | 本文首次将单细胞测序技术应用于成年心脏组织，揭示了细胞骨架相关蛋白4作为纤维母细胞激活的新调节因子。 | NA | 研究健康和病变心脏中转录组差异以及基因表达的细胞类型特异性变化。 | 成年小鼠心脏组织的单细胞RNA测序。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | RNA | 成年小鼠心脏组织 |
| 26934 | 2024-08-09 |
Epigenetic regulation in B-cell maturation and its dysregulation in autoimmunity
2018-07, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/cmi.2017.133
PMID:29375128
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综述 | 本文综述了B细胞成熟过程中的表观遗传调控及其在自身免疫疾病中的失调 | 利用新一代测序、单细胞测序和DNA甲基化测序等现代技术，深入理解B细胞生物学及其在自身免疫发展中的作用 | NA | 总结表观遗传修饰在B细胞激活和分化中的研究进展，特别是在自身免疫条件下 | B细胞的表观遗传调控及其在自身免疫疾病中的作用 | NA | 自身免疫疾病 | 下一代测序, 单细胞测序, DNA甲基化测序 | NA | DNA | NA |
| 26935 | 2024-08-09 |
Single cell transcriptome sequencing: A new approach for the study of mammalian sex determination
2018-06-15, Molecular and cellular endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1016/j.mce.2018.01.013
PMID:29371022
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综述 | 本文综述了单细胞转录组测序（scRNA-seq）在哺乳动物性别决定研究中的应用 | scRNA-seq技术能够全面且无偏地识别和分类细胞群，追踪细胞发育轨迹，并描述控制其分化的转录动力学 | scRNA-seq技术仍存在一些实验方法上的局限性 | 探讨scRNA-seq技术在哺乳动物性别决定研究中的应用及其未来发展 | 哺乳动物性别决定过程中的细胞群及其发育轨迹 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 26936 | 2024-08-09 |
ST Spot Detector: a web-based application for automatic spot and tissue detection for spatial Transcriptomics image datasets
2018-06-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/bty030
PMID:29360929
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research paper | 本文介绍了一个名为ST Spot Detector的网络工具，用于自动检测空间转录组学图像数据集中的斑点和组织 | ST Spot Detector通过用户友好的界面自动化并简化了图像与转录组数据的校准过程 | NA | 开发一个自动化工具，以简化空间转录组学数据与图像的校准过程 | 空间转录组学图像数据集中的斑点和组织检测 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | 图像 | NA |
| 26937 | 2024-08-09 |
Circulating plasmablasts are elevated and produce pathogenic anti-endothelial cell autoantibodies in idiopathic pulmonary arterial hypertension
2018-05, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.201747460
PMID:29369345
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研究论文 | 本文研究了特发性肺动脉高压（IPAH）中循环浆母细胞的水平及其在疾病发病机制中的作用 | 首次详细描述了IPAH中浆母细胞产生的IgA自身抗体及其对内皮细胞的影响 | NA | 评估IPAH中激活B细胞（浆母细胞）的水平，并表征这些浆母细胞衍生的重组抗体 | 特发性肺动脉高压（IPAH）中的浆母细胞及其产生的抗体 | NA | 肺动脉高压 | 单细胞测序 | NA | 血液样本 | NA |
| 26938 | 2024-08-09 |
Systems biology of embryonic development: Prospects for a complete understanding of the Caenorhabditis elegans embryo
2018-05, Wiley interdisciplinary reviews. Developmental biology
DOI:10.1002/wdev.314
PMID:29369536
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研究论文 | 本文探讨了系统生物学框架如何帮助全面理解秀丽隐杆线虫胚胎中的胚胎调控关系 | 结合现代基因组学工具和发育生物学，特别是利用秀丽隐杆线虫胚胎的小尺寸和强大的遗传及基因组工具，以细胞分辨率理解mRNA表达和调控 | 目前的建模和扰动实验主要集中在单个细胞类型或基因上，需要改进方法以扩展到整个基因组和生物体 | 旨在通过系统生物学框架全面理解秀丽隐杆线虫胚胎的发育调控关系 | 秀丽隐杆线虫胚胎的基因表达和调控 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 26939 | 2024-08-09 |
dropClust: efficient clustering of ultra-large scRNA-seq data
2018-04-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gky007
PMID:29361178
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研究论文 | 本文介绍了一种名为dropClust的新型聚类算法，该算法利用局部敏感哈希技术对超大规模的单细胞RNA测序数据进行高效聚类 | dropClust在执行时间、聚类准确性和检测次要细胞亚型方面优于现有的最佳实践方法 | NA | 开发一种适用于高维单细胞数据的聚类方法，以提高处理大规模数据时的效率和准确性 | 超大规模的单细胞RNA测序数据 | 单细胞测序 | NA | 局部敏感哈希 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 数万个单细胞 |
| 26940 | 2024-08-09 |
Review: Somatic mutations in neurodegeneration
2018-04, Neuropathology and applied neurobiology
IF:4.0Q1
DOI:10.1111/nan.12465
PMID:29369391
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综述 | 本文综述了体细胞突变在神经退行性疾病中的作用，特别是晚发性散发性神经退行性疾病 | 探讨了体细胞突变在神经退行性疾病中的潜在作用，尤其是通过单细胞测序技术的进步 | 单细胞测序技术仍存在误差，且需要进一步改进 | 探讨体细胞突变在神经退行性疾病中的作用及其与疾病发展的关系 | 主要关注散发性晚发性神经退行性疾病，如帕金森病、阿尔茨海默病和肌萎缩侧索硬化症 | NA | 神经退行性疾病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |