单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
26901	2024-08-09	Reply from Authors re: Xue-Ru Wu. Attention to Detail by Single-cell sequencing. Eur Urol 2017;71:13-4 2017-01, European urology IF:25.3Q1 DOI:10.1016/j.eururo.2016.11.003 PMID:27842721	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
26902	2024-08-09	Single-Cell Sequencing for Drug Discovery and Drug Development 2017, Current topics in medicinal chemistry IF:2.9Q3 DOI:10.2174/1568026617666161116145358 PMID:27848892	综述	本文综述了单细胞测序技术在药物发现和药物开发中的应用现状	单细胞测序技术提供了更强大和精确的方法来分析药物对处理过的细胞和组织的影响	NA	探讨单细胞测序技术在药物发现和药物开发中的潜在应用	单细胞全基因组/外显子测序、单细胞转录组测序、单细胞亚硫酸氢盐测序等	基因组学	NA	NGS（下一代测序技术）	NA	基因组、表观基因组和转录组数据	单细胞级别
26903	2024-08-09	Genome evolution in ductal carcinoma in situ: invasion of the clones 2017-Jan, The Journal of pathology IF:5.6Q1 DOI:10.1002/path.4840 PMID:27861897	综述	本文综述了导管原位癌（DCIS）向浸润性导管癌（IDC）进展过程中肿瘤内异质性的作用及其在诊断和治疗中的相关性	讨论了新兴技术如单细胞测序、STAR-FISH和成像质谱技术在理解DCIS演化中的潜在应用	NA	探讨DCIS向IDC进展的分子和基因组基础	导管原位癌（DCIS）及其向浸润性导管癌（IDC）的进展	数字病理学	乳腺癌	单细胞测序	NA	NA	NA
26904	2024-08-09	Pinpointing Cancer Stem Cells in Oligodendroglioma 2017-01, Cancer discovery IF:29.7Q1 DOI:10.1158/2159-8290.CD-NB2016-149 PMID:27864226	研究论文	通过单细胞RNA测序技术研究低级别少突胶质瘤，识别出具有神经干细胞和祖细胞基因表达特征的细胞群体	首次通过单细胞RNA测序技术在低级别少突胶质瘤中识别出具有神经干细胞特征的癌症干细胞	NA	识别并研究少突胶质瘤中的癌症干细胞	低级别少突胶质瘤中的单个细胞	数字病理学	脑肿瘤	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	具体样本数量未提及
26905	2024-08-09	Single-cell isolation by a modular single-cell pipette for RNA-sequencing 2016-11-29, Lab on a chip IF:6.1Q2 DOI:10.1039/c6lc01241h PMID:27841430	research paper	本文报道了一种模块化单细胞移液管（mSCP），由SCP-Tip、空气置换移液管（ADP）和ADP-Tips三个模块化组件组成，可快速、方便且可靠地从细胞悬液中分离单个活细胞，并适用于单细胞转录组测序。	mSCP通过组装含有流体动力陷阱的SCP-Tip，能够从每微升5-10个细胞的悬液中分离单细胞，并实现100%的单细胞分离效率。	NA	开发一种方便、快速且高效的单细胞分离方法，以满足单细胞转录组测序的需求。	单细胞分离技术及其在单细胞转录组测序中的应用。	digital pathology	NA	RNA-seq	NA	text	每微升5-10个细胞
26906	2024-08-09	An automated approach to prepare tissue-derived spatially barcoded RNA-sequencing libraries 2016-11-16, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/srep37137 PMID:27849009	研究论文	本文介绍了一种在机器人工作站上运行的保留转录本空间信息的自动化方法	该方法通过减少技术变异性和提高吞吐量，实现了比标准协议更高的效率	NA	开发一种稳健、可扩展且自动化的文库制备协议，以保留或推断空间上下文	牙龈组织活检样本的RNA序列	数字病理学	牙周病	RNA测序	NA	RNA	六个牙龈组织活检样本的重复切片
26907	2024-08-09	Single-cell RNA-seq ties macrophage polarization to growth rate of intracellular Salmonella 2016-Nov-14, Nature microbiology IF:20.5Q1 DOI:10.1038/nmicrobiol.2016.206 PMID:27841856	研究论文	本文通过结合荧光报告细菌细胞分裂和单细胞RNA测序分析，研究了巨噬细胞对模型病原体沙门氏菌不同细胞内状态的反应	首次揭示了巨噬细胞在感染不同生长状态的沙门氏菌时表现出不同的功能性宿主反应状态，并展示了这些状态如何影响病原体的生长和免疫逃避	NA	探究宿主细胞如何响应细胞内病原体生长速率的异质性	巨噬细胞对沙门氏菌不同细胞内状态的反应	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组	NA
26908	2024-08-09	Exploring viral infection using single-cell sequencing 2017-07-15, Virus research IF:2.5Q3 DOI:10.1016/j.virusres.2016.10.016 PMID:27816430	综述	本文综述了利用单细胞测序技术研究病毒多样性和细胞对病毒复制的响应变异性的最新研究	利用单细胞测序技术从病毒和宿主细胞的角度研究病毒感染的动态变化	NA	探讨单细胞测序技术在病毒学领域的应用	病毒多样性和细胞对病毒复制的响应变异性	基因组学	NA	单细胞测序（SCS）	NA	基因组和/或转录组数据	NA
26909	2024-08-09	Single-cell sequencing of the small-RNA transcriptome 2016-Dec, Nature biotechnology IF:33.1Q1 DOI:10.1038/nbt.3701 PMID:27798564	研究论文	本文介绍了一种单细胞水平的小RNA转录组测序方法，并应用于人类胚胎干细胞和癌细胞中，分析了microRNA及tRNA和snoRNA片段，揭示了microRNA作为不同细胞类型和状态标记的潜力	首次开发了一种单细胞水平的小RNA转录组测序方法	NA	研究小RNA表达的异质性及其在不同细胞类型和状态中的作用	人类胚胎干细胞和癌细胞中的小RNA	数字病理学	NA	单细胞测序	NA	RNA	多种人类胚胎干细胞和癌细胞
26910	2024-08-09	Single-cell RNA-seq supports a developmental hierarchy in human oligodendroglioma 2016-11-10, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/nature20123 PMID:27806376	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术分析了6个IDH1或IDH2突变的人类少突胶质细胞瘤中的4,347个单细胞，重建了其发育程序，并推断出肿瘤细胞的分化状态与神经干细胞表达程序的关联	首次提供了单细胞分辨率下少突胶质细胞瘤细胞结构的深入分析，支持了癌症干细胞模型	需要完整的系统发育树来确定遗传进化对推断层次结构的影响	探究人类少突胶质细胞瘤中的细胞层次结构及其与发育程序的关系	IDH1或IDH2突变的人类少突胶质细胞瘤中的单细胞	数字病理学	神经系统肿瘤	RNA测序	NA	基因表达数据	4,347个单细胞
26911	2024-08-09	Revealing the vectors of cellular identity with single-cell genomics 2016-Nov-08, Nature biotechnology IF:33.1Q1 DOI:10.1038/nbt.3711 PMID:27824854	研究论文	本文探讨了单细胞基因组学在构建人类细胞全面图谱以及重新定义细胞身份和其分子调控机制方面的应用	利用新兴的计算分析方法，特别是单细胞RNA测序（scRNA-seq），以数据驱动的方式揭示细胞身份的多方面特征	计算方法需要克服技术噪声、数据规模及形成新的生物学抽象概念等挑战	探索单细胞基因组学在细胞身份定义和调控机制中的应用	人类细胞的身份及其分子调控机制	基因组学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因组数据	NA
26912	2024-08-09	Laminin-guided highly efficient endothelial commitment from human pluripotent stem cells 2016-11-02, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/srep35680 PMID:27804979	研究论文	本文研究了从人多能干细胞（hPSCs）通过定向分化获得高度纯化的内皮祖细胞（PSC-EPCs）的方法，特别关注了细胞外基质（ECM）在分化过程中的作用。	使用短片段的层粘连蛋白411（LM411-E8）作为ECM，成功引导hPSCs高效分化为纯度超过95%的PSC-EPCs，无需细胞分选，并通过单细胞RNA测序分析揭示了其对细胞转录异质性的解决作用。	NA	探索和优化从hPSCs定向分化为内皮细胞的条件，特别是ECM的作用。	人多能干细胞（hPSCs）及其定向分化为内皮祖细胞（PSC-EPCs）的过程。	细胞生物学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA序列	NA
26913	2024-08-09	Embryo genome profiling by single-cell sequencing for successful preimplantation genetic diagnosis in a family harboring COL4A1 c.1537G>A; p.G513S mutation 2016 Jul-Sep, Journal of human reproductive sciences DOI:10.4103/0974-1208.192072 PMID:27803589	研究论文	本文通过单细胞测序技术对携带COL4A1基因c.1537G>A; p.G513S突变家庭的胚胎进行基因组分析，实现了成功的植入前遗传诊断	这是印度首次报道通过IVF程序使用单细胞测序技术避免潜在致病性COL4A1等位基因，成功诞生正常儿童	NA	筛查不携带COL4A1基因c.1537G>A; p.G513S突变的胚胎，以避免选择性妊娠终止	12个胚胎的滋养层活检样本	NA	NA	单细胞测序	NA	DNA	12个胚胎
26914	2024-08-09	De Novo MS/MS Sequencing of Native Human Antibodies 2017-01-06, Journal of proteome research IF:3.8Q1 DOI:10.1021/acs.jproteome.6b00608 PMID:27779884	研究论文	本研究展示了一种新的MS/MS抗体发现方法，该方法仅需要血清抗体，无需基因材料测序	首次证明了仅通过MS/MS技术直接从血清中纯化和测序抗体的可行性	NA	探索一种新的抗体发现方法，以简化从感染个体中获取治疗性单克隆抗体的过程	来自巨细胞病毒暴露个体的血清多克隆抗体	生物技术	NA	MS/MS	NA	血清	单个巨细胞病毒暴露个体
26915	2024-08-09	Single-Cell RNA Sequencing of Human T Cells 2017, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) DOI:10.1007/978-1-4939-6548-9_16 PMID:27787803	研究论文	本文描述了一种生成人类血液CD4和CD8 T细胞单细胞转录组文库的协议，并介绍了处理由此产生的序列数据以进行进一步计算分析的基本生物信息学步骤	本文采用单细胞RNA测序技术，通过转录组分析无假设地评估细胞状态和亚群，这种方法在研究T细胞时尤为重要，因为它可以识别传统表型标准无法区分的不同T细胞亚型和过渡状态	NA	研究人类T细胞如何利用细胞异质性、可塑性和多样性在动态过程中（如发育、分化和抗原反应）实现广泛的功能灵活性	人类血液中的CD4和CD8 T细胞	数字病理学	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	具体样本数量未在摘要中提及
26916	2024-08-09	Cells Respond to Distinct Nanoparticle Properties with Multiple Strategies As Revealed by Single-Cell RNA-Seq 2016-11-22, ACS nano IF:15.8Q1 DOI:10.1021/acsnano.6b05452 PMID:27788331	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了不同纳米颗粒（NP）属性对肺泡上皮细胞反应的影响	首次采用单细胞RNA测序技术研究不同负荷的纳米颗粒对细胞反应的独特影响	研究仅限于特定的纳米颗粒类型和细胞类型	揭示纳米颗粒属性对细胞反应和人类健康的具体影响	肺泡上皮细胞与不同负荷的氨基化或羧基化量子点（QDs）	生物技术	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	特定负荷的肺泡上皮细胞
26917	2024-08-09	Single Cell Total RNA Sequencing through Isothermal Amplification in Picoliter-Droplet Emulsion 2016-11-15, Analytical chemistry IF:6.7Q1 DOI:10.1021/acs.analchem.6b02581 PMID:27783484	研究论文	本文开发了一种名为“easier-seq”的新型RNA扩增方法，用于从单个细胞中逆转录和扩增总RNA，包括有和没有多聚腺苷酸尾的RNA，以实现高效率、可重复性和准确性的转录组测序。	该方法通过在油中将逆转录的cDNA分子分配到1.5 × 10的65-pL反应器中，使用随机引物在每个反应器中进行等温扩增，大大简化了单细胞RNA测序的实验步骤，并减少了引入错误的机会。	NA	开发一种新的RNA扩增方法，以提高单细胞RNA测序的效率和质量。	单个细胞中的总RNA，包括有和没有多聚腺苷酸尾的RNA。	基因组学	NA	RNA测序	NA	转录组数据	单个细胞
26918	2024-08-09	A statistical approach for identifying differential distributions in single-cell RNA-seq experiments 2016-10-25, Genome biology IF:10.1Q1 DOI:10.1186/s13059-016-1077-y PMID:27782827	研究论文	本文提出了一种新的统计方法，用于在存在不同表达状态的情况下，表征生物条件内和之间的表达差异	该方法能够检测到比均值偏移更复杂的基因表达分布的细微差异，并能表征这些差异	NA	旨在量化细胞异质性，并表征在不同生物条件下的表达差异	单细胞RNA测序实验中的基因表达差异	生物信息学	NA	单细胞RNA测序	统计方法	基因表达数据	NA
26919	2024-08-09	Single-cell RNA-seq identifies a PD-1hi ILC progenitor and defines its development pathway 2016-11-03, Nature IF:50.5Q1 DOI:10.1038/nature20105 PMID:27749818	研究论文	本文利用单细胞RNA测序技术研究了小鼠骨髓前体细胞中的ILC前体亚群，揭示了ILC发育的不同阶段和途径	首次发现并定义了高表达PD-1的ILC前体细胞，并阐明了其在ILC2发育中的早期检查点作用	NA	探究ILC前体细胞的异质性、发育轨迹和信号依赖性	小鼠骨髓中的ILC前体细胞	免疫学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA	小鼠骨髓前体细胞
26920	2024-08-09	Massive and parallel expression profiling using microarrayed single-cell sequencing 2016-10-14, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/ncomms13182 PMID:27739429	研究论文	本文介绍了一种名为MASC-seq的新技术，该技术通过微阵列基础的条形码技术实现单细胞表达模式的并行大规模分析	MASC-seq技术能够在低成本（0.13美元/细胞）下实现高吞吐量和稳健性的单细胞分析，比商业系统成本低两个数量级	NA	加速对微妙克隆动态的研究，并提供对疾病发展和其它生物过程的关键见解	单细胞转录组	NA	NA	微阵列技术	NA	转录组数据	每天可分析数千个单细胞